# TARGET T0305 # Using neural net dunbrack-30pc-1763-t2k-thin90-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-t3c1-near-backbone-11-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0305.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1058 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 Y 0.012 0.017 0.027 0.071 0.082 0.132 0.247 0.151 0.122 0.087 0.053 2 F 0.007 0.008 0.027 0.030 0.039 0.064 0.161 0.154 0.196 0.176 0.137 3 Q 0.008 0.019 0.092 0.126 0.108 0.124 0.204 0.135 0.085 0.064 0.036 4 S 0.005 0.018 0.088 0.062 0.066 0.089 0.153 0.152 0.144 0.131 0.093 5 M 0.007 0.011 0.021 0.031 0.044 0.081 0.169 0.163 0.203 0.159 0.109 6 K 0.100 0.090 0.109 0.190 0.163 0.130 0.106 0.049 0.037 0.019 0.008 7 Q 0.056 0.056 0.075 0.144 0.118 0.136 0.181 0.096 0.070 0.044 0.023 8 F 0.022 0.037 0.037 0.071 0.066 0.090 0.195 0.149 0.148 0.109 0.076 9 V 0.019 0.026 0.049 0.064 0.068 0.099 0.193 0.134 0.141 0.124 0.083 10 K 0.062 0.083 0.228 0.222 0.151 0.108 0.083 0.028 0.019 0.012 0.006 11 H 0.053 0.073 0.125 0.175 0.129 0.133 0.160 0.070 0.045 0.026 0.011 12 I 0.024 0.027 0.030 0.056 0.055 0.084 0.204 0.163 0.153 0.124 0.080 13 G 0.086 0.075 0.107 0.136 0.118 0.119 0.146 0.083 0.066 0.041 0.022 14 E 0.098 0.095 0.223 0.192 0.130 0.095 0.082 0.035 0.026 0.015 0.007 15 L 0.077 0.080 0.109 0.144 0.122 0.122 0.161 0.078 0.056 0.034 0.018 16 Y 0.071 0.064 0.063 0.099 0.091 0.109 0.191 0.118 0.093 0.064 0.037 17 S 0.172 0.149 0.160 0.193 0.120 0.080 0.069 0.029 0.017 0.009 0.004 18 N 0.236 0.143 0.179 0.154 0.098 0.071 0.060 0.027 0.017 0.009 0.004 19 N 0.227 0.170 0.099 0.151 0.109 0.087 0.083 0.037 0.022 0.010 0.005 20 Q 0.262 0.163 0.116 0.144 0.101 0.077 0.071 0.033 0.021 0.009 0.004 21 H 0.311 0.139 0.145 0.154 0.096 0.064 0.050 0.022 0.012 0.005 0.002 22 G 0.295 0.177 0.177 0.131 0.083 0.060 0.039 0.020 0.011 0.004 0.002 23 F 0.076 0.113 0.086 0.112 0.103 0.132 0.161 0.103 0.065 0.031 0.017 24 S 0.152 0.152 0.161 0.172 0.124 0.098 0.076 0.035 0.019 0.008 0.004 25 E 0.199 0.129 0.238 0.180 0.099 0.071 0.046 0.020 0.011 0.005 0.002 26 D 0.106 0.172 0.207 0.181 0.118 0.102 0.064 0.029 0.014 0.004 0.001 27 F 0.019 0.030 0.071 0.073 0.075 0.137 0.237 0.142 0.112 0.071 0.033 28 E 0.047 0.081 0.338 0.197 0.128 0.100 0.069 0.023 0.011 0.006 0.002 29 E 0.023 0.064 0.363 0.214 0.111 0.106 0.075 0.027 0.011 0.005 0.001 30 V 0.008 0.013 0.111 0.055 0.059 0.127 0.257 0.137 0.109 0.085 0.038 31 Q 0.033 0.049 0.278 0.183 0.119 0.127 0.138 0.036 0.021 0.013 0.004 32 R 0.023 0.050 0.428 0.192 0.094 0.079 0.078 0.028 0.015 0.010 0.003 33 C 0.017 0.028 0.102 0.062 0.064 0.125 0.284 0.146 0.084 0.059 0.028 34 T 0.127 0.157 0.222 0.199 0.106 0.077 0.064 0.025 0.013 0.007 0.003 35 A 0.264 0.144 0.215 0.140 0.085 0.060 0.048 0.022 0.013 0.007 0.002 36 D 0.338 0.179 0.136 0.137 0.088 0.051 0.038 0.017 0.010 0.005 0.002 37 M 0.211 0.127 0.061 0.113 0.096 0.108 0.138 0.068 0.045 0.022 0.010 38 N 0.275 0.195 0.176 0.170 0.092 0.042 0.024 0.013 0.008 0.004 0.002 39 I 0.070 0.063 0.058 0.082 0.093 0.130 0.195 0.131 0.086 0.056 0.035 40 T 0.213 0.245 0.119 0.198 0.107 0.055 0.030 0.019 0.010 0.004 0.002 41 A 0.055 0.033 0.032 0.055 0.073 0.113 0.179 0.137 0.140 0.108 0.074 42 E 0.275 0.210 0.133 0.203 0.098 0.043 0.022 0.008 0.005 0.002 0.001 43 H 0.074 0.055 0.055 0.129 0.103 0.112 0.187 0.109 0.084 0.061 0.031 44 S 0.131 0.097 0.075 0.093 0.089 0.098 0.133 0.106 0.081 0.056 0.039 45 N 0.164 0.241 0.123 0.203 0.108 0.071 0.048 0.023 0.013 0.005 0.002 46 H 0.207 0.118 0.104 0.119 0.115 0.101 0.098 0.057 0.041 0.026 0.014 47 P 0.508 0.165 0.079 0.111 0.064 0.035 0.021 0.009 0.006 0.002 0.001 48 E 0.275 0.177 0.102 0.152 0.104 0.077 0.059 0.027 0.017 0.007 0.003 49 N 0.062 0.064 0.062 0.082 0.084 0.104 0.165 0.133 0.105 0.080 0.059 50 K 0.096 0.105 0.127 0.165 0.140 0.131 0.113 0.056 0.037 0.019 0.011 51 H 0.112 0.108 0.284 0.194 0.115 0.080 0.053 0.024 0.018 0.010 0.004 52 K 0.038 0.034 0.056 0.101 0.109 0.146 0.218 0.120 0.085 0.059 0.035 53 N 0.034 0.032 0.047 0.063 0.061 0.088 0.163 0.140 0.158 0.124 0.088 54 R 0.026 0.060 0.076 0.152 0.127 0.130 0.167 0.105 0.071 0.052 0.034 55 Y 0.030 0.040 0.068 0.084 0.082 0.101 0.150 0.119 0.121 0.114 0.090 56 I 0.055 0.063 0.046 0.129 0.131 0.135 0.163 0.093 0.085 0.061 0.040 57 N 0.095 0.090 0.062 0.164 0.144 0.125 0.119 0.073 0.066 0.041 0.020 58 I 0.008 0.007 0.007 0.021 0.032 0.054 0.132 0.147 0.200 0.207 0.183 59 L 0.029 0.041 0.036 0.102 0.109 0.115 0.170 0.139 0.117 0.080 0.063 60 A 0.007 0.011 0.024 0.035 0.035 0.041 0.097 0.119 0.187 0.224 0.221 61 Y 0.018 0.026 0.031 0.063 0.090 0.108 0.175 0.137 0.132 0.115 0.104 62 D 0.046 0.072 0.045 0.134 0.109 0.104 0.146 0.105 0.110 0.079 0.050 63 H 0.050 0.054 0.030 0.122 0.139 0.146 0.172 0.104 0.082 0.060 0.040 64 S 0.056 0.052 0.028 0.073 0.072 0.081 0.141 0.127 0.155 0.130 0.086 65 R 0.042 0.055 0.029 0.151 0.162 0.141 0.157 0.107 0.075 0.051 0.031 66 V 0.008 0.006 0.010 0.012 0.018 0.031 0.082 0.117 0.208 0.258 0.250 67 K 0.045 0.098 0.048 0.247 0.208 0.130 0.108 0.059 0.030 0.016 0.010 68 L 0.006 0.005 0.007 0.010 0.014 0.024 0.070 0.110 0.206 0.281 0.268 69 R 0.119 0.115 0.038 0.172 0.156 0.116 0.112 0.067 0.047 0.032 0.025 70 P 0.215 0.163 0.061 0.141 0.106 0.081 0.077 0.053 0.053 0.033 0.016 71 L 0.112 0.077 0.019 0.079 0.094 0.100 0.138 0.118 0.100 0.087 0.075 72 P 0.350 0.212 0.028 0.108 0.084 0.065 0.058 0.040 0.031 0.015 0.009 73 G 0.318 0.149 0.051 0.125 0.091 0.065 0.060 0.043 0.042 0.032 0.024 74 K 0.288 0.186 0.042 0.123 0.106 0.081 0.073 0.039 0.029 0.018 0.014 75 D 0.252 0.176 0.041 0.139 0.101 0.076 0.078 0.052 0.044 0.026 0.016 76 S 0.266 0.144 0.046 0.113 0.093 0.084 0.085 0.060 0.048 0.034 0.026 77 K 0.309 0.240 0.069 0.154 0.095 0.058 0.034 0.018 0.013 0.006 0.003 78 H 0.114 0.111 0.044 0.118 0.110 0.110 0.129 0.088 0.078 0.058 0.039 79 S 0.103 0.088 0.038 0.136 0.134 0.139 0.141 0.081 0.068 0.042 0.029 80 D 0.100 0.094 0.097 0.167 0.135 0.118 0.109 0.065 0.061 0.035 0.018 81 Y 0.009 0.015 0.021 0.078 0.094 0.122 0.211 0.152 0.119 0.101 0.078 82 I 0.002 0.003 0.010 0.012 0.016 0.026 0.079 0.117 0.217 0.256 0.263 83 N 0.004 0.011 0.024 0.074 0.097 0.112 0.203 0.167 0.132 0.104 0.073 84 A 0.007 0.009 0.046 0.044 0.053 0.065 0.116 0.120 0.192 0.189 0.161 85 N 0.008 0.011 0.020 0.054 0.077 0.105 0.225 0.154 0.150 0.117 0.079 86 Y 0.018 0.031 0.036 0.093 0.099 0.096 0.161 0.158 0.144 0.106 0.059 87 V 0.003 0.003 0.004 0.007 0.013 0.030 0.093 0.146 0.226 0.236 0.240 88 D 0.124 0.157 0.105 0.212 0.160 0.101 0.071 0.036 0.021 0.009 0.005 89 G 0.040 0.037 0.040 0.066 0.067 0.083 0.158 0.121 0.148 0.134 0.105 90 Y 0.174 0.121 0.043 0.116 0.116 0.109 0.135 0.076 0.056 0.031 0.023 91 N 0.256 0.199 0.084 0.164 0.095 0.068 0.060 0.031 0.024 0.012 0.006 92 K 0.155 0.155 0.072 0.163 0.127 0.107 0.104 0.054 0.031 0.020 0.012 93 A 0.182 0.173 0.083 0.154 0.124 0.095 0.084 0.045 0.034 0.018 0.009 94 K 0.072 0.074 0.070 0.169 0.148 0.148 0.149 0.065 0.053 0.034 0.018 95 A 0.046 0.058 0.100 0.178 0.169 0.157 0.139 0.067 0.048 0.027 0.012 96 Y 0.001 0.002 0.007 0.021 0.035 0.069 0.210 0.195 0.173 0.164 0.121 97 I 0.002 0.004 0.020 0.027 0.031 0.038 0.100 0.159 0.198 0.217 0.205 98 A 0.001 0.001 0.008 0.007 0.013 0.021 0.065 0.125 0.221 0.271 0.266 99 T 0.005 0.011 0.031 0.044 0.069 0.091 0.157 0.158 0.180 0.139 0.116 100 Q 0.014 0.018 0.024 0.067 0.086 0.110 0.194 0.142 0.151 0.112 0.082 101 G 0.069 0.057 0.031 0.104 0.094 0.102 0.168 0.125 0.113 0.082 0.055 102 P 0.066 0.082 0.029 0.091 0.079 0.085 0.142 0.123 0.127 0.097 0.079 103 L 0.071 0.073 0.026 0.090 0.102 0.119 0.190 0.112 0.096 0.069 0.053 104 K 0.409 0.171 0.097 0.158 0.088 0.038 0.021 0.008 0.006 0.003 0.001 105 S 0.300 0.137 0.064 0.145 0.102 0.088 0.083 0.038 0.024 0.012 0.006 106 T 0.096 0.177 0.048 0.106 0.100 0.093 0.117 0.106 0.081 0.047 0.029 107 F 0.023 0.028 0.016 0.048 0.069 0.125 0.205 0.165 0.143 0.098 0.079 108 E 0.258 0.163 0.235 0.186 0.096 0.039 0.013 0.005 0.003 0.001 0.001 109 D 0.022 0.032 0.040 0.145 0.160 0.176 0.223 0.106 0.054 0.030 0.013 110 F 0.001 0.002 0.006 0.006 0.007 0.013 0.048 0.085 0.231 0.290 0.310 111 W 0.002 0.006 0.026 0.050 0.084 0.150 0.255 0.158 0.134 0.088 0.046 112 R 0.004 0.020 0.226 0.156 0.138 0.142 0.143 0.078 0.047 0.032 0.015 113 M 0.001 0.003 0.013 0.026 0.038 0.081 0.248 0.220 0.165 0.128 0.077 114 I 0.005 0.004 0.018 0.015 0.016 0.024 0.080 0.136 0.244 0.262 0.198 115 W 0.009 0.021 0.066 0.077 0.095 0.120 0.199 0.134 0.129 0.094 0.055 116 E 0.016 0.040 0.121 0.131 0.148 0.163 0.179 0.074 0.060 0.043 0.025 117 Q 0.039 0.058 0.084 0.167 0.107 0.124 0.205 0.082 0.061 0.048 0.026 118 N 0.070 0.123 0.082 0.199 0.150 0.125 0.127 0.066 0.032 0.019 0.007 119 T 0.006 0.006 0.006 0.013 0.020 0.054 0.142 0.164 0.206 0.203 0.180 120 G 0.058 0.093 0.068 0.214 0.208 0.159 0.103 0.049 0.028 0.012 0.007 121 I 0.001 0.004 0.008 0.026 0.041 0.058 0.151 0.145 0.187 0.204 0.175 122 I 0.001 0.001 0.003 0.007 0.012 0.017 0.063 0.108 0.216 0.251 0.320 123 V 0.001 0.001 0.004 0.009 0.017 0.029 0.103 0.156 0.245 0.228 0.207 124 M 0.001 0.002 0.018 0.026 0.040 0.048 0.127 0.169 0.200 0.191 0.179 125 I 0.001 0.001 0.005 0.007 0.013 0.024 0.092 0.145 0.246 0.235 0.231 126 T 0.004 0.006 0.017 0.025 0.035 0.053 0.144 0.167 0.216 0.188 0.144 127 N 0.059 0.078 0.100 0.190 0.182 0.151 0.131 0.056 0.032 0.014 0.006 128 L 0.051 0.039 0.044 0.074 0.079 0.116 0.205 0.130 0.125 0.083 0.054 129 V 0.165 0.126 0.076 0.157 0.114 0.099 0.129 0.058 0.041 0.022 0.013 130 E 0.116 0.097 0.095 0.135 0.103 0.103 0.154 0.075 0.057 0.040 0.025 131 K 0.169 0.163 0.144 0.167 0.124 0.093 0.078 0.032 0.017 0.009 0.005 132 G 0.240 0.189 0.130 0.161 0.100 0.071 0.057 0.026 0.016 0.007 0.003 133 R 0.265 0.116 0.092 0.127 0.114 0.098 0.085 0.045 0.031 0.017 0.008 134 R 0.262 0.130 0.128 0.142 0.100 0.082 0.071 0.036 0.027 0.013 0.007 135 K 0.059 0.091 0.097 0.166 0.135 0.124 0.146 0.082 0.051 0.032 0.018 136 C 0.015 0.023 0.035 0.048 0.058 0.087 0.169 0.158 0.152 0.141 0.113 137 D 0.071 0.079 0.109 0.181 0.147 0.131 0.119 0.065 0.050 0.030 0.018 138 Q 0.080 0.066 0.118 0.189 0.151 0.122 0.121 0.058 0.049 0.032 0.015 139 Y 0.034 0.022 0.027 0.057 0.060 0.074 0.167 0.138 0.157 0.151 0.113 140 W 0.034 0.043 0.026 0.069 0.074 0.094 0.176 0.160 0.140 0.103 0.080 141 P 0.069 0.114 0.086 0.133 0.107 0.095 0.123 0.095 0.076 0.057 0.044 142 T 0.290 0.170 0.068 0.151 0.121 0.076 0.058 0.031 0.018 0.010 0.006 143 E 0.582 0.162 0.040 0.076 0.057 0.033 0.020 0.013 0.011 0.005 0.002 144 N 0.379 0.204 0.033 0.119 0.090 0.062 0.052 0.028 0.019 0.008 0.004 145 S 0.184 0.096 0.039 0.105 0.110 0.104 0.135 0.085 0.069 0.043 0.029 146 E 0.239 0.142 0.170 0.174 0.101 0.062 0.051 0.024 0.019 0.011 0.007 147 E 0.120 0.188 0.130 0.231 0.138 0.085 0.062 0.027 0.011 0.005 0.002 148 Y 0.020 0.021 0.017 0.032 0.047 0.072 0.160 0.180 0.159 0.155 0.136 149 G 0.282 0.216 0.075 0.178 0.109 0.064 0.038 0.020 0.011 0.004 0.002 150 N 0.273 0.156 0.137 0.179 0.132 0.064 0.026 0.016 0.011 0.005 0.001 151 I 0.019 0.013 0.009 0.020 0.037 0.072 0.169 0.179 0.191 0.163 0.128 152 I 0.082 0.143 0.055 0.245 0.181 0.114 0.080 0.054 0.029 0.012 0.005 153 V 0.005 0.004 0.014 0.010 0.016 0.034 0.090 0.143 0.214 0.257 0.212 154 T 0.101 0.197 0.106 0.277 0.164 0.085 0.042 0.017 0.007 0.003 0.001 155 L 0.025 0.024 0.021 0.037 0.038 0.063 0.151 0.144 0.198 0.179 0.120 156 K 0.225 0.227 0.067 0.182 0.124 0.073 0.053 0.024 0.013 0.007 0.004 157 S 0.335 0.207 0.087 0.152 0.088 0.060 0.039 0.017 0.011 0.004 0.001 158 T 0.307 0.129 0.104 0.127 0.099 0.082 0.068 0.036 0.025 0.014 0.007 159 K 0.197 0.187 0.116 0.178 0.113 0.087 0.072 0.027 0.015 0.006 0.003 160 I 0.052 0.061 0.113 0.120 0.098 0.114 0.173 0.104 0.078 0.057 0.031 161 H 0.072 0.088 0.189 0.180 0.134 0.122 0.113 0.048 0.028 0.017 0.009 162 A 0.090 0.106 0.238 0.185 0.119 0.103 0.081 0.037 0.025 0.012 0.004 163 C 0.042 0.045 0.077 0.114 0.112 0.137 0.189 0.117 0.082 0.056 0.028 164 Y 0.042 0.040 0.058 0.072 0.078 0.111 0.185 0.147 0.127 0.085 0.054 165 T 0.057 0.104 0.129 0.205 0.137 0.112 0.112 0.067 0.042 0.023 0.012 166 V 0.029 0.033 0.078 0.075 0.084 0.103 0.162 0.116 0.127 0.112 0.081 167 R 0.076 0.082 0.092 0.173 0.133 0.119 0.147 0.069 0.054 0.036 0.019 168 R 0.083 0.102 0.114 0.211 0.161 0.121 0.102 0.051 0.032 0.017 0.006 169 F 0.020 0.016 0.028 0.033 0.042 0.076 0.172 0.163 0.173 0.161 0.116 170 S 0.115 0.165 0.109 0.238 0.149 0.094 0.069 0.033 0.016 0.008 0.003 171 I 0.031 0.027 0.048 0.048 0.057 0.082 0.152 0.138 0.156 0.155 0.107 172 R 0.140 0.178 0.093 0.205 0.139 0.095 0.081 0.034 0.019 0.011 0.007 173 N 0.160 0.127 0.074 0.158 0.119 0.100 0.107 0.063 0.049 0.030 0.013 174 T 0.179 0.091 0.057 0.103 0.101 0.097 0.118 0.086 0.073 0.057 0.038 175 K 0.254 0.227 0.074 0.175 0.108 0.069 0.046 0.024 0.015 0.006 0.003 176 V 0.046 0.042 0.027 0.060 0.071 0.090 0.157 0.140 0.140 0.130 0.098 177 K 0.215 0.175 0.077 0.174 0.123 0.081 0.069 0.036 0.024 0.015 0.010 178 K 0.197 0.147 0.077 0.174 0.119 0.088 0.079 0.048 0.037 0.023 0.011 179 G 0.146 0.106 0.045 0.113 0.115 0.105 0.121 0.090 0.071 0.052 0.036 180 Q 0.192 0.129 0.041 0.130 0.103 0.091 0.108 0.075 0.064 0.041 0.027 181 K 0.231 0.159 0.068 0.160 0.125 0.082 0.067 0.043 0.033 0.020 0.011 182 G 0.227 0.140 0.060 0.116 0.098 0.085 0.093 0.065 0.054 0.036 0.025 183 N 0.208 0.166 0.039 0.159 0.126 0.092 0.091 0.053 0.035 0.019 0.012 184 P 0.380 0.154 0.059 0.100 0.079 0.059 0.056 0.041 0.037 0.022 0.013 185 K 0.361 0.190 0.053 0.153 0.101 0.060 0.042 0.020 0.012 0.005 0.003 186 G 0.399 0.195 0.073 0.101 0.075 0.052 0.043 0.026 0.021 0.010 0.005 187 R 0.241 0.171 0.044 0.151 0.117 0.088 0.088 0.049 0.028 0.015 0.009 188 Q 0.443 0.212 0.098 0.099 0.063 0.037 0.022 0.013 0.008 0.003 0.002 189 N 0.236 0.187 0.085 0.175 0.120 0.082 0.058 0.028 0.016 0.008 0.004 190 E 0.293 0.167 0.103 0.129 0.111 0.084 0.053 0.029 0.020 0.008 0.004 191 R 0.071 0.056 0.057 0.115 0.111 0.131 0.170 0.110 0.088 0.057 0.034 192 V 0.079 0.124 0.141 0.207 0.160 0.121 0.083 0.046 0.023 0.010 0.004 193 V 0.003 0.004 0.014 0.017 0.023 0.045 0.114 0.142 0.204 0.231 0.204 194 I 0.027 0.051 0.083 0.137 0.147 0.155 0.167 0.100 0.068 0.041 0.025 195 Q 0.012 0.020 0.053 0.097 0.089 0.103 0.168 0.131 0.140 0.118 0.069 196 Y 0.014 0.015 0.028 0.044 0.059 0.088 0.171 0.150 0.160 0.150 0.121 197 H 0.026 0.051 0.045 0.131 0.107 0.106 0.166 0.123 0.114 0.081 0.050 198 Y 0.014 0.017 0.024 0.043 0.056 0.078 0.157 0.143 0.163 0.172 0.134 199 T 0.085 0.080 0.070 0.146 0.134 0.119 0.135 0.079 0.070 0.049 0.034 200 Q 0.128 0.113 0.070 0.178 0.137 0.106 0.110 0.064 0.049 0.030 0.014 201 W 0.040 0.027 0.016 0.040 0.049 0.066 0.135 0.142 0.159 0.167 0.159 202 P 0.123 0.151 0.042 0.140 0.120 0.103 0.117 0.076 0.061 0.038 0.029 203 D 0.154 0.150 0.066 0.163 0.126 0.088 0.085 0.060 0.049 0.037 0.022 204 M 0.194 0.088 0.028 0.092 0.112 0.110 0.117 0.088 0.076 0.055 0.041 205 G 0.394 0.199 0.044 0.127 0.085 0.055 0.037 0.025 0.021 0.009 0.005 206 V 0.045 0.049 0.016 0.067 0.075 0.085 0.145 0.137 0.137 0.127 0.116 207 P 0.097 0.083 0.028 0.080 0.089 0.094 0.137 0.119 0.113 0.084 0.075 208 E 0.270 0.186 0.098 0.220 0.100 0.052 0.034 0.016 0.012 0.007 0.004 209 Y 0.109 0.142 0.055 0.126 0.135 0.124 0.120 0.073 0.057 0.038 0.022 210 A 0.100 0.102 0.024 0.117 0.106 0.114 0.148 0.109 0.093 0.053 0.033 211 L 0.200 0.093 0.053 0.151 0.118 0.111 0.108 0.066 0.051 0.031 0.018 212 P 0.073 0.143 0.097 0.198 0.180 0.126 0.087 0.051 0.027 0.012 0.005 213 V 0.003 0.008 0.010 0.022 0.026 0.042 0.106 0.145 0.228 0.214 0.196 214 L 0.006 0.005 0.012 0.025 0.055 0.102 0.202 0.192 0.185 0.134 0.082 215 T 0.027 0.056 0.211 0.328 0.181 0.097 0.059 0.025 0.011 0.004 0.002 216 F 0.001 0.002 0.009 0.011 0.017 0.036 0.121 0.171 0.243 0.234 0.156 217 V 0.001 0.001 0.005 0.006 0.013 0.033 0.119 0.164 0.259 0.237 0.162 218 R 0.018 0.034 0.313 0.216 0.154 0.114 0.091 0.030 0.017 0.010 0.003 219 R 0.006 0.030 0.128 0.183 0.169 0.197 0.183 0.072 0.021 0.009 0.002 220 S 0.001 0.001 0.003 0.002 0.003 0.008 0.053 0.103 0.242 0.303 0.283 221 S 0.033 0.048 0.102 0.162 0.190 0.181 0.182 0.054 0.026 0.016 0.006 222 A 0.046 0.059 0.533 0.195 0.082 0.042 0.025 0.008 0.005 0.003 0.001 223 A 0.031 0.024 0.067 0.078 0.084 0.140 0.315 0.116 0.074 0.046 0.026 224 R 0.099 0.089 0.077 0.110 0.076 0.091 0.180 0.111 0.080 0.056 0.031 225 M 0.123 0.137 0.167 0.158 0.109 0.088 0.096 0.056 0.032 0.022 0.013 226 P 0.343 0.239 0.123 0.116 0.077 0.047 0.028 0.016 0.007 0.004 0.002 227 E 0.504 0.216 0.038 0.082 0.063 0.041 0.024 0.016 0.010 0.004 0.002 228 T 0.449 0.200 0.035 0.102 0.084 0.054 0.032 0.019 0.015 0.007 0.004 229 G 0.112 0.093 0.030 0.119 0.131 0.136 0.138 0.086 0.079 0.045 0.031 230 P 0.020 0.036 0.031 0.127 0.135 0.148 0.172 0.118 0.097 0.066 0.050 231 V 0.001 0.002 0.007 0.018 0.027 0.046 0.128 0.154 0.198 0.217 0.202 232 L 0.001 0.002 0.010 0.022 0.033 0.043 0.104 0.162 0.196 0.215 0.211 233 V 0.001 0.001 0.004 0.005 0.009 0.015 0.053 0.110 0.232 0.282 0.288 234 H 0.003 0.006 0.016 0.031 0.049 0.063 0.126 0.167 0.197 0.178 0.165 235 C 0.003 0.006 0.008 0.020 0.032 0.054 0.133 0.146 0.218 0.199 0.181 236 S 0.056 0.067 0.048 0.126 0.128 0.129 0.148 0.102 0.094 0.062 0.042 237 A 0.034 0.037 0.018 0.074 0.080 0.110 0.192 0.133 0.130 0.109 0.083 238 G 0.081 0.081 0.033 0.099 0.099 0.103 0.134 0.110 0.110 0.085 0.065 239 V 0.027 0.026 0.014 0.054 0.062 0.090 0.164 0.132 0.152 0.141 0.137 240 G 0.067 0.088 0.058 0.141 0.132 0.118 0.124 0.082 0.081 0.061 0.048 241 R 0.010 0.017 0.012 0.059 0.069 0.094 0.182 0.134 0.145 0.145 0.132 242 T 0.011 0.018 0.014 0.053 0.060 0.075 0.141 0.134 0.169 0.170 0.154 243 G 0.003 0.008 0.007 0.040 0.061 0.086 0.171 0.150 0.175 0.162 0.137 244 T 0.001 0.003 0.005 0.021 0.036 0.055 0.129 0.138 0.208 0.206 0.196 245 Y 0.001 0.001 0.003 0.013 0.026 0.041 0.130 0.158 0.220 0.208 0.200 246 I 0.001 0.001 0.003 0.009 0.016 0.021 0.087 0.154 0.215 0.249 0.245 247 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.009 0.037 0.109 0.235 0.285 0.316 248 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.013 0.054 0.118 0.268 0.255 0.283 249 D 0.003 0.007 0.032 0.071 0.129 0.166 0.242 0.166 0.105 0.052 0.027 250 S 0.001 0.003 0.007 0.028 0.047 0.087 0.249 0.219 0.163 0.115 0.082 251 M 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.006 0.032 0.087 0.249 0.302 0.315 252 L 0.001 0.002 0.007 0.022 0.056 0.112 0.271 0.179 0.152 0.121 0.077 253 Q 0.022 0.034 0.309 0.201 0.143 0.107 0.097 0.039 0.025 0.015 0.006 254 Q 0.005 0.012 0.033 0.107 0.114 0.163 0.317 0.133 0.069 0.034 0.014 255 I 0.001 0.001 0.004 0.002 0.003 0.007 0.049 0.095 0.225 0.329 0.285 256 K 0.019 0.064 0.137 0.233 0.212 0.149 0.129 0.031 0.013 0.008 0.004 257 D 0.087 0.141 0.371 0.168 0.090 0.063 0.045 0.020 0.010 0.005 0.002 258 K 0.245 0.117 0.083 0.142 0.115 0.106 0.106 0.046 0.024 0.011 0.006 259 S 0.393 0.184 0.061 0.083 0.066 0.068 0.066 0.035 0.026 0.011 0.005 260 T 0.166 0.125 0.109 0.210 0.153 0.092 0.066 0.037 0.024 0.012 0.006 261 V 0.049 0.025 0.036 0.039 0.052 0.095 0.183 0.166 0.145 0.113 0.097 262 N 0.037 0.145 0.088 0.269 0.176 0.117 0.083 0.046 0.023 0.011 0.007 263 V 0.001 0.004 0.007 0.010 0.013 0.026 0.079 0.108 0.203 0.271 0.278 264 L 0.031 0.028 0.024 0.116 0.164 0.176 0.194 0.111 0.080 0.047 0.028 265 G 0.111 0.088 0.125 0.263 0.155 0.104 0.076 0.041 0.024 0.010 0.003 266 F 0.001 0.004 0.006 0.016 0.024 0.037 0.110 0.163 0.228 0.227 0.185 267 L 0.001 0.001 0.002 0.003 0.005 0.015 0.064 0.129 0.267 0.265 0.248 268 K 0.014 0.030 0.246 0.212 0.200 0.134 0.095 0.034 0.020 0.011 0.004 269 H 0.011 0.036 0.173 0.197 0.171 0.188 0.144 0.054 0.017 0.007 0.002 270 I 0.001 0.001 0.004 0.003 0.004 0.010 0.060 0.101 0.256 0.297 0.263 271 R 0.013 0.018 0.039 0.064 0.095 0.157 0.285 0.142 0.092 0.065 0.032 272 T 0.023 0.053 0.470 0.192 0.103 0.070 0.047 0.018 0.013 0.008 0.003 273 Q 0.012 0.027 0.077 0.099 0.104 0.168 0.283 0.109 0.060 0.038 0.022 274 R 0.019 0.024 0.029 0.050 0.045 0.072 0.189 0.159 0.170 0.149 0.094 275 N 0.041 0.043 0.088 0.132 0.120 0.138 0.180 0.092 0.076 0.055 0.034 276 Y 0.050 0.061 0.147 0.163 0.144 0.135 0.142 0.068 0.049 0.028 0.014 277 L 0.020 0.019 0.039 0.070 0.068 0.085 0.184 0.138 0.154 0.129 0.095 278 V 0.027 0.023 0.036 0.045 0.047 0.068 0.162 0.155 0.171 0.148 0.117 279 Q 0.034 0.097 0.104 0.169 0.132 0.117 0.142 0.084 0.059 0.037 0.025 280 T 0.053 0.095 0.086 0.106 0.106 0.124 0.153 0.105 0.085 0.055 0.032 281 E 0.279 0.155 0.088 0.178 0.133 0.084 0.046 0.019 0.012 0.005 0.002 282 E 0.277 0.125 0.107 0.173 0.102 0.084 0.070 0.030 0.020 0.009 0.003 283 Q 0.013 0.034 0.040 0.086 0.101 0.132 0.217 0.134 0.116 0.081 0.047 284 Y 0.002 0.005 0.022 0.025 0.033 0.079 0.204 0.147 0.190 0.169 0.123 285 I 0.011 0.023 0.236 0.218 0.156 0.136 0.127 0.046 0.024 0.017 0.007 286 F 0.002 0.008 0.043 0.080 0.086 0.132 0.277 0.179 0.089 0.071 0.035 287 I 0.001 0.001 0.003 0.002 0.003 0.007 0.035 0.082 0.232 0.311 0.323 288 H 0.002 0.003 0.010 0.023 0.052 0.116 0.236 0.179 0.180 0.124 0.075 289 D 0.010 0.027 0.155 0.216 0.212 0.154 0.118 0.056 0.031 0.015 0.006 290 A 0.001 0.001 0.003 0.008 0.015 0.033 0.158 0.189 0.211 0.205 0.180 291 L 0.001 0.001 0.002 0.002 0.002 0.004 0.023 0.072 0.230 0.318 0.346 292 L 0.001 0.002 0.031 0.028 0.059 0.099 0.223 0.159 0.169 0.140 0.090 293 E 0.004 0.015 0.178 0.143 0.158 0.167 0.187 0.072 0.042 0.023 0.011 294 A 0.002 0.005 0.019 0.032 0.034 0.064 0.219 0.179 0.196 0.155 0.096 295 I 0.007 0.007 0.015 0.016 0.020 0.038 0.145 0.166 0.203 0.216 0.168 296 L 0.063 0.095 0.149 0.193 0.153 0.127 0.120 0.048 0.028 0.016 0.009 297 G 0.133 0.122 0.177 0.151 0.125 0.109 0.093 0.042 0.028 0.015 0.007