# TARGET T0383 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0383.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 17 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.055 0.007 0.026 0.022 0.344 0.546 2 N 0.145 0.022 0.036 0.019 0.285 0.493 3 A 0.285 0.039 0.044 0.017 0.213 0.402 4 M 0.402 0.008 0.024 0.017 0.152 0.397 5 N 0.699 0.012 0.009 0.010 0.071 0.199 6 L 0.758 0.020 0.006 0.008 0.057 0.151 7 K 0.766 0.022 0.004 0.008 0.074 0.127 8 R 0.659 0.004 0.006 0.004 0.106 0.222 9 E 0.685 0.005 0.005 0.003 0.128 0.174 10 Q 0.713 0.003 0.013 0.005 0.128 0.138 11 E 0.881 0.008 0.007 0.005 0.050 0.048 12 F 0.895 0.017 0.005 0.005 0.046 0.032 13 V 0.727 0.006 0.011 0.013 0.137 0.107 14 S 0.543 0.005 0.022 0.042 0.197 0.191 15 Q 0.809 0.010 0.010 0.026 0.074 0.071 16 Y 0.770 0.024 0.008 0.044 0.059 0.095 17 H 0.622 0.017 0.014 0.053 0.106 0.188 18 F 0.384 0.022 0.097 0.107 0.244 0.145 19 D 0.239 0.025 0.120 0.099 0.356 0.162 20 A 0.185 0.012 0.104 0.152 0.400 0.147 21 R 0.147 0.028 0.060 0.104 0.431 0.230 22 N 0.077 0.015 0.026 0.067 0.569 0.246 23 F 0.059 0.015 0.047 0.091 0.529 0.260 24 E 0.053 0.018 0.041 0.153 0.461 0.274 25 W 0.070 0.024 0.059 0.160 0.456 0.231 26 E 0.059 0.019 0.119 0.295 0.328 0.181 27 N 0.059 0.021 0.159 0.318 0.288 0.154 28 E 0.096 0.011 0.160 0.291 0.293 0.148 29 N 0.102 0.007 0.057 0.145 0.387 0.304 30 G 0.060 0.007 0.005 0.007 0.272 0.648 31 A 0.115 0.014 0.004 0.003 0.200 0.664 32 P 0.234 0.009 0.007 0.003 0.165 0.583 33 E 0.517 0.010 0.015 0.005 0.128 0.326 34 T 0.742 0.011 0.009 0.004 0.071 0.163 35 K 0.785 0.006 0.005 0.004 0.055 0.145 36 V 0.785 0.003 0.002 0.003 0.048 0.159 37 D 0.859 0.007 0.001 0.004 0.032 0.097 38 V 0.847 0.012 0.002 0.005 0.025 0.109 39 N 0.811 0.006 0.004 0.008 0.047 0.123 40 F 0.627 0.010 0.056 0.022 0.127 0.158 41 Q 0.449 0.013 0.058 0.031 0.200 0.250 42 L 0.301 0.013 0.065 0.043 0.303 0.275 43 L 0.122 0.010 0.046 0.078 0.385 0.358 44 Q 0.092 0.010 0.025 0.143 0.375 0.355 45 H 0.051 0.009 0.105 0.483 0.289 0.064 46 D 0.046 0.009 0.111 0.514 0.257 0.063 47 Q 0.032 0.003 0.203 0.485 0.237 0.040 48 E 0.022 0.003 0.176 0.560 0.181 0.058 49 N 0.016 0.004 0.131 0.530 0.202 0.117 50 Q 0.032 0.006 0.020 0.045 0.287 0.611 51 V 0.090 0.002 0.004 0.002 0.189 0.712 52 T 0.524 0.008 0.002 0.001 0.134 0.331 53 S 0.944 0.002 0.001 0.001 0.014 0.040 54 L 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 55 I 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 56 V 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 57 I 0.986 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 58 L 0.944 0.001 0.001 0.001 0.011 0.044 59 S 0.957 0.001 0.001 0.001 0.013 0.028 60 F 0.955 0.003 0.001 0.001 0.012 0.029 61 M 0.956 0.002 0.001 0.001 0.018 0.022 62 I 0.896 0.004 0.002 0.001 0.042 0.055 63 V 0.717 0.012 0.006 0.002 0.140 0.124 64 F 0.307 0.007 0.020 0.005 0.523 0.137 65 D 0.103 0.003 0.045 0.011 0.701 0.137 66 K 0.361 0.011 0.020 0.008 0.438 0.163 67 F 0.805 0.013 0.005 0.006 0.093 0.079 68 V 0.860 0.004 0.001 0.005 0.031 0.099 69 I 0.872 0.008 0.001 0.006 0.030 0.083 70 S 0.855 0.006 0.001 0.009 0.034 0.095 71 G 0.701 0.004 0.001 0.014 0.033 0.247 72 T 0.571 0.008 0.001 0.221 0.041 0.158 73 I 0.449 0.005 0.003 0.338 0.075 0.130 74 S 0.188 0.006 0.005 0.561 0.107 0.132 75 Q 0.072 0.004 0.011 0.800 0.082 0.030 76 V 0.065 0.004 0.020 0.779 0.109 0.023 77 N 0.069 0.004 0.014 0.791 0.088 0.033 78 H 0.078 0.007 0.019 0.765 0.092 0.039 79 I 0.056 0.013 0.029 0.777 0.095 0.030 80 D 0.030 0.003 0.046 0.730 0.149 0.043 81 G 0.020 0.004 0.066 0.562 0.256 0.093 82 R 0.047 0.018 0.064 0.440 0.289 0.142 83 I 0.053 0.034 0.021 0.256 0.387 0.248 84 V 0.027 0.014 0.015 0.076 0.557 0.312 85 N 0.017 0.010 0.012 0.031 0.616 0.313 86 E 0.029 0.022 0.019 0.023 0.630 0.276 87 P 0.009 0.008 0.396 0.078 0.410 0.099 88 S 0.008 0.005 0.465 0.068 0.341 0.113 89 E 0.007 0.006 0.489 0.082 0.286 0.130 90 L 0.010 0.018 0.059 0.120 0.305 0.488 91 N 0.006 0.005 0.013 0.082 0.140 0.754 92 Q 0.002 0.001 0.018 0.900 0.032 0.047 93 E 0.003 0.001 0.014 0.932 0.034 0.017 94 E 0.002 0.001 0.017 0.946 0.025 0.009 95 V 0.003 0.001 0.012 0.963 0.014 0.008 96 E 0.001 0.001 0.019 0.955 0.019 0.006 97 T 0.001 0.001 0.019 0.960 0.014 0.007 98 L 0.001 0.001 0.017 0.956 0.012 0.014 99 A 0.001 0.001 0.024 0.898 0.022 0.056 100 R 0.001 0.001 0.042 0.844 0.028 0.085 101 P 0.001 0.001 0.084 0.758 0.044 0.113 102 C 0.001 0.001 0.055 0.925 0.008 0.011 103 L 0.001 0.001 0.026 0.963 0.007 0.003 104 N 0.001 0.001 0.025 0.948 0.017 0.010 105 M 0.001 0.001 0.044 0.944 0.010 0.001 106 L 0.001 0.001 0.054 0.918 0.026 0.002 107 N 0.001 0.001 0.077 0.865 0.053 0.005 108 R 0.001 0.001 0.068 0.782 0.118 0.030 109 L 0.002 0.001 0.020 0.492 0.242 0.242 110 T 0.013 0.017 0.008 0.287 0.175 0.499 111 Y 0.128 0.008 0.007 0.281 0.147 0.430 112 E 0.323 0.007 0.006 0.476 0.061 0.126 113 V 0.497 0.005 0.008 0.399 0.029 0.062 114 T 0.539 0.005 0.012 0.381 0.020 0.042 115 E 0.484 0.001 0.026 0.423 0.025 0.042 116 I 0.212 0.003 0.050 0.673 0.030 0.031 117 A 0.206 0.006 0.040 0.671 0.037 0.041 118 L 0.181 0.008 0.037 0.609 0.095 0.070 119 D 0.106 0.035 0.028 0.427 0.209 0.195 120 L 0.065 0.023 0.026 0.074 0.739 0.072 121 P 0.037 0.007 0.015 0.029 0.837 0.076 122 G 0.017 0.007 0.011 0.010 0.859 0.095 123 I 0.107 0.114 0.012 0.009 0.625 0.134 124 N 0.133 0.045 0.020 0.024 0.247 0.531 125 L 0.110 0.027 0.200 0.144 0.195 0.324 126 E 0.095 0.030 0.128 0.119 0.214 0.415 127 F 0.006 0.004 0.019 0.041 0.086 0.843