# TARGET T0283 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0283.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 7.00874 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.028 0.596 0.015 0.017 0.018 0.040 0.085 0.201 2 S 0.014 0.853 0.007 0.008 0.008 0.017 0.038 0.056 3 F 0.019 0.946 0.002 0.001 0.001 0.003 0.012 0.015 4 I 0.036 0.889 0.006 0.002 0.002 0.005 0.037 0.022 5 E 0.036 0.697 0.015 0.006 0.006 0.018 0.106 0.115 6 K 0.070 0.379 0.024 0.006 0.008 0.055 0.246 0.213 7 M 0.075 0.341 0.020 0.006 0.006 0.041 0.367 0.143 8 I 0.064 0.291 0.017 0.005 0.009 0.066 0.131 0.416 9 G 0.029 0.214 0.021 0.011 0.014 0.076 0.091 0.542 10 S 0.075 0.336 0.025 0.010 0.011 0.084 0.097 0.362 11 L 0.237 0.248 0.024 0.012 0.013 0.072 0.089 0.304 12 N 0.067 0.190 0.015 0.009 0.010 0.091 0.064 0.554 13 D 0.020 0.593 0.007 0.003 0.006 0.037 0.035 0.298 14 K 0.031 0.766 0.008 0.004 0.006 0.029 0.017 0.139 15 R 0.017 0.783 0.014 0.015 0.010 0.020 0.045 0.096 16 E 0.006 0.950 0.002 0.001 0.001 0.004 0.013 0.024 17 W 0.011 0.967 0.002 0.001 0.001 0.002 0.009 0.007 18 K 0.004 0.962 0.002 0.003 0.002 0.002 0.014 0.013 19 A 0.007 0.914 0.003 0.001 0.002 0.004 0.047 0.024 20 M 0.004 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.002 21 E 0.010 0.960 0.002 0.001 0.001 0.001 0.014 0.010 22 A 0.068 0.636 0.051 0.009 0.005 0.017 0.105 0.109 23 R 0.290 0.419 0.016 0.008 0.005 0.026 0.093 0.143 24 A 0.744 0.028 0.012 0.001 0.001 0.016 0.051 0.147 25 K 0.023 0.026 0.003 0.002 0.002 0.057 0.020 0.867 26 A 0.002 0.011 0.002 0.001 0.001 0.030 0.003 0.951 27 L 0.114 0.233 0.008 0.004 0.002 0.103 0.064 0.473 28 P 0.324 0.469 0.004 0.001 0.001 0.028 0.050 0.123 29 K 0.100 0.627 0.003 0.001 0.001 0.025 0.046 0.198 30 E 0.009 0.892 0.003 0.001 0.001 0.011 0.020 0.065 31 Y 0.004 0.949 0.002 0.001 0.001 0.004 0.023 0.018 32 H 0.004 0.959 0.003 0.001 0.001 0.003 0.019 0.012 33 H 0.004 0.959 0.004 0.001 0.001 0.002 0.022 0.007 34 A 0.002 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.003 35 Y 0.004 0.945 0.004 0.001 0.001 0.001 0.040 0.005 36 K 0.002 0.966 0.002 0.001 0.001 0.002 0.019 0.008 37 A 0.012 0.946 0.005 0.001 0.001 0.003 0.022 0.012 38 I 0.036 0.828 0.008 0.002 0.002 0.007 0.097 0.020 39 Q 0.038 0.599 0.007 0.003 0.004 0.020 0.174 0.155 40 K 0.023 0.130 0.012 0.005 0.007 0.046 0.512 0.267 41 Y 0.016 0.081 0.030 0.018 0.018 0.090 0.607 0.139 42 M 0.069 0.077 0.060 0.030 0.060 0.134 0.202 0.368 43 W 0.109 0.019 0.046 0.029 0.045 0.137 0.070 0.545 44 T 0.114 0.012 0.026 0.018 0.025 0.132 0.093 0.581 45 S 0.034 0.005 0.016 0.010 0.018 0.184 0.055 0.678 46 G 0.021 0.007 0.017 0.008 0.017 0.212 0.036 0.682 47 G 0.063 0.033 0.017 0.014 0.017 0.170 0.041 0.646 48 P 0.079 0.082 0.020 0.012 0.016 0.113 0.057 0.621 49 T 0.092 0.137 0.028 0.014 0.018 0.103 0.132 0.475 50 D 0.095 0.243 0.024 0.014 0.016 0.082 0.226 0.300 51 W 0.114 0.398 0.016 0.008 0.013 0.071 0.082 0.298 52 Q 0.065 0.454 0.015 0.014 0.023 0.065 0.067 0.297 53 D 0.029 0.772 0.005 0.004 0.011 0.023 0.025 0.130 54 T 0.032 0.678 0.008 0.005 0.010 0.022 0.150 0.095 55 K 0.015 0.605 0.039 0.025 0.017 0.029 0.176 0.094 56 R 0.040 0.472 0.037 0.018 0.021 0.046 0.221 0.144 57 I 0.160 0.657 0.029 0.006 0.005 0.024 0.054 0.066 58 F 0.066 0.559 0.010 0.003 0.008 0.030 0.168 0.156 59 G 0.012 0.482 0.015 0.005 0.006 0.029 0.143 0.309 60 G 0.006 0.900 0.008 0.003 0.004 0.013 0.026 0.040 61 I 0.010 0.942 0.009 0.002 0.001 0.006 0.012 0.019 62 L 0.022 0.885 0.022 0.003 0.003 0.007 0.035 0.023 63 D 0.013 0.870 0.016 0.002 0.003 0.008 0.056 0.032 64 L 0.016 0.846 0.022 0.002 0.003 0.009 0.079 0.024 65 F 0.012 0.926 0.010 0.004 0.003 0.004 0.023 0.018 66 E 0.023 0.805 0.025 0.007 0.008 0.012 0.026 0.095 67 E 0.056 0.711 0.031 0.010 0.009 0.021 0.041 0.122 68 G 0.117 0.098 0.192 0.042 0.024 0.044 0.299 0.184 69 A 0.497 0.025 0.016 0.007 0.007 0.052 0.047 0.348 70 A 0.542 0.004 0.005 0.002 0.001 0.022 0.028 0.395 71 E 0.012 0.003 0.002 0.002 0.003 0.055 0.004 0.919 72 G 0.005 0.002 0.004 0.002 0.007 0.049 0.012 0.919 73 K 0.009 0.009 0.037 0.112 0.054 0.157 0.054 0.569 74 K 0.036 0.018 0.072 0.076 0.074 0.059 0.061 0.603 75 V 0.088 0.016 0.066 0.078 0.057 0.076 0.116 0.504 76 T 0.011 0.021 0.189 0.080 0.122 0.052 0.104 0.420 77 D 0.030 0.026 0.092 0.050 0.082 0.085 0.037 0.600 78 L 0.020 0.038 0.129 0.083 0.065 0.124 0.045 0.497 79 T 0.048 0.400 0.039 0.015 0.031 0.060 0.068 0.339 80 G 0.059 0.707 0.015 0.007 0.011 0.021 0.080 0.101 81 E 0.019 0.661 0.016 0.014 0.009 0.033 0.086 0.163 82 D 0.014 0.918 0.004 0.002 0.002 0.006 0.030 0.025 83 V 0.014 0.960 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 0.008 84 A 0.016 0.896 0.004 0.001 0.001 0.003 0.063 0.015 85 A 0.007 0.905 0.003 0.001 0.001 0.006 0.050 0.027 86 F 0.009 0.954 0.004 0.001 0.001 0.002 0.021 0.008 87 C 0.015 0.968 0.002 0.001 0.001 0.001 0.007 0.006 88 D 0.046 0.843 0.017 0.001 0.001 0.006 0.031 0.056 89 E 0.091 0.592 0.032 0.002 0.001 0.025 0.083 0.174 90 L 0.202 0.162 0.066 0.003 0.002 0.040 0.354 0.171 91 M 0.177 0.085 0.017 0.002 0.002 0.060 0.110 0.548 92 K 0.045 0.024 0.007 0.001 0.001 0.056 0.050 0.816 93 D 0.022 0.071 0.007 0.002 0.002 0.093 0.058 0.745 94 T 0.063 0.255 0.012 0.004 0.006 0.118 0.033 0.509 95 K 0.045 0.293 0.022 0.010 0.010 0.092 0.038 0.489 96 T 0.035 0.682 0.014 0.006 0.005 0.042 0.025 0.193 97 W 0.024 0.891 0.008 0.003 0.003 0.010 0.018 0.042 98 M 0.025 0.822 0.005 0.002 0.003 0.014 0.042 0.085 99 D 0.019 0.382 0.007 0.004 0.003 0.009 0.544 0.032 100 K 0.005 0.836 0.004 0.004 0.004 0.010 0.100 0.037 101 Y 0.045 0.850 0.006 0.003 0.007 0.009 0.030 0.050 102 R 0.088 0.479 0.019 0.028 0.022 0.037 0.191 0.137 103 T 0.073 0.384 0.009 0.010 0.016 0.057 0.068 0.383 104 K 0.106 0.139 0.013 0.014 0.014 0.107 0.098 0.510 105 L 0.044 0.130 0.009 0.009 0.009 0.122 0.113 0.564 106 N 0.183 0.217 0.011 0.006 0.010 0.062 0.137 0.374 107 D 0.129 0.141 0.015 0.022 0.024 0.086 0.082 0.500 108 S 0.093 0.040 0.032 0.026 0.036 0.109 0.074 0.589 109 I 0.099 0.011 0.020 0.026 0.039 0.135 0.052 0.618 110 G 0.077 0.006 0.012 0.016 0.030 0.106 0.046 0.707 111 R 0.038 0.005 0.008 0.012 0.020 0.102 0.028 0.786 112 D 0.031 0.007 0.014 0.018 0.039 0.117 0.033 0.741