# TARGET T0286 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0286.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1642 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.065 0.017 0.053 0.054 0.096 0.077 0.006 0.632 2 A 0.009 0.007 0.015 0.015 0.036 0.053 0.002 0.862 3 S 0.027 0.013 0.012 0.015 0.041 0.088 0.007 0.798 4 K 0.176 0.018 0.017 0.019 0.019 0.121 0.024 0.606 5 T 0.319 0.008 0.028 0.014 0.018 0.208 0.032 0.373 6 I 0.089 0.011 0.275 0.097 0.061 0.095 0.014 0.358 7 K 0.016 0.005 0.510 0.123 0.162 0.058 0.005 0.121 8 I 0.009 0.002 0.562 0.051 0.121 0.031 0.003 0.221 9 M 0.001 0.001 0.915 0.043 0.026 0.002 0.001 0.012 10 P 0.001 0.001 0.257 0.020 0.028 0.016 0.001 0.677 11 V 0.001 0.001 0.884 0.016 0.046 0.011 0.001 0.041 12 G 0.002 0.005 0.468 0.052 0.065 0.077 0.002 0.329 13 D 0.023 0.005 0.239 0.032 0.093 0.143 0.011 0.454 14 S 0.061 0.008 0.200 0.031 0.052 0.238 0.008 0.403 15 C 0.120 0.031 0.086 0.054 0.091 0.192 0.017 0.410 16 T 0.111 0.047 0.083 0.053 0.090 0.268 0.023 0.325 17 E 0.157 0.104 0.045 0.053 0.098 0.159 0.025 0.360 18 G 0.166 0.158 0.050 0.057 0.088 0.078 0.029 0.373 19 M 0.166 0.073 0.064 0.065 0.095 0.110 0.040 0.387 20 G 0.115 0.060 0.060 0.071 0.090 0.082 0.029 0.493 21 G 0.083 0.020 0.043 0.038 0.077 0.056 0.012 0.671 22 G 0.043 0.021 0.046 0.041 0.071 0.096 0.011 0.671 23 E 0.074 0.018 0.030 0.017 0.036 0.139 0.010 0.675 24 M 0.072 0.035 0.052 0.021 0.031 0.143 0.012 0.633 25 G 0.150 0.044 0.035 0.018 0.020 0.115 0.023 0.595 26 S 0.178 0.021 0.052 0.012 0.016 0.168 0.014 0.540 27 Y 0.067 0.043 0.042 0.015 0.025 0.152 0.005 0.652 28 R 0.045 0.064 0.048 0.015 0.058 0.213 0.006 0.551 29 T 0.021 0.100 0.015 0.007 0.018 0.176 0.003 0.660 30 E 0.037 0.292 0.006 0.004 0.009 0.222 0.004 0.425 31 L 0.033 0.788 0.004 0.003 0.006 0.046 0.003 0.117 32 Y 0.009 0.932 0.002 0.001 0.004 0.008 0.002 0.042 33 R 0.011 0.946 0.001 0.001 0.001 0.006 0.002 0.032 34 L 0.024 0.952 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.015 35 L 0.023 0.955 0.001 0.001 0.002 0.001 0.005 0.013 36 T 0.036 0.905 0.005 0.002 0.004 0.004 0.014 0.031 37 Q 0.084 0.806 0.013 0.003 0.003 0.006 0.030 0.055 38 A 0.208 0.556 0.023 0.006 0.004 0.012 0.096 0.095 39 G 0.491 0.106 0.041 0.008 0.005 0.016 0.152 0.180 40 L 0.102 0.038 0.486 0.020 0.015 0.060 0.024 0.255 41 S 0.021 0.012 0.107 0.026 0.033 0.091 0.009 0.701 42 I 0.046 0.007 0.126 0.025 0.049 0.056 0.004 0.686 43 D 0.018 0.009 0.410 0.108 0.095 0.096 0.006 0.258 44 F 0.020 0.008 0.202 0.053 0.082 0.087 0.005 0.545 45 V 0.018 0.017 0.412 0.147 0.207 0.045 0.004 0.151 46 G 0.020 0.018 0.135 0.117 0.169 0.097 0.008 0.437 47 S 0.057 0.011 0.160 0.050 0.104 0.081 0.010 0.527 48 Q 0.053 0.013 0.096 0.058 0.082 0.152 0.011 0.535 49 R 0.078 0.015 0.067 0.047 0.083 0.181 0.018 0.511 50 S 0.050 0.025 0.073 0.034 0.063 0.113 0.020 0.621 51 G 0.112 0.014 0.043 0.037 0.052 0.125 0.018 0.599 52 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.991 53 S 0.027 0.006 0.034 0.041 0.084 0.159 0.007 0.642 54 S 0.144 0.015 0.035 0.032 0.055 0.136 0.013 0.570 55 L 0.116 0.018 0.048 0.055 0.095 0.127 0.007 0.535 56 P 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.001 0.984 57 D 0.032 0.016 0.030 0.038 0.080 0.167 0.006 0.631 58 K 0.116 0.027 0.025 0.023 0.032 0.108 0.014 0.655 59 D 0.101 0.031 0.034 0.022 0.046 0.289 0.015 0.462 60 H 0.188 0.050 0.039 0.032 0.040 0.217 0.019 0.415 61 E 0.200 0.075 0.084 0.037 0.051 0.209 0.018 0.326 62 G 0.082 0.050 0.096 0.039 0.064 0.154 0.024 0.491 63 H 0.097 0.072 0.168 0.077 0.124 0.134 0.013 0.315 64 S 0.016 0.040 0.055 0.044 0.073 0.060 0.005 0.706 65 G 0.038 0.044 0.045 0.037 0.096 0.068 0.013 0.658 66 W 0.223 0.029 0.067 0.033 0.047 0.112 0.023 0.467 67 T 0.075 0.032 0.040 0.021 0.027 0.196 0.019 0.589 68 I 0.154 0.046 0.042 0.030 0.070 0.078 0.007 0.573 69 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.996 70 Q 0.014 0.028 0.008 0.011 0.029 0.279 0.004 0.628 71 I 0.233 0.322 0.015 0.007 0.014 0.074 0.009 0.327 72 A 0.061 0.711 0.010 0.006 0.017 0.025 0.005 0.165 73 S 0.086 0.640 0.010 0.005 0.007 0.040 0.010 0.200 74 N 0.212 0.520 0.008 0.003 0.003 0.034 0.023 0.197 75 I 0.137 0.715 0.013 0.003 0.006 0.013 0.014 0.099 76 N 0.029 0.683 0.022 0.004 0.011 0.042 0.013 0.195 77 N 0.054 0.639 0.010 0.004 0.006 0.046 0.015 0.227 78 W 0.129 0.708 0.010 0.003 0.004 0.020 0.015 0.111 79 L 0.084 0.770 0.017 0.005 0.007 0.017 0.014 0.086 80 N 0.096 0.616 0.031 0.012 0.013 0.033 0.034 0.165 81 T 0.276 0.279 0.029 0.010 0.015 0.030 0.062 0.299 82 H 0.252 0.190 0.055 0.017 0.023 0.050 0.099 0.315 83 N 0.132 0.044 0.067 0.035 0.031 0.128 0.035 0.528 84 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 85 D 0.032 0.001 0.248 0.169 0.172 0.212 0.010 0.155 86 V 0.051 0.001 0.699 0.041 0.045 0.034 0.003 0.126 87 V 0.001 0.001 0.950 0.027 0.020 0.001 0.001 0.002 88 F 0.001 0.001 0.952 0.024 0.019 0.001 0.001 0.004 89 L 0.001 0.001 0.985 0.005 0.009 0.001 0.001 0.001 90 W 0.001 0.001 0.979 0.007 0.010 0.001 0.001 0.003 91 I 0.001 0.001 0.907 0.021 0.034 0.007 0.001 0.031 92 G 0.001 0.001 0.633 0.027 0.086 0.067 0.001 0.184 93 G 0.006 0.001 0.305 0.026 0.059 0.115 0.003 0.484 94 N 0.014 0.002 0.095 0.020 0.041 0.213 0.008 0.606 95 D 0.104 0.004 0.032 0.015 0.025 0.170 0.013 0.637 96 L 0.070 0.014 0.039 0.017 0.019 0.245 0.012 0.584 97 L 0.091 0.030 0.041 0.019 0.029 0.208 0.018 0.562 98 L 0.134 0.077 0.088 0.029 0.035 0.198 0.015 0.426 99 N 0.024 0.058 0.026 0.016 0.025 0.124 0.006 0.721 100 G 0.033 0.037 0.020 0.009 0.031 0.055 0.005 0.811 101 N 0.041 0.054 0.011 0.007 0.017 0.401 0.006 0.462 102 L 0.153 0.106 0.007 0.005 0.012 0.379 0.009 0.329 103 N 0.053 0.773 0.004 0.005 0.007 0.039 0.003 0.115 104 A 0.022 0.826 0.011 0.004 0.011 0.016 0.004 0.106 105 T 0.028 0.749 0.005 0.004 0.007 0.044 0.007 0.157 106 G 0.155 0.630 0.003 0.002 0.004 0.037 0.016 0.154 107 L 0.041 0.875 0.005 0.001 0.003 0.009 0.005 0.062 108 S 0.006 0.897 0.003 0.001 0.001 0.013 0.003 0.077 109 N 0.011 0.907 0.001 0.001 0.001 0.010 0.003 0.067 110 L 0.015 0.935 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.042 111 I 0.004 0.970 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.020 112 D 0.001 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 113 Q 0.004 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 114 I 0.022 0.954 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.016 115 F 0.021 0.936 0.005 0.002 0.002 0.002 0.007 0.025 116 T 0.074 0.814 0.006 0.004 0.003 0.004 0.027 0.069 117 V 0.141 0.534 0.039 0.006 0.007 0.007 0.109 0.157 118 K 0.147 0.405 0.046 0.022 0.024 0.036 0.039 0.281 119 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 120 N 0.049 0.006 0.057 0.068 0.074 0.157 0.030 0.559 121 V 0.502 0.001 0.174 0.019 0.016 0.037 0.015 0.236 122 T 0.004 0.001 0.814 0.092 0.037 0.013 0.001 0.038 123 L 0.001 0.001 0.739 0.047 0.072 0.012 0.001 0.127 124 F 0.001 0.001 0.983 0.007 0.008 0.001 0.001 0.001 125 V 0.001 0.001 0.958 0.014 0.014 0.002 0.001 0.011 126 A 0.001 0.001 0.976 0.006 0.011 0.001 0.001 0.006 127 D 0.001 0.001 0.817 0.019 0.038 0.027 0.001 0.097 128 Y 0.005 0.001 0.341 0.013 0.053 0.095 0.003 0.489 129 Y 0.014 0.001 0.107 0.012 0.031 0.249 0.003 0.584 130 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.997 131 W 0.022 0.001 0.010 0.009 0.020 0.130 0.002 0.806 132 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 133 E 0.009 0.006 0.004 0.006 0.017 0.148 0.001 0.809 134 A 0.254 0.062 0.009 0.005 0.008 0.151 0.006 0.505 135 I 0.211 0.384 0.012 0.007 0.018 0.047 0.004 0.318 136 K 0.058 0.603 0.013 0.007 0.012 0.060 0.005 0.242 137 Q 0.068 0.733 0.007 0.004 0.005 0.034 0.008 0.143 138 Y 0.081 0.840 0.004 0.002 0.004 0.010 0.009 0.051 139 N 0.073 0.827 0.007 0.003 0.006 0.012 0.015 0.058 140 A 0.048 0.829 0.014 0.005 0.004 0.009 0.013 0.076 141 V 0.115 0.602 0.015 0.004 0.005 0.042 0.033 0.182 142 I 0.098 0.673 0.031 0.006 0.011 0.023 0.012 0.146 143 P 0.002 0.094 0.004 0.001 0.002 0.010 0.001 0.886 144 G 0.017 0.338 0.006 0.003 0.004 0.082 0.005 0.545 145 I 0.048 0.736 0.003 0.001 0.001 0.029 0.006 0.176 146 V 0.018 0.890 0.004 0.001 0.003 0.008 0.003 0.073 147 Q 0.003 0.961 0.003 0.001 0.002 0.002 0.001 0.027 148 Q 0.006 0.943 0.002 0.001 0.001 0.003 0.002 0.042 149 K 0.010 0.970 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.015 150 A 0.006 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 151 N 0.033 0.927 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.022 152 A 0.292 0.539 0.009 0.003 0.002 0.002 0.102 0.051 153 G 0.392 0.302 0.036 0.005 0.004 0.007 0.160 0.095 154 K 0.127 0.089 0.276 0.040 0.017 0.035 0.088 0.328 155 K 0.033 0.008 0.246 0.020 0.021 0.063 0.026 0.582 156 V 0.069 0.002 0.351 0.018 0.029 0.061 0.006 0.463 157 Y 0.002 0.001 0.918 0.035 0.015 0.006 0.001 0.022 158 F 0.001 0.001 0.145 0.010 0.019 0.011 0.001 0.814 159 V 0.001 0.001 0.931 0.020 0.030 0.003 0.001 0.016 160 K 0.002 0.001 0.184 0.045 0.055 0.165 0.001 0.546 161 L 0.013 0.002 0.347 0.023 0.126 0.083 0.003 0.404 162 S 0.016 0.005 0.084 0.017 0.044 0.478 0.003 0.354 163 E 0.089 0.011 0.031 0.015 0.028 0.266 0.016 0.543 164 I 0.139 0.075 0.046 0.020 0.034 0.171 0.012 0.502 165 Q 0.181 0.145 0.047 0.043 0.096 0.184 0.024 0.280 166 F 0.182 0.206 0.050 0.051 0.081 0.062 0.022 0.345 167 D 0.109 0.208 0.046 0.051 0.090 0.060 0.027 0.410 168 R 0.154 0.089 0.052 0.026 0.047 0.075 0.033 0.524 169 N 0.103 0.073 0.032 0.020 0.034 0.253 0.036 0.449 170 T 0.171 0.042 0.045 0.024 0.026 0.127 0.035 0.529 171 D 0.065 0.030 0.049 0.018 0.021 0.150 0.011 0.656 172 I 0.083 0.024 0.068 0.030 0.056 0.163 0.011 0.564 173 S 0.061 0.039 0.129 0.073 0.121 0.177 0.009 0.391 174 W 0.031 0.023 0.069 0.041 0.082 0.117 0.009 0.627 175 D 0.076 0.038 0.121 0.064 0.091 0.178 0.015 0.417 176 G 0.131 0.033 0.138 0.061 0.072 0.119 0.025 0.421 177 L 0.137 0.020 0.165 0.033 0.067 0.227 0.013 0.338 178 H 0.054 0.017 0.156 0.060 0.070 0.220 0.012 0.411 179 L 0.043 0.029 0.099 0.033 0.059 0.111 0.003 0.623 180 S 0.015 0.035 0.056 0.019 0.072 0.250 0.005 0.548 181 E 0.030 0.029 0.011 0.004 0.019 0.142 0.004 0.761 182 I 0.030 0.075 0.003 0.002 0.004 0.444 0.004 0.438 183 G 0.083 0.177 0.002 0.001 0.002 0.501 0.008 0.226 184 Y 0.025 0.901 0.002 0.001 0.001 0.009 0.002 0.059 185 K 0.001 0.967 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.026 186 K 0.004 0.965 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.025 187 I 0.006 0.981 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 188 A 0.004 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 189 N 0.002 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 190 I 0.009 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.012 191 W 0.022 0.945 0.002 0.001 0.001 0.002 0.006 0.023 192 Y 0.017 0.925 0.006 0.001 0.002 0.004 0.005 0.041 193 K 0.014 0.924 0.003 0.001 0.001 0.003 0.005 0.049 194 Y 0.044 0.838 0.009 0.001 0.001 0.006 0.016 0.086 195 T 0.047 0.832 0.009 0.001 0.002 0.009 0.011 0.088 196 I 0.015 0.829 0.021 0.003 0.004 0.011 0.006 0.112 197 D 0.015 0.796 0.008 0.002 0.003 0.019 0.006 0.149 198 I 0.039 0.809 0.012 0.002 0.002 0.016 0.011 0.109 199 L 0.013 0.942 0.006 0.002 0.002 0.004 0.003 0.029 200 R 0.023 0.838 0.011 0.004 0.006 0.018 0.010 0.090 201 A 0.056 0.794 0.008 0.004 0.005 0.014 0.015 0.104 202 L 0.185 0.685 0.010 0.004 0.004 0.011 0.030 0.072 203 A 0.172 0.550 0.036 0.011 0.008 0.031 0.057 0.134 204 G 0.180 0.184 0.047 0.014 0.013 0.028 0.074 0.460 205 E 0.214 0.078 0.085 0.018 0.023 0.084 0.026 0.472