# TARGET T0286 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0286.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 83 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.034 0.005 0.015 0.022 0.243 0.680 2 A 0.057 0.028 0.020 0.018 0.248 0.629 3 S 0.084 0.019 0.020 0.008 0.301 0.568 4 K 0.224 0.012 0.009 0.005 0.214 0.535 5 T 0.445 0.010 0.004 0.003 0.103 0.434 6 I 0.854 0.007 0.001 0.002 0.023 0.114 7 K 0.948 0.002 0.001 0.001 0.009 0.040 8 I 0.980 0.001 0.001 0.001 0.002 0.015 9 M 0.965 0.002 0.001 0.002 0.007 0.024 10 P 0.801 0.010 0.002 0.005 0.033 0.150 11 V 0.361 0.007 0.030 0.015 0.220 0.367 12 G 0.118 0.012 0.121 0.023 0.459 0.268 13 D 0.042 0.008 0.261 0.047 0.487 0.154 14 S 0.074 0.027 0.241 0.057 0.471 0.130 15 C 0.153 0.024 0.146 0.109 0.436 0.131 16 T 0.190 0.042 0.088 0.119 0.392 0.169 17 E 0.162 0.024 0.064 0.109 0.446 0.195 18 G 0.065 0.016 0.054 0.070 0.566 0.229 19 M 0.108 0.035 0.043 0.043 0.504 0.267 20 G 0.067 0.038 0.042 0.033 0.490 0.330 21 G 0.036 0.038 0.053 0.030 0.563 0.281 22 G 0.016 0.014 0.106 0.050 0.632 0.182 23 E 0.007 0.010 0.179 0.076 0.601 0.127 24 M 0.008 0.009 0.114 0.141 0.565 0.163 25 G 0.013 0.011 0.072 0.219 0.450 0.235 26 S 0.023 0.020 0.044 0.328 0.294 0.291 27 Y 0.023 0.033 0.052 0.521 0.160 0.211 28 R 0.011 0.005 0.054 0.757 0.075 0.098 29 T 0.005 0.001 0.046 0.841 0.056 0.051 30 E 0.002 0.001 0.027 0.931 0.022 0.017 31 L 0.002 0.001 0.012 0.961 0.014 0.010 32 Y 0.002 0.001 0.013 0.956 0.019 0.010 33 R 0.001 0.001 0.010 0.950 0.026 0.012 34 L 0.001 0.001 0.012 0.957 0.021 0.008 35 L 0.001 0.001 0.020 0.936 0.032 0.009 36 T 0.001 0.001 0.041 0.903 0.041 0.013 37 Q 0.002 0.001 0.047 0.805 0.098 0.047 38 A 0.003 0.001 0.038 0.624 0.146 0.188 39 G 0.006 0.002 0.005 0.022 0.169 0.795 40 L 0.043 0.010 0.008 0.009 0.239 0.691 41 S 0.186 0.017 0.015 0.009 0.240 0.532 42 I 0.471 0.016 0.046 0.017 0.224 0.225 43 D 0.633 0.007 0.044 0.017 0.126 0.173 44 F 0.760 0.015 0.026 0.020 0.082 0.098 45 V 0.646 0.012 0.021 0.024 0.138 0.159 46 G 0.498 0.013 0.014 0.020 0.190 0.265 47 S 0.309 0.029 0.027 0.027 0.274 0.335 48 Q 0.194 0.032 0.032 0.026 0.384 0.332 49 R 0.168 0.036 0.030 0.023 0.427 0.316 50 S 0.108 0.028 0.021 0.019 0.443 0.380 51 G 0.094 0.028 0.022 0.029 0.391 0.436 52 P 0.090 0.044 0.025 0.047 0.350 0.444 53 S 0.074 0.028 0.049 0.104 0.377 0.368 54 S 0.068 0.032 0.051 0.124 0.358 0.367 55 L 0.067 0.020 0.077 0.206 0.386 0.243 56 P 0.069 0.018 0.104 0.242 0.363 0.204 57 D 0.068 0.016 0.113 0.301 0.325 0.177 58 K 0.077 0.016 0.125 0.345 0.270 0.166 59 D 0.068 0.014 0.096 0.370 0.255 0.195 60 H 0.052 0.014 0.075 0.323 0.320 0.216 61 E 0.044 0.012 0.056 0.326 0.319 0.243 62 G 0.040 0.013 0.046 0.228 0.347 0.326 63 H 0.038 0.016 0.044 0.242 0.380 0.280 64 S 0.035 0.011 0.044 0.409 0.268 0.233 65 G 0.049 0.008 0.031 0.492 0.194 0.225 66 W 0.053 0.010 0.028 0.611 0.125 0.173 67 T 0.081 0.017 0.022 0.611 0.073 0.196 68 I 0.052 0.004 0.019 0.842 0.032 0.051 69 P 0.044 0.002 0.018 0.874 0.030 0.032 70 Q 0.034 0.002 0.020 0.867 0.038 0.038 71 I 0.032 0.002 0.017 0.877 0.038 0.033 72 A 0.020 0.001 0.024 0.871 0.051 0.033 73 S 0.015 0.002 0.023 0.809 0.086 0.065 74 N 0.012 0.002 0.025 0.713 0.118 0.130 75 I 0.015 0.007 0.034 0.652 0.152 0.141 76 N 0.018 0.005 0.069 0.504 0.229 0.175 77 N 0.023 0.003 0.078 0.395 0.261 0.240 78 W 0.041 0.007 0.104 0.374 0.281 0.192 79 L 0.063 0.027 0.077 0.238 0.314 0.281 80 N 0.066 0.009 0.087 0.164 0.333 0.341 81 T 0.094 0.020 0.077 0.110 0.361 0.337 82 H 0.057 0.038 0.039 0.068 0.334 0.465 83 N 0.039 0.017 0.008 0.006 0.743 0.188 84 P 0.053 0.002 0.002 0.001 0.777 0.165 85 D 0.174 0.002 0.002 0.001 0.672 0.150 86 V 0.972 0.003 0.001 0.001 0.016 0.009 87 V 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 88 F 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 89 L 0.984 0.001 0.001 0.001 0.003 0.013 90 W 0.846 0.005 0.001 0.001 0.018 0.130 91 I 0.330 0.004 0.010 0.005 0.188 0.464 92 G 0.123 0.009 0.020 0.011 0.327 0.510 93 G 0.081 0.026 0.050 0.034 0.358 0.451 94 N 0.091 0.072 0.088 0.064 0.394 0.290 95 D 0.065 0.020 0.165 0.118 0.472 0.161 96 L 0.018 0.006 0.281 0.235 0.351 0.108 97 L 0.016 0.008 0.221 0.296 0.373 0.086 98 L 0.012 0.010 0.137 0.358 0.343 0.140 99 N 0.015 0.012 0.024 0.119 0.323 0.506 100 G 0.010 0.009 0.031 0.168 0.264 0.518 101 N 0.005 0.005 0.039 0.353 0.232 0.364 102 L 0.003 0.004 0.061 0.619 0.177 0.137 103 N 0.002 0.002 0.055 0.802 0.089 0.051 104 A 0.001 0.001 0.040 0.872 0.053 0.032 105 T 0.001 0.001 0.038 0.860 0.053 0.046 106 G 0.001 0.002 0.030 0.924 0.021 0.022 107 L 0.001 0.001 0.011 0.965 0.010 0.012 108 S 0.001 0.001 0.004 0.982 0.006 0.007 109 N 0.001 0.001 0.003 0.983 0.005 0.008 110 L 0.001 0.001 0.001 0.988 0.003 0.006 111 I 0.002 0.001 0.001 0.990 0.003 0.004 112 D 0.001 0.001 0.001 0.990 0.004 0.003 113 Q 0.001 0.001 0.001 0.991 0.003 0.003 114 I 0.001 0.001 0.002 0.985 0.006 0.006 115 F 0.001 0.001 0.011 0.967 0.013 0.008 116 T 0.001 0.001 0.015 0.919 0.037 0.027 117 V 0.001 0.003 0.014 0.829 0.060 0.094 118 K 0.002 0.007 0.014 0.063 0.799 0.116 119 P 0.001 0.001 0.014 0.010 0.902 0.072 120 N 0.005 0.001 0.017 0.002 0.929 0.047 121 V 0.166 0.008 0.004 0.001 0.751 0.069 122 T 0.748 0.007 0.001 0.001 0.057 0.187 123 L 0.989 0.002 0.001 0.001 0.002 0.008 124 F 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 125 V 0.985 0.002 0.001 0.001 0.002 0.012 126 A 0.928 0.001 0.002 0.001 0.014 0.055 127 D 0.753 0.003 0.003 0.002 0.059 0.180 128 Y 0.441 0.016 0.007 0.006 0.144 0.386 129 Y 0.295 0.035 0.009 0.011 0.214 0.436 130 P 0.117 0.012 0.020 0.020 0.314 0.517 131 W 0.029 0.011 0.039 0.044 0.464 0.412 132 P 0.013 0.005 0.075 0.120 0.538 0.248 133 E 0.008 0.005 0.081 0.239 0.463 0.204 134 A 0.013 0.016 0.083 0.406 0.292 0.188 135 I 0.012 0.010 0.040 0.643 0.149 0.145 136 K 0.006 0.002 0.022 0.849 0.065 0.057 137 Q 0.005 0.002 0.017 0.918 0.034 0.024 138 Y 0.004 0.001 0.009 0.946 0.019 0.021 139 N 0.003 0.001 0.004 0.964 0.012 0.016 140 A 0.002 0.001 0.004 0.972 0.010 0.012 141 V 0.001 0.001 0.004 0.979 0.007 0.008 142 I 0.001 0.001 0.003 0.978 0.006 0.011 143 P 0.001 0.001 0.006 0.967 0.011 0.015 144 G 0.001 0.001 0.005 0.953 0.016 0.025 145 I 0.001 0.001 0.003 0.956 0.010 0.030 146 V 0.001 0.001 0.004 0.956 0.014 0.024 147 Q 0.001 0.001 0.005 0.958 0.019 0.018 148 Q 0.001 0.001 0.008 0.966 0.017 0.009 149 K 0.001 0.001 0.010 0.955 0.025 0.008 150 A 0.001 0.001 0.019 0.932 0.035 0.012 151 N 0.001 0.001 0.016 0.867 0.075 0.041 152 A 0.003 0.001 0.024 0.664 0.164 0.145 153 G 0.009 0.006 0.015 0.270 0.245 0.454 154 K 0.028 0.008 0.012 0.061 0.256 0.635 155 K 0.134 0.009 0.014 0.072 0.244 0.527 156 V 0.287 0.011 0.011 0.064 0.175 0.452 157 Y 0.498 0.017 0.008 0.061 0.095 0.322 158 F 0.644 0.009 0.009 0.073 0.059 0.205 159 V 0.673 0.006 0.014 0.099 0.054 0.154 160 K 0.694 0.008 0.020 0.106 0.062 0.111 161 L 0.625 0.009 0.032 0.129 0.087 0.118 162 S 0.432 0.008 0.058 0.161 0.175 0.166 163 E 0.336 0.010 0.085 0.155 0.242 0.171 164 I 0.223 0.012 0.072 0.165 0.304 0.224 165 Q 0.180 0.024 0.055 0.148 0.361 0.232 166 F 0.145 0.015 0.041 0.111 0.376 0.313 167 D 0.112 0.015 0.030 0.064 0.377 0.402 168 R 0.086 0.019 0.042 0.086 0.414 0.353 169 N 0.073 0.020 0.060 0.075 0.362 0.411 170 T 0.073 0.018 0.235 0.125 0.342 0.207 171 D 0.073 0.015 0.244 0.139 0.335 0.195 172 I 0.112 0.027 0.195 0.141 0.308 0.216 173 S 0.102 0.049 0.091 0.114 0.460 0.184 174 W 0.067 0.018 0.056 0.074 0.593 0.192 175 D 0.038 0.008 0.060 0.038 0.664 0.191 176 G 0.109 0.021 0.039 0.050 0.537 0.243 177 L 0.262 0.095 0.022 0.051 0.285 0.285 178 H 0.148 0.065 0.013 0.072 0.299 0.403 179 L 0.067 0.039 0.015 0.130 0.286 0.462 180 S 0.009 0.010 0.007 0.280 0.123 0.570 181 E 0.001 0.001 0.002 0.991 0.004 0.003 182 I 0.001 0.001 0.001 0.995 0.003 0.001 183 G 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 184 Y 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 185 K 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 186 K 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 187 I 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 188 A 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 189 N 0.001 0.001 0.001 0.991 0.005 0.004 190 I 0.001 0.001 0.001 0.982 0.007 0.010 191 W 0.001 0.001 0.003 0.965 0.009 0.021 192 Y 0.001 0.001 0.005 0.953 0.014 0.028 193 K 0.001 0.001 0.006 0.968 0.010 0.016 194 Y 0.001 0.001 0.009 0.982 0.004 0.004 195 T 0.001 0.001 0.008 0.978 0.007 0.007 196 I 0.001 0.001 0.011 0.962 0.012 0.015 197 D 0.001 0.001 0.011 0.936 0.021 0.031 198 I 0.001 0.001 0.013 0.958 0.017 0.012 199 L 0.001 0.001 0.020 0.931 0.034 0.013 200 R 0.001 0.001 0.039 0.863 0.078 0.019 201 A 0.001 0.001 0.038 0.786 0.126 0.050 202 L 0.001 0.002 0.047 0.659 0.174 0.117 203 A 0.002 0.010 0.045 0.472 0.210 0.261 204 G 0.003 0.005 0.028 0.243 0.180 0.541 205 E 0.001 0.001 0.004 0.027 0.051 0.917