# TARGET T0332 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0332.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1414 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 L 0.051 0.013 0.040 0.029 0.050 0.069 0.006 0.742 2 G 0.043 0.012 0.028 0.027 0.059 0.110 0.007 0.713 3 K 0.060 0.015 0.025 0.020 0.040 0.109 0.007 0.723 4 S 0.073 0.023 0.013 0.020 0.030 0.173 0.010 0.658 5 I 0.168 0.023 0.025 0.019 0.038 0.119 0.017 0.591 6 S 0.072 0.031 0.050 0.062 0.050 0.200 0.025 0.511 7 R 0.126 0.012 0.113 0.073 0.070 0.153 0.039 0.413 8 L 0.136 0.005 0.256 0.092 0.131 0.141 0.011 0.228 9 I 0.006 0.001 0.665 0.153 0.139 0.016 0.001 0.018 10 V 0.001 0.001 0.677 0.123 0.142 0.008 0.001 0.048 11 V 0.001 0.001 0.889 0.044 0.061 0.001 0.001 0.004 12 A 0.001 0.001 0.780 0.076 0.111 0.006 0.001 0.026 13 S 0.001 0.001 0.791 0.062 0.110 0.009 0.001 0.027 14 L 0.004 0.001 0.418 0.061 0.109 0.076 0.003 0.327 15 I 0.013 0.001 0.248 0.033 0.102 0.091 0.004 0.508 16 D 0.011 0.002 0.046 0.018 0.045 0.208 0.007 0.663 17 K 0.052 0.005 0.018 0.011 0.019 0.134 0.007 0.754 18 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.996 19 T 0.029 0.017 0.019 0.013 0.019 0.231 0.009 0.664 20 N 0.175 0.058 0.028 0.007 0.009 0.154 0.013 0.557 21 L 0.051 0.374 0.042 0.014 0.021 0.071 0.005 0.422 22 G 0.072 0.322 0.028 0.012 0.025 0.194 0.008 0.340 23 G 0.077 0.459 0.018 0.007 0.011 0.195 0.005 0.228 24 L 0.021 0.868 0.005 0.004 0.007 0.027 0.003 0.065 25 C 0.006 0.956 0.003 0.002 0.003 0.004 0.002 0.024 26 R 0.003 0.979 0.002 0.001 0.002 0.002 0.001 0.009 27 T 0.007 0.974 0.002 0.002 0.002 0.001 0.003 0.011 28 C 0.021 0.921 0.005 0.003 0.010 0.003 0.009 0.029 29 E 0.020 0.924 0.002 0.002 0.003 0.006 0.008 0.034 30 V 0.037 0.913 0.005 0.002 0.002 0.003 0.013 0.023 31 F 0.137 0.746 0.009 0.012 0.005 0.004 0.050 0.037 32 G 0.386 0.158 0.053 0.028 0.014 0.013 0.193 0.155 33 A 0.066 0.042 0.602 0.060 0.062 0.044 0.020 0.103 34 S 0.020 0.026 0.270 0.217 0.191 0.077 0.011 0.187 35 V 0.022 0.006 0.227 0.052 0.115 0.071 0.006 0.501 36 L 0.003 0.002 0.845 0.083 0.045 0.007 0.002 0.013 37 V 0.002 0.002 0.820 0.085 0.053 0.006 0.002 0.030 38 V 0.001 0.001 0.725 0.074 0.134 0.005 0.001 0.058 39 G 0.002 0.001 0.574 0.085 0.167 0.031 0.001 0.138 40 S 0.004 0.001 0.153 0.038 0.092 0.090 0.003 0.619 41 L 0.012 0.001 0.073 0.014 0.041 0.094 0.005 0.760 42 Q 0.089 0.002 0.033 0.015 0.025 0.333 0.012 0.490 43 C 0.174 0.006 0.040 0.020 0.025 0.158 0.013 0.564 44 I 0.028 0.011 0.032 0.023 0.027 0.070 0.003 0.805 45 S 0.017 0.012 0.020 0.014 0.030 0.152 0.004 0.751 46 D 0.065 0.023 0.020 0.011 0.038 0.137 0.007 0.698 47 K 0.032 0.028 0.009 0.004 0.011 0.158 0.004 0.753 48 Q 0.038 0.042 0.004 0.003 0.005 0.585 0.006 0.317 49 F 0.167 0.411 0.011 0.006 0.012 0.154 0.009 0.229 50 Q 0.029 0.840 0.012 0.009 0.015 0.017 0.004 0.075 51 H 0.027 0.749 0.015 0.017 0.025 0.016 0.008 0.143 52 L 0.048 0.757 0.040 0.020 0.040 0.013 0.012 0.070 53 S 0.071 0.711 0.012 0.024 0.046 0.023 0.020 0.093 54 V 0.197 0.366 0.058 0.029 0.054 0.045 0.036 0.216 55 S 0.143 0.361 0.017 0.024 0.021 0.078 0.032 0.325 56 A 0.192 0.296 0.062 0.014 0.038 0.069 0.032 0.297 57 E 0.060 0.397 0.018 0.020 0.032 0.109 0.019 0.344 58 Q 0.187 0.260 0.017 0.024 0.028 0.087 0.060 0.337 59 W 0.270 0.250 0.041 0.019 0.031 0.041 0.076 0.272 60 L 0.177 0.163 0.098 0.176 0.130 0.033 0.028 0.194 61 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 62 L 0.008 0.005 0.028 0.050 0.141 0.064 0.003 0.702 63 V 0.281 0.021 0.166 0.257 0.140 0.023 0.010 0.102 64 E 0.062 0.006 0.047 0.057 0.091 0.030 0.006 0.701 65 V 0.033 0.005 0.402 0.171 0.151 0.015 0.004 0.218 66 K 0.007 0.002 0.027 0.031 0.033 0.042 0.001 0.857 67 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.995 68 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.991 69 Q 0.037 0.003 0.003 0.003 0.004 0.193 0.003 0.754 70 L 0.278 0.071 0.011 0.004 0.009 0.072 0.005 0.549 71 I 0.047 0.266 0.011 0.003 0.011 0.076 0.003 0.584 72 D 0.032 0.284 0.003 0.001 0.003 0.159 0.002 0.516 73 Y 0.019 0.860 0.001 0.001 0.001 0.016 0.001 0.101 74 L 0.003 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 75 Q 0.005 0.972 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.018 76 Q 0.025 0.954 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.013 77 K 0.077 0.882 0.002 0.001 0.001 0.001 0.017 0.018 78 K 0.107 0.747 0.016 0.005 0.008 0.007 0.037 0.075 79 T 0.078 0.557 0.058 0.008 0.008 0.024 0.047 0.219 80 E 0.176 0.285 0.070 0.015 0.009 0.036 0.113 0.296 81 G 0.507 0.026 0.061 0.009 0.004 0.027 0.148 0.218 82 Y 0.056 0.003 0.775 0.019 0.013 0.036 0.009 0.088 83 T 0.005 0.002 0.612 0.085 0.070 0.038 0.002 0.186 84 I 0.004 0.001 0.436 0.061 0.130 0.024 0.001 0.344 85 I 0.001 0.001 0.813 0.066 0.075 0.009 0.001 0.035 86 G 0.003 0.001 0.598 0.078 0.104 0.029 0.001 0.186 87 V 0.005 0.001 0.594 0.066 0.170 0.032 0.002 0.129 88 E 0.010 0.004 0.174 0.077 0.128 0.154 0.003 0.451 89 Q 0.029 0.005 0.117 0.032 0.103 0.122 0.005 0.584 90 T 0.040 0.011 0.034 0.021 0.063 0.284 0.008 0.538 91 A 0.076 0.023 0.019 0.012 0.036 0.113 0.011 0.710 92 K 0.104 0.061 0.012 0.010 0.018 0.268 0.023 0.504 93 S 0.435 0.085 0.017 0.009 0.014 0.147 0.039 0.254 94 L 0.327 0.166 0.050 0.021 0.022 0.056 0.025 0.333 95 D 0.059 0.092 0.050 0.029 0.042 0.103 0.019 0.606 96 L 0.080 0.075 0.117 0.034 0.093 0.063 0.010 0.528 97 T 0.063 0.081 0.033 0.037 0.077 0.360 0.013 0.337 98 Q 0.185 0.052 0.026 0.023 0.047 0.241 0.022 0.403 99 Y 0.240 0.215 0.054 0.051 0.051 0.072 0.016 0.301 100 C 0.065 0.070 0.046 0.049 0.066 0.103 0.033 0.568 101 F 0.095 0.029 0.036 0.084 0.113 0.060 0.012 0.570 102 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 103 E 0.015 0.003 0.021 0.056 0.122 0.152 0.007 0.624 104 K 0.117 0.003 0.044 0.027 0.024 0.098 0.016 0.672 105 S 0.191 0.004 0.221 0.084 0.107 0.145 0.009 0.238 106 L 0.018 0.002 0.702 0.128 0.106 0.017 0.002 0.024 107 L 0.002 0.001 0.751 0.093 0.128 0.007 0.001 0.018 108 L 0.001 0.001 0.817 0.069 0.094 0.004 0.001 0.014 109 L 0.001 0.001 0.771 0.084 0.097 0.008 0.001 0.037 110 G 0.002 0.001 0.632 0.068 0.140 0.028 0.002 0.127 111 N 0.005 0.001 0.275 0.046 0.126 0.102 0.003 0.442 112 E 0.011 0.001 0.091 0.016 0.063 0.129 0.004 0.685 113 R 0.042 0.003 0.015 0.008 0.019 0.562 0.007 0.345 114 E 0.300 0.013 0.022 0.015 0.014 0.245 0.041 0.349 115 G 0.200 0.023 0.027 0.015 0.010 0.061 0.031 0.632 116 I 0.182 0.021 0.107 0.034 0.049 0.172 0.010 0.425 117 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 118 A 0.001 0.004 0.004 0.004 0.035 0.024 0.001 0.927 119 N 0.027 0.015 0.003 0.002 0.005 0.105 0.002 0.841 120 L 0.128 0.212 0.002 0.002 0.008 0.143 0.004 0.501 121 I 0.020 0.917 0.002 0.002 0.003 0.004 0.001 0.051 122 Q 0.015 0.933 0.001 0.002 0.003 0.004 0.003 0.040 123 Q 0.335 0.510 0.004 0.003 0.002 0.004 0.061 0.082 124 L 0.229 0.622 0.029 0.007 0.008 0.006 0.049 0.049 125 D 0.069 0.447 0.108 0.068 0.051 0.035 0.064 0.158 126 V 0.080 0.160 0.254 0.054 0.061 0.067 0.045 0.280 127 C 0.063 0.068 0.373 0.083 0.098 0.080 0.013 0.221 128 V 0.014 0.027 0.495 0.255 0.115 0.015 0.007 0.071 129 E 0.007 0.011 0.381 0.104 0.136 0.014 0.007 0.340 130 I 0.007 0.002 0.461 0.229 0.185 0.013 0.003 0.100 131 P 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.994 132 Q 0.002 0.001 0.061 0.060 0.300 0.091 0.003 0.482 133 Q 0.067 0.002 0.037 0.021 0.034 0.092 0.008 0.739 134 G 0.143 0.006 0.045 0.074 0.049 0.095 0.019 0.569 135 I 0.102 0.003 0.031 0.017 0.030 0.098 0.004 0.716 136 I 0.038 0.015 0.130 0.100 0.152 0.083 0.003 0.477 137 R 0.022 0.029 0.071 0.132 0.171 0.123 0.006 0.446 138 S 0.034 0.038 0.053 0.045 0.094 0.087 0.007 0.643 139 L 0.083 0.151 0.157 0.121 0.104 0.058 0.012 0.315 140 N 0.039 0.045 0.035 0.024 0.037 0.285 0.012 0.522 141 V 0.074 0.193 0.062 0.036 0.069 0.176 0.009 0.380 142 H 0.020 0.561 0.017 0.014 0.025 0.167 0.004 0.192 143 V 0.053 0.408 0.008 0.007 0.017 0.244 0.012 0.251 144 S 0.006 0.960 0.002 0.002 0.001 0.005 0.001 0.024 145 G 0.004 0.953 0.001 0.002 0.002 0.006 0.003 0.029 146 A 0.004 0.980 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.011 147 L 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 148 L 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 149 I 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 150 W 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 151 E 0.002 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 152 Y 0.005 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 153 T 0.005 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 154 R 0.006 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.010 155 Q 0.014 0.957 0.002 0.001 0.001 0.002 0.008 0.016 156 Q 0.039 0.905 0.003 0.002 0.002 0.003 0.019 0.026 157 L 0.090 0.788 0.016 0.007 0.006 0.007 0.031 0.055 158 L 0.187 0.436 0.054 0.018 0.019 0.030 0.049 0.207 159 S 0.081 0.170 0.038 0.014 0.016 0.044 0.030 0.606