This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA S A 2 2 NATAA M A 3 3 NATAA S A 4 4 NATAA E A 5 5 NATAA T A 6 6 NATAA F A 7 7 NATAA D A 8 8 NATAA V A 9 9 NATAA E A 10 10 NATAA L A 11 11 NATAA T A 12 12 NATAA K A 13 13 NATAA N A 14 14 NATAA V A 15 15 NATAA Q A 16 16 NATAA G A 17 17 NATAA L A 18 18 NATAA G A 19 19 NATAA I A 20 20 NATAA T A 21 21 NATAA I A 22 22 NATAA A A 23 23 NATAA G A 24 24 NATAA Y A 25 25 NATAA I A 26 26 NATAA G A 27 27 NATAA D A 28 28 NATAA K A 29 29 NATAA K A 30 30 NATAA L A 31 31 NATAA E A 32 32 NATRO P A 33 33 NATAA S A 34 34 NATAA G A 35 35 NATAA I A 36 36 NATAA F A 37 37 NATAA V A 38 38 NATAA K A 39 39 NATAA S A 40 40 NATAA I A 41 41 NATAA T A 42 42 NATAA K A 43 43 NATAA S A 44 44 NATAA S A 45 45 NATAA A A 46 46 NATAA V A 47 47 NATAA E A 48 48 NATAA H A 49 49 NATAA D A 50 50 NATAA G A 51 51 NATAA R A 52 52 NATAA I A 53 53 NATAA Q A 54 54 NATAA I A 55 55 NATAA G A 56 56 NATAA D A 57 57 NATAA Q A 58 58 NATAA I A 59 59 NATAA I A 60 60 NATAA A A 61 61 NATAA V A 62 62 NATAA D A 63 63 NATAA G A 64 64 NATAA T A 65 65 NATAA N A 66 66 NATAA L A 67 67 NATAA Q A 68 68 NATAA G A 69 69 NATAA F A 70 70 NATAA T A 71 71 NATAA N A 72 72 NATAA Q A 73 73 NATAA Q A 74 74 NATAA A A 75 75 NATAA V A 76 76 NATAA E A 77 77 NATAA V A 78 78 NATAA L A 79 79 NATAA R A 80 80 NATAA H A 81 81 NATAA T A 82 82 NATAA G A 83 83 NATAA Q A 84 84 NATAA T A 85 85 NATAA V A 86 86 NATAA L A 87 87 NATAA L A 88 88 NATAA T A 89 89 NATAA L A 90 90 NATAA M A 91 91 NATAA R A 92 92 NATAA R A 93 93 NATAA G A 94 94 NATAA E A 95 95 NATAA T A 96 96 NATAA S A 97 97 NATAA V