# TARGET T0309
# Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net
# This is a 4-layer network, with 
#	window	units
#	    5	   15
#	    7	   15
#	    9	   15
#	   13	    7 (1 EBGHSTL )
# The input amino acid frequencies were determined from
# alignment T0309.t2k-thin90.a2m.gz
# with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1)
# Counts were regularized to probabilities using
# /projects/compbio/lib/recode3.20comp
# Total sequence weight for alignment was 1
#
Pos	AA	E	B	G	H	S	T	C
10N	1S	5N	5N	5N	5N	5N	5N	5N
1	M	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.997
2	A	0.039	0.025	0.010	0.066	0.003	0.038	0.819
3	S	0.054	0.012	0.030	0.082	0.171	0.117	0.534
4	K	0.098	0.011	0.055	0.117	0.222	0.149	0.347
5	K	0.172	0.015	0.055	0.126	0.172	0.115	0.344
6	V	0.280	0.021	0.054	0.123	0.098	0.069	0.355
7	H	0.412	0.017	0.054	0.110	0.093	0.062	0.251
8	Q	0.552	0.013	0.033	0.089	0.073	0.052	0.188
9	I	0.595	0.035	0.018	0.079	0.057	0.031	0.184
10	N	0.524	0.027	0.013	0.070	0.055	0.046	0.266
11	V	0.379	0.019	0.034	0.106	0.067	0.128	0.267
12	K	0.236	0.012	0.063	0.103	0.145	0.258	0.183
13	G	0.242	0.010	0.070	0.081	0.223	0.178	0.194
14	F	0.390	0.020	0.042	0.073	0.124	0.080	0.270
15	F	0.552	0.035	0.020	0.054	0.084	0.048	0.208
16	D	0.466	0.012	0.018	0.051	0.084	0.045	0.324
17	M	0.335	0.016	0.073	0.185	0.112	0.085	0.193
18	D	0.354	0.011	0.080	0.186	0.099	0.084	0.185
19	V	0.461	0.013	0.071	0.216	0.046	0.060	0.134
20	M	0.508	0.014	0.033	0.231	0.042	0.041	0.130
21	E	0.497	0.014	0.029	0.228	0.046	0.048	0.137
22	V	0.378	0.018	0.026	0.298	0.066	0.046	0.167
23	T	0.257	0.015	0.029	0.329	0.080	0.062	0.228
24	E	0.131	0.007	0.051	0.448	0.090	0.112	0.160
25	Q	0.105	0.009	0.047	0.435	0.104	0.131	0.169
26	T	0.107	0.011	0.054	0.389	0.119	0.096	0.223
27	K	0.082	0.008	0.064	0.435	0.096	0.128	0.186
28	E	0.071	0.007	0.081	0.474	0.088	0.136	0.143
29	A	0.068	0.006	0.087	0.457	0.083	0.130	0.170
30	E	0.128	0.012	0.070	0.391	0.081	0.123	0.195
31	Y	0.170	0.013	0.064	0.407	0.066	0.085	0.194
32	T	0.191	0.011	0.036	0.393	0.081	0.073	0.215
33	Y	0.155	0.012	0.033	0.488	0.076	0.060	0.176
34	D	0.125	0.017	0.023	0.505	0.062	0.059	0.210
35	F	0.019	0.003	0.025	0.867	0.015	0.031	0.039
36	K	0.013	0.001	0.028	0.897	0.013	0.027	0.021
37	E	0.013	0.001	0.040	0.883	0.011	0.035	0.017
38	I	0.017	0.003	0.029	0.887	0.012	0.031	0.021
39	L	0.023	0.005	0.035	0.836	0.015	0.052	0.033
40	S	0.028	0.002	0.057	0.742	0.024	0.109	0.037
41	E	0.025	0.003	0.055	0.618	0.058	0.192	0.048
42	F	0.039	0.012	0.061	0.359	0.147	0.234	0.149
43	N	0.026	0.009	0.033	0.088	0.137	0.528	0.180
44	G	0.027	0.005	0.042	0.031	0.248	0.399	0.248
45	K	0.102	0.008	0.042	0.033	0.333	0.187	0.295
46	N	0.300	0.017	0.022	0.016	0.146	0.103	0.396
47	V	0.573	0.020	0.011	0.014	0.067	0.021	0.294
48	S	0.766	0.011	0.004	0.007	0.028	0.009	0.176
49	I	0.831	0.011	0.006	0.011	0.020	0.005	0.116
50	T	0.847	0.011	0.003	0.009	0.013	0.004	0.114
51	V	0.716	0.015	0.010	0.018	0.023	0.011	0.208
52	K	0.642	0.014	0.018	0.021	0.058	0.029	0.219
53	E	0.366	0.017	0.066	0.049	0.111	0.087	0.305
54	E	0.178	0.013	0.138	0.062	0.174	0.157	0.278
55	N	0.216	0.012	0.082	0.052	0.200	0.167	0.271
56	E	0.232	0.018	0.047	0.035	0.185	0.122	0.361
57	L	0.288	0.023	0.007	0.023	0.167	0.022	0.470
58	P	0.303	0.030	0.006	0.017	0.071	0.027	0.545
59	V	0.384	0.036	0.019	0.052	0.076	0.051	0.382
60	K	0.306	0.013	0.047	0.072	0.114	0.123	0.325
61	G	0.248	0.011	0.079	0.112	0.139	0.131	0.281
62	V	0.416	0.018	0.040	0.119	0.093	0.048	0.266
63	E	0.501	0.026	0.026	0.110	0.072	0.041	0.224
64	M	0.405	0.021	0.019	0.111	0.095	0.070	0.278
65	A	0.197	0.020	0.011	0.074	0.022	0.105	0.571
66	G	0.001	0.001	0.001	0.003	0.001	0.001	0.992