# TARGET T0313 # Using neural net t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0313.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 90.4103 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 N 0.420 0.216 0.094 0.170 0.067 0.021 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 2 I 0.001 0.001 0.001 0.005 0.011 0.023 0.096 0.159 0.274 0.243 0.187 3 R 0.006 0.081 0.054 0.323 0.288 0.159 0.065 0.014 0.006 0.002 0.001 4 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.046 0.128 0.260 0.304 0.249 5 I 0.001 0.005 0.007 0.069 0.132 0.181 0.271 0.150 0.095 0.053 0.036 6 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.005 0.026 0.085 0.219 0.324 0.335 7 R 0.003 0.008 0.005 0.086 0.142 0.154 0.228 0.163 0.127 0.061 0.024 8 V 0.002 0.006 0.004 0.020 0.028 0.044 0.105 0.173 0.253 0.227 0.138 9 R 0.009 0.035 0.020 0.171 0.205 0.184 0.192 0.094 0.058 0.024 0.008 10 P 0.027 0.057 0.025 0.120 0.132 0.132 0.172 0.135 0.109 0.063 0.030 11 V 0.042 0.046 0.023 0.123 0.147 0.139 0.173 0.123 0.098 0.062 0.025 12 T 0.099 0.180 0.055 0.176 0.152 0.117 0.108 0.054 0.035 0.016 0.007 13 K 0.387 0.200 0.075 0.168 0.083 0.041 0.026 0.010 0.006 0.003 0.001 14 E 0.490 0.221 0.070 0.110 0.052 0.027 0.016 0.006 0.004 0.002 0.001 15 D 0.121 0.091 0.048 0.119 0.095 0.095 0.134 0.096 0.091 0.066 0.042 16 G 0.263 0.161 0.054 0.126 0.096 0.083 0.088 0.048 0.040 0.026 0.016 17 E 0.340 0.216 0.105 0.139 0.076 0.049 0.036 0.016 0.012 0.007 0.004 18 G 0.270 0.131 0.058 0.128 0.103 0.089 0.083 0.047 0.041 0.030 0.019 19 P 0.356 0.202 0.057 0.136 0.084 0.057 0.045 0.024 0.020 0.012 0.007 20 E 0.289 0.144 0.066 0.143 0.115 0.088 0.073 0.036 0.026 0.014 0.006 21 A 0.128 0.115 0.073 0.164 0.138 0.109 0.108 0.064 0.054 0.031 0.017 22 T 0.057 0.067 0.043 0.128 0.132 0.139 0.166 0.105 0.086 0.051 0.025 23 N 0.037 0.051 0.043 0.123 0.134 0.137 0.174 0.114 0.095 0.060 0.033 24 A 0.017 0.020 0.021 0.052 0.064 0.083 0.161 0.151 0.175 0.148 0.107 25 V 0.029 0.065 0.061 0.170 0.169 0.137 0.156 0.084 0.066 0.040 0.023 26 T 0.021 0.032 0.024 0.085 0.094 0.104 0.172 0.147 0.149 0.106 0.066 27 F 0.039 0.044 0.030 0.108 0.135 0.142 0.187 0.120 0.098 0.062 0.034 28 D 0.213 0.222 0.080 0.194 0.114 0.069 0.053 0.024 0.017 0.009 0.005 29 A 0.327 0.135 0.058 0.141 0.102 0.077 0.070 0.035 0.026 0.018 0.011 30 D 0.430 0.243 0.072 0.115 0.058 0.031 0.022 0.010 0.009 0.006 0.004 31 D 0.084 0.131 0.061 0.174 0.141 0.122 0.122 0.069 0.053 0.030 0.014 32 D 0.102 0.082 0.048 0.129 0.124 0.121 0.147 0.090 0.079 0.051 0.027 33 S 0.041 0.052 0.048 0.114 0.114 0.122 0.175 0.118 0.108 0.068 0.040 34 I 0.013 0.015 0.021 0.059 0.069 0.094 0.174 0.152 0.175 0.139 0.089 35 I 0.017 0.025 0.042 0.092 0.114 0.126 0.183 0.134 0.128 0.090 0.049 36 H 0.038 0.082 0.111 0.176 0.153 0.125 0.138 0.078 0.058 0.028 0.012 37 L 0.025 0.024 0.025 0.055 0.067 0.098 0.176 0.156 0.168 0.128 0.077 38 L 0.044 0.062 0.050 0.136 0.138 0.135 0.182 0.104 0.083 0.045 0.022 39 H 0.186 0.163 0.116 0.160 0.108 0.081 0.078 0.042 0.035 0.020 0.010 40 K 0.262 0.154 0.076 0.161 0.107 0.080 0.074 0.034 0.027 0.016 0.010 41 G 0.485 0.134 0.038 0.080 0.057 0.050 0.052 0.034 0.031 0.023 0.016 42 K 0.209 0.178 0.060 0.179 0.129 0.092 0.077 0.035 0.023 0.012 0.007 43 P 0.202 0.165 0.070 0.171 0.123 0.087 0.075 0.043 0.034 0.020 0.011 44 V 0.053 0.055 0.031 0.120 0.144 0.159 0.189 0.106 0.079 0.043 0.020 45 S 0.050 0.102 0.067 0.269 0.221 0.131 0.089 0.035 0.022 0.010 0.005 46 F 0.002 0.003 0.003 0.011 0.020 0.037 0.116 0.172 0.252 0.229 0.156 47 E 0.028 0.104 0.082 0.310 0.235 0.120 0.076 0.026 0.012 0.005 0.002 48 L 0.003 0.003 0.003 0.009 0.012 0.021 0.079 0.144 0.251 0.254 0.222 49 D 0.025 0.056 0.049 0.231 0.207 0.166 0.146 0.059 0.036 0.016 0.008 50 K 0.033 0.080 0.060 0.195 0.180 0.143 0.153 0.073 0.050 0.024 0.009 51 V 0.008 0.011 0.009 0.035 0.042 0.058 0.133 0.157 0.223 0.190 0.134 52 F 0.014 0.026 0.021 0.063 0.088 0.115 0.216 0.155 0.139 0.094 0.069 53 S 0.071 0.209 0.081 0.231 0.155 0.097 0.081 0.036 0.023 0.011 0.005 54 P 0.359 0.138 0.058 0.135 0.106 0.081 0.067 0.027 0.017 0.009 0.004 55 Q 0.552 0.184 0.044 0.107 0.056 0.029 0.017 0.006 0.003 0.002 0.001 56 A 0.072 0.044 0.019 0.061 0.072 0.097 0.191 0.162 0.143 0.089 0.049 57 S 0.081 0.491 0.087 0.159 0.080 0.045 0.028 0.012 0.009 0.005 0.003 58 Q 0.012 0.015 0.015 0.056 0.129 0.204 0.256 0.145 0.097 0.050 0.021 59 Q 0.280 0.148 0.111 0.185 0.128 0.075 0.049 0.012 0.008 0.003 0.001 60 D 0.022 0.073 0.124 0.433 0.201 0.092 0.042 0.009 0.003 0.001 0.001 61 V 0.001 0.002 0.007 0.009 0.011 0.018 0.080 0.133 0.251 0.262 0.226 62 F 0.001 0.002 0.015 0.022 0.061 0.169 0.342 0.183 0.124 0.059 0.023 63 Q 0.021 0.051 0.670 0.196 0.045 0.011 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 64 E 0.012 0.040 0.080 0.137 0.197 0.254 0.215 0.043 0.016 0.005 0.002 65 V 0.001 0.001 0.003 0.005 0.006 0.016 0.094 0.147 0.263 0.269 0.195 66 Q 0.080 0.092 0.101 0.205 0.207 0.179 0.106 0.019 0.008 0.003 0.001 67 A 0.187 0.152 0.474 0.127 0.036 0.015 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 68 L 0.002 0.004 0.011 0.022 0.048 0.130 0.326 0.176 0.150 0.089 0.041 69 V 0.001 0.003 0.007 0.008 0.008 0.018 0.102 0.130 0.217 0.248 0.258 70 T 0.016 0.054 0.288 0.300 0.203 0.090 0.031 0.009 0.005 0.003 0.001 71 S 0.051 0.087 0.229 0.159 0.144 0.141 0.107 0.038 0.023 0.012 0.008 72 C 0.004 0.006 0.009 0.021 0.018 0.031 0.127 0.148 0.223 0.220 0.193 73 I 0.013 0.018 0.023 0.033 0.039 0.079 0.193 0.143 0.166 0.156 0.136 74 D 0.094 0.193 0.324 0.232 0.086 0.036 0.019 0.006 0.004 0.003 0.002 75 G 0.101 0.096 0.103 0.143 0.129 0.134 0.147 0.063 0.044 0.026 0.014 76 F 0.016 0.033 0.020 0.087 0.096 0.123 0.225 0.143 0.134 0.083 0.041 77 N 0.015 0.037 0.030 0.104 0.154 0.176 0.200 0.108 0.090 0.053 0.034 78 V 0.003 0.003 0.006 0.012 0.020 0.033 0.102 0.163 0.250 0.212 0.196 79 C 0.003 0.005 0.006 0.024 0.028 0.052 0.166 0.181 0.214 0.179 0.143 80 I 0.001 0.001 0.002 0.004 0.003 0.006 0.038 0.105 0.239 0.318 0.282 81 F 0.001 0.001 0.003 0.007 0.011 0.022 0.084 0.137 0.225 0.225 0.284 82 A 0.001 0.001 0.002 0.003 0.004 0.008 0.036 0.085 0.198 0.295 0.366 83 Y 0.001 0.003 0.003 0.024 0.044 0.084 0.208 0.200 0.213 0.149 0.071 84 G 0.012 0.020 0.014 0.035 0.041 0.067 0.135 0.162 0.181 0.166 0.168 85 Q 0.034 0.039 0.029 0.082 0.104 0.123 0.169 0.116 0.114 0.099 0.091 86 T 0.023 0.044 0.026 0.097 0.086 0.087 0.137 0.121 0.135 0.124 0.120 87 G 0.112 0.053 0.023 0.098 0.116 0.137 0.160 0.093 0.093 0.071 0.043 88 A 0.087 0.062 0.026 0.075 0.056 0.057 0.090 0.088 0.129 0.138 0.192 89 G 0.097 0.055 0.022 0.076 0.081 0.092 0.136 0.113 0.129 0.114 0.086 90 K 0.033 0.047 0.020 0.091 0.109 0.117 0.148 0.111 0.125 0.097 0.103 91 T 0.008 0.025 0.014 0.060 0.057 0.060 0.103 0.117 0.160 0.184 0.212 92 Y 0.005 0.009 0.010 0.041 0.068 0.106 0.192 0.162 0.175 0.135 0.097 93 T 0.012 0.025 0.023 0.092 0.088 0.080 0.133 0.135 0.153 0.132 0.128 94 M 0.003 0.003 0.002 0.010 0.017 0.029 0.076 0.113 0.209 0.271 0.267 95 E 0.013 0.052 0.038 0.225 0.208 0.159 0.153 0.070 0.049 0.022 0.012 96 G 0.019 0.018 0.008 0.032 0.047 0.073 0.153 0.159 0.187 0.168 0.135 97 T 0.066 0.208 0.095 0.286 0.154 0.083 0.057 0.020 0.015 0.008 0.007 98 A 0.131 0.109 0.048 0.168 0.163 0.125 0.115 0.055 0.039 0.028 0.019 99 E 0.505 0.217 0.065 0.130 0.048 0.018 0.009 0.003 0.002 0.002 0.001 100 N 0.076 0.112 0.044 0.180 0.184 0.153 0.126 0.058 0.036 0.020 0.011 101 P 0.050 0.078 0.040 0.145 0.161 0.163 0.160 0.080 0.060 0.039 0.023 102 G 0.051 0.051 0.028 0.103 0.115 0.130 0.179 0.122 0.103 0.068 0.050 103 I 0.003 0.005 0.005 0.014 0.021 0.032 0.095 0.126 0.221 0.232 0.246 104 N 0.003 0.007 0.005 0.025 0.049 0.085 0.173 0.177 0.203 0.159 0.114 105 Q 0.041 0.038 0.043 0.107 0.133 0.162 0.198 0.105 0.092 0.054 0.029 106 R 0.020 0.027 0.033 0.108 0.133 0.175 0.238 0.131 0.075 0.039 0.019 107 A 0.001 0.001 0.005 0.009 0.009 0.014 0.062 0.110 0.258 0.280 0.251 108 L 0.001 0.001 0.004 0.006 0.008 0.018 0.085 0.122 0.223 0.274 0.258 109 Q 0.005 0.017 0.246 0.262 0.225 0.129 0.072 0.023 0.013 0.005 0.002 110 L 0.001 0.005 0.028 0.053 0.107 0.215 0.352 0.141 0.064 0.026 0.009 111 L 0.001 0.001 0.002 0.002 0.002 0.003 0.025 0.065 0.223 0.342 0.337 112 F 0.001 0.001 0.004 0.007 0.023 0.092 0.324 0.215 0.178 0.108 0.049 113 S 0.008 0.029 0.618 0.238 0.072 0.022 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 114 E 0.002 0.008 0.025 0.040 0.087 0.211 0.403 0.134 0.061 0.023 0.006 115 V 0.001 0.001 0.007 0.006 0.007 0.015 0.079 0.125 0.251 0.283 0.224 116 Q 0.010 0.029 0.112 0.172 0.206 0.191 0.186 0.055 0.026 0.010 0.004 117 E 0.039 0.082 0.563 0.169 0.076 0.042 0.019 0.006 0.003 0.001 0.001 118 K 0.026 0.050 0.065 0.093 0.115 0.175 0.267 0.095 0.061 0.034 0.020 119 A 0.144 0.083 0.044 0.073 0.067 0.096 0.168 0.106 0.099 0.072 0.049 120 S 0.403 0.186 0.132 0.131 0.062 0.036 0.028 0.010 0.006 0.004 0.003 121 D 0.513 0.224 0.114 0.099 0.031 0.012 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 122 W 0.029 0.031 0.013 0.072 0.092 0.140 0.232 0.149 0.125 0.074 0.042 123 E 0.089 0.206 0.124 0.337 0.167 0.056 0.016 0.003 0.001 0.001 0.001 124 Y 0.001 0.002 0.004 0.014 0.032 0.072 0.219 0.227 0.224 0.140 0.065 125 T 0.009 0.050 0.060 0.353 0.299 0.145 0.061 0.015 0.006 0.002 0.001 126 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.053 0.137 0.278 0.296 0.222 127 T 0.005 0.027 0.030 0.245 0.300 0.192 0.131 0.042 0.020 0.006 0.003 128 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.008 0.044 0.116 0.265 0.310 0.246 129 S 0.007 0.020 0.022 0.145 0.195 0.181 0.218 0.112 0.067 0.024 0.009 130 A 0.005 0.008 0.005 0.021 0.028 0.051 0.150 0.189 0.236 0.189 0.117 131 A 0.009 0.014 0.014 0.055 0.056 0.071 0.153 0.157 0.203 0.170 0.098 132 E 0.006 0.013 0.015 0.057 0.075 0.120 0.221 0.175 0.153 0.101 0.064 133 I 0.009 0.018 0.035 0.049 0.039 0.042 0.102 0.140 0.206 0.207 0.154 134 Y 0.002 0.011 0.013 0.059 0.077 0.102 0.202 0.175 0.187 0.117 0.055 135 N 0.009 0.024 0.032 0.105 0.146 0.173 0.194 0.121 0.108 0.060 0.028 136 E 0.065 0.044 0.050 0.105 0.110 0.131 0.195 0.121 0.093 0.057 0.029 137 V 0.018 0.032 0.033 0.127 0.138 0.157 0.223 0.125 0.090 0.042 0.016 138 L 0.002 0.003 0.007 0.010 0.009 0.015 0.062 0.109 0.234 0.279 0.270 139 R 0.003 0.012 0.031 0.126 0.191 0.214 0.195 0.098 0.071 0.040 0.017 140 D 0.004 0.023 0.065 0.110 0.121 0.151 0.219 0.137 0.100 0.050 0.019 141 L 0.001 0.002 0.004 0.013 0.021 0.039 0.135 0.175 0.230 0.213 0.166 142 L 0.003 0.006 0.008 0.020 0.033 0.055 0.166 0.173 0.221 0.187 0.129 143 G 0.021 0.067 0.058 0.197 0.194 0.162 0.160 0.073 0.044 0.018 0.006 144 K 0.176 0.186 0.115 0.210 0.125 0.085 0.063 0.021 0.011 0.005 0.002 145 E 0.372 0.263 0.074 0.137 0.072 0.039 0.024 0.009 0.005 0.003 0.001 146 P 0.323 0.180 0.050 0.127 0.094 0.067 0.069 0.035 0.027 0.017 0.010 147 Q 0.480 0.219 0.048 0.108 0.058 0.036 0.025 0.011 0.009 0.004 0.002 148 E 0.310 0.205 0.097 0.175 0.092 0.056 0.037 0.013 0.008 0.004 0.003 149 K 0.180 0.152 0.074 0.168 0.128 0.103 0.086 0.046 0.034 0.018 0.010 150 L 0.096 0.059 0.049 0.114 0.125 0.156 0.188 0.096 0.068 0.034 0.015 151 E 0.108 0.172 0.165 0.289 0.148 0.069 0.034 0.008 0.004 0.002 0.001 152 I 0.001 0.002 0.004 0.010 0.017 0.037 0.129 0.174 0.247 0.229 0.150 153 R 0.036 0.128 0.097 0.307 0.215 0.115 0.066 0.020 0.010 0.004 0.002 154 L 0.001 0.002 0.003 0.006 0.011 0.021 0.081 0.131 0.242 0.271 0.231 155 C 0.007 0.033 0.032 0.168 0.203 0.181 0.198 0.089 0.052 0.025 0.012 156 P 0.081 0.083 0.046 0.137 0.139 0.127 0.154 0.089 0.073 0.046 0.026 157 D 0.072 0.096 0.045 0.213 0.166 0.127 0.127 0.065 0.045 0.027 0.016 158 G 0.313 0.111 0.043 0.116 0.101 0.086 0.086 0.048 0.040 0.031 0.026 159 S 0.410 0.272 0.062 0.136 0.053 0.029 0.020 0.008 0.005 0.003 0.002 160 G 0.335 0.147 0.071 0.144 0.103 0.074 0.059 0.028 0.021 0.013 0.007 161 Q 0.114 0.202 0.094 0.243 0.153 0.093 0.058 0.020 0.013 0.007 0.003 162 L 0.010 0.019 0.018 0.069 0.103 0.121 0.166 0.149 0.154 0.118 0.073 163 Y 0.010 0.048 0.047 0.175 0.196 0.171 0.178 0.078 0.052 0.028 0.017 164 V 0.009 0.011 0.012 0.040 0.064 0.085 0.172 0.173 0.186 0.140 0.107 165 P 0.364 0.144 0.076 0.180 0.103 0.054 0.045 0.017 0.010 0.005 0.003 166 G 0.350 0.178 0.054 0.177 0.111 0.062 0.041 0.014 0.008 0.004 0.002 167 L 0.005 0.004 0.002 0.011 0.014 0.024 0.069 0.111 0.219 0.264 0.277 168 T 0.087 0.239 0.096 0.249 0.147 0.088 0.055 0.019 0.011 0.005 0.003 169 E 0.021 0.056 0.066 0.150 0.157 0.149 0.175 0.101 0.071 0.035 0.018 170 F 0.023 0.021 0.014 0.062 0.102 0.142 0.212 0.141 0.135 0.084 0.063 171 Q 0.080 0.135 0.085 0.310 0.210 0.094 0.058 0.015 0.008 0.003 0.002 172 V 0.008 0.005 0.003 0.012 0.017 0.034 0.125 0.176 0.239 0.211 0.172 173 Q 0.128 0.232 0.105 0.263 0.151 0.065 0.037 0.012 0.005 0.002 0.001 174 S 0.022 0.582 0.068 0.159 0.067 0.039 0.032 0.014 0.010 0.005 0.002 175 V 0.042 0.029 0.023 0.133 0.271 0.265 0.151 0.049 0.024 0.009 0.003 176 D 0.846 0.105 0.026 0.018 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 177 D 0.001 0.012 0.032 0.216 0.227 0.227 0.201 0.062 0.017 0.004 0.001 178 I 0.001 0.001 0.002 0.003 0.005 0.012 0.065 0.124 0.241 0.279 0.269 179 N 0.003 0.009 0.159 0.222 0.242 0.231 0.108 0.018 0.007 0.002 0.001 180 K 0.001 0.018 0.433 0.287 0.140 0.076 0.033 0.007 0.004 0.001 0.001 181 V 0.001 0.001 0.006 0.005 0.007 0.018 0.095 0.133 0.249 0.268 0.217 182 F 0.001 0.001 0.009 0.008 0.013 0.032 0.176 0.213 0.250 0.197 0.101 183 E 0.004 0.025 0.593 0.212 0.102 0.040 0.017 0.004 0.002 0.001 0.001 184 F 0.005 0.027 0.113 0.119 0.168 0.237 0.229 0.060 0.028 0.011 0.003 185 G 0.022 0.020 0.023 0.022 0.019 0.034 0.123 0.141 0.237 0.220 0.140 186 H 0.057 0.071 0.060 0.107 0.120 0.157 0.210 0.096 0.066 0.038 0.019 187 T 0.130 0.149 0.318 0.193 0.097 0.053 0.033 0.013 0.009 0.004 0.002 188 N 0.179 0.134 0.088 0.153 0.124 0.112 0.107 0.046 0.032 0.017 0.009 189 R 0.070 0.040 0.031 0.059 0.060 0.087 0.153 0.132 0.150 0.128 0.090 190 T 0.061 0.130 0.127 0.168 0.144 0.116 0.113 0.059 0.045 0.025 0.012 191 T 0.100 0.101 0.143 0.147 0.119 0.106 0.109 0.064 0.059 0.035 0.015 192 E 0.226 0.125 0.087 0.157 0.114 0.094 0.095 0.045 0.032 0.017 0.008 193 F 0.131 0.072 0.061 0.101 0.087 0.090 0.132 0.099 0.098 0.075 0.054 194 T 0.089 0.105 0.098 0.136 0.113 0.102 0.123 0.081 0.074 0.049 0.028 195 N 0.252 0.209 0.156 0.163 0.094 0.059 0.036 0.014 0.010 0.005 0.002 196 L 0.123 0.100 0.083 0.116 0.101 0.105 0.130 0.082 0.076 0.052 0.032 197 N 0.180 0.130 0.066 0.117 0.101 0.090 0.105 0.069 0.064 0.045 0.031 198 E 0.281 0.150 0.090 0.171 0.113 0.075 0.057 0.025 0.020 0.011 0.007 199 H 0.188 0.146 0.087 0.148 0.117 0.097 0.091 0.048 0.039 0.024 0.014 200 S 0.147 0.103 0.066 0.119 0.099 0.098 0.112 0.075 0.078 0.057 0.044 201 S 0.106 0.108 0.057 0.115 0.109 0.112 0.140 0.087 0.079 0.053 0.034 202 R 0.060 0.060 0.049 0.115 0.137 0.149 0.166 0.101 0.087 0.051 0.026 203 S 0.042 0.037 0.025 0.080 0.094 0.122 0.197 0.133 0.128 0.088 0.053 204 H 0.021 0.026 0.027 0.098 0.113 0.140 0.180 0.126 0.123 0.092 0.053 205 A 0.004 0.006 0.010 0.023 0.022 0.033 0.119 0.161 0.253 0.225 0.142 206 L 0.003 0.010 0.028 0.090 0.083 0.093 0.128 0.131 0.163 0.165 0.107 207 L 0.001 0.002 0.006 0.011 0.015 0.025 0.109 0.192 0.294 0.237 0.109 208 I 0.001 0.011 0.028 0.185 0.214 0.192 0.178 0.096 0.057 0.026 0.011 209 V 0.001 0.001 0.002 0.003 0.004 0.008 0.047 0.129 0.288 0.337 0.180 210 T 0.003 0.019 0.026 0.287 0.321 0.182 0.114 0.034 0.012 0.002 0.001 211 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.009 0.041 0.110 0.270 0.328 0.233 212 R 0.006 0.041 0.038 0.355 0.304 0.149 0.078 0.019 0.007 0.001 0.001 213 G 0.042 0.067 0.021 0.064 0.073 0.106 0.197 0.174 0.146 0.079 0.030 214 V 0.040 0.103 0.069 0.280 0.200 0.122 0.099 0.046 0.025 0.011 0.004 215 D 0.301 0.297 0.058 0.170 0.095 0.043 0.024 0.007 0.004 0.001 0.001 216 C 0.052 0.041 0.018 0.096 0.104 0.118 0.180 0.149 0.122 0.081 0.040 217 S 0.337 0.273 0.059 0.133 0.078 0.048 0.036 0.015 0.011 0.005 0.003 218 T 0.441 0.217 0.059 0.139 0.064 0.037 0.025 0.009 0.005 0.003 0.001 219 G 0.612 0.152 0.037 0.076 0.045 0.029 0.021 0.010 0.008 0.005 0.003 220 L 0.117 0.127 0.057 0.159 0.127 0.120 0.116 0.062 0.054 0.035 0.027 221 R 0.074 0.113 0.069 0.229 0.190 0.137 0.096 0.043 0.028 0.015 0.007 222 T 0.040 0.055 0.056 0.140 0.144 0.146 0.165 0.099 0.079 0.048 0.030 223 T 0.029 0.055 0.057 0.217 0.205 0.151 0.139 0.064 0.043 0.025 0.015 224 G 0.017 0.018 0.013 0.045 0.063 0.089 0.192 0.193 0.189 0.123 0.059 225 K 0.023 0.052 0.051 0.256 0.277 0.169 0.110 0.035 0.018 0.007 0.003 226 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.027 0.076 0.219 0.307 0.360 227 N 0.004 0.018 0.021 0.130 0.181 0.184 0.232 0.123 0.070 0.025 0.012 228 L 0.002 0.003 0.002 0.005 0.005 0.010 0.052 0.131 0.251 0.272 0.267 229 V 0.003 0.004 0.005 0.014 0.019 0.033 0.101 0.144 0.225 0.239 0.213 230 D 0.003 0.006 0.007 0.022 0.028 0.050 0.148 0.170 0.226 0.189 0.153 231 L 0.004 0.007 0.006 0.016 0.017 0.026 0.080 0.124 0.203 0.248 0.268 232 A 0.004 0.007 0.005 0.019 0.029 0.050 0.130 0.161 0.221 0.206 0.169 233 G 0.013 0.028 0.015 0.071 0.094 0.124 0.172 0.128 0.139 0.118 0.098 234 S 0.016 0.029 0.019 0.071 0.092 0.108 0.155 0.132 0.135 0.127 0.116 235 E 0.028 0.021 0.015 0.056 0.078 0.103 0.163 0.138 0.153 0.132 0.111 236 R 0.041 0.060 0.041 0.116 0.122 0.118 0.139 0.097 0.101 0.085 0.079 237 V 0.014 0.014 0.013 0.051 0.069 0.092 0.134 0.124 0.180 0.177 0.132 238 G 0.142 0.138 0.071 0.179 0.133 0.110 0.095 0.049 0.039 0.025 0.018 239 K 0.196 0.139 0.108 0.193 0.116 0.084 0.073 0.035 0.026 0.017 0.012 240 S 0.157 0.146 0.052 0.106 0.081 0.074 0.106 0.077 0.077 0.067 0.059 241 G 0.389 0.213 0.058 0.138 0.086 0.050 0.031 0.013 0.011 0.007 0.005 242 A 0.131 0.080 0.033 0.060 0.050 0.054 0.092 0.088 0.139 0.134 0.139 243 E 0.170 0.355 0.100 0.180 0.093 0.048 0.029 0.012 0.007 0.003 0.002 244 G 0.405 0.130 0.058 0.129 0.101 0.070 0.053 0.024 0.017 0.009 0.005 245 S 0.366 0.199 0.079 0.140 0.081 0.050 0.040 0.018 0.014 0.008 0.005 246 R 0.016 0.029 0.035 0.097 0.118 0.158 0.199 0.135 0.115 0.067 0.031 247 L 0.026 0.028 0.045 0.085 0.113 0.151 0.223 0.130 0.107 0.061 0.031 248 R 0.073 0.084 0.360 0.214 0.126 0.070 0.045 0.015 0.008 0.003 0.001 249 E 0.006 0.015 0.052 0.085 0.098 0.136 0.231 0.136 0.123 0.076 0.042 250 A 0.007 0.006 0.020 0.022 0.024 0.044 0.136 0.148 0.201 0.213 0.180 251 Q 0.017 0.033 0.258 0.254 0.188 0.115 0.081 0.028 0.017 0.007 0.002 252 H 0.009 0.045 0.199 0.140 0.152 0.175 0.163 0.059 0.036 0.016 0.006 253 I 0.004 0.009 0.022 0.028 0.026 0.038 0.117 0.131 0.219 0.227 0.180 254 N 0.027 0.028 0.050 0.064 0.084 0.134 0.259 0.148 0.111 0.065 0.030 255 K 0.035 0.075 0.317 0.265 0.148 0.079 0.047 0.016 0.011 0.005 0.003 256 S 0.013 0.029 0.044 0.057 0.057 0.083 0.227 0.158 0.163 0.113 0.057 257 L 0.016 0.020 0.058 0.061 0.038 0.056 0.153 0.120 0.177 0.171 0.130 258 S 0.030 0.055 0.216 0.116 0.131 0.123 0.142 0.079 0.054 0.032 0.020 259 A 0.003 0.027 0.081 0.093 0.118 0.167 0.244 0.118 0.089 0.041 0.019 260 L 0.001 0.003 0.009 0.017 0.020 0.035 0.151 0.172 0.244 0.213 0.134 261 G 0.147 0.089 0.105 0.186 0.176 0.150 0.102 0.025 0.012 0.005 0.002 262 D 0.027 0.084 0.181 0.303 0.196 0.119 0.065 0.015 0.006 0.002 0.001 263 V 0.001 0.001 0.006 0.005 0.005 0.006 0.044 0.100 0.275 0.314 0.245 264 I 0.001 0.001 0.010 0.013 0.021 0.054 0.188 0.161 0.198 0.202 0.152 265 A 0.002 0.016 0.520 0.228 0.129 0.057 0.029 0.009 0.005 0.002 0.001 266 A 0.002 0.007 0.028 0.050 0.101 0.219 0.339 0.138 0.073 0.032 0.013 267 L 0.001 0.001 0.004 0.006 0.008 0.017 0.091 0.143 0.267 0.267 0.194 268 R 0.009 0.028 0.047 0.086 0.140 0.207 0.264 0.108 0.067 0.030 0.015 269 S 0.156 0.219 0.317 0.190 0.065 0.031 0.014 0.004 0.002 0.001 0.001 270 R 0.262 0.204 0.126 0.148 0.096 0.074 0.056 0.017 0.010 0.005 0.003 271 Q 0.429 0.186 0.059 0.113 0.074 0.054 0.043 0.017 0.012 0.007 0.004 272 G 0.561 0.184 0.051 0.093 0.052 0.029 0.017 0.007 0.004 0.002 0.001 273 H 0.022 0.057 0.031 0.120 0.148 0.185 0.203 0.104 0.073 0.038 0.017 274 V 0.019 0.027 0.014 0.044 0.058 0.085 0.142 0.140 0.177 0.157 0.137 275 P 0.162 0.123 0.054 0.142 0.120 0.098 0.108 0.063 0.053 0.039 0.038 276 F 0.078 0.052 0.032 0.090 0.104 0.114 0.169 0.121 0.114 0.078 0.048 277 R 0.084 0.074 0.032 0.127 0.119 0.118 0.160 0.104 0.089 0.058 0.036 278 N 0.151 0.121 0.056 0.210 0.171 0.125 0.089 0.035 0.023 0.012 0.007 279 S 0.026 0.039 0.037 0.065 0.072 0.104 0.185 0.158 0.154 0.101 0.059 280 K 0.064 0.105 0.089 0.202 0.159 0.135 0.131 0.056 0.034 0.016 0.008 281 L 0.003 0.005 0.004 0.015 0.016 0.025 0.102 0.146 0.255 0.242 0.187 282 T 0.008 0.025 0.042 0.124 0.140 0.159 0.193 0.105 0.099 0.065 0.041 283 Y 0.012 0.037 0.100 0.204 0.163 0.142 0.146 0.080 0.061 0.038 0.017 284 L 0.003 0.008 0.030 0.037 0.035 0.048 0.150 0.181 0.224 0.178 0.106 285 L 0.001 0.005 0.026 0.031 0.032 0.044 0.127 0.155 0.222 0.207 0.151 286 Q 0.004 0.019 0.087 0.195 0.251 0.196 0.142 0.056 0.032 0.013 0.005 287 D 0.025 0.063 0.118 0.200 0.178 0.166 0.142 0.057 0.032 0.015 0.005 288 S 0.016 0.028 0.031 0.066 0.059 0.081 0.186 0.163 0.173 0.126 0.070 289 L 0.051 0.034 0.024 0.037 0.035 0.053 0.115 0.105 0.146 0.172 0.227 290 S 0.176 0.213 0.094 0.183 0.109 0.071 0.063 0.034 0.027 0.018 0.012 291 G 0.304 0.143 0.063 0.146 0.093 0.084 0.075 0.036 0.028 0.017 0.010 292 D 0.322 0.200 0.061 0.153 0.099 0.065 0.047 0.019 0.015 0.010 0.008 293 S 0.040 0.039 0.020 0.066 0.073 0.086 0.142 0.128 0.164 0.137 0.105 294 K 0.018 0.043 0.035 0.128 0.186 0.188 0.178 0.091 0.074 0.038 0.021 295 T 0.002 0.004 0.005 0.019 0.026 0.039 0.115 0.164 0.234 0.209 0.183 296 L 0.001 0.003 0.004 0.019 0.036 0.066 0.175 0.205 0.214 0.166 0.112 297 M 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.010 0.059 0.135 0.257 0.268 0.261 298 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.009 0.047 0.101 0.206 0.287 0.341 299 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.010 0.054 0.123 0.251 0.297 0.256 300 Q 0.001 0.004 0.004 0.019 0.028 0.051 0.151 0.190 0.234 0.185 0.133 301 V 0.001 0.002 0.002 0.008 0.013 0.024 0.076 0.130 0.234 0.267 0.243 302 S 0.008 0.027 0.018 0.111 0.162 0.180 0.220 0.127 0.088 0.040 0.018 303 P 0.045 0.074 0.034 0.111 0.118 0.129 0.166 0.118 0.104 0.065 0.036 304 V 0.065 0.086 0.038 0.159 0.175 0.149 0.147 0.076 0.057 0.032 0.016 305 E 0.329 0.165 0.056 0.159 0.110 0.072 0.054 0.023 0.017 0.009 0.005 306 K 0.334 0.192 0.074 0.174 0.100 0.056 0.036 0.015 0.011 0.006 0.004 307 N 0.053 0.094 0.035 0.084 0.082 0.105 0.150 0.116 0.123 0.092 0.064 308 T 0.075 0.070 0.029 0.094 0.135 0.172 0.186 0.103 0.073 0.041 0.021 309 S 0.527 0.138 0.069 0.099 0.059 0.038 0.035 0.014 0.010 0.006 0.004 310 E 0.012 0.031 0.024 0.102 0.139 0.176 0.218 0.121 0.093 0.054 0.029 311 T 0.010 0.016 0.036 0.050 0.039 0.046 0.101 0.127 0.202 0.200 0.172 312 L 0.044 0.039 0.079 0.122 0.174 0.208 0.196 0.076 0.041 0.016 0.005 313 Y 0.014 0.051 0.171 0.230 0.184 0.161 0.121 0.040 0.019 0.006 0.002 314 S 0.001 0.002 0.012 0.016 0.020 0.033 0.126 0.152 0.235 0.229 0.175 315 L 0.005 0.005 0.046 0.024 0.026 0.052 0.192 0.169 0.193 0.172 0.116 316 K 0.005 0.022 0.401 0.325 0.156 0.060 0.022 0.005 0.002 0.001 0.001 317 F 0.001 0.007 0.066 0.051 0.074 0.138 0.287 0.150 0.127 0.069 0.030 318 A 0.001 0.003 0.039 0.021 0.020 0.030 0.125 0.144 0.216 0.227 0.174 319 E 0.047 0.050 0.371 0.148 0.112 0.108 0.106 0.033 0.017 0.007 0.003 320 R 0.007 0.037 0.300 0.244 0.184 0.132 0.067 0.017 0.008 0.003 0.001 321 V 0.014 0.030 0.088 0.041 0.034 0.050 0.136 0.110 0.183 0.180 0.132 322 R 0.111 0.069 0.076 0.093 0.094 0.119 0.167 0.097 0.085 0.058 0.033