# TARGET T0296 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0296.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 13.3628 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 T 0.028 0.071 0.033 0.084 0.090 0.104 0.141 0.131 0.134 0.108 0.077 2 P 0.064 0.107 0.048 0.138 0.136 0.133 0.126 0.084 0.074 0.052 0.036 3 I 0.040 0.019 0.014 0.038 0.052 0.069 0.138 0.147 0.192 0.163 0.129 4 S 0.098 0.072 0.057 0.144 0.127 0.111 0.139 0.088 0.076 0.050 0.037 5 L 0.026 0.036 0.052 0.112 0.105 0.125 0.155 0.121 0.122 0.086 0.059 6 I 0.014 0.021 0.031 0.056 0.063 0.088 0.163 0.154 0.155 0.141 0.112 7 G 0.025 0.027 0.051 0.056 0.068 0.083 0.166 0.141 0.156 0.133 0.093 8 A 0.099 0.104 0.131 0.186 0.152 0.110 0.110 0.046 0.031 0.019 0.011 9 A 0.122 0.096 0.083 0.140 0.114 0.109 0.136 0.069 0.061 0.041 0.029 10 T 0.056 0.046 0.032 0.056 0.074 0.100 0.173 0.137 0.132 0.113 0.081 11 D 0.277 0.404 0.097 0.117 0.051 0.026 0.016 0.006 0.003 0.002 0.001 12 A 0.206 0.097 0.050 0.106 0.121 0.134 0.138 0.066 0.044 0.024 0.013 13 T 0.589 0.173 0.057 0.091 0.046 0.020 0.014 0.005 0.003 0.001 0.001 14 D 0.054 0.168 0.086 0.263 0.173 0.117 0.080 0.030 0.017 0.007 0.004 15 Y 0.005 0.012 0.014 0.029 0.046 0.093 0.185 0.191 0.198 0.140 0.087 16 V 0.026 0.019 0.052 0.090 0.135 0.208 0.252 0.107 0.066 0.030 0.014 17 V 0.020 0.068 0.333 0.318 0.141 0.064 0.036 0.011 0.005 0.002 0.001 18 L 0.001 0.003 0.012 0.021 0.026 0.055 0.187 0.198 0.205 0.176 0.115 19 A 0.001 0.001 0.010 0.007 0.013 0.036 0.156 0.184 0.224 0.204 0.164 20 K 0.005 0.013 0.420 0.241 0.154 0.088 0.053 0.015 0.006 0.003 0.001 21 A 0.001 0.005 0.067 0.095 0.168 0.228 0.234 0.103 0.054 0.032 0.013 22 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.036 0.078 0.222 0.314 0.343 23 D 0.004 0.006 0.054 0.121 0.196 0.227 0.264 0.074 0.036 0.013 0.005 24 K 0.017 0.043 0.726 0.141 0.049 0.018 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 25 A 0.001 0.002 0.006 0.013 0.026 0.083 0.297 0.202 0.172 0.116 0.082 26 A 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.009 0.063 0.127 0.237 0.282 0.274 27 K 0.009 0.035 0.489 0.232 0.143 0.062 0.022 0.005 0.002 0.001 0.001 28 E 0.060 0.100 0.497 0.181 0.089 0.050 0.017 0.004 0.001 0.001 0.001 29 I 0.004 0.004 0.003 0.012 0.026 0.064 0.207 0.197 0.195 0.174 0.115 30 G 0.361 0.245 0.066 0.117 0.073 0.054 0.047 0.016 0.012 0.006 0.005 31 V 0.004 0.005 0.008 0.013 0.018 0.029 0.067 0.099 0.198 0.231 0.328 32 D 0.082 0.149 0.094 0.200 0.157 0.125 0.101 0.042 0.023 0.014 0.013 33 F 0.017 0.032 0.016 0.055 0.068 0.099 0.197 0.162 0.154 0.110 0.089 34 I 0.014 0.009 0.006 0.015 0.019 0.032 0.068 0.096 0.177 0.234 0.329 35 G 0.051 0.051 0.032 0.095 0.104 0.103 0.136 0.114 0.125 0.099 0.090 36 G 0.069 0.066 0.035 0.100 0.092 0.106 0.157 0.114 0.106 0.092 0.065 37 F 0.011 0.017 0.014 0.041 0.049 0.073 0.141 0.137 0.172 0.181 0.164 38 S 0.036 0.039 0.037 0.078 0.076 0.094 0.147 0.124 0.147 0.122 0.099 39 A 0.038 0.030 0.036 0.076 0.075 0.091 0.159 0.131 0.147 0.129 0.087 40 L 0.011 0.014 0.018 0.042 0.047 0.070 0.152 0.149 0.181 0.175 0.142 41 V 0.006 0.010 0.015 0.044 0.063 0.096 0.181 0.176 0.187 0.134 0.088 42 Q 0.043 0.063 0.096 0.181 0.171 0.145 0.139 0.074 0.049 0.026 0.014 43 K 0.190 0.176 0.142 0.187 0.115 0.073 0.065 0.025 0.016 0.008 0.003 44 G 0.302 0.142 0.052 0.121 0.095 0.075 0.089 0.048 0.040 0.024 0.012 45 Y 0.022 0.027 0.016 0.062 0.075 0.095 0.185 0.154 0.157 0.120 0.087 46 Q 0.164 0.280 0.150 0.174 0.095 0.058 0.045 0.017 0.010 0.005 0.003 47 K 0.278 0.193 0.102 0.178 0.109 0.068 0.045 0.016 0.007 0.003 0.001 48 G 0.504 0.182 0.038 0.073 0.060 0.051 0.041 0.021 0.015 0.010 0.007 49 D 0.067 0.173 0.063 0.194 0.173 0.122 0.106 0.048 0.031 0.015 0.007 50 E 0.155 0.121 0.077 0.216 0.199 0.127 0.069 0.020 0.010 0.004 0.002 51 I 0.037 0.067 0.097 0.165 0.160 0.152 0.160 0.081 0.043 0.022 0.016 52 L 0.003 0.011 0.014 0.049 0.079 0.130 0.251 0.192 0.141 0.087 0.042 53 I 0.002 0.002 0.005 0.009 0.015 0.030 0.121 0.176 0.245 0.228 0.166 54 N 0.052 0.088 0.295 0.291 0.147 0.066 0.037 0.013 0.007 0.003 0.002 55 S 0.008 0.045 0.069 0.110 0.116 0.147 0.201 0.119 0.089 0.060 0.037 56 I 0.002 0.004 0.005 0.012 0.018 0.035 0.109 0.147 0.224 0.232 0.212 57 P 0.071 0.038 0.055 0.090 0.115 0.168 0.263 0.096 0.062 0.029 0.014 58 R 0.091 0.099 0.417 0.228 0.098 0.037 0.019 0.005 0.003 0.001 0.001 59 A 0.008 0.012 0.026 0.037 0.042 0.084 0.201 0.158 0.161 0.145 0.126 60 L 0.009 0.010 0.028 0.045 0.056 0.106 0.216 0.167 0.162 0.119 0.081 61 A 0.059 0.086 0.504 0.138 0.090 0.058 0.044 0.011 0.005 0.002 0.002 62 E 0.098 0.146 0.318 0.211 0.104 0.067 0.041 0.009 0.004 0.002 0.001 63 T 0.038 0.033 0.027 0.055 0.082 0.107 0.211 0.140 0.135 0.099 0.072 64 D 0.383 0.187 0.149 0.151 0.065 0.035 0.020 0.006 0.003 0.001 0.001 65 K 0.020 0.051 0.119 0.185 0.210 0.214 0.141 0.036 0.016 0.006 0.002 66 V 0.002 0.004 0.007 0.010 0.010 0.017 0.070 0.130 0.215 0.266 0.268 67 C 0.003 0.010 0.022 0.067 0.108 0.159 0.241 0.156 0.122 0.070 0.043 68 S 0.008 0.027 0.097 0.072 0.073 0.084 0.169 0.145 0.144 0.107 0.076 69 S 0.012 0.014 0.029 0.065 0.061 0.072 0.147 0.167 0.165 0.150 0.117 70 V 0.025 0.027 0.026 0.077 0.104 0.133 0.225 0.148 0.121 0.074 0.041 71 N 0.059 0.097 0.081 0.190 0.169 0.138 0.119 0.063 0.045 0.026 0.013 72 I 0.010 0.017 0.017 0.035 0.037 0.050 0.112 0.142 0.204 0.200 0.176 73 G 0.039 0.038 0.025 0.061 0.071 0.081 0.148 0.130 0.148 0.133 0.125 74 S 0.091 0.113 0.043 0.148 0.137 0.124 0.133 0.080 0.062 0.040 0.029 75 T 0.048 0.058 0.030 0.092 0.109 0.116 0.146 0.125 0.117 0.089 0.071 76 K 0.310 0.171 0.078 0.149 0.107 0.072 0.052 0.025 0.017 0.011 0.008 77 S 0.197 0.128 0.046 0.142 0.118 0.101 0.121 0.061 0.043 0.029 0.016 78 G 0.269 0.148 0.066 0.146 0.113 0.089 0.075 0.037 0.029 0.018 0.011 79 I 0.010 0.018 0.011 0.034 0.045 0.065 0.132 0.139 0.179 0.183 0.185 80 N 0.004 0.042 0.026 0.072 0.076 0.105 0.166 0.141 0.148 0.116 0.105 81 M 0.017 0.013 0.015 0.048 0.091 0.153 0.246 0.154 0.137 0.077 0.048 82 T 0.269 0.129 0.163 0.227 0.111 0.051 0.030 0.010 0.006 0.003 0.002 83 A 0.001 0.007 0.014 0.051 0.068 0.098 0.198 0.176 0.175 0.129 0.083 84 V 0.001 0.001 0.004 0.003 0.004 0.007 0.034 0.079 0.191 0.289 0.387 85 A 0.003 0.006 0.106 0.158 0.219 0.250 0.186 0.043 0.019 0.007 0.002 86 D 0.008 0.028 0.401 0.216 0.159 0.109 0.060 0.013 0.004 0.002 0.001 87 M 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.019 0.128 0.153 0.231 0.262 0.195 88 G 0.001 0.001 0.003 0.004 0.006 0.020 0.124 0.169 0.230 0.237 0.206 89 R 0.024 0.041 0.595 0.212 0.083 0.028 0.011 0.004 0.001 0.001 0.001 90 I 0.001 0.007 0.028 0.061 0.146 0.274 0.309 0.098 0.044 0.023 0.009 91 I 0.001 0.001 0.002 0.002 0.002 0.004 0.031 0.079 0.218 0.314 0.348 92 K 0.011 0.010 0.032 0.099 0.184 0.236 0.275 0.084 0.045 0.017 0.007 93 E 0.022 0.059 0.615 0.186 0.067 0.030 0.013 0.004 0.002 0.001 0.001 94 T 0.002 0.005 0.014 0.024 0.040 0.089 0.254 0.200 0.177 0.124 0.070 95 A 0.009 0.004 0.007 0.010 0.014 0.031 0.126 0.161 0.212 0.210 0.216 96 N 0.107 0.186 0.378 0.186 0.083 0.034 0.017 0.005 0.002 0.001 0.001 97 L 0.018 0.033 0.041 0.084 0.112 0.163 0.217 0.124 0.101 0.069 0.039 98 S 0.424 0.175 0.047 0.089 0.065 0.050 0.054 0.035 0.028 0.021 0.011 99 D 0.508 0.122 0.037 0.099 0.066 0.057 0.053 0.022 0.017 0.010 0.008 100 M 0.079 0.072 0.031 0.092 0.113 0.123 0.182 0.116 0.097 0.062 0.033 101 G 0.120 0.221 0.046 0.154 0.125 0.117 0.101 0.049 0.034 0.021 0.012 102 V 0.031 0.040 0.026 0.108 0.156 0.173 0.171 0.107 0.092 0.058 0.037 103 A 0.050 0.017 0.014 0.035 0.056 0.097 0.210 0.158 0.169 0.116 0.077 104 K 0.014 0.041 0.075 0.280 0.228 0.148 0.116 0.053 0.027 0.012 0.006 105 L 0.005 0.006 0.014 0.016 0.014 0.019 0.080 0.146 0.227 0.268 0.206 106 V 0.003 0.003 0.029 0.028 0.029 0.036 0.075 0.117 0.178 0.230 0.272 107 V 0.001 0.005 0.059 0.041 0.044 0.069 0.199 0.176 0.190 0.139 0.076 108 F 0.001 0.005 0.048 0.055 0.064 0.108 0.229 0.172 0.146 0.106 0.066 109 A 0.003 0.003 0.012 0.009 0.008 0.017 0.080 0.124 0.228 0.278 0.237 110 N 0.012 0.016 0.020 0.046 0.066 0.098 0.183 0.164 0.182 0.122 0.090 111 A 0.019 0.028 0.031 0.040 0.041 0.059 0.122 0.133 0.182 0.176 0.168 112 V 0.049 0.047 0.037 0.087 0.110 0.122 0.178 0.127 0.113 0.077 0.053 113 E 0.204 0.131 0.069 0.144 0.117 0.099 0.101 0.055 0.038 0.024 0.018 114 D 0.169 0.133 0.067 0.149 0.129 0.098 0.087 0.058 0.047 0.037 0.025 115 N 0.055 0.064 0.029 0.088 0.096 0.111 0.150 0.121 0.119 0.094 0.074 116 P 0.031 0.018 0.009 0.029 0.042 0.066 0.154 0.161 0.185 0.165 0.140 117 F 0.021 0.013 0.008 0.027 0.038 0.056 0.138 0.152 0.193 0.170 0.184 118 M 0.012 0.009 0.009 0.022 0.021 0.033 0.082 0.114 0.181 0.221 0.296 119 A 0.011 0.010 0.011 0.031 0.035 0.055 0.115 0.152 0.203 0.194 0.183 120 G 0.016 0.014 0.016 0.026 0.030 0.048 0.111 0.163 0.210 0.192 0.174 121 A 0.019 0.014 0.017 0.028 0.030 0.044 0.102 0.139 0.194 0.211 0.203 122 F 0.015 0.017 0.016 0.042 0.051 0.071 0.130 0.141 0.178 0.164 0.175 123 H 0.025 0.029 0.022 0.044 0.051 0.064 0.124 0.141 0.186 0.169 0.144 124 G 0.098 0.051 0.033 0.073 0.072 0.084 0.125 0.113 0.132 0.116 0.103 125 V 0.063 0.056 0.025 0.075 0.082 0.100 0.154 0.124 0.125 0.107 0.089 126 G 0.156 0.107 0.038 0.106 0.111 0.111 0.120 0.086 0.069 0.054 0.041 127 E 0.187 0.167 0.054 0.137 0.107 0.093 0.091 0.053 0.045 0.036 0.030 128 A 0.058 0.028 0.017 0.044 0.055 0.078 0.133 0.124 0.157 0.156 0.151 129 D 0.221 0.188 0.082 0.181 0.116 0.076 0.056 0.029 0.022 0.015 0.013 130 V 0.024 0.036 0.025 0.092 0.115 0.133 0.189 0.129 0.106 0.083 0.067 131 I 0.019 0.019 0.017 0.044 0.050 0.060 0.114 0.125 0.156 0.177 0.217 132 I 0.009 0.011 0.014 0.049 0.070 0.089 0.176 0.158 0.166 0.137 0.121 133 N 0.039 0.066 0.078 0.191 0.153 0.126 0.120 0.079 0.065 0.046 0.036 134 V 0.019 0.021 0.016 0.043 0.057 0.083 0.182 0.175 0.172 0.140 0.092 135 G 0.063 0.040 0.023 0.073 0.077 0.092 0.151 0.132 0.136 0.111 0.102 136 V 0.010 0.010 0.007 0.018 0.019 0.029 0.073 0.112 0.193 0.241 0.289 137 S 0.015 0.031 0.022 0.067 0.074 0.087 0.144 0.154 0.165 0.127 0.113 138 G 0.013 0.020 0.008 0.025 0.028 0.045 0.105 0.150 0.197 0.211 0.198 139 P 0.031 0.032 0.012 0.065 0.103 0.143 0.203 0.139 0.131 0.085 0.056 140 G 0.204 0.084 0.047 0.118 0.096 0.094 0.117 0.080 0.074 0.052 0.035 141 V 0.005 0.013 0.008 0.036 0.046 0.062 0.122 0.145 0.183 0.199 0.181 142 V 0.001 0.003 0.005 0.010 0.012 0.022 0.074 0.124 0.231 0.253 0.264 143 K 0.014 0.015 0.043 0.163 0.226 0.228 0.170 0.069 0.043 0.020 0.009 144 R 0.029 0.050 0.279 0.222 0.151 0.110 0.085 0.033 0.022 0.011 0.008 145 A 0.001 0.001 0.003 0.010 0.016 0.041 0.144 0.165 0.222 0.215 0.183 146 L 0.001 0.001 0.003 0.005 0.009 0.024 0.106 0.159 0.236 0.258 0.199 147 E 0.009 0.028 0.528 0.165 0.114 0.074 0.048 0.017 0.009 0.004 0.003 148 K 0.020 0.056 0.255 0.202 0.166 0.144 0.105 0.028 0.014 0.007 0.004 149 V 0.002 0.002 0.002 0.006 0.010 0.026 0.108 0.143 0.226 0.263 0.210 150 R 0.093 0.115 0.060 0.166 0.140 0.147 0.141 0.064 0.042 0.020 0.012 151 G 0.466 0.153 0.201 0.096 0.043 0.021 0.012 0.004 0.002 0.001 0.001 152 Q 0.106 0.104 0.054 0.150 0.145 0.140 0.154 0.074 0.039 0.024 0.010 153 S 0.196 0.286 0.054 0.123 0.091 0.075 0.071 0.036 0.034 0.022 0.014 154 F 0.010 0.010 0.007 0.027 0.047 0.089 0.164 0.153 0.207 0.154 0.131 155 D 0.221 0.184 0.147 0.180 0.107 0.066 0.053 0.020 0.013 0.006 0.003 156 V 0.011 0.039 0.037 0.138 0.162 0.175 0.193 0.115 0.074 0.037 0.020 157 V 0.004 0.006 0.004 0.012 0.015 0.032 0.089 0.141 0.211 0.247 0.240 158 A 0.014 0.016 0.034 0.099 0.165 0.223 0.251 0.104 0.059 0.024 0.010 159 E 0.097 0.112 0.459 0.196 0.068 0.033 0.023 0.007 0.004 0.002 0.001 160 T 0.008 0.015 0.043 0.097 0.113 0.160 0.255 0.135 0.088 0.055 0.033 161 V 0.002 0.002 0.010 0.007 0.007 0.016 0.078 0.139 0.232 0.284 0.224 162 K 0.004 0.014 0.189 0.214 0.228 0.186 0.116 0.030 0.013 0.004 0.001 163 K 0.028 0.048 0.584 0.191 0.083 0.043 0.017 0.004 0.001 0.001 0.001 164 T 0.008 0.012 0.022 0.045 0.074 0.163 0.356 0.157 0.092 0.050 0.021 165 A 0.010 0.008 0.032 0.021 0.021 0.038 0.154 0.175 0.226 0.192 0.123 166 F 0.018 0.031 0.254 0.165 0.172 0.153 0.115 0.046 0.025 0.014 0.007 167 K 0.023 0.058 0.401 0.183 0.129 0.090 0.065 0.025 0.015 0.008 0.003 168 I 0.013 0.021 0.044 0.042 0.051 0.075 0.200 0.165 0.175 0.133 0.081 169 T 0.026 0.027 0.055 0.057 0.064 0.084 0.166 0.138 0.169 0.128 0.085 170 R 0.076 0.077 0.276 0.161 0.132 0.105 0.086 0.038 0.025 0.015 0.009 171 I 0.015 0.053 0.135 0.128 0.120 0.123 0.168 0.102 0.081 0.051 0.024 172 G 0.016 0.021 0.043 0.029 0.028 0.042 0.131 0.156 0.210 0.189 0.134 173 Q 0.059 0.062 0.136 0.194 0.172 0.150 0.126 0.046 0.030 0.016 0.009 174 L 0.032 0.043 0.259 0.116 0.101 0.114 0.154 0.078 0.054 0.032 0.019 175 V 0.002 0.007 0.031 0.044 0.046 0.054 0.117 0.143 0.196 0.202 0.158 176 G 0.001 0.002 0.009 0.006 0.008 0.019 0.107 0.144 0.227 0.250 0.226 177 Q 0.008 0.013 0.201 0.267 0.231 0.155 0.076 0.024 0.015 0.007 0.003 178 M 0.012 0.027 0.198 0.096 0.126 0.165 0.205 0.073 0.049 0.029 0.021 179 A 0.001 0.003 0.011 0.027 0.028 0.046 0.131 0.147 0.202 0.205 0.199 180 S 0.002 0.002 0.010 0.007 0.013 0.030 0.134 0.162 0.244 0.233 0.162 181 E 0.028 0.043 0.458 0.270 0.121 0.054 0.019 0.005 0.002 0.001 0.001 182 R 0.014 0.054 0.233 0.142 0.156 0.161 0.140 0.048 0.028 0.014 0.010 183 L 0.003 0.003 0.003 0.011 0.016 0.037 0.114 0.138 0.191 0.231 0.255 184 G 0.496 0.277 0.066 0.100 0.038 0.015 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 185 V 0.001 0.001 0.002 0.004 0.007 0.012 0.056 0.119 0.252 0.263 0.284 186 E 0.112 0.215 0.103 0.282 0.164 0.075 0.036 0.008 0.003 0.001 0.002 187 F 0.001 0.001 0.001 0.005 0.009 0.023 0.095 0.151 0.249 0.230 0.236 188 G 0.003 0.003 0.003 0.014 0.028 0.066 0.161 0.185 0.200 0.156 0.180 189 I 0.001 0.001 0.001 0.004 0.005 0.011 0.054 0.116 0.229 0.267 0.309 190 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.009 0.043 0.103 0.213 0.275 0.348 191 D 0.001 0.002 0.003 0.012 0.017 0.033 0.097 0.176 0.232 0.219 0.209 192 L 0.003 0.003 0.004 0.014 0.022 0.042 0.139 0.210 0.241 0.196 0.127 193 S 0.007 0.010 0.010 0.037 0.043 0.069 0.142 0.180 0.211 0.168 0.124 194 L 0.005 0.009 0.005 0.023 0.033 0.052 0.121 0.166 0.214 0.209 0.164 195 A 0.017 0.026 0.015 0.055 0.071 0.086 0.147 0.163 0.177 0.132 0.110 196 P 0.041 0.041 0.018 0.074 0.100 0.118 0.166 0.139 0.127 0.101 0.075 197 T 0.064 0.080 0.022 0.109 0.139 0.129 0.162 0.117 0.089 0.054 0.035 198 P 0.199 0.111 0.035 0.125 0.122 0.112 0.108 0.068 0.055 0.038 0.029 199 A 0.547 0.169 0.050 0.089 0.053 0.033 0.027 0.012 0.009 0.006 0.005 200 V 0.085 0.114 0.040 0.130 0.122 0.121 0.147 0.093 0.071 0.049 0.026 201 G 0.204 0.151 0.044 0.119 0.108 0.099 0.104 0.065 0.051 0.033 0.023 202 D 0.079 0.144 0.071 0.215 0.192 0.136 0.093 0.034 0.021 0.009 0.005 203 S 0.026 0.043 0.030 0.075 0.095 0.136 0.230 0.157 0.106 0.065 0.037 204 V 0.002 0.004 0.007 0.026 0.042 0.068 0.157 0.162 0.198 0.181 0.153 205 A 0.006 0.005 0.021 0.023 0.034 0.081 0.231 0.178 0.181 0.143 0.097 206 R 0.005 0.023 0.135 0.411 0.227 0.108 0.051 0.021 0.010 0.005 0.002 207 V 0.002 0.005 0.023 0.019 0.025 0.042 0.152 0.188 0.200 0.192 0.151 208 L 0.001 0.001 0.026 0.016 0.013 0.013 0.046 0.083 0.183 0.274 0.344 209 E 0.001 0.003 0.072 0.052 0.103 0.155 0.346 0.137 0.079 0.035 0.016 210 E 0.009 0.028 0.407 0.270 0.140 0.088 0.038 0.011 0.005 0.002 0.001 211 M 0.006 0.010 0.015 0.021 0.043 0.105 0.308 0.181 0.150 0.105 0.056 212 G 0.109 0.099 0.059 0.084 0.050 0.050 0.094 0.095 0.126 0.116 0.118 213 L 0.025 0.032 0.034 0.050 0.088 0.120 0.200 0.143 0.127 0.099 0.083 214 E 0.263 0.218 0.191 0.183 0.082 0.036 0.017 0.005 0.003 0.001 0.001 215 T 0.166 0.137 0.063 0.142 0.153 0.133 0.117 0.043 0.024 0.014 0.009 216 V 0.036 0.024 0.012 0.033 0.037 0.049 0.097 0.106 0.155 0.184 0.267 217 G 0.119 0.114 0.039 0.098 0.115 0.107 0.125 0.082 0.083 0.062 0.058 218 T 0.149 0.144 0.062 0.138 0.122 0.114 0.106 0.059 0.050 0.033 0.023 219 H 0.046 0.045 0.018 0.078 0.120 0.149 0.200 0.127 0.095 0.071 0.051 220 G 0.007 0.013 0.006 0.022 0.039 0.069 0.132 0.139 0.193 0.175 0.204 221 T 0.004 0.015 0.014 0.036 0.049 0.078 0.161 0.147 0.192 0.156 0.149 222 T 0.009 0.010 0.014 0.050 0.067 0.109 0.189 0.163 0.172 0.124 0.093 223 A 0.005 0.006 0.020 0.039 0.049 0.069 0.161 0.176 0.186 0.150 0.141 224 A 0.001 0.001 0.006 0.009 0.009 0.012 0.056 0.105 0.187 0.254 0.362 225 L 0.001 0.001 0.008 0.007 0.010 0.023 0.098 0.115 0.201 0.244 0.294 226 A 0.001 0.002 0.083 0.055 0.067 0.119 0.262 0.132 0.122 0.091 0.068 227 L 0.001 0.001 0.010 0.017 0.034 0.082 0.288 0.203 0.147 0.120 0.098 228 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.016 0.048 0.152 0.323 0.457 229 N 0.001 0.001 0.011 0.021 0.043 0.112 0.280 0.198 0.168 0.106 0.061 230 D 0.027 0.033 0.357 0.174 0.123 0.126 0.102 0.031 0.015 0.008 0.004 231 Q 0.003 0.004 0.012 0.019 0.048 0.152 0.436 0.176 0.082 0.046 0.022 232 V 0.002 0.002 0.011 0.007 0.004 0.005 0.027 0.066 0.181 0.321 0.375 233 K 0.006 0.012 0.043 0.075 0.136 0.207 0.256 0.129 0.076 0.039 0.020 234 K 0.051 0.079 0.434 0.226 0.103 0.061 0.028 0.010 0.005 0.003 0.001 235 G 0.014 0.019 0.031 0.042 0.058 0.090 0.218 0.176 0.155 0.125 0.069 236 G 0.048 0.037 0.044 0.068 0.052 0.069 0.158 0.115 0.148 0.132 0.130 237 V 0.024 0.028 0.055 0.048 0.057 0.079 0.157 0.130 0.156 0.140 0.124 238 M 0.038 0.060 0.122 0.162 0.113 0.116 0.122 0.085 0.080 0.057 0.044 239 A 0.053 0.045 0.058 0.072 0.080 0.106 0.177 0.124 0.127 0.094 0.065 240 C 0.058 0.049 0.064 0.098 0.079 0.084 0.124 0.105 0.131 0.110 0.098 241 N 0.114 0.089 0.086 0.166 0.142 0.122 0.104 0.067 0.054 0.035 0.021 242 Q 0.050 0.094 0.089 0.171 0.163 0.145 0.136 0.069 0.045 0.024 0.013 243 V 0.021 0.037 0.037 0.081 0.090 0.117 0.173 0.141 0.127 0.100 0.077 244 G 0.011 0.009 0.005 0.018 0.028 0.046 0.111 0.138 0.192 0.204 0.237 245 G 0.021 0.023 0.015 0.051 0.062 0.077 0.161 0.156 0.169 0.138 0.128 246 L 0.006 0.004 0.004 0.009 0.010 0.017 0.051 0.092 0.196 0.252 0.361 247 S 0.009 0.015 0.012 0.051 0.066 0.081 0.158 0.171 0.177 0.134 0.125 248 G 0.025 0.027 0.017 0.069 0.089 0.129 0.184 0.163 0.129 0.098 0.070 249 A 0.005 0.004 0.005 0.012 0.018 0.030 0.104 0.161 0.223 0.221 0.217 250 F 0.005 0.003 0.004 0.011 0.012 0.021 0.075 0.131 0.206 0.247 0.286 251 I 0.001 0.002 0.002 0.007 0.011 0.024 0.086 0.136 0.225 0.238 0.268 252 P 0.005 0.012 0.009 0.035 0.039 0.070 0.156 0.178 0.197 0.172 0.129 253 V 0.009 0.009 0.007 0.025 0.039 0.068 0.158 0.173 0.205 0.175 0.132 254 S 0.025 0.021 0.019 0.050 0.053 0.059 0.132 0.162 0.188 0.153 0.138 255 E 0.002 0.010 0.008 0.030 0.039 0.064 0.148 0.166 0.190 0.190 0.154 256 D 0.001 0.006 0.013 0.034 0.063 0.099 0.203 0.180 0.175 0.129 0.097 257 E 0.168 0.080 0.121 0.251 0.179 0.097 0.059 0.024 0.013 0.006 0.003 258 G 0.010 0.035 0.045 0.179 0.204 0.199 0.193 0.071 0.039 0.017 0.008 259 M 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.007 0.045 0.094 0.239 0.298 0.309 260 I 0.002 0.002 0.018 0.057 0.106 0.227 0.322 0.132 0.079 0.038 0.017 261 A 0.008 0.033 0.622 0.203 0.084 0.032 0.013 0.003 0.001 0.001 0.001 262 A 0.001 0.002 0.009 0.013 0.025 0.070 0.249 0.207 0.197 0.141 0.087 263 V 0.001 0.001 0.003 0.005 0.008 0.017 0.078 0.147 0.255 0.279 0.208 264 Q 0.027 0.051 0.385 0.206 0.162 0.093 0.052 0.014 0.006 0.002 0.001 265 N 0.059 0.092 0.216 0.227 0.163 0.135 0.078 0.020 0.007 0.003 0.001 266 G 0.235 0.077 0.026 0.075 0.072 0.090 0.150 0.109 0.077 0.063 0.027 267 S 0.064 0.112 0.082 0.210 0.156 0.146 0.138 0.047 0.026 0.012 0.008 268 L 0.004 0.006 0.010 0.014 0.028 0.050 0.136 0.163 0.227 0.210 0.152 269 N 0.025 0.331 0.109 0.295 0.130 0.061 0.032 0.009 0.004 0.002 0.001 270 L 0.014 0.012 0.006 0.023 0.049 0.081 0.185 0.170 0.202 0.141 0.117 271 E 0.665 0.146 0.080 0.074 0.025 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 272 K 0.012 0.053 0.040 0.330 0.231 0.168 0.127 0.027 0.009 0.003 0.001 273 L 0.003 0.002 0.008 0.006 0.007 0.012 0.044 0.089 0.197 0.283 0.348 274 E 0.008 0.010 0.052 0.188 0.242 0.226 0.184 0.056 0.022 0.008 0.003 275 A 0.008 0.045 0.446 0.193 0.125 0.089 0.062 0.018 0.008 0.004 0.001 276 M 0.001 0.002 0.006 0.012 0.020 0.046 0.167 0.180 0.193 0.211 0.162 277 T 0.026 0.027 0.026 0.048 0.057 0.066 0.180 0.186 0.175 0.125 0.084 278 A 0.014 0.019 0.043 0.043 0.045 0.058 0.130 0.140 0.174 0.173 0.160 279 I 0.011 0.018 0.040 0.054 0.054 0.068 0.157 0.165 0.190 0.149 0.095 280 C 0.006 0.009 0.012 0.021 0.025 0.037 0.129 0.165 0.210 0.194 0.192 281 S 0.013 0.012 0.019 0.034 0.041 0.060 0.123 0.143 0.191 0.183 0.180 282 V 0.009 0.007 0.011 0.020 0.023 0.035 0.126 0.190 0.259 0.198 0.121 283 G 0.008 0.009 0.011 0.027 0.033 0.053 0.128 0.165 0.195 0.181 0.190 284 L 0.002 0.002 0.004 0.006 0.006 0.012 0.051 0.113 0.223 0.289 0.293 285 D 0.002 0.003 0.004 0.017 0.028 0.058 0.161 0.208 0.231 0.156 0.131 286 M 0.001 0.002 0.003 0.004 0.005 0.012 0.049 0.100 0.194 0.292 0.338 287 I 0.001 0.002 0.002 0.010 0.020 0.040 0.124 0.183 0.238 0.212 0.167 288 A 0.002 0.006 0.005 0.019 0.026 0.044 0.116 0.160 0.221 0.206 0.196 289 I 0.002 0.004 0.003 0.015 0.033 0.050 0.120 0.153 0.202 0.203 0.217 290 P 0.045 0.088 0.045 0.191 0.212 0.158 0.148 0.061 0.032 0.013 0.007 291 E 0.480 0.124 0.041 0.139 0.100 0.055 0.037 0.013 0.006 0.003 0.002 292 D 0.344 0.200 0.056 0.161 0.093 0.057 0.046 0.020 0.013 0.007 0.004 293 T 0.007 0.029 0.008 0.039 0.071 0.114 0.181 0.157 0.161 0.132 0.100 294 P 0.112 0.508 0.047 0.113 0.072 0.055 0.042 0.020 0.014 0.010 0.007 295 A 0.079 0.036 0.016 0.105 0.199 0.239 0.189 0.067 0.043 0.018 0.009 296 E 0.459 0.200 0.071 0.132 0.067 0.032 0.021 0.007 0.005 0.002 0.002 297 T 0.001 0.008 0.011 0.122 0.140 0.183 0.241 0.143 0.087 0.041 0.023 298 I 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.009 0.051 0.119 0.221 0.291 0.300 299 A 0.002 0.003 0.061 0.115 0.169 0.277 0.247 0.072 0.033 0.014 0.006 300 A 0.001 0.011 0.159 0.244 0.209 0.171 0.132 0.042 0.019 0.009 0.003 301 M 0.001 0.001 0.003 0.003 0.004 0.010 0.063 0.109 0.200 0.276 0.332 302 I 0.002 0.001 0.008 0.008 0.010 0.016 0.083 0.146 0.226 0.274 0.227 303 A 0.002 0.013 0.221 0.122 0.155 0.148 0.157 0.075 0.053 0.032 0.021 304 D 0.006 0.019 0.127 0.087 0.104 0.177 0.264 0.097 0.064 0.036 0.018 305 E 0.029 0.017 0.044 0.038 0.038 0.056 0.174 0.167 0.186 0.157 0.093 306 A 0.048 0.032 0.094 0.072 0.053 0.077 0.150 0.120 0.128 0.119 0.107 307 A 0.018 0.022 0.145 0.061 0.052 0.070 0.146 0.123 0.142 0.126 0.095 308 I 0.016 0.023 0.109 0.070 0.058 0.078 0.145 0.121 0.142 0.134 0.105 309 G 0.032 0.042 0.094 0.072 0.078 0.098 0.172 0.120 0.116 0.095 0.081 310 V 0.038 0.041 0.089 0.078 0.070 0.079 0.130 0.107 0.133 0.121 0.113 311 I 0.056 0.045 0.069 0.081 0.083 0.097 0.155 0.106 0.118 0.099 0.090 312 N 0.146 0.101 0.108 0.154 0.120 0.102 0.108 0.056 0.048 0.033 0.023 313 M 0.171 0.132 0.091 0.142 0.113 0.095 0.103 0.057 0.047 0.032 0.017 314 K 0.041 0.058 0.040 0.106 0.116 0.119 0.176 0.121 0.105 0.072 0.045 315 T 0.011 0.017 0.016 0.044 0.063 0.093 0.164 0.154 0.161 0.143 0.134 316 T 0.008 0.010 0.009 0.035 0.054 0.080 0.205 0.201 0.186 0.131 0.081 317 A 0.005 0.004 0.004 0.013 0.014 0.025 0.084 0.140 0.209 0.240 0.263 318 V 0.001 0.001 0.002 0.006 0.006 0.012 0.055 0.126 0.241 0.304 0.245 319 R 0.001 0.003 0.005 0.017 0.027 0.059 0.156 0.191 0.227 0.179 0.135 320 I 0.001 0.002 0.004 0.008 0.010 0.018 0.067 0.129 0.216 0.295 0.250 321 I 0.001 0.003 0.002 0.019 0.050 0.069 0.178 0.219 0.233 0.143 0.083 322 P 0.023 0.058 0.040 0.137 0.140 0.135 0.179 0.119 0.093 0.050 0.026 323 K 0.053 0.052 0.025 0.146 0.201 0.172 0.187 0.089 0.047 0.021 0.007 324 G 0.262 0.148 0.043 0.157 0.111 0.087 0.087 0.050 0.030 0.016 0.009 325 K 0.588 0.188 0.040 0.075 0.042 0.026 0.019 0.009 0.006 0.004 0.002 326 E 0.315 0.239 0.043 0.132 0.085 0.071 0.056 0.026 0.018 0.011 0.006 327 G 0.151 0.098 0.021 0.085 0.103 0.115 0.131 0.105 0.089 0.063 0.039 328 D 0.157 0.230 0.065 0.177 0.127 0.079 0.070 0.036 0.028 0.017 0.014 329 M 0.056 0.066 0.038 0.137 0.147 0.136 0.157 0.103 0.077 0.052 0.031 330 I 0.058 0.037 0.023 0.106 0.136 0.135 0.147 0.117 0.102 0.079 0.060 331 E 0.048 0.101 0.097 0.242 0.178 0.123 0.102 0.049 0.033 0.016 0.011 332 F 0.021 0.025 0.023 0.062 0.067 0.094 0.173 0.155 0.162 0.130 0.089 333 G 0.050 0.040 0.022 0.070 0.077 0.094 0.143 0.134 0.137 0.121 0.112 334 G 0.065 0.059 0.036 0.103 0.091 0.102 0.129 0.111 0.118 0.102 0.083 335 L 0.019 0.030 0.024 0.074 0.093 0.112 0.170 0.136 0.134 0.110 0.099 336 L 0.022 0.017 0.013 0.035 0.032 0.038 0.076 0.113 0.176 0.205 0.274 337 G 0.024 0.026 0.023 0.078 0.100 0.128 0.186 0.146 0.131 0.095 0.063 338 T 0.096 0.204 0.109 0.276 0.152 0.081 0.045 0.017 0.010 0.006 0.004 339 A 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.014 0.050 0.113 0.226 0.289 0.294 340 P 0.051 0.112 0.054 0.253 0.226 0.145 0.100 0.030 0.017 0.007 0.006 341 V 0.002 0.003 0.002 0.008 0.010 0.015 0.054 0.102 0.196 0.243 0.367 342 M 0.006 0.009 0.006 0.037 0.069 0.119 0.201 0.158 0.163 0.120 0.112 343 K 0.053 0.169 0.067 0.283 0.190 0.104 0.076 0.029 0.016 0.008 0.005 344 V 0.001 0.002 0.001 0.005 0.010 0.016 0.061 0.105 0.212 0.261 0.327 345 N 0.116 0.174 0.101 0.266 0.166 0.084 0.055 0.019 0.010 0.005 0.003 346 G 0.398 0.204 0.046 0.162 0.082 0.044 0.040 0.012 0.007 0.003 0.002 347 A 0.077 0.050 0.023 0.075 0.080 0.098 0.160 0.142 0.132 0.099 0.064 348 S 0.124 0.431 0.052 0.137 0.084 0.066 0.050 0.020 0.016 0.011 0.008 349 S 0.026 0.042 0.016 0.092 0.147 0.176 0.191 0.117 0.098 0.057 0.036 350 V 0.434 0.160 0.060 0.130 0.089 0.060 0.037 0.014 0.010 0.004 0.002 351 D 0.021 0.084 0.085 0.351 0.250 0.121 0.061 0.017 0.007 0.002 0.001 352 F 0.009 0.006 0.007 0.014 0.015 0.023 0.075 0.153 0.241 0.261 0.195 353 I 0.006 0.007 0.014 0.067 0.145 0.197 0.231 0.147 0.094 0.055 0.035 354 S 0.031 0.110 0.528 0.192 0.077 0.032 0.018 0.006 0.004 0.002 0.001 355 R 0.027 0.033 0.027 0.103 0.133 0.231 0.275 0.097 0.043 0.023 0.008 356 G 0.253 0.110 0.022 0.064 0.058 0.055 0.103 0.104 0.099 0.083 0.049 357 G 0.133 0.115 0.033 0.097 0.098 0.112 0.128 0.093 0.080 0.064 0.048 358 Q 0.168 0.195 0.083 0.174 0.133 0.095 0.079 0.033 0.022 0.013 0.007 359 I 0.051 0.034 0.017 0.047 0.060 0.089 0.143 0.149 0.161 0.142 0.107 360 P 0.221 0.194 0.051 0.143 0.119 0.071 0.066 0.048 0.037 0.027 0.023