# TARGET T0286 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0286.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1642 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.097 0.006 0.017 0.032 0.028 0.112 0.103 0.606 2 A 0.263 0.010 0.008 0.014 0.018 0.081 0.071 0.535 3 S 0.054 0.004 0.008 0.004 0.009 0.089 0.040 0.794 4 K 0.021 0.005 0.041 0.018 0.047 0.190 0.043 0.636 5 T 0.014 0.003 0.079 0.032 0.068 0.135 0.078 0.591 6 I 0.003 0.002 0.218 0.073 0.089 0.116 0.055 0.445 7 K 0.002 0.001 0.652 0.059 0.094 0.033 0.064 0.096 8 I 0.002 0.002 0.519 0.073 0.082 0.043 0.084 0.195 9 M 0.004 0.001 0.825 0.043 0.038 0.019 0.019 0.052 10 P 0.044 0.009 0.485 0.049 0.072 0.076 0.112 0.152 11 V 0.028 0.022 0.292 0.024 0.052 0.164 0.097 0.320 12 G 0.033 0.017 0.119 0.020 0.049 0.185 0.122 0.456 13 D 0.045 0.034 0.090 0.026 0.047 0.144 0.387 0.227 14 S 0.054 0.074 0.119 0.036 0.074 0.164 0.166 0.314 15 C 0.160 0.048 0.092 0.047 0.086 0.138 0.081 0.348 16 T 0.062 0.025 0.058 0.046 0.080 0.136 0.105 0.489 17 E 0.052 0.021 0.044 0.032 0.079 0.185 0.056 0.531 18 G 0.071 0.016 0.039 0.037 0.068 0.184 0.072 0.513 19 M 0.065 0.014 0.032 0.039 0.043 0.166 0.042 0.600 20 G 0.108 0.027 0.035 0.024 0.050 0.121 0.083 0.552 21 G 0.062 0.023 0.023 0.029 0.047 0.134 0.061 0.621 22 G 0.119 0.021 0.023 0.025 0.036 0.119 0.067 0.590 23 E 0.110 0.036 0.018 0.028 0.039 0.132 0.089 0.547 24 M 0.049 0.043 0.018 0.013 0.036 0.128 0.047 0.666 25 G 0.034 0.049 0.026 0.030 0.056 0.125 0.110 0.570 26 S 0.022 0.194 0.027 0.039 0.047 0.114 0.093 0.465 27 Y 0.031 0.714 0.009 0.013 0.018 0.029 0.041 0.145 28 R 0.019 0.903 0.005 0.004 0.004 0.008 0.018 0.039 29 T 0.009 0.934 0.004 0.003 0.003 0.005 0.020 0.023 30 E 0.005 0.971 0.004 0.001 0.001 0.002 0.007 0.008 31 L 0.033 0.942 0.002 0.001 0.001 0.002 0.012 0.008 32 Y 0.010 0.052 0.006 0.001 0.001 0.003 0.916 0.011 33 R 0.011 0.567 0.007 0.004 0.003 0.013 0.317 0.078 34 L 0.114 0.577 0.015 0.003 0.004 0.031 0.047 0.211 35 L 0.092 0.110 0.067 0.040 0.017 0.071 0.228 0.375 36 T 0.381 0.047 0.007 0.003 0.007 0.048 0.055 0.452 37 Q 0.137 0.008 0.007 0.002 0.001 0.067 0.048 0.730 38 A 0.033 0.007 0.026 0.007 0.008 0.188 0.025 0.706 39 G 0.047 0.005 0.013 0.002 0.004 0.079 0.028 0.822 40 L 0.015 0.008 0.069 0.014 0.013 0.179 0.022 0.680 41 S 0.020 0.015 0.299 0.016 0.039 0.088 0.070 0.453 42 I 0.021 0.014 0.118 0.055 0.055 0.107 0.074 0.556 43 D 0.015 0.008 0.481 0.073 0.093 0.063 0.071 0.197 44 F 0.020 0.012 0.240 0.060 0.086 0.077 0.149 0.357 45 V 0.042 0.016 0.310 0.091 0.107 0.085 0.080 0.269 46 G 0.080 0.013 0.122 0.057 0.106 0.102 0.093 0.428 47 S 0.025 0.008 0.061 0.039 0.066 0.138 0.061 0.601 48 Q 0.073 0.009 0.057 0.030 0.050 0.163 0.060 0.558 49 R 0.058 0.006 0.027 0.025 0.033 0.177 0.091 0.583 50 S 0.028 0.006 0.022 0.013 0.025 0.141 0.061 0.703 51 G 0.108 0.019 0.025 0.021 0.040 0.156 0.081 0.550 52 P 0.099 0.017 0.021 0.025 0.032 0.150 0.061 0.596 53 S 0.031 0.014 0.035 0.024 0.045 0.137 0.068 0.647 54 S 0.050 0.014 0.027 0.020 0.037 0.171 0.047 0.634 55 L 0.216 0.021 0.025 0.022 0.027 0.162 0.065 0.463 56 P 0.058 0.020 0.019 0.011 0.019 0.140 0.047 0.686 57 D 0.076 0.027 0.026 0.012 0.032 0.154 0.053 0.619 58 K 0.061 0.032 0.032 0.028 0.044 0.154 0.082 0.568 59 D 0.045 0.019 0.050 0.038 0.057 0.152 0.059 0.580 60 H 0.044 0.017 0.080 0.049 0.091 0.135 0.161 0.422 61 E 0.018 0.012 0.109 0.056 0.096 0.156 0.089 0.464 62 G 0.101 0.010 0.097 0.036 0.079 0.137 0.076 0.465 63 H 0.105 0.008 0.052 0.051 0.058 0.124 0.100 0.502 64 S 0.034 0.011 0.065 0.026 0.099 0.134 0.064 0.566 65 G 0.032 0.013 0.041 0.024 0.066 0.144 0.051 0.630 66 W 0.007 0.011 0.074 0.097 0.086 0.181 0.031 0.513 67 T 0.022 0.076 0.033 0.020 0.031 0.093 0.038 0.686 68 I 0.208 0.525 0.016 0.013 0.012 0.030 0.089 0.106 69 P 0.108 0.301 0.031 0.010 0.010 0.057 0.168 0.316 70 Q 0.048 0.256 0.030 0.011 0.009 0.044 0.389 0.213 71 I 0.145 0.601 0.009 0.003 0.004 0.028 0.083 0.125 72 A 0.184 0.284 0.015 0.004 0.007 0.048 0.217 0.241 73 S 0.016 0.195 0.015 0.008 0.010 0.083 0.175 0.498 74 N 0.030 0.631 0.008 0.002 0.004 0.044 0.043 0.238 75 I 0.081 0.770 0.006 0.002 0.002 0.022 0.026 0.091 76 N 0.117 0.347 0.024 0.004 0.006 0.042 0.279 0.182 77 N 0.043 0.119 0.023 0.005 0.006 0.040 0.597 0.167 78 W 0.091 0.099 0.081 0.011 0.012 0.083 0.359 0.263 79 L 0.199 0.024 0.048 0.017 0.018 0.075 0.147 0.472 80 N 0.088 0.007 0.012 0.007 0.013 0.076 0.041 0.756 81 T 0.006 0.001 0.016 0.002 0.006 0.117 0.043 0.809 82 H 0.039 0.002 0.031 0.008 0.009 0.225 0.038 0.647 83 N 0.157 0.004 0.027 0.006 0.008 0.181 0.084 0.533 84 P 0.002 0.002 0.087 0.005 0.011 0.239 0.040 0.613 85 D 0.001 0.001 0.853 0.008 0.033 0.031 0.043 0.032 86 V 0.001 0.001 0.692 0.029 0.028 0.022 0.124 0.103 87 V 0.001 0.001 0.973 0.009 0.004 0.001 0.009 0.003 88 F 0.001 0.001 0.948 0.004 0.008 0.004 0.029 0.007 89 L 0.001 0.001 0.940 0.009 0.009 0.008 0.025 0.007 90 W 0.005 0.001 0.826 0.010 0.020 0.031 0.073 0.034 91 I 0.019 0.006 0.503 0.013 0.041 0.147 0.166 0.105 92 G 0.062 0.013 0.263 0.016 0.045 0.245 0.114 0.241 93 G 0.052 0.018 0.126 0.013 0.036 0.248 0.173 0.334 94 N 0.074 0.037 0.051 0.010 0.031 0.219 0.093 0.485 95 D 0.094 0.032 0.039 0.016 0.034 0.193 0.168 0.424 96 L 0.065 0.067 0.020 0.017 0.024 0.209 0.077 0.521 97 L 0.040 0.061 0.023 0.013 0.025 0.151 0.065 0.621 98 L 0.060 0.121 0.012 0.014 0.015 0.129 0.046 0.604 99 N 0.120 0.444 0.008 0.008 0.012 0.042 0.191 0.174 100 G 0.064 0.695 0.005 0.004 0.007 0.032 0.051 0.142 101 N 0.040 0.419 0.016 0.011 0.015 0.044 0.284 0.171 102 L 0.013 0.519 0.018 0.010 0.008 0.040 0.255 0.136 103 N 0.065 0.844 0.003 0.001 0.002 0.009 0.048 0.029 104 A 0.062 0.248 0.005 0.001 0.002 0.016 0.598 0.067 105 T 0.001 0.047 0.002 0.001 0.001 0.010 0.900 0.038 106 G 0.003 0.933 0.001 0.001 0.001 0.005 0.035 0.022 107 L 0.004 0.978 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.006 108 S 0.005 0.935 0.003 0.001 0.001 0.003 0.046 0.008 109 N 0.005 0.939 0.002 0.001 0.001 0.003 0.044 0.007 110 L 0.005 0.978 0.004 0.001 0.001 0.001 0.010 0.002 111 I 0.017 0.929 0.008 0.001 0.001 0.002 0.035 0.007 112 D 0.013 0.242 0.048 0.001 0.001 0.014 0.612 0.070 113 Q 0.020 0.298 0.068 0.001 0.001 0.024 0.512 0.076 114 I 0.222 0.397 0.087 0.006 0.005 0.033 0.107 0.145 115 F 0.285 0.063 0.012 0.005 0.007 0.065 0.029 0.535 116 T 0.003 0.003 0.032 0.004 0.004 0.060 0.063 0.831 117 V 0.111 0.003 0.021 0.005 0.006 0.116 0.049 0.690 118 K 0.854 0.001 0.007 0.001 0.001 0.020 0.042 0.076 119 P 0.014 0.001 0.015 0.001 0.002 0.171 0.005 0.791 120 N 0.001 0.001 0.054 0.001 0.007 0.087 0.010 0.840 121 V 0.001 0.001 0.298 0.045 0.035 0.185 0.059 0.377 122 T 0.001 0.001 0.885 0.023 0.020 0.010 0.037 0.025 123 L 0.001 0.001 0.755 0.040 0.036 0.009 0.082 0.077 124 F 0.001 0.001 0.962 0.012 0.008 0.002 0.009 0.007 125 V 0.004 0.001 0.852 0.025 0.033 0.013 0.030 0.043 126 A 0.014 0.001 0.620 0.042 0.055 0.060 0.050 0.158 127 D 0.047 0.004 0.182 0.022 0.052 0.172 0.074 0.446 128 Y 0.044 0.005 0.049 0.009 0.021 0.197 0.067 0.609 129 Y 0.028 0.010 0.035 0.015 0.019 0.203 0.048 0.642 130 P 0.034 0.045 0.018 0.008 0.010 0.142 0.034 0.709 131 W 0.181 0.319 0.010 0.006 0.006 0.071 0.066 0.341 132 P 0.213 0.579 0.005 0.002 0.002 0.029 0.038 0.132 133 E 0.074 0.602 0.009 0.003 0.004 0.038 0.052 0.218 134 A 0.069 0.664 0.008 0.002 0.004 0.033 0.055 0.164 135 I 0.091 0.455 0.014 0.004 0.005 0.033 0.280 0.118 136 K 0.057 0.550 0.009 0.004 0.007 0.040 0.133 0.200 137 Q 0.066 0.435 0.018 0.005 0.007 0.044 0.118 0.307 138 Y 0.077 0.415 0.014 0.009 0.012 0.058 0.134 0.281 139 N 0.116 0.261 0.016 0.004 0.007 0.058 0.216 0.321 140 A 0.013 0.284 0.018 0.012 0.010 0.100 0.116 0.446 141 V 0.015 0.680 0.008 0.002 0.003 0.038 0.020 0.235 142 I 0.030 0.916 0.001 0.001 0.001 0.006 0.027 0.019 143 P 0.008 0.915 0.003 0.001 0.001 0.005 0.049 0.019 144 G 0.006 0.928 0.004 0.001 0.001 0.003 0.045 0.013 145 I 0.004 0.984 0.002 0.001 0.001 0.001 0.005 0.003 146 V 0.015 0.971 0.002 0.001 0.001 0.001 0.007 0.005 147 Q 0.016 0.743 0.027 0.002 0.001 0.007 0.163 0.041 148 Q 0.022 0.816 0.014 0.002 0.001 0.010 0.067 0.068 149 K 0.301 0.185 0.109 0.007 0.003 0.025 0.246 0.123 150 A 0.467 0.042 0.023 0.007 0.005 0.050 0.105 0.301 151 N 0.082 0.003 0.009 0.001 0.001 0.031 0.033 0.839 152 A 0.036 0.002 0.004 0.001 0.002 0.058 0.009 0.889 153 G 0.052 0.001 0.015 0.002 0.004 0.102 0.046 0.776 154 K 0.007 0.001 0.031 0.007 0.011 0.198 0.015 0.729 155 K 0.007 0.001 0.258 0.016 0.048 0.092 0.036 0.541 156 V 0.003 0.001 0.202 0.074 0.059 0.065 0.039 0.557 157 Y 0.001 0.001 0.808 0.048 0.066 0.015 0.013 0.048 158 F 0.003 0.004 0.407 0.087 0.112 0.035 0.059 0.293 159 V 0.005 0.005 0.658 0.137 0.054 0.023 0.022 0.095 160 K 0.150 0.087 0.271 0.050 0.071 0.060 0.084 0.227 161 L 0.106 0.133 0.139 0.034 0.047 0.084 0.110 0.347 162 S 0.068 0.144 0.065 0.027 0.043 0.078 0.060 0.515 163 E 0.100 0.115 0.061 0.038 0.050 0.096 0.123 0.418 164 I 0.074 0.101 0.047 0.051 0.061 0.126 0.089 0.451 165 Q 0.104 0.034 0.047 0.034 0.058 0.095 0.148 0.480 166 F 0.055 0.014 0.020 0.024 0.032 0.125 0.175 0.555 167 D 0.066 0.025 0.017 0.021 0.029 0.105 0.101 0.637 168 R 0.113 0.021 0.007 0.010 0.020 0.114 0.027 0.687 169 N 0.060 0.014 0.013 0.015 0.026 0.121 0.066 0.686 170 T 0.042 0.017 0.025 0.028 0.043 0.150 0.060 0.636 171 D 0.027 0.010 0.039 0.032 0.053 0.177 0.068 0.594 172 I 0.018 0.006 0.066 0.031 0.029 0.168 0.054 0.627 173 S 0.321 0.018 0.038 0.015 0.022 0.094 0.064 0.428 174 W 0.200 0.019 0.021 0.015 0.016 0.113 0.097 0.519 175 D 0.017 0.011 0.067 0.013 0.046 0.159 0.025 0.662 176 G 0.013 0.010 0.128 0.031 0.107 0.112 0.078 0.521 177 L 0.016 0.029 0.134 0.117 0.085 0.114 0.070 0.436 178 H 0.072 0.108 0.210 0.055 0.077 0.099 0.072 0.306 179 L 0.059 0.206 0.058 0.036 0.040 0.083 0.106 0.411 180 S 0.057 0.700 0.013 0.004 0.006 0.028 0.052 0.141 181 E 0.023 0.860 0.005 0.002 0.002 0.014 0.028 0.066 182 I 0.006 0.936 0.003 0.002 0.002 0.008 0.014 0.030 183 G 0.006 0.970 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.004 184 Y 0.004 0.932 0.001 0.001 0.001 0.001 0.059 0.003 185 K 0.001 0.789 0.001 0.001 0.001 0.001 0.198 0.007 186 K 0.001 0.939 0.001 0.001 0.001 0.002 0.052 0.005 187 I 0.002 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 188 A 0.003 0.977 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.003 189 N 0.003 0.966 0.002 0.001 0.001 0.001 0.020 0.008 190 I 0.020 0.909 0.003 0.001 0.001 0.004 0.050 0.013 191 W 0.022 0.210 0.010 0.001 0.001 0.006 0.740 0.012 192 Y 0.023 0.701 0.003 0.001 0.001 0.008 0.209 0.055 193 K 0.017 0.738 0.008 0.001 0.001 0.015 0.064 0.158 194 Y 0.013 0.791 0.015 0.002 0.001 0.025 0.056 0.097 195 T 0.060 0.804 0.011 0.001 0.001 0.014 0.057 0.052 196 I 0.103 0.722 0.011 0.001 0.001 0.018 0.038 0.106 197 D 0.057 0.637 0.038 0.002 0.002 0.034 0.052 0.177 198 I 0.071 0.530 0.040 0.003 0.003 0.043 0.070 0.240 199 L 0.231 0.308 0.074 0.004 0.004 0.044 0.084 0.249 200 R 0.167 0.084 0.081 0.009 0.006 0.064 0.097 0.491 201 A 0.108 0.029 0.026 0.004 0.004 0.074 0.041 0.714 202 L 0.114 0.010 0.023 0.005 0.005 0.090 0.043 0.711 203 A 0.048 0.005 0.008 0.004 0.005 0.099 0.023 0.808 204 G 0.044 0.008 0.007 0.003 0.007 0.069 0.028 0.834 205 E 0.032 0.010 0.016 0.015 0.022 0.133 0.029 0.743