PFRMAT RR
TARGET T0309
AUTHOR 5370-1100-4902
REMARK From group SAM-TO6 under the direction of
REMARK Kevin Karplus.
REMARK Residue-residue contact predictions
REMARK  by George Shackelford and Kevin Karplus
REMARK The value given is an approximation of the probability
REMARK as provided by the neural network.
REMARK The predictions are limited to a score >= .18 which
REMARK is an approximation of the probability.
REMARK
METHOD The predictor is an artificial neural network.
METHOD NN: logseploglen.5xt04_ent.5xnearNS_str2.miRpz_entR_pplR.n45.net
METHOD Inputs may include separation and sequence length,
METHOD e-value statistic based on mutual information values,
METHOD a statistic based on propensity of residues in contact.
METHOD Other inputs are distributions from alignments and
METHOD secondary predictions from SAM-t04 and/or SAM-t06 of
METHOD the University of California, Santa Cruz
MODEL 1
MASKKVHQINVKGFFDMDVMEVTEQTKEAEYTYDFKEILSEFNGKNVSIT
VKEENELPVKGVE
3 12 0 8 0.151967957943
3 13 0 8 0.212409800061
3 14 0 8 0.190733272631
3 15 0 8 0.196821632913
3 16 0 8 0.137416854943
3 17 0 8 0.163051011737
3 19 0 8 0.143141527108
3 22 0 8 0.135104930572
3 31 0 8 0.137096106747
4 13 0 8 0.217152709492
4 14 0 8 0.203418766195
4 15 0 8 0.193337318584
4 16 0 8 0.16803789799
4 17 0 8 0.162019803034
4 18 0 8 0.143039056842
4 19 0 8 0.158735549699
4 22 0 8 0.145630741303
4 31 0 8 0.139427549263
4 33 0 8 0.127114852284
4 42 0 8 0.133894154927
6 15 0 8 0.23959467354
6 17 0 8 0.230708387057
6 19 0 8 0.237921643142
6 20 0 8 0.214331686818
6 22 0 8 0.228896777823
6 23 0 8 0.177945959406
6 26 0 8 0.175542625053
6 29 0 8 0.199993656909
6 31 0 8 0.202975704286
6 32 0 8 0.185289011161
6 33 0 8 0.195835641247
6 35 0 8 0.207310033864
6 38 0 8 0.21182197857
6 39 0 8 0.175440154787
6 42 0 8 0.207590119257
6 45 0 8 0.132648897225
6 46 0 8 0.199437715056
6 47 0 8 0.221936932331
6 48 0 8 0.217748338241
6 49 0 8 0.236627590075
6 50 0 8 0.206179282617
6 51 0 8 0.223411528247
6 57 0 8 0.197860974177
6 59 0 8 0.188546589696
7 16 0 8 0.246164156116
7 17 0 8 0.235540429353
7 18 0 8 0.218858595435
7 19 0 8 0.239798963466
7 20 0 8 0.210301840314
7 21 0 8 0.204186154628
7 22 0 8 0.224498688968
7 23 0 8 0.187101270999
7 25 0 8 0.163425760136
7 26 0 8 0.185704747667
7 29 0 8 0.198658941038
7 30 0 8 0.137046660777
7 31 0 8 0.201582433978
7 32 0 8 0.194436840798
7 33 0 8 0.194489865094
7 34 0 8 0.152887913216
7 35 0 8 0.195186662899
7 38 0 8 0.174188065734
7 39 0 8 0.131701291246
7 41 0 8 0.134249385181
7 42 0 8 0.208077747599
7 44 0 8 0.133494683543
7 46 0 8 0.211197723206
7 47 0 8 0.213613419052
7 48 0 8 0.231338823166
7 49 0 8 0.211410145693
7 50 0 8 0.220041395071
7 51 0 8 0.223105093358
7 55 0 8 0.135275063743
7 57 0 8 0.195911762016
7 58 0 8 0.153141649111
7 59 0 8 0.178656419914
7 61 0 8 0.148159642394
8 23 0 8 0.1430735389
8 26 0 8 0.136646213486
8 31 0 8 0.172429480797
8 32 0 8 0.143627854241
8 33 0 8 0.164601403119
8 35 0 8 0.161540632554
8 38 0 8 0.133069513267
8 42 0 8 0.131542868962
8 46 0 8 0.162344129556
8 47 0 8 0.159843855079
8 48 0 8 0.200330995529
8 49 0 8 0.174514344071
8 50 0 8 0.191155189883
8 51 0 8 0.170201159151
8 52 0 8 0.147613134312
8 59 0 8 0.126780116083
9 18 0 8 0.229731503859
9 19 0 8 0.261546732128
9 20 0 8 0.237105784647
9 21 0 8 0.221166941479
9 22 0 8 0.257147342063
9 23 0 8 0.208099542862
9 24 0 8 0.132112473517
9 25 0 8 0.191602806027
9 26 0 8 0.200785117721
9 27 0 8 0.131195445967
9 28 0 8 0.134227264615
9 29 0 8 0.212638162367
9 30 0 8 0.141857233113
9 31 0 8 0.212674921542
9 32 0 8 0.203855647359
9 33 0 8 0.205370580776
9 34 0 8 0.14763037534
9 35 0 8 0.236156226854
9 38 0 8 0.253383918249
9 39 0 8 0.221063820609
9 41 0 8 0.134918206977
9 42 0 8 0.213065284458
9 45 0 8 0.138303629367
9 46 0 8 0.208281712223
9 47 0 8 0.251337765964
9 48 0 8 0.22643326252
9 49 0 8 0.268231791367
9 50 0 8 0.216887588011
9 51 0 8 0.255081671632
9 52 0 8 0.158813947585
9 53 0 8 0.156145491751
9 54 0 8 0.131006445255
9 55 0 8 0.129453776756
9 56 0 8 0.128151265826
9 57 0 8 0.208764135727
9 58 0 8 0.132304076649
9 59 0 8 0.212420209739
9 61 0 8 0.129768994811
10 19 0 8 0.218067785228
10 20 0 8 0.208429074224
10 21 0 8 0.197504442714
10 22 0 8 0.205218013936
10 23 0 8 0.152491044251
10 25 0 8 0.12799512066
10 26 0 8 0.137658229346
10 29 0 8 0.147277747506
10 31 0 8 0.173848449997
10 32 0 8 0.14308427388
10 33 0 8 0.160098566881
10 34 0 8 0.131144698788
10 35 0 8 0.138738233414
10 42 0 8 0.141300315353
10 46 0 8 0.177495415541
10 47 0 8 0.157177351059
10 48 0 8 0.216170946758
10 49 0 8 0.16422535351
10 50 0 8 0.19107841851
10 51 0 8 0.157482484739
10 52 0 8 0.149461177417
10 53 0 8 0.1365544782
11 20 0 8 0.2228965745
11 21 0 8 0.214573386524
11 22 0 8 0.232689478856
11 23 0 8 0.195163566427
11 24 0 8 0.137166046769
11 25 0 8 0.173571292326
11 26 0 8 0.181177839049
11 27 0 8 0.13889437858
11 28 0 8 0.140801626728
11 29 0 8 0.201619843757
11 30 0 8 0.138538172419
11 31 0 8 0.203154945925
11 32 0 8 0.190099258195
11 33 0 8 0.198008336178
11 34 0 8 0.143407949798
11 35 0 8 0.20945800581
11 38 0 8 0.210687974298
11 39 0 8 0.176568628917
11 42 0 8 0.169678723448
11 46 0 8 0.165026573395
11 47 0 8 0.221172146318
11 48 0 8 0.181650178178
11 49 0 8 0.241552994169
11 50 0 8 0.184380441474
11 51 0 8 0.223401443872
11 52 0 8 0.135950066285
11 53 0 8 0.145905621856
11 57 0 8 0.192702653543
11 59 0 8 0.190120402853
12 21 0 8 0.161971332971
12 22 0 8 0.202091206978
12 23 0 8 0.138252882188
12 25 0 8 0.130797275792
12 26 0 8 0.139897285972
12 29 0 8 0.144262519282
12 31 0 8 0.166448145015
12 32 0 8 0.127600203509
12 33 0 8 0.153354722203
12 35 0 8 0.149401972375
12 47 0 8 0.127339310961
12 48 0 8 0.134113083462
12 50 0 8 0.134453349804
12 51 0 8 0.143231310578
13 22 0 8 0.195311579032
13 23 0 8 0.143427793246
13 25 0 8 0.138149761318
13 26 0 8 0.153226878348
13 29 0 8 0.162459937221
13 31 0 8 0.178886408732
13 32 0 8 0.140739819266
13 33 0 8 0.166769218513
13 35 0 8 0.16100193173
13 38 0 8 0.130737420145
13 42 0 8 0.129618705088
13 46 0 8 0.140032286481
13 47 0 8 0.138815004787
13 48 0 8 0.150814760829
13 49 0 8 0.13697476894
13 50 0 8 0.137549253032
13 51 0 8 0.150502470496
14 23 0 8 0.203349151475
14 24 0 8 0.149289417734
14 25 0 8 0.184049934205
14 26 0 8 0.187361838246
14 27 0 8 0.135652089259
14 28 0 8 0.140235275197
14 29 0 8 0.201410674294
14 30 0 8 0.143610287909
14 31 0 8 0.202599654676
14 32 0 8 0.195819376126
14 33 0 8 0.200336200368
14 34 0 8 0.145413439279
14 35 0 8 0.211306699521
14 38 0 8 0.18827268505
14 39 0 8 0.160072217385
14 42 0 8 0.169747687563
14 46 0 8 0.165778022009
14 47 0 8 0.205916763556
14 48 0 8 0.181379526556
14 49 0 8 0.214437410108
14 50 0 8 0.180367510696
14 51 0 8 0.21135354307
14 52 0 8 0.132248775236
14 53 0 8 0.138802643295
14 57 0 8 0.18302393034
14 59 0 8 0.178511660332
15 24 0 8 0.153370987324
15 25 0 8 0.186182291634
15 26 0 8 0.189904076737
15 27 0 8 0.146400406852
15 28 0 8 0.147770580688
15 29 0 8 0.198514181457
15 30 0 8 0.148541222145
15 31 0 8 0.20506056756
15 32 0 8 0.193552668793
15 33 0 8 0.201748988822
15 34 0 8 0.146140815513
15 35 0 8 0.208922232708
15 38 0 8 0.185558036271
15 39 0 8 0.154780197452
15 42 0 8 0.177405306768
15 46 0 8 0.181214598224
15 47 0 8 0.209895212276
15 48 0 8 0.186049893545
15 49 0 8 0.216377513801
15 50 0 8 0.181730202576
15 51 0 8 0.211783267581
15 52 0 8 0.136007970118
15 53 0 8 0.139736911874
15 57 0 8 0.181362936132
15 59 0 8 0.16974866347
16 25 0 8 0.141550798224
16 26 0 8 0.149088380832
16 29 0 8 0.157213784931
16 31 0 8 0.180752668773
16 32 0 8 0.151011243497
16 33 0 8 0.175737806511
16 34 0 8 0.127853939405
16 35 0 8 0.158946020372
16 38 0 8 0.126780441386
16 48 0 8 0.136930853112
16 50 0 8 0.128476568256
16 51 0 8 0.136899298776
17 26 0 8 0.191281081924
17 27 0 8 0.138170255371
17 28 0 8 0.138026796999
17 29 0 8 0.200531056523
17 30 0 8 0.14172028079
17 31 0 8 0.202815004885
17 32 0 8 0.190434970303
17 33 0 8 0.199318329064
17 34 0 8 0.143868903341
17 35 0 8 0.200026837757
17 38 0 8 0.181949781716
17 39 0 8 0.145026329388
17 42 0 8 0.167396076296
17 46 0 8 0.195746183079
17 47 0 8 0.227745857826
17 48 0 8 0.215596462666
17 49 0 8 0.236002684107
17 50 0 8 0.211649568282
17 51 0 8 0.229378550722
17 52 0 8 0.167152424776
17 53 0 8 0.174973996405
17 54 0 8 0.13502165315
17 55 0 8 0.144468110417
17 57 0 8 0.202025170585
17 58 0 8 0.133398719326
17 59 0 8 0.196177208799
17 61 0 8 0.149350574591
18 27 0 8 0.146285249792
18 28 0 8 0.137917495383
18 29 0 8 0.195775134995
18 30 0 8 0.150953014362
18 31 0 8 0.198179119954
18 32 0 8 0.19138908233
18 33 0 8 0.195777412112
18 34 0 8 0.171115584282
18 35 0 8 0.174642513229
18 36 0 8 0.135746426964
18 38 0 8 0.150677483203
18 42 0 8 0.174259957571
18 45 0 8 0.127200732125
18 46 0 8 0.192941750829
18 47 0 8 0.168256501223
18 48 0 8 0.226903649834
18 49 0 8 0.168674189544
18 50 0 8 0.218329978986
18 51 0 8 0.182167083739
18 52 0 8 0.205793799238
18 53 0 8 0.164310908049
18 55 0 8 0.132495354478
18 57 0 8 0.143045888193
18 58 0 8 0.128203314215
18 59 0 8 0.139576537776
18 61 0 8 0.136489743017
19 28 0 8 0.181349598733
19 29 0 8 0.226333719977
19 30 0 8 0.184787720116
19 31 0 8 0.225673356044
19 32 0 8 0.220430456778
19 33 0 8 0.222355921861
19 34 0 8 0.197171333025
19 35 0 8 0.243776761581
19 36 0 8 0.159953156695
19 38 0 8 0.246977086888
19 39 0 8 0.220435011012
19 41 0 8 0.141549171712
19 42 0 8 0.206979201293
19 44 0 8 0.14307223769
19 45 0 8 0.134981640951
19 46 0 8 0.204069045753
19 47 0 8 0.24856228563
19 48 0 8 0.216202826396
19 49 0 8 0.258325587465
19 50 0 8 0.21935858527
19 51 0 8 0.247098424695
19 52 0 8 0.169249974845
19 53 0 8 0.178199695302
19 54 0 8 0.141550798224
19 55 0 8 0.145280715888
19 57 0 8 0.214434482386
19 58 0 8 0.135684619502
19 59 0 8 0.220752831486
19 61 0 8 0.149184995654
20 29 0 8 0.21767319338
20 30 0 8 0.171287669267
20 31 0 8 0.216818298594
20 32 0 8 0.210479130138
20 33 0 8 0.211037023806
20 34 0 8 0.17915250612
20 35 0 8 0.220986398631
20 36 0 8 0.134396421879
20 38 0 8 0.198460181253
20 39 0 8 0.171932743986
20 42 0 8 0.208347098011
20 46 0 8 0.208882871114
20 47 0 8 0.222690332759
20 48 0 8 0.218943174067
20 49 0 8 0.23259091222
20 50 0 8 0.214037288119
20 51 0 8 0.227160638754
20 52 0 8 0.157076182003
20 53 0 8 0.142842574174
20 54 0 8 0.130782637183
20 55 0 8 0.130073152583
20 57 0 8 0.193085209201
20 58 0 8 0.127956084368
20 59 0 8 0.193165233599
20 61 0 8 0.142113896731
21 30 0 8 0.152362224489
21 31 0 8 0.203212199152
21 32 0 8 0.198934797499
21 33 0 8 0.205965884223
21 34 0 8 0.176146061061
21 35 0 8 0.190463922219
21 36 0 8 0.133491430519
21 38 0 8 0.160634014681
21 42 0 8 0.149561695868
21 46 0 8 0.166571109333
21 47 0 8 0.180594897095
21 48 0 8 0.212758849569
21 49 0 8 0.194945613799
21 50 0 8 0.207931036203
21 51 0 8 0.195979750224
21 52 0 8 0.188214455915
21 53 0 8 0.152178753918
21 55 0 8 0.13070586581
21 57 0 8 0.144617424233
21 59 0 8 0.137038528216
22 31 0 8 0.224737460952
22 32 0 8 0.219274657243
22 33 0 8 0.219771394054
22 34 0 8 0.203108102375
22 35 0 8 0.246208722548
22 36 0 8 0.189079760379
22 37 0 8 0.140354335886
22 38 0 8 0.25247111963
22 39 0 8 0.220687445697
22 40 0 8 0.127714709965
22 41 0 8 0.152136464602
22 42 0 8 0.19304096807
22 44 0 8 0.159295395181
22 45 0 8 0.149154091923
22 46 0 8 0.205299339544
22 47 0 8 0.245847636851
22 48 0 8 0.210096249178
22 49 0 8 0.261218827278
22 50 0 8 0.218483521733
22 51 0 8 0.242832733929
22 52 0 8 0.167199268326
22 53 0 8 0.184850178183
22 54 0 8 0.166223686338
22 55 0 8 0.153257782079
22 56 0 8 0.135350208604
22 57 0 8 0.209864308545
22 58 0 8 0.143892650419
22 59 0 8 0.21654341804
22 61 0 8 0.202348195898
23 32 0 8 0.213473213705
23 33 0 8 0.221185158415
23 34 0 8 0.226755962531
23 35 0 8 0.235732357787
23 36 0 8 0.16216521322
23 38 0 8 0.22317893701
23 39 0 8 0.180241293353
23 42 0 8 0.200006343704
23 44 0 8 0.13962663435
23 46 0 8 0.222190342924
23 47 0 8 0.235021246675
23 48 0 8 0.229359032577
23 49 0 8 0.227971617712
23 50 0 8 0.221185158415
23 51 0 8 0.229974179472
23 57 0 8 0.178060791164
23 59 0 8 0.193900742393
24 33 0 8 0.18450308049
24 35 0 8 0.181551286239
24 47 0 8 0.164180461774
24 49 0 8 0.15186711419
24 51 0 8 0.173806485983
24 59 0 8 0.199974789368
25 34 0 8 0.371989068826
25 35 0 8 0.408618746835
25 36 0 8 0.194511009752
25 38 0 8 0.21599723526
25 39 0 8 0.178083562334
25 41 0 8 0.170078845437
25 42 0 8 0.195200976206
25 43 0 8 0.166664145828
25 44 0 8 0.174759947406
25 45 0 8 0.129284619493
25 46 0 8 0.201939941348
25 47 0 8 0.219207644943
25 48 0 8 0.210722456356
25 49 0 8 0.211239361918
25 50 0 8 0.208487953964
25 51 0 8 0.215757812672
25 52 0 8 0.157247616384
25 53 0 8 0.155236922064
25 54 0 8 0.141038446897
25 55 0 8 0.143102165513
25 57 0 8 0.208851316778
25 58 0 8 0.147871749744
25 59 0 8 0.22457253262
25 60 0 8 0.133441984549
26 35 0 8 0.217978977664
26 36 0 8 0.162576720794
26 38 0 8 0.210409515418
26 39 0 8 0.161836332463
26 41 0 8 0.142494825876
26 42 0 8 0.184711274045
26 44 0 8 0.131555555757
26 46 0 8 0.171558320889
26 47 0 8 0.205695557904
26 48 0 8 0.161090413991
26 49 0 8 0.198702856866
26 50 0 8 0.174026065124
26 51 0 8 0.198223361084
26 53 0 8 0.132377594998
26 57 0 8 0.184310176149
26 59 0 8 0.18086197039
27 47 0 8 0.137939290645
27 49 0 8 0.135512209214
27 51 0 8 0.150710989354
27 59 0 8 0.128602785599
28 38 0 8 0.173348460162
28 39 0 8 0.127105418513
28 42 0 8 0.150766616069
28 47 0 8 0.16522533318
28 49 0 8 0.165895130883
28 50 0 8 0.13137663942
28 51 0 8 0.171930792171
28 57 0 8 0.147954701863
28 59 0 8 0.151281244513
29 38 0 8 0.23497635494
29 39 0 8 0.201630253435
29 41 0 8 0.137846904755
29 42 0 8 0.213780949804
29 47 0 8 0.202361207995
29 48 0 8 0.168797153862
29 49 0 8 0.201383023588
29 50 0 8 0.17575504754
29 51 0 8 0.191457070538
29 57 0 8 0.183954620593
29 59 0 8 0.160039687142
31 41 0 8 0.14598239323
31 42 0 8 0.198479699399
31 44 0 8 0.144009108689
31 45 0 8 0.131114120359
31 46 0 8 0.199343702654
31 47 0 8 0.222807766937
31 48 0 8 0.192003903923
31 49 0 8 0.223399492057
31 50 0 8 0.202075592462
31 51 0 8 0.220302612923
31 52 0 8 0.133611141813
31 53 0 8 0.168065548697
31 54 0 8 0.136550899874
31 55 0 8 0.136516092514
31 57 0 8 0.198313144555
31 58 0 8 0.13632546529
31 59 0 8 0.192435254946
31 61 0 8 0.14761964036
32 42 0 8 0.174108691941
32 46 0 8 0.158706272481
32 47 0 8 0.188157853292
32 48 0 8 0.145378306617
32 49 0 8 0.182557121353
32 50 0 8 0.1553221513
32 51 0 8 0.1851201792
32 57 0 8 0.16856261081
32 59 0 8 0.161474596161
33 42 0 8 0.169133841877
33 46 0 8 0.165348948103
33 47 0 8 0.200604574873
33 48 0 8 0.146122598577
33 49 0 8 0.191564745643
33 50 0 8 0.171477645886
33 51 0 8 0.198753278743
33 57 0 8 0.176706557148
33 59 0 8 0.171992274331
35 44 0 8 0.146130405835
35 46 0 8 0.212536993311
35 47 0 8 0.254542970808
35 48 0 8 0.213398394146
35 49 0 8 0.260881488658
35 50 0 8 0.218418135945
35 51 0 8 0.248285453262
35 55 0 8 0.148244871631
35 57 0 8 0.217459794986
35 58 0 8 0.137724265739
35 59 0 8 0.204388167437
35 61 0 8 0.148847331731
38 47 0 8 0.263890536137
38 48 0 8 0.189033892736
38 49 0 8 0.275533495868
38 50 0 8 0.201297469049
38 51 0 8 0.254793128376
38 53 0 8 0.142679597657
38 57 0 8 0.21073774557
38 59 0 8 0.225807380645
39 48 0 8 0.204769421885
39 49 0 8 0.265163119243
39 50 0 8 0.21363846734
39 51 0 8 0.259869147496
39 52 0 8 0.138281183499
39 53 0 8 0.14276710401
39 57 0 8 0.207578408369
39 59 0 8 0.201614638918
41 50 0 8 0.131532133982
41 51 0 8 0.14665316684
41 57 0 8 0.134456928131
42 51 0 8 0.237413195443
42 52 0 8 0.151678764083
42 53 0 8 0.155180970046
42 54 0 8 0.139023198342
42 55 0 8 0.141221917467
42 57 0 8 0.198462133068
42 58 0 8 0.151655992913
42 59 0 8 0.21286619937
42 60 0 8 0.131459266238
42 61 0 8 0.145846742116
44 57 0 8 0.150622507093
44 59 0 8 0.145396848855
45 54 0 8 0.181703202474
45 55 0 8 0.140607746479
45 56 0 8 0.157899522454
45 57 0 8 0.1832594493
45 58 0 8 0.137422710386
45 59 0 8 0.160853268519
45 61 0 8 0.149117332748
46 55 0 8 0.175611263866
46 56 0 8 0.165158971484
46 57 0 8 0.202288665553
46 58 0 8 0.149658635992
46 59 0 8 0.172275612747
46 61 0 8 0.145069594611
47 56 0 8 0.213803395672
47 57 0 8 0.248893443504
47 58 0 8 0.210100803412
47 59 0 8 0.247817343065
47 60 0 8 0.151016773638
47 61 0 8 0.218432449252
48 57 0 8 0.222263861274
48 58 0 8 0.166846315189
48 59 0 8 0.217826410825
48 61 0 8 0.202665040465
49 58 0 8 0.220854976449
49 59 0 8 0.26081480166
49 60 0 8 0.167484233254
49 61 0 8 0.226395202136
50 59 0 8 0.234867378625
50 60 0 8 0.182035661558
50 61 0 8 0.244093606148
51 60 0 8 0.175770336754
51 61 0 8 0.225616428118
END