(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
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Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

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 214 .T...L....S....L....L..CD.....L....HR.I....L..L.....T..K.V..R..Gs
 215 .S...Q....N....Y....I..LQ.....L....HK.I....L..Y.....S..H.Mn.N..P.
 216 .S...E....W....Q....I..KS.....I....HQ.L....I..L.....K..N.I..D..Da
 217 .S...E....W....Q....I..KN.....I....HQ.I....I..L.....K..G.I..D..De
 218 .S...I....D....L....I..RE.....I....HG.L....I..L.....K..N.I..D..De
 219 .T...A....N....T....I..LT.....I....HA.E....L..E.....R..H.-..-..-.
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 221 .N...A....N....V....L..LQ.....L....HK.E....L..Y.....K..F.V..P..V.
 222 .T...P....A....L....I..RQ.....L....HA.I....G..M.....G..G.I..N..Da
 223 .S...E....N....A....I..KD.....I....HT.L....V..L.....M..D.K..P..Q.
 224 .T...E....R....D....I..LK.....L....HR.L....F..Y.....Y..R.I..D..Ea
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 226 .S...E....Q....N....L..LE.....A....HY.V....L..M.....K..G.L..L..D.
 227 .S...E....R....T....I..KD.....I....HS.L....V..L.....M..N.N..A..E.
 228 .D...T....G....L....V..CD.....L....HR.V....L..L.....A..G.S..R..Gm
 229 .D...E....I....A....I..RD.....I....NR.L....Vt.Y.....S..D.N..P..Tk
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 115 IA.H.FWFVTI.HPF..DDGNGRIAR.V.LTDM..A.L.A.Q..D....DKqh6yyS..L..S..
 116 IA.H.AQFETI.HPF..IDGNGRVGR.I.LLPL..M.L.A.A..E....GYp....P..V..Y..
 117 LA.H.LYFVSI.HPF..EDGNGRIAR.A.LAEK..S.L.A.Q..Nl...KQ.....P..T..L..
 118 LA.H.YKLVYV.HPF..VDGNGRTSR.L.LMNL..I.L.M.Q..A....SYp....P..I..T..
 119 LS.H.YQFETI.HPF..LDGNGRIGR.L.LIPL..Y.L.V.S..H....GVlak..Ps.L..Y..
 120 LA.H.LWFVTL.HPF..DDGNGRIAR.A.VGDL..F.L.A.R..A....DGsp6fyS..L..S..
 121 IA.H.LWFESI.HPF..EDGNGRIGR.A.IAEK..A.L.S.Q..-....GFsk...P..VmtV..
 122 IV.H.AEFEAI.HPF..LDGNGRLGR.L.VVPL..F.L.Y.A..N....GLlsr..Pn.F..Y..
 123 MA.H.YKLVHI.HPF..SDGNGRTSR.L.LMNT..L.L.M.R..A....GYp....P..V..I..
 124 IA.H.YQFETI.HPF..LDGNGRIGR.L.LISL..Y.L.V.H..S....KVlqk..Pl.L..Y..
 125 VL.K.AQFELI.HPF..SDGNGRIGR.M.LVPL..I.L.Y.N..K....KMlss..Pm.F..Y..
 126 ML.H.NKFVAI.HPF..IDGNGRTGR.L.LMNL..E.L.M.K..A....GF.....Q..V..T..
 127 MA.H.YQFETL.HPF..NDGNGRIGR.L.LVVL..D.L.C.W..K....GIlse..Pl.L..A..
 128 IA.Q.FQLVHI.HPF..LDGNGRTAR.L.LSTL..C.L.Y.R..K....GYdfkk.L..F..T..
 129 IA.Q.FQLVHI.HPF..LDGNGRTAR.L.LSTL..C.L.Y.R..K....GYdfkk.L..F..T..
 130 IV.H.LWFETI.HPF..EDGNGRIGR.A.IAEK..A.L.A.Q..Sl...EAptlt.A..L..A..
 131 IF.V.VVFLEI.HPF..QDGNGRLSR.V.LTTL..L.L.L.Q..A....GYa....Y..V..P..
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 290 LL.H.YRYIRI.HPF..EDGNGRIAR.L.LVNF..V.L.H.R..Y....GY.....Pm.I..V..
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 292 RV.H.IDFVGI.HPF..VDGNGRMSR.L.LLNY..E.L.V.K..N....GYp....P..I..N..
 293 HY.Y.CEINVL.HPF..RVGSGLAQR.I.FFEQ..L.A.I.H..A....GY.....Q..L..S..
 294 EL.H.TRFVKI.HPF..VDGNGRTGR.L.LLNF..E.L.M.K..S....GYp....P..A..V..
 295 TL.H.FVIGYV.HPF..RDGNGRVAR.A.LFYW..Y.M.F.K..C....GYtgfr.Y..I..A..
 296 AT.I.LDFLCI.HPF..CDGNGRMAR.L.LTLL..L.L.Y.K..E....GYevgr.F..I..S..
 297 IA.H.YQFVTI.HHY..YDGNGRTAR.L.LTTL..I.L.H.L..G....GYdlk..G..Ly.S..
 298 DF.H.VAFEKI.HPF..SDGNGRVGR.L.VMFK..E.C.L.K..N....NIm....P..F..I..
 299 KF.H.--FESI.HPF..IDGNGRTGR.L.LINY..Q.L.M.R..N....GYy....P..I..D..
 300 II.H.YQFEVI.HPF..RDGNGRTGR.I.LIIL..L.L.L.K..Y....NIlkk..Pv.L..Y..
 301 IA.H.YQFEAI.HPF..YDGNGRSGR.I.LNVL..F.L.I.E..Q....QLltl..Pi.L..Y..
 302 IS.A.YQFVTI.HPF..DDGNGRLAR.A.LALY..I.L.M.I..N....EYdlng.Y..F..T..
 303 DF.H.VDFEKI.HPF..SDGNGRVGR.L.VMFK..E.C.L.K..N....NIm....P..F..I..
 304 EV.F.MTLDHA.HPF..RKGNGRAQR.I.FMEK..L.G.Q.A..A....GY.....K..I..D..
 305 RF.H.MEFERI.HPF..IDGNGRIGR.L.LMNL..E.L.M.Q..Q....GFp....P..T..N..
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 310 YA.H.YAFVCI.HPF..ADGNGRVAR.A.LASV..F.L.Y.K..Dp...GV.....P..L..V..
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 388 IS.H.FFFEYI.HPF..YDGNGRFGR.Y.LLSL..Y.L.A.R..Kl...DIltaf.S..V..S..
 389 S-.H.YLFEYI.HPF..YDGNGRVGR.F.IIAK..L.L.S.D..Yyd..NYt....A..L..T..
 390 IF.L.QQFEFI.QPF..SVANGCVGR.L.WFSL..I.L.A.K..W....HPava..W..L..S..
 391 KV.L.SELNYV.HPF..REGNGRAQE.A.FISE..L.G.H.H..Y....GH.....E..I..D..
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 393 RF.I.LNFYCI.VPF..NQGNNRLAF.M.LMQL..L.L.I.K..S....GHtfvk.Y..V..C..
 394 IS.H.FYFENT.HPF..YDGNGRTGRfI.LCSY..L.A.R.K..L....DYlsav.G..V..S..
 395 LG.H.FFFVYI.HPY..SDGNGRIGR.F.LMNL..M.L.A.S..G....HY.....Pw.T..I..
 396 S-.H.YLFEYI.HPF..YDGNGRVGR.F.IIAK..L.L.S.D..Yyd..NYt....A..L..T..
 397 IA.H.YQFVTI.HHY..YDGNGRTAR.L.LTTL..I.L.H.L..G....GYdlk..G..Ly.S..
 398 EC.H.VEFILI.HPF..REGNGRLSR.L.LCDV..L.A.V.L..A....GK.....Gl.L..D..
 399 --.Y.IEMNII.HPF..LEGNGRSTR.I.WLDL..I.F.K.K..Nl...KK.....V..V..N..
 400 S-.H.YLFEYI.HPF..YDGNGRVGR.F.IIAK..L.L.S.D..Yyd..NYt....A..L..T..
 401 S-.H.YLFEYI.HPF..YDGNGRVGR.F.IIAK..L.L.S.D..Yyd..NYt....A..L..T..
 402 S-.H.YLFEYI.HPF..YDGNGRVGR.F.IIAK..L.L.S.D..Yyd..NYt....A..L..T..
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 405 --.Y.VEMNVA.HPF..REGNGRATR.I.WLDL..I.L.K.K..Em...KL.....V..V..D..
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 410 PL.F.VSLKNI.RPF..INGNEHTIH.L.FFEK..L.A.Q.A..A....EH.....Q..L..D..
 411 EH.H.IEFEEI.HPF..SDGNGRTGR.A.LMFY..Q.T.I.K..A....NLt....P..F..V..
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 450 LA.H.YKLVHI.HPW..ADGNGRMSR.L.LMNV..I.Q.Y.E..A....GLv....P..A..I..
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 452 LG.H.FMFVYI.HPY..IDGNGRIGR.F.LMNL..M.S.A.S..G....GYs....W..I..V..
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 457 FY.L.SEINAL.HPF..REGNGRVQR.L.FIEY..L.A.E.N..I....GY.....Q..V..D..
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 459 YF.I.AEINAV.HPF..REGNGRCQL.T.LLNV..L.M.E.I..S....GF.....E..M..D..
 460 LL.H.YQFEAI.HPF..TDGNGRTGR.I.LNVL..Y.L.L.Q..E....ALlpf..Pv.L..Y..
 461 RF.H.HRLAAI.HPF..PNGNGRHAR.L.MTDI..L.L.V.H..Ll...GQ.....Ph.F..T..
 462 RS.H.IEFILI.HPF..REGNGRISR.L.LLDF..M.S.N.K..A....GV.....Gl.L..D..
 463 LG.H.FIFVYI.HPY..FDGNGRMGR.F.VMNL..M.M.A.S..G....GY.....Pw.T..I..
 464 SI.A.YGFVFL.HPF..EDGNGRIHR.F.LIHN..I.L.S.L..Q....ELvp7mfP..V..S..
 465 S-.H.HRLAWI.HPF..RDGNGRVAR.L.HTHL..A.L.G.A..L....GLtn...G..L..-..
 466 DF.H.HRFESI.HPF..QDGNGRVGR.I.IMFK..E.C.L.K..H....DIm....P..L..I..
 467 LG.H.FLFTFI.HPL..PDGNGRSGR.F.LMNV..M.L.A.E..G....GY.....Pw.T..I..
 468 DI.H.YNLVNI.HPF..GDGNGRTSR.L.MMNY..I.Q.M.Y..H....QE.....P..L..-..
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   1 K..E...F....M....H....T.M...K..N.....T.G....R.N.....V..N.D..R...P
   2 E..T...A....Q....R....L.V...A..L.....F.K....E.D.....T..Q.K..I...Q
   3 A..T...L....F....N....V.L...L..K.....A.N....F.W.....S..K.H..S...K
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   5 D..T...A....R....R....L.I...A..L.....F.E....A.D.....Q..Q.K..I...Q
   6 D..T...A....R....R....L.I...A..L.....F.E....A.D.....Q..Q.K..I...Q
   7 E..A...A....T....Q....I.V...D..L.....F.K....E.D.....R..E.R..I...T
   8 K..E...I....E....Q....T.V...F..K.....T.N....Y.W.....R..H.I..D...Q
   9 E..A...A....T....Q....I.V...D..L.....F.K....E.D.....R..E.R..I...T
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  12 K..E...I....E....Q....T.V...F..K.....T.N....Y.W.....R..H.I..D...Q
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  21 S..V...L....L....N....V.L...F..K.....A.S....F.W.....D..K.Q..S...K
  22 D..T...A....Q....Q....L.M...K..L.....S.A....E.D.....G..Q.R..I...N
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  42 R..N...Iefl.I....N....K.T...K..F.....Y.D....K.F.....K..D.T..L...N
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 124 Q..T...L....K....K....I.I...El.K.....T.D....L.E.....K..N.K..L...L
 125 S..K...A....W....S....I.L...E..L.....Y.K....E.M.....K..S.K..V...P
 126 N..L...I....Y....P....N.-...-..-.....-.-....-.-.....-..-.-..-...-
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 130 Q..N...Irfl.I....E....K.T...R..F.....L.D....R.L.....R..G.K..L...N
 131 K..K...V....E....Re...K.I...V..M.....T.S....L.P.....E..I.S..L...R
 132 S..E...L....S....H....P.V...P..LlaqesM.E....G.M.....P..L.I..F...N
 133 -..-...-....-....-....-.-...-..-.....-.-....-.-.....-..-.-..-...-
 134 A..H...L....I....A....K.T...R..M.....L.D....R.L.....R..N.Q..L...N
 135 R..L...L....E....-....-.-...-..-.....-.-....-.-.....-..-.-..-...-
 136 K..K...V....E....Reki.V.L...A..A.....L.P....E.L.....S..L.Q..I...-
 137 E..L...I....D....D....I.T...L..K.....S.R....F.W.....E..K.H..A...T
 138 E..R...I....N....-....-.L...T..A.....G.G....R.A.....Q..G.A..P...R
 139 D..R...V....G....F....F.-...-..-.....-.-....-.-.....-..-.-..-...-
 140 Y..A...L....-....-....-.-...-..-.....-.-....-.-.....-..-.-..-...-
 141 E..L...I....D....D....I.T...L..K.....S.R....F.W.....E..K.H..A...T
 142 E..R...I....N....-....-.L...T..A.....G.G....R.A.....Q..G.A..P...R
 143 T..E...I....E....K....V.-...-..-.....-.-....-.-.....-..-.-..-...-
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 147 W..A...T....-....-....-.-...-..-.....-.-....-.-.....-..-.-..-...-
 148 S..R...Vgff.I....A....K.A...H..F.....Y.D....R.H.....R..D.Q..L...N
 149 K..K...L....D....Y....I.V...Q..K.....T.K....F.Wd....R..H.K..N...D
 150 D..F...L....L....E....K.T...R..F.....H.D....R.Y.....R..G.K..L...N
 151 D..L...I....N....Q....I.K...K..L.....M.Q....E.H.....K..L.L..I...R
 152 -..-...-....-....-....-.-...-..-.....-.-....-.-.....-..-.-..-...-
 153 D..D...T....P....Q....V.T...P..Q.....V.T....P.Q.....V..G.K..L...L
 154 K..K...V....A....Reki.V.L...A..S.....L.P....E.L.....S..L.Q..I...V
 155 R..T...I....K....R....L.L...A..L.....M.Q....E.H.....K..H.I..I...K
 156 H..G...T....Q....M....-.-...-..-.....-.-....-.-.....-..-.-..-...-
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