# TARGET T0362 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0362.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 212 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 2 N 0.019 0.019 0.003 0.009 0.005 0.021 0.925 3 P 0.024 0.013 0.014 0.016 0.261 0.100 0.573 4 E 0.041 0.013 0.055 0.018 0.202 0.177 0.495 5 N 0.092 0.013 0.061 0.010 0.267 0.093 0.465 6 W 0.264 0.014 0.054 0.009 0.202 0.067 0.390 7 L 0.574 0.032 0.021 0.006 0.081 0.027 0.260 8 L 0.758 0.014 0.008 0.003 0.035 0.014 0.168 9 L 0.797 0.011 0.004 0.002 0.025 0.007 0.154 10 R 0.829 0.005 0.003 0.001 0.031 0.004 0.126 11 R 0.905 0.004 0.001 0.001 0.010 0.001 0.078 12 V 0.948 0.003 0.001 0.001 0.005 0.001 0.043 13 V 0.935 0.009 0.001 0.001 0.004 0.001 0.051 14 R 0.814 0.016 0.001 0.001 0.017 0.002 0.151 15 F 0.312 0.008 0.045 0.008 0.230 0.079 0.318 16 G 0.040 0.005 0.100 0.010 0.265 0.491 0.090 17 D 0.049 0.017 0.143 0.008 0.160 0.448 0.174 18 T 0.129 0.058 0.036 0.010 0.292 0.095 0.379 19 D 0.110 0.026 0.014 0.013 0.216 0.105 0.516 20 A 0.160 0.025 0.037 0.045 0.201 0.386 0.146 21 A 0.294 0.020 0.030 0.089 0.064 0.358 0.145 22 G 0.615 0.011 0.019 0.067 0.080 0.135 0.073 23 V 0.699 0.016 0.013 0.081 0.037 0.044 0.110 24 M 0.701 0.033 0.016 0.077 0.028 0.046 0.099 25 H 0.342 0.021 0.045 0.231 0.063 0.178 0.121 26 F 0.114 0.016 0.049 0.324 0.128 0.185 0.183 27 H 0.012 0.003 0.089 0.648 0.054 0.120 0.074 28 Q 0.006 0.002 0.084 0.551 0.049 0.279 0.028 29 L 0.004 0.002 0.059 0.843 0.011 0.068 0.014 30 F 0.003 0.003 0.027 0.902 0.014 0.029 0.023 31 R 0.004 0.001 0.016 0.907 0.018 0.038 0.016 32 W 0.002 0.001 0.014 0.918 0.012 0.038 0.015 33 C 0.001 0.001 0.006 0.953 0.009 0.017 0.014 34 H 0.001 0.001 0.002 0.969 0.007 0.014 0.008 35 E 0.001 0.001 0.001 0.968 0.005 0.016 0.009 36 S 0.001 0.001 0.001 0.974 0.004 0.010 0.010 37 W 0.001 0.001 0.001 0.980 0.003 0.009 0.006 38 E 0.001 0.001 0.001 0.984 0.002 0.010 0.003 39 E 0.001 0.001 0.001 0.979 0.003 0.012 0.005 40 S 0.001 0.001 0.001 0.980 0.004 0.009 0.006 41 L 0.001 0.001 0.002 0.980 0.004 0.008 0.005 42 E 0.001 0.001 0.009 0.965 0.002 0.020 0.002 43 S 0.001 0.001 0.015 0.867 0.004 0.109 0.003 44 Y 0.001 0.001 0.019 0.361 0.019 0.588 0.012 45 G 0.001 0.005 0.015 0.030 0.062 0.782 0.104 46 L 0.014 0.020 0.009 0.007 0.193 0.029 0.727 47 N 0.046 0.035 0.020 0.008 0.064 0.014 0.813 48 P 0.008 0.003 0.649 0.222 0.024 0.051 0.044 49 A 0.015 0.001 0.626 0.253 0.020 0.055 0.029 50 D 0.019 0.003 0.629 0.222 0.022 0.070 0.034 51 I 0.035 0.022 0.172 0.404 0.112 0.077 0.177 52 F 0.025 0.012 0.090 0.283 0.082 0.082 0.426 53 P 0.013 0.004 0.129 0.282 0.047 0.440 0.085 54 G 0.010 0.005 0.151 0.252 0.093 0.398 0.091 55 S 0.017 0.017 0.136 0.217 0.224 0.125 0.264 56 R 0.024 0.009 0.103 0.282 0.121 0.302 0.157 57 K 0.022 0.008 0.128 0.261 0.118 0.317 0.144 58 S 0.031 0.016 0.091 0.241 0.195 0.173 0.253 59 E 0.071 0.020 0.060 0.206 0.080 0.205 0.357 60 V 0.042 0.012 0.057 0.142 0.054 0.080 0.612 61 T 0.071 0.022 0.115 0.126 0.067 0.131 0.469 62 P 0.082 0.016 0.124 0.086 0.173 0.259 0.260 63 E 0.119 0.008 0.061 0.057 0.233 0.228 0.294 64 V 0.212 0.025 0.013 0.033 0.177 0.033 0.508 65 A 0.409 0.012 0.003 0.008 0.071 0.021 0.477 66 L 0.539 0.005 0.001 0.004 0.049 0.003 0.399 67 P 0.813 0.007 0.001 0.003 0.033 0.002 0.142 68 I 0.919 0.006 0.001 0.001 0.004 0.001 0.069 69 I 0.968 0.001 0.001 0.002 0.007 0.002 0.020 70 H 0.966 0.002 0.001 0.002 0.003 0.001 0.025 71 C 0.934 0.002 0.003 0.003 0.008 0.007 0.042 72 Q 0.893 0.003 0.002 0.003 0.029 0.012 0.058 73 A 0.721 0.005 0.003 0.005 0.040 0.009 0.218 74 D 0.783 0.006 0.002 0.004 0.062 0.016 0.126 75 F 0.882 0.011 0.004 0.004 0.016 0.019 0.064 76 R 0.852 0.013 0.009 0.006 0.024 0.015 0.082 77 R 0.808 0.002 0.005 0.003 0.060 0.007 0.113 78 P 0.765 0.001 0.011 0.004 0.046 0.017 0.156 79 I 0.754 0.016 0.008 0.005 0.030 0.014 0.173 80 H 0.596 0.018 0.012 0.004 0.041 0.021 0.309 81 T 0.262 0.007 0.069 0.005 0.125 0.338 0.194 82 G 0.016 0.002 0.039 0.001 0.112 0.818 0.013 83 D 0.041 0.002 0.031 0.001 0.158 0.679 0.089 84 A 0.761 0.006 0.001 0.001 0.024 0.025 0.182 85 L 0.958 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.035 86 A 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 87 M 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 88 E 0.986 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.012 89 L 0.973 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.024 90 R 0.959 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.034 91 P 0.874 0.001 0.002 0.001 0.011 0.003 0.108 92 E 0.850 0.008 0.006 0.005 0.041 0.013 0.077 93 R 0.794 0.014 0.010 0.008 0.032 0.032 0.110 94 L 0.570 0.007 0.016 0.006 0.141 0.121 0.140 95 N 0.165 0.006 0.010 0.002 0.314 0.374 0.128 96 P 0.097 0.003 0.017 0.001 0.366 0.351 0.164 97 N 0.479 0.004 0.004 0.001 0.216 0.028 0.270 98 S 0.910 0.006 0.001 0.001 0.015 0.003 0.066 99 F 0.965 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.029 100 Q 0.981 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.016 101 V 0.962 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.034 102 H 0.967 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.023 103 F 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 104 E 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 105 F 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 106 R 0.943 0.003 0.001 0.001 0.006 0.004 0.044 107 C 0.646 0.003 0.007 0.001 0.090 0.075 0.178 108 E 0.016 0.001 0.010 0.001 0.154 0.807 0.012 109 E 0.019 0.001 0.006 0.001 0.118 0.841 0.017 110 Q 0.772 0.008 0.001 0.001 0.026 0.009 0.184 111 I 0.926 0.012 0.001 0.001 0.003 0.001 0.059 112 A 0.972 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.019 113 A 0.979 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.015 114 H 0.981 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.014 115 A 0.976 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.019 116 L 0.973 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.019 117 I 0.970 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.025 118 R 0.988 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.007 119 H 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 120 L 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 121 A 0.980 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.016 122 I 0.877 0.008 0.001 0.001 0.017 0.002 0.096 123 N 0.378 0.011 0.002 0.001 0.025 0.007 0.576 124 A 0.023 0.003 0.041 0.008 0.067 0.820 0.039 125 Q 0.006 0.002 0.042 0.008 0.079 0.845 0.018 126 T 0.034 0.007 0.046 0.017 0.395 0.326 0.175 127 R 0.049 0.012 0.011 0.008 0.246 0.161 0.513 128 H 0.194 0.061 0.012 0.009 0.240 0.045 0.440 129 R 0.210 0.056 0.013 0.006 0.140 0.036 0.539 130 C 0.158 0.020 0.016 0.008 0.150 0.034 0.615 131 A 0.075 0.039 0.021 0.007 0.090 0.049 0.720 132 L 0.007 0.008 0.003 0.004 0.060 0.005 0.913 133 P 0.006 0.002 0.002 0.010 0.013 0.005 0.962 134 E 0.002 0.001 0.100 0.717 0.035 0.082 0.063 135 G 0.001 0.004 0.068 0.817 0.025 0.051 0.033 136 I 0.001 0.001 0.040 0.926 0.008 0.013 0.012 137 D 0.001 0.001 0.009 0.973 0.003 0.008 0.006 138 R 0.002 0.001 0.010 0.959 0.004 0.018 0.006 139 W 0.002 0.001 0.010 0.958 0.003 0.022 0.004 140 L 0.002 0.001 0.010 0.949 0.006 0.023 0.009 141 E 0.002 0.001 0.020 0.913 0.008 0.045 0.011 142 A 0.003 0.001 0.023 0.815 0.022 0.119 0.017 143 S 0.002 0.002 0.036 0.732 0.028 0.151 0.048 144 G 0.006 0.019 0.044 0.461 0.064 0.280 0.125 145 V 0.012 0.005 0.045 0.151 0.178 0.415 0.194 146 G 0.022 0.006 0.028 0.058 0.375 0.296 0.216 147 K 0.036 0.017 0.015 0.023 0.192 0.053 0.664 148 I 0.131 0.035 0.044 0.034 0.111 0.134 0.512 149 G 0.154 0.012 0.048 0.036 0.178 0.179 0.393 150 S 0.198 0.040 0.038 0.040 0.202 0.074 0.409 151 I 0.195 0.045 0.025 0.118 0.076 0.029 0.512