# TARGET T0355 # Using neural net t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0355.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 972 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.227 0.087 0.062 0.109 0.097 0.091 0.104 0.073 0.071 0.048 0.032 2 Q 0.264 0.243 0.118 0.145 0.089 0.055 0.044 0.019 0.013 0.006 0.003 3 T 0.108 0.196 0.145 0.227 0.139 0.084 0.057 0.022 0.012 0.006 0.003 4 I 0.048 0.037 0.019 0.046 0.051 0.067 0.127 0.114 0.170 0.160 0.162 5 S 0.126 0.202 0.181 0.223 0.125 0.070 0.045 0.015 0.008 0.004 0.002 6 D 0.393 0.180 0.151 0.170 0.060 0.026 0.014 0.004 0.002 0.001 0.001 7 N 0.391 0.163 0.076 0.111 0.073 0.061 0.064 0.029 0.017 0.009 0.005 8 A 0.063 0.144 0.063 0.122 0.104 0.127 0.152 0.086 0.074 0.043 0.022 9 A 0.048 0.036 0.048 0.072 0.117 0.192 0.244 0.102 0.077 0.043 0.021 10 N 0.184 0.148 0.416 0.155 0.054 0.022 0.013 0.004 0.002 0.001 0.001 11 A 0.012 0.036 0.073 0.189 0.190 0.202 0.181 0.061 0.035 0.015 0.006 12 I 0.005 0.009 0.040 0.022 0.014 0.015 0.059 0.097 0.211 0.255 0.274 13 Q 0.006 0.014 0.136 0.150 0.202 0.225 0.174 0.052 0.027 0.011 0.003 14 E 0.014 0.056 0.567 0.208 0.082 0.039 0.021 0.007 0.004 0.002 0.001 15 I 0.002 0.007 0.033 0.032 0.048 0.098 0.302 0.177 0.157 0.097 0.046 16 F 0.004 0.006 0.018 0.017 0.020 0.037 0.128 0.142 0.208 0.216 0.205 17 G 0.111 0.191 0.353 0.184 0.084 0.040 0.021 0.007 0.005 0.003 0.002 18 R 0.074 0.094 0.149 0.173 0.136 0.144 0.135 0.049 0.029 0.013 0.005 19 S 0.335 0.189 0.071 0.108 0.075 0.067 0.072 0.032 0.025 0.016 0.010 20 K 0.080 0.074 0.049 0.113 0.115 0.120 0.148 0.091 0.089 0.068 0.054 21 A 0.087 0.135 0.113 0.188 0.161 0.118 0.091 0.043 0.034 0.019 0.011 22 L 0.007 0.009 0.010 0.031 0.040 0.068 0.165 0.179 0.212 0.161 0.118 23 I 0.007 0.009 0.008 0.026 0.036 0.060 0.154 0.169 0.202 0.182 0.148 24 G 0.027 0.035 0.029 0.070 0.073 0.085 0.157 0.140 0.159 0.127 0.098 25 M 0.004 0.005 0.005 0.013 0.015 0.026 0.083 0.128 0.223 0.248 0.252 26 I 0.006 0.008 0.007 0.024 0.033 0.056 0.132 0.163 0.221 0.195 0.155 27 H 0.015 0.038 0.024 0.097 0.110 0.124 0.189 0.140 0.132 0.081 0.049 28 C 0.008 0.014 0.009 0.025 0.030 0.045 0.109 0.147 0.216 0.212 0.185 29 P 0.166 0.133 0.071 0.187 0.140 0.101 0.089 0.045 0.035 0.020 0.012 30 A 0.191 0.133 0.053 0.155 0.129 0.102 0.097 0.053 0.043 0.028 0.017 31 F 0.050 0.051 0.025 0.095 0.098 0.109 0.151 0.126 0.135 0.098 0.063 32 P 0.097 0.071 0.027 0.085 0.092 0.120 0.175 0.114 0.105 0.070 0.043 33 G 0.156 0.105 0.042 0.095 0.086 0.087 0.118 0.089 0.096 0.074 0.053 34 A 0.025 0.019 0.008 0.027 0.033 0.046 0.095 0.123 0.199 0.203 0.221 35 P 0.144 0.129 0.059 0.157 0.124 0.106 0.108 0.062 0.054 0.034 0.023 36 R 0.042 0.045 0.028 0.114 0.131 0.141 0.189 0.128 0.101 0.056 0.026 37 Y 0.008 0.007 0.005 0.017 0.020 0.031 0.082 0.129 0.232 0.242 0.226 38 R 0.034 0.052 0.048 0.124 0.130 0.131 0.161 0.107 0.100 0.069 0.044 39 N 0.059 0.076 0.067 0.151 0.132 0.122 0.155 0.098 0.076 0.041 0.022 40 A 0.039 0.028 0.025 0.063 0.078 0.102 0.182 0.154 0.153 0.110 0.067 41 S 0.063 0.244 0.069 0.196 0.138 0.096 0.088 0.042 0.033 0.019 0.012 42 M 0.039 0.024 0.011 0.034 0.047 0.067 0.132 0.141 0.195 0.168 0.143 43 D 0.360 0.186 0.079 0.160 0.098 0.053 0.038 0.013 0.008 0.003 0.002 44 A 0.092 0.141 0.096 0.269 0.174 0.101 0.070 0.028 0.017 0.008 0.004 45 I 0.004 0.009 0.005 0.013 0.019 0.034 0.085 0.113 0.213 0.234 0.272 46 Y 0.009 0.012 0.011 0.039 0.089 0.181 0.274 0.166 0.120 0.065 0.033 47 D 0.309 0.149 0.206 0.144 0.073 0.043 0.042 0.015 0.010 0.006 0.003 48 A 0.015 0.039 0.024 0.139 0.167 0.174 0.198 0.104 0.068 0.044 0.028 49 C 0.001 0.003 0.004 0.006 0.006 0.010 0.034 0.073 0.204 0.286 0.373 50 M 0.005 0.006 0.015 0.049 0.131 0.256 0.296 0.119 0.076 0.033 0.015 51 R 0.118 0.095 0.533 0.171 0.050 0.018 0.010 0.003 0.001 0.001 0.001 52 D 0.001 0.001 0.003 0.015 0.039 0.115 0.337 0.197 0.152 0.091 0.050 53 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.018 0.055 0.166 0.289 0.468 54 E 0.002 0.008 0.292 0.299 0.217 0.117 0.049 0.010 0.004 0.002 0.001 55 R 0.001 0.014 0.223 0.184 0.209 0.201 0.118 0.029 0.013 0.006 0.002 56 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.028 0.057 0.167 0.302 0.439 57 I 0.001 0.001 0.005 0.010 0.022 0.060 0.250 0.222 0.194 0.144 0.092 58 E 0.012 0.057 0.609 0.205 0.073 0.027 0.010 0.003 0.002 0.001 0.001 59 G 0.012 0.019 0.021 0.057 0.094 0.185 0.344 0.130 0.074 0.043 0.020 60 G 0.096 0.089 0.036 0.098 0.070 0.073 0.125 0.099 0.132 0.106 0.076 61 M 0.002 0.002 0.001 0.003 0.006 0.011 0.041 0.075 0.183 0.247 0.428 62 H 0.022 0.050 0.065 0.139 0.152 0.164 0.182 0.098 0.072 0.034 0.023 63 G 0.005 0.010 0.007 0.031 0.043 0.079 0.194 0.193 0.192 0.145 0.100 64 L 0.002 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.030 0.074 0.178 0.286 0.417 65 I 0.001 0.002 0.003 0.006 0.008 0.017 0.070 0.121 0.228 0.252 0.292 66 V 0.001 0.002 0.002 0.005 0.007 0.012 0.046 0.095 0.206 0.284 0.339 67 E 0.003 0.005 0.005 0.028 0.041 0.071 0.165 0.179 0.211 0.170 0.121 68 N 0.011 0.014 0.010 0.037 0.051 0.081 0.165 0.177 0.190 0.153 0.113 69 H 0.017 0.026 0.018 0.059 0.073 0.090 0.152 0.144 0.167 0.138 0.116 70 G 0.035 0.036 0.017 0.059 0.068 0.091 0.160 0.130 0.159 0.137 0.108 71 D 0.123 0.108 0.052 0.159 0.131 0.109 0.118 0.072 0.062 0.041 0.024 72 V 0.013 0.014 0.008 0.029 0.041 0.067 0.146 0.154 0.204 0.180 0.143 73 P 0.060 0.071 0.028 0.087 0.087 0.092 0.127 0.106 0.130 0.112 0.099 74 F 0.014 0.016 0.009 0.040 0.055 0.082 0.174 0.163 0.190 0.148 0.109 75 S 0.052 0.057 0.032 0.069 0.074 0.084 0.135 0.121 0.140 0.120 0.117 76 K 0.131 0.159 0.082 0.203 0.139 0.090 0.083 0.042 0.034 0.023 0.015 77 P 0.134 0.097 0.052 0.139 0.130 0.120 0.125 0.073 0.060 0.043 0.027 78 D 0.208 0.129 0.060 0.161 0.119 0.089 0.091 0.054 0.043 0.029 0.018 79 D 0.125 0.078 0.040 0.111 0.108 0.109 0.146 0.093 0.088 0.062 0.041 80 I 0.041 0.058 0.025 0.068 0.073 0.089 0.135 0.120 0.147 0.135 0.111 81 G 0.098 0.085 0.028 0.082 0.096 0.111 0.134 0.106 0.110 0.084 0.065 82 P 0.390 0.137 0.086 0.117 0.079 0.055 0.055 0.029 0.025 0.017 0.010 83 E 0.058 0.090 0.041 0.141 0.144 0.141 0.155 0.087 0.073 0.046 0.024 84 T 0.010 0.011 0.011 0.026 0.029 0.042 0.092 0.126 0.227 0.227 0.198 85 S 0.035 0.025 0.064 0.155 0.189 0.183 0.175 0.079 0.053 0.029 0.013 86 A 0.026 0.055 0.334 0.186 0.131 0.093 0.083 0.041 0.029 0.015 0.007 87 F 0.001 0.003 0.006 0.015 0.025 0.057 0.164 0.166 0.223 0.193 0.147 88 M 0.002 0.002 0.007 0.014 0.025 0.054 0.152 0.171 0.227 0.203 0.143 89 S 0.016 0.039 0.406 0.179 0.129 0.083 0.074 0.030 0.024 0.013 0.007 90 V 0.005 0.020 0.095 0.123 0.147 0.182 0.212 0.094 0.065 0.037 0.019 91 V 0.001 0.001 0.003 0.005 0.005 0.009 0.038 0.074 0.188 0.298 0.379 92 T 0.004 0.007 0.019 0.039 0.085 0.140 0.262 0.186 0.142 0.081 0.037 93 D 0.049 0.083 0.425 0.233 0.102 0.053 0.031 0.011 0.008 0.004 0.002 94 R 0.092 0.075 0.055 0.117 0.126 0.157 0.194 0.082 0.052 0.032 0.018 95 I 0.042 0.032 0.026 0.054 0.047 0.061 0.133 0.127 0.180 0.157 0.141 96 V 0.012 0.016 0.018 0.030 0.040 0.062 0.135 0.137 0.183 0.182 0.185 97 R 0.087 0.202 0.210 0.227 0.116 0.067 0.047 0.018 0.013 0.008 0.005 98 T 0.071 0.055 0.038 0.089 0.097 0.119 0.172 0.120 0.110 0.076 0.055 99 A 0.255 0.105 0.046 0.125 0.100 0.088 0.105 0.058 0.050 0.038 0.031 100 G 0.227 0.198 0.087 0.176 0.122 0.073 0.052 0.023 0.021 0.012 0.009 101 V 0.006 0.016 0.009 0.029 0.045 0.070 0.143 0.150 0.200 0.183 0.149 102 P 0.025 0.035 0.023 0.089 0.145 0.187 0.204 0.112 0.089 0.053 0.037 103 V 0.200 0.111 0.076 0.140 0.105 0.087 0.113 0.060 0.048 0.034 0.026 104 G 0.009 0.019 0.012 0.088 0.126 0.157 0.221 0.127 0.112 0.079 0.050 105 I 0.001 0.001 0.003 0.004 0.004 0.006 0.026 0.063 0.183 0.277 0.431 106 N 0.020 0.032 0.081 0.220 0.232 0.183 0.130 0.048 0.029 0.015 0.009 107 V 0.007 0.034 0.118 0.162 0.155 0.146 0.163 0.089 0.063 0.038 0.026 108 L 0.001 0.001 0.002 0.007 0.012 0.029 0.111 0.139 0.208 0.230 0.259 109 A 0.014 0.013 0.017 0.036 0.047 0.081 0.186 0.161 0.177 0.143 0.124 110 N 0.207 0.204 0.230 0.197 0.083 0.039 0.022 0.007 0.005 0.003 0.003 111 A 0.084 0.115 0.060 0.177 0.155 0.150 0.142 0.055 0.035 0.018 0.010 112 P 0.092 0.049 0.015 0.049 0.054 0.071 0.121 0.113 0.146 0.142 0.146 113 I 0.105 0.134 0.052 0.127 0.137 0.130 0.138 0.066 0.052 0.033 0.027 114 P 0.023 0.033 0.018 0.060 0.089 0.128 0.192 0.145 0.152 0.103 0.058 115 A 0.018 0.015 0.012 0.038 0.044 0.067 0.153 0.139 0.194 0.178 0.142 116 F 0.009 0.010 0.012 0.033 0.039 0.060 0.140 0.138 0.196 0.194 0.168 117 A 0.005 0.007 0.023 0.028 0.031 0.047 0.122 0.157 0.215 0.207 0.157 118 I 0.001 0.003 0.018 0.023 0.020 0.028 0.101 0.142 0.226 0.229 0.209 119 A 0.001 0.003 0.029 0.024 0.022 0.033 0.091 0.132 0.214 0.248 0.203 120 K 0.002 0.007 0.045 0.070 0.086 0.127 0.236 0.156 0.145 0.086 0.040 121 A 0.005 0.010 0.041 0.035 0.036 0.057 0.153 0.165 0.204 0.162 0.131 122 G 0.007 0.012 0.013 0.026 0.029 0.050 0.144 0.157 0.229 0.209 0.124 123 G 0.041 0.083 0.052 0.144 0.142 0.152 0.179 0.094 0.069 0.031 0.014 124 A 0.095 0.054 0.035 0.059 0.052 0.062 0.112 0.117 0.159 0.137 0.117 125 K 0.111 0.119 0.059 0.160 0.152 0.135 0.135 0.058 0.041 0.020 0.010 126 F 0.028 0.031 0.019 0.057 0.058 0.078 0.147 0.148 0.187 0.145 0.101 127 I 0.031 0.028 0.023 0.057 0.077 0.104 0.182 0.148 0.155 0.120 0.074 128 R 0.065 0.170 0.106 0.180 0.140 0.110 0.104 0.052 0.039 0.021 0.013 129 V 0.006 0.005 0.003 0.015 0.027 0.045 0.123 0.157 0.233 0.216 0.169 130 N 0.072 0.065 0.044 0.156 0.175 0.165 0.160 0.068 0.053 0.027 0.016 131 Q 0.042 0.098 0.186 0.276 0.165 0.103 0.077 0.027 0.015 0.007 0.004 132 W 0.003 0.005 0.011 0.024 0.033 0.058 0.155 0.172 0.215 0.187 0.136 133 A 0.001 0.004 0.008 0.013 0.015 0.027 0.098 0.141 0.235 0.247 0.211 134 N 0.008 0.030 0.132 0.244 0.257 0.162 0.100 0.034 0.021 0.009 0.004 135 A 0.095 0.100 0.250 0.175 0.110 0.093 0.087 0.036 0.027 0.016 0.011 136 Y 0.014 0.025 0.026 0.079 0.097 0.140 0.269 0.156 0.112 0.057 0.026 137 V 0.002 0.002 0.003 0.004 0.006 0.014 0.054 0.089 0.199 0.270 0.356 138 A 0.023 0.094 0.174 0.233 0.197 0.125 0.087 0.030 0.018 0.010 0.008 139 N 0.132 0.154 0.234 0.203 0.110 0.074 0.050 0.018 0.013 0.007 0.005 140 E 0.025 0.019 0.013 0.055 0.080 0.129 0.241 0.163 0.122 0.092 0.060 141 G 0.325 0.195 0.066 0.134 0.090 0.061 0.049 0.025 0.022 0.017 0.015 142 F 0.007 0.009 0.008 0.019 0.022 0.033 0.081 0.099 0.182 0.224 0.318 143 M 0.067 0.101 0.057 0.134 0.117 0.120 0.137 0.082 0.077 0.057 0.050 144 E 0.143 0.121 0.058 0.162 0.123 0.105 0.106 0.064 0.056 0.036 0.027 145 G 0.087 0.032 0.019 0.043 0.041 0.050 0.099 0.102 0.153 0.172 0.204 146 R 0.048 0.088 0.048 0.144 0.140 0.144 0.154 0.082 0.074 0.047 0.032 147 A 0.017 0.018 0.011 0.024 0.026 0.033 0.084 0.116 0.207 0.216 0.248 148 A 0.089 0.072 0.077 0.124 0.126 0.129 0.143 0.080 0.073 0.050 0.037 149 E 0.173 0.145 0.101 0.174 0.121 0.091 0.085 0.041 0.034 0.021 0.013 150 A 0.054 0.056 0.035 0.076 0.075 0.090 0.153 0.120 0.140 0.111 0.090 151 M 0.037 0.025 0.026 0.046 0.058 0.085 0.166 0.144 0.168 0.139 0.107 152 R 0.348 0.241 0.176 0.130 0.055 0.024 0.015 0.005 0.004 0.002 0.001 153 Y 0.014 0.024 0.020 0.043 0.056 0.101 0.203 0.158 0.171 0.124 0.085 154 R 0.030 0.027 0.022 0.063 0.097 0.136 0.199 0.137 0.134 0.092 0.062 155 S 0.257 0.162 0.214 0.184 0.085 0.043 0.031 0.010 0.007 0.004 0.002 156 L 0.048 0.063 0.133 0.169 0.153 0.144 0.141 0.066 0.047 0.025 0.012 157 L 0.004 0.006 0.006 0.009 0.011 0.024 0.078 0.116 0.217 0.257 0.272 158 R 0.006 0.014 0.023 0.071 0.140 0.209 0.266 0.130 0.086 0.040 0.016 159 A 0.116 0.093 0.511 0.156 0.064 0.029 0.017 0.006 0.005 0.003 0.001 160 E 0.032 0.052 0.091 0.176 0.160 0.170 0.185 0.067 0.038 0.019 0.009 161 H 0.007 0.006 0.010 0.015 0.016 0.032 0.101 0.143 0.248 0.239 0.183 162 I 0.007 0.017 0.070 0.100 0.137 0.177 0.226 0.114 0.081 0.047 0.024 163 K 0.019 0.063 0.530 0.194 0.102 0.048 0.025 0.009 0.006 0.003 0.001 164 V 0.012 0.019 0.028 0.058 0.080 0.140 0.255 0.157 0.129 0.081 0.040 165 F 0.058 0.048 0.034 0.080 0.066 0.079 0.152 0.130 0.151 0.121 0.083 166 A 0.033 0.035 0.043 0.059 0.068 0.089 0.155 0.124 0.154 0.134 0.106 167 D 0.135 0.173 0.164 0.207 0.127 0.078 0.058 0.025 0.018 0.009 0.005 168 S 0.091 0.048 0.033 0.062 0.051 0.070 0.139 0.127 0.156 0.133 0.091 169 H 0.107 0.096 0.055 0.120 0.105 0.106 0.135 0.090 0.086 0.061 0.040 170 V 0.049 0.056 0.057 0.093 0.080 0.089 0.133 0.112 0.139 0.111 0.082 171 K 0.045 0.069 0.078 0.137 0.137 0.127 0.144 0.091 0.080 0.054 0.035 172 H 0.058 0.053 0.056 0.107 0.100 0.106 0.158 0.117 0.118 0.080 0.046 173 G 0.173 0.108 0.052 0.113 0.101 0.098 0.121 0.079 0.073 0.050 0.031 174 A 0.200 0.109 0.049 0.099 0.085 0.081 0.106 0.079 0.085 0.062 0.046 175 H 0.200 0.116 0.048 0.101 0.097 0.092 0.115 0.075 0.075 0.049 0.031 176 A 0.175 0.117 0.046 0.140 0.119 0.103 0.110 0.070 0.060 0.038 0.021 177 I 0.080 0.047 0.033 0.077 0.098 0.120 0.182 0.126 0.117 0.076 0.045 178 T 0.034 0.108 0.045 0.086 0.078 0.078 0.111 0.104 0.126 0.116 0.113 179 A 0.078 0.199 0.069 0.158 0.127 0.101 0.102 0.060 0.051 0.035 0.019 180 D 0.538 0.140 0.055 0.115 0.080 0.040 0.021 0.005 0.003 0.001 0.001 181 R 0.462 0.170 0.132 0.151 0.048 0.019 0.011 0.003 0.002 0.001 0.001 182 S 0.004 0.012 0.015 0.045 0.059 0.116 0.232 0.174 0.167 0.106 0.068 183 I 0.001 0.002 0.008 0.011 0.027 0.086 0.243 0.215 0.200 0.133 0.074 184 D 0.011 0.031 0.655 0.202 0.069 0.021 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 185 E 0.008 0.043 0.312 0.241 0.175 0.126 0.068 0.015 0.008 0.003 0.001 186 L 0.001 0.001 0.003 0.004 0.005 0.012 0.056 0.095 0.213 0.277 0.333 187 T 0.002 0.003 0.016 0.020 0.046 0.115 0.322 0.212 0.149 0.081 0.034 188 R 0.013 0.041 0.717 0.147 0.054 0.018 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 189 D 0.014 0.036 0.066 0.097 0.132 0.216 0.269 0.082 0.048 0.026 0.013 190 L 0.005 0.003 0.003 0.006 0.007 0.016 0.061 0.112 0.225 0.275 0.286 191 A 0.125 0.136 0.147 0.172 0.132 0.107 0.094 0.036 0.024 0.015 0.012 192 F 0.027 0.057 0.140 0.143 0.124 0.126 0.138 0.085 0.077 0.053 0.031 193 F 0.020 0.015 0.012 0.028 0.033 0.055 0.130 0.136 0.187 0.189 0.195 194 D 0.073 0.075 0.038 0.109 0.095 0.099 0.140 0.096 0.104 0.087 0.084 195 A 0.020 0.021 0.021 0.042 0.049 0.064 0.124 0.126 0.182 0.184 0.165 196 D 0.109 0.101 0.057 0.146 0.125 0.107 0.119 0.077 0.070 0.048 0.041 197 G 0.038 0.029 0.018 0.055 0.060 0.082 0.155 0.149 0.166 0.139 0.109 198 V 0.023 0.032 0.019 0.069 0.085 0.107 0.168 0.132 0.145 0.120 0.099 199 I 0.010 0.013 0.010 0.032 0.034 0.048 0.113 0.131 0.201 0.196 0.212 200 A 0.003 0.004 0.005 0.010 0.016 0.027 0.076 0.105 0.188 0.235 0.331 201 T 0.026 0.071 0.055 0.136 0.108 0.093 0.147 0.111 0.107 0.078 0.068 202 G 0.037 0.032 0.020 0.067 0.086 0.109 0.165 0.124 0.136 0.124 0.100 203 Q 0.065 0.135 0.085 0.247 0.161 0.100 0.092 0.041 0.032 0.022 0.020 204 R 0.073 0.070 0.060 0.146 0.145 0.134 0.152 0.077 0.066 0.046 0.031 205 T 0.109 0.128 0.064 0.182 0.139 0.104 0.110 0.060 0.047 0.032 0.025 206 G 0.378 0.138 0.044 0.126 0.099 0.074 0.058 0.027 0.025 0.018 0.014 207 N 0.142 0.118 0.055 0.123 0.116 0.116 0.126 0.066 0.059 0.044 0.035 208 S 0.244 0.143 0.054 0.137 0.100 0.082 0.092 0.055 0.045 0.028 0.019 209 A 0.066 0.048 0.020 0.068 0.085 0.099 0.168 0.141 0.143 0.101 0.063 210 S 0.032 0.333 0.084 0.191 0.127 0.087 0.065 0.032 0.025 0.015 0.009 211 L 0.027 0.016 0.014 0.059 0.135 0.176 0.212 0.140 0.120 0.063 0.039 212 E 0.771 0.115 0.046 0.044 0.014 0.006 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 213 E 0.001 0.010 0.023 0.158 0.224 0.240 0.231 0.074 0.029 0.009 0.003 214 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.027 0.066 0.172 0.280 0.449 215 E 0.004 0.012 0.153 0.371 0.264 0.130 0.048 0.011 0.004 0.002 0.001 216 E 0.001 0.025 0.366 0.258 0.182 0.105 0.048 0.008 0.004 0.001 0.001 217 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.053 0.095 0.195 0.273 0.370 218 G 0.001 0.001 0.002 0.008 0.023 0.083 0.289 0.241 0.197 0.114 0.041 219 A 0.013 0.060 0.554 0.232 0.083 0.034 0.014 0.004 0.003 0.001 0.001 220 A 0.005 0.017 0.050 0.058 0.100 0.208 0.344 0.108 0.062 0.034 0.016 221 T 0.013 0.012 0.008 0.022 0.018 0.034 0.119 0.142 0.229 0.221 0.182 222 H 0.480 0.280 0.084 0.103 0.036 0.011 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 223 L 0.003 0.005 0.009 0.023 0.043 0.089 0.206 0.218 0.225 0.124 0.054 224 P 0.023 0.049 0.029 0.117 0.168 0.197 0.205 0.099 0.062 0.030 0.020 225 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.012 0.065 0.121 0.212 0.255 0.325 226 L 0.002 0.002 0.003 0.008 0.014 0.028 0.096 0.160 0.225 0.233 0.229 227 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.007 0.035 0.079 0.187 0.276 0.407 228 G 0.003 0.005 0.005 0.018 0.026 0.043 0.111 0.138 0.212 0.215 0.226 229 S 0.011 0.013 0.011 0.037 0.043 0.065 0.161 0.155 0.192 0.168 0.145 230 G 0.050 0.078 0.043 0.127 0.128 0.133 0.184 0.104 0.075 0.046 0.032 231 V 0.002 0.003 0.002 0.010 0.017 0.027 0.080 0.115 0.202 0.240 0.301 232 N 0.041 0.630 0.072 0.147 0.062 0.026 0.012 0.004 0.003 0.001 0.001 233 E 0.082 0.053 0.032 0.194 0.291 0.203 0.099 0.027 0.012 0.005 0.002 234 G 0.875 0.074 0.016 0.018 0.007 0.004 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 235 N 0.001 0.007 0.009 0.102 0.169 0.255 0.278 0.106 0.049 0.018 0.008 236 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.029 0.080 0.198 0.288 0.399 237 V 0.002 0.008 0.133 0.254 0.272 0.217 0.083 0.017 0.008 0.004 0.001 238 E 0.002 0.021 0.337 0.316 0.176 0.092 0.040 0.009 0.005 0.002 0.001 239 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.009 0.057 0.100 0.198 0.275 0.354 240 L 0.001 0.001 0.004 0.005 0.010 0.028 0.147 0.211 0.266 0.213 0.117 241 K 0.009 0.043 0.520 0.267 0.108 0.036 0.012 0.003 0.001 0.001 0.001 242 R 0.005 0.025 0.075 0.088 0.151 0.260 0.286 0.063 0.029 0.013 0.005 243 T 0.012 0.011 0.008 0.024 0.022 0.037 0.119 0.142 0.230 0.219 0.175 244 S 0.366 0.232 0.065 0.124 0.082 0.056 0.043 0.014 0.009 0.005 0.004 245 G 0.010 0.022 0.020 0.075 0.117 0.190 0.237 0.147 0.103 0.055 0.023 246 V 0.004 0.007 0.004 0.018 0.024 0.045 0.123 0.136 0.191 0.216 0.233 247 I 0.002 0.005 0.005 0.016 0.023 0.040 0.124 0.155 0.205 0.208 0.217 248 V 0.001 0.002 0.002 0.007 0.010 0.015 0.059 0.118 0.253 0.272 0.263 249 A 0.001 0.001 0.001 0.009 0.018 0.039 0.097 0.127 0.217 0.257 0.232 250 S 0.015 0.021 0.029 0.120 0.120 0.125 0.192 0.146 0.121 0.077 0.034 251 S 0.003 0.009 0.011 0.051 0.076 0.117 0.229 0.203 0.148 0.099 0.055 252 L 0.001 0.004 0.009 0.017 0.013 0.015 0.039 0.077 0.198 0.291 0.337 253 K 0.001 0.005 0.009 0.089 0.195 0.226 0.236 0.124 0.078 0.029 0.008 254 E 0.046 0.099 0.193 0.223 0.155 0.124 0.086 0.039 0.023 0.009 0.003 255 G 0.144 0.137 0.078 0.167 0.125 0.114 0.127 0.053 0.032 0.016 0.006 256 G 0.227 0.110 0.033 0.079 0.061 0.064 0.108 0.087 0.098 0.079 0.053 257 V 0.295 0.206 0.071 0.146 0.091 0.059 0.057 0.030 0.024 0.014 0.007 258 W 0.130 0.126 0.081 0.146 0.125 0.115 0.116 0.065 0.054 0.028 0.015 259 W 0.024 0.030 0.017 0.050 0.066 0.091 0.149 0.137 0.177 0.146 0.115 260 N 0.092 0.139 0.042 0.107 0.112 0.119 0.141 0.088 0.077 0.051 0.031 261 P 0.593 0.109 0.071 0.093 0.053 0.032 0.026 0.011 0.007 0.004 0.002 262 V 0.221 0.111 0.047 0.122 0.109 0.094 0.127 0.074 0.055 0.026 0.013 263 E 0.021 0.105 0.061 0.112 0.093 0.123 0.164 0.112 0.104 0.065 0.041 264 L 0.004 0.006 0.013 0.051 0.159 0.258 0.285 0.122 0.066 0.025 0.010 265 A 0.286 0.118 0.481 0.074 0.022 0.010 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 266 R 0.001 0.006 0.044 0.183 0.247 0.240 0.195 0.051 0.023 0.008 0.003 267 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.024 0.066 0.185 0.309 0.412 268 R 0.001 0.005 0.108 0.329 0.328 0.164 0.052 0.008 0.003 0.001 0.001 269 S 0.008 0.042 0.707 0.138 0.061 0.028 0.013 0.002 0.001 0.001 0.001 270 F 0.001 0.001 0.004 0.006 0.011 0.032 0.174 0.184 0.245 0.207 0.138 271 V 0.001 0.001 0.002 0.002 0.006 0.028 0.217 0.233 0.255 0.178 0.077 272 A 0.004 0.020 0.750 0.163 0.046 0.012 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 273 A 0.002 0.018 0.120 0.089 0.171 0.271 0.245 0.049 0.022 0.009 0.003 274 A 0.001 0.002 0.004 0.005 0.005 0.011 0.067 0.113 0.255 0.299 0.240 275 R 0.058 0.072 0.101 0.160 0.172 0.173 0.174 0.050 0.024 0.011 0.005 276 P 0.189 0.127 0.506 0.112 0.038 0.016 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 277 G 0.020 0.040 0.034 0.054 0.070 0.132 0.251 0.140 0.124 0.084 0.050 278 L 0.016 0.021 0.023 0.051 0.075 0.134 0.248 0.162 0.144 0.086 0.040 279 E 0.314 0.176 0.347 0.110 0.034 0.011 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 280 A 0.061 0.098 0.201 0.198 0.149 0.132 0.102 0.032 0.016 0.006 0.002 281 L 0.028 0.015 0.014 0.023 0.025 0.051 0.138 0.155 0.215 0.193 0.144 282 E 0.111 0.155 0.187 0.196 0.148 0.105 0.066 0.018 0.009 0.003 0.001 283 H 0.164 0.151 0.403 0.138 0.063 0.037 0.024 0.008 0.006 0.003 0.001 284 H 0.163 0.124 0.070 0.127 0.107 0.108 0.127 0.067 0.054 0.034 0.019 285 H 0.300 0.152 0.059 0.096 0.078 0.078 0.090 0.057 0.048 0.029 0.015 286 H 0.226 0.145 0.095 0.137 0.111 0.095 0.089 0.044 0.034 0.017 0.007 287 H 0.244 0.163 0.101 0.144 0.110 0.085 0.069 0.035 0.028 0.015 0.007 288 H 0.337 0.181 0.059 0.128 0.085 0.065 0.058 0.034 0.029 0.016 0.008