# TARGET T0386 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0386.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 8 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.010 0.004 0.007 0.110 0.168 0.702 2 P 0.017 0.014 0.017 0.353 0.146 0.452 3 K 0.014 0.007 0.033 0.440 0.198 0.308 4 A 0.010 0.004 0.047 0.488 0.193 0.259 5 K 0.012 0.006 0.042 0.458 0.215 0.267 6 A 0.017 0.014 0.061 0.347 0.330 0.231 7 K 0.021 0.018 0.070 0.338 0.325 0.228 8 T 0.032 0.016 0.075 0.223 0.438 0.216 9 K 0.033 0.010 0.052 0.098 0.506 0.302 10 N 0.023 0.003 0.021 0.037 0.433 0.482 11 T 0.111 0.014 0.017 0.027 0.345 0.485 12 E 0.296 0.029 0.015 0.027 0.159 0.475 13 I 0.422 0.032 0.012 0.022 0.113 0.399 14 I 0.348 0.053 0.009 0.013 0.129 0.449 15 S 0.185 0.019 0.007 0.006 0.206 0.576 16 P 0.170 0.008 0.041 0.009 0.323 0.448 17 H 0.156 0.032 0.081 0.008 0.360 0.363 18 H 0.307 0.026 0.078 0.008 0.303 0.279 19 Y 0.514 0.038 0.034 0.007 0.179 0.228 20 V 0.560 0.158 0.009 0.005 0.106 0.161 21 Y 0.224 0.049 0.006 0.009 0.664 0.048 22 P 0.045 0.003 0.008 0.011 0.894 0.038 23 N 0.020 0.002 0.003 0.003 0.937 0.035 24 T 0.099 0.010 0.003 0.008 0.820 0.060 25 T 0.434 0.026 0.004 0.033 0.178 0.326 26 T 0.629 0.078 0.010 0.057 0.096 0.130 27 L 0.633 0.014 0.021 0.080 0.132 0.119 28 K 0.573 0.021 0.022 0.103 0.155 0.126 29 N 0.418 0.040 0.024 0.118 0.272 0.129 30 K 0.290 0.015 0.038 0.150 0.380 0.127 31 Y 0.156 0.012 0.082 0.083 0.485 0.181 32 G 0.144 0.014 0.048 0.025 0.563 0.206 33 I 0.194 0.024 0.062 0.023 0.358 0.339 34 K 0.188 0.100 0.016 0.015 0.206 0.476 35 N 0.060 0.024 0.012 0.043 0.277 0.585 36 L 0.001 0.001 0.069 0.887 0.037 0.007 37 N 0.001 0.001 0.043 0.931 0.023 0.002 38 A 0.001 0.001 0.030 0.957 0.011 0.001 39 F 0.001 0.001 0.008 0.978 0.008 0.005 40 L 0.002 0.001 0.008 0.976 0.010 0.003 41 E 0.002 0.001 0.012 0.957 0.020 0.008 42 K 0.002 0.001 0.013 0.914 0.041 0.029 43 C 0.004 0.008 0.018 0.849 0.081 0.039 44 S 0.006 0.002 0.018 0.801 0.109 0.064 45 H 0.006 0.002 0.013 0.507 0.211 0.261 46 D 0.013 0.008 0.009 0.413 0.215 0.343 47 T 0.013 0.011 0.005 0.445 0.082 0.443 48 A 0.002 0.001 0.007 0.966 0.012 0.013 49 K 0.001 0.001 0.010 0.977 0.008 0.004 50 A 0.002 0.001 0.014 0.962 0.013 0.008 51 M 0.003 0.001 0.009 0.962 0.014 0.010 52 I 0.004 0.001 0.014 0.948 0.021 0.013 53 N 0.006 0.001 0.015 0.905 0.039 0.034 54 L 0.009 0.002 0.023 0.831 0.057 0.079 55 R 0.032 0.020 0.021 0.636 0.130 0.160 56 E 0.050 0.012 0.035 0.405 0.229 0.269 57 E 0.020 0.005 0.012 0.186 0.248 0.530 58 S 0.016 0.009 0.010 0.061 0.303 0.600 59 L 0.012 0.022 0.010 0.060 0.478 0.419 60 P 0.011 0.007 0.055 0.071 0.575 0.281 61 E 0.016 0.006 0.093 0.107 0.576 0.201 62 Y 0.048 0.019 0.113 0.081 0.502 0.237 63 F 0.067 0.095 0.063 0.121 0.281 0.373 64 D 0.038 0.019 0.027 0.115 0.177 0.624 65 T 0.005 0.002 0.119 0.671 0.103 0.100 66 A 0.001 0.001 0.084 0.882 0.025 0.008 67 Y 0.001 0.001 0.073 0.901 0.021 0.003 68 L 0.005 0.002 0.034 0.930 0.022 0.007 69 C 0.008 0.001 0.021 0.930 0.025 0.014 70 H 0.009 0.002 0.028 0.910 0.035 0.017 71 I 0.012 0.002 0.023 0.894 0.040 0.030 72 H 0.015 0.005 0.074 0.752 0.076 0.077 73 Q 0.022 0.009 0.059 0.642 0.091 0.177 74 Q 0.012 0.006 0.032 0.439 0.074 0.437 75 L 0.001 0.001 0.001 0.027 0.024 0.947