# TARGET T0348
# Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net
# This is a 4-layer network, with 
#	window	units
#	    5	   15
#	    7	   15
#	    9	   15
#	   13	    6 (1 EBGHTL )
# The input amino acid frequencies were determined from
# alignment T0348.t2k-thin90.a2m.gz
# with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1)
# Counts were regularized to probabilities using
# /projects/compbio/lib/recode3.20comp
# Total sequence weight for alignment was 159
#
Pos	AA	E	B	G	H	T	C
10N	1S	5N	5N	5N	5N	5N	5N
1	M	0.014	0.012	0.004	0.023	0.156	0.792
2	D	0.022	0.018	0.009	0.071	0.171	0.708
3	A	0.006	0.003	0.140	0.623	0.142	0.086
4	K	0.010	0.002	0.185	0.625	0.127	0.052
5	F	0.014	0.003	0.097	0.733	0.085	0.068
6	L	0.008	0.003	0.015	0.938	0.015	0.020
7	E	0.008	0.001	0.012	0.958	0.015	0.005
8	I	0.008	0.001	0.016	0.943	0.023	0.009
9	L	0.007	0.002	0.015	0.931	0.032	0.014
10	V	0.006	0.008	0.023	0.838	0.084	0.042
11	C	0.008	0.004	0.025	0.294	0.399	0.271
12	P	0.004	0.003	0.084	0.050	0.631	0.227
13	L	0.008	0.010	0.388	0.057	0.474	0.064
14	C	0.013	0.010	0.323	0.046	0.543	0.065
15	K	0.022	0.016	0.173	0.041	0.602	0.146
16	G	0.061	0.009	0.051	0.021	0.474	0.385
17	P	0.174	0.026	0.054	0.021	0.322	0.403
18	L	0.475	0.051	0.029	0.016	0.173	0.257
19	V	0.681	0.027	0.013	0.011	0.087	0.181
20	F	0.663	0.035	0.013	0.011	0.077	0.200
21	D	0.342	0.021	0.027	0.019	0.407	0.184
22	K	0.035	0.002	0.180	0.069	0.641	0.073
23	S	0.024	0.004	0.141	0.054	0.719	0.058
24	K	0.042	0.011	0.148	0.053	0.693	0.053
25	D	0.084	0.007	0.044	0.039	0.478	0.348
26	E	0.592	0.032	0.023	0.020	0.173	0.160
27	L	0.780	0.034	0.011	0.012	0.083	0.081
28	I	0.692	0.063	0.011	0.023	0.091	0.120
29	C	0.346	0.040	0.037	0.043	0.379	0.155
30	K	0.022	0.002	0.196	0.135	0.607	0.038
31	G	0.007	0.001	0.389	0.109	0.478	0.017
32	D	0.009	0.003	0.296	0.077	0.580	0.035
33	R	0.037	0.007	0.099	0.039	0.551	0.266
34	L	0.138	0.018	0.023	0.018	0.284	0.518
35	A	0.305	0.035	0.020	0.012	0.206	0.422
36	F	0.512	0.021	0.012	0.008	0.161	0.287
37	P	0.456	0.021	0.031	0.013	0.260	0.219
38	I	0.290	0.024	0.080	0.026	0.342	0.237
39	K	0.216	0.011	0.104	0.034	0.444	0.191
40	D	0.124	0.008	0.030	0.023	0.636	0.179
41	G	0.070	0.014	0.022	0.022	0.663	0.210
42	I	0.202	0.116	0.029	0.025	0.502	0.127
43	P	0.324	0.015	0.040	0.030	0.350	0.241
44	M	0.558	0.022	0.048	0.046	0.182	0.145
45	M	0.632	0.081	0.013	0.027	0.096	0.151
46	L	0.301	0.030	0.010	0.133	0.155	0.371
47	E	0.004	0.001	0.149	0.785	0.053	0.009
48	S	0.003	0.001	0.204	0.699	0.087	0.007
49	E	0.002	0.001	0.155	0.738	0.096	0.009
50	A	0.012	0.004	0.031	0.736	0.121	0.096
51	R	0.020	0.008	0.020	0.788	0.080	0.083
52	E	0.054	0.011	0.014	0.426	0.203	0.291
53	L	0.031	0.004	0.013	0.153	0.225	0.574
54	A	0.016	0.009	0.011	0.048	0.308	0.608
55	P	0.016	0.006	0.136	0.173	0.404	0.265
56	E	0.018	0.012	0.162	0.138	0.451	0.220
57	E	0.038	0.016	0.189	0.127	0.347	0.283
58	E	0.066	0.027	0.061	0.068	0.197	0.581
59	V	0.048	0.038	0.027	0.063	0.235	0.590
60	K	0.047	0.041	0.017	0.045	0.237	0.613
61	L	0.032	0.026	0.013	0.037	0.357	0.536
62	E	0.034	0.011	0.020	0.027	0.390	0.519
63	H	0.070	0.021	0.045	0.046	0.457	0.361
64	H	0.145	0.053	0.048	0.030	0.442	0.282
65	H	0.136	0.033	0.037	0.028	0.291	0.474
66	H	0.064	0.030	0.019	0.017	0.230	0.640
67	H	0.026	0.019	0.006	0.015	0.175	0.760
68	H	0.002	0.006	0.001	0.004	0.047	0.941