# TARGET T0360 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0360.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 48.0141 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.030 0.088 0.008 0.017 0.016 0.096 0.141 0.604 2 T 0.045 0.605 0.006 0.006 0.008 0.034 0.138 0.158 3 Q 0.037 0.868 0.001 0.001 0.002 0.011 0.016 0.065 4 E 0.045 0.698 0.023 0.010 0.009 0.027 0.065 0.123 5 T 0.049 0.805 0.007 0.006 0.006 0.019 0.028 0.079 6 A 0.113 0.702 0.015 0.003 0.003 0.022 0.027 0.116 7 L 0.055 0.659 0.023 0.007 0.007 0.028 0.050 0.171 8 G 0.087 0.450 0.023 0.005 0.006 0.037 0.080 0.311 9 A 0.093 0.256 0.026 0.011 0.009 0.059 0.173 0.372 10 A 0.083 0.286 0.034 0.009 0.009 0.079 0.131 0.368 11 L 0.109 0.278 0.011 0.004 0.007 0.054 0.053 0.484 12 K 0.087 0.192 0.010 0.006 0.008 0.067 0.038 0.593 13 S 0.061 0.143 0.014 0.009 0.011 0.068 0.247 0.447 14 A 0.092 0.240 0.017 0.012 0.015 0.099 0.130 0.396 15 V 0.104 0.102 0.025 0.020 0.022 0.087 0.121 0.519 16 Q 0.034 0.145 0.016 0.012 0.011 0.094 0.068 0.620 17 T 0.066 0.426 0.010 0.005 0.007 0.061 0.031 0.395 18 M 0.050 0.538 0.010 0.007 0.005 0.057 0.022 0.310 19 S 0.038 0.782 0.002 0.001 0.002 0.016 0.043 0.116 20 K 0.016 0.311 0.001 0.001 0.001 0.007 0.637 0.026 21 K 0.003 0.796 0.002 0.001 0.001 0.006 0.170 0.020 22 K 0.003 0.956 0.001 0.001 0.002 0.004 0.013 0.021 23 Q 0.003 0.976 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.007 24 T 0.005 0.968 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.003 25 E 0.009 0.909 0.005 0.001 0.001 0.003 0.054 0.017 26 M 0.035 0.578 0.038 0.003 0.003 0.017 0.284 0.041 27 I 0.241 0.465 0.027 0.002 0.002 0.016 0.201 0.045 28 A 0.336 0.223 0.025 0.002 0.002 0.031 0.105 0.276 29 D 0.010 0.052 0.021 0.002 0.002 0.044 0.038 0.831 30 H 0.037 0.061 0.024 0.003 0.003 0.106 0.028 0.738 31 I 0.511 0.073 0.020 0.004 0.003 0.068 0.048 0.273 32 Y 0.199 0.038 0.021 0.002 0.003 0.086 0.029 0.621 33 G 0.054 0.060 0.035 0.004 0.008 0.093 0.031 0.715 34 K 0.017 0.034 0.073 0.010 0.013 0.107 0.049 0.697 35 Y 0.066 0.046 0.181 0.039 0.027 0.102 0.070 0.468 36 D 0.356 0.042 0.063 0.016 0.016 0.069 0.080 0.357 37 V 0.151 0.020 0.052 0.013 0.015 0.077 0.061 0.609 38 F 0.080 0.008 0.018 0.007 0.016 0.068 0.026 0.778 39 K 0.061 0.004 0.015 0.014 0.014 0.086 0.035 0.770 40 R 0.018 0.007 0.020 0.021 0.032 0.151 0.026 0.725 41 F 0.021 0.006 0.031 0.009 0.021 0.087 0.027 0.799 42 K 0.074 0.028 0.103 0.100 0.078 0.164 0.069 0.384 43 P 0.011 0.016 0.137 0.020 0.040 0.081 0.058 0.638 44 L 0.038 0.038 0.202 0.076 0.092 0.133 0.091 0.331 45 A 0.027 0.038 0.394 0.043 0.063 0.048 0.211 0.175 46 L 0.029 0.120 0.268 0.029 0.044 0.072 0.107 0.331 47 G 0.015 0.147 0.457 0.046 0.050 0.050 0.069 0.166 48 I 0.023 0.597 0.101 0.015 0.021 0.041 0.059 0.143 49 D 0.043 0.888 0.016 0.001 0.002 0.005 0.027 0.016 50 Q 0.033 0.739 0.026 0.003 0.002 0.018 0.124 0.056 51 D 0.073 0.664 0.053 0.003 0.002 0.017 0.114 0.074 52 L 0.448 0.361 0.022 0.001 0.002 0.013 0.099 0.054 53 I 0.679 0.071 0.015 0.001 0.001 0.020 0.061 0.152 54 A 0.021 0.014 0.008 0.002 0.002 0.038 0.070 0.845 55 A 0.025 0.016 0.003 0.001 0.001 0.041 0.008 0.907 56 L 0.391 0.040 0.011 0.003 0.003 0.092 0.069 0.392 57 P 0.094 0.062 0.004 0.001 0.001 0.090 0.016 0.732 58 Q 0.051 0.159 0.005 0.001 0.001 0.065 0.019 0.700 59 Y 0.016 0.360 0.011 0.001 0.001 0.075 0.045 0.490 60 D 0.008 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.003 61 A 0.004 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 62 A 0.002 0.933 0.006 0.001 0.001 0.003 0.046 0.009 63 L 0.002 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.002 64 I 0.003 0.968 0.001 0.001 0.001 0.001 0.025 0.002 65 A 0.002 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.003 66 R 0.012 0.489 0.011 0.001 0.002 0.008 0.446 0.032 67 V 0.026 0.561 0.015 0.003 0.002 0.013 0.359 0.021 68 L 0.155 0.495 0.019 0.004 0.006 0.030 0.154 0.137 69 A 0.057 0.151 0.015 0.006 0.007 0.064 0.094 0.605 70 N 0.064 0.105 0.033 0.008 0.017 0.111 0.110 0.552 71 H 0.113 0.085 0.044 0.017 0.017 0.152 0.108 0.465 72 C 0.019 0.043 0.039 0.012 0.017 0.155 0.050 0.665 73 R 0.017 0.129 0.021 0.006 0.008 0.103 0.032 0.683 74 R 0.033 0.790 0.006 0.004 0.003 0.023 0.041 0.100 75 P 0.016 0.936 0.004 0.001 0.001 0.005 0.010 0.027 76 R 0.011 0.861 0.009 0.008 0.010 0.011 0.039 0.051 77 Y 0.011 0.880 0.006 0.005 0.006 0.007 0.064 0.021 78 L 0.021 0.907 0.005 0.005 0.005 0.004 0.035 0.017 79 K 0.044 0.681 0.016 0.032 0.038 0.017 0.075 0.098 80 A 0.031 0.108 0.055 0.043 0.054 0.048 0.451 0.210 81 L 0.262 0.064 0.041 0.050 0.043 0.073 0.201 0.265 82 A 0.361 0.012 0.013 0.016 0.019 0.053 0.071 0.456 83 R 0.010 0.002 0.004 0.004 0.008 0.074 0.010 0.888 84 G 0.034 0.003 0.015 0.014 0.047 0.109 0.031 0.747 85 G 0.015 0.002 0.024 0.068 0.064 0.117 0.037 0.675 86 K 0.006 0.001 0.154 0.124 0.152 0.102 0.028 0.433 87 R 0.004 0.001 0.102 0.106 0.154 0.073 0.051 0.509 88 F 0.006 0.001 0.232 0.189 0.115 0.061 0.046 0.350 89 D 0.245 0.004 0.158 0.066 0.075 0.063 0.081 0.308 90 L 0.285 0.005 0.044 0.058 0.044 0.081 0.058 0.426 91 N 0.017 0.003 0.032 0.012 0.041 0.093 0.012 0.789 92 N 0.017 0.003 0.033 0.015 0.060 0.102 0.024 0.747 93 R 0.048 0.004 0.052 0.179 0.133 0.135 0.080 0.370 94 F 0.107 0.004 0.025 0.051 0.062 0.073 0.032 0.646 95 K 0.044 0.002 0.034 0.073 0.161 0.080 0.038 0.570 96 G 0.009 0.003 0.043 0.063 0.137 0.090 0.027 0.628 97 E 0.004 0.008 0.023 0.082 0.130 0.109 0.012 0.633 98 V 0.004 0.024 0.023 0.041 0.027 0.072 0.011 0.797 99 T 0.070 0.868 0.002 0.004 0.002 0.005 0.027 0.021 100 P 0.038 0.941 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.011 101 E 0.012 0.939 0.002 0.002 0.002 0.004 0.015 0.025 102 E 0.012 0.967 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.006 103 Q 0.027 0.921 0.002 0.001 0.001 0.004 0.031 0.014 104 A 0.032 0.479 0.032 0.007 0.005 0.013 0.350 0.080 105 I 0.139 0.369 0.015 0.003 0.004 0.026 0.307 0.137 106 A 0.580 0.109 0.016 0.002 0.001 0.030 0.111 0.151 107 Q 0.057 0.079 0.006 0.003 0.003 0.050 0.053 0.750 108 N 0.012 0.097 0.001 0.001 0.001 0.029 0.009 0.851 109 H 0.068 0.566 0.005 0.001 0.001 0.059 0.051 0.248 110 P 0.056 0.777 0.007 0.002 0.001 0.026 0.040 0.091 111 F 0.028 0.908 0.004 0.001 0.001 0.007 0.009 0.043 112 V 0.010 0.967 0.004 0.001 0.001 0.002 0.003 0.013 113 Q 0.020 0.943 0.014 0.001 0.001 0.002 0.011 0.010 114 Q 0.012 0.956 0.007 0.001 0.001 0.002 0.010 0.012 115 A 0.078 0.853 0.011 0.001 0.001 0.004 0.027 0.026 116 L 0.052 0.340 0.025 0.001 0.001 0.010 0.512 0.060 117 Q 0.032 0.717 0.004 0.001 0.001 0.011 0.100 0.136 118 Q 0.057 0.761 0.004 0.001 0.001 0.011 0.041 0.127 119 Q 0.013 0.869 0.002 0.001 0.001 0.009 0.017 0.088 120 S 0.025 0.925 0.001 0.001 0.001 0.004 0.009 0.036 121 A 0.010 0.970 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.012 122 Q 0.028 0.934 0.004 0.001 0.001 0.003 0.012 0.017 123 A 0.044 0.440 0.040 0.001 0.001 0.013 0.410 0.054 124 A 0.052 0.764 0.014 0.001 0.001 0.011 0.096 0.062 125 A 0.208 0.292 0.053 0.001 0.001 0.023 0.240 0.183 126 E 0.041 0.347 0.010 0.001 0.001 0.050 0.107 0.442 127 T 0.058 0.450 0.006 0.001 0.001 0.033 0.029 0.423 128 L 0.030 0.655 0.004 0.001 0.001 0.037 0.015 0.258 129 S 0.040 0.847 0.005 0.001 0.001 0.013 0.020 0.074 130 V 0.060 0.878 0.005 0.001 0.001 0.007 0.012 0.038 131 E 0.046 0.881 0.014 0.001 0.001 0.007 0.012 0.038 132 A 0.135 0.720 0.018 0.001 0.001 0.011 0.023 0.091 133 E 0.145 0.251 0.037 0.002 0.002 0.041 0.253 0.269 134 A 0.041 0.098 0.022 0.002 0.002 0.049 0.439 0.347 135 A 0.064 0.145 0.014 0.003 0.003 0.068 0.126 0.578 136 E 0.143 0.124 0.010 0.005 0.005 0.075 0.039 0.598 137 S 0.106 0.044 0.007 0.004 0.005 0.077 0.039 0.718 138 S 0.096 0.025 0.008 0.004 0.005 0.105 0.053 0.704 139 A 0.136 0.024 0.009 0.006 0.007 0.109 0.071 0.639 140 A 0.055 0.018 0.011 0.006 0.009 0.119 0.050 0.733 141 E 0.036 0.017 0.023 0.011 0.022 0.119 0.045 0.727