PFRMAT QA TARGET T0301 AUTHOR 7072-3475-1278 METHOD linear combination of alignment based constraints and METHOD undertaker cost functions MODEL 1 QMODE 1 MetaTasser_TS3 0.549 MetaTasser_TS2 0.548 MetaTasser_TS1 0.546 MetaTasser_TS5 0.540 MetaTasser_TS4 0.537 Zhang-Server_TS1 0.533 RAPTOR_TS5 0.532 SP4_TS2 0.522 Zhang-Server_TS2 0.522 FAMS_TS3 0.520 FUNCTION_TS2 0.520 RAPTOR_TS4 0.519 RAPTOR_TS1 0.515 RAPTOR-ACE_TS1 0.513 RAPTOR_TS2 0.510 BayesHH_TS1 0.508 RAPTORESS_TS2 0.507 RAPTORESS_TS1 0.507 RAPTOR-ACE_TS2 0.504 SP3_TS1 0.504 Ma-OPUS-server_TS2 0.502 Pcons6_TS4 0.501 Pmodeller6_TS3 0.501 FUNCTION_TS4 0.501 Ma-OPUS-server_TS1 0.500 RAPTORESS_TS3 0.498 3D-JIGSAW_TS1 0.497 ROBETTA_TS1 0.495 FUNCTION_TS1 0.494 CIRCLE_TS4 0.494 CIRCLE_TS2 0.491 FAMS_TS2 0.491 3D-JIGSAW_RECOM_TS3 0.490 3D-JIGSAW_POPULUS_TS1 0.488 3D-JIGSAW_POPULUS_TS5 0.488 beautshot_TS1 0.487 ROBETTA_TS5 0.487 3D-JIGSAW_POPULUS_TS3 0.486 3D-JIGSAW_POPULUS_TS4 0.486 SAM_T06_server_TS1 0.485 3D-JIGSAW_POPULUS_TS2 0.485 ROBETTA_TS2 0.482 SP4_TS1 0.481 Ma-OPUS-server_TS3 0.481 RAPTORESS_TS5 0.480 GeneSilicoMetaServer_TS4 0.478 HHpred1_TS1 0.477 RAPTORESS_TS4 0.475 SPARKS2_TS2 0.475 SPARKS2_TS3 0.463 ROBETTA_TS4 0.460 Zhang-Server_TS4 0.460 shub_TS1 0.459 FAMS_TS4 0.459 FUNCTION_TS5 0.459 FAMS_TS1 0.459 UNI-EID_expm_TS1 0.456 RAPTOR-ACE_TS5 0.454 Zhang-Server_TS5 0.454 ROBETTA_TS3 0.453 RAPTOR-ACE_TS4 0.452 SAM_T06_server_TS5 0.452 SPARKS2_TS5 0.450 SP4_TS3 0.448 HHpred2_TS1 0.447 HHpred3_TS1 0.447 SPARKS2_TS4 0.446 Zhang-Server_TS3 0.441 Pmodeller6_TS1 0.440 CIRCLE_TS3 0.439 FAMSD_TS2 0.439 FAMS_TS5 0.439 SPARKS2_TS1 0.436 GeneSilicoMetaServer_TS1 0.435 beautshotbase_TS1 0.434 CIRCLE_TS1 0.432 FAMSD_TS1 0.432 Pcons6_TS5 0.430 SP4_TS4 0.430 SAM_T06_server_TS4 0.427 PROTINFO_TS3 0.424 karypis.srv_TS1 0.420 karypis.srv.2_TS1 0.420 keasar-server_TS3 0.415 Pcons6_TS3 0.410 PROTINFO_TS1 0.410 RAPTOR-ACE_TS3 0.407 GeneSilicoMetaServer_TS3 0.405 keasar-server_TS1 0.404 Bilab-ENABLE_TS2 0.404 SP3_TS2 0.402 Pcons6_TS1 0.400 Pmodeller6_TS2 0.400 SP3_TS4 0.396 FUGMOD_TS2 0.394 PROTINFO_TS4 0.394 Pcons6_TS2 0.391 Pmodeller6_TS4 0.391 keasar-server_TS5 0.391 SP3_TS5 0.390 Ma-OPUS-server_TS5 0.389 FUNCTION_TS3 0.386 keasar-server_TS2 0.383 Pmodeller6_TS5 0.380 SAM_T06_server_TS3 0.377 CIRCLE_TS5 0.375 SP4_TS5 0.372 SP3_TS3 0.370 Bilab-ENABLE_TS1 0.370 FAMSD_TS4 0.370 FUGMOD_TS1 0.369 GeneSilicoMetaServer_TS2 0.368 3D-JIGSAW_TS5 0.366 Phyre-2_TS2 0.365 nFOLD_TS5 0.360 keasar-server_TS4 0.359 PROTINFO_TS2 0.358 Phyre-2_TS4 0.354 karypis.srv.2_TS3 0.352 Phyre-2_TS1 0.352 RAPTOR_TS3 0.349 3D-JIGSAW_TS4 0.346 nFOLD_TS1 0.339 FAMSD_TS3 0.326 PROTINFO-AB_TS5 0.322 PROTINFO-AB_TS3 0.319 PROTINFO-AB_TS4 0.316 mGen-3D_TS1 0.316 PROTINFO-AB_TS2 0.315 PROTINFO_TS5 0.315 PROTINFO-AB_TS1 0.313 CaspIta-FOX_TS1 0.310 3Dpro_TS2 0.306 Phyre-2_TS5 0.306 nFOLD_TS4 0.300 3Dpro_TS1 0.297 FOLDpro_TS1 0.297 ABIpro_TS2 0.295 ABIpro_TS4 0.291 GeneSilicoMetaServer_TS5 0.284 ABIpro_TS3 0.284 FUGMOD_TS3 0.283 ABIpro_TS1 0.281 nFOLD_TS3 0.271 SAM_T06_server_TS2 0.268 3Dpro_TS4 0.268 SAM-T02_AL1 0.267 karypis.srv_TS4 0.265 ABIpro_TS5 0.264 FUGUE_AL2 0.262 FOLDpro_TS4 0.261 nFOLD_TS2 0.260 SAM-T02_AL4 0.257 FUGUE_AL1 0.254 FOLDpro_TS5 0.254 FORTE2_AL3 0.252 FOLDpro_TS2 0.251 Phyre-1_TS1 0.250 FAMSD_TS5 0.248 SAM-T02_AL2 0.248 SAM-T02_AL3 0.248 karypis.srv_TS2 0.248 karypis.srv_TS3 0.248 3D-JIGSAW_TS2 0.247 Phyre-2_TS3 0.245 karypis.srv_TS5 0.245 3Dpro_TS5 0.242 UNI-EID_bnmx_TS4 0.240 LOOPP_TS1 0.237 NN_PUT_lab_TS1 0.237 UNI-EID_sfst_AL2 0.235 LOOPP_TS2 0.234 FORTE1_AL1 0.230 3D-JIGSAW_RECOM_TS1 0.229 3D-JIGSAW_RECOM_TS4 0.229 3D-JIGSAW_RECOM_TS5 0.228 UNI-EID_bnmx_TS3 0.226 FORTE1_AL4 0.226 FORTE2_AL2 0.226 FUGUE_AL3 0.226 CaspIta-FOX_TS5 0.226 3D-JIGSAW_RECOM_TS2 0.225 UNI-EID_bnmx_TS1 0.225 karypis.srv.2_TS4 0.223 karypis.srv.2_TS5 0.220 LOOPP_TS4 0.218 CaspIta-FOX_TS3 0.216 karypis.srv.2_TS2 0.216 FORTE1_AL2 0.216 FORTE1_AL5 0.215 FORTE2_AL4 0.215 SAM-T99_AL5 0.215 Huber-Torda-Server_TS4 0.214 FOLDpro_TS3 0.213 UNI-EID_sfst_AL1 0.210 UNI-EID_bnmx_TS2 0.209 3D-JIGSAW_TS3 0.209 LOOPP_TS3 0.209 CaspIta-FOX_TS2 0.207 Distill_TS2 0.207 UNI-EID_sfst_AL3 0.207 3Dpro_TS3 0.207 POMYSL_TS4 0.206 Huber-Torda-Server_TS3 0.206 Huber-Torda-Server_TS1 0.206 Ma-OPUS-server_TS4 0.206 Distill_TS3 0.206 Distill_TS4 0.205 UNI-EID_sfst_AL4 0.204 Distill_TS1 0.204 POMYSL_TS1 0.204 LOOPP_TS5 0.203 Distill_TS5 0.202 FORTE2_AL5 0.200 CaspIta-FOX_TS4 0.198 forecast-s_AL4 0.195 forecast-s_AL5 0.192 FUGUE_AL4 0.190 Huber-Torda-Server_TS5 0.189 POMYSL_TS5 0.188 gtg_AL1 0.186 forecast-s_AL1 0.186 gtg_AL4 0.186 Huber-Torda-Server_TS2 0.185 gtg_AL5 0.185 FUGMOD_TS5 0.185 gtg_AL2 0.185 forecast-s_AL2 0.185 FORTE1_AL3 0.185 FORTE2_AL1 0.185 FUGUE_AL5 0.185 FPSOLVER-SERVER_TS1 0.182 gtg_AL3 0.181 FPSOLVER-SERVER_TS4 0.180 SAM-T99_AL3 0.179 SAM-T99_AL2 0.179 panther2_TS1 0.179 forecast-s_AL3 0.179 SAM-T99_AL1 0.177 FPSOLVER-SERVER_TS2 0.177 POMYSL_TS3 0.177 SAM-T99_AL4 0.176 POMYSL_TS2 0.173 FPSOLVER-SERVER_TS3 0.173 SAM-T02_AL5 0.169 karypis.srv.4_TS1 0.159 FPSOLVER-SERVER_TS5 0.158 karypis.srv.4_TS3 0.153 karypis.srv.4_TS4 0.153 karypis.srv.4_TS2 0.151 FUGMOD_TS4 0.140 karypis.srv.4_TS5 0.138 END