# TARGET T0358 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0358.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 6.03747 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.070 0.011 0.079 0.040 0.067 0.093 0.013 0.626 2 T 0.047 0.012 0.070 0.060 0.086 0.118 0.009 0.599 3 Q 0.023 0.009 0.086 0.048 0.084 0.065 0.005 0.679 4 S 0.032 0.016 0.053 0.046 0.079 0.120 0.006 0.649 5 V 0.149 0.021 0.184 0.114 0.122 0.088 0.025 0.297 6 L 0.081 0.020 0.102 0.053 0.076 0.056 0.018 0.594 7 L 0.080 0.012 0.224 0.144 0.201 0.052 0.015 0.272 8 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 9 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 10 G 0.091 0.001 0.018 0.020 0.033 0.086 0.005 0.747 11 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 12 F 0.069 0.007 0.030 0.033 0.061 0.173 0.003 0.626 13 T 0.177 0.039 0.026 0.024 0.034 0.124 0.003 0.572 14 R 0.063 0.074 0.015 0.022 0.064 0.073 0.004 0.685 15 R 0.050 0.130 0.010 0.016 0.025 0.281 0.007 0.482 16 Q 0.139 0.398 0.009 0.013 0.019 0.177 0.017 0.228 17 A 0.037 0.851 0.005 0.015 0.013 0.013 0.006 0.061 18 Q 0.060 0.608 0.016 0.034 0.053 0.045 0.016 0.169 19 A 0.050 0.639 0.025 0.071 0.075 0.028 0.009 0.103 20 V 0.040 0.661 0.017 0.090 0.105 0.013 0.013 0.059 21 T 0.035 0.512 0.058 0.118 0.172 0.018 0.010 0.077 22 T 0.029 0.397 0.043 0.201 0.179 0.022 0.016 0.113 23 T 0.059 0.237 0.058 0.143 0.196 0.047 0.027 0.235 24 Y 0.047 0.239 0.068 0.174 0.247 0.052 0.019 0.152 25 S 0.073 0.143 0.090 0.202 0.248 0.073 0.031 0.140 26 N 0.148 0.034 0.062 0.153 0.186 0.065 0.060 0.291 27 I 0.109 0.017 0.186 0.265 0.205 0.046 0.019 0.152 28 T 0.013 0.009 0.192 0.229 0.260 0.077 0.007 0.213 29 L 0.015 0.004 0.189 0.219 0.346 0.045 0.004 0.178 30 E 0.016 0.004 0.177 0.194 0.238 0.172 0.004 0.196 31 D 0.018 0.007 0.085 0.109 0.230 0.097 0.006 0.448 32 D 0.022 0.004 0.045 0.026 0.067 0.169 0.007 0.660 33 Q 0.008 0.001 0.002 0.003 0.006 0.848 0.005 0.126 34 G 0.180 0.009 0.010 0.022 0.020 0.313 0.054 0.393 35 S 0.252 0.010 0.018 0.029 0.047 0.446 0.013 0.185 36 H 0.039 0.008 0.036 0.113 0.136 0.242 0.009 0.417 37 F 0.036 0.005 0.026 0.220 0.551 0.077 0.004 0.081 38 R 0.011 0.002 0.016 0.355 0.574 0.015 0.001 0.025 39 L 0.003 0.002 0.018 0.370 0.538 0.010 0.001 0.058 40 V 0.002 0.001 0.027 0.382 0.557 0.009 0.001 0.021 41 V 0.003 0.002 0.029 0.397 0.507 0.012 0.001 0.050 42 R 0.002 0.003 0.033 0.370 0.527 0.014 0.001 0.050 43 D 0.007 0.004 0.026 0.212 0.486 0.040 0.005 0.222 44 T 0.032 0.004 0.025 0.068 0.166 0.125 0.012 0.567 45 E 0.029 0.002 0.006 0.023 0.031 0.448 0.018 0.442 46 G 0.117 0.016 0.022 0.107 0.048 0.120 0.126 0.444 47 R 0.464 0.002 0.026 0.034 0.081 0.279 0.010 0.104 48 M 0.005 0.001 0.017 0.089 0.068 0.047 0.001 0.772 49 V 0.005 0.001 0.033 0.330 0.590 0.016 0.001 0.025 50 W 0.006 0.002 0.038 0.269 0.439 0.014 0.001 0.232 51 R 0.001 0.002 0.058 0.381 0.521 0.009 0.001 0.027 52 A 0.003 0.007 0.040 0.263 0.506 0.026 0.001 0.154 53 W 0.005 0.021 0.051 0.292 0.522 0.024 0.003 0.082 54 N 0.055 0.027 0.052 0.175 0.285 0.066 0.022 0.317 55 F 0.164 0.032 0.092 0.096 0.161 0.048 0.061 0.344 56 E 0.130 0.012 0.029 0.059 0.102 0.214 0.008 0.444 57 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 58 D 0.011 0.010 0.009 0.021 0.057 0.173 0.004 0.715 59 A 0.451 0.020 0.018 0.009 0.013 0.049 0.015 0.425 60 G 0.197 0.065 0.020 0.018 0.029 0.167 0.012 0.493 61 E 0.322 0.080 0.024 0.015 0.027 0.187 0.008 0.338 62 G 0.089 0.336 0.027 0.018 0.022 0.081 0.007 0.420 63 L 0.098 0.375 0.038 0.026 0.059 0.103 0.019 0.283 64 N 0.054 0.506 0.038 0.028 0.036 0.075 0.018 0.244 65 R 0.065 0.594 0.035 0.024 0.031 0.048 0.015 0.188 66 Y 0.060 0.629 0.029 0.022 0.037 0.049 0.012 0.162 67 I 0.051 0.658 0.041 0.040 0.056 0.040 0.016 0.098 68 R 0.031 0.734 0.044 0.034 0.044 0.025 0.013 0.075 69 T 0.054 0.584 0.046 0.028 0.041 0.026 0.033 0.190 70 S 0.133 0.344 0.057 0.045 0.037 0.043 0.059 0.282 71 G 0.265 0.115 0.046 0.033 0.032 0.064 0.066 0.379 72 I 0.156 0.070 0.225 0.058 0.080 0.093 0.022 0.296 73 R 0.062 0.076 0.101 0.103 0.145 0.145 0.014 0.354 74 T 0.047 0.062 0.063 0.045 0.081 0.066 0.010 0.625 75 D 0.047 0.052 0.069 0.043 0.061 0.117 0.014 0.595 76 T 0.099 0.034 0.033 0.024 0.034 0.197 0.017 0.560 77 A 0.090 0.050 0.064 0.035 0.068 0.142 0.012 0.539 78 T 0.043 0.079 0.038 0.062 0.077 0.204 0.010 0.488 79 R 0.066 0.098 0.034 0.031 0.070 0.118 0.009 0.574 80 L 0.085 0.259 0.050 0.051 0.121 0.107 0.009 0.319 81 E 0.081 0.249 0.036 0.057 0.091 0.185 0.022 0.279 82 H 0.162 0.290 0.027 0.037 0.053 0.053 0.026 0.351 83 H 0.204 0.234 0.037 0.035 0.057 0.062 0.029 0.342 84 H 0.145 0.143 0.039 0.038 0.049 0.081 0.033 0.472 85 H 0.142 0.103 0.046 0.035 0.056 0.086 0.033 0.499 86 H 0.115 0.060 0.042 0.029 0.048 0.092 0.020 0.593 87 H 0.076 0.044 0.035 0.029 0.044 0.091 0.013 0.668