# TARGET T0361 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0361.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 9.19624 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.063 0.022 0.045 0.030 0.067 0.085 0.007 0.681 2 A 0.053 0.026 0.048 0.041 0.070 0.146 0.010 0.606 3 T 0.097 0.031 0.025 0.026 0.039 0.115 0.013 0.655 4 L 0.134 0.043 0.046 0.021 0.039 0.076 0.008 0.633 5 T 0.078 0.066 0.041 0.046 0.059 0.178 0.010 0.524 6 E 0.059 0.047 0.044 0.020 0.037 0.123 0.010 0.660 7 D 0.061 0.109 0.041 0.020 0.043 0.149 0.011 0.565 8 D 0.087 0.076 0.021 0.010 0.018 0.141 0.012 0.634 9 V 0.069 0.221 0.030 0.012 0.022 0.334 0.010 0.303 10 L 0.085 0.429 0.027 0.014 0.047 0.211 0.013 0.174 11 E 0.056 0.777 0.016 0.011 0.022 0.031 0.005 0.081 12 Q 0.063 0.734 0.011 0.010 0.014 0.013 0.013 0.142 13 L 0.169 0.510 0.060 0.014 0.033 0.020 0.034 0.160 14 D 0.091 0.527 0.018 0.018 0.032 0.042 0.025 0.247 15 A 0.124 0.266 0.037 0.010 0.024 0.046 0.037 0.456 16 Q 0.231 0.196 0.029 0.006 0.011 0.151 0.035 0.340 17 D 0.128 0.134 0.028 0.004 0.004 0.101 0.021 0.581 18 N 0.071 0.159 0.025 0.005 0.005 0.187 0.014 0.533 19 L 0.072 0.460 0.052 0.006 0.012 0.059 0.008 0.333 20 F 0.026 0.375 0.025 0.004 0.010 0.245 0.006 0.309 21 S 0.047 0.419 0.005 0.002 0.004 0.319 0.005 0.199 22 F 0.011 0.954 0.002 0.001 0.001 0.005 0.001 0.027 23 M 0.003 0.966 0.002 0.001 0.001 0.005 0.002 0.020 24 K 0.002 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.009 25 T 0.003 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 26 A 0.009 0.973 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.012 27 H 0.005 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 28 S 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 29 I 0.005 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.010 30 L 0.009 0.976 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 31 L 0.005 0.978 0.002 0.001 0.001 0.002 0.002 0.010 32 Q 0.017 0.948 0.002 0.001 0.001 0.003 0.006 0.024 33 G 0.073 0.864 0.002 0.001 0.001 0.005 0.012 0.045 34 I 0.038 0.890 0.005 0.001 0.002 0.004 0.006 0.053 35 R 0.007 0.933 0.004 0.001 0.001 0.003 0.004 0.047 36 Q 0.070 0.793 0.005 0.002 0.001 0.004 0.029 0.095 37 F 0.161 0.660 0.026 0.003 0.003 0.007 0.060 0.078 38 L 0.054 0.637 0.097 0.015 0.023 0.015 0.019 0.140 39 P 0.001 0.022 0.008 0.002 0.002 0.009 0.002 0.953 40 S 0.086 0.134 0.087 0.041 0.027 0.079 0.041 0.505 41 L 0.266 0.179 0.176 0.037 0.021 0.026 0.034 0.262 42 F 0.036 0.046 0.540 0.081 0.077 0.050 0.013 0.157 43 V 0.035 0.034 0.204 0.131 0.122 0.059 0.005 0.409 44 D 0.030 0.041 0.165 0.137 0.196 0.084 0.008 0.340 45 N 0.033 0.021 0.049 0.024 0.045 0.225 0.011 0.593 46 D 0.077 0.021 0.031 0.014 0.032 0.201 0.021 0.603 47 E 0.064 0.021 0.013 0.009 0.014 0.193 0.013 0.672 48 E 0.041 0.025 0.005 0.007 0.009 0.523 0.010 0.380 49 I 0.145 0.130 0.015 0.023 0.045 0.224 0.016 0.403 50 V 0.039 0.448 0.019 0.050 0.097 0.090 0.004 0.254 51 E 0.016 0.488 0.025 0.103 0.144 0.038 0.004 0.182 52 Y 0.020 0.409 0.024 0.150 0.155 0.022 0.007 0.212 53 A 0.026 0.411 0.019 0.185 0.216 0.012 0.011 0.120 54 V 0.036 0.248 0.060 0.172 0.294 0.022 0.017 0.152 55 K 0.025 0.141 0.049 0.211 0.212 0.025 0.006 0.330 56 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 57 L 0.034 0.155 0.045 0.108 0.214 0.077 0.014 0.353 58 L 0.240 0.283 0.038 0.039 0.047 0.040 0.025 0.288 59 A 0.219 0.326 0.041 0.052 0.077 0.036 0.031 0.217 60 Q 0.365 0.143 0.041 0.022 0.031 0.052 0.050 0.296 61 S 0.342 0.080 0.031 0.012 0.012 0.035 0.103 0.385 62 G 0.328 0.032 0.084 0.030 0.021 0.052 0.054 0.400 63 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.994 64 L 0.017 0.007 0.030 0.024 0.088 0.124 0.004 0.707 65 D 0.062 0.012 0.016 0.011 0.020 0.113 0.004 0.762 66 D 0.061 0.024 0.014 0.016 0.020 0.135 0.005 0.725 67 I 0.270 0.137 0.032 0.038 0.044 0.088 0.006 0.386 68 D 0.058 0.126 0.026 0.039 0.068 0.163 0.006 0.514 69 V 0.027 0.408 0.015 0.067 0.073 0.073 0.004 0.332 70 A 0.024 0.709 0.017 0.032 0.059 0.064 0.005 0.089 71 L 0.026 0.763 0.009 0.018 0.027 0.045 0.007 0.104 72 R 0.003 0.965 0.006 0.005 0.004 0.002 0.001 0.014 73 L 0.006 0.928 0.010 0.008 0.011 0.007 0.004 0.026 74 I 0.006 0.967 0.005 0.004 0.006 0.002 0.002 0.008 75 Y 0.005 0.962 0.008 0.004 0.006 0.002 0.003 0.011 76 A 0.016 0.932 0.007 0.004 0.004 0.004 0.008 0.025 77 L 0.021 0.907 0.018 0.005 0.005 0.003 0.014 0.027 78 G 0.206 0.519 0.026 0.014 0.011 0.020 0.073 0.131 79 K 0.079 0.413 0.147 0.018 0.014 0.028 0.023 0.277 80 M 0.067 0.481 0.055 0.025 0.040 0.074 0.017 0.242 81 D 0.069 0.400 0.053 0.014 0.029 0.072 0.018 0.345 82 K 0.051 0.407 0.034 0.007 0.015 0.060 0.013 0.413 83 W 0.065 0.341 0.019 0.005 0.005 0.234 0.018 0.312 84 L 0.156 0.443 0.008 0.003 0.006 0.135 0.024 0.224 85 Y 0.032 0.843 0.015 0.005 0.007 0.011 0.004 0.082 86 A 0.027 0.520 0.016 0.006 0.010 0.081 0.010 0.330 87 D 0.081 0.561 0.010 0.004 0.006 0.050 0.016 0.272 88 I 0.046 0.812 0.007 0.002 0.007 0.008 0.005 0.113 89 T 0.013 0.609 0.008 0.003 0.005 0.154 0.006 0.202 90 H 0.052 0.661 0.002 0.001 0.002 0.132 0.007 0.143 91 F 0.016 0.960 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.018 92 S 0.002 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 93 Q 0.006 0.966 0.002 0.001 0.001 0.002 0.003 0.021 94 Y 0.039 0.914 0.002 0.001 0.002 0.004 0.007 0.031 95 W 0.011 0.951 0.003 0.001 0.003 0.003 0.003 0.025 96 H 0.009 0.941 0.002 0.001 0.001 0.005 0.005 0.036 97 Y 0.022 0.935 0.004 0.001 0.001 0.003 0.007 0.028 98 L 0.036 0.909 0.004 0.003 0.003 0.003 0.010 0.032 99 N 0.074 0.764 0.020 0.011 0.011 0.015 0.024 0.082 100 E 0.183 0.444 0.037 0.014 0.015 0.023 0.049 0.235 101 Q 0.164 0.252 0.041 0.013 0.016 0.083 0.044 0.387 102 D 0.072 0.079 0.021 0.010 0.011 0.064 0.036 0.708 103 E 0.082 0.073 0.062 0.014 0.016 0.135 0.058 0.560 104 T 0.146 0.019 0.054 0.018 0.024 0.207 0.013 0.520 105 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 106 G 0.032 0.006 0.033 0.040 0.106 0.175 0.005 0.603 107 F 0.212 0.018 0.109 0.059 0.069 0.084 0.007 0.442 108 A 0.091 0.031 0.059 0.071 0.139 0.135 0.005 0.468 109 D 0.087 0.022 0.044 0.031 0.091 0.119 0.006 0.598 110 D 0.062 0.024 0.023 0.010 0.021 0.076 0.005 0.780 111 I 0.078 0.025 0.016 0.008 0.013 0.546 0.010 0.303 112 T 0.122 0.065 0.016 0.008 0.020 0.564 0.016 0.190 113 W 0.050 0.613 0.038 0.017 0.036 0.045 0.004 0.197 114 D 0.018 0.429 0.020 0.012 0.028 0.134 0.007 0.353 115 F 0.109 0.369 0.011 0.005 0.015 0.097 0.017 0.378 116 I 0.066 0.822 0.007 0.003 0.011 0.016 0.006 0.069 117 S 0.026 0.822 0.008 0.005 0.008 0.024 0.012 0.095 118 N 0.235 0.466 0.008 0.003 0.004 0.019 0.062 0.203 119 V 0.396 0.409 0.050 0.007 0.006 0.011 0.038 0.083 120 N 0.064 0.438 0.189 0.032 0.027 0.071 0.033 0.147 121 S 0.037 0.368 0.122 0.022 0.041 0.046 0.012 0.351 122 I 0.079 0.374 0.152 0.027 0.061 0.087 0.015 0.206 123 T 0.088 0.449 0.090 0.025 0.025 0.129 0.019 0.174 124 R 0.102 0.449 0.112 0.013 0.019 0.046 0.025 0.233 125 N 0.135 0.284 0.064 0.015 0.020 0.056 0.039 0.387 126 A 0.143 0.087 0.043 0.009 0.012 0.048 0.031 0.626 127 T 0.085 0.095 0.053 0.013 0.018 0.186 0.020 0.531 128 L 0.124 0.087 0.041 0.010 0.028 0.195 0.014 0.500 129 Y 0.074 0.229 0.043 0.015 0.028 0.117 0.007 0.488 130 D 0.037 0.220 0.024 0.011 0.020 0.246 0.008 0.433 131 A 0.087 0.515 0.017 0.009 0.016 0.070 0.008 0.278 132 L 0.068 0.748 0.011 0.009 0.022 0.031 0.007 0.103 133 K 0.100 0.634 0.012 0.013 0.019 0.057 0.021 0.143 134 A 0.085 0.723 0.011 0.006 0.010 0.020 0.016 0.128 135 M 0.181 0.571 0.012 0.007 0.011 0.019 0.031 0.168 136 K 0.218 0.323 0.022 0.008 0.009 0.078 0.059 0.282 137 F 0.183 0.285 0.044 0.010 0.013 0.051 0.043 0.372 138 A 0.162 0.167 0.038 0.011 0.016 0.076 0.022 0.508 139 D 0.052 0.118 0.046 0.016 0.018 0.110 0.015 0.626 140 F 0.113 0.204 0.065 0.026 0.051 0.094 0.011 0.436 141 A 0.084 0.288 0.059 0.042 0.076 0.170 0.008 0.275 142 V 0.036 0.505 0.021 0.038 0.047 0.058 0.006 0.288 143 W 0.058 0.620 0.024 0.026 0.062 0.039 0.008 0.163 144 S 0.054 0.605 0.010 0.023 0.031 0.045 0.013 0.219 145 E 0.044 0.660 0.013 0.012 0.024 0.027 0.011 0.209 146 A 0.038 0.799 0.005 0.008 0.014 0.023 0.008 0.104 147 R 0.043 0.811 0.005 0.007 0.011 0.020 0.013 0.090 148 F 0.031 0.860 0.008 0.006 0.009 0.009 0.009 0.069 149 S 0.040 0.794 0.010 0.006 0.007 0.016 0.019 0.109 150 G 0.173 0.513 0.012 0.008 0.005 0.017 0.044 0.228 151 M 0.144 0.398 0.043 0.010 0.012 0.054 0.024 0.314 152 V 0.042 0.513 0.058 0.043 0.040 0.052 0.013 0.239 153 K 0.020 0.471 0.063 0.038 0.051 0.055 0.007 0.294 154 T 0.011 0.530 0.025 0.023 0.030 0.058 0.005 0.319 155 A 0.018 0.737 0.020 0.015 0.020 0.038 0.006 0.147 156 L 0.011 0.877 0.007 0.010 0.009 0.022 0.004 0.060 157 T 0.017 0.902 0.006 0.007 0.009 0.018 0.004 0.037 158 L 0.009 0.964 0.002 0.005 0.005 0.003 0.001 0.010 159 A 0.004 0.973 0.001 0.004 0.004 0.002 0.002 0.010 160 V 0.010 0.942 0.003 0.006 0.008 0.004 0.005 0.022 161 T 0.004 0.976 0.002 0.003 0.003 0.001 0.001 0.009 162 T 0.005 0.959 0.002 0.003 0.003 0.003 0.003 0.022 163 T 0.007 0.968 0.001 0.001 0.002 0.003 0.003 0.015 164 L 0.006 0.972 0.001 0.001 0.002 0.002 0.002 0.013 165 K 0.009 0.966 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.015 166 E 0.101 0.809 0.004 0.002 0.002 0.004 0.038 0.040 167 L 0.093 0.815 0.014 0.004 0.004 0.002 0.034 0.034 168 T 0.068 0.493 0.042 0.024 0.030 0.035 0.028 0.279 169 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999