# TARGET T0341 # Using neural net t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0341.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 4797 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.427 0.120 0.089 0.104 0.059 0.045 0.051 0.034 0.034 0.023 0.016 2 A 0.258 0.139 0.068 0.117 0.088 0.082 0.091 0.055 0.048 0.033 0.021 3 A 0.120 0.089 0.049 0.120 0.104 0.117 0.140 0.085 0.077 0.054 0.044 4 R 0.120 0.100 0.109 0.150 0.125 0.113 0.109 0.057 0.056 0.035 0.027 5 R 0.098 0.105 0.251 0.191 0.115 0.086 0.079 0.030 0.022 0.013 0.009 6 A 0.182 0.195 0.154 0.216 0.112 0.062 0.044 0.015 0.011 0.006 0.003 7 L 0.004 0.004 0.005 0.014 0.022 0.039 0.129 0.183 0.264 0.201 0.134 8 K 0.017 0.080 0.094 0.279 0.260 0.154 0.083 0.020 0.009 0.003 0.002 9 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.012 0.078 0.168 0.276 0.259 0.201 10 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.066 0.141 0.232 0.246 0.297 11 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.047 0.104 0.210 0.287 0.338 12 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.035 0.082 0.203 0.314 0.352 13 D 0.001 0.002 0.002 0.011 0.016 0.032 0.103 0.164 0.234 0.229 0.208 14 L 0.002 0.004 0.003 0.016 0.027 0.046 0.120 0.178 0.233 0.207 0.163 15 N 0.009 0.024 0.017 0.113 0.157 0.172 0.222 0.135 0.090 0.041 0.020 16 G 0.021 0.036 0.021 0.115 0.154 0.186 0.204 0.104 0.081 0.051 0.026 17 T 0.012 0.017 0.011 0.038 0.038 0.048 0.109 0.127 0.196 0.202 0.201 18 L 0.003 0.003 0.002 0.009 0.013 0.027 0.091 0.130 0.221 0.247 0.254 19 H 0.005 0.015 0.011 0.034 0.045 0.060 0.126 0.142 0.201 0.188 0.173 20 I 0.006 0.016 0.011 0.063 0.087 0.105 0.176 0.152 0.171 0.125 0.088 21 E 0.066 0.086 0.060 0.164 0.157 0.143 0.142 0.075 0.054 0.033 0.021 22 D 0.197 0.146 0.086 0.214 0.136 0.082 0.069 0.031 0.021 0.012 0.006 23 A 0.189 0.116 0.058 0.154 0.119 0.092 0.101 0.059 0.053 0.036 0.025 24 A 0.018 0.066 0.027 0.078 0.089 0.113 0.158 0.120 0.137 0.109 0.085 25 V 0.006 0.009 0.005 0.022 0.051 0.103 0.190 0.184 0.193 0.135 0.102 26 P 0.431 0.139 0.083 0.120 0.074 0.052 0.053 0.021 0.015 0.008 0.004 27 G 0.004 0.034 0.022 0.157 0.208 0.194 0.180 0.091 0.060 0.033 0.017 28 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.019 0.058 0.192 0.291 0.432 29 Q 0.003 0.003 0.015 0.098 0.217 0.292 0.239 0.077 0.038 0.015 0.005 30 E 0.006 0.040 0.443 0.252 0.139 0.067 0.037 0.010 0.005 0.001 0.001 31 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.015 0.113 0.165 0.259 0.242 0.203 32 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.020 0.068 0.194 0.322 0.393 33 K 0.001 0.005 0.461 0.285 0.153 0.060 0.026 0.005 0.002 0.001 0.001 34 R 0.001 0.002 0.022 0.081 0.209 0.346 0.263 0.053 0.017 0.005 0.002 35 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.037 0.157 0.332 0.463 36 R 0.001 0.003 0.007 0.048 0.115 0.187 0.342 0.161 0.083 0.036 0.018 37 A 0.011 0.054 0.711 0.130 0.049 0.023 0.011 0.004 0.003 0.002 0.001 38 T 0.005 0.014 0.013 0.064 0.113 0.252 0.374 0.098 0.041 0.018 0.007 39 S 0.528 0.219 0.050 0.100 0.039 0.022 0.019 0.008 0.007 0.004 0.003 40 V 0.002 0.004 0.003 0.012 0.020 0.037 0.117 0.151 0.223 0.222 0.208 41 M 0.033 0.096 0.071 0.193 0.204 0.167 0.127 0.053 0.034 0.014 0.007 42 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.009 0.044 0.104 0.228 0.258 0.349 43 R 0.005 0.008 0.007 0.043 0.067 0.113 0.225 0.176 0.148 0.112 0.096 44 F 0.001 0.002 0.002 0.006 0.007 0.015 0.079 0.149 0.259 0.263 0.217 45 V 0.001 0.002 0.003 0.005 0.007 0.013 0.048 0.087 0.185 0.266 0.383 46 T 0.003 0.008 0.009 0.023 0.029 0.043 0.120 0.153 0.229 0.218 0.165 47 N 0.024 0.031 0.022 0.084 0.097 0.126 0.209 0.150 0.134 0.083 0.041 48 T 0.052 0.080 0.047 0.126 0.137 0.140 0.164 0.094 0.074 0.049 0.037 49 T 0.089 0.108 0.044 0.101 0.097 0.098 0.137 0.090 0.101 0.077 0.056 50 K 0.422 0.158 0.056 0.141 0.092 0.056 0.041 0.016 0.010 0.005 0.003 51 E 0.242 0.124 0.070 0.135 0.110 0.094 0.110 0.054 0.037 0.017 0.008 52 T 0.031 0.105 0.039 0.083 0.088 0.113 0.144 0.108 0.118 0.091 0.079 53 K 0.010 0.015 0.017 0.073 0.160 0.219 0.251 0.117 0.080 0.039 0.018 54 K 0.279 0.144 0.332 0.146 0.057 0.022 0.013 0.003 0.002 0.001 0.001 55 D 0.015 0.058 0.168 0.385 0.202 0.098 0.053 0.013 0.006 0.002 0.001 56 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.015 0.080 0.154 0.268 0.257 0.216 57 L 0.001 0.002 0.025 0.061 0.152 0.274 0.292 0.107 0.057 0.023 0.006 58 E 0.015 0.036 0.805 0.102 0.026 0.009 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 59 R 0.001 0.004 0.018 0.048 0.095 0.228 0.392 0.129 0.059 0.021 0.007 60 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.006 0.036 0.091 0.221 0.318 0.322 61 K 0.017 0.067 0.225 0.290 0.224 0.107 0.051 0.011 0.005 0.002 0.001 62 K 0.067 0.101 0.431 0.186 0.096 0.063 0.035 0.011 0.007 0.003 0.001 63 L 0.024 0.024 0.014 0.042 0.059 0.125 0.270 0.170 0.133 0.091 0.050 64 E 0.231 0.191 0.082 0.156 0.114 0.083 0.074 0.030 0.021 0.011 0.006 65 F 0.025 0.022 0.020 0.035 0.037 0.049 0.114 0.131 0.201 0.199 0.166 66 E 0.176 0.206 0.115 0.195 0.120 0.083 0.056 0.022 0.015 0.008 0.005 67 I 0.013 0.012 0.007 0.022 0.026 0.040 0.100 0.124 0.207 0.221 0.229 68 S 0.055 0.094 0.042 0.142 0.141 0.135 0.150 0.088 0.070 0.047 0.037 69 E 0.170 0.105 0.089 0.147 0.117 0.096 0.096 0.059 0.054 0.039 0.027 70 D 0.181 0.130 0.056 0.138 0.113 0.095 0.110 0.064 0.052 0.036 0.027 71 E 0.195 0.118 0.065 0.163 0.126 0.104 0.092 0.049 0.042 0.028 0.017 72 I 0.031 0.045 0.027 0.083 0.082 0.095 0.165 0.127 0.143 0.113 0.089 73 F 0.038 0.033 0.040 0.068 0.073 0.083 0.134 0.128 0.155 0.138 0.110 74 T 0.024 0.038 0.036 0.069 0.078 0.087 0.147 0.126 0.157 0.132 0.107 75 S 0.043 0.079 0.057 0.124 0.107 0.109 0.137 0.099 0.106 0.082 0.055 76 L 0.042 0.034 0.031 0.082 0.112 0.140 0.194 0.126 0.117 0.080 0.044 77 T 0.334 0.143 0.134 0.129 0.075 0.053 0.056 0.030 0.024 0.014 0.009 78 A 0.042 0.043 0.049 0.083 0.085 0.109 0.174 0.122 0.131 0.100 0.062 79 A 0.012 0.012 0.019 0.033 0.042 0.067 0.156 0.151 0.203 0.172 0.133 80 R 0.021 0.036 0.159 0.233 0.193 0.141 0.114 0.044 0.033 0.018 0.008 81 N 0.022 0.060 0.356 0.188 0.133 0.096 0.078 0.030 0.021 0.011 0.006 82 L 0.003 0.006 0.022 0.030 0.039 0.068 0.175 0.165 0.203 0.164 0.125 83 I 0.003 0.005 0.014 0.021 0.039 0.076 0.208 0.197 0.201 0.153 0.083 84 E 0.021 0.070 0.400 0.243 0.138 0.065 0.039 0.012 0.008 0.003 0.002 85 Q 0.039 0.065 0.162 0.156 0.134 0.139 0.150 0.066 0.048 0.026 0.013 86 K 0.066 0.050 0.040 0.086 0.083 0.102 0.173 0.130 0.129 0.092 0.049 87 Q 0.277 0.170 0.097 0.130 0.095 0.079 0.075 0.033 0.024 0.013 0.006 88 V 0.069 0.047 0.049 0.072 0.069 0.080 0.135 0.121 0.145 0.125 0.088 89 R 0.205 0.250 0.092 0.152 0.096 0.070 0.062 0.031 0.023 0.013 0.007 90 P 0.210 0.112 0.053 0.113 0.097 0.095 0.113 0.072 0.069 0.044 0.023 91 M 0.103 0.065 0.037 0.089 0.092 0.107 0.149 0.111 0.118 0.080 0.051 92 L 0.087 0.070 0.064 0.129 0.119 0.117 0.151 0.097 0.087 0.053 0.027 93 L 0.046 0.048 0.067 0.100 0.112 0.122 0.172 0.122 0.108 0.066 0.037 94 L 0.024 0.035 0.043 0.050 0.051 0.071 0.140 0.132 0.175 0.158 0.121 95 D 0.042 0.083 0.055 0.144 0.160 0.158 0.163 0.082 0.063 0.034 0.015 96 D 0.322 0.121 0.134 0.141 0.079 0.054 0.058 0.030 0.029 0.020 0.011 97 R 0.170 0.106 0.110 0.159 0.128 0.104 0.114 0.050 0.034 0.017 0.009 98 A 0.015 0.016 0.015 0.029 0.033 0.060 0.145 0.150 0.214 0.188 0.136 99 L 0.005 0.015 0.025 0.073 0.129 0.184 0.249 0.142 0.101 0.053 0.024 100 P 0.134 0.122 0.477 0.144 0.062 0.027 0.017 0.006 0.005 0.003 0.002 101 E 0.035 0.056 0.081 0.185 0.178 0.167 0.171 0.065 0.037 0.017 0.008 102 F 0.006 0.004 0.005 0.012 0.015 0.032 0.100 0.135 0.222 0.245 0.222 103 T 0.027 0.059 0.090 0.163 0.175 0.163 0.171 0.071 0.048 0.023 0.010 104 G 0.150 0.133 0.279 0.156 0.088 0.062 0.057 0.029 0.025 0.015 0.008 105 V 0.016 0.022 0.019 0.062 0.075 0.106 0.204 0.158 0.149 0.113 0.076 106 Q 0.124 0.119 0.055 0.131 0.118 0.111 0.130 0.077 0.067 0.043 0.024 107 T 0.091 0.095 0.071 0.174 0.151 0.131 0.127 0.068 0.052 0.027 0.013 108 Q 0.290 0.141 0.110 0.133 0.095 0.071 0.065 0.034 0.029 0.020 0.012 109 D 0.128 0.200 0.054 0.157 0.113 0.095 0.099 0.061 0.050 0.029 0.015 110 P 0.211 0.077 0.027 0.080 0.087 0.095 0.124 0.096 0.095 0.070 0.040 111 N 0.233 0.167 0.079 0.161 0.126 0.087 0.071 0.033 0.025 0.012 0.006 112 A 0.096 0.092 0.097 0.177 0.137 0.112 0.110 0.068 0.057 0.035 0.018 113 V 0.021 0.026 0.024 0.084 0.103 0.138 0.214 0.147 0.124 0.077 0.043 114 V 0.015 0.021 0.035 0.047 0.053 0.075 0.154 0.159 0.192 0.149 0.103 115 I 0.022 0.041 0.068 0.117 0.124 0.123 0.173 0.111 0.104 0.074 0.043 116 G 0.173 0.145 0.117 0.156 0.110 0.086 0.085 0.046 0.041 0.026 0.016 117 L 0.044 0.036 0.025 0.076 0.085 0.107 0.187 0.140 0.137 0.100 0.063 118 A 0.086 0.075 0.036 0.088 0.092 0.100 0.141 0.110 0.116 0.090 0.066 119 P 0.270 0.162 0.073 0.109 0.084 0.074 0.080 0.047 0.048 0.032 0.022 120 E 0.326 0.129 0.053 0.115 0.094 0.086 0.085 0.044 0.034 0.022 0.012 121 H 0.097 0.056 0.029 0.076 0.085 0.102 0.159 0.125 0.126 0.089 0.056 122 F 0.119 0.137 0.063 0.148 0.124 0.098 0.107 0.069 0.064 0.040 0.031 123 H 0.021 0.055 0.030 0.059 0.069 0.096 0.164 0.135 0.159 0.127 0.085 124 Y 0.014 0.012 0.011 0.040 0.083 0.143 0.238 0.171 0.154 0.085 0.050 125 Q 0.481 0.140 0.109 0.136 0.060 0.029 0.024 0.010 0.006 0.003 0.002 126 L 0.001 0.018 0.025 0.095 0.151 0.193 0.237 0.127 0.086 0.045 0.022 127 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.042 0.097 0.235 0.294 0.318 128 N 0.007 0.012 0.055 0.176 0.250 0.250 0.174 0.044 0.021 0.008 0.002 129 Q 0.007 0.047 0.388 0.276 0.146 0.077 0.042 0.010 0.005 0.002 0.001 130 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.059 0.111 0.246 0.284 0.286 131 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.011 0.081 0.130 0.232 0.285 0.256 132 R 0.001 0.007 0.473 0.283 0.154 0.054 0.020 0.005 0.002 0.001 0.001 133 L 0.001 0.002 0.023 0.036 0.106 0.286 0.372 0.103 0.045 0.019 0.007 134 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.024 0.065 0.190 0.295 0.421 135 L 0.003 0.007 0.016 0.039 0.077 0.157 0.321 0.164 0.114 0.062 0.039 136 D 0.101 0.146 0.423 0.221 0.067 0.028 0.011 0.002 0.001 0.001 0.001 137 G 0.495 0.208 0.089 0.118 0.050 0.024 0.012 0.002 0.001 0.001 0.001 138 A 0.007 0.012 0.005 0.025 0.041 0.074 0.187 0.183 0.211 0.154 0.101 139 P 0.020 0.085 0.046 0.192 0.227 0.194 0.139 0.051 0.028 0.012 0.006 140 L 0.001 0.001 0.001 0.006 0.012 0.032 0.118 0.181 0.246 0.223 0.180 141 I 0.001 0.002 0.002 0.013 0.022 0.043 0.140 0.177 0.214 0.203 0.182 142 A 0.001 0.001 0.001 0.004 0.006 0.011 0.054 0.105 0.210 0.271 0.336 143 I 0.002 0.004 0.004 0.015 0.023 0.036 0.103 0.152 0.234 0.235 0.191 144 H 0.011 0.017 0.012 0.053 0.069 0.100 0.190 0.178 0.178 0.125 0.067 145 K 0.099 0.128 0.064 0.214 0.176 0.123 0.102 0.046 0.028 0.014 0.006 146 A 0.078 0.073 0.036 0.092 0.077 0.079 0.128 0.110 0.137 0.108 0.082 147 R 0.150 0.116 0.067 0.164 0.136 0.118 0.109 0.052 0.045 0.027 0.015 148 Y 0.131 0.092 0.067 0.122 0.095 0.093 0.131 0.092 0.091 0.056 0.030 149 Y 0.049 0.039 0.047 0.075 0.082 0.110 0.173 0.131 0.136 0.096 0.061 150 K 0.036 0.042 0.058 0.097 0.115 0.143 0.180 0.108 0.102 0.071 0.048 151 R 0.030 0.064 0.128 0.170 0.144 0.126 0.134 0.072 0.067 0.041 0.025 152 K 0.078 0.083 0.180 0.156 0.129 0.109 0.110 0.057 0.049 0.032 0.017 153 D 0.127 0.103 0.102 0.153 0.110 0.100 0.127 0.069 0.057 0.033 0.019 154 G 0.078 0.039 0.034 0.060 0.066 0.086 0.148 0.130 0.145 0.126 0.088 155 L 0.034 0.071 0.102 0.202 0.172 0.136 0.139 0.062 0.044 0.024 0.012 156 A 0.045 0.071 0.145 0.145 0.135 0.124 0.125 0.074 0.065 0.042 0.029 157 L 0.030 0.029 0.029 0.074 0.076 0.091 0.168 0.138 0.150 0.121 0.094 158 G 0.287 0.174 0.050 0.131 0.098 0.078 0.076 0.039 0.034 0.021 0.012 159 P 0.118 0.053 0.023 0.057 0.058 0.066 0.116 0.110 0.147 0.133 0.120 160 G 0.149 0.103 0.035 0.100 0.100 0.100 0.128 0.087 0.087 0.061 0.051 161 P 0.173 0.139 0.054 0.146 0.118 0.101 0.102 0.064 0.052 0.032 0.019 162 F 0.024 0.032 0.018 0.080 0.108 0.139 0.199 0.139 0.129 0.083 0.049 163 V 0.006 0.005 0.005 0.011 0.013 0.020 0.059 0.102 0.208 0.254 0.316 164 T 0.041 0.072 0.067 0.195 0.166 0.132 0.142 0.077 0.057 0.033 0.019 165 A 0.015 0.024 0.027 0.056 0.063 0.086 0.171 0.167 0.174 0.131 0.084 166 L 0.009 0.008 0.009 0.025 0.030 0.045 0.115 0.142 0.205 0.210 0.200 167 E 0.014 0.029 0.032 0.094 0.106 0.125 0.193 0.134 0.127 0.089 0.057 168 Y 0.021 0.051 0.052 0.096 0.097 0.106 0.157 0.125 0.134 0.096 0.064 169 A 0.039 0.038 0.031 0.079 0.072 0.081 0.142 0.123 0.151 0.132 0.111 170 T 0.115 0.098 0.037 0.107 0.116 0.115 0.145 0.096 0.085 0.056 0.032 171 D 0.232 0.176 0.069 0.169 0.112 0.080 0.069 0.035 0.030 0.017 0.010 172 T 0.136 0.089 0.037 0.093 0.100 0.108 0.133 0.092 0.089 0.071 0.052 173 K 0.336 0.172 0.079 0.135 0.089 0.066 0.054 0.026 0.021 0.013 0.009 174 A 0.226 0.144 0.072 0.134 0.103 0.082 0.082 0.051 0.046 0.035 0.026 175 M 0.079 0.058 0.039 0.085 0.087 0.105 0.155 0.116 0.116 0.093 0.066 176 V 0.115 0.120 0.079 0.160 0.125 0.099 0.106 0.061 0.059 0.041 0.034 177 V 0.084 0.063 0.047 0.106 0.105 0.109 0.149 0.101 0.100 0.078 0.058 178 G 0.332 0.150 0.061 0.144 0.096 0.070 0.059 0.030 0.028 0.018 0.012 179 K 0.098 0.076 0.033 0.086 0.085 0.092 0.134 0.112 0.116 0.094 0.074 180 P 0.075 0.111 0.038 0.100 0.098 0.097 0.127 0.101 0.111 0.080 0.062 181 E 0.037 0.140 0.047 0.135 0.147 0.137 0.148 0.085 0.069 0.037 0.018 182 K 0.103 0.078 0.044 0.188 0.215 0.164 0.114 0.045 0.029 0.014 0.006 183 T 0.348 0.174 0.105 0.180 0.088 0.045 0.034 0.013 0.007 0.003 0.002 184 F 0.001 0.001 0.002 0.013 0.029 0.066 0.186 0.215 0.237 0.162 0.088 185 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.010 0.058 0.122 0.251 0.285 0.268 186 L 0.001 0.005 0.059 0.183 0.229 0.230 0.167 0.056 0.040 0.021 0.008 187 E 0.001 0.007 0.092 0.136 0.167 0.190 0.208 0.087 0.061 0.034 0.017 188 A 0.001 0.001 0.002 0.002 0.002 0.004 0.029 0.075 0.193 0.290 0.403 189 L 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.034 0.145 0.204 0.268 0.220 0.113 190 R 0.002 0.016 0.334 0.306 0.206 0.085 0.037 0.009 0.004 0.002 0.001 191 D 0.002 0.014 0.053 0.068 0.128 0.258 0.339 0.082 0.036 0.014 0.005 192 A 0.002 0.002 0.002 0.005 0.008 0.022 0.129 0.176 0.250 0.232 0.173 193 D 0.598 0.258 0.040 0.066 0.021 0.009 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 194 C 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.020 0.089 0.145 0.244 0.246 0.242 195 A 0.194 0.635 0.058 0.083 0.020 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 196 P 0.030 0.030 0.018 0.095 0.157 0.182 0.221 0.113 0.082 0.043 0.029 197 E 0.421 0.203 0.060 0.139 0.092 0.043 0.024 0.008 0.005 0.002 0.002 198 E 0.004 0.030 0.027 0.249 0.295 0.230 0.125 0.028 0.009 0.003 0.001 199 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.030 0.101 0.214 0.300 0.349 200 V 0.001 0.001 0.002 0.005 0.014 0.052 0.194 0.216 0.215 0.164 0.136 201 M 0.001 0.001 0.002 0.003 0.003 0.007 0.045 0.087 0.207 0.310 0.335 202 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.013 0.065 0.117 0.206 0.290 0.300 203 G 0.009 0.022 0.020 0.072 0.076 0.095 0.174 0.149 0.163 0.120 0.100 204 D 0.002 0.006 0.004 0.022 0.037 0.055 0.134 0.159 0.196 0.192 0.194 205 D 0.078 0.236 0.080 0.258 0.163 0.093 0.056 0.017 0.011 0.005 0.004 206 C 0.027 0.025 0.012 0.071 0.128 0.162 0.209 0.131 0.108 0.076 0.051 207 R 0.401 0.157 0.052 0.155 0.098 0.055 0.040 0.016 0.012 0.008 0.006 208 D 0.038 0.098 0.036 0.192 0.186 0.156 0.123 0.063 0.050 0.033 0.023 209 D 0.001 0.004 0.003 0.009 0.016 0.029 0.073 0.120 0.221 0.244 0.280 210 V 0.006 0.006 0.007 0.034 0.080 0.168 0.238 0.149 0.143 0.097 0.071 211 D 0.099 0.109 0.276 0.281 0.125 0.052 0.033 0.010 0.008 0.005 0.004 212 G 0.001 0.003 0.006 0.043 0.054 0.084 0.200 0.168 0.169 0.146 0.128 213 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.033 0.132 0.288 0.533 214 Q 0.002 0.008 0.092 0.207 0.255 0.223 0.143 0.040 0.018 0.007 0.004 215 N 0.001 0.012 0.230 0.163 0.200 0.202 0.129 0.035 0.017 0.007 0.003 216 I 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.015 0.104 0.144 0.226 0.261 0.240 217 G 0.202 0.147 0.046 0.148 0.117 0.089 0.106 0.054 0.046 0.028 0.017 218 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.019 0.056 0.185 0.276 0.456 219 L 0.011 0.029 0.019 0.088 0.140 0.198 0.269 0.118 0.072 0.033 0.023 220 G 0.001 0.001 0.001 0.004 0.005 0.012 0.058 0.120 0.234 0.274 0.292 221 I 0.001 0.001 0.001 0.005 0.007 0.016 0.067 0.123 0.205 0.269 0.305 222 L 0.001 0.002 0.003 0.011 0.018 0.031 0.097 0.158 0.248 0.224 0.207 223 V 0.001 0.002 0.002 0.007 0.010 0.018 0.063 0.123 0.229 0.277 0.268 224 K 0.015 0.032 0.032 0.139 0.153 0.157 0.192 0.118 0.092 0.048 0.022 225 T 0.083 0.113 0.062 0.170 0.141 0.125 0.136 0.077 0.054 0.027 0.013 226 G 0.168 0.107 0.054 0.119 0.092 0.087 0.116 0.077 0.080 0.060 0.040 227 K 0.099 0.183 0.078 0.226 0.164 0.108 0.082 0.030 0.019 0.009 0.004 228 Y 0.034 0.024 0.012 0.030 0.035 0.049 0.121 0.145 0.219 0.190 0.141 229 K 0.128 0.166 0.070 0.192 0.151 0.118 0.091 0.037 0.025 0.013 0.008 230 A 0.139 0.117 0.074 0.156 0.132 0.102 0.112 0.062 0.054 0.033 0.019 231 A 0.115 0.074 0.052 0.101 0.104 0.114 0.142 0.092 0.093 0.066 0.047 232 D 0.128 0.175 0.098 0.149 0.107 0.090 0.107 0.059 0.046 0.027 0.016 233 E 0.114 0.075 0.060 0.121 0.124 0.130 0.162 0.090 0.068 0.038 0.019 234 E 0.239 0.147 0.132 0.159 0.098 0.066 0.067 0.033 0.028 0.018 0.013 235 K 0.097 0.138 0.141 0.234 0.145 0.098 0.077 0.030 0.022 0.012 0.007 236 I 0.038 0.021 0.020 0.036 0.040 0.066 0.146 0.145 0.178 0.163 0.145 237 N 0.254 0.221 0.100 0.151 0.097 0.072 0.057 0.023 0.015 0.008 0.004 238 P 0.311 0.126 0.076 0.115 0.080 0.069 0.081 0.045 0.044 0.032 0.021 239 P 0.094 0.117 0.037 0.154 0.152 0.142 0.144 0.067 0.050 0.029 0.014 240 P 0.042 0.025 0.015 0.048 0.065 0.081 0.136 0.139 0.180 0.152 0.117 241 Y 0.048 0.079 0.049 0.202 0.198 0.158 0.139 0.060 0.039 0.018 0.010 242 L 0.003 0.007 0.009 0.030 0.061 0.102 0.196 0.201 0.195 0.130 0.066 243 T 0.015 0.039 0.026 0.114 0.138 0.145 0.213 0.126 0.099 0.054 0.030 244 C 0.004 0.004 0.003 0.011 0.018 0.035 0.129 0.181 0.245 0.204 0.167 245 E 0.182 0.174 0.147 0.244 0.125 0.053 0.041 0.015 0.010 0.005 0.004 246 S 0.029 0.213 0.062 0.201 0.159 0.118 0.110 0.047 0.033 0.018 0.010 247 F 0.001 0.004 0.002 0.013 0.032 0.063 0.145 0.176 0.227 0.192 0.145 248 P 0.507 0.200 0.073 0.115 0.055 0.029 0.015 0.003 0.001 0.001 0.001 249 H 0.054 0.127 0.121 0.336 0.191 0.094 0.056 0.014 0.005 0.002 0.001 250 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.050 0.101 0.239 0.286 0.306 251 V 0.001 0.001 0.004 0.023 0.073 0.201 0.330 0.167 0.115 0.059 0.027 252 D 0.037 0.064 0.731 0.123 0.030 0.009 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 253 H 0.001 0.003 0.013 0.039 0.098 0.249 0.387 0.126 0.055 0.023 0.008 254 I 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.002 0.017 0.053 0.191 0.337 0.395 255 L 0.002 0.009 0.061 0.145 0.239 0.248 0.193 0.061 0.027 0.011 0.003 256 Q 0.022 0.060 0.665 0.160 0.057 0.023 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 257 H 0.012 0.013 0.016 0.034 0.062 0.161 0.363 0.169 0.103 0.051 0.017 258 L 0.043 0.043 0.038 0.050 0.041 0.062 0.158 0.140 0.182 0.146 0.096 259 L 0.064 0.100 0.137 0.102 0.088 0.096 0.120 0.082 0.087 0.070 0.054