# TARGET T0326 # Using neural net dunbrack-30pc-1763-t2k-thin90-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-t3c1-near-backbone-11-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0326.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 29.467 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.028 0.030 0.016 0.055 0.074 0.106 0.192 0.162 0.140 0.116 0.081 2 P 0.116 0.123 0.068 0.194 0.157 0.101 0.075 0.067 0.052 0.030 0.017 3 I 0.007 0.004 0.005 0.009 0.018 0.037 0.101 0.137 0.225 0.241 0.216 4 N 0.091 0.159 0.071 0.254 0.177 0.095 0.066 0.041 0.024 0.013 0.010 5 V 0.003 0.004 0.003 0.008 0.012 0.022 0.083 0.118 0.206 0.263 0.278 6 P 0.255 0.180 0.049 0.151 0.117 0.072 0.061 0.048 0.031 0.020 0.015 7 S 0.253 0.182 0.054 0.158 0.112 0.083 0.064 0.034 0.034 0.017 0.010 8 G 0.365 0.208 0.048 0.122 0.101 0.065 0.043 0.023 0.016 0.007 0.003 9 L 0.152 0.065 0.018 0.084 0.082 0.095 0.157 0.120 0.104 0.072 0.052 10 P 0.202 0.193 0.089 0.158 0.108 0.086 0.071 0.044 0.028 0.014 0.008 11 A 0.031 0.128 0.089 0.160 0.134 0.117 0.121 0.091 0.065 0.041 0.024 12 V 0.016 0.016 0.018 0.047 0.081 0.143 0.225 0.149 0.141 0.098 0.069 13 K 0.228 0.108 0.196 0.247 0.121 0.053 0.027 0.010 0.006 0.002 0.001 14 V 0.009 0.016 0.032 0.118 0.119 0.148 0.283 0.143 0.072 0.043 0.018 15 L 0.001 0.001 0.007 0.003 0.003 0.006 0.032 0.074 0.205 0.309 0.361 16 A 0.011 0.038 0.110 0.155 0.200 0.186 0.181 0.067 0.029 0.016 0.006 17 K 0.054 0.095 0.547 0.148 0.079 0.043 0.017 0.009 0.005 0.002 0.001 18 E 0.058 0.039 0.041 0.084 0.102 0.175 0.267 0.119 0.067 0.032 0.016 19 G 0.260 0.163 0.081 0.127 0.087 0.079 0.082 0.055 0.041 0.019 0.007 20 I 0.024 0.021 0.043 0.056 0.070 0.110 0.193 0.149 0.143 0.112 0.080 21 F 0.063 0.084 0.157 0.169 0.142 0.128 0.129 0.062 0.036 0.019 0.012 22 V 0.039 0.044 0.092 0.125 0.086 0.092 0.161 0.112 0.107 0.085 0.058 23 M 0.047 0.066 0.063 0.094 0.089 0.100 0.173 0.122 0.102 0.081 0.064 24 T 0.114 0.203 0.086 0.177 0.121 0.097 0.093 0.051 0.034 0.016 0.007 25 E 0.208 0.155 0.101 0.194 0.140 0.096 0.059 0.023 0.014 0.006 0.003 26 K 0.498 0.133 0.145 0.107 0.057 0.032 0.017 0.006 0.004 0.001 0.001 27 R 0.102 0.084 0.089 0.191 0.135 0.128 0.156 0.064 0.031 0.015 0.005 28 A 0.016 0.021 0.069 0.034 0.042 0.081 0.188 0.176 0.163 0.129 0.082 29 I 0.027 0.085 0.277 0.222 0.146 0.109 0.080 0.029 0.014 0.008 0.004 30 H 0.076 0.082 0.360 0.158 0.113 0.095 0.063 0.026 0.015 0.009 0.003 31 Q 0.119 0.073 0.133 0.159 0.115 0.118 0.141 0.059 0.043 0.027 0.014 32 D 0.125 0.125 0.092 0.155 0.113 0.119 0.140 0.066 0.040 0.018 0.007 33 I 0.041 0.037 0.077 0.075 0.070 0.091 0.149 0.139 0.126 0.115 0.079 34 R 0.061 0.101 0.098 0.153 0.136 0.141 0.143 0.081 0.043 0.026 0.017 35 P 0.058 0.112 0.105 0.200 0.151 0.117 0.096 0.064 0.050 0.031 0.016 36 L 0.005 0.007 0.006 0.021 0.034 0.065 0.149 0.133 0.185 0.201 0.194 37 E 0.019 0.045 0.024 0.165 0.206 0.188 0.161 0.090 0.061 0.027 0.013 38 I 0.001 0.001 0.002 0.007 0.012 0.024 0.095 0.128 0.208 0.255 0.269 39 L 0.001 0.001 0.003 0.008 0.017 0.023 0.081 0.160 0.223 0.237 0.247 40 I 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.006 0.033 0.092 0.232 0.300 0.329 41 L 0.001 0.001 0.010 0.006 0.014 0.022 0.074 0.135 0.244 0.247 0.248 42 N 0.001 0.002 0.015 0.022 0.043 0.076 0.194 0.189 0.209 0.141 0.107 43 L 0.005 0.012 0.029 0.040 0.047 0.079 0.201 0.170 0.178 0.133 0.107 44 M 0.024 0.042 0.025 0.086 0.093 0.125 0.241 0.160 0.100 0.063 0.041 45 P 0.228 0.098 0.059 0.101 0.094 0.099 0.121 0.075 0.064 0.038 0.024 46 D 0.417 0.203 0.087 0.144 0.074 0.040 0.021 0.007 0.004 0.002 0.001 47 K 0.117 0.109 0.050 0.113 0.112 0.122 0.172 0.084 0.064 0.037 0.021 48 I 0.103 0.083 0.060 0.107 0.094 0.106 0.173 0.103 0.078 0.055 0.040 49 K 0.167 0.160 0.199 0.246 0.110 0.063 0.035 0.012 0.005 0.002 0.001 50 T 0.058 0.096 0.189 0.128 0.115 0.118 0.114 0.075 0.058 0.036 0.015 51 E 0.022 0.033 0.038 0.084 0.102 0.163 0.229 0.127 0.105 0.061 0.036 52 I 0.046 0.046 0.119 0.152 0.131 0.148 0.163 0.082 0.062 0.037 0.015 53 Q 0.007 0.024 0.088 0.172 0.163 0.157 0.200 0.099 0.046 0.030 0.014 54 L 0.001 0.001 0.007 0.006 0.007 0.015 0.064 0.102 0.229 0.294 0.274 55 L 0.002 0.003 0.023 0.029 0.057 0.097 0.206 0.160 0.176 0.155 0.092 56 R 0.005 0.017 0.154 0.164 0.141 0.132 0.180 0.085 0.057 0.043 0.022 57 L 0.001 0.003 0.013 0.022 0.029 0.051 0.166 0.186 0.201 0.194 0.134 58 L 0.003 0.002 0.005 0.006 0.010 0.022 0.081 0.149 0.230 0.257 0.234 59 G 0.074 0.103 0.118 0.206 0.169 0.123 0.100 0.048 0.032 0.017 0.009 60 N 0.058 0.073 0.074 0.138 0.148 0.132 0.146 0.089 0.066 0.046 0.030 61 T 0.044 0.036 0.010 0.042 0.048 0.065 0.160 0.164 0.180 0.139 0.112 62 P 0.191 0.154 0.058 0.183 0.132 0.090 0.074 0.046 0.037 0.022 0.015 63 L 0.045 0.054 0.041 0.093 0.099 0.110 0.170 0.111 0.110 0.098 0.069 64 Q 0.119 0.154 0.057 0.223 0.184 0.108 0.069 0.045 0.024 0.012 0.006 65 V 0.004 0.004 0.002 0.005 0.011 0.027 0.084 0.162 0.237 0.257 0.206 66 N 0.086 0.223 0.056 0.256 0.199 0.096 0.039 0.027 0.012 0.005 0.002 67 V 0.001 0.001 0.002 0.004 0.007 0.016 0.054 0.085 0.210 0.294 0.325 68 T 0.067 0.107 0.050 0.237 0.222 0.130 0.094 0.046 0.026 0.014 0.008 69 L 0.006 0.008 0.012 0.041 0.041 0.062 0.160 0.143 0.202 0.193 0.133 70 L 0.014 0.015 0.028 0.042 0.050 0.061 0.128 0.138 0.171 0.184 0.169 71 Y 0.018 0.042 0.034 0.109 0.104 0.117 0.200 0.148 0.112 0.073 0.042 72 T 0.026 0.032 0.048 0.060 0.068 0.081 0.138 0.132 0.150 0.145 0.121 73 E 0.201 0.147 0.073 0.179 0.136 0.099 0.087 0.036 0.024 0.012 0.006 74 T 0.288 0.165 0.084 0.156 0.103 0.066 0.059 0.032 0.026 0.015 0.006 75 H 0.121 0.075 0.030 0.083 0.092 0.107 0.178 0.117 0.089 0.062 0.046 76 K 0.277 0.206 0.076 0.162 0.102 0.066 0.053 0.028 0.017 0.008 0.004 77 P 0.174 0.138 0.120 0.140 0.111 0.092 0.085 0.052 0.042 0.028 0.017 78 K 0.225 0.160 0.085 0.167 0.134 0.093 0.073 0.031 0.018 0.008 0.004 79 H 0.314 0.116 0.073 0.117 0.085 0.075 0.078 0.057 0.044 0.026 0.014 80 T 0.151 0.176 0.064 0.156 0.124 0.114 0.099 0.059 0.032 0.016 0.009 81 P 0.071 0.193 0.084 0.117 0.096 0.097 0.102 0.092 0.078 0.044 0.026 82 I 0.049 0.042 0.030 0.130 0.164 0.182 0.195 0.087 0.061 0.036 0.023 83 E 0.453 0.108 0.204 0.136 0.056 0.024 0.010 0.004 0.003 0.001 0.001 84 H 0.005 0.017 0.018 0.094 0.107 0.146 0.285 0.159 0.089 0.053 0.027 85 I 0.001 0.001 0.004 0.002 0.003 0.009 0.047 0.098 0.227 0.297 0.311 86 L 0.013 0.023 0.153 0.205 0.215 0.163 0.139 0.047 0.023 0.014 0.005 87 K 0.038 0.063 0.575 0.158 0.087 0.050 0.018 0.007 0.003 0.001 0.001 88 F 0.002 0.004 0.009 0.013 0.017 0.045 0.193 0.186 0.230 0.177 0.124 89 Y 0.024 0.020 0.023 0.043 0.068 0.117 0.264 0.188 0.126 0.083 0.045 90 T 0.070 0.072 0.481 0.189 0.080 0.044 0.031 0.014 0.010 0.006 0.003 91 T 0.048 0.131 0.178 0.193 0.157 0.135 0.101 0.038 0.012 0.005 0.002 92 F 0.006 0.005 0.005 0.010 0.016 0.038 0.134 0.166 0.236 0.212 0.172 93 S 0.271 0.159 0.175 0.205 0.101 0.048 0.026 0.008 0.004 0.002 0.001 94 A 0.101 0.114 0.207 0.261 0.151 0.084 0.052 0.018 0.007 0.003 0.001 95 V 0.013 0.009 0.022 0.014 0.019 0.038 0.125 0.153 0.202 0.210 0.194 96 K 0.074 0.147 0.078 0.219 0.167 0.135 0.110 0.042 0.018 0.007 0.003 97 D 0.102 0.102 0.399 0.151 0.090 0.059 0.040 0.022 0.018 0.012 0.005 98 R 0.106 0.082 0.098 0.164 0.136 0.140 0.162 0.054 0.029 0.018 0.011 99 K 0.243 0.206 0.098 0.164 0.104 0.074 0.050 0.032 0.019 0.008 0.002 100 F 0.005 0.007 0.007 0.015 0.026 0.059 0.139 0.182 0.184 0.197 0.179 101 D 0.057 0.140 0.072 0.192 0.181 0.150 0.094 0.056 0.033 0.015 0.011 102 G 0.004 0.006 0.010 0.035 0.046 0.068 0.136 0.128 0.200 0.200 0.168 103 F 0.004 0.005 0.008 0.033 0.055 0.067 0.152 0.153 0.167 0.169 0.186 104 I 0.001 0.001 0.002 0.011 0.015 0.021 0.082 0.138 0.231 0.252 0.246 105 I 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.007 0.025 0.072 0.187 0.300 0.398 106 T 0.001 0.003 0.009 0.017 0.034 0.055 0.133 0.182 0.230 0.184 0.153 107 G 0.008 0.017 0.027 0.067 0.094 0.115 0.167 0.167 0.157 0.107 0.077 108 A 0.003 0.006 0.004 0.014 0.025 0.049 0.137 0.167 0.212 0.194 0.188 109 P 0.065 0.089 0.026 0.145 0.120 0.104 0.144 0.115 0.093 0.058 0.040 110 V 0.031 0.019 0.018 0.047 0.058 0.075 0.146 0.106 0.160 0.166 0.173 111 E 0.144 0.141 0.081 0.232 0.154 0.093 0.087 0.029 0.020 0.011 0.006 112 L 0.041 0.049 0.032 0.118 0.101 0.098 0.188 0.133 0.105 0.087 0.047 113 L 0.037 0.028 0.018 0.029 0.045 0.074 0.149 0.183 0.173 0.147 0.118 114 P 0.241 0.289 0.095 0.205 0.099 0.041 0.017 0.008 0.004 0.001 0.001 115 F 0.186 0.071 0.061 0.075 0.085 0.094 0.120 0.091 0.091 0.075 0.050 116 E 0.284 0.252 0.055 0.154 0.105 0.064 0.047 0.019 0.012 0.005 0.003 117 E 0.157 0.177 0.083 0.196 0.129 0.097 0.084 0.039 0.025 0.010 0.003 118 V 0.114 0.043 0.067 0.083 0.097 0.118 0.158 0.115 0.088 0.071 0.047 119 D 0.242 0.192 0.179 0.224 0.084 0.046 0.022 0.007 0.003 0.001 0.001 120 Y 0.006 0.036 0.048 0.053 0.055 0.082 0.171 0.180 0.162 0.134 0.072 121 W 0.009 0.014 0.016 0.044 0.084 0.157 0.290 0.174 0.106 0.063 0.045 122 E 0.366 0.089 0.354 0.141 0.033 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 123 E 0.012 0.052 0.062 0.179 0.219 0.216 0.173 0.062 0.018 0.006 0.002 124 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.033 0.081 0.253 0.292 0.333 125 T 0.012 0.019 0.100 0.171 0.258 0.221 0.158 0.037 0.015 0.008 0.002 126 E 0.014 0.034 0.741 0.141 0.046 0.018 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 127 I 0.001 0.001 0.004 0.003 0.005 0.020 0.128 0.187 0.253 0.225 0.175 128 M 0.001 0.002 0.005 0.005 0.015 0.057 0.204 0.246 0.224 0.155 0.087 129 E 0.013 0.029 0.702 0.159 0.060 0.022 0.009 0.003 0.002 0.001 0.001 130 W 0.004 0.013 0.082 0.090 0.107 0.199 0.320 0.114 0.039 0.022 0.010 131 S 0.005 0.006 0.014 0.011 0.010 0.020 0.090 0.129 0.259 0.256 0.200 132 R 0.044 0.064 0.111 0.189 0.177 0.167 0.159 0.044 0.023 0.014 0.006 133 H 0.098 0.102 0.438 0.168 0.085 0.051 0.030 0.013 0.008 0.005 0.002 134 N 0.062 0.060 0.061 0.115 0.105 0.145 0.230 0.108 0.062 0.033 0.018 135 V 0.076 0.073 0.044 0.068 0.067 0.095 0.158 0.145 0.126 0.090 0.057 136 Y 0.073 0.081 0.100 0.154 0.129 0.123 0.122 0.076 0.064 0.044 0.032 137 S 0.067 0.087 0.101 0.164 0.151 0.138 0.128 0.065 0.050 0.031 0.019 138 T 0.017 0.025 0.022 0.081 0.090 0.111 0.175 0.137 0.143 0.115 0.084 139 M 0.004 0.006 0.008 0.022 0.030 0.050 0.123 0.138 0.206 0.210 0.204 140 F 0.003 0.008 0.016 0.047 0.064 0.085 0.164 0.157 0.173 0.154 0.129 141 I 0.001 0.003 0.010 0.021 0.032 0.048 0.119 0.142 0.203 0.216 0.205 142 C 0.001 0.002 0.006 0.014 0.022 0.037 0.108 0.141 0.216 0.229 0.226 143 W 0.001 0.003 0.006 0.019 0.032 0.049 0.135 0.163 0.209 0.207 0.177 144 A 0.001 0.002 0.005 0.015 0.025 0.044 0.120 0.137 0.216 0.215 0.221 145 A 0.001 0.002 0.004 0.013 0.026 0.049 0.144 0.155 0.223 0.203 0.181 146 Q 0.001 0.002 0.005 0.025 0.046 0.073 0.202 0.190 0.181 0.150 0.126 147 A 0.001 0.001 0.002 0.004 0.007 0.012 0.056 0.103 0.223 0.276 0.318 148 G 0.001 0.001 0.004 0.008 0.018 0.028 0.101 0.165 0.231 0.227 0.217 149 L 0.001 0.001 0.008 0.009 0.017 0.026 0.090 0.131 0.236 0.241 0.240 150 Y 0.002 0.003 0.018 0.025 0.045 0.072 0.182 0.158 0.193 0.159 0.143 151 Y 0.005 0.010 0.025 0.048 0.056 0.080 0.206 0.159 0.171 0.139 0.101 152 F 0.017 0.020 0.030 0.055 0.064 0.095 0.205 0.152 0.145 0.122 0.095 153 Y 0.069 0.074 0.052 0.117 0.107 0.120 0.184 0.103 0.081 0.054 0.040 154 G 0.226 0.170 0.073 0.150 0.114 0.084 0.080 0.046 0.031 0.017 0.009 155 I 0.145 0.070 0.029 0.073 0.086 0.102 0.152 0.104 0.100 0.075 0.065 156 P 0.373 0.221 0.072 0.152 0.084 0.044 0.030 0.011 0.008 0.003 0.002 157 K 0.177 0.094 0.071 0.149 0.116 0.094 0.122 0.063 0.052 0.038 0.023 158 Y 0.184 0.114 0.075 0.105 0.100 0.100 0.123 0.074 0.060 0.038 0.027 159 E 0.177 0.231 0.112 0.209 0.111 0.068 0.048 0.023 0.012 0.005 0.002 160 L 0.083 0.066 0.051 0.079 0.094 0.115 0.159 0.126 0.094 0.078 0.054 161 P 0.379 0.189 0.090 0.143 0.089 0.051 0.029 0.015 0.010 0.004 0.002 162 Q 0.230 0.127 0.099 0.166 0.121 0.093 0.072 0.037 0.030 0.016 0.007 163 K 0.039 0.040 0.038 0.066 0.083 0.112 0.173 0.126 0.128 0.109 0.087 164 L 0.035 0.066 0.052 0.144 0.116 0.132 0.181 0.110 0.081 0.051 0.032 165 S 0.026 0.036 0.064 0.100 0.099 0.117 0.158 0.130 0.106 0.097 0.067 166 G 0.052 0.061 0.058 0.108 0.106 0.118 0.151 0.122 0.102 0.073 0.048 167 V 0.047 0.053 0.035 0.108 0.100 0.099 0.136 0.119 0.131 0.102 0.070 168 Y 0.017 0.019 0.014 0.033 0.049 0.070 0.141 0.145 0.184 0.182 0.146 169 K 0.072 0.125 0.064 0.239 0.179 0.120 0.095 0.047 0.032 0.017 0.009 170 H 0.033 0.021 0.032 0.055 0.059 0.081 0.156 0.123 0.164 0.162 0.115 171 R 0.107 0.095 0.073 0.187 0.143 0.111 0.128 0.064 0.045 0.030 0.018 172 V 0.035 0.049 0.041 0.082 0.073 0.089 0.175 0.142 0.135 0.109 0.070 173 A 0.075 0.082 0.053 0.096 0.102 0.111 0.150 0.118 0.088 0.070 0.054 174 K 0.233 0.234 0.099 0.178 0.110 0.064 0.040 0.019 0.013 0.006 0.003 175 D 0.251 0.166 0.068 0.148 0.123 0.090 0.068 0.037 0.028 0.015 0.007 176 S 0.179 0.078 0.030 0.101 0.113 0.118 0.142 0.091 0.078 0.044 0.027 177 V 0.132 0.084 0.075 0.142 0.115 0.107 0.123 0.080 0.071 0.043 0.027 178 L 0.017 0.038 0.056 0.113 0.103 0.102 0.165 0.129 0.111 0.094 0.072 179 F 0.008 0.010 0.020 0.023 0.034 0.055 0.136 0.154 0.186 0.194 0.180 180 R 0.088 0.101 0.101 0.214 0.151 0.113 0.103 0.054 0.038 0.023 0.015 181 G 0.169 0.157 0.112 0.157 0.127 0.096 0.074 0.047 0.035 0.019 0.008 182 H 0.059 0.043 0.014 0.049 0.059 0.082 0.157 0.151 0.157 0.125 0.104 183 D 0.267 0.197 0.058 0.141 0.111 0.083 0.062 0.035 0.027 0.013 0.007 184 D 0.126 0.118 0.100 0.186 0.134 0.102 0.095 0.051 0.042 0.029 0.017 185 F 0.083 0.078 0.058 0.122 0.129 0.131 0.145 0.093 0.075 0.051 0.034 186 F 0.018 0.020 0.019 0.050 0.060 0.091 0.172 0.149 0.174 0.142 0.105 187 W 0.030 0.053 0.067 0.153 0.133 0.125 0.147 0.103 0.080 0.063 0.045 188 A 0.005 0.008 0.014 0.028 0.039 0.063 0.137 0.144 0.189 0.199 0.174 189 P 0.020 0.029 0.033 0.075 0.080 0.092 0.149 0.137 0.153 0.129 0.103 190 H 0.018 0.021 0.021 0.071 0.082 0.099 0.175 0.145 0.152 0.126 0.090 191 S 0.033 0.031 0.035 0.066 0.071 0.079 0.134 0.123 0.157 0.144 0.127 192 R 0.030 0.065 0.029 0.113 0.104 0.109 0.174 0.128 0.114 0.080 0.056 193 Y 0.022 0.031 0.022 0.061 0.075 0.096 0.167 0.138 0.154 0.131 0.102 194 T 0.156 0.079 0.081 0.176 0.139 0.105 0.123 0.053 0.044 0.028 0.016 195 E 0.255 0.135 0.108 0.221 0.123 0.065 0.048 0.023 0.013 0.006 0.002 196 V 0.007 0.009 0.007 0.012 0.018 0.039 0.126 0.160 0.211 0.208 0.202 197 K 0.056 0.240 0.075 0.171 0.135 0.110 0.105 0.057 0.029 0.014 0.008 198 K 0.128 0.111 0.136 0.240 0.185 0.104 0.057 0.020 0.011 0.006 0.002 199 E 0.634 0.085 0.136 0.071 0.038 0.019 0.010 0.004 0.002 0.001 0.001 200 D 0.082 0.106 0.034 0.205 0.155 0.136 0.164 0.074 0.031 0.010 0.003 201 I 0.002 0.001 0.005 0.003 0.006 0.015 0.074 0.128 0.230 0.273 0.263 202 D 0.057 0.098 0.376 0.275 0.120 0.046 0.020 0.004 0.002 0.001 0.001 203 K 0.077 0.165 0.433 0.172 0.082 0.043 0.019 0.007 0.002 0.001 0.001 204 V 0.029 0.016 0.012 0.023 0.036 0.075 0.216 0.232 0.153 0.116 0.092 205 P 0.553 0.228 0.049 0.080 0.042 0.026 0.012 0.006 0.002 0.001 0.001 206 E 0.210 0.194 0.298 0.153 0.089 0.033 0.011 0.006 0.004 0.001 0.001 207 L 0.016 0.013 0.018 0.032 0.058 0.125 0.261 0.167 0.131 0.093 0.085 208 E 0.068 0.082 0.123 0.230 0.166 0.130 0.105 0.046 0.032 0.012 0.005 209 I 0.005 0.013 0.117 0.118 0.092 0.111 0.209 0.128 0.086 0.079 0.043 210 L 0.004 0.006 0.041 0.031 0.037 0.059 0.159 0.171 0.181 0.175 0.136 211 A 0.013 0.016 0.054 0.053 0.063 0.099 0.190 0.171 0.160 0.118 0.064 212 E 0.061 0.146 0.218 0.219 0.143 0.092 0.063 0.031 0.016 0.008 0.004 213 S 0.097 0.077 0.056 0.084 0.094 0.128 0.181 0.114 0.089 0.052 0.029 214 D 0.375 0.199 0.068 0.145 0.084 0.052 0.039 0.018 0.012 0.006 0.003 215 E 0.304 0.199 0.105 0.164 0.102 0.063 0.036 0.015 0.008 0.003 0.001 216 A 0.029 0.032 0.029 0.058 0.077 0.117 0.191 0.153 0.132 0.103 0.079 217 G 0.036 0.071 0.064 0.146 0.147 0.164 0.159 0.094 0.067 0.033 0.019 218 V 0.006 0.010 0.037 0.070 0.081 0.108 0.183 0.147 0.148 0.125 0.084 219 Y 0.003 0.005 0.019 0.037 0.054 0.076 0.185 0.181 0.168 0.149 0.122 220 V 0.002 0.003 0.013 0.022 0.025 0.032 0.105 0.145 0.235 0.228 0.189 221 V 0.003 0.004 0.027 0.020 0.029 0.040 0.110 0.139 0.215 0.225 0.187 222 A 0.020 0.042 0.097 0.124 0.137 0.142 0.187 0.102 0.078 0.045 0.026 223 N 0.071 0.102 0.108 0.152 0.124 0.129 0.152 0.075 0.049 0.026 0.012 224 K 0.243 0.156 0.079 0.137 0.101 0.091 0.094 0.048 0.028 0.015 0.007 225 S 0.369 0.205 0.077 0.123 0.079 0.061 0.046 0.021 0.012 0.005 0.002 226 E 0.195 0.153 0.103 0.153 0.127 0.101 0.082 0.038 0.026 0.014 0.007 227 R 0.068 0.072 0.073 0.131 0.135 0.151 0.167 0.080 0.063 0.037 0.022 228 Q 0.037 0.047 0.099 0.172 0.144 0.144 0.157 0.081 0.061 0.037 0.021 229 I 0.003 0.005 0.019 0.035 0.047 0.078 0.194 0.172 0.159 0.163 0.125 230 F 0.002 0.005 0.017 0.028 0.035 0.049 0.116 0.157 0.200 0.207 0.185 231 V 0.001 0.002 0.010 0.011 0.016 0.029 0.083 0.128 0.225 0.257 0.237 232 T 0.010 0.021 0.043 0.087 0.118 0.132 0.175 0.139 0.120 0.089 0.066 233 G 0.007 0.012 0.014 0.030 0.039 0.062 0.138 0.151 0.211 0.185 0.150 234 H 0.025 0.028 0.016 0.059 0.070 0.090 0.164 0.147 0.161 0.128 0.112 235 P 0.085 0.063 0.050 0.104 0.092 0.095 0.147 0.095 0.114 0.087 0.068 236 E 0.090 0.091 0.057 0.173 0.136 0.114 0.142 0.071 0.058 0.041 0.029 237 Y 0.046 0.048 0.030 0.069 0.071 0.090 0.177 0.126 0.136 0.114 0.093 238 D 0.089 0.136 0.067 0.167 0.124 0.107 0.125 0.071 0.055 0.037 0.023 239 R 0.145 0.100 0.088 0.174 0.155 0.124 0.106 0.047 0.034 0.018 0.008 240 Y 0.272 0.082 0.117 0.126 0.092 0.081 0.091 0.050 0.046 0.029 0.016 241 T 0.073 0.113 0.069 0.200 0.146 0.127 0.147 0.063 0.035 0.017 0.009 242 L 0.007 0.015 0.023 0.020 0.025 0.044 0.127 0.161 0.203 0.209 0.167 243 R 0.066 0.099 0.112 0.215 0.192 0.142 0.099 0.040 0.019 0.010 0.005 244 D 0.280 0.123 0.281 0.144 0.083 0.047 0.021 0.010 0.007 0.003 0.001 245 E 0.046 0.039 0.046 0.111 0.117 0.143 0.216 0.117 0.085 0.050 0.029 246 Y 0.011 0.016 0.024 0.030 0.034 0.063 0.182 0.161 0.208 0.159 0.112 247 Y 0.017 0.035 0.192 0.173 0.142 0.125 0.145 0.064 0.047 0.039 0.021 248 R 0.033 0.056 0.290 0.175 0.128 0.121 0.109 0.044 0.023 0.014 0.006 249 D 0.039 0.045 0.085 0.110 0.093 0.111 0.185 0.128 0.099 0.069 0.037 250 I 0.040 0.037 0.026 0.061 0.071 0.105 0.219 0.161 0.130 0.093 0.058 251 G 0.190 0.131 0.180 0.166 0.118 0.072 0.055 0.032 0.029 0.018 0.010 252 R 0.100 0.094 0.077 0.179 0.142 0.121 0.147 0.061 0.039 0.025 0.014 253 N 0.208 0.145 0.079 0.131 0.110 0.080 0.082 0.065 0.050 0.032 0.017 254 L 0.059 0.044 0.018 0.056 0.068 0.095 0.177 0.154 0.137 0.107 0.086 255 K 0.365 0.269 0.094 0.133 0.080 0.033 0.012 0.008 0.005 0.002 0.001 256 V 0.069 0.038 0.017 0.047 0.067 0.096 0.153 0.145 0.149 0.121 0.098 257 P 0.363 0.291 0.048 0.130 0.079 0.040 0.022 0.013 0.008 0.003 0.002 258 I 0.056 0.057 0.018 0.082 0.083 0.094 0.156 0.131 0.130 0.110 0.083 259 P 0.221 0.171 0.059 0.142 0.122 0.087 0.070 0.048 0.037 0.025 0.018 260 A 0.172 0.130 0.060 0.209 0.143 0.100 0.079 0.041 0.035 0.019 0.010 261 N 0.090 0.060 0.043 0.094 0.104 0.107 0.140 0.110 0.105 0.090 0.058 262 Y 0.056 0.061 0.028 0.098 0.092 0.098 0.153 0.140 0.119 0.089 0.068 263 F 0.056 0.066 0.037 0.081 0.086 0.097 0.136 0.140 0.124 0.099 0.076 264 P 0.162 0.144 0.068 0.151 0.123 0.092 0.085 0.060 0.051 0.036 0.028 265 N 0.324 0.166 0.048 0.136 0.106 0.072 0.060 0.033 0.029 0.017 0.010 266 D 0.322 0.153 0.032 0.117 0.100 0.075 0.073 0.047 0.041 0.025 0.015 267 D 0.255 0.158 0.036 0.116 0.095 0.082 0.092 0.063 0.050 0.031 0.022 268 P 0.201 0.173 0.053 0.145 0.112 0.086 0.084 0.058 0.043 0.027 0.018 269 T 0.224 0.154 0.080 0.135 0.114 0.087 0.075 0.048 0.041 0.025 0.017 270 K 0.239 0.160 0.064 0.167 0.124 0.088 0.073 0.038 0.026 0.014 0.008 271 T 0.212 0.131 0.060 0.145 0.120 0.098 0.090 0.060 0.044 0.026 0.014 272 P 0.077 0.086 0.044 0.092 0.094 0.107 0.141 0.121 0.111 0.076 0.052 273 I 0.100 0.125 0.074 0.176 0.152 0.124 0.105 0.065 0.044 0.023 0.012 274 L 0.077 0.046 0.059 0.087 0.091 0.109 0.147 0.115 0.115 0.092 0.062 275 T 0.116 0.143 0.094 0.226 0.158 0.112 0.083 0.035 0.020 0.009 0.005 276 W 0.020 0.026 0.033 0.051 0.046 0.064 0.144 0.135 0.183 0.174 0.124 277 W 0.045 0.049 0.048 0.102 0.120 0.141 0.187 0.119 0.085 0.062 0.042 278 S 0.135 0.157 0.185 0.216 0.117 0.080 0.054 0.027 0.017 0.008 0.003 279 H 0.033 0.053 0.055 0.106 0.120 0.143 0.183 0.118 0.088 0.063 0.037 280 A 0.033 0.034 0.031 0.060 0.069 0.105 0.176 0.135 0.168 0.113 0.076 281 H 0.047 0.048 0.103 0.194 0.160 0.143 0.147 0.063 0.050 0.030 0.015 282 L 0.011 0.020 0.061 0.100 0.104 0.130 0.227 0.139 0.092 0.073 0.044 283 F 0.002 0.004 0.015 0.019 0.020 0.031 0.102 0.136 0.209 0.235 0.227 284 F 0.003 0.007 0.019 0.023 0.038 0.068 0.154 0.177 0.200 0.182 0.129 285 S 0.024 0.045 0.127 0.169 0.182 0.166 0.127 0.066 0.052 0.028 0.014 286 N 0.016 0.019 0.036 0.076 0.090 0.134 0.232 0.144 0.124 0.082 0.048 287 W 0.010 0.016 0.019 0.059 0.058 0.070 0.171 0.160 0.173 0.151 0.112 288 L 0.002 0.003 0.007 0.009 0.013 0.027 0.094 0.126 0.220 0.254 0.244 289 N 0.008 0.028 0.073 0.125 0.167 0.182 0.186 0.098 0.067 0.041 0.025 290 Y 0.006 0.013 0.040 0.071 0.082 0.120 0.208 0.146 0.144 0.106 0.064 291 C 0.009 0.010 0.022 0.052 0.065 0.085 0.195 0.168 0.168 0.134 0.092 292 I 0.003 0.005 0.011 0.020 0.024 0.037 0.124 0.155 0.223 0.222 0.176 293 Y 0.003 0.007 0.032 0.036 0.053 0.070 0.154 0.136 0.179 0.176 0.154 294 Q 0.011 0.020 0.073 0.099 0.102 0.121 0.220 0.116 0.104 0.084 0.050 295 K 0.032 0.051 0.098 0.173 0.150 0.141 0.163 0.081 0.055 0.037 0.018 296 T 0.018 0.024 0.022 0.042 0.046 0.080 0.207 0.174 0.168 0.135 0.084 297 P 0.131 0.115 0.062 0.156 0.141 0.114 0.114 0.077 0.047 0.028 0.014 298 Y 0.103 0.064 0.056 0.072 0.083 0.100 0.141 0.119 0.114 0.087 0.061 299 R 0.192 0.295 0.076 0.209 0.119 0.056 0.029 0.014 0.006 0.002 0.001 300 L 0.024 0.014 0.009 0.025 0.037 0.063 0.161 0.135 0.186 0.181 0.165 301 E 0.334 0.177 0.113 0.199 0.094 0.041 0.025 0.008 0.005 0.003 0.001 302 D 0.113 0.142 0.111 0.249 0.143 0.093 0.080 0.038 0.019 0.010 0.003 303 I 0.015 0.013 0.011 0.014 0.025 0.055 0.137 0.199 0.203 0.181 0.146 304 H 0.223 0.241 0.102 0.207 0.110 0.062 0.031 0.014 0.007 0.003 0.001