# TARGET T0361 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0361.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 9.8219 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.049 0.027 0.041 0.035 0.079 0.085 0.006 0.678 2 A 0.081 0.055 0.077 0.082 0.139 0.138 0.012 0.416 3 T 0.155 0.069 0.040 0.061 0.081 0.137 0.020 0.437 4 L 0.155 0.066 0.077 0.037 0.068 0.060 0.010 0.528 5 T 0.075 0.099 0.044 0.067 0.086 0.161 0.010 0.457 6 E 0.076 0.059 0.053 0.025 0.053 0.106 0.015 0.614 7 D 0.057 0.110 0.037 0.019 0.044 0.130 0.012 0.592 8 D 0.089 0.073 0.017 0.009 0.017 0.178 0.013 0.604 9 V 0.075 0.304 0.025 0.011 0.020 0.273 0.010 0.281 10 L 0.060 0.564 0.023 0.012 0.037 0.127 0.011 0.166 11 E 0.049 0.792 0.015 0.010 0.018 0.027 0.006 0.083 12 Q 0.081 0.737 0.010 0.008 0.010 0.011 0.015 0.127 13 L 0.155 0.561 0.060 0.012 0.027 0.016 0.032 0.136 14 D 0.082 0.539 0.019 0.017 0.029 0.042 0.025 0.247 15 A 0.126 0.273 0.037 0.009 0.021 0.047 0.037 0.450 16 Q 0.239 0.198 0.030 0.006 0.010 0.150 0.035 0.332 17 D 0.126 0.137 0.029 0.004 0.003 0.103 0.021 0.577 18 N 0.072 0.158 0.025 0.005 0.005 0.187 0.014 0.535 19 L 0.073 0.464 0.051 0.006 0.011 0.057 0.008 0.330 20 F 0.026 0.376 0.026 0.004 0.010 0.247 0.006 0.305 21 S 0.047 0.417 0.005 0.002 0.004 0.324 0.005 0.196 22 F 0.011 0.954 0.002 0.001 0.001 0.005 0.001 0.027 23 M 0.003 0.966 0.002 0.001 0.001 0.005 0.002 0.020 24 K 0.002 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.009 25 T 0.003 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 26 A 0.009 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.012 27 H 0.005 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 28 S 0.001 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 29 I 0.005 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 30 L 0.009 0.976 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 31 L 0.004 0.979 0.002 0.001 0.001 0.002 0.002 0.010 32 Q 0.015 0.951 0.002 0.001 0.001 0.003 0.005 0.024 33 G 0.062 0.879 0.002 0.001 0.001 0.004 0.010 0.042 34 I 0.033 0.901 0.004 0.001 0.002 0.004 0.006 0.049 35 R 0.006 0.940 0.003 0.001 0.001 0.003 0.003 0.043 36 Q 0.063 0.816 0.004 0.001 0.001 0.003 0.025 0.087 37 F 0.115 0.735 0.021 0.002 0.002 0.006 0.044 0.074 38 L 0.042 0.713 0.056 0.010 0.015 0.011 0.014 0.138 39 P 0.002 0.041 0.007 0.002 0.003 0.010 0.002 0.934 40 S 0.065 0.201 0.033 0.023 0.017 0.087 0.024 0.549 41 L 0.126 0.506 0.070 0.021 0.011 0.019 0.019 0.228 42 F 0.079 0.283 0.207 0.058 0.060 0.075 0.028 0.209 43 V 0.093 0.199 0.182 0.106 0.084 0.051 0.011 0.275 44 D 0.040 0.150 0.059 0.045 0.077 0.096 0.013 0.520 45 N 0.070 0.092 0.028 0.015 0.025 0.153 0.027 0.590 46 D 0.133 0.068 0.021 0.009 0.011 0.110 0.041 0.607 47 E 0.039 0.019 0.012 0.006 0.009 0.524 0.013 0.379 48 E 0.061 0.057 0.005 0.009 0.012 0.426 0.009 0.422 49 I 0.087 0.418 0.016 0.023 0.046 0.125 0.007 0.278 50 V 0.024 0.491 0.020 0.070 0.107 0.081 0.006 0.200 51 E 0.017 0.591 0.018 0.081 0.113 0.025 0.004 0.151 52 Y 0.021 0.442 0.018 0.151 0.191 0.019 0.007 0.152 53 A 0.025 0.489 0.018 0.171 0.177 0.011 0.010 0.099 54 V 0.032 0.332 0.053 0.149 0.256 0.019 0.020 0.139 55 K 0.026 0.168 0.055 0.210 0.200 0.024 0.007 0.310 56 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 57 L 0.036 0.163 0.045 0.105 0.219 0.073 0.014 0.343 58 L 0.233 0.284 0.038 0.038 0.048 0.041 0.026 0.293 59 A 0.227 0.304 0.040 0.048 0.071 0.039 0.033 0.236 60 Q 0.379 0.133 0.040 0.020 0.028 0.052 0.051 0.298 61 S 0.347 0.080 0.031 0.012 0.012 0.037 0.100 0.381 62 G 0.322 0.031 0.088 0.030 0.021 0.053 0.054 0.401 63 P 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.993 64 L 0.017 0.007 0.030 0.022 0.086 0.128 0.003 0.706 65 D 0.062 0.013 0.016 0.010 0.019 0.121 0.004 0.756 66 D 0.064 0.026 0.013 0.014 0.017 0.143 0.005 0.718 67 I 0.273 0.152 0.029 0.033 0.038 0.087 0.006 0.382 68 D 0.057 0.148 0.026 0.034 0.060 0.163 0.006 0.507 69 V 0.025 0.466 0.013 0.055 0.061 0.069 0.004 0.309 70 A 0.020 0.766 0.014 0.024 0.043 0.054 0.004 0.075 71 L 0.022 0.814 0.007 0.013 0.020 0.036 0.006 0.083 72 R 0.002 0.975 0.004 0.004 0.003 0.002 0.001 0.010 73 L 0.005 0.948 0.007 0.005 0.007 0.005 0.003 0.019 74 I 0.005 0.975 0.004 0.003 0.004 0.001 0.002 0.007 75 Y 0.004 0.971 0.005 0.003 0.004 0.002 0.003 0.008 76 A 0.014 0.946 0.005 0.003 0.003 0.003 0.007 0.019 77 L 0.019 0.924 0.014 0.004 0.004 0.002 0.013 0.021 78 G 0.203 0.550 0.023 0.012 0.009 0.016 0.071 0.115 79 K 0.079 0.454 0.143 0.017 0.012 0.026 0.023 0.245 80 M 0.066 0.506 0.052 0.022 0.036 0.070 0.017 0.230 81 D 0.070 0.413 0.052 0.013 0.028 0.070 0.019 0.335 82 K 0.050 0.411 0.034 0.007 0.014 0.059 0.012 0.413 83 W 0.063 0.339 0.018 0.004 0.005 0.236 0.017 0.317 84 L 0.153 0.453 0.008 0.003 0.006 0.135 0.024 0.220 85 Y 0.031 0.850 0.014 0.005 0.007 0.011 0.004 0.080 86 A 0.026 0.533 0.015 0.005 0.009 0.077 0.010 0.325 87 D 0.084 0.562 0.010 0.004 0.006 0.047 0.016 0.271 88 I 0.048 0.812 0.007 0.002 0.007 0.008 0.005 0.112 89 T 0.013 0.618 0.008 0.003 0.005 0.149 0.006 0.198 90 H 0.050 0.662 0.002 0.001 0.002 0.129 0.007 0.146 91 F 0.016 0.960 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.019 92 S 0.002 0.982 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.012 93 Q 0.006 0.966 0.002 0.001 0.001 0.002 0.003 0.021 94 Y 0.036 0.918 0.002 0.001 0.002 0.004 0.007 0.030 95 W 0.011 0.954 0.003 0.001 0.003 0.003 0.003 0.024 96 H 0.009 0.944 0.002 0.001 0.001 0.005 0.005 0.033 97 Y 0.022 0.933 0.004 0.001 0.001 0.003 0.007 0.028 98 L 0.035 0.910 0.005 0.003 0.003 0.003 0.010 0.031 99 N 0.072 0.763 0.020 0.011 0.011 0.015 0.025 0.082 100 E 0.183 0.440 0.037 0.015 0.016 0.024 0.049 0.237 101 Q 0.161 0.252 0.041 0.014 0.017 0.087 0.043 0.386 102 D 0.070 0.080 0.020 0.011 0.012 0.063 0.034 0.709 103 E 0.082 0.074 0.060 0.014 0.017 0.133 0.058 0.563 104 T 0.154 0.019 0.051 0.018 0.025 0.210 0.013 0.509 105 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 106 G 0.031 0.006 0.030 0.037 0.101 0.175 0.005 0.614 107 F 0.235 0.018 0.104 0.057 0.068 0.085 0.007 0.425 108 A 0.092 0.029 0.051 0.066 0.129 0.146 0.005 0.482 109 D 0.086 0.021 0.039 0.030 0.089 0.112 0.006 0.616 110 D 0.062 0.023 0.021 0.009 0.021 0.077 0.005 0.782 111 I 0.071 0.023 0.013 0.008 0.012 0.588 0.009 0.277 112 T 0.132 0.071 0.013 0.008 0.020 0.527 0.016 0.214 113 W 0.046 0.624 0.033 0.016 0.035 0.035 0.004 0.208 114 D 0.015 0.425 0.018 0.012 0.029 0.128 0.006 0.367 115 F 0.092 0.386 0.009 0.005 0.014 0.079 0.016 0.398 116 I 0.058 0.840 0.005 0.003 0.010 0.014 0.005 0.065 117 S 0.030 0.802 0.007 0.006 0.008 0.029 0.013 0.104 118 N 0.232 0.503 0.006 0.003 0.003 0.017 0.053 0.183 119 V 0.341 0.457 0.054 0.007 0.006 0.013 0.036 0.086 120 N 0.064 0.518 0.137 0.032 0.023 0.055 0.031 0.141 121 S 0.029 0.381 0.127 0.019 0.035 0.039 0.012 0.360 122 I 0.067 0.436 0.167 0.030 0.062 0.071 0.013 0.156 123 T 0.051 0.574 0.109 0.027 0.027 0.078 0.013 0.121 124 R 0.075 0.492 0.113 0.014 0.023 0.035 0.024 0.224 125 N 0.140 0.344 0.085 0.018 0.022 0.053 0.039 0.300 126 A 0.179 0.155 0.069 0.016 0.019 0.054 0.041 0.467 127 T 0.081 0.121 0.059 0.015 0.023 0.156 0.021 0.525 128 L 0.131 0.138 0.060 0.015 0.035 0.189 0.018 0.414 129 Y 0.086 0.241 0.038 0.013 0.024 0.143 0.010 0.445 130 D 0.056 0.238 0.028 0.010 0.018 0.160 0.011 0.479 131 A 0.071 0.441 0.018 0.009 0.014 0.095 0.010 0.344 132 L 0.094 0.614 0.014 0.009 0.028 0.059 0.010 0.172 133 K 0.070 0.691 0.009 0.011 0.017 0.051 0.014 0.137 134 A 0.078 0.760 0.010 0.007 0.011 0.020 0.014 0.100 135 M 0.170 0.566 0.011 0.008 0.012 0.019 0.030 0.185 136 K 0.214 0.313 0.020 0.009 0.010 0.057 0.049 0.329 137 F 0.161 0.285 0.046 0.011 0.016 0.058 0.041 0.382 138 A 0.133 0.146 0.024 0.009 0.013 0.085 0.024 0.567 139 D 0.057 0.099 0.032 0.010 0.012 0.110 0.014 0.665 140 F 0.173 0.197 0.051 0.021 0.043 0.133 0.013 0.369 141 A 0.087 0.348 0.059 0.036 0.066 0.160 0.007 0.238 142 V 0.030 0.571 0.018 0.037 0.051 0.049 0.005 0.238 143 W 0.061 0.633 0.021 0.027 0.063 0.033 0.008 0.153 144 S 0.062 0.592 0.010 0.026 0.036 0.043 0.015 0.217 145 E 0.046 0.640 0.016 0.014 0.028 0.028 0.012 0.215 146 A 0.044 0.762 0.006 0.009 0.016 0.028 0.010 0.126 147 R 0.048 0.783 0.005 0.007 0.012 0.025 0.014 0.106 148 F 0.034 0.842 0.008 0.006 0.009 0.010 0.010 0.081 149 S 0.040 0.782 0.011 0.006 0.006 0.017 0.019 0.118 150 G 0.177 0.491 0.013 0.008 0.005 0.017 0.046 0.244 151 M 0.139 0.378 0.045 0.011 0.012 0.056 0.023 0.336 152 V 0.041 0.492 0.060 0.045 0.042 0.056 0.013 0.250 153 K 0.020 0.460 0.065 0.038 0.050 0.057 0.007 0.303 154 T 0.010 0.522 0.025 0.022 0.029 0.059 0.005 0.328 155 A 0.016 0.743 0.020 0.014 0.019 0.037 0.005 0.145 156 L 0.010 0.884 0.006 0.009 0.008 0.021 0.004 0.058 157 T 0.016 0.910 0.005 0.006 0.008 0.017 0.004 0.035 158 L 0.007 0.970 0.002 0.004 0.004 0.003 0.001 0.009 159 A 0.003 0.978 0.001 0.003 0.003 0.002 0.001 0.008 160 V 0.008 0.953 0.003 0.005 0.006 0.003 0.004 0.018 161 T 0.003 0.982 0.002 0.002 0.002 0.001 0.001 0.006 162 T 0.004 0.969 0.001 0.002 0.003 0.002 0.002 0.017 163 T 0.006 0.973 0.001 0.001 0.002 0.002 0.002 0.013 164 L 0.006 0.975 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.012 165 K 0.007 0.973 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.012 166 E 0.090 0.827 0.003 0.002 0.001 0.003 0.037 0.038 167 L 0.087 0.829 0.013 0.003 0.003 0.002 0.032 0.030 168 T 0.068 0.504 0.037 0.022 0.028 0.033 0.028 0.278 169 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999