# TARGET T0328 # Using neural net dunbrack-30pc-1763-t2k-thin90-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-t1c2-str2-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 13 (1 str2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0328.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 58.982 # Pos AA A B C E G H M P Q S T Y Z 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.007 0.038 0.537 0.004 0.007 0.019 0.005 0.003 0.047 0.066 0.021 0.161 0.083 2 D 0.004 0.076 0.549 0.003 0.004 0.011 0.007 0.003 0.060 0.038 0.020 0.023 0.204 3 I 0.001 0.025 0.779 0.003 0.004 0.009 0.001 0.001 0.050 0.036 0.012 0.063 0.017 4 Q 0.001 0.020 0.613 0.005 0.016 0.023 0.002 0.001 0.021 0.085 0.168 0.004 0.040 5 N 0.001 0.014 0.374 0.006 0.028 0.018 0.001 0.001 0.006 0.247 0.295 0.007 0.005 6 M 0.001 0.010 0.495 0.001 0.015 0.019 0.001 0.001 0.004 0.378 0.070 0.003 0.005 7 P 0.001 0.034 0.665 0.001 0.044 0.057 0.001 0.001 0.005 0.102 0.071 0.003 0.017 8 R 0.001 0.047 0.351 0.002 0.111 0.138 0.002 0.002 0.014 0.140 0.149 0.017 0.026 9 E 0.003 0.029 0.289 0.013 0.156 0.145 0.004 0.003 0.010 0.135 0.171 0.015 0.026 10 Q 0.005 0.035 0.202 0.005 0.202 0.219 0.003 0.004 0.017 0.103 0.121 0.018 0.066 11 L 0.006 0.010 0.112 0.025 0.220 0.301 0.002 0.003 0.005 0.102 0.188 0.012 0.015 12 G 0.012 0.009 0.137 0.005 0.175 0.279 0.005 0.007 0.008 0.085 0.212 0.048 0.018 13 V 0.023 0.044 0.198 0.002 0.114 0.228 0.009 0.010 0.037 0.056 0.089 0.009 0.182 14 C 0.016 0.058 0.247 0.013 0.067 0.328 0.007 0.006 0.029 0.083 0.065 0.065 0.017 15 A 0.004 0.011 0.399 0.004 0.057 0.207 0.001 0.004 0.029 0.146 0.082 0.019 0.036 16 E 0.001 0.008 0.331 0.008 0.116 0.214 0.001 0.001 0.005 0.129 0.162 0.003 0.020 17 G 0.001 0.012 0.251 0.006 0.131 0.205 0.001 0.001 0.002 0.148 0.226 0.008 0.008 18 N 0.002 0.016 0.462 0.003 0.049 0.104 0.001 0.001 0.001 0.216 0.104 0.016 0.025 19 L 0.010 0.012 0.154 0.008 0.067 0.230 0.001 0.001 0.003 0.092 0.292 0.016 0.115 20 H 0.070 0.010 0.116 0.021 0.022 0.237 0.005 0.005 0.013 0.105 0.212 0.132 0.053 21 S 0.232 0.002 0.162 0.011 0.007 0.136 0.026 0.004 0.033 0.036 0.025 0.052 0.273 22 V 0.557 0.002 0.035 0.031 0.002 0.080 0.087 0.011 0.025 0.011 0.004 0.062 0.093 23 Y 0.686 0.001 0.007 0.007 0.001 0.057 0.115 0.019 0.007 0.001 0.003 0.031 0.064 24 L 0.642 0.001 0.007 0.003 0.001 0.045 0.111 0.025 0.010 0.001 0.003 0.103 0.047 25 M 0.785 0.001 0.009 0.007 0.002 0.025 0.074 0.003 0.003 0.003 0.003 0.020 0.065 26 F 0.462 0.002 0.051 0.020 0.005 0.024 0.070 0.004 0.020 0.015 0.010 0.240 0.078 27 N 0.109 0.007 0.150 0.018 0.012 0.026 0.026 0.003 0.047 0.061 0.041 0.071 0.429 28 A 0.021 0.022 0.429 0.007 0.026 0.072 0.009 0.003 0.031 0.161 0.085 0.039 0.096 29 N 0.002 0.011 0.399 0.003 0.019 0.066 0.002 0.001 0.014 0.284 0.161 0.022 0.016 30 D 0.001 0.004 0.127 0.002 0.047 0.079 0.001 0.001 0.001 0.210 0.524 0.002 0.004 31 N 0.001 0.005 0.221 0.001 0.038 0.073 0.001 0.001 0.001 0.357 0.302 0.002 0.001 32 V 0.001 0.015 0.347 0.001 0.093 0.227 0.001 0.001 0.001 0.181 0.133 0.001 0.002 33 E 0.001 0.008 0.094 0.001 0.163 0.638 0.001 0.001 0.001 0.017 0.078 0.001 0.001 34 S 0.001 0.001 0.011 0.001 0.180 0.712 0.001 0.001 0.001 0.009 0.087 0.001 0.001 35 Q 0.001 0.002 0.017 0.001 0.096 0.799 0.001 0.001 0.001 0.016 0.068 0.001 0.001 36 L 0.001 0.002 0.038 0.001 0.017 0.921 0.001 0.001 0.004 0.006 0.010 0.001 0.001 37 R 0.001 0.001 0.003 0.001 0.007 0.979 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.001 0.001 38 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.969 0.001 0.001 0.001 0.002 0.019 0.001 0.001 39 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 40 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 41 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 42 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.966 0.001 0.001 0.001 0.001 0.027 0.001 0.001 43 V 0.001 0.001 0.004 0.001 0.002 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 44 A 0.001 0.001 0.002 0.001 0.004 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 45 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.001 0.001 46 Y 0.001 0.001 0.002 0.001 0.006 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 47 I 0.001 0.001 0.005 0.001 0.006 0.975 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.001 0.001 48 Y 0.001 0.001 0.002 0.001 0.017 0.962 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.001 0.001 49 E 0.001 0.001 0.007 0.001 0.024 0.935 0.001 0.001 0.001 0.006 0.026 0.001 0.001 50 L 0.001 0.003 0.026 0.001 0.033 0.870 0.001 0.001 0.005 0.007 0.055 0.001 0.001 51 T 0.001 0.005 0.090 0.001 0.072 0.617 0.001 0.001 0.001 0.035 0.178 0.001 0.001 52 D 0.001 0.002 0.044 0.001 0.080 0.188 0.001 0.001 0.001 0.057 0.627 0.001 0.001 53 Q 0.001 0.003 0.059 0.001 0.048 0.042 0.001 0.001 0.002 0.126 0.719 0.001 0.001 54 Y 0.001 0.011 0.595 0.001 0.016 0.007 0.001 0.001 0.003 0.294 0.071 0.001 0.002 55 S 0.001 0.033 0.701 0.001 0.031 0.006 0.001 0.001 0.003 0.171 0.050 0.002 0.003 56 D 0.001 0.008 0.224 0.001 0.443 0.014 0.001 0.001 0.002 0.091 0.214 0.001 0.003 57 S 0.001 0.002 0.067 0.011 0.596 0.014 0.001 0.001 0.001 0.114 0.192 0.001 0.001 58 A 0.005 0.009 0.232 0.009 0.366 0.017 0.005 0.003 0.033 0.126 0.155 0.012 0.029 59 F 0.028 0.013 0.304 0.004 0.021 0.004 0.019 0.020 0.408 0.055 0.015 0.042 0.068 60 N 0.023 0.005 0.201 0.058 0.003 0.002 0.026 0.048 0.480 0.102 0.005 0.029 0.020 61 G 0.030 0.001 0.024 0.005 0.001 0.001 0.067 0.294 0.540 0.008 0.001 0.009 0.020 62 F 0.025 0.001 0.005 0.005 0.001 0.001 0.134 0.617 0.197 0.002 0.001 0.004 0.009 63 V 0.027 0.001 0.003 0.002 0.001 0.001 0.214 0.595 0.138 0.001 0.001 0.010 0.006 64 A 0.066 0.002 0.024 0.004 0.001 0.001 0.166 0.462 0.227 0.007 0.004 0.024 0.013 65 I 0.019 0.014 0.217 0.002 0.004 0.006 0.066 0.219 0.324 0.055 0.034 0.009 0.031 66 G 0.004 0.032 0.290 0.003 0.024 0.035 0.009 0.029 0.185 0.226 0.131 0.008 0.023 67 A 0.001 0.008 0.131 0.002 0.160 0.265 0.001 0.005 0.013 0.105 0.306 0.002 0.003 68 N 0.001 0.004 0.067 0.001 0.315 0.320 0.001 0.004 0.004 0.101 0.183 0.001 0.001 69 Y 0.001 0.007 0.045 0.001 0.412 0.414 0.001 0.001 0.003 0.025 0.088 0.001 0.003 70 W 0.001 0.006 0.036 0.001 0.479 0.411 0.001 0.001 0.001 0.009 0.057 0.001 0.001 71 D 0.001 0.001 0.020 0.001 0.497 0.359 0.001 0.001 0.001 0.013 0.107 0.001 0.001 72 S 0.001 0.004 0.085 0.001 0.452 0.270 0.001 0.001 0.001 0.039 0.145 0.001 0.003 73 L 0.001 0.055 0.231 0.001 0.140 0.240 0.001 0.001 0.009 0.109 0.205 0.002 0.006 74 Y 0.001 0.017 0.502 0.001 0.087 0.094 0.001 0.001 0.002 0.155 0.139 0.002 0.001 75 P 0.001 0.008 0.119 0.001 0.133 0.090 0.001 0.001 0.001 0.129 0.517 0.001 0.002 76 E 0.001 0.005 0.119 0.001 0.103 0.041 0.001 0.001 0.002 0.218 0.507 0.002 0.001 77 S 0.001 0.030 0.457 0.001 0.028 0.014 0.001 0.001 0.008 0.352 0.103 0.001 0.005 78 R 0.001 0.057 0.744 0.001 0.009 0.008 0.001 0.001 0.006 0.160 0.011 0.003 0.001 79 P 0.001 0.024 0.510 0.001 0.299 0.039 0.001 0.001 0.002 0.048 0.073 0.001 0.004 80 E 0.001 0.002 0.039 0.001 0.662 0.043 0.001 0.001 0.001 0.017 0.234 0.001 0.001 81 M 0.001 0.005 0.067 0.001 0.582 0.029 0.001 0.001 0.002 0.049 0.262 0.001 0.003 82 L 0.001 0.025 0.349 0.001 0.205 0.037 0.001 0.001 0.039 0.237 0.094 0.002 0.009 83 K 0.001 0.011 0.527 0.002 0.030 0.014 0.001 0.001 0.012 0.338 0.057 0.007 0.001 84 P 0.001 0.026 0.468 0.003 0.040 0.007 0.001 0.001 0.009 0.239 0.178 0.001 0.029 85 F 0.001 0.021 0.620 0.002 0.020 0.006 0.001 0.001 0.014 0.263 0.026 0.023 0.004 86 P 0.001 0.027 0.633 0.005 0.037 0.011 0.001 0.001 0.011 0.119 0.100 0.007 0.047 87 A 0.002 0.089 0.492 0.005 0.049 0.015 0.004 0.002 0.020 0.112 0.112 0.050 0.048 88 M 0.003 0.052 0.580 0.002 0.052 0.016 0.003 0.001 0.030 0.110 0.061 0.028 0.060 89 Q 0.001 0.025 0.511 0.005 0.055 0.019 0.001 0.001 0.018 0.132 0.192 0.017 0.023 90 E 0.001 0.019 0.213 0.004 0.060 0.018 0.001 0.001 0.006 0.198 0.462 0.005 0.013 91 G 0.001 0.008 0.183 0.005 0.049 0.015 0.001 0.001 0.004 0.323 0.404 0.005 0.003 92 N 0.001 0.031 0.416 0.005 0.049 0.024 0.001 0.002 0.006 0.153 0.274 0.011 0.025 93 R 0.008 0.110 0.439 0.004 0.027 0.025 0.007 0.003 0.013 0.132 0.091 0.048 0.093 94 E 0.009 0.083 0.449 0.021 0.017 0.016 0.006 0.002 0.019 0.174 0.036 0.056 0.111 95 A 0.002 0.009 0.598 0.012 0.008 0.007 0.001 0.001 0.008 0.214 0.018 0.098 0.024 96 P 0.002 0.011 0.639 0.023 0.016 0.007 0.001 0.001 0.005 0.123 0.072 0.006 0.095 97 A 0.007 0.047 0.484 0.006 0.033 0.006 0.002 0.001 0.007 0.142 0.119 0.093 0.052 98 I 0.010 0.032 0.346 0.016 0.036 0.006 0.003 0.001 0.005 0.271 0.127 0.045 0.102 99 E 0.006 0.023 0.293 0.025 0.070 0.010 0.002 0.001 0.007 0.275 0.197 0.036 0.056 100 Y 0.010 0.008 0.393 0.017 0.049 0.011 0.002 0.002 0.014 0.231 0.192 0.036 0.034 101 D 0.019 0.007 0.516 0.042 0.014 0.004 0.009 0.002 0.021 0.238 0.029 0.047 0.053 102 L 0.155 0.004 0.107 0.008 0.004 0.002 0.099 0.086 0.255 0.022 0.006 0.057 0.195 103 F 0.374 0.001 0.012 0.027 0.001 0.001 0.206 0.193 0.069 0.004 0.001 0.065 0.045 104 V 0.427 0.001 0.003 0.007 0.001 0.001 0.277 0.186 0.026 0.001 0.001 0.029 0.044 105 H 0.498 0.001 0.006 0.006 0.001 0.001 0.195 0.168 0.054 0.001 0.001 0.039 0.030 106 L 0.305 0.002 0.057 0.013 0.002 0.001 0.147 0.170 0.124 0.012 0.003 0.081 0.084 107 R 0.092 0.008 0.234 0.021 0.009 0.003 0.048 0.031 0.192 0.181 0.016 0.050 0.116 108 C 0.010 0.015 0.630 0.004 0.030 0.022 0.005 0.002 0.044 0.147 0.037 0.012 0.042 109 D 0.001 0.012 0.361 0.004 0.022 0.041 0.001 0.001 0.009 0.421 0.120 0.003 0.004 110 R 0.001 0.009 0.171 0.004 0.071 0.221 0.001 0.001 0.004 0.210 0.304 0.002 0.004 111 Y 0.001 0.005 0.096 0.001 0.028 0.583 0.001 0.001 0.002 0.101 0.172 0.007 0.004 112 D 0.001 0.004 0.110 0.001 0.006 0.737 0.001 0.001 0.002 0.063 0.065 0.007 0.007 113 I 0.001 0.002 0.011 0.001 0.001 0.974 0.001 0.001 0.001 0.006 0.003 0.001 0.003 114 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 115 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 116 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 117 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 118 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 119 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 120 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 121 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 122 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 123 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.924 0.001 0.001 0.001 0.001 0.072 0.001 0.001 124 M 0.001 0.001 0.007 0.001 0.025 0.784 0.001 0.001 0.001 0.007 0.175 0.001 0.001 125 F 0.001 0.005 0.085 0.001 0.068 0.537 0.001 0.001 0.001 0.053 0.251 0.001 0.001 126 E 0.001 0.001 0.048 0.001 0.191 0.268 0.001 0.001 0.001 0.045 0.447 0.001 0.001 127 D 0.001 0.002 0.132 0.002 0.194 0.133 0.001 0.001 0.002 0.191 0.343 0.001 0.001 128 L 0.001 0.008 0.240 0.001 0.189 0.131 0.001 0.001 0.087 0.091 0.238 0.003 0.008 129 V 0.005 0.016 0.417 0.006 0.067 0.044 0.007 0.016 0.188 0.093 0.079 0.019 0.043 130 E 0.053 0.030 0.172 0.016 0.029 0.053 0.041 0.066 0.204 0.080 0.014 0.200 0.042 131 L 0.039 0.013 0.105 0.008 0.027 0.054 0.029 0.094 0.282 0.027 0.023 0.030 0.267 132 V 0.022 0.009 0.063 0.617 0.021 0.040 0.014 0.036 0.056 0.017 0.014 0.037 0.055 133 E 0.026 0.006 0.143 0.061 0.045 0.070 0.004 0.017 0.056 0.041 0.012 0.335 0.185 134 E 0.023 0.007 0.135 0.039 0.067 0.142 0.002 0.004 0.011 0.047 0.046 0.036 0.441 135 E 0.019 0.014 0.157 0.048 0.068 0.177 0.003 0.009 0.027 0.120 0.139 0.140 0.080 136 R 0.014 0.010 0.208 0.061 0.041 0.075 0.002 0.005 0.020 0.180 0.255 0.059 0.071 137 G 0.026 0.008 0.252 0.052 0.025 0.020 0.005 0.004 0.013 0.158 0.285 0.062 0.093 138 F 0.074 0.015 0.263 0.010 0.024 0.012 0.017 0.007 0.030 0.116 0.076 0.153 0.202 139 R 0.059 0.029 0.143 0.010 0.016 0.011 0.027 0.003 0.037 0.056 0.030 0.255 0.323 140 F 0.043 0.032 0.273 0.019 0.016 0.008 0.014 0.005 0.081 0.077 0.036 0.095 0.302 141 M 0.003 0.027 0.515 0.001 0.004 0.009 0.002 0.001 0.030 0.256 0.019 0.112 0.022 142 D 0.001 0.009 0.732 0.001 0.007 0.011 0.001 0.001 0.005 0.175 0.026 0.001 0.033 143 S 0.001 0.007 0.106 0.003 0.212 0.355 0.001 0.001 0.001 0.078 0.234 0.001 0.002 144 R 0.001 0.007 0.055 0.001 0.368 0.347 0.001 0.001 0.001 0.040 0.173 0.002 0.002 145 D 0.003 0.010 0.072 0.001 0.450 0.307 0.002 0.002 0.015 0.027 0.082 0.007 0.022 146 L 0.008 0.056 0.053 0.010 0.208 0.432 0.004 0.003 0.009 0.056 0.141 0.004 0.015 147 T 0.005 0.005 0.058 0.018 0.103 0.227 0.001 0.002 0.007 0.067 0.488 0.008 0.010 148 G 0.013 0.007 0.112 0.004 0.078 0.153 0.002 0.003 0.004 0.184 0.409 0.017 0.014 149 F 0.020 0.043 0.417 0.003 0.047 0.110 0.004 0.004 0.024 0.111 0.164 0.008 0.046 150 V 0.012 0.125 0.351 0.007 0.024 0.035 0.005 0.003 0.060 0.156 0.079 0.125 0.018 151 D 0.002 0.026 0.602 0.007 0.018 0.014 0.001 0.002 0.037 0.098 0.090 0.019 0.084 152 G 0.009 0.032 0.419 0.021 0.019 0.010 0.004 0.002 0.013 0.172 0.227 0.022 0.050 153 T 0.008 0.035 0.467 0.006 0.022 0.012 0.004 0.002 0.008 0.185 0.170 0.049 0.032 154 E 0.004 0.065 0.434 0.001 0.010 0.008 0.002 0.001 0.004 0.290 0.119 0.015 0.047 155 N 0.001 0.012 0.727 0.001 0.007 0.005 0.001 0.001 0.002 0.190 0.047 0.004 0.003 156 P 0.001 0.014 0.356 0.001 0.033 0.034 0.001 0.001 0.001 0.180 0.376 0.001 0.004 157 K 0.001 0.017 0.256 0.002 0.040 0.031 0.001 0.001 0.001 0.120 0.529 0.003 0.003 158 G 0.001 0.014 0.440 0.001 0.045 0.043 0.001 0.001 0.001 0.283 0.160 0.003 0.009 159 R 0.001 0.012 0.497 0.003 0.053 0.069 0.001 0.001 0.001 0.209 0.145 0.006 0.005 160 H 0.002 0.043 0.324 0.004 0.071 0.103 0.001 0.001 0.001 0.196 0.208 0.017 0.030 161 R 0.022 0.028 0.282 0.009 0.062 0.141 0.002 0.001 0.004 0.128 0.149 0.054 0.120 162 Q 0.106 0.019 0.258 0.063 0.024 0.106 0.006 0.002 0.006 0.081 0.050 0.101 0.178 163 E 0.209 0.009 0.112 0.033 0.022 0.093 0.015 0.006 0.016 0.027 0.035 0.148 0.277 164 V 0.411 0.005 0.047 0.014 0.023 0.061 0.032 0.016 0.023 0.013 0.025 0.139 0.192 165 A 0.553 0.004 0.029 0.015 0.026 0.039 0.062 0.013 0.021 0.017 0.025 0.110 0.087 166 L 0.564 0.005 0.017 0.005 0.013 0.023 0.086 0.014 0.022 0.009 0.027 0.086 0.131 167 V 0.508 0.013 0.066 0.009 0.009 0.016 0.047 0.007 0.023 0.016 0.046 0.101 0.139 168 G 0.110 0.017 0.303 0.012 0.010 0.008 0.011 0.002 0.023 0.080 0.104 0.103 0.216 169 S 0.007 0.013 0.258 0.002 0.009 0.008 0.001 0.001 0.006 0.245 0.345 0.075 0.031 170 E 0.001 0.010 0.158 0.001 0.007 0.010 0.001 0.001 0.001 0.252 0.551 0.002 0.008 171 D 0.001 0.006 0.648 0.001 0.003 0.004 0.001 0.001 0.001 0.314 0.021 0.002 0.002 172 P 0.001 0.004 0.085 0.001 0.061 0.141 0.001 0.001 0.001 0.122 0.581 0.001 0.004 173 E 0.001 0.010 0.089 0.002 0.078 0.111 0.001 0.001 0.001 0.132 0.571 0.003 0.003 174 F 0.004 0.014 0.317 0.001 0.170 0.157 0.003 0.001 0.006 0.128 0.114 0.007 0.079 175 K 0.007 0.044 0.154 0.022 0.052 0.160 0.003 0.001 0.001 0.292 0.240 0.019 0.007 176 G 0.002 0.013 0.105 0.002 0.014 0.131 0.001 0.001 0.001 0.200 0.476 0.007 0.048 177 G 0.006 0.006 0.237 0.001 0.004 0.353 0.001 0.001 0.002 0.182 0.161 0.026 0.022 178 S 0.009 0.007 0.162 0.001 0.001 0.734 0.001 0.001 0.001 0.036 0.017 0.006 0.026 179 Y 0.003 0.001 0.020 0.001 0.001 0.960 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.004 0.006 180 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 181 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 182 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 183 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 184 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 185 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 186 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.939 0.001 0.001 0.001 0.001 0.056 0.001 0.001 187 H 0.001 0.001 0.007 0.001 0.009 0.709 0.001 0.001 0.001 0.012 0.262 0.001 0.001 188 N 0.001 0.003 0.103 0.001 0.020 0.383 0.001 0.001 0.001 0.080 0.411 0.001 0.001 189 L 0.001 0.006 0.365 0.001 0.166 0.284 0.001 0.001 0.001 0.091 0.086 0.001 0.001 190 S 0.001 0.002 0.044 0.001 0.491 0.191 0.001 0.001 0.001 0.047 0.223 0.001 0.001 191 K 0.001 0.003 0.045 0.001 0.570 0.111 0.001 0.001 0.001 0.043 0.226 0.001 0.001 192 W 0.001 0.003 0.053 0.001 0.738 0.116 0.001 0.001 0.006 0.020 0.062 0.001 0.002 193 H 0.001 0.004 0.096 0.001 0.411 0.172 0.001 0.001 0.002 0.106 0.204 0.003 0.001 194 R 0.001 0.006 0.075 0.001 0.456 0.088 0.001 0.001 0.002 0.092 0.274 0.001 0.005 195 L 0.001 0.011 0.455 0.001 0.068 0.080 0.001 0.001 0.009 0.336 0.036 0.004 0.001 196 P 0.001 0.014 0.769 0.001 0.025 0.119 0.001 0.001 0.002 0.035 0.031 0.001 0.004 197 L 0.001 0.004 0.188 0.001 0.049 0.683 0.001 0.001 0.001 0.042 0.033 0.001 0.001 198 K 0.001 0.001 0.090 0.001 0.042 0.768 0.001 0.001 0.001 0.039 0.060 0.001 0.001 199 K 0.001 0.001 0.016 0.001 0.031 0.798 0.001 0.001 0.001 0.010 0.140 0.001 0.001 200 Q 0.003 0.006 0.022 0.001 0.024 0.869 0.002 0.001 0.005 0.011 0.048 0.002 0.007 201 E 0.004 0.004 0.023 0.002 0.022 0.863 0.002 0.004 0.024 0.010 0.028 0.005 0.009 202 D 0.012 0.004 0.021 0.013 0.035 0.731 0.007 0.028 0.019 0.018 0.074 0.012 0.025 203 I 0.010 0.004 0.047 0.018 0.050 0.574 0.005 0.019 0.040 0.030 0.156 0.015 0.033 204 I 0.018 0.011 0.076 0.019 0.044 0.446 0.008 0.009 0.028 0.093 0.160 0.057 0.031 205 G 0.029 0.014 0.237 0.012 0.039 0.146 0.004 0.003 0.012 0.144 0.218 0.056 0.086 206 R 0.036 0.023 0.380 0.008 0.022 0.038 0.005 0.002 0.012 0.182 0.107 0.106 0.078 207 T 0.006 0.033 0.473 0.004 0.030 0.023 0.001 0.001 0.012 0.142 0.094 0.037 0.144 208 K 0.006 0.029 0.319 0.011 0.092 0.036 0.001 0.001 0.006 0.123 0.302 0.018 0.056 209 Q 0.004 0.012 0.367 0.008 0.095 0.027 0.001 0.001 0.004 0.155 0.260 0.050 0.018 210 D 0.001 0.003 0.078 0.008 0.068 0.012 0.001 0.001 0.001 0.101 0.715 0.003 0.009 211 N 0.002 0.006 0.107 0.004 0.021 0.004 0.001 0.001 0.003 0.168 0.671 0.008 0.005 212 I 0.011 0.038 0.610 0.002 0.019 0.006 0.005 0.001 0.011 0.135 0.036 0.069 0.058 213 E 0.022 0.112 0.385 0.003 0.016 0.008 0.013 0.003 0.033 0.049 0.033 0.061 0.263 214 Y 0.021 0.098 0.413 0.016 0.050 0.015 0.010 0.005 0.048 0.061 0.046 0.119 0.098 215 E 0.007 0.042 0.401 0.025 0.047 0.017 0.005 0.004 0.021 0.155 0.178 0.028 0.070 216 S 0.001 0.010 0.461 0.012 0.059 0.013 0.001 0.001 0.005 0.222 0.181 0.014 0.022 217 E 0.001 0.024 0.301 0.006 0.032 0.020 0.001 0.001 0.002 0.330 0.250 0.014 0.018 218 D 0.001 0.023 0.453 0.007 0.022 0.013 0.001 0.001 0.002 0.322 0.123 0.005 0.028 219 K 0.001 0.011 0.482 0.002 0.008 0.009 0.001 0.001 0.004 0.425 0.035 0.021 0.004 220 P 0.001 0.008 0.711 0.005 0.019 0.017 0.001 0.001 0.002 0.121 0.095 0.001 0.020 221 L 0.003 0.037 0.289 0.009 0.042 0.035 0.002 0.001 0.006 0.207 0.317 0.037 0.014 222 T 0.015 0.019 0.426 0.020 0.032 0.032 0.005 0.004 0.014 0.170 0.108 0.061 0.094 223 S 0.042 0.028 0.321 0.037 0.031 0.049 0.010 0.006 0.022 0.089 0.046 0.091 0.227 224 H 0.084 0.013 0.229 0.044 0.020 0.050 0.011 0.007 0.023 0.058 0.034 0.305 0.122 225 I 0.106 0.008 0.153 0.041 0.033 0.065 0.025 0.009 0.022 0.037 0.026 0.064 0.410 226 K 0.104 0.006 0.074 0.042 0.017 0.059 0.016 0.013 0.028 0.021 0.017 0.538 0.066 227 R 0.139 0.009 0.098 0.033 0.023 0.046 0.015 0.007 0.020 0.028 0.023 0.046 0.512 228 V 0.145 0.012 0.132 0.047 0.010 0.022 0.013 0.005 0.016 0.035 0.012 0.452 0.100 229 N 0.081 0.007 0.142 0.010 0.009 0.011 0.003 0.003 0.013 0.038 0.013 0.140 0.529 230 L 0.079 0.024 0.159 0.024 0.036 0.062 0.005 0.005 0.012 0.077 0.051 0.098 0.369 231 K 0.051 0.040 0.254 0.022 0.046 0.108 0.006 0.004 0.014 0.133 0.098 0.098 0.126 232 D 0.003 0.009 0.449 0.002 0.063 0.150 0.001 0.001 0.005 0.091 0.156 0.019 0.052 233 E 0.001 0.004 0.062 0.001 0.026 0.081 0.001 0.001 0.001 0.054 0.763 0.004 0.004 234 N 0.001 0.001 0.011 0.001 0.005 0.019 0.001 0.001 0.001 0.022 0.941 0.001 0.001 235 G 0.001 0.002 0.203 0.001 0.010 0.041 0.001 0.001 0.001 0.210 0.530 0.001 0.001 236 K 0.002 0.036 0.529 0.001 0.014 0.126 0.001 0.001 0.002 0.152 0.118 0.012 0.008 237 S 0.010 0.110 0.270 0.002 0.022 0.325 0.004 0.001 0.006 0.048 0.062 0.012 0.129 238 I 0.016 0.005 0.123 0.068 0.020 0.605 0.004 0.002 0.007 0.033 0.018 0.066 0.033 239 E 0.027 0.005 0.040 0.016 0.020 0.742 0.008 0.007 0.007 0.017 0.009 0.041 0.062 240 I 0.019 0.003 0.013 0.002 0.015 0.825 0.006 0.013 0.010 0.003 0.010 0.013 0.069 241 L 0.016 0.007 0.026 0.030 0.021 0.819 0.004 0.012 0.003 0.007 0.033 0.013 0.008 242 R 0.012 0.005 0.078 0.004 0.046 0.640 0.002 0.015 0.009 0.020 0.089 0.021 0.058 243 Q 0.010 0.018 0.122 0.003 0.046 0.451 0.002 0.005 0.009 0.074 0.194 0.017 0.049 244 S 0.002 0.024 0.358 0.003 0.028 0.148 0.001 0.001 0.012 0.255 0.152 0.007 0.009 245 M 0.001 0.009 0.637 0.001 0.013 0.018 0.001 0.001 0.005 0.202 0.103 0.005 0.006 246 P 0.001 0.016 0.407 0.002 0.028 0.016 0.001 0.001 0.002 0.190 0.328 0.002 0.010 247 Y 0.001 0.015 0.245 0.001 0.044 0.014 0.001 0.001 0.003 0.302 0.368 0.003 0.005 248 G 0.001 0.019 0.332 0.001 0.030 0.019 0.001 0.001 0.002 0.392 0.189 0.005 0.009 249 S 0.001 0.040 0.461 0.001 0.030 0.031 0.001 0.001 0.005 0.325 0.083 0.005 0.018 250 L 0.001 0.027 0.249 0.002 0.163 0.206 0.001 0.001 0.002 0.159 0.179 0.003 0.009 251 K 0.001 0.013 0.193 0.008 0.156 0.191 0.001 0.001 0.001 0.105 0.311 0.011 0.009 252 E 0.009 0.029 0.123 0.005 0.124 0.160 0.002 0.001 0.002 0.092 0.330 0.021 0.102 253 Q 0.060 0.021 0.076 0.021 0.027 0.150 0.005 0.003 0.008 0.069 0.424 0.079 0.057 254 G 0.211 0.006 0.177 0.037 0.005 0.053 0.011 0.006 0.017 0.073 0.203 0.119 0.085 255 L 0.550 0.001 0.108 0.017 0.002 0.017 0.053 0.010 0.017 0.023 0.011 0.042 0.148 256 M 0.753 0.001 0.018 0.007 0.001 0.008 0.091 0.013 0.008 0.003 0.001 0.048 0.047 257 F 0.718 0.001 0.004 0.002 0.001 0.009 0.154 0.014 0.006 0.001 0.001 0.046 0.043 258 I 0.571 0.001 0.012 0.007 0.002 0.011 0.197 0.022 0.016 0.002 0.002 0.079 0.077 259 S 0.629 0.001 0.026 0.024 0.002 0.004 0.114 0.009 0.015 0.004 0.005 0.080 0.086 260 T 0.290 0.005 0.082 0.058 0.006 0.005 0.080 0.009 0.066 0.064 0.029 0.079 0.229 261 C 0.143 0.023 0.162 0.009 0.015 0.012 0.028 0.008 0.085 0.143 0.075 0.090 0.205 262 R 0.004 0.027 0.249 0.001 0.009 0.028 0.002 0.001 0.011 0.548 0.073 0.030 0.019 263 T 0.001 0.005 0.688 0.001 0.004 0.028 0.001 0.001 0.002 0.256 0.014 0.001 0.002 264 P 0.001 0.001 0.008 0.001 0.049 0.883 0.001 0.001 0.001 0.006 0.053 0.001 0.001 265 D 0.001 0.001 0.004 0.001 0.051 0.897 0.001 0.001 0.001 0.006 0.041 0.001 0.001 266 H 0.001 0.001 0.002 0.001 0.029 0.960 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 267 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 268 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 269 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 270 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 271 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 272 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 273 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 274 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 275 V 0.001 0.001 0.006 0.001 0.011 0.902 0.001 0.001 0.001 0.006 0.074 0.001 0.001 276 F 0.001 0.002 0.011 0.001 0.013 0.672 0.001 0.001 0.001 0.008 0.291 0.001 0.001 277 G 0.002 0.026 0.133 0.001 0.012 0.315 0.001 0.001 0.005 0.076 0.422 0.001 0.004 278 D 0.001 0.009 0.689 0.001 0.007 0.043 0.001 0.001 0.003 0.162 0.085 0.001 0.001 279 G 0.001 0.004 0.138 0.001 0.016 0.043 0.001 0.001 0.001 0.224 0.572 0.001 0.001 280 A 0.001 0.004 0.106 0.001 0.018 0.033 0.001 0.001 0.001 0.178 0.658 0.001 0.001 281 G 0.001 0.011 0.278 0.001 0.015 0.042 0.001 0.001 0.002 0.481 0.165 0.002 0.002 282 N 0.001 0.034 0.504 0.001 0.018 0.199 0.001 0.001 0.003 0.110 0.124 0.002 0.005 283 H 0.001 0.092 0.277 0.001 0.042 0.432 0.001 0.001 0.006 0.040 0.080 0.007 0.021 284 D 0.002 0.011 0.118 0.003 0.089 0.630 0.001 0.002 0.007 0.037 0.081 0.010 0.009 285 H 0.003 0.008 0.057 0.005 0.097 0.690 0.002 0.004 0.004 0.033 0.073 0.006 0.019 286 L 0.004 0.009 0.045 0.002 0.121 0.698 0.001 0.002 0.003 0.019 0.078 0.006 0.011 287 M 0.003 0.005 0.038 0.009 0.181 0.556 0.001 0.002 0.001 0.029 0.170 0.002 0.004 288 H 0.002 0.005 0.059 0.002 0.129 0.481 0.001 0.003 0.001 0.042 0.266 0.005 0.004 289 F 0.006 0.016 0.158 0.001 0.102 0.458 0.002 0.006 0.014 0.066 0.146 0.003 0.021 290 T 0.005 0.065 0.354 0.007 0.025 0.172 0.003 0.005 0.041 0.242 0.052 0.019 0.010 291 S 0.003 0.037 0.580 0.010 0.016 0.032 0.001 0.001 0.022 0.181 0.042 0.036 0.038 292 A 0.003 0.019 0.460 0.010 0.042 0.067 0.002 0.005 0.020 0.130 0.158 0.006 0.079 293 L 0.020 0.041 0.218 0.007 0.049 0.064 0.015 0.028 0.026 0.075 0.325 0.085 0.045 294 T 0.029 0.017 0.171 0.017 0.050 0.043 0.011 0.011 0.020 0.223 0.311 0.029 0.066 295 G 0.021 0.029 0.286 0.053 0.049 0.050 0.004 0.006 0.035 0.240 0.171 0.022 0.034 296 S 0.067 0.020 0.346 0.010 0.053 0.073 0.013 0.023 0.064 0.085 0.108 0.081 0.058 297 S 0.213 0.023 0.099 0.010 0.029 0.048 0.066 0.050 0.044 0.031 0.058 0.068 0.260 298 F 0.257 0.020 0.077 0.012 0.025 0.044 0.126 0.066 0.048 0.023 0.033 0.172 0.098 299 F 0.199 0.032 0.106 0.027 0.015 0.033 0.186 0.029 0.102 0.035 0.027 0.024 0.183 300 A 0.030 0.020 0.394 0.008 0.007 0.015 0.013 0.002 0.067 0.139 0.009 0.263 0.032 301 P 0.001 0.012 0.571 0.001 0.011 0.025 0.001 0.001 0.006 0.286 0.027 0.005 0.055 302 S 0.001 0.017 0.687 0.001 0.023 0.124 0.001 0.001 0.001 0.103 0.031 0.001 0.010 303 L 0.001 0.001 0.015 0.001 0.055 0.895 0.001 0.001 0.001 0.006 0.027 0.001 0.001 304 D 0.001 0.001 0.017 0.001 0.090 0.858 0.001 0.001 0.001 0.008 0.026 0.001 0.001 305 F 0.001 0.001 0.004 0.001 0.118 0.840 0.001 0.001 0.001 0.001 0.036 0.001 0.001 306 L 0.001 0.002 0.006 0.001 0.116 0.826 0.001 0.001 0.001 0.006 0.043 0.001 0.001 307 M 0.001 0.001 0.008 0.001 0.088 0.758 0.001 0.001 0.001 0.005 0.140 0.001 0.001 308 Q 0.001 0.002 0.028 0.001 0.096 0.461 0.001 0.001 0.001 0.038 0.373 0.001 0.001 309 F 0.001 0.011 0.364 0.001 0.036 0.252 0.001 0.001 0.004 0.105 0.226 0.001 0.001 310 D 0.001 0.046 0.410 0.001 0.033 0.117 0.001 0.001 0.004 0.156 0.230 0.001 0.002 311 N 0.001 0.010 0.637 0.001 0.021 0.057 0.001 0.001 0.001 0.232 0.041 0.001 0.001