# TARGET T0332 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0332.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 286.338 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 L 0.011 0.004 0.007 0.013 0.029 0.103 0.018 0.816 2 G 0.048 0.006 0.010 0.034 0.088 0.081 0.057 0.676 3 K 0.024 0.003 0.009 0.046 0.038 0.104 0.046 0.730 4 S 0.055 0.009 0.033 0.050 0.081 0.105 0.091 0.576 5 I 0.074 0.006 0.033 0.026 0.047 0.124 0.063 0.626 6 S 0.017 0.007 0.091 0.047 0.078 0.140 0.067 0.553 7 R 0.003 0.006 0.225 0.058 0.150 0.093 0.059 0.407 8 L 0.001 0.005 0.360 0.121 0.242 0.047 0.077 0.146 9 I 0.001 0.003 0.582 0.152 0.155 0.009 0.066 0.032 10 V 0.002 0.005 0.625 0.146 0.139 0.009 0.040 0.035 11 V 0.010 0.008 0.610 0.137 0.135 0.015 0.041 0.044 12 A 0.017 0.007 0.448 0.111 0.144 0.042 0.085 0.145 13 S 0.056 0.012 0.154 0.071 0.130 0.120 0.079 0.378 14 L 0.099 0.009 0.053 0.034 0.064 0.143 0.090 0.508 15 I 0.025 0.006 0.027 0.021 0.036 0.163 0.054 0.669 16 D 0.034 0.007 0.022 0.016 0.027 0.125 0.060 0.709 17 K 0.117 0.031 0.015 0.017 0.021 0.141 0.125 0.534 18 P 0.046 0.062 0.023 0.010 0.017 0.154 0.058 0.630 19 T 0.031 0.092 0.046 0.012 0.018 0.159 0.069 0.573 20 N 0.054 0.665 0.017 0.008 0.008 0.038 0.075 0.134 21 L 0.036 0.825 0.012 0.004 0.005 0.020 0.038 0.060 22 G 0.026 0.754 0.017 0.007 0.014 0.023 0.091 0.068 23 G 0.017 0.357 0.034 0.012 0.023 0.023 0.477 0.056 24 L 0.004 0.631 0.019 0.005 0.010 0.019 0.282 0.029 25 C 0.005 0.898 0.021 0.006 0.008 0.006 0.038 0.018 26 R 0.014 0.844 0.033 0.016 0.022 0.009 0.038 0.024 27 T 0.040 0.775 0.026 0.005 0.009 0.014 0.103 0.029 28 C 0.130 0.229 0.116 0.019 0.011 0.025 0.371 0.101 29 E 0.516 0.131 0.011 0.013 0.010 0.032 0.056 0.231 30 V 0.061 0.010 0.015 0.002 0.003 0.072 0.088 0.748 31 F 0.010 0.009 0.068 0.013 0.024 0.245 0.080 0.551 32 G 0.079 0.011 0.031 0.009 0.021 0.089 0.083 0.678 33 A 0.018 0.005 0.030 0.018 0.014 0.174 0.049 0.692 34 S 0.005 0.004 0.406 0.041 0.138 0.087 0.095 0.224 35 V 0.008 0.003 0.333 0.067 0.142 0.055 0.116 0.277 36 L 0.001 0.001 0.744 0.078 0.053 0.017 0.026 0.080 37 V 0.003 0.002 0.681 0.071 0.084 0.027 0.029 0.103 38 V 0.015 0.004 0.421 0.090 0.098 0.077 0.055 0.241 39 G 0.121 0.013 0.156 0.043 0.053 0.121 0.063 0.430 40 S 0.179 0.020 0.037 0.015 0.031 0.119 0.071 0.528 41 L 0.048 0.013 0.034 0.016 0.029 0.136 0.062 0.662 42 Q 0.024 0.020 0.042 0.038 0.058 0.131 0.082 0.606 43 C 0.045 0.029 0.024 0.024 0.029 0.123 0.035 0.691 44 I 0.205 0.091 0.025 0.031 0.030 0.106 0.073 0.439 45 S 0.086 0.155 0.012 0.008 0.012 0.081 0.039 0.606 46 D 0.101 0.296 0.010 0.007 0.010 0.063 0.053 0.460 47 K 0.087 0.516 0.013 0.011 0.012 0.045 0.096 0.220 48 Q 0.080 0.541 0.010 0.008 0.016 0.049 0.046 0.250 49 F 0.054 0.190 0.037 0.029 0.045 0.085 0.232 0.328 50 Q 0.041 0.256 0.026 0.033 0.054 0.095 0.190 0.305 51 H 0.064 0.216 0.040 0.022 0.049 0.089 0.202 0.317 52 L 0.043 0.292 0.033 0.044 0.057 0.079 0.158 0.293 53 S 0.074 0.210 0.079 0.028 0.052 0.099 0.107 0.349 54 V 0.133 0.140 0.046 0.027 0.028 0.135 0.084 0.406 55 S 0.145 0.121 0.061 0.015 0.021 0.070 0.253 0.313 56 A 0.155 0.109 0.020 0.011 0.020 0.102 0.071 0.513 57 E 0.085 0.027 0.027 0.016 0.024 0.103 0.081 0.638 58 Q 0.035 0.025 0.030 0.030 0.046 0.142 0.081 0.612 59 W 0.047 0.011 0.035 0.014 0.035 0.131 0.063 0.665 60 L 0.062 0.013 0.043 0.052 0.054 0.160 0.056 0.561 61 P 0.030 0.008 0.038 0.017 0.040 0.106 0.048 0.713 62 L 0.088 0.010 0.057 0.041 0.078 0.114 0.074 0.539 63 V 0.042 0.006 0.103 0.130 0.182 0.081 0.077 0.379 64 E 0.010 0.003 0.057 0.038 0.075 0.076 0.027 0.714 65 V 0.004 0.003 0.116 0.138 0.153 0.097 0.021 0.469 66 K 0.029 0.023 0.052 0.049 0.056 0.101 0.037 0.653 67 P 0.204 0.231 0.026 0.020 0.017 0.071 0.085 0.348 68 P 0.049 0.265 0.023 0.015 0.012 0.074 0.057 0.505 69 Q 0.035 0.817 0.005 0.002 0.002 0.015 0.035 0.090 70 L 0.026 0.951 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 0.008 71 I 0.023 0.927 0.004 0.001 0.001 0.004 0.025 0.016 72 D 0.018 0.897 0.005 0.002 0.001 0.006 0.034 0.037 73 Y 0.061 0.871 0.006 0.001 0.001 0.007 0.030 0.023 74 L 0.160 0.722 0.007 0.001 0.001 0.009 0.051 0.050 75 Q 0.044 0.142 0.017 0.006 0.004 0.024 0.366 0.398 76 Q 0.030 0.176 0.013 0.003 0.003 0.060 0.283 0.431 77 K 0.148 0.041 0.078 0.008 0.005 0.080 0.324 0.314 78 K 0.760 0.008 0.003 0.001 0.002 0.021 0.015 0.190 79 T 0.110 0.003 0.002 0.001 0.001 0.028 0.023 0.833 80 E 0.006 0.004 0.041 0.003 0.011 0.275 0.010 0.650 81 G 0.008 0.005 0.103 0.011 0.049 0.113 0.048 0.663 82 Y 0.005 0.007 0.193 0.135 0.056 0.108 0.041 0.455 83 T 0.003 0.007 0.736 0.046 0.087 0.018 0.038 0.066 84 I 0.008 0.015 0.404 0.162 0.156 0.026 0.069 0.159 85 I 0.005 0.006 0.726 0.100 0.081 0.012 0.019 0.052 86 G 0.013 0.021 0.326 0.123 0.178 0.036 0.145 0.159 87 V 0.029 0.082 0.211 0.101 0.126 0.069 0.130 0.251 88 E 0.103 0.119 0.086 0.066 0.090 0.088 0.087 0.362 89 Q 0.061 0.053 0.038 0.029 0.035 0.104 0.153 0.526 90 T 0.190 0.134 0.015 0.018 0.023 0.078 0.134 0.409 91 A 0.171 0.077 0.014 0.012 0.017 0.096 0.080 0.533 92 K 0.051 0.063 0.010 0.014 0.027 0.106 0.040 0.690 93 S 0.027 0.025 0.015 0.014 0.027 0.113 0.134 0.644 94 L 0.030 0.062 0.036 0.044 0.044 0.146 0.122 0.515 95 D 0.164 0.104 0.031 0.034 0.057 0.078 0.087 0.445 96 L 0.116 0.030 0.041 0.046 0.049 0.086 0.110 0.522 97 T 0.105 0.022 0.036 0.054 0.093 0.081 0.059 0.550 98 Q 0.080 0.003 0.018 0.035 0.051 0.079 0.036 0.698 99 Y 0.009 0.002 0.020 0.053 0.064 0.119 0.025 0.709 100 C 0.012 0.001 0.018 0.015 0.039 0.105 0.021 0.789 101 F 0.076 0.001 0.024 0.019 0.017 0.144 0.062 0.656 102 P 0.069 0.006 0.029 0.014 0.012 0.123 0.071 0.676 103 E 0.012 0.004 0.054 0.009 0.024 0.246 0.053 0.599 104 K 0.001 0.002 0.424 0.033 0.098 0.097 0.094 0.250 105 S 0.001 0.001 0.653 0.060 0.083 0.020 0.116 0.066 106 L 0.001 0.001 0.804 0.038 0.043 0.014 0.048 0.051 107 L 0.002 0.001 0.848 0.046 0.051 0.010 0.022 0.021 108 L 0.006 0.003 0.752 0.046 0.073 0.032 0.040 0.047 109 L 0.019 0.011 0.588 0.031 0.066 0.094 0.063 0.129 110 G 0.108 0.028 0.195 0.031 0.072 0.161 0.102 0.303 111 N 0.050 0.012 0.169 0.029 0.054 0.163 0.187 0.335 112 E 0.216 0.013 0.031 0.014 0.029 0.143 0.037 0.518 113 R 0.204 0.006 0.017 0.013 0.021 0.089 0.209 0.440 114 E 0.011 0.010 0.008 0.005 0.010 0.176 0.021 0.759 115 G 0.004 0.012 0.007 0.006 0.012 0.105 0.025 0.829 116 I 0.029 0.321 0.006 0.015 0.006 0.072 0.028 0.524 117 P 0.073 0.906 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.006 118 A 0.034 0.908 0.002 0.001 0.001 0.004 0.030 0.021 119 N 0.026 0.882 0.008 0.002 0.002 0.006 0.041 0.033 120 L 0.148 0.601 0.011 0.002 0.002 0.012 0.176 0.048 121 I 0.146 0.137 0.051 0.009 0.009 0.045 0.461 0.143 122 Q 0.087 0.068 0.019 0.003 0.005 0.059 0.175 0.583 123 Q 0.042 0.019 0.017 0.002 0.002 0.074 0.056 0.789 124 L 0.078 0.018 0.040 0.009 0.016 0.242 0.069 0.528 125 D 0.019 0.004 0.020 0.005 0.013 0.099 0.057 0.784 126 V 0.007 0.003 0.407 0.045 0.095 0.112 0.069 0.261 127 C 0.004 0.002 0.334 0.048 0.090 0.052 0.069 0.403 128 V 0.002 0.001 0.503 0.210 0.097 0.035 0.019 0.132 129 E 0.004 0.002 0.577 0.042 0.070 0.048 0.030 0.227 130 I 0.050 0.007 0.269 0.126 0.087 0.111 0.101 0.249 131 P 0.093 0.017 0.083 0.019 0.021 0.115 0.039 0.612 132 Q 0.221 0.059 0.033 0.011 0.020 0.103 0.081 0.471 133 Q 0.069 0.070 0.032 0.016 0.031 0.107 0.052 0.623 134 G 0.035 0.070 0.048 0.038 0.061 0.112 0.133 0.502 135 I 0.056 0.166 0.037 0.040 0.052 0.105 0.147 0.397 136 I 0.061 0.234 0.042 0.035 0.041 0.084 0.162 0.342 137 R 0.052 0.488 0.015 0.016 0.026 0.049 0.063 0.290 138 S 0.019 0.480 0.014 0.005 0.010 0.035 0.292 0.145 139 L 0.006 0.798 0.005 0.006 0.005 0.011 0.126 0.042 140 N 0.006 0.776 0.003 0.001 0.002 0.006 0.194 0.012 141 V 0.001 0.946 0.001 0.001 0.001 0.001 0.046 0.004 142 H 0.001 0.981 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.002 143 V 0.001 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.002 144 S 0.001 0.951 0.001 0.001 0.001 0.001 0.044 0.002 145 G 0.001 0.964 0.001 0.001 0.001 0.001 0.034 0.001 146 A 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 147 L 0.001 0.992 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 148 L 0.002 0.975 0.003 0.001 0.001 0.001 0.016 0.002 149 I 0.003 0.320 0.013 0.001 0.001 0.002 0.656 0.003 150 W 0.002 0.734 0.003 0.002 0.001 0.003 0.247 0.008 151 E 0.005 0.968 0.002 0.001 0.001 0.003 0.009 0.011 152 Y 0.025 0.887 0.006 0.005 0.005 0.010 0.033 0.030 153 T 0.057 0.494 0.035 0.012 0.011 0.027 0.237 0.127 154 R 0.262 0.346 0.006 0.009 0.008 0.032 0.073 0.264 155 Q 0.229 0.034 0.015 0.009 0.010 0.084 0.133 0.485 156 Q 0.026 0.015 0.010 0.018 0.020 0.145 0.091 0.675 157 L 0.018 0.006 0.005 0.005 0.011 0.070 0.024 0.861 158 L 0.070 0.011 0.009 0.014 0.013 0.108 0.043 0.731 159 S 0.101 0.022 0.012 0.018 0.020 0.104 0.058 0.666