# TARGET T0309
# Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net
# This is a 4-layer network, with 
#	window	units
#	    5	   15
#	    7	   15
#	    9	   15
#	   13	    6 (1 EBGHTL )
# The input amino acid frequencies were determined from
# alignment T0309.t2k-thin90.a2m.gz
# with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1)
# Counts were regularized to probabilities using
# /projects/compbio/lib/recode3.20comp
# Total sequence weight for alignment was 2
#
Pos	AA	E	B	G	H	T	C
10N	1S	5N	5N	5N	5N	5N	5N
1	M	0.021	0.007	0.004	0.009	0.157	0.802
2	A	0.055	0.028	0.008	0.011	0.174	0.724
3	S	0.104	0.021	0.014	0.008	0.279	0.574
4	K	0.163	0.011	0.070	0.028	0.401	0.326
5	K	0.254	0.014	0.093	0.038	0.374	0.227
6	V	0.458	0.022	0.069	0.024	0.254	0.172
7	H	0.583	0.019	0.030	0.017	0.177	0.174
8	Q	0.750	0.013	0.007	0.012	0.090	0.128
9	I	0.796	0.012	0.004	0.011	0.060	0.117
10	N	0.640	0.020	0.003	0.009	0.104	0.225
11	V	0.338	0.033	0.007	0.013	0.300	0.309
12	K	0.190	0.008	0.017	0.012	0.419	0.355
13	G	0.229	0.010	0.030	0.019	0.451	0.262
14	F	0.555	0.020	0.024	0.017	0.254	0.130
15	F	0.649	0.025	0.015	0.012	0.176	0.123
16	D	0.521	0.014	0.016	0.006	0.273	0.171
17	M	0.382	0.005	0.044	0.008	0.397	0.164
18	D	0.587	0.008	0.034	0.007	0.216	0.148
19	V	0.863	0.006	0.016	0.007	0.059	0.050
20	M	0.914	0.005	0.005	0.006	0.030	0.040
21	E	0.918	0.008	0.003	0.007	0.023	0.040
22	V	0.828	0.006	0.006	0.013	0.052	0.095
23	T	0.610	0.008	0.013	0.032	0.168	0.170
24	E	0.297	0.006	0.049	0.108	0.321	0.218
25	Q	0.265	0.018	0.042	0.128	0.341	0.206
26	T	0.266	0.013	0.035	0.088	0.363	0.235
27	K	0.196	0.011	0.054	0.108	0.337	0.294
28	E	0.265	0.022	0.096	0.132	0.281	0.205
29	A	0.279	0.012	0.101	0.159	0.242	0.208
30	E	0.344	0.008	0.065	0.105	0.191	0.287
31	Y	0.440	0.029	0.034	0.107	0.128	0.263
32	T	0.454	0.027	0.015	0.111	0.108	0.286
33	Y	0.427	0.015	0.017	0.186	0.105	0.251
34	D	0.302	0.030	0.006	0.133	0.071	0.459
35	F	0.019	0.001	0.010	0.924	0.022	0.024
36	K	0.001	0.001	0.005	0.983	0.007	0.003
37	E	0.003	0.001	0.006	0.979	0.009	0.002
38	I	0.002	0.001	0.005	0.983	0.008	0.001
39	L	0.002	0.001	0.003	0.984	0.007	0.003
40	S	0.006	0.001	0.012	0.953	0.022	0.005
41	E	0.004	0.001	0.016	0.905	0.052	0.023
42	F	0.017	0.010	0.028	0.626	0.213	0.106
43	N	0.013	0.011	0.028	0.179	0.490	0.278
44	G	0.013	0.002	0.020	0.028	0.577	0.361
45	K	0.162	0.023	0.013	0.008	0.440	0.354
46	N	0.363	0.020	0.004	0.002	0.186	0.425
47	V	0.606	0.007	0.001	0.001	0.077	0.307
48	S	0.833	0.004	0.001	0.001	0.027	0.134
49	I	0.939	0.006	0.001	0.001	0.008	0.047
50	T	0.943	0.001	0.001	0.001	0.010	0.044
51	V	0.928	0.002	0.001	0.002	0.016	0.051
52	K	0.792	0.003	0.003	0.003	0.057	0.142
53	E	0.607	0.007	0.011	0.006	0.170	0.198
54	E	0.286	0.010	0.041	0.011	0.328	0.324
55	N	0.180	0.016	0.036	0.010	0.376	0.381
56	E	0.213	0.027	0.035	0.010	0.284	0.431
57	L	0.168	0.033	0.008	0.006	0.197	0.588
58	P	0.112	0.024	0.010	0.009	0.214	0.631
59	V	0.154	0.037	0.021	0.015	0.510	0.264
60	K	0.193	0.008	0.022	0.021	0.514	0.243
61	G	0.318	0.012	0.027	0.026	0.447	0.169
62	V	0.662	0.024	0.012	0.021	0.175	0.106
63	E	0.653	0.032	0.013	0.032	0.119	0.151
64	M	0.431	0.038	0.020	0.047	0.250	0.215
65	A	0.200	0.021	0.014	0.038	0.381	0.346
66	G	0.060	0.011	0.008	0.024	0.378	0.519
67	D	0.069	0.029	0.014	0.028	0.389	0.472
68	P	0.075	0.040	0.057	0.107	0.330	0.390
69	L	0.064	0.021	0.145	0.171	0.371	0.227
70	E	0.067	0.012	0.198	0.176	0.361	0.185
71	H	0.073	0.016	0.200	0.179	0.365	0.168
72	H	0.099	0.013	0.108	0.146	0.386	0.249
73	H	0.111	0.026	0.090	0.137	0.308	0.328
74	H	0.093	0.028	0.041	0.109	0.223	0.506
75	H	0.048	0.017	0.015	0.083	0.140	0.697
76	H	0.001	0.002	0.001	0.004	0.017	0.976