# TARGET T0283 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0283.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 7.00874 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.069 0.045 0.046 0.018 0.036 0.095 0.009 0.682 2 S 0.092 0.064 0.031 0.025 0.033 0.224 0.013 0.516 3 F 0.113 0.107 0.024 0.017 0.030 0.112 0.010 0.588 4 I 0.108 0.249 0.038 0.021 0.063 0.169 0.008 0.343 5 E 0.055 0.380 0.021 0.018 0.033 0.238 0.010 0.245 6 K 0.066 0.700 0.006 0.007 0.011 0.025 0.007 0.178 7 M 0.091 0.668 0.015 0.007 0.017 0.031 0.016 0.155 8 I 0.034 0.803 0.014 0.008 0.012 0.013 0.009 0.107 9 G 0.045 0.708 0.010 0.009 0.011 0.011 0.019 0.187 10 S 0.157 0.459 0.028 0.009 0.017 0.038 0.034 0.258 11 L 0.099 0.538 0.026 0.011 0.018 0.026 0.019 0.264 12 N 0.056 0.208 0.024 0.010 0.015 0.221 0.023 0.443 13 D 0.136 0.229 0.010 0.005 0.005 0.132 0.019 0.463 14 K 0.148 0.467 0.014 0.003 0.007 0.079 0.010 0.273 15 R 0.029 0.478 0.011 0.007 0.008 0.120 0.007 0.339 16 E 0.015 0.690 0.006 0.005 0.005 0.057 0.004 0.217 17 W 0.021 0.869 0.004 0.003 0.008 0.013 0.003 0.079 18 K 0.007 0.932 0.002 0.003 0.004 0.009 0.001 0.043 19 A 0.002 0.964 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.026 20 M 0.005 0.976 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.012 21 E 0.004 0.981 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 22 A 0.003 0.972 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.019 23 R 0.013 0.968 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.014 24 A 0.010 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.010 25 K 0.011 0.963 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.017 26 A 0.054 0.837 0.004 0.002 0.001 0.002 0.047 0.052 27 L 0.321 0.475 0.010 0.006 0.004 0.008 0.035 0.141 28 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 29 K 0.003 0.029 0.005 0.005 0.013 0.093 0.002 0.851 30 E 0.087 0.122 0.004 0.002 0.002 0.117 0.007 0.661 31 Y 0.097 0.636 0.003 0.002 0.002 0.026 0.003 0.230 32 H 0.028 0.848 0.006 0.002 0.002 0.014 0.002 0.098 33 H 0.005 0.884 0.003 0.002 0.002 0.008 0.001 0.095 34 A 0.007 0.955 0.001 0.002 0.002 0.004 0.002 0.028 35 Y 0.002 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 36 K 0.002 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 37 A 0.002 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 38 I 0.009 0.968 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.016 39 Q 0.004 0.978 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 40 K 0.003 0.973 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.017 41 Y 0.011 0.959 0.003 0.002 0.002 0.002 0.005 0.016 42 M 0.015 0.945 0.004 0.004 0.004 0.002 0.007 0.019 43 W 0.030 0.833 0.028 0.012 0.012 0.008 0.015 0.060 44 T 0.102 0.637 0.033 0.028 0.019 0.017 0.043 0.120 45 S 0.149 0.355 0.081 0.020 0.024 0.028 0.060 0.283 46 G 0.096 0.176 0.074 0.029 0.035 0.093 0.057 0.441 47 G 0.155 0.042 0.092 0.033 0.028 0.113 0.042 0.495 48 P 0.003 0.001 0.004 0.001 0.001 0.006 0.001 0.983 49 T 0.024 0.013 0.065 0.037 0.067 0.176 0.005 0.614 50 D 0.055 0.019 0.027 0.020 0.036 0.108 0.005 0.730 51 W 0.084 0.039 0.044 0.023 0.083 0.136 0.005 0.587 52 Q 0.069 0.031 0.014 0.010 0.022 0.549 0.005 0.299 53 D 0.205 0.149 0.010 0.008 0.012 0.170 0.013 0.433 54 T 0.222 0.317 0.020 0.009 0.018 0.073 0.015 0.327 55 K 0.099 0.305 0.029 0.011 0.020 0.210 0.019 0.307 56 R 0.158 0.297 0.020 0.010 0.018 0.157 0.023 0.317 57 I 0.083 0.661 0.018 0.007 0.013 0.069 0.009 0.141 58 F 0.031 0.749 0.028 0.006 0.015 0.036 0.008 0.126 59 G 0.028 0.682 0.015 0.003 0.008 0.035 0.008 0.221 60 G 0.109 0.553 0.007 0.003 0.004 0.060 0.017 0.247 61 I 0.081 0.754 0.009 0.002 0.003 0.021 0.011 0.119 62 L 0.018 0.862 0.009 0.002 0.004 0.012 0.006 0.087 63 D 0.018 0.873 0.006 0.002 0.003 0.013 0.007 0.079 64 L 0.022 0.914 0.008 0.002 0.002 0.006 0.006 0.040 65 F 0.025 0.901 0.005 0.002 0.004 0.009 0.008 0.047 66 E 0.031 0.865 0.015 0.004 0.005 0.013 0.009 0.060 67 E 0.010 0.945 0.006 0.003 0.003 0.002 0.003 0.028 68 G 0.034 0.866 0.012 0.005 0.009 0.004 0.012 0.057 69 A 0.028 0.882 0.010 0.006 0.014 0.006 0.008 0.045 70 A 0.042 0.831 0.013 0.010 0.012 0.012 0.018 0.062 71 E 0.215 0.572 0.016 0.012 0.008 0.022 0.079 0.076 72 G 0.623 0.105 0.016 0.007 0.003 0.004 0.156 0.086 73 K 0.376 0.048 0.342 0.037 0.026 0.049 0.028 0.095 74 K 0.004 0.010 0.036 0.013 0.018 0.036 0.003 0.880 75 V 0.052 0.029 0.140 0.059 0.232 0.101 0.006 0.381 76 T 0.024 0.036 0.127 0.069 0.061 0.101 0.005 0.576 77 D 0.045 0.037 0.081 0.021 0.044 0.081 0.011 0.681 78 L 0.149 0.084 0.255 0.045 0.048 0.085 0.017 0.318 79 T 0.042 0.151 0.145 0.047 0.050 0.187 0.013 0.365 80 G 0.072 0.116 0.125 0.033 0.068 0.072 0.020 0.493 81 E 0.070 0.054 0.092 0.011 0.022 0.234 0.006 0.511 82 D 0.032 0.095 0.018 0.008 0.012 0.318 0.006 0.510 83 V 0.052 0.410 0.025 0.006 0.023 0.086 0.006 0.393 84 A 0.010 0.612 0.008 0.003 0.007 0.130 0.004 0.226 85 A 0.033 0.662 0.002 0.001 0.002 0.137 0.005 0.156 86 F 0.019 0.947 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.027 87 C 0.004 0.974 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.016 88 D 0.002 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 89 E 0.015 0.965 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.011 90 L 0.081 0.885 0.002 0.001 0.001 0.001 0.013 0.016 91 M 0.070 0.845 0.015 0.003 0.005 0.003 0.014 0.044 92 K 0.110 0.583 0.019 0.006 0.007 0.019 0.038 0.217 93 D 0.225 0.304 0.041 0.004 0.004 0.015 0.083 0.323 94 T 0.250 0.165 0.050 0.004 0.004 0.049 0.073 0.405 95 K 0.103 0.064 0.106 0.010 0.007 0.155 0.038 0.518 96 T 0.043 0.038 0.064 0.009 0.011 0.266 0.008 0.560 97 W 0.051 0.090 0.048 0.010 0.024 0.148 0.003 0.625 98 M 0.032 0.143 0.035 0.012 0.032 0.274 0.004 0.468 99 D 0.040 0.243 0.013 0.008 0.016 0.190 0.006 0.484 100 K 0.056 0.578 0.005 0.006 0.008 0.080 0.005 0.262 101 Y 0.037 0.781 0.003 0.004 0.007 0.061 0.006 0.102 102 R 0.021 0.903 0.003 0.003 0.007 0.011 0.003 0.048 103 T 0.004 0.965 0.001 0.002 0.002 0.003 0.001 0.022 104 K 0.032 0.888 0.003 0.003 0.004 0.005 0.011 0.053 105 L 0.042 0.908 0.006 0.003 0.004 0.004 0.009 0.024 106 N 0.028 0.831 0.015 0.008 0.012 0.014 0.017 0.075 107 D 0.097 0.552 0.022 0.010 0.011 0.022 0.035 0.252 108 S 0.224 0.371 0.025 0.010 0.012 0.107 0.040 0.210 109 I 0.218 0.328 0.038 0.020 0.021 0.064 0.031 0.280 110 G 0.119 0.279 0.083 0.043 0.052 0.138 0.033 0.253 111 R 0.155 0.147 0.070 0.047 0.063 0.095 0.026 0.397 112 D 0.038 0.094 0.032 0.024 0.037 0.051 0.011 0.714