This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA R A 3 3 NATAA I A 4 4 NATAA V A 5 5 NATAA A A 6 6 NATAA A A 7 7 NATAA D A 8 8 NATAA T A 9 9 NATAA G A 10 10 NATAA G A 11 11 NATAA A A 12 12 NATAA V A 13 13 NATAA L A 14 14 NATAA D A 15 15 NATAA E A 16 16 NATAA T A 17 17 NATAA F A 18 18 NATAA E A 19 19 NATRO P A 20 20 NATAA I A 21 21 NATAA G A 22 22 NATAA L A 23 23 NATAA I A 24 24 NATAA A A 25 25 NATAA T A 26 26 NATAA V A 27 27 NATAA A A 28 28 NATAA V A 29 29 NATAA L A 30 30 NATAA V A 31 31 NATAA E A 32 32 NATAA K A 33 33 NATRO P A 34 34 NATAA Y A 35 35 NATAA R A 36 36 NATAA S A 37 37 NATAA A A 38 38 NATAA K A 39 39 NATAA E A 40 40 NATAA V A 41 41 NATAA M A 42 42 NATAA V A 43 43 NATAA K A 44 44 NATAA Y A 45 45 NATAA A A 46 46 NATAA N A 47 47 NATRO P A 48 48 NATAA Y A 49 49 NATAA D A 50 50 NATAA Y A 51 51 NATAA D A 52 52 NATAA L A 53 53 NATAA T A 54 54 NATAA G A 55 55 NATAA R A 56 56 NATAA Q A 57 57 NATAA A A 58 58 NATAA I A 59 59 NATAA R A 60 60 NATAA D A 61 61 NATAA E A 62 62 NATAA V A 63 63 NATAA L A 64 64 NATAA L A 65 65 NATAA A A 66 66 NATAA I A 67 67 NATAA E A 68 68 NATAA L A 69 69 NATAA A A 70 70 NATAA R A 71 71 NATAA K A 72 72 NATAA V A 73 73 NATAA K A 74 74 NATRO P A 75 75 NATAA D A 76 76 NATAA V A 77 77 NATAA I A 78 78 NATAA H A 79 79 NATAA L A 80 80 NATAA D A 81 81 NATAA S A 82 82 NATAA T A 83 83 NATAA L A 84 84 NATAA G A 85 85 NATAA G A 86 86 NATAA I A 87 87 NATAA E A 88 88 NATAA L A 89 89 NATAA R A 90 90 NATAA K A 91 91 NATAA L A 92 92 NATAA D A 93 93 NATAA E A 94 94 NATRO P A 95 95 NATAA T A 96 96 NATAA I A 97 97 NATAA D A 98 98 NATAA A A 99 99 NATAA L A 100 100 NATAA G A 101 101 NATAA I A 102 102 NATAA S A 103 103 NATAA D A 104 104 NATAA K A 105 105 NATAA G A 106 106 NATAA K A 107 107 NATAA E A 108 108 NATAA V A 109 109 NATAA W A 110 110 NATAA K A 111 111 NATAA E A 112 112 NATAA L A 113 113 NATAA S A 114 114 NATAA K A 115 115 NATAA D A 116 116 NATAA L A 117 117 NATAA Q A 118 118 NATRO P A 119 119 NATAA L A 120 120 NATAA A A 121 121 NATAA R A 122 122 NATAA K A 123 123 NATAA F A 124 124 NATAA W A 125 125 NATAA E A 126 126 NATAA E A 127 127 NATAA T A 128 128 NATAA N A 129 129 NATAA I A 130 130 NATAA E A 131 131 NATAA I A 132 132 NATAA V A 133 133 NATAA A A 134 134 NATAA I A 135 135 NATAA G A 136 136 NATAA K A 137 137 NATAA S A 138 138 NATAA S A 139 139 NATAA V A 140 140 NATRO P A 141 141 NATAA V A 142 142 NATAA R A 143 143 NATAA I A 144 144 NATAA A A 145 145 NATAA E A 146 146 NATAA I A 147 147 NATAA Y A 148 148 NATAA A A 149 149 NATAA G A 150 150 NATAA I A 151 151 NATAA Y A 152 152 NATAA S A 153 153 NATAA A A 154 154 NATAA K A 155 155 NATAA W A 156 156 NATAA G A 157 157 NATAA I A 158 158 NATAA E A 159 159 NATAA N A 160 160 NATAA V A 161 161 NATAA E A 162 162 NATAA K A 163 163 NATAA E A 164 164 NATAA G A 165 165 NATAA H A 166 166 NATAA L A 167 167 NATAA I A 168 168 NATAA I A 169 169 NATAA G A 170 170 NATAA L A 171 171 NATRO P A 172 172 NATAA R A 173 173 NATAA Y A 174 174 NATAA M A 175 175 NATAA E A 176 176 NATAA V A 177 177 NATAA N A 178 178 NATAA I A 179 179 NATAA K A 180 180 NATAA D A 181 181 NATAA G A 182 182 NATAA K A 183 183 NATAA I A 184 184 NATAA I A 185 185 NATAA G A 186 186 NATAA R A 187 187 NATAA S A 188 188 NATAA L A 189 189 NATAA D A 190 190 NATRO P A 191 191 NATAA R A 192 192 NATAA E A 193 193 NATAA G A 194 194 NATAA G A 195 195 NATAA L A 196 196 NATAA Y A 197 197 NATAA G A 198 198 NATAA S A 199 199 NATAA A A 200 200 NATAA E A 201 201 NATAA V A 202 202 NATAA S A 203 203 NATAA V A 204 204 NATRO P A 205 205 NATAA E A 206 206 NATAA G A 207 207 NATAA V A 208 208 NATAA K A 209 209 NATAA W A 210 210 NATAA E A 211 211 NATAA I A 212 212 NATAA Y A 213 213 NATRO P A 214 214 NATAA N A 215 215 NATRO P A 216 216 NATAA V A 217 217 NATAA A A 218 218 NATAA R A 219 219 NATAA R A 220 220 NATAA F A 221 221 NATAA M A 222 222 NATAA I A 223 223 NATAA F A 224 224 NATAA E A 225 225 NATAA I A 226 226 NATAA F A 227 227 NATAA S A 228 228 NATAA K A 229 229 NATAA R