# TARGET T0290 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0290.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 90.6897 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 R 0.031 0.002 0.021 0.025 0.026 0.062 0.004 0.829 2 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 3 R 0.025 0.002 0.071 0.100 0.185 0.088 0.005 0.524 4 C 0.074 0.003 0.076 0.063 0.066 0.048 0.004 0.666 5 F 0.031 0.006 0.130 0.145 0.249 0.054 0.003 0.384 6 F 0.029 0.005 0.106 0.129 0.216 0.082 0.002 0.430 7 D 0.026 0.008 0.103 0.148 0.220 0.083 0.005 0.408 8 I 0.050 0.012 0.094 0.136 0.276 0.112 0.006 0.314 9 A 0.052 0.037 0.079 0.217 0.342 0.117 0.008 0.149 10 I 0.046 0.056 0.078 0.223 0.288 0.072 0.010 0.227 11 N 0.040 0.070 0.054 0.192 0.265 0.053 0.016 0.310 12 N 0.103 0.036 0.046 0.071 0.143 0.061 0.050 0.491 13 Q 0.117 0.021 0.040 0.081 0.106 0.158 0.026 0.451 14 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.996 15 A 0.010 0.004 0.016 0.047 0.074 0.103 0.008 0.737 16 G 0.252 0.009 0.066 0.109 0.060 0.064 0.049 0.393 17 R 0.203 0.002 0.093 0.055 0.089 0.131 0.007 0.421 18 V 0.022 0.001 0.150 0.284 0.250 0.054 0.001 0.238 19 V 0.007 0.001 0.157 0.272 0.495 0.020 0.001 0.047 20 F 0.001 0.001 0.170 0.338 0.423 0.008 0.001 0.057 21 E 0.001 0.001 0.279 0.266 0.398 0.010 0.001 0.044 22 L 0.003 0.004 0.143 0.280 0.432 0.029 0.001 0.108 23 F 0.009 0.006 0.161 0.145 0.465 0.058 0.004 0.152 24 S 0.016 0.009 0.064 0.077 0.167 0.102 0.007 0.559 25 D 0.059 0.013 0.024 0.016 0.041 0.138 0.024 0.685 26 V 0.303 0.017 0.012 0.009 0.015 0.181 0.041 0.422 27 C 0.199 0.039 0.031 0.037 0.023 0.155 0.023 0.493 28 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 29 K 0.009 0.022 0.026 0.031 0.080 0.198 0.002 0.632 30 T 0.040 0.165 0.018 0.016 0.022 0.078 0.004 0.657 31 C 0.040 0.540 0.018 0.017 0.056 0.054 0.005 0.270 32 E 0.061 0.488 0.013 0.009 0.015 0.136 0.006 0.272 33 N 0.089 0.642 0.003 0.004 0.005 0.055 0.011 0.191 34 F 0.034 0.877 0.005 0.004 0.005 0.007 0.006 0.062 35 R 0.008 0.915 0.004 0.007 0.011 0.008 0.004 0.043 36 C 0.009 0.902 0.005 0.012 0.014 0.006 0.004 0.048 37 L 0.041 0.845 0.008 0.022 0.032 0.008 0.011 0.032 38 C 0.070 0.778 0.015 0.047 0.029 0.007 0.018 0.037 39 T 0.046 0.565 0.079 0.084 0.066 0.017 0.029 0.113 40 G 0.097 0.186 0.040 0.070 0.087 0.036 0.058 0.426 41 E 0.213 0.060 0.035 0.034 0.044 0.102 0.036 0.476 42 K 0.039 0.032 0.026 0.031 0.032 0.106 0.021 0.713 43 G 0.105 0.036 0.049 0.059 0.064 0.121 0.027 0.539 44 T 0.055 0.017 0.051 0.054 0.062 0.109 0.010 0.642 45 G 0.055 0.017 0.032 0.072 0.112 0.107 0.010 0.595 46 K 0.080 0.013 0.036 0.048 0.089 0.140 0.006 0.588 47 S 0.028 0.014 0.019 0.050 0.063 0.156 0.006 0.665 48 T 0.104 0.020 0.023 0.048 0.088 0.136 0.016 0.564 49 Q 0.153 0.021 0.032 0.037 0.065 0.192 0.038 0.462 50 K 0.185 0.011 0.053 0.072 0.085 0.258 0.012 0.323 51 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 52 L 0.010 0.005 0.047 0.105 0.260 0.101 0.003 0.468 53 H 0.095 0.009 0.048 0.066 0.091 0.087 0.010 0.594 54 Y 0.083 0.024 0.092 0.096 0.198 0.083 0.007 0.416 55 K 0.042 0.027 0.074 0.075 0.101 0.141 0.007 0.533 56 S 0.062 0.019 0.051 0.035 0.042 0.071 0.020 0.700 57 C 0.208 0.019 0.095 0.052 0.066 0.123 0.020 0.417 58 L 0.041 0.013 0.086 0.063 0.088 0.128 0.007 0.573 59 F 0.016 0.020 0.074 0.140 0.250 0.074 0.004 0.422 60 H 0.027 0.037 0.069 0.181 0.307 0.082 0.006 0.290 61 R 0.050 0.038 0.106 0.190 0.221 0.067 0.010 0.318 62 V 0.057 0.046 0.073 0.145 0.214 0.070 0.010 0.385 63 V 0.038 0.068 0.093 0.174 0.390 0.047 0.008 0.182 64 K 0.009 0.031 0.029 0.030 0.086 0.051 0.006 0.759 65 D 0.050 0.043 0.033 0.034 0.048 0.092 0.031 0.668 66 F 0.724 0.012 0.033 0.022 0.011 0.023 0.060 0.114 67 M 0.045 0.013 0.701 0.051 0.038 0.026 0.019 0.108 68 V 0.006 0.007 0.600 0.088 0.110 0.026 0.006 0.157 69 Q 0.010 0.008 0.519 0.104 0.153 0.073 0.004 0.128 70 G 0.008 0.010 0.241 0.065 0.122 0.056 0.004 0.495 71 G 0.011 0.006 0.293 0.051 0.087 0.123 0.008 0.420 72 D 0.057 0.003 0.047 0.041 0.057 0.179 0.008 0.608 73 F 0.027 0.005 0.042 0.068 0.081 0.075 0.005 0.697 74 S 0.028 0.006 0.018 0.053 0.100 0.488 0.006 0.302 75 E 0.120 0.014 0.035 0.066 0.091 0.141 0.011 0.523 76 G 0.053 0.026 0.021 0.050 0.066 0.305 0.008 0.470 77 N 0.077 0.022 0.027 0.050 0.059 0.163 0.021 0.582 78 G 0.090 0.042 0.054 0.065 0.075 0.130 0.031 0.512 79 R 0.074 0.010 0.024 0.031 0.058 0.460 0.015 0.328 80 G 0.075 0.014 0.036 0.045 0.062 0.165 0.020 0.582 81 G 0.122 0.018 0.043 0.053 0.102 0.175 0.011 0.477 82 E 0.032 0.007 0.070 0.064 0.084 0.129 0.006 0.609 83 S 0.018 0.009 0.020 0.047 0.110 0.084 0.004 0.708 84 I 0.070 0.020 0.071 0.122 0.248 0.092 0.008 0.367 85 Y 0.032 0.017 0.038 0.064 0.120 0.228 0.008 0.494 86 G 0.099 0.020 0.034 0.052 0.135 0.126 0.019 0.514 87 G 0.102 0.032 0.062 0.062 0.061 0.135 0.014 0.532 88 F 0.038 0.012 0.026 0.019 0.033 0.124 0.009 0.738 89 F 0.127 0.028 0.085 0.064 0.141 0.118 0.008 0.429 90 E 0.030 0.024 0.047 0.048 0.091 0.132 0.006 0.622 91 D 0.055 0.046 0.034 0.040 0.093 0.090 0.011 0.630 92 E 0.177 0.050 0.055 0.026 0.060 0.157 0.016 0.459 93 S 0.057 0.045 0.020 0.025 0.033 0.429 0.020 0.370 94 F 0.225 0.054 0.043 0.033 0.045 0.107 0.032 0.462 95 A 0.074 0.062 0.033 0.021 0.039 0.215 0.007 0.549 96 V 0.096 0.067 0.048 0.041 0.097 0.163 0.012 0.477 97 K 0.068 0.117 0.035 0.048 0.074 0.134 0.010 0.515 98 H 0.114 0.088 0.040 0.043 0.073 0.121 0.020 0.501 99 N 0.124 0.149 0.049 0.047 0.056 0.121 0.019 0.434 100 A 0.080 0.127 0.079 0.044 0.067 0.111 0.021 0.471 101 A 0.025 0.060 0.037 0.020 0.030 0.184 0.011 0.634 102 F 0.147 0.088 0.065 0.034 0.048 0.197 0.027 0.394 103 L 0.083 0.275 0.213 0.064 0.076 0.091 0.010 0.188 104 L 0.028 0.306 0.167 0.096 0.197 0.064 0.010 0.132 105 S 0.063 0.308 0.120 0.096 0.256 0.055 0.008 0.094 106 M 0.067 0.379 0.052 0.121 0.171 0.037 0.020 0.152 107 A 0.160 0.295 0.077 0.103 0.142 0.033 0.042 0.148 108 N 0.215 0.109 0.044 0.093 0.098 0.075 0.093 0.274 109 R 0.191 0.067 0.102 0.066 0.085 0.058 0.063 0.368 110 G 0.109 0.027 0.050 0.045 0.077 0.205 0.023 0.464 111 K 0.012 0.004 0.010 0.008 0.008 0.036 0.003 0.920 112 D 0.019 0.029 0.047 0.045 0.069 0.122 0.009 0.660 113 T 0.115 0.013 0.039 0.021 0.027 0.158 0.018 0.609 114 N 0.038 0.010 0.022 0.015 0.017 0.594 0.014 0.289 115 G 0.221 0.026 0.031 0.030 0.032 0.183 0.044 0.432 116 S 0.126 0.015 0.047 0.020 0.031 0.512 0.011 0.240 117 Q 0.083 0.013 0.047 0.084 0.149 0.325 0.008 0.291 118 F 0.065 0.027 0.036 0.154 0.361 0.158 0.004 0.196 119 F 0.026 0.014 0.063 0.273 0.501 0.055 0.004 0.064 120 I 0.019 0.039 0.035 0.347 0.421 0.029 0.003 0.107 121 T 0.008 0.036 0.052 0.301 0.511 0.014 0.005 0.073 122 T 0.022 0.028 0.051 0.202 0.378 0.042 0.018 0.259 123 K 0.046 0.012 0.050 0.158 0.273 0.163 0.013 0.285 124 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 125 T 0.022 0.007 0.023 0.074 0.150 0.215 0.005 0.504 126 P 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.991 127 H 0.057 0.008 0.022 0.057 0.123 0.195 0.007 0.532 128 L 0.367 0.013 0.039 0.053 0.059 0.184 0.013 0.271 129 D 0.103 0.037 0.051 0.070 0.081 0.159 0.017 0.483 130 G 0.105 0.018 0.063 0.056 0.068 0.103 0.036 0.551 131 H 0.195 0.004 0.033 0.023 0.039 0.492 0.012 0.202 132 H 0.043 0.006 0.053 0.101 0.095 0.102 0.011 0.590 133 V 0.021 0.005 0.109 0.267 0.380 0.068 0.006 0.142 134 V 0.006 0.002 0.130 0.214 0.239 0.044 0.003 0.363 135 F 0.003 0.001 0.093 0.209 0.384 0.038 0.001 0.271 136 G 0.006 0.003 0.077 0.296 0.445 0.029 0.001 0.143 137 Q 0.017 0.002 0.150 0.188 0.301 0.051 0.003 0.288 138 V 0.009 0.005 0.113 0.173 0.259 0.060 0.002 0.378 139 I 0.013 0.022 0.125 0.248 0.358 0.055 0.003 0.177 140 S 0.006 0.030 0.037 0.067 0.114 0.089 0.003 0.653 141 G 0.042 0.051 0.026 0.030 0.075 0.080 0.016 0.680 142 Q 0.173 0.079 0.023 0.017 0.025 0.109 0.014 0.561 143 E 0.035 0.079 0.009 0.010 0.013 0.232 0.008 0.613 144 V 0.052 0.399 0.006 0.011 0.023 0.101 0.006 0.403 145 V 0.014 0.838 0.007 0.007 0.018 0.014 0.002 0.100 146 R 0.004 0.908 0.002 0.003 0.007 0.011 0.002 0.061 147 E 0.005 0.964 0.001 0.001 0.002 0.002 0.002 0.023 148 I 0.021 0.944 0.001 0.002 0.003 0.001 0.006 0.022 149 E 0.041 0.894 0.003 0.004 0.005 0.004 0.015 0.033 150 N 0.123 0.672 0.008 0.007 0.006 0.007 0.049 0.129 151 Q 0.390 0.259 0.044 0.013 0.013 0.023 0.075 0.182 152 K 0.074 0.194 0.043 0.028 0.017 0.076 0.027 0.541 153 T 0.024 0.065 0.076 0.031 0.033 0.058 0.010 0.703 154 D 0.028 0.083 0.048 0.042 0.054 0.109 0.007 0.629 155 A 0.043 0.038 0.029 0.014 0.021 0.133 0.009 0.714 156 A 0.053 0.027 0.010 0.008 0.013 0.552 0.020 0.316 157 S 0.475 0.090 0.013 0.012 0.009 0.050 0.099 0.253 158 K 0.416 0.032 0.050 0.039 0.035 0.180 0.016 0.231 159 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 160 F 0.015 0.002 0.024 0.098 0.480 0.089 0.003 0.289 161 A 0.077 0.002 0.026 0.083 0.102 0.079 0.006 0.625 162 E 0.028 0.002 0.035 0.066 0.090 0.056 0.004 0.720 163 V 0.103 0.003 0.190 0.147 0.183 0.062 0.004 0.309 164 R 0.008 0.001 0.485 0.220 0.168 0.023 0.002 0.092 165 I 0.002 0.001 0.252 0.140 0.261 0.019 0.001 0.324 166 L 0.001 0.001 0.648 0.122 0.191 0.009 0.001 0.027 167 S 0.004 0.003 0.191 0.148 0.187 0.085 0.003 0.379 168 C 0.011 0.002 0.332 0.047 0.164 0.060 0.005 0.380 169 G 0.029 0.004 0.102 0.094 0.103 0.229 0.006 0.432 170 E 0.059 0.004 0.067 0.045 0.090 0.125 0.015 0.596 171 L 0.052 0.017 0.089 0.083 0.168 0.079 0.015 0.497 172 I 0.051 0.010 0.056 0.135 0.156 0.085 0.007 0.500 173 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999