# TARGET T0312 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0312.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 184 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.067 0.008 0.072 0.060 0.085 0.084 0.008 0.615 2 K 0.030 0.008 0.061 0.088 0.102 0.084 0.006 0.621 3 V 0.016 0.005 0.043 0.039 0.096 0.038 0.002 0.761 4 F 0.022 0.015 0.074 0.142 0.204 0.099 0.005 0.439 5 E 0.025 0.010 0.020 0.035 0.062 0.062 0.004 0.781 6 F 0.073 0.035 0.073 0.099 0.172 0.069 0.010 0.469 7 E 0.055 0.024 0.026 0.054 0.070 0.168 0.013 0.590 8 V 0.110 0.026 0.034 0.049 0.077 0.093 0.024 0.588 9 G 0.162 0.031 0.052 0.116 0.116 0.102 0.043 0.379 10 K 0.185 0.007 0.111 0.129 0.154 0.130 0.032 0.253 11 G 0.009 0.003 0.075 0.098 0.086 0.041 0.004 0.686 12 F 0.015 0.001 0.201 0.279 0.438 0.032 0.003 0.032 13 L 0.008 0.001 0.180 0.216 0.315 0.027 0.001 0.252 14 L 0.001 0.001 0.375 0.308 0.305 0.003 0.001 0.008 15 R 0.002 0.001 0.230 0.258 0.292 0.016 0.001 0.199 16 L 0.002 0.001 0.419 0.163 0.337 0.009 0.001 0.069 17 D 0.002 0.001 0.076 0.053 0.146 0.213 0.001 0.508 18 Y 0.007 0.001 0.019 0.008 0.028 0.109 0.003 0.825 19 G 0.067 0.010 0.022 0.009 0.015 0.185 0.013 0.680 20 K 0.304 0.012 0.017 0.005 0.008 0.237 0.014 0.404 21 D 0.032 0.084 0.017 0.012 0.012 0.208 0.004 0.632 22 L 0.039 0.417 0.009 0.010 0.034 0.122 0.005 0.365 23 V 0.016 0.760 0.008 0.003 0.010 0.043 0.002 0.157 24 R 0.010 0.861 0.001 0.001 0.002 0.043 0.002 0.079 25 Q 0.007 0.968 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.020 26 I 0.009 0.959 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.026 27 E 0.001 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 28 E 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 29 F 0.004 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 30 L 0.003 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 31 E 0.003 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 32 E 0.011 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.004 33 K 0.071 0.856 0.002 0.001 0.001 0.001 0.058 0.011 34 G 0.646 0.084 0.014 0.003 0.001 0.004 0.186 0.061 35 I 0.063 0.057 0.712 0.026 0.016 0.025 0.019 0.083 36 H 0.019 0.040 0.187 0.069 0.086 0.108 0.017 0.476 37 A 0.020 0.016 0.277 0.034 0.055 0.085 0.005 0.508 38 A 0.008 0.010 0.719 0.145 0.062 0.021 0.003 0.032 39 H 0.005 0.006 0.572 0.113 0.097 0.020 0.002 0.184 40 I 0.002 0.003 0.623 0.154 0.182 0.007 0.001 0.027 41 S 0.004 0.008 0.365 0.232 0.269 0.032 0.002 0.088 42 A 0.004 0.012 0.262 0.207 0.355 0.027 0.004 0.129 43 I 0.008 0.012 0.226 0.114 0.254 0.064 0.005 0.317 44 G 0.045 0.013 0.098 0.170 0.182 0.128 0.026 0.337 45 A 0.069 0.013 0.054 0.063 0.097 0.087 0.009 0.607 46 V 0.040 0.044 0.067 0.178 0.303 0.112 0.014 0.242 47 R 0.098 0.037 0.058 0.135 0.226 0.130 0.014 0.302 48 S 0.051 0.048 0.078 0.215 0.190 0.070 0.020 0.327 49 A 0.152 0.038 0.125 0.130 0.210 0.082 0.019 0.244 50 V 0.032 0.034 0.318 0.240 0.256 0.039 0.010 0.071 51 I 0.013 0.023 0.164 0.232 0.326 0.035 0.007 0.200 52 G 0.016 0.021 0.284 0.176 0.289 0.035 0.009 0.169 53 Y 0.017 0.022 0.278 0.134 0.167 0.062 0.007 0.313 54 Y 0.017 0.009 0.089 0.054 0.114 0.117 0.006 0.594 55 D 0.022 0.009 0.028 0.034 0.091 0.111 0.005 0.701 56 Q 0.035 0.012 0.016 0.013 0.040 0.107 0.006 0.771 57 E 0.041 0.015 0.004 0.005 0.010 0.549 0.010 0.364 58 K 0.293 0.066 0.006 0.008 0.012 0.173 0.033 0.410 59 K 0.146 0.156 0.018 0.017 0.016 0.085 0.026 0.536 60 E 0.110 0.063 0.028 0.021 0.028 0.139 0.029 0.583 61 Y 0.203 0.065 0.039 0.038 0.068 0.101 0.021 0.465 62 V 0.153 0.047 0.058 0.144 0.233 0.087 0.013 0.265 63 K 0.011 0.011 0.033 0.065 0.098 0.032 0.002 0.748 64 K 0.019 0.023 0.090 0.251 0.298 0.045 0.005 0.269 65 E 0.025 0.020 0.046 0.161 0.174 0.062 0.006 0.507 66 L 0.039 0.020 0.056 0.169 0.307 0.051 0.008 0.350 67 M 0.045 0.020 0.069 0.129 0.265 0.104 0.014 0.354 68 E 0.035 0.008 0.026 0.094 0.099 0.089 0.009 0.639 69 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.994 70 L 0.073 0.005 0.049 0.117 0.246 0.188 0.009 0.313 71 E 0.091 0.009 0.200 0.297 0.184 0.052 0.010 0.157 72 I 0.011 0.009 0.124 0.176 0.294 0.026 0.002 0.357 73 L 0.011 0.006 0.313 0.226 0.381 0.018 0.002 0.044 74 S 0.008 0.019 0.177 0.333 0.293 0.029 0.004 0.138 75 L 0.011 0.014 0.295 0.141 0.342 0.039 0.010 0.149 76 S 0.029 0.015 0.088 0.122 0.254 0.164 0.009 0.320 77 G 0.076 0.017 0.058 0.174 0.181 0.100 0.045 0.349 78 N 0.184 0.006 0.039 0.058 0.114 0.226 0.015 0.358 79 V 0.038 0.013 0.068 0.235 0.184 0.085 0.008 0.368 80 S 0.042 0.011 0.019 0.128 0.275 0.218 0.005 0.302 81 M 0.049 0.017 0.032 0.155 0.261 0.080 0.007 0.399 82 K 0.036 0.021 0.021 0.057 0.088 0.301 0.008 0.468 83 D 0.083 0.018 0.012 0.030 0.045 0.248 0.037 0.528 84 S 0.256 0.045 0.024 0.032 0.027 0.075 0.094 0.446 85 K 0.128 0.005 0.060 0.031 0.041 0.428 0.022 0.285 86 P 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.001 0.990 87 F 0.027 0.002 0.066 0.127 0.414 0.139 0.005 0.220 88 C 0.036 0.002 0.126 0.157 0.165 0.079 0.005 0.430 89 H 0.011 0.002 0.148 0.217 0.293 0.049 0.003 0.277 90 I 0.014 0.001 0.130 0.239 0.463 0.034 0.001 0.118 91 H 0.006 0.001 0.157 0.272 0.492 0.026 0.001 0.046 92 V 0.006 0.001 0.115 0.295 0.492 0.025 0.001 0.064 93 L 0.004 0.002 0.155 0.359 0.431 0.014 0.002 0.032 94 L 0.014 0.002 0.077 0.340 0.426 0.028 0.003 0.110 95 G 0.011 0.002 0.126 0.227 0.472 0.029 0.005 0.127 96 K 0.011 0.002 0.048 0.062 0.170 0.140 0.008 0.559 97 D 0.016 0.002 0.014 0.018 0.027 0.098 0.009 0.817 98 G 0.105 0.010 0.041 0.062 0.039 0.119 0.049 0.574 99 E 0.363 0.002 0.093 0.034 0.052 0.206 0.023 0.227 100 V 0.008 0.003 0.111 0.064 0.055 0.053 0.002 0.704 101 Y 0.009 0.007 0.102 0.179 0.393 0.087 0.002 0.221 102 G 0.012 0.006 0.093 0.097 0.209 0.058 0.004 0.520 103 G 0.035 0.011 0.103 0.142 0.228 0.093 0.007 0.381 104 H 0.068 0.011 0.074 0.131 0.186 0.131 0.008 0.391 105 L 0.064 0.021 0.072 0.143 0.299 0.103 0.008 0.291 106 F 0.047 0.023 0.065 0.185 0.335 0.112 0.010 0.223 107 S 0.042 0.022 0.039 0.089 0.140 0.092 0.019 0.557 108 A 0.107 0.016 0.040 0.055 0.087 0.123 0.024 0.548 109 E 0.176 0.017 0.071 0.139 0.145 0.167 0.027 0.258 110 V 0.031 0.009 0.126 0.168 0.181 0.083 0.019 0.384 111 F 0.011 0.004 0.219 0.281 0.264 0.038 0.004 0.177 112 A 0.005 0.002 0.173 0.182 0.239 0.040 0.003 0.356 113 C 0.005 0.001 0.247 0.262 0.347 0.028 0.002 0.108 114 E 0.004 0.001 0.392 0.216 0.247 0.025 0.002 0.114 115 V 0.004 0.001 0.219 0.195 0.268 0.030 0.001 0.282 116 F 0.002 0.001 0.497 0.213 0.259 0.008 0.001 0.020 117 V 0.004 0.001 0.205 0.175 0.351 0.021 0.001 0.242 118 L 0.001 0.001 0.459 0.192 0.283 0.008 0.001 0.055 119 P 0.001 0.001 0.007 0.008 0.014 0.008 0.001 0.963 120 L 0.021 0.004 0.172 0.081 0.284 0.106 0.007 0.325 121 S 0.047 0.005 0.024 0.027 0.039 0.134 0.007 0.716 122 G 0.120 0.010 0.018 0.016 0.033 0.058 0.025 0.721 123 E 0.267 0.013 0.028 0.011 0.018 0.160 0.027 0.476 124 A 0.082 0.015 0.020 0.025 0.022 0.118 0.010 0.708 125 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 126 E 0.011 0.012 0.020 0.050 0.133 0.190 0.003 0.581 127 R 0.263 0.043 0.028 0.028 0.042 0.168 0.011 0.418 128 A 0.144 0.173 0.049 0.073 0.080 0.053 0.006 0.421 129 F 0.102 0.078 0.052 0.048 0.068 0.095 0.007 0.548 130 D 0.106 0.126 0.048 0.059 0.092 0.082 0.011 0.476 131 E 0.027 0.041 0.012 0.010 0.032 0.046 0.008 0.825 132 Q 0.058 0.031 0.007 0.006 0.012 0.668 0.016 0.202 133 T 0.450 0.091 0.008 0.007 0.006 0.256 0.041 0.140 134 G 0.318 0.276 0.029 0.021 0.015 0.046 0.032 0.264 135 L 0.067 0.095 0.200 0.045 0.097 0.123 0.012 0.361 136 F 0.049 0.066 0.039 0.088 0.182 0.141 0.010 0.425 137 L 0.108 0.122 0.036 0.069 0.207 0.076 0.010 0.372 138 W 0.101 0.209 0.065 0.106 0.179 0.091 0.014 0.235 139 L 0.116 0.171 0.063 0.089 0.110 0.068 0.021 0.363 140 E 0.067 0.110 0.030 0.048 0.087 0.064 0.018 0.576 141 H 0.128 0.113 0.041 0.036 0.084 0.116 0.021 0.462 142 H 0.065 0.082 0.016 0.015 0.024 0.086 0.019 0.693 143 H 0.085 0.065 0.018 0.014 0.019 0.079 0.025 0.695 144 H 0.125 0.046 0.022 0.010 0.013 0.083 0.019 0.681 145 H 0.104 0.034 0.022 0.010 0.017 0.107 0.016 0.689 146 H 0.088 0.037 0.026 0.017 0.029 0.115 0.010 0.679