# TARGET T0348
# Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-ebghtl-stride-seeded.net
# This is a 4-layer network, with 
#	window	units
#	    3	   13
#	    7	   13
#	    9	   13
#	   11	    6 (1 EBGHTL )
# The input amino acid frequencies were determined from
# alignment T0348.t04-thin90.a2m.gz
# with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1)
# The weighting was determined by the posterior distribution
# after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp.
# Counts were regularized to probabilities using
# /projects/compbio/lib/recode3.20comp
# Total sequence weight for alignment was 28.2264
#
Pos	AA	E	B	G	H	T	C
10N	1S	5N	5N	5N	5N	5N	5N
1	M	0.004	0.006	0.004	0.040	0.088	0.857
2	D	0.006	0.008	0.003	0.116	0.076	0.791
3	A	0.002	0.002	0.021	0.813	0.050	0.111
4	K	0.004	0.002	0.039	0.872	0.052	0.031
5	F	0.012	0.003	0.099	0.765	0.094	0.026
6	L	0.041	0.005	0.091	0.632	0.153	0.078
7	E	0.064	0.005	0.062	0.668	0.115	0.085
8	I	0.126	0.010	0.042	0.695	0.070	0.056
9	L	0.142	0.023	0.027	0.641	0.070	0.096
10	V	0.163	0.040	0.055	0.338	0.153	0.251
11	C	0.106	0.018	0.088	0.107	0.331	0.349
12	P	0.071	0.006	0.143	0.057	0.419	0.303
13	L	0.078	0.029	0.084	0.025	0.383	0.401
14	C	0.092	0.039	0.034	0.026	0.470	0.339
15	K	0.094	0.025	0.026	0.046	0.478	0.331
16	G	0.115	0.015	0.027	0.029	0.422	0.393
17	P	0.286	0.025	0.062	0.049	0.323	0.256
18	L	0.486	0.025	0.081	0.040	0.182	0.185
19	V	0.556	0.033	0.036	0.047	0.141	0.187
20	F	0.590	0.055	0.021	0.035	0.105	0.194
21	D	0.364	0.034	0.012	0.023	0.386	0.182
22	K	0.050	0.005	0.192	0.051	0.665	0.037
23	S	0.036	0.006	0.167	0.035	0.717	0.039
24	K	0.021	0.005	0.140	0.026	0.776	0.032
25	D	0.074	0.005	0.035	0.009	0.591	0.286
26	E	0.532	0.076	0.026	0.019	0.131	0.216
27	L	0.765	0.033	0.019	0.017	0.077	0.090
28	I	0.783	0.024	0.017	0.013	0.048	0.116
29	C	0.441	0.014	0.021	0.025	0.185	0.313
30	K	0.101	0.007	0.072	0.036	0.438	0.345
31	G	0.048	0.007	0.090	0.030	0.540	0.285
32	D	0.046	0.014	0.175	0.031	0.554	0.182
33	R	0.096	0.013	0.259	0.050	0.407	0.175
34	L	0.216	0.032	0.105	0.063	0.282	0.301
35	A	0.340	0.025	0.062	0.071	0.199	0.303
36	F	0.412	0.013	0.021	0.030	0.151	0.373
37	P	0.522	0.025	0.016	0.014	0.136	0.288
38	I	0.497	0.082	0.026	0.016	0.322	0.058
39	K	0.323	0.017	0.020	0.012	0.606	0.022
40	D	0.054	0.003	0.018	0.016	0.882	0.028
41	G	0.067	0.008	0.011	0.012	0.846	0.056
42	I	0.368	0.041	0.008	0.009	0.325	0.249
43	P	0.635	0.022	0.025	0.023	0.115	0.180
44	M	0.707	0.023	0.061	0.045	0.073	0.090
45	M	0.691	0.027	0.047	0.050	0.069	0.116
46	L	0.512	0.020	0.041	0.100	0.123	0.204
47	E	0.093	0.004	0.137	0.425	0.185	0.156
48	S	0.036	0.003	0.197	0.449	0.223	0.092
49	E	0.009	0.003	0.271	0.544	0.144	0.029
50	A	0.010	0.006	0.278	0.505	0.147	0.055
51	R	0.012	0.005	0.185	0.575	0.150	0.073
52	E	0.016	0.008	0.071	0.409	0.195	0.301
53	L	0.010	0.013	0.015	0.164	0.172	0.625
54	A	0.006	0.006	0.003	0.017	0.208	0.760
55	P	0.003	0.002	0.095	0.381	0.255	0.264
56	E	0.006	0.001	0.145	0.667	0.142	0.038
57	E	0.021	0.003	0.158	0.604	0.180	0.033
58	E	0.070	0.008	0.067	0.612	0.126	0.117
59	V	0.143	0.015	0.053	0.567	0.100	0.121
60	K	0.160	0.011	0.038	0.520	0.098	0.174
61	L	0.126	0.008	0.048	0.517	0.097	0.203
62	E	0.116	0.013	0.055	0.393	0.148	0.275
63	H	0.082	0.015	0.061	0.459	0.172	0.212
64	H	0.075	0.011	0.064	0.227	0.289	0.335
65	H	0.085	0.019	0.046	0.129	0.272	0.450
66	H	0.046	0.017	0.029	0.102	0.200	0.605
67	H	0.025	0.015	0.007	0.050	0.107	0.797
68	H	0.006	0.002	0.001	0.002	0.022	0.968