This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA S A 2 2 NATAA T A 3 3 NATAA S A 4 4 NATRO C A 5 5 NATAA V A 6 6 NATAA A A 7 7 NATAA E A 8 8 NATAA E A 9 9 NATRO P A 10 10 NATAA I A 11 11 NATAA K A 12 12 NATAA K A 13 13 NATAA I A 14 14 NATAA A A 15 15 NATAA I A 16 16 NATAA F A 17 17 NATAA G A 18 18 NATAA G A 19 19 NATAA T A 20 20 NATAA H A 21 21 NATAA G A 22 22 NATAA N A 23 23 NATAA E A 24 24 NATAA L A 25 25 NATAA T A 26 26 NATAA G A 27 27 NATAA V A 28 28 NATAA F A 29 29 NATAA L A 30 30 NATAA V A 31 31 NATAA T A 32 32 NATAA H A 33 33 NATAA W A 34 34 NATAA L A 35 35 NATAA K A 36 36 NATAA N A 37 37 NATAA G A 38 38 NATAA A A 39 39 NATAA E A 40 40 NATAA V A 41 41 NATAA H A 42 42 NATAA R A 43 43 NATAA A A 44 44 NATAA G A 45 45 NATAA L A 46 46 NATAA E A 47 47 NATAA V A 48 48 NATAA K A 49 49 NATRO P A 50 50 NATAA F A 51 51 NATAA I A 52 52 NATAA T A 53 53 NATAA N A 54 54 NATRO P A 55 55 NATAA R A 56 56 NATAA A A 57 57 NATAA V A 58 58 NATAA E A 59 59 NATAA K A 60 60 NATRO C A 61 61 NATAA T A 62 62 NATAA R A 63 63 NATAA Y A 64 64 NATAA I A 65 65 NATAA D A 66 66 NATRO C A 67 67 NATAA D A 68 68 NATAA L A 69 69 NATAA N A 70 70 NATAA R A 71 71 NATAA V A 72 72 NATAA F A 73 73 NATAA D A 74 74 NATAA L A 75 75 NATAA E A 76 76 NATAA N A 77 77 NATAA L A 78 78 NATAA S A 79 79 NATAA K A 80 80 NATAA E A 81 81 NATAA M A 82 82 NATAA S A 83 83 NATAA E A 84 84 NATAA D A 85 85 NATAA L A 86 86 NATRO P A 87 87 NATAA Y A 88 88 NATAA E A 89 89 NATAA V A 90 90 NATAA R A 91 91 NATAA R A 92 92 NATAA A A 93 93 NATAA Q A 94 94 NATAA E A 95 95 NATAA I A 96 96 NATAA N A 97 97 NATAA H A 98 98 NATAA L A 99 99 NATAA F A 100 100 NATAA G A 101 101 NATRO P A 102 102 NATAA K A 103 103 NATAA N A 104 104 NATAA S A 105 105 NATAA D A 106 106 NATAA D A 107 107 NATAA A A 108 108 NATAA Y A 109 109 NATAA D A 110 110 NATAA V A 111 111 NATAA V A 112 112 NATAA F A 113 113 NATAA D A 114 114 NATAA L A 115 115 NATAA H A 116 116 NATAA N A 117 117 NATAA T A 118 118 NATAA T A 119 119 NATAA S A 120 120 NATAA N A 121 121 NATAA M A 122 122 NATAA G A 123 123 NATRO C A 124 124 NATAA T A 125 125 NATAA L A 126 126 NATAA I A 127 127 NATAA L A 128 128 NATAA E A 129 129 NATAA D A 130 130 NATAA S A 131 131 NATAA R A 132 132 NATAA N A 133 133 NATAA D A 134 134 NATAA F A 135 135 NATAA L A 136 136 NATAA I A 137 137 NATAA Q A 138 138 NATAA M A 139 139 NATAA F A 140 140 NATAA H A 141 141 NATAA Y A 142 142 NATAA I A 143 143 NATAA K A 144 144 NATAA T A 145 145 NATRO C A 146 146 NATAA M A 147 147 NATAA A A 148 148 NATRO P A 149 149 NATAA L A 150 150 NATRO P A 151 151 NATRO C A 152 152 NATAA S A 153 153 NATAA V A 154 154 NATAA Y A 155 155 NATAA L A 156 156 NATAA I A 157 157 NATAA E A 158 158 NATAA H A 159 159 NATRO P A 160 160 NATAA S A 161 161 NATAA L A 162 162 NATAA K A 163 163 NATAA Y A 164 164 NATAA A A 165 165 NATAA T A 166 166 NATAA T A 167 167 NATAA R A 168 168 NATAA S A 169 169 NATAA I A 170 170 NATAA A A 171 171 NATAA K A 172 172 NATAA Y A 173 173 NATRO P A 174 174 NATAA V A 175 175 NATAA G A 176 176 NATAA I A 177 177 NATAA E A 178 178 NATAA V A 179 179 NATAA G A 180 180 NATRO P A 181 181 NATAA Q A 182 182 NATRO P A 183 183 NATAA H A 184 184 NATAA G A 185 185 NATAA V A 186 186 NATAA L A 187 187 NATAA R A 188 188 NATAA A A 189 189 NATAA D A 190 190 NATAA I A 191 191 NATAA L A 192 192 NATAA D A 193 193 NATAA Q A 194 194 NATAA M A 195 195 NATAA R A 196 196 NATAA R A 197 197 NATAA M A 198 198 NATAA L A 199 199 NATAA K A 200 200 NATAA H A 201 201 NATAA A A 202 202 NATAA L A 203 203 NATAA D A 204 204 NATAA F A 205 205 NATAA I A 206 206 NATAA Q A 207 207 NATAA R A 208 208 NATAA F A 209 209 NATAA N A 210 210 NATAA E A 211 211 NATAA G A 212 212 NATAA K A 213 213 NATAA E A 214 214 NATAA F A 215 215 NATRO P A 216 216 NATRO P A 217 217 NATRO C A 218 218 NATAA A A 219 219 NATAA I A 220 220 NATAA D A 221 221 NATAA V A 222 222 NATAA Y A 223 223 NATAA K A 224 224 NATAA I A 225 225 NATAA M A 226 226 NATAA E A 227 227 NATAA K A 228 228 NATAA V A 229 229 NATAA D A 230 230 NATAA Y A 231 231 NATRO P A 232 232 NATAA R A 233 233 NATAA N A 234 234 NATAA E A 235 235 NATAA S A 236 236 NATAA G A 237 237 NATAA D A 238 238 NATAA V A 239 239 NATAA A A 240 240 NATAA A A 241 241 NATAA V A 242 242 NATAA I A 243 243 NATAA H A 244 244 NATRO P A 245 245 NATAA N A 246 246 NATAA L A 247 247 NATAA Q A 248 248 NATAA D A 249 249 NATAA Q A 250 250 NATAA D A 251 251 NATAA W A 252 252 NATAA K A 253 253 NATRO P A 254 254 NATAA L A 255 255 NATAA H A 256 256 NATRO P A 257 257 NATAA G A 258 258 NATAA D A 259 259 NATRO P A 260 260 NATAA V A 261 261 NATAA F A 262 262 NATAA V A 263 263 NATAA S A 264 264 NATAA L A 265 265 NATAA D A 266 266 NATAA G A 267 267 NATAA K A 268 268 NATAA V A 269 269 NATAA I A 270 270 NATRO P A 271 271 NATAA L A 272 272 NATAA G A 273 273 NATAA G A 274 274 NATAA D A 275 275 NATRO C A 276 276 NATAA T A 277 277 NATAA V A 278 278 NATAA Y A 279 279 NATRO P A 280 280 NATAA V A 281 281 NATAA F A 282 282 NATAA V A 283 283 NATAA N A 284 284 NATAA E A 285 285 NATAA A A 286 286 NATAA A A 287 287 NATAA Y A 288 288 NATAA Y A 289 289 NATAA E A 290 290 NATAA K A 291 291 NATAA K A 292 292 NATAA E A 293 293 NATAA A A 294 294 NATAA F A 295 295 NATAA A A 296 296 NATAA K A 297 297 NATAA T A 298 298 NATAA T A 299 299 NATAA K A 300 300 NATAA L A 301 301 NATAA T A 302 302 NATAA L A 303 303 NATAA N A 304 304 NATAA A A 305 305 NATAA K A 306 306 NATAA S A 307 307 NATAA I A 308 308 NATAA R A 309 309 NATAA S A 310 310 NATAA T A 311 311 NATAA L A 312 312 NATAA H