# TARGET T0338 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-pb-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 16 (1 pb ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp7/T0338/T0338.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 989 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M N O P 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 A 0.057 0.033 0.056 0.075 0.004 0.177 0.007 0.007 0.007 0.009 0.190 0.156 0.207 0.002 0.003 0.009 2 S 0.014 0.095 0.058 0.055 0.001 0.090 0.002 0.006 0.003 0.002 0.115 0.320 0.228 0.001 0.004 0.006 3 S 0.006 0.022 0.031 0.062 0.001 0.052 0.001 0.002 0.002 0.001 0.119 0.168 0.522 0.001 0.002 0.007 4 R 0.003 0.008 0.035 0.027 0.001 0.027 0.004 0.001 0.001 0.001 0.050 0.087 0.752 0.001 0.001 0.002 5 W 0.001 0.008 0.009 0.027 0.001 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 0.018 0.032 0.888 0.001 0.002 0.003 6 F 0.002 0.017 0.014 0.063 0.001 0.016 0.006 0.001 0.001 0.001 0.005 0.027 0.822 0.003 0.002 0.023 7 F 0.007 0.015 0.080 0.116 0.001 0.023 0.011 0.001 0.001 0.001 0.007 0.012 0.700 0.003 0.007 0.015 8 T 0.002 0.020 0.040 0.042 0.001 0.180 0.004 0.004 0.001 0.001 0.015 0.016 0.657 0.003 0.005 0.009 9 R 0.002 0.008 0.006 0.022 0.001 0.051 0.002 0.003 0.001 0.001 0.324 0.014 0.551 0.006 0.002 0.005 10 E 0.002 0.050 0.011 0.020 0.001 0.009 0.003 0.002 0.001 0.001 0.028 0.236 0.618 0.003 0.009 0.006 11 Q 0.003 0.005 0.020 0.017 0.001 0.014 0.012 0.001 0.001 0.001 0.005 0.024 0.837 0.016 0.008 0.036 12 L 0.005 0.006 0.067 0.013 0.007 0.017 0.074 0.003 0.001 0.001 0.029 0.011 0.694 0.042 0.017 0.015 13 E 0.008 0.054 0.077 0.048 0.004 0.016 0.030 0.040 0.005 0.002 0.029 0.025 0.454 0.041 0.085 0.082 14 N 0.034 0.039 0.129 0.139 0.003 0.008 0.033 0.006 0.035 0.010 0.009 0.017 0.196 0.025 0.038 0.279 15 T 0.079 0.027 0.356 0.097 0.007 0.078 0.051 0.003 0.003 0.003 0.008 0.011 0.207 0.005 0.011 0.054 16 P 0.033 0.116 0.279 0.186 0.012 0.087 0.021 0.017 0.003 0.004 0.091 0.016 0.098 0.010 0.006 0.020 17 S 0.016 0.084 0.035 0.165 0.027 0.372 0.013 0.014 0.010 0.007 0.047 0.120 0.067 0.007 0.008 0.007 18 R 0.011 0.089 0.063 0.088 0.026 0.055 0.011 0.025 0.009 0.005 0.380 0.050 0.155 0.006 0.011 0.015 19 R 0.013 0.031 0.036 0.036 0.154 0.032 0.177 0.010 0.010 0.005 0.030 0.135 0.043 0.268 0.007 0.013 20 C 0.009 0.024 0.068 0.039 0.002 0.013 0.009 0.213 0.004 0.002 0.017 0.019 0.066 0.002 0.504 0.009 21 G 0.012 0.024 0.050 0.051 0.004 0.024 0.011 0.005 0.179 0.099 0.024 0.017 0.059 0.005 0.004 0.433 22 V 0.677 0.034 0.070 0.104 0.002 0.009 0.004 0.005 0.003 0.001 0.015 0.029 0.033 0.001 0.005 0.007 23 E 0.013 0.033 0.328 0.111 0.012 0.328 0.013 0.005 0.004 0.007 0.017 0.036 0.073 0.003 0.003 0.013 24 A 0.018 0.113 0.078 0.207 0.007 0.127 0.005 0.020 0.003 0.003 0.247 0.041 0.118 0.002 0.006 0.007 25 D 0.010 0.070 0.037 0.136 0.007 0.202 0.004 0.007 0.011 0.005 0.093 0.271 0.132 0.003 0.004 0.009 26 K 0.018 0.058 0.111 0.121 0.003 0.023 0.004 0.010 0.003 0.002 0.168 0.104 0.353 0.002 0.006 0.014 27 E 0.006 0.013 0.031 0.029 0.005 0.202 0.008 0.002 0.002 0.002 0.025 0.166 0.495 0.004 0.002 0.008 28 L 0.002 0.006 0.010 0.007 0.001 0.039 0.003 0.003 0.001 0.001 0.173 0.031 0.719 0.001 0.003 0.002 29 S 0.001 0.014 0.003 0.009 0.001 0.015 0.001 0.001 0.001 0.001 0.038 0.338 0.572 0.001 0.002 0.004 30 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.031 0.942 0.001 0.001 0.002 31 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.020 0.965 0.001 0.001 0.001 32 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.015 0.980 0.001 0.001 0.001 33 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.992 0.001 0.001 0.001 34 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 35 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 36 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 37 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 38 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 39 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 40 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 41 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 42 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.001 0.004 43 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.989 0.001 0.002 0.001 44 R 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.028 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.222 0.688 0.004 0.047 45 L 0.003 0.002 0.026 0.004 0.001 0.001 0.009 0.006 0.001 0.001 0.001 0.004 0.308 0.002 0.624 0.009 46 N 0.003 0.008 0.034 0.007 0.001 0.009 0.005 0.001 0.009 0.012 0.004 0.003 0.244 0.003 0.002 0.656 47 V 0.463 0.012 0.031 0.028 0.001 0.018 0.006 0.001 0.001 0.001 0.034 0.051 0.338 0.002 0.003 0.008 48 S 0.002 0.010 0.034 0.004 0.001 0.371 0.001 0.001 0.001 0.002 0.052 0.116 0.402 0.001 0.001 0.002 49 Q 0.001 0.004 0.001 0.003 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.645 0.038 0.300 0.001 0.001 0.001 50 L 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.764 0.225 0.001 0.001 0.001 51 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.988 0.001 0.001 0.001 52 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.985 0.001 0.001 0.001 53 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 0.986 0.001 0.001 0.001 54 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.994 0.001 0.001 0.001 55 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 56 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 57 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 58 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 59 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.988 0.002 0.003 0.001 60 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.969 0.005 0.008 0.008 61 R 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.961 0.004 0.006 0.015 62 F 0.005 0.002 0.016 0.002 0.001 0.002 0.012 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.891 0.011 0.006 0.040 63 Y 0.007 0.009 0.056 0.015 0.003 0.009 0.040 0.001 0.001 0.001 0.005 0.010 0.768 0.029 0.013 0.035 64 M 0.007 0.037 0.075 0.047 0.007 0.036 0.046 0.008 0.002 0.001 0.013 0.016 0.590 0.029 0.034 0.053 65 H 0.022 0.078 0.136 0.127 0.008 0.026 0.046 0.015 0.011 0.005 0.028 0.016 0.271 0.037 0.050 0.124 66 H 0.070 0.048 0.258 0.175 0.004 0.033 0.020 0.019 0.012 0.008 0.030 0.027 0.183 0.006 0.037 0.071 67 S 0.066 0.088 0.271 0.228 0.004 0.068 0.010 0.004 0.012 0.005 0.026 0.027 0.127 0.003 0.005 0.058 68 F 0.064 0.061 0.179 0.341 0.026 0.092 0.027 0.004 0.003 0.003 0.046 0.039 0.092 0.006 0.003 0.014 69 T 0.011 0.079 0.101 0.189 0.034 0.301 0.011 0.032 0.003 0.003 0.053 0.064 0.101 0.004 0.008 0.006 70 K 0.009 0.066 0.029 0.095 0.093 0.159 0.025 0.026 0.019 0.013 0.243 0.047 0.129 0.023 0.005 0.019 71 F 0.025 0.129 0.046 0.064 0.011 0.033 0.021 0.059 0.012 0.008 0.103 0.285 0.144 0.009 0.041 0.011 72 N 0.016 0.036 0.083 0.037 0.003 0.069 0.008 0.016 0.029 0.022 0.052 0.115 0.399 0.003 0.032 0.079 73 K 0.060 0.008 0.064 0.029 0.001 0.042 0.002 0.003 0.006 0.004 0.170 0.077 0.505 0.001 0.002 0.027 74 N 0.017 0.050 0.048 0.032 0.001 0.020 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.398 0.412 0.001 0.001 0.004 75 I 0.002 0.001 0.009 0.017 0.001 0.042 0.001 0.001 0.001 0.001 0.069 0.024 0.836 0.001 0.001 0.001 76 I 0.001 0.006 0.003 0.003 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.090 0.880 0.001 0.001 0.001 77 S 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.018 0.965 0.001 0.001 0.001 78 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.986 0.001 0.001 0.001 79 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.996 0.001 0.001 0.001 80 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 81 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 82 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 83 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 84 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.977 0.008 0.004 0.008 85 A 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.962 0.002 0.018 0.011 86 K 0.004 0.003 0.017 0.007 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.718 0.020 0.006 0.219 87 V 0.024 0.007 0.059 0.023 0.001 0.017 0.012 0.001 0.001 0.001 0.004 0.010 0.788 0.009 0.017 0.026 88 E 0.005 0.020 0.053 0.014 0.013 0.079 0.046 0.002 0.001 0.001 0.033 0.012 0.655 0.037 0.005 0.025 89 E 0.012 0.177 0.039 0.092 0.006 0.023 0.024 0.034 0.004 0.001 0.094 0.082 0.311 0.032 0.046 0.026 90 Q 0.012 0.042 0.083 0.067 0.006 0.065 0.044 0.011 0.019 0.012 0.028 0.120 0.354 0.015 0.042 0.080 91 A 0.051 0.052 0.182 0.054 0.004 0.031 0.030 0.008 0.007 0.003 0.076 0.026 0.356 0.008 0.023 0.087 92 R 0.056 0.134 0.210 0.215 0.003 0.023 0.010 0.009 0.006 0.005 0.028 0.098 0.149 0.005 0.012 0.037 93 K 0.020 0.012 0.055 0.047 0.007 0.502 0.008 0.005 0.002 0.009 0.020 0.048 0.249 0.002 0.004 0.009 94 L 0.002 0.010 0.009 0.007 0.002 0.099 0.003 0.004 0.001 0.001 0.656 0.021 0.178 0.003 0.001 0.002 95 E 0.002 0.047 0.006 0.015 0.001 0.004 0.001 0.004 0.002 0.001 0.046 0.721 0.145 0.001 0.004 0.002 96 H 0.003 0.002 0.008 0.009 0.001 0.022 0.002 0.001 0.002 0.001 0.010 0.062 0.867 0.001 0.001 0.010 97 V 0.003 0.004 0.029 0.005 0.001 0.009 0.007 0.001 0.001 0.001 0.063 0.015 0.856 0.003 0.001 0.005 98 I 0.001 0.016 0.013 0.018 0.001 0.010 0.003 0.001 0.001 0.001 0.009 0.102 0.820 0.001 0.004 0.002 99 K 0.001 0.006 0.010 0.038 0.001 0.010 0.004 0.001 0.001 0.001 0.005 0.009 0.894 0.003 0.002 0.016 100 V 0.005 0.014 0.027 0.057 0.001 0.016 0.009 0.001 0.001 0.001 0.010 0.013 0.824 0.005 0.006 0.011 101 A 0.005 0.031 0.136 0.114 0.003 0.022 0.015 0.003 0.001 0.001 0.011 0.016 0.568 0.020 0.017 0.038 102 H 0.011 0.023 0.075 0.156 0.010 0.052 0.030 0.004 0.001 0.001 0.025 0.011 0.514 0.031 0.024 0.032 103 A 0.022 0.138 0.175 0.245 0.006 0.015 0.021 0.013 0.005 0.002 0.014 0.012 0.175 0.024 0.033 0.099 104 C 0.043 0.042 0.198 0.322 0.007 0.084 0.031 0.008 0.010 0.008 0.011 0.017 0.123 0.006 0.021 0.070 105 L 0.057 0.107 0.359 0.267 0.006 0.046 0.012 0.004 0.004 0.003 0.025 0.007 0.060 0.002 0.004 0.040 106 H 0.044 0.073 0.111 0.512 0.008 0.127 0.006 0.006 0.003 0.006 0.024 0.044 0.027 0.002 0.002 0.006 107 P 0.006 0.041 0.028 0.121 0.011 0.639 0.003 0.009 0.002 0.003 0.064 0.029 0.038 0.001 0.001 0.002 108 L 0.004 0.124 0.019 0.116 0.003 0.060 0.002 0.011 0.005 0.001 0.506 0.070 0.073 0.001 0.002 0.003 109 E 0.008 0.063 0.045 0.104 0.005 0.052 0.012 0.003 0.006 0.002 0.028 0.523 0.139 0.003 0.003 0.005 110 P 0.010 0.023 0.085 0.115 0.002 0.066 0.008 0.012 0.002 0.001 0.068 0.032 0.544 0.003 0.014 0.015 111 L 0.008 0.079 0.115 0.166 0.010 0.045 0.038 0.003 0.011 0.002 0.040 0.060 0.322 0.027 0.007 0.067 112 L 0.027 0.051 0.166 0.285 0.006 0.018 0.029 0.011 0.003 0.001 0.013 0.034 0.300 0.007 0.029 0.020 113 D 0.015 0.024 0.187 0.185 0.021 0.136 0.034 0.008 0.011 0.010 0.013 0.012 0.222 0.020 0.009 0.093 114 T 0.045 0.076 0.111 0.190 0.071 0.057 0.053 0.021 0.004 0.005 0.136 0.019 0.143 0.029 0.014 0.028 115 K 0.012 0.106 0.073 0.087 0.060 0.170 0.057 0.058 0.008 0.010 0.054 0.105 0.107 0.039 0.033 0.021 116 C 0.018 0.069 0.051 0.055 0.006 0.123 0.012 0.096 0.021 0.020 0.162 0.059 0.190 0.006 0.078 0.034 117 D 0.053 0.089 0.047 0.043 0.002 0.059 0.006 0.009 0.051 0.022 0.168 0.220 0.151 0.004 0.014 0.060 118 A 0.146 0.035 0.105 0.048 0.002 0.042 0.007 0.005 0.006 0.002 0.118 0.203 0.243 0.005 0.010 0.023 119 Y 0.019 0.028 0.155 0.033 0.006 0.089 0.030 0.004 0.003 0.001 0.071 0.152 0.370 0.011 0.006 0.022 120 L 0.009 0.138 0.104 0.096 0.004 0.031 0.022 0.007 0.003 0.001 0.042 0.062 0.435 0.004 0.016 0.026 121 Q 0.013 0.066 0.168 0.236 0.002 0.028 0.010 0.005 0.006 0.004 0.009 0.045 0.341 0.002 0.010 0.056 122 Q 0.018 0.009 0.049 0.027 0.004 0.318 0.008 0.003 0.001 0.006 0.029 0.027 0.486 0.002 0.002 0.012 123 T 0.002 0.004 0.005 0.003 0.001 0.143 0.001 0.003 0.001 0.001 0.447 0.038 0.349 0.001 0.001 0.001 124 R 0.001 0.012 0.002 0.003 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.067 0.573 0.338 0.001 0.001 0.001 125 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.054 0.938 0.001 0.001 0.001 126 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.005 0.987 0.001 0.001 0.001 127 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.979 0.001 0.001 0.001 128 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.996 0.001 0.001 0.001 129 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 130 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 131 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 132 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 133 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 134 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 135 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 136 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.095 0.860 0.001 0.033 137 L 0.001 0.002 0.016 0.001 0.001 0.001 0.006 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.181 0.003 0.782 0.003 138 G 0.001 0.009 0.020 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.046 0.002 0.003 0.902 139 F 0.887 0.001 0.023 0.050 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.024 0.001 0.001 0.007 140 E 0.008 0.071 0.813 0.079 0.001 0.006 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 0.001 0.001 0.006 141 I 0.002 0.007 0.020 0.947 0.002 0.014 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 142 T 0.004 0.034 0.160 0.727 0.013 0.046 0.002 0.002 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.001 0.001 0.002 143 I 0.007 0.027 0.018 0.651 0.037 0.201 0.004 0.005 0.002 0.003 0.029 0.003 0.007 0.001 0.001 0.002 144 E 0.004 0.243 0.036 0.634 0.005 0.021 0.001 0.013 0.004 0.002 0.015 0.015 0.004 0.001 0.001 0.002 145 H 0.004 0.017 0.012 0.104 0.022 0.749 0.006 0.003 0.005 0.015 0.010 0.031 0.018 0.001 0.001 0.003 146 P 0.005 0.066 0.026 0.028 0.004 0.060 0.001 0.023 0.001 0.001 0.731 0.019 0.031 0.001 0.001 0.002 147 H 0.004 0.023 0.009 0.019 0.006 0.080 0.004 0.004 0.010 0.008 0.087 0.681 0.055 0.006 0.002 0.003 148 T 0.007 0.017 0.019 0.014 0.001 0.020 0.002 0.010 0.001 0.001 0.234 0.147 0.501 0.001 0.023 0.003 149 D 0.002 0.005 0.005 0.004 0.001 0.023 0.001 0.001 0.004 0.001 0.055 0.181 0.701 0.001 0.001 0.018 150 V 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.023 0.080 0.884 0.001 0.001 0.001 151 V 0.001 0.002 0.002 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.041 0.945 0.001 0.001 0.001 152 K 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.989 0.001 0.001 0.001 153 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.987 0.001 0.001 0.001 154 T 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.986 0.001 0.001 0.001 155 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.986 0.001 0.001 0.001 156 L 0.001 0.002 0.002 0.003 0.001 0.001 0.015 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.784 0.143 0.006 0.036 157 V 0.002 0.004 0.032 0.006 0.001 0.002 0.021 0.002 0.001 0.001 0.003 0.006 0.742 0.007 0.157 0.017 158 R 0.004 0.009 0.039 0.007 0.001 0.011 0.018 0.001 0.002 0.002 0.005 0.005 0.566 0.018 0.009 0.302 159 A 0.139 0.036 0.070 0.031 0.003 0.019 0.023 0.007 0.002 0.002 0.050 0.027 0.479 0.028 0.030 0.053 160 S 0.007 0.013 0.053 0.004 0.003 0.270 0.017 0.004 0.001 0.004 0.054 0.056 0.472 0.008 0.019 0.013 161 K 0.006 0.029 0.012 0.006 0.001 0.011 0.002 0.005 0.001 0.001 0.532 0.065 0.314 0.001 0.006 0.010 162 D 0.005 0.011 0.004 0.004 0.001 0.013 0.001 0.001 0.003 0.001 0.013 0.681 0.255 0.001 0.001 0.006 163 L 0.002 0.001 0.013 0.001 0.001 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 0.039 0.019 0.914 0.001 0.001 0.002 164 A 0.001 0.006 0.004 0.002 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.096 0.878 0.001 0.001 0.001 165 Q 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.013 0.973 0.001 0.001 0.001 166 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.018 0.971 0.001 0.001 0.001 167 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.006 0.985 0.001 0.001 0.001 168 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.988 0.001 0.001 0.001 169 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.995 0.001 0.001 0.001 170 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 171 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.988 0.002 0.001 0.001 172 T 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.003 0.003 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.959 0.008 0.010 0.003 173 N 0.001 0.003 0.002 0.003 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.005 0.932 0.004 0.018 0.025 174 S 0.007 0.002 0.007 0.003 0.001 0.002 0.010 0.001 0.001 0.001 0.006 0.010 0.877 0.018 0.005 0.052 175 L 0.010 0.009 0.044 0.009 0.001 0.004 0.013 0.001 0.001 0.001 0.007 0.017 0.847 0.006 0.017 0.015 176 H 0.005 0.026 0.080 0.046 0.003 0.023 0.020 0.003 0.003 0.001 0.008 0.014 0.623 0.018 0.012 0.115 177 L 0.023 0.045 0.099 0.101 0.008 0.046 0.053 0.004 0.002 0.002 0.027 0.018 0.511 0.011 0.014 0.035 178 T 0.013 0.080 0.118 0.071 0.005 0.158 0.019 0.015 0.004 0.004 0.041 0.048 0.378 0.005 0.019 0.022 179 T 0.024 0.103 0.073 0.111 0.004 0.073 0.012 0.010 0.010 0.004 0.175 0.059 0.283 0.011 0.010 0.037 180 F 0.041 0.111 0.124 0.171 0.002 0.040 0.005 0.007 0.007 0.001 0.045 0.152 0.247 0.004 0.020 0.023 181 C 0.025 0.025 0.195 0.119 0.010 0.066 0.035 0.002 0.005 0.003 0.032 0.038 0.368 0.022 0.006 0.049 182 L 0.019 0.067 0.136 0.187 0.006 0.046 0.018 0.017 0.001 0.001 0.070 0.045 0.352 0.004 0.016 0.013 183 Q 0.014 0.097 0.151 0.401 0.009 0.026 0.010 0.007 0.020 0.004 0.010 0.021 0.127 0.007 0.006 0.088 184 Y 0.065 0.028 0.267 0.415 0.008 0.031 0.013 0.004 0.002 0.005 0.009 0.014 0.115 0.001 0.006 0.019 185 K 0.008 0.029 0.130 0.115 0.011 0.447 0.003 0.005 0.002 0.008 0.035 0.020 0.175 0.001 0.001 0.009 186 P 0.003 0.004 0.003 0.019 0.001 0.221 0.001 0.002 0.001 0.001 0.519 0.044 0.183 0.001 0.001 0.001 187 T 0.001 0.017 0.001 0.002 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 0.847 0.103 0.001 0.001 0.001 188 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.143 0.047 0.805 0.001 0.001 0.001 189 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.053 0.944 0.001 0.001 0.001 190 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.996 0.001 0.001 0.001 191 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.997 0.001 0.001 0.001 192 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 193 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 194 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 195 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 196 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 197 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.002 198 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.002 0.001 199 K 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.950 0.010 0.005 0.029 200 W 0.002 0.001 0.004 0.001 0.004 0.001 0.061 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.147 0.744 0.008 0.026 201 S 0.003 0.007 0.022 0.002 0.001 0.002 0.019 0.022 0.001 0.001 0.003 0.003 0.158 0.012 0.730 0.017 202 N 0.007 0.018 0.028 0.008 0.001 0.004 0.010 0.002 0.040 0.014 0.005 0.005 0.076 0.009 0.013 0.762 203 W 0.784 0.013 0.055 0.032 0.001 0.006 0.011 0.001 0.003 0.001 0.009 0.012 0.038 0.003 0.006 0.023 204 E 0.022 0.079 0.744 0.089 0.001 0.009 0.006 0.001 0.002 0.001 0.002 0.006 0.012 0.001 0.003 0.022 205 I 0.020 0.017 0.192 0.697 0.004 0.038 0.006 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.010 0.001 0.001 0.005 206 P 0.012 0.065 0.158 0.534 0.020 0.168 0.005 0.003 0.002 0.002 0.014 0.006 0.009 0.001 0.001 0.003 207 V 0.005 0.110 0.031 0.689 0.009 0.068 0.002 0.013 0.003 0.003 0.040 0.014 0.008 0.001 0.001 0.003 208 S 0.005 0.032 0.023 0.087 0.035 0.676 0.005 0.006 0.007 0.008 0.030 0.054 0.029 0.001 0.001 0.002 209 T 0.005 0.043 0.019 0.028 0.051 0.033 0.026 0.016 0.002 0.003 0.690 0.028 0.032 0.021 0.001 0.002 210 D 0.004 0.068 0.018 0.049 0.002 0.038 0.002 0.135 0.009 0.003 0.027 0.481 0.036 0.001 0.123 0.004 211 G 0.011 0.014 0.060 0.042 0.002 0.024 0.005 0.004 0.104 0.036 0.109 0.026 0.290 0.004 0.006 0.262 212 K 0.176 0.051 0.074 0.089 0.002 0.022 0.016 0.002 0.002 0.001 0.039 0.176 0.336 0.002 0.005 0.007 213 H 0.010 0.025 0.153 0.128 0.005 0.118 0.009 0.008 0.002 0.002 0.024 0.040 0.448 0.004 0.006 0.018 214 W 0.007 0.053 0.061 0.177 0.029 0.110 0.036 0.007 0.004 0.002 0.055 0.035 0.346 0.049 0.007 0.020 215 W 0.008 0.059 0.069 0.138 0.006 0.084 0.025 0.020 0.004 0.002 0.037 0.064 0.403 0.010 0.059 0.013 216 E 0.013 0.034 0.073 0.119 0.003 0.037 0.015 0.012 0.013 0.009 0.089 0.055 0.399 0.010 0.016 0.101 217 Y 0.120 0.072 0.113 0.115 0.011 0.038 0.035 0.005 0.011 0.002 0.034 0.044 0.214 0.042 0.010 0.133 218 V 0.015 0.121 0.510 0.202 0.001 0.005 0.013 0.007 0.001 0.001 0.005 0.011 0.047 0.005 0.037 0.019 219 D 0.003 0.004 0.035 0.019 0.003 0.866 0.009 0.001 0.001 0.005 0.002 0.006 0.039 0.001 0.002 0.005 220 P 0.004 0.026 0.005 0.006 0.001 0.008 0.001 0.002 0.001 0.001 0.930 0.003 0.011 0.001 0.001 0.002 221 T 0.008 0.309 0.022 0.053 0.001 0.007 0.001 0.001 0.010 0.001 0.003 0.564 0.009 0.001 0.003 0.009 222 V 0.011 0.022 0.736 0.134 0.001 0.002 0.004 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.054 0.001 0.005 0.024 223 T 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.001 224 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 225 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.004 0.001 0.001 0.001 226 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.993 0.001 0.001 0.002 227 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.994 0.001 0.001 0.001 228 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.996 0.001 0.001 0.001 229 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.995 0.001 0.001 0.001 230 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 231 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 232 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 233 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 234 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 235 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 236 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 237 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.966 0.018 0.003 0.009 238 L 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.018 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.912 0.030 0.021 0.011 239 E 0.002 0.005 0.014 0.002 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.798 0.020 0.042 0.098 240 K 0.031 0.029 0.076 0.021 0.001 0.001 0.017 0.001 0.004 0.001 0.003 0.004 0.278 0.041 0.028 0.464 241 T 0.030 0.004 0.222 0.008 0.007 0.172 0.114 0.001 0.001 0.001 0.006 0.009 0.383 0.009 0.017 0.015 242 P 0.006 0.066 0.035 0.009 0.004 0.063 0.011 0.024 0.001 0.001 0.570 0.013 0.169 0.012 0.008 0.011 243 N 0.008 0.084 0.007 0.027 0.001 0.021 0.003 0.009 0.018 0.004 0.061 0.643 0.088 0.005 0.013 0.008 244 R 0.022 0.018 0.081 0.019 0.002 0.035 0.018 0.004 0.006 0.004 0.057 0.105 0.567 0.007 0.015 0.040 245 L 0.017 0.026 0.120 0.030 0.002 0.041 0.016 0.007 0.002 0.001 0.070 0.095 0.531 0.006 0.015 0.020 246 K 0.011 0.025 0.072 0.057 0.001 0.034 0.008 0.006 0.004 0.002 0.058 0.092 0.596 0.004 0.011 0.019 247 K 0.014 0.023 0.060 0.093 0.002 0.031 0.006 0.003 0.003 0.002 0.034 0.060 0.637 0.004 0.005 0.025 248 I 0.012 0.016 0.072 0.076 0.008 0.070 0.025 0.002 0.002 0.001 0.027 0.042 0.606 0.017 0.005 0.019 249 R 0.004 0.061 0.103 0.096 0.003 0.037 0.013 0.012 0.001 0.001 0.039 0.036 0.552 0.006 0.024 0.012 250 N 0.007 0.020 0.051 0.110 0.005 0.078 0.012 0.010 0.007 0.005 0.040 0.038 0.547 0.015 0.012 0.043 251 W 0.028 0.037 0.074 0.096 0.003 0.032 0.008 0.009 0.003 0.002 0.085 0.038 0.541 0.006 0.014 0.024 252 R 0.012 0.038 0.061 0.068 0.011 0.085 0.028 0.004 0.004 0.002 0.038 0.081 0.496 0.031 0.007 0.034 253 A 0.011 0.031 0.083 0.059 0.020 0.057 0.066 0.014 0.002 0.001 0.058 0.038 0.475 0.035 0.035 0.016 254 N 0.007 0.093 0.080 0.078 0.012 0.045 0.027 0.041 0.013 0.007 0.045 0.062 0.347 0.021 0.057 0.064 255 Q 0.049 0.032 0.070 0.058 0.039 0.037 0.091 0.013 0.030 0.015 0.048 0.034 0.225 0.110 0.025 0.124 256 A 0.049 0.055 0.217 0.048 0.020 0.041 0.092 0.038 0.005 0.004 0.054 0.046 0.174 0.026 0.101 0.030