# TARGET T0314 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0314.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2.48375 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.012 0.024 0.051 0.090 0.164 0.121 0.132 0.406 2 S 0.014 0.040 0.053 0.068 0.169 0.111 0.155 0.390 3 I 0.017 0.081 0.052 0.096 0.093 0.125 0.078 0.457 4 T 0.049 0.496 0.036 0.029 0.044 0.047 0.104 0.196 5 S 0.041 0.772 0.009 0.007 0.009 0.016 0.086 0.060 6 T 0.019 0.835 0.012 0.005 0.006 0.016 0.043 0.064 7 D 0.019 0.897 0.009 0.004 0.004 0.010 0.024 0.034 8 I 0.023 0.888 0.007 0.001 0.002 0.008 0.043 0.028 9 C 0.042 0.750 0.015 0.003 0.003 0.011 0.135 0.041 10 Q 0.029 0.845 0.008 0.002 0.002 0.011 0.045 0.058 11 A 0.048 0.708 0.008 0.002 0.002 0.013 0.106 0.112 12 A 0.111 0.448 0.027 0.006 0.006 0.039 0.202 0.161 13 D 0.058 0.237 0.020 0.009 0.008 0.068 0.215 0.385 14 A 0.118 0.187 0.027 0.004 0.005 0.082 0.074 0.502 15 L 0.150 0.173 0.024 0.008 0.011 0.124 0.088 0.424 16 K 0.023 0.052 0.045 0.009 0.016 0.116 0.061 0.679 17 G 0.067 0.077 0.191 0.020 0.046 0.117 0.113 0.370 18 F 0.053 0.029 0.161 0.063 0.063 0.106 0.146 0.378 19 V 0.029 0.015 0.250 0.099 0.110 0.086 0.064 0.347 20 G 0.030 0.010 0.096 0.078 0.161 0.092 0.063 0.469 21 F 0.019 0.002 0.064 0.107 0.138 0.094 0.112 0.465 22 N 0.051 0.004 0.041 0.097 0.149 0.095 0.151 0.412 23 R 0.124 0.002 0.018 0.029 0.066 0.100 0.046 0.614 24 K 0.049 0.002 0.028 0.045 0.098 0.133 0.035 0.610 25 T 0.010 0.002 0.038 0.030 0.111 0.111 0.024 0.674 26 G 0.008 0.002 0.073 0.122 0.401 0.085 0.034 0.274 27 R 0.001 0.001 0.090 0.266 0.419 0.026 0.033 0.165 28 Y 0.001 0.001 0.172 0.404 0.370 0.007 0.014 0.032 29 I 0.001 0.001 0.169 0.333 0.427 0.006 0.021 0.043 30 V 0.001 0.001 0.229 0.354 0.323 0.012 0.015 0.064 31 R 0.004 0.003 0.227 0.287 0.375 0.023 0.016 0.064 32 F 0.026 0.011 0.111 0.145 0.157 0.083 0.073 0.394 33 S 0.169 0.101 0.060 0.068 0.070 0.069 0.272 0.191 34 E 0.124 0.071 0.042 0.019 0.034 0.138 0.093 0.479 35 D 0.270 0.078 0.014 0.013 0.023 0.096 0.053 0.453 36 S 0.069 0.048 0.014 0.012 0.019 0.106 0.117 0.614 37 F 0.025 0.074 0.036 0.018 0.054 0.207 0.075 0.511 38 G 0.054 0.118 0.044 0.029 0.067 0.145 0.098 0.446 39 M 0.063 0.096 0.074 0.069 0.049 0.115 0.117 0.417 40 D 0.190 0.151 0.098 0.030 0.060 0.091 0.116 0.265 41 V 0.070 0.045 0.103 0.029 0.040 0.138 0.173 0.401 42 A 0.075 0.026 0.096 0.016 0.026 0.114 0.142 0.504 43 D 0.276 0.026 0.023 0.014 0.023 0.086 0.142 0.411 44 D 0.026 0.010 0.024 0.013 0.028 0.143 0.046 0.710 45 S 0.011 0.007 0.062 0.022 0.072 0.131 0.067 0.628 46 I 0.020 0.006 0.038 0.053 0.065 0.143 0.060 0.616 47 T 0.033 0.012 0.074 0.059 0.063 0.168 0.059 0.531 48 P 0.053 0.042 0.041 0.021 0.033 0.136 0.047 0.628 49 T 0.190 0.128 0.026 0.018 0.028 0.100 0.062 0.448 50 S 0.101 0.141 0.032 0.028 0.047 0.089 0.095 0.466 51 E 0.027 0.065 0.081 0.070 0.204 0.101 0.127 0.326 52 F 0.022 0.030 0.063 0.119 0.209 0.081 0.161 0.315 53 V 0.019 0.046 0.067 0.237 0.239 0.075 0.072 0.247 54 W 0.025 0.037 0.052 0.059 0.137 0.078 0.061 0.549 55 S 0.100 0.105 0.034 0.110 0.094 0.096 0.122 0.338 56 S 0.083 0.116 0.019 0.025 0.030 0.115 0.043 0.568 57 V 0.114 0.336 0.009 0.010 0.017 0.076 0.036 0.401 58 R 0.084 0.604 0.004 0.007 0.011 0.035 0.042 0.213 59 D 0.044 0.611 0.008 0.010 0.014 0.034 0.070 0.209 60 D 0.032 0.724 0.008 0.018 0.020 0.024 0.058 0.116 61 V 0.063 0.501 0.025 0.021 0.028 0.045 0.142 0.175 62 M 0.053 0.628 0.015 0.021 0.023 0.032 0.079 0.149 63 R 0.049 0.621 0.008 0.010 0.016 0.035 0.040 0.221 64 L 0.017 0.492 0.018 0.011 0.011 0.048 0.154 0.249 65 G 0.026 0.878 0.002 0.003 0.004 0.007 0.053 0.028 66 R 0.040 0.835 0.003 0.002 0.002 0.010 0.056 0.052 67 E 0.003 0.910 0.003 0.005 0.006 0.008 0.021 0.044 68 Q 0.006 0.927 0.004 0.002 0.005 0.005 0.027 0.024 69 L 0.006 0.923 0.004 0.004 0.003 0.005 0.040 0.015 70 Q 0.010 0.848 0.030 0.008 0.007 0.006 0.067 0.023 71 I 0.054 0.760 0.025 0.007 0.007 0.018 0.069 0.060 72 L 0.067 0.239 0.125 0.014 0.014 0.030 0.436 0.075 73 L 0.129 0.360 0.022 0.007 0.009 0.039 0.185 0.247 74 E 0.051 0.124 0.016 0.004 0.006 0.059 0.176 0.565 75 Q 0.021 0.139 0.020 0.013 0.011 0.121 0.099 0.575 76 N 0.082 0.219 0.028 0.009 0.012 0.123 0.089 0.438 77 I 0.204 0.151 0.016 0.007 0.007 0.084 0.051 0.479 78 N 0.178 0.145 0.037 0.010 0.014 0.080 0.147 0.391 79 E 0.087 0.107 0.027 0.010 0.016 0.112 0.068 0.573 80 R 0.031 0.022 0.158 0.027 0.049 0.119 0.124 0.470 81 L 0.066 0.017 0.092 0.035 0.048 0.133 0.047 0.562 82 N 0.227 0.013 0.082 0.029 0.035 0.102 0.090 0.422 83 I 0.022 0.020 0.027 0.017 0.032 0.134 0.027 0.721 84 G 0.024 0.027 0.023 0.008 0.025 0.098 0.019 0.774 85 E 0.129 0.159 0.027 0.081 0.077 0.122 0.049 0.357 86 P 0.038 0.259 0.043 0.035 0.093 0.072 0.060 0.401 87 L 0.028 0.281 0.056 0.101 0.202 0.056 0.069 0.208 88 L 0.014 0.142 0.092 0.219 0.283 0.033 0.103 0.116 89 V 0.015 0.193 0.116 0.198 0.235 0.028 0.070 0.144 90 Y 0.032 0.096 0.153 0.219 0.285 0.025 0.093 0.096 91 L 0.045 0.020 0.215 0.209 0.149 0.034 0.157 0.171 92 R 0.181 0.042 0.040 0.080 0.096 0.046 0.094 0.422 93 R 0.199 0.013 0.012 0.012 0.016 0.059 0.025 0.663 94 Q 0.006 0.008 0.008 0.014 0.015 0.106 0.011 0.832 95 D 0.016 0.035 0.003 0.003 0.005 0.050 0.010 0.878 96 L 0.248 0.151 0.013 0.014 0.008 0.085 0.166 0.315 97 P 0.066 0.455 0.014 0.013 0.011 0.059 0.094 0.288 98 E 0.057 0.610 0.015 0.004 0.011 0.026 0.049 0.228 99 I 0.036 0.586 0.038 0.024 0.032 0.048 0.048 0.188 100 T 0.051 0.478 0.061 0.038 0.045 0.041 0.120 0.167 101 A 0.047 0.488 0.033 0.028 0.033 0.044 0.099 0.227 102 Q 0.111 0.244 0.074 0.035 0.059 0.060 0.153 0.264 103 R 0.106 0.089 0.030 0.064 0.055 0.081 0.130 0.445 104 Q 0.059 0.041 0.023 0.025 0.041 0.089 0.095 0.627 105 L 0.046 0.032 0.017 0.030 0.043 0.099 0.081 0.653 106 R 0.059 0.027 0.015 0.034 0.046 0.107 0.061 0.652