# TARGET T0348
# Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net
# This is a 4-layer network, with 
#	window	units
#	    5	   15
#	    7	   15
#	    9	   15
#	   13	    7 (1 EBGHSTL )
# The input amino acid frequencies were determined from
# alignment T0348.t2k-thin90.a2m.gz
# with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1)
# Counts were regularized to probabilities using
# /projects/compbio/lib/recode3.20comp
# Total sequence weight for alignment was 155
#
Pos	AA	E	B	G	H	S	T	C
10N	1S	5N	5N	5N	5N	5N	5N	5N
1	M	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.998
2	D	0.009	0.022	0.001	0.012	0.001	0.004	0.950
3	A	0.002	0.005	0.057	0.518	0.115	0.087	0.216
4	K	0.004	0.007	0.038	0.713	0.051	0.070	0.116
5	F	0.001	0.001	0.025	0.957	0.005	0.007	0.005
6	L	0.001	0.001	0.013	0.973	0.003	0.005	0.005
7	E	0.001	0.001	0.019	0.963	0.002	0.012	0.003
8	I	0.003	0.001	0.026	0.939	0.003	0.027	0.002
9	L	0.005	0.002	0.017	0.858	0.016	0.094	0.007
10	V	0.010	0.011	0.011	0.647	0.030	0.260	0.031
11	C	0.006	0.007	0.022	0.141	0.227	0.106	0.491
12	P	0.010	0.023	0.196	0.092	0.145	0.361	0.173
13	L	0.023	0.023	0.213	0.063	0.110	0.450	0.118
14	C	0.033	0.031	0.133	0.061	0.122	0.355	0.264
15	K	0.051	0.008	0.030	0.045	0.355	0.252	0.260
16	G	0.098	0.011	0.006	0.018	0.569	0.043	0.256
17	P	0.211	0.034	0.005	0.011	0.132	0.026	0.580
18	L	0.565	0.052	0.006	0.012	0.055	0.014	0.296
19	V	0.673	0.033	0.007	0.011	0.037	0.009	0.230
20	F	0.540	0.051	0.009	0.018	0.058	0.019	0.304
21	D	0.287	0.019	0.009	0.022	0.068	0.033	0.562
22	K	0.050	0.008	0.151	0.154	0.159	0.341	0.137
23	S	0.034	0.005	0.182	0.111	0.189	0.360	0.120
24	K	0.050	0.005	0.197	0.098	0.117	0.413	0.121
25	D	0.135	0.006	0.088	0.066	0.188	0.306	0.211
26	E	0.571	0.016	0.027	0.039	0.099	0.051	0.197
27	L	0.733	0.039	0.011	0.030	0.036	0.017	0.134
28	I	0.748	0.045	0.006	0.031	0.033	0.014	0.124
29	C	0.479	0.026	0.005	0.022	0.051	0.014	0.403
30	K	0.098	0.009	0.159	0.152	0.133	0.231	0.218
31	G	0.031	0.004	0.250	0.128	0.154	0.354	0.079
32	D	0.031	0.012	0.390	0.067	0.075	0.299	0.126
33	R	0.101	0.023	0.247	0.033	0.158	0.198	0.240
34	L	0.162	0.027	0.187	0.029	0.111	0.129	0.356
35	A	0.210	0.059	0.088	0.025	0.210	0.071	0.338
36	F	0.205	0.017	0.009	0.021	0.252	0.013	0.484
37	P	0.273	0.035	0.004	0.015	0.037	0.014	0.622
38	I	0.170	0.107	0.008	0.030	0.026	0.019	0.640
39	K	0.070	0.033	0.032	0.021	0.072	0.071	0.700
40	D	0.002	0.001	0.030	0.014	0.125	0.812	0.016
41	G	0.002	0.001	0.019	0.004	0.071	0.880	0.022
42	I	0.071	0.050	0.032	0.017	0.166	0.047	0.618
43	P	0.153	0.072	0.037	0.019	0.065	0.039	0.616
44	M	0.176	0.018	0.098	0.039	0.133	0.167	0.368
45	M	0.163	0.120	0.090	0.031	0.109	0.163	0.324
46	L	0.080	0.056	0.012	0.023	0.222	0.028	0.579
47	E	0.045	0.009	0.115	0.357	0.062	0.078	0.333
48	S	0.008	0.001	0.237	0.645	0.020	0.067	0.022
49	E	0.007	0.003	0.417	0.484	0.011	0.064	0.013
50	A	0.016	0.008	0.174	0.705	0.021	0.041	0.034
51	R	0.027	0.005	0.095	0.672	0.045	0.088	0.068
52	E	0.031	0.009	0.037	0.593	0.047	0.205	0.078
53	L	0.016	0.010	0.023	0.333	0.177	0.085	0.356
54	A	0.013	0.015	0.022	0.113	0.107	0.069	0.661
55	P	0.009	0.004	0.075	0.197	0.115	0.406	0.194
56	E	0.009	0.004	0.104	0.149	0.092	0.407	0.236
57	E	0.016	0.005	0.108	0.244	0.182	0.098	0.347
58	E	0.066	0.023	0.071	0.356	0.060	0.087	0.338
59	V	0.059	0.065	0.048	0.218	0.036	0.097	0.475
60	K	0.012	0.006	0.010	0.076	0.016	0.018	0.862