# TARGET T0354 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0354.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 35.058 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.014 0.659 0.012 0.017 0.015 0.037 0.064 0.181 2 E 0.017 0.918 0.001 0.001 0.001 0.005 0.026 0.031 3 I 0.014 0.378 0.001 0.001 0.001 0.003 0.590 0.013 4 Q 0.002 0.881 0.001 0.001 0.001 0.003 0.100 0.012 5 E 0.003 0.966 0.001 0.001 0.001 0.002 0.017 0.012 6 I 0.002 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 7 S 0.002 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 0.002 8 K 0.001 0.931 0.001 0.001 0.001 0.001 0.064 0.003 9 L 0.001 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 10 A 0.006 0.958 0.003 0.001 0.001 0.001 0.030 0.002 11 I 0.017 0.885 0.010 0.001 0.001 0.002 0.076 0.009 12 E 0.011 0.806 0.031 0.001 0.001 0.007 0.087 0.057 13 A 0.041 0.790 0.016 0.001 0.001 0.016 0.047 0.089 14 L 0.211 0.540 0.033 0.001 0.001 0.025 0.079 0.109 15 E 0.095 0.231 0.010 0.002 0.001 0.033 0.098 0.530 16 D 0.060 0.155 0.019 0.001 0.002 0.063 0.143 0.556 17 I 0.037 0.061 0.049 0.009 0.005 0.154 0.215 0.471 18 K 0.193 0.066 0.034 0.006 0.007 0.096 0.080 0.518 19 G 0.151 0.043 0.020 0.002 0.004 0.097 0.064 0.620 20 K 0.013 0.018 0.100 0.010 0.020 0.188 0.052 0.601 21 D 0.026 0.015 0.273 0.029 0.084 0.121 0.112 0.340 22 I 0.010 0.008 0.205 0.053 0.068 0.094 0.076 0.485 23 I 0.005 0.005 0.640 0.087 0.104 0.033 0.032 0.093 24 E 0.007 0.009 0.306 0.079 0.144 0.071 0.090 0.294 25 L 0.009 0.008 0.417 0.123 0.091 0.073 0.060 0.219 26 D 0.248 0.062 0.098 0.048 0.072 0.077 0.096 0.300 27 T 0.139 0.032 0.032 0.014 0.021 0.079 0.231 0.452 28 S 0.020 0.037 0.038 0.026 0.044 0.132 0.199 0.505 29 K 0.038 0.135 0.017 0.014 0.030 0.101 0.118 0.548 30 L 0.058 0.255 0.014 0.030 0.030 0.085 0.122 0.406 31 T 0.042 0.221 0.033 0.035 0.058 0.072 0.236 0.305 32 S 0.028 0.151 0.040 0.044 0.071 0.106 0.341 0.219 33 L 0.043 0.078 0.113 0.046 0.060 0.102 0.334 0.224 34 F 0.066 0.051 0.077 0.044 0.065 0.148 0.287 0.260 35 Q 0.008 0.020 0.123 0.029 0.063 0.154 0.149 0.456 36 R 0.002 0.004 0.617 0.027 0.071 0.084 0.095 0.101 37 M 0.002 0.002 0.640 0.045 0.062 0.038 0.142 0.069 38 I 0.002 0.002 0.796 0.039 0.041 0.018 0.070 0.031 39 V 0.006 0.003 0.771 0.029 0.051 0.036 0.059 0.047 40 A 0.019 0.006 0.517 0.047 0.078 0.103 0.105 0.126 41 T 0.030 0.017 0.325 0.022 0.054 0.145 0.183 0.224 42 G 0.053 0.053 0.103 0.013 0.037 0.280 0.106 0.355 43 D 0.059 0.181 0.043 0.011 0.022 0.177 0.090 0.417 44 S 0.030 0.780 0.004 0.002 0.005 0.035 0.045 0.098 45 N 0.014 0.896 0.005 0.002 0.004 0.014 0.023 0.043 46 R 0.006 0.913 0.004 0.008 0.006 0.011 0.027 0.027 47 Q 0.004 0.981 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.003 48 V 0.006 0.977 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.002 49 K 0.008 0.758 0.005 0.004 0.004 0.004 0.199 0.017 50 A 0.009 0.470 0.007 0.003 0.003 0.009 0.472 0.027 51 L 0.013 0.894 0.003 0.001 0.001 0.004 0.068 0.015 52 A 0.020 0.897 0.002 0.001 0.001 0.006 0.033 0.039 53 N 0.007 0.881 0.002 0.001 0.001 0.008 0.034 0.065 54 S 0.007 0.939 0.002 0.001 0.001 0.005 0.020 0.026 55 V 0.008 0.969 0.001 0.001 0.001 0.003 0.010 0.008 56 Q 0.013 0.947 0.003 0.001 0.001 0.003 0.017 0.015 57 V 0.007 0.940 0.012 0.002 0.001 0.003 0.011 0.022 58 K 0.032 0.868 0.024 0.003 0.002 0.007 0.026 0.038 59 L 0.165 0.066 0.356 0.010 0.004 0.021 0.302 0.075 60 K 0.709 0.037 0.011 0.003 0.002 0.019 0.035 0.184 61 E 0.241 0.005 0.006 0.001 0.001 0.020 0.011 0.717 62 A 0.004 0.002 0.006 0.002 0.004 0.121 0.006 0.856 63 G 0.008 0.004 0.006 0.004 0.009 0.062 0.019 0.889 64 V 0.031 0.011 0.014 0.025 0.012 0.107 0.033 0.767 65 D 0.089 0.020 0.113 0.067 0.051 0.115 0.100 0.445 66 I 0.088 0.013 0.045 0.026 0.038 0.108 0.086 0.597 67 V 0.027 0.009 0.120 0.036 0.053 0.120 0.046 0.589 68 G 0.109 0.015 0.053 0.030 0.049 0.113 0.047 0.584 69 S 0.084 0.017 0.024 0.042 0.044 0.104 0.047 0.638 70 E 0.038 0.009 0.040 0.043 0.084 0.134 0.046 0.605 71 G 0.039 0.006 0.028 0.047 0.105 0.122 0.097 0.556 72 H 0.092 0.004 0.033 0.048 0.056 0.143 0.081 0.542 73 E 0.149 0.007 0.016 0.023 0.034 0.104 0.045 0.622 74 S 0.033 0.006 0.017 0.016 0.051 0.149 0.032 0.696 75 G 0.006 0.004 0.043 0.050 0.187 0.146 0.042 0.523 76 E 0.004 0.002 0.099 0.239 0.456 0.046 0.045 0.108 77 W 0.002 0.002 0.075 0.282 0.374 0.022 0.031 0.212 78 V 0.001 0.001 0.148 0.449 0.358 0.007 0.009 0.027 79 L 0.001 0.001 0.208 0.204 0.443 0.015 0.044 0.083 80 V 0.010 0.002 0.303 0.344 0.190 0.023 0.074 0.054 81 D 0.312 0.011 0.108 0.093 0.102 0.067 0.131 0.175 82 A 0.029 0.008 0.038 0.019 0.047 0.164 0.040 0.655 83 G 0.007 0.007 0.093 0.041 0.202 0.169 0.040 0.441 84 D 0.006 0.007 0.185 0.102 0.210 0.093 0.151 0.247 85 V 0.002 0.006 0.383 0.224 0.172 0.035 0.073 0.106 86 V 0.003 0.006 0.460 0.151 0.191 0.022 0.077 0.089 87 V 0.010 0.008 0.438 0.177 0.195 0.029 0.063 0.081 88 H 0.025 0.011 0.539 0.115 0.151 0.032 0.052 0.074 89 V 0.013 0.025 0.256 0.108 0.171 0.087 0.063 0.275 90 M 0.027 0.095 0.178 0.043 0.094 0.099 0.067 0.398 91 L 0.190 0.224 0.057 0.043 0.053 0.082 0.139 0.212 92 P 0.079 0.253 0.026 0.020 0.026 0.099 0.124 0.373 93 A 0.053 0.349 0.020 0.016 0.027 0.073 0.128 0.335 94 V 0.149 0.326 0.016 0.013 0.021 0.068 0.117 0.290 95 R 0.109 0.340 0.015 0.028 0.025 0.064 0.125 0.295 96 D 0.021 0.628 0.004 0.006 0.012 0.031 0.020 0.278 97 Y 0.017 0.622 0.009 0.010 0.018 0.049 0.028 0.248 98 Y 0.010 0.782 0.012 0.023 0.016 0.023 0.035 0.099 99 D 0.017 0.951 0.001 0.001 0.002 0.002 0.017 0.009 100 I 0.023 0.868 0.009 0.004 0.003 0.005 0.069 0.019 101 E 0.018 0.757 0.020 0.020 0.015 0.012 0.085 0.072 102 A 0.138 0.201 0.087 0.029 0.035 0.047 0.256 0.208 103 L 0.428 0.055 0.040 0.027 0.028 0.076 0.110 0.235 104 W 0.355 0.009 0.009 0.009 0.013 0.042 0.038 0.524 105 G 0.009 0.001 0.001 0.001 0.003 0.050 0.006 0.928 106 G 0.009 0.002 0.005 0.006 0.011 0.116 0.016 0.836 107 Q 0.038 0.008 0.009 0.019 0.019 0.149 0.033 0.727 108 K 0.063 0.024 0.023 0.024 0.032 0.123 0.037 0.675 109 P 0.068 0.039 0.032 0.030 0.043 0.088 0.042 0.658 110 S 0.036 0.064 0.075 0.065 0.077 0.091 0.062 0.531 111 F 0.066 0.089 0.068 0.050 0.064 0.083 0.051 0.529 112 A 0.088 0.077 0.096 0.089 0.086 0.078 0.096 0.390 113 V 0.107 0.051 0.051 0.052 0.070 0.084 0.059 0.526 114 G 0.236 0.033 0.029 0.036 0.047 0.078 0.079 0.462 115 A 0.042 0.020 0.011 0.022 0.029 0.109 0.031 0.736 116 A 0.022 0.013 0.006 0.007 0.015 0.091 0.021 0.823 117 K 0.058 0.066 0.007 0.017 0.016 0.139 0.052 0.645 118 P 0.092 0.340 0.005 0.008 0.010 0.071 0.039 0.436 119 W 0.094 0.636 0.005 0.005 0.008 0.032 0.033 0.187 120 S 0.050 0.716 0.008 0.009 0.012 0.029 0.033 0.144 121 A 0.049 0.521 0.029 0.023 0.030 0.051 0.083 0.213 122 V 0.079 0.465 0.028 0.024 0.035 0.064 0.109 0.197 123 L 0.148 0.319 0.036 0.023 0.034 0.055 0.161 0.223 124 E 0.067 0.161 0.028 0.033 0.047 0.081 0.110 0.472 125 H 0.086 0.076 0.030 0.027 0.042 0.093 0.111 0.536 126 H 0.129 0.042 0.026 0.038 0.047 0.122 0.088 0.509 127 H 0.110 0.015 0.017 0.021 0.036 0.101 0.047 0.655 128 H 0.058 0.010 0.011 0.016 0.027 0.105 0.041 0.732 129 H 0.029 0.009 0.017 0.021 0.037 0.130 0.042 0.715 130 H 0.047 0.012 0.022 0.031 0.051 0.110 0.049 0.679