# TARGET T0382 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0382.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 7.23876 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.040 0.042 0.024 0.052 0.062 0.113 0.065 0.602 2 S 0.108 0.166 0.016 0.033 0.045 0.094 0.065 0.473 3 K 0.131 0.191 0.013 0.016 0.023 0.082 0.049 0.495 4 L 0.050 0.134 0.027 0.029 0.032 0.099 0.051 0.578 5 D 0.235 0.225 0.016 0.019 0.034 0.060 0.087 0.324 6 L 0.097 0.039 0.017 0.015 0.022 0.092 0.223 0.496 7 H 0.015 0.046 0.025 0.029 0.045 0.078 0.443 0.319 8 Q 0.019 0.131 0.014 0.015 0.037 0.102 0.091 0.592 9 M 0.014 0.136 0.028 0.049 0.046 0.144 0.065 0.518 10 T 0.018 0.826 0.005 0.005 0.007 0.017 0.043 0.080 11 T 0.013 0.970 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.006 12 Q 0.005 0.935 0.003 0.001 0.001 0.004 0.037 0.014 13 D 0.004 0.895 0.002 0.001 0.001 0.003 0.085 0.008 14 L 0.006 0.951 0.002 0.001 0.001 0.002 0.035 0.004 15 V 0.007 0.963 0.002 0.001 0.001 0.002 0.019 0.006 16 A 0.006 0.886 0.006 0.002 0.002 0.005 0.049 0.043 17 L 0.012 0.833 0.007 0.005 0.009 0.015 0.070 0.047 18 F 0.026 0.270 0.039 0.010 0.016 0.028 0.561 0.052 19 A 0.022 0.632 0.014 0.021 0.019 0.032 0.159 0.100 20 K 0.025 0.385 0.050 0.021 0.043 0.052 0.100 0.324 21 V 0.024 0.313 0.081 0.065 0.057 0.087 0.130 0.243 22 T 0.101 0.241 0.089 0.033 0.046 0.063 0.262 0.166 23 V 0.116 0.187 0.056 0.028 0.027 0.098 0.148 0.340 24 E 0.023 0.321 0.030 0.018 0.031 0.093 0.060 0.424 25 Q 0.030 0.516 0.018 0.008 0.014 0.051 0.071 0.292 26 D 0.033 0.799 0.011 0.010 0.011 0.022 0.050 0.066 27 D 0.053 0.684 0.027 0.013 0.017 0.026 0.065 0.116 28 A 0.075 0.345 0.053 0.025 0.030 0.073 0.193 0.207 29 L 0.098 0.343 0.067 0.029 0.028 0.063 0.192 0.180 30 L 0.086 0.404 0.018 0.009 0.019 0.054 0.080 0.329 31 G 0.038 0.283 0.028 0.012 0.020 0.071 0.193 0.355 32 N 0.025 0.456 0.016 0.019 0.020 0.064 0.144 0.256 33 Q 0.057 0.712 0.009 0.005 0.009 0.030 0.045 0.133 34 I 0.046 0.465 0.018 0.011 0.013 0.045 0.237 0.165 35 S 0.033 0.667 0.015 0.009 0.010 0.035 0.100 0.131 36 R 0.038 0.762 0.008 0.004 0.006 0.021 0.052 0.108 37 F 0.023 0.750 0.012 0.005 0.006 0.022 0.088 0.094 38 N 0.030 0.735 0.014 0.006 0.008 0.020 0.113 0.073 39 R 0.028 0.805 0.007 0.005 0.004 0.021 0.040 0.089 40 L 0.023 0.879 0.006 0.002 0.003 0.009 0.034 0.044 41 F 0.021 0.855 0.005 0.002 0.003 0.013 0.041 0.059 42 G 0.016 0.815 0.007 0.004 0.004 0.013 0.066 0.076 43 V 0.011 0.914 0.002 0.002 0.002 0.006 0.033 0.030 44 M 0.017 0.885 0.003 0.001 0.001 0.006 0.065 0.022 45 A 0.008 0.886 0.004 0.004 0.003 0.006 0.053 0.036 46 E 0.010 0.877 0.008 0.002 0.003 0.012 0.032 0.056 47 I 0.010 0.954 0.002 0.001 0.001 0.003 0.017 0.012 48 A 0.015 0.958 0.002 0.001 0.001 0.002 0.010 0.012 49 D 0.012 0.942 0.004 0.001 0.001 0.003 0.009 0.028 50 E 0.039 0.838 0.019 0.004 0.003 0.010 0.031 0.057 51 L 0.394 0.249 0.046 0.008 0.005 0.028 0.165 0.105 52 K 0.108 0.072 0.050 0.013 0.008 0.062 0.163 0.524 53 A 0.098 0.016 0.007 0.001 0.001 0.047 0.011 0.817 54 R 0.342 0.036 0.005 0.002 0.001 0.062 0.025 0.525 55 D 0.032 0.045 0.001 0.001 0.002 0.070 0.005 0.844 56 G 0.015 0.048 0.005 0.001 0.004 0.078 0.069 0.780 57 D 0.019 0.644 0.005 0.019 0.008 0.045 0.127 0.133 58 Q 0.014 0.877 0.004 0.003 0.005 0.008 0.037 0.051 59 R 0.014 0.894 0.005 0.010 0.011 0.007 0.023 0.036 60 T 0.012 0.190 0.029 0.030 0.041 0.017 0.624 0.057 61 A 0.012 0.594 0.019 0.028 0.024 0.020 0.254 0.049 62 L 0.057 0.539 0.043 0.030 0.070 0.033 0.136 0.093 63 L 0.182 0.214 0.037 0.090 0.076 0.052 0.093 0.255 64 S 0.163 0.076 0.038 0.050 0.130 0.067 0.086 0.391 65 L 0.081 0.023 0.027 0.020 0.040 0.128 0.083 0.598 66 F 0.008 0.004 0.066 0.097 0.095 0.149 0.067 0.513 67 E 0.022 0.002 0.009 0.005 0.008 0.076 0.017 0.861 68 Y 0.549 0.018 0.020 0.010 0.007 0.058 0.119 0.218 69 P 0.083 0.022 0.019 0.006 0.012 0.121 0.014 0.723 70 N 0.023 0.033 0.014 0.004 0.019 0.064 0.021 0.821 71 M 0.014 0.279 0.050 0.069 0.069 0.085 0.039 0.394 72 Q 0.014 0.334 0.088 0.096 0.107 0.049 0.078 0.234 73 V 0.011 0.721 0.036 0.059 0.037 0.011 0.050 0.074 74 R 0.013 0.901 0.015 0.010 0.011 0.004 0.031 0.016 75 L 0.006 0.918 0.014 0.012 0.008 0.003 0.023 0.017 76 Q 0.006 0.894 0.007 0.013 0.019 0.004 0.032 0.025 77 A 0.017 0.143 0.029 0.009 0.013 0.012 0.756 0.022 78 A 0.019 0.548 0.009 0.024 0.017 0.013 0.340 0.030 79 K 0.074 0.423 0.015 0.014 0.038 0.026 0.087 0.323 80 L 0.043 0.158 0.034 0.057 0.098 0.103 0.143 0.363 81 T 0.101 0.065 0.048 0.085 0.142 0.089 0.125 0.345 82 L 0.110 0.016 0.031 0.059 0.065 0.110 0.054 0.555 83 A 0.010 0.012 0.042 0.057 0.097 0.151 0.041 0.590 84 V 0.013 0.014 0.032 0.030 0.048 0.122 0.023 0.719 85 A 0.105 0.181 0.029 0.049 0.036 0.107 0.068 0.424 86 P 0.089 0.549 0.012 0.005 0.006 0.035 0.040 0.264 87 V 0.045 0.776 0.006 0.004 0.003 0.023 0.023 0.120 88 K 0.020 0.899 0.004 0.001 0.001 0.006 0.030 0.039 89 A 0.019 0.946 0.001 0.001 0.001 0.002 0.024 0.009 90 R 0.010 0.947 0.001 0.001 0.001 0.002 0.031 0.009 91 E 0.001 0.975 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.012 92 Q 0.004 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.005 93 L 0.007 0.964 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 0.003 94 E 0.027 0.665 0.014 0.002 0.001 0.006 0.246 0.039 95 A 0.034 0.241 0.027 0.003 0.002 0.022 0.593 0.078 96 I 0.131 0.203 0.077 0.007 0.005 0.061 0.352 0.164 97 V 0.240 0.054 0.033 0.005 0.005 0.067 0.049 0.547 98 S 0.065 0.019 0.004 0.001 0.002 0.055 0.018 0.834 99 S 0.036 0.018 0.007 0.002 0.003 0.098 0.021 0.814 100 K 0.020 0.025 0.037 0.014 0.018 0.227 0.036 0.622 101 W 0.047 0.025 0.030 0.009 0.012 0.129 0.034 0.714 102 F 0.144 0.055 0.086 0.026 0.019 0.127 0.083 0.459 103 P 0.184 0.068 0.046 0.007 0.009 0.095 0.049 0.543 104 Q 0.281 0.162 0.015 0.005 0.006 0.069 0.066 0.395 105 A 0.024 0.122 0.022 0.004 0.007 0.104 0.029 0.688 106 G 0.070 0.349 0.015 0.007 0.011 0.094 0.063 0.391 107 D 0.087 0.746 0.006 0.006 0.005 0.021 0.055 0.074 108 A 0.026 0.796 0.005 0.004 0.010 0.024 0.037 0.098 109 G 0.025 0.729 0.014 0.014 0.027 0.021 0.064 0.106 110 M 0.023 0.710 0.018 0.037 0.045 0.027 0.060 0.080 111 C 0.040 0.672 0.038 0.022 0.038 0.026 0.074 0.090 112 L 0.072 0.267 0.074 0.115 0.097 0.045 0.166 0.164 113 D 0.058 0.094 0.086 0.096 0.099 0.071 0.188 0.308 114 L 0.151 0.031 0.070 0.035 0.060 0.090 0.143 0.420 115 L 0.375 0.004 0.027 0.020 0.024 0.079 0.080 0.390 116 D 0.084 0.002 0.005 0.006 0.010 0.052 0.030 0.812 117 D 0.008 0.001 0.009 0.005 0.023 0.093 0.006 0.856 118 G 0.011 0.001 0.041 0.078 0.198 0.123 0.023 0.526 119 T 0.003 0.001 0.044 0.214 0.231 0.067 0.025 0.416 120 F 0.002 0.001 0.053 0.110 0.133 0.054 0.014 0.632 121 K 0.030 0.001 0.047 0.241 0.134 0.070 0.043 0.434 122 P 0.049 0.002 0.021 0.036 0.030 0.065 0.032 0.765 123 K 0.071 0.005 0.024 0.024 0.041 0.090 0.028 0.716