# TARGET T0381 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-pb-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 16 (1 pb ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp7/T0381/T0381.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 804.578 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M N O P 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.105 0.020 0.312 0.377 0.007 0.043 0.014 0.003 0.015 0.013 0.006 0.008 0.028 0.003 0.003 0.043 2 T 0.075 0.085 0.220 0.351 0.012 0.160 0.015 0.006 0.003 0.004 0.017 0.015 0.024 0.002 0.003 0.007 3 A 0.012 0.076 0.069 0.463 0.018 0.199 0.009 0.012 0.007 0.004 0.075 0.023 0.020 0.003 0.002 0.007 4 T 0.014 0.247 0.089 0.497 0.004 0.029 0.004 0.008 0.010 0.003 0.019 0.047 0.014 0.001 0.004 0.009 5 E 0.027 0.055 0.158 0.536 0.010 0.096 0.009 0.003 0.011 0.008 0.014 0.019 0.029 0.001 0.002 0.023 6 P 0.028 0.081 0.248 0.341 0.013 0.157 0.009 0.012 0.002 0.003 0.053 0.017 0.028 0.002 0.003 0.005 7 T 0.004 0.073 0.027 0.122 0.006 0.590 0.003 0.014 0.004 0.005 0.065 0.050 0.031 0.001 0.003 0.002 8 E 0.007 0.075 0.023 0.104 0.006 0.076 0.006 0.008 0.008 0.003 0.490 0.097 0.082 0.004 0.004 0.006 9 K 0.019 0.140 0.077 0.127 0.004 0.038 0.017 0.008 0.010 0.002 0.040 0.334 0.134 0.010 0.016 0.023 10 I 0.026 0.045 0.357 0.177 0.003 0.016 0.034 0.006 0.007 0.003 0.017 0.028 0.159 0.010 0.025 0.088 11 L 0.032 0.031 0.380 0.158 0.008 0.130 0.038 0.004 0.004 0.004 0.014 0.014 0.123 0.003 0.008 0.050 12 P 0.031 0.203 0.231 0.345 0.004 0.020 0.008 0.011 0.002 0.003 0.044 0.012 0.051 0.004 0.005 0.027 13 S 0.007 0.008 0.014 0.032 0.006 0.813 0.004 0.002 0.002 0.006 0.011 0.039 0.051 0.001 0.001 0.002 14 P 0.002 0.022 0.008 0.005 0.001 0.027 0.002 0.002 0.001 0.001 0.853 0.012 0.061 0.001 0.001 0.001 15 D 0.002 0.043 0.003 0.009 0.001 0.008 0.001 0.001 0.002 0.001 0.012 0.878 0.036 0.001 0.003 0.002 16 Y 0.008 0.006 0.065 0.015 0.001 0.013 0.002 0.001 0.002 0.001 0.059 0.039 0.745 0.001 0.003 0.040 17 V 0.004 0.002 0.027 0.005 0.001 0.038 0.003 0.001 0.001 0.001 0.027 0.066 0.827 0.001 0.001 0.001 18 Q 0.001 0.011 0.003 0.008 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.030 0.055 0.885 0.001 0.001 0.001 19 S 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.041 0.941 0.001 0.001 0.001 20 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.007 0.985 0.001 0.001 0.001 21 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.031 0.966 0.001 0.001 0.001 22 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 0.001 23 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 24 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.996 0.001 0.001 0.001 25 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 26 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 27 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 28 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 29 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.963 0.017 0.002 0.015 30 F 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.914 0.016 0.035 0.012 31 D 0.001 0.002 0.009 0.002 0.001 0.004 0.007 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.878 0.022 0.013 0.056 32 H 0.018 0.013 0.013 0.005 0.003 0.006 0.055 0.002 0.002 0.001 0.034 0.008 0.492 0.234 0.019 0.095 33 R 0.011 0.029 0.077 0.005 0.002 0.008 0.070 0.008 0.001 0.001 0.020 0.042 0.316 0.056 0.323 0.032 34 N 0.013 0.036 0.117 0.011 0.002 0.023 0.089 0.004 0.009 0.006 0.020 0.030 0.259 0.043 0.067 0.271 35 Q 0.178 0.091 0.102 0.032 0.001 0.037 0.030 0.008 0.007 0.004 0.077 0.100 0.191 0.005 0.044 0.093 36 R 0.062 0.155 0.300 0.030 0.002 0.052 0.017 0.001 0.012 0.003 0.025 0.043 0.097 0.005 0.008 0.189 37 R 0.036 0.175 0.520 0.183 0.001 0.004 0.001 0.002 0.001 0.001 0.006 0.024 0.035 0.001 0.005 0.008 38 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 39 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 40 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 0.001 0.001 41 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 42 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 43 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 44 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.001 0.001 45 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.979 0.001 0.002 46 T 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.041 0.001 0.952 0.001 47 D 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.050 0.001 0.001 0.942 48 L 0.893 0.003 0.009 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 0.073 0.001 0.001 0.004 49 T 0.003 0.007 0.062 0.001 0.001 0.504 0.002 0.001 0.001 0.001 0.027 0.052 0.338 0.001 0.002 0.001 50 R 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.809 0.018 0.159 0.001 0.001 0.001 51 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.895 0.101 0.001 0.001 0.001 52 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.009 0.985 0.001 0.001 0.001 53 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.986 0.001 0.001 0.001 54 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.989 0.001 0.001 0.001 55 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 56 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 57 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 58 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 59 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 60 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 61 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.994 0.001 0.001 0.001 62 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.968 0.001 0.005 63 L 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.976 0.001 64 G 0.001 0.002 0.013 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.028 0.023 0.001 0.001 0.035 0.001 0.001 0.890 65 Y 0.973 0.001 0.003 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 66 V 0.011 0.044 0.723 0.122 0.003 0.022 0.005 0.001 0.001 0.001 0.005 0.013 0.041 0.002 0.002 0.005 67 A 0.002 0.036 0.085 0.683 0.030 0.104 0.006 0.003 0.001 0.001 0.005 0.004 0.030 0.001 0.002 0.006 68 T 0.006 0.057 0.049 0.420 0.281 0.070 0.038 0.011 0.002 0.003 0.022 0.005 0.015 0.014 0.001 0.005 69 D 0.006 0.098 0.037 0.122 0.038 0.314 0.013 0.220 0.007 0.010 0.042 0.027 0.024 0.004 0.035 0.005 70 G 0.012 0.124 0.034 0.084 0.008 0.074 0.012 0.036 0.100 0.076 0.288 0.038 0.039 0.007 0.010 0.058 71 S 0.205 0.195 0.050 0.094 0.003 0.041 0.013 0.009 0.031 0.006 0.029 0.259 0.028 0.003 0.021 0.014 72 A 0.060 0.100 0.497 0.119 0.001 0.012 0.008 0.003 0.014 0.002 0.012 0.020 0.035 0.002 0.009 0.104 73 F 0.065 0.014 0.541 0.274 0.002 0.025 0.005 0.001 0.003 0.002 0.010 0.016 0.027 0.001 0.001 0.014 74 W 0.033 0.032 0.250 0.294 0.037 0.217 0.013 0.002 0.001 0.003 0.026 0.014 0.068 0.002 0.001 0.007 75 L 0.005 0.112 0.035 0.594 0.004 0.071 0.001 0.017 0.001 0.002 0.060 0.038 0.054 0.001 0.001 0.003 76 T 0.002 0.005 0.007 0.043 0.005 0.648 0.001 0.002 0.004 0.011 0.058 0.082 0.131 0.001 0.001 0.001 77 P 0.001 0.003 0.001 0.002 0.001 0.026 0.001 0.001 0.001 0.001 0.758 0.044 0.163 0.001 0.001 0.001 78 R 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.835 0.136 0.001 0.001 0.001 79 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.024 0.970 0.001 0.001 0.001 80 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.989 0.001 0.001 0.001 81 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 82 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.990 0.001 0.001 0.001 83 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.001 0.004 84 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.991 0.001 0.001 0.001 85 S 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.970 0.002 0.002 0.007 86 Y 0.001 0.002 0.006 0.003 0.001 0.004 0.011 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.924 0.019 0.008 0.013 87 L 0.001 0.007 0.024 0.006 0.001 0.005 0.022 0.001 0.001 0.001 0.008 0.006 0.847 0.027 0.023 0.021 88 S 0.004 0.012 0.023 0.014 0.001 0.011 0.011 0.005 0.001 0.001 0.012 0.018 0.768 0.012 0.051 0.055 89 S 0.031 0.017 0.040 0.010 0.003 0.016 0.042 0.002 0.005 0.003 0.023 0.014 0.474 0.101 0.018 0.203 90 L 0.048 0.048 0.192 0.030 0.001 0.014 0.012 0.011 0.001 0.001 0.040 0.046 0.421 0.004 0.099 0.032 91 S 0.012 0.031 0.083 0.020 0.001 0.167 0.006 0.002 0.005 0.009 0.021 0.084 0.483 0.002 0.003 0.070 92 L 0.018 0.007 0.013 0.011 0.001 0.080 0.002 0.001 0.001 0.001 0.306 0.056 0.501 0.001 0.001 0.002 93 P 0.001 0.010 0.006 0.004 0.001 0.018 0.001 0.001 0.001 0.001 0.056 0.440 0.462 0.001 0.001 0.001 94 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.027 0.049 0.915 0.001 0.001 0.001 95 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.041 0.947 0.001 0.001 0.001 96 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.016 0.977 0.001 0.001 0.001 97 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.992 0.001 0.001 0.001 98 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.006 0.988 0.001 0.001 0.001 99 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.980 0.001 0.001 0.001 100 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.996 0.001 0.001 0.001 101 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.994 0.001 0.001 0.001 102 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 103 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 104 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 105 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.988 0.001 0.001 0.004 106 K 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.017 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.123 0.818 0.002 0.032 107 V 0.001 0.002 0.034 0.002 0.001 0.002 0.020 0.005 0.001 0.001 0.002 0.002 0.169 0.003 0.757 0.004 108 H 0.003 0.033 0.040 0.007 0.001 0.004 0.009 0.001 0.012 0.005 0.003 0.003 0.147 0.003 0.004 0.725 109 E 0.700 0.029 0.054 0.127 0.001 0.005 0.003 0.001 0.003 0.001 0.006 0.006 0.040 0.001 0.002 0.022 110 S 0.014 0.034 0.785 0.103 0.001 0.033 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.016 0.001 0.001 0.004 111 S 0.005 0.097 0.145 0.722 0.001 0.016 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 112 S 0.001 0.006 0.035 0.935 0.001 0.012 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 113 V 0.001 0.009 0.082 0.891 0.002 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 114 S 0.001 0.003 0.011 0.970 0.005 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 115 I 0.007 0.009 0.014 0.625 0.204 0.129 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 116 L 0.001 0.009 0.003 0.067 0.879 0.013 0.008 0.009 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 117 D 0.001 0.006 0.001 0.005 0.007 0.052 0.001 0.899 0.002 0.003 0.004 0.001 0.001 0.001 0.017 0.001 118 G 0.002 0.024 0.002 0.005 0.001 0.020 0.002 0.014 0.359 0.217 0.293 0.006 0.005 0.002 0.002 0.044 119 A 0.595 0.118 0.010 0.021 0.001 0.003 0.001 0.003 0.015 0.001 0.006 0.193 0.003 0.001 0.026 0.003 120 D 0.036 0.044 0.733 0.024 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.144 121 I 0.035 0.002 0.785 0.173 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 122 V 0.001 0.013 0.423 0.560 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 123 Y 0.001 0.001 0.002 0.952 0.007 0.036 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 124 V 0.001 0.039 0.014 0.706 0.124 0.083 0.001 0.011 0.001 0.001 0.017 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 125 A 0.001 0.104 0.005 0.772 0.004 0.021 0.001 0.071 0.004 0.002 0.010 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 126 R 0.009 0.040 0.073 0.796 0.004 0.011 0.001 0.003 0.032 0.007 0.003 0.002 0.002 0.001 0.001 0.015 127 V 0.095 0.017 0.216 0.588 0.017 0.046 0.006 0.002 0.001 0.002 0.003 0.002 0.002 0.001 0.001 0.002 128 P 0.004 0.075 0.071 0.491 0.030 0.292 0.002 0.012 0.001 0.003 0.011 0.003 0.002 0.001 0.001 0.001 129 V 0.003 0.043 0.004 0.227 0.026 0.535 0.001 0.016 0.006 0.006 0.118 0.011 0.004 0.001 0.001 0.001 130 S 0.005 0.626 0.019 0.145 0.002 0.024 0.001 0.013 0.015 0.003 0.048 0.088 0.006 0.001 0.001 0.002 131 R 0.030 0.068 0.141 0.479 0.003 0.050 0.004 0.010 0.030 0.006 0.041 0.077 0.038 0.001 0.004 0.018 132 I 0.027 0.026 0.601 0.241 0.003 0.026 0.004 0.002 0.003 0.001 0.013 0.009 0.035 0.001 0.002 0.008 133 M 0.012 0.041 0.138 0.729 0.002 0.026 0.001 0.002 0.001 0.001 0.009 0.008 0.025 0.001 0.001 0.004 134 T 0.005 0.019 0.048 0.834 0.032 0.033 0.004 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.011 0.003 0.001 0.002 135 V 0.004 0.027 0.055 0.812 0.008 0.030 0.001 0.034 0.001 0.001 0.008 0.002 0.012 0.001 0.005 0.001 136 G 0.002 0.036 0.038 0.838 0.010 0.022 0.001 0.003 0.014 0.006 0.007 0.003 0.008 0.001 0.001 0.011 137 I 0.063 0.014 0.040 0.805 0.017 0.026 0.001 0.004 0.002 0.002 0.007 0.004 0.012 0.001 0.001 0.002 138 T 0.003 0.011 0.026 0.115 0.679 0.095 0.028 0.003 0.001 0.002 0.006 0.004 0.004 0.021 0.001 0.001 139 I 0.002 0.043 0.007 0.177 0.013 0.049 0.001 0.621 0.002 0.001 0.030 0.005 0.008 0.001 0.041 0.001 140 G 0.003 0.055 0.010 0.113 0.010 0.045 0.005 0.007 0.360 0.269 0.030 0.037 0.016 0.002 0.001 0.037 141 T 0.514 0.033 0.032 0.124 0.005 0.042 0.007 0.016 0.007 0.004 0.080 0.065 0.058 0.001 0.006 0.005 142 R 0.014 0.155 0.444 0.189 0.003 0.024 0.005 0.005 0.014 0.003 0.017 0.051 0.038 0.002 0.003 0.034 143 L 0.034 0.024 0.154 0.546 0.008 0.084 0.007 0.003 0.003 0.003 0.013 0.030 0.079 0.001 0.003 0.006 144 P 0.008 0.053 0.113 0.203 0.014 0.360 0.005 0.005 0.002 0.004 0.057 0.022 0.147 0.001 0.001 0.005 145 A 0.006 0.068 0.016 0.288 0.008 0.091 0.002 0.008 0.003 0.002 0.280 0.084 0.137 0.002 0.001 0.003 146 Y 0.005 0.082 0.036 0.149 0.009 0.044 0.006 0.004 0.005 0.002 0.026 0.314 0.306 0.002 0.004 0.007 147 A 0.003 0.005 0.020 0.038 0.003 0.051 0.004 0.003 0.002 0.002 0.043 0.030 0.784 0.001 0.002 0.008 148 T 0.002 0.011 0.007 0.010 0.001 0.061 0.001 0.001 0.001 0.001 0.035 0.100 0.767 0.001 0.001 0.002 149 S 0.002 0.002 0.002 0.007 0.001 0.014 0.002 0.001 0.001 0.001 0.204 0.103 0.658 0.002 0.001 0.002 150 M 0.001 0.002 0.004 0.006 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.053 0.133 0.793 0.001 0.002 0.001 151 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.015 0.977 0.001 0.001 0.001 152 R 0.001 0.003 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.975 0.001 0.001 0.001 153 V 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.983 0.001 0.001 0.001 154 L 0.001 0.003 0.001 0.008 0.001 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.973 0.002 0.001 0.001 155 L 0.001 0.003 0.002 0.016 0.003 0.003 0.021 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.559 0.362 0.019 0.007 156 A 0.001 0.003 0.015 0.007 0.001 0.001 0.010 0.008 0.001 0.001 0.002 0.001 0.302 0.024 0.546 0.078 157 G 0.010 0.005 0.025 0.006 0.001 0.001 0.004 0.001 0.004 0.002 0.001 0.001 0.054 0.004 0.009 0.876 158 L 0.397 0.026 0.362 0.062 0.001 0.009 0.015 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.065 0.002 0.005 0.047 159 P 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.973 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.014 0.001 0.001 0.001 160 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.979 0.005 0.006 0.001 0.001 0.001 161 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.986 0.006 0.001 0.001 0.001 162 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.033 0.962 0.001 0.001 0.001 163 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.994 0.001 0.001 0.001 164 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.995 0.001 0.001 0.001 165 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 166 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.001 0.001 167 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.992 0.002 0.002 0.001 168 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.977 0.006 0.005 0.008 169 K 0.002 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.014 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.532 0.302 0.015 0.125 170 L 0.005 0.003 0.106 0.002 0.001 0.002 0.024 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.642 0.004 0.184 0.020 171 D 0.006 0.015 0.051 0.006 0.001 0.041 0.011 0.001 0.001 0.002 0.013 0.013 0.687 0.008 0.006 0.138 172 I 0.086 0.048 0.033 0.040 0.001 0.025 0.008 0.002 0.001 0.001 0.135 0.047 0.529 0.012 0.010 0.021 173 Q 0.009 0.037 0.141 0.032 0.003 0.043 0.037 0.003 0.002 0.001 0.036 0.140 0.471 0.016 0.015 0.015 174 R 0.009 0.050 0.086 0.082 0.002 0.030 0.020 0.007 0.002 0.001 0.056 0.025 0.558 0.008 0.024 0.041 175 L 0.020 0.117 0.184 0.192 0.006 0.022 0.047 0.003 0.009 0.003 0.014 0.056 0.190 0.029 0.012 0.098 176 T 0.017 0.012 0.112 0.039 0.013 0.372 0.078 0.006 0.001 0.003 0.014 0.024 0.275 0.006 0.018 0.009 177 E 0.007 0.127 0.055 0.038 0.005 0.047 0.011 0.024 0.005 0.003 0.454 0.019 0.143 0.015 0.011 0.038 178 R 0.040 0.221 0.051 0.176 0.002 0.013 0.008 0.007 0.030 0.004 0.015 0.298 0.064 0.011 0.026 0.035 179 T 0.048 0.015 0.311 0.045 0.003 0.102 0.033 0.003 0.005 0.005 0.016 0.026 0.304 0.004 0.019 0.061 180 I 0.027 0.042 0.180 0.047 0.006 0.117 0.021 0.004 0.002 0.002 0.303 0.026 0.189 0.005 0.003 0.024 181 T 0.018 0.257 0.077 0.165 0.001 0.015 0.002 0.018 0.003 0.002 0.027 0.303 0.096 0.001 0.007 0.008 182 A 0.001 0.002 0.006 0.007 0.001 0.556 0.001 0.001 0.001 0.006 0.014 0.042 0.359 0.001 0.001 0.003 183 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.001 0.001 0.001 0.001 0.743 0.011 0.225 0.001 0.001 0.001 184 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 0.841 0.134 0.001 0.001 0.001 185 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.021 0.975 0.001 0.001 0.001 186 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 0.001 187 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 188 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 189 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 190 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 191 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 192 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.991 0.004 0.001 0.004 193 V 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.960 0.004 0.007 0.006 194 R 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.004 0.024 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.913 0.017 0.007 0.019 195 A 0.002 0.003 0.004 0.001 0.007 0.002 0.090 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.092 0.765 0.011 0.014 196 D 0.002 0.022 0.010 0.003 0.001 0.001 0.002 0.021 0.002 0.001 0.001 0.002 0.026 0.002 0.889 0.016 197 G 0.022 0.004 0.083 0.009 0.001 0.002 0.006 0.001 0.040 0.010 0.003 0.001 0.039 0.003 0.005 0.773 198 I 0.813 0.007 0.121 0.033 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.009 0.001 0.001 0.004 199 C 0.014 0.024 0.508 0.342 0.013 0.054 0.006 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.014 0.002 0.001 0.008 200 V 0.004 0.049 0.051 0.714 0.077 0.070 0.007 0.004 0.001 0.001 0.005 0.003 0.009 0.001 0.001 0.002 201 L 0.002 0.031 0.009 0.125 0.045 0.668 0.004 0.044 0.003 0.009 0.033 0.011 0.011 0.002 0.002 0.001 202 D 0.003 0.117 0.009 0.043 0.003 0.182 0.002 0.061 0.017 0.014 0.459 0.052 0.031 0.001 0.005 0.003 203 Q 0.019 0.085 0.021 0.050 0.001 0.014 0.002 0.004 0.041 0.006 0.144 0.554 0.043 0.002 0.003 0.012 204 E 0.080 0.024 0.276 0.071 0.006 0.032 0.022 0.003 0.005 0.001 0.029 0.147 0.251 0.006 0.013 0.035 205 L 0.009 0.030 0.343 0.051 0.005 0.055 0.010 0.005 0.001 0.001 0.039 0.028 0.395 0.001 0.005 0.022 206 E 0.006 0.016 0.015 0.018 0.319 0.059 0.229 0.002 0.002 0.001 0.018 0.015 0.069 0.225 0.001 0.005 207 A 0.003 0.021 0.014 0.028 0.001 0.009 0.002 0.505 0.001 0.001 0.026 0.009 0.057 0.001 0.322 0.001 208 G 0.001 0.034 0.012 0.024 0.001 0.004 0.001 0.001 0.380 0.048 0.003 0.013 0.033 0.001 0.001 0.444 209 L 0.812 0.002 0.025 0.039 0.001 0.030 0.003 0.001 0.001 0.001 0.008 0.008 0.068 0.001 0.001 0.002 210 R 0.001 0.379 0.531 0.053 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.013 0.001 0.001 0.002 211 S 0.005 0.003 0.024 0.851 0.007 0.054 0.001 0.002 0.001 0.001 0.021 0.001 0.024 0.003 0.001 0.003 212 M 0.003 0.064 0.541 0.317 0.003 0.014 0.001 0.009 0.001 0.001 0.009 0.004 0.028 0.001 0.003 0.002 213 A 0.001 0.012 0.020 0.940 0.001 0.005 0.001 0.002 0.002 0.001 0.003 0.002 0.008 0.001 0.001 0.004 214 A 0.015 0.007 0.094 0.827 0.011 0.024 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.003 215 P 0.003 0.022 0.063 0.848 0.007 0.042 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.005 0.001 0.001 0.002 216 I 0.003 0.031 0.010 0.449 0.248 0.214 0.011 0.003 0.002 0.003 0.014 0.004 0.003 0.004 0.001 0.001 217 R 0.004 0.228 0.019 0.430 0.015 0.052 0.002 0.188 0.003 0.001 0.035 0.009 0.005 0.001 0.007 0.001 218 G 0.003 0.032 0.012 0.042 0.064 0.500 0.006 0.016 0.072 0.121 0.039 0.055 0.023 0.001 0.002 0.011 219 A 0.020 0.020 0.008 0.005 0.127 0.006 0.118 0.008 0.001 0.002 0.497 0.012 0.009 0.162 0.002 0.002 220 S 0.001 0.018 0.008 0.005 0.001 0.004 0.001 0.176 0.003 0.001 0.003 0.052 0.003 0.001 0.723 0.001 221 G 0.004 0.005 0.014 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.253 0.009 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.705 222 L 0.919 0.005 0.040 0.031 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 223 T 0.004 0.004 0.768 0.093 0.001 0.124 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 224 V 0.001 0.101 0.028 0.784 0.003 0.044 0.001 0.002 0.001 0.001 0.031 0.002 0.004 0.001 0.001 0.001 225 A 0.001 0.025 0.010 0.945 0.001 0.006 0.001 0.002 0.001 0.001 0.004 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 226 A 0.002 0.002 0.060 0.880 0.019 0.014 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 227 V 0.002 0.031 0.074 0.834 0.005 0.023 0.001 0.005 0.001 0.001 0.002 0.003 0.017 0.001 0.001 0.001 228 N 0.001 0.013 0.004 0.690 0.016 0.246 0.001 0.002 0.002 0.004 0.005 0.002 0.011 0.001 0.001 0.002 229 I 0.010 0.091 0.011 0.491 0.028 0.204 0.004 0.014 0.002 0.001 0.101 0.009 0.030 0.001 0.001 0.002 230 S 0.003 0.295 0.050 0.530 0.005 0.019 0.002 0.007 0.009 0.003 0.009 0.044 0.013 0.001 0.002 0.008 231 T 0.029 0.029 0.092 0.532 0.022 0.151 0.012 0.005 0.006 0.007 0.012 0.013 0.069 0.003 0.004 0.015 232 P 0.014 0.098 0.096 0.114 0.014 0.364 0.010 0.016 0.002 0.003 0.122 0.022 0.111 0.004 0.004 0.006 233 A 0.007 0.183 0.030 0.189 0.012 0.100 0.012 0.015 0.010 0.003 0.208 0.126 0.072 0.016 0.008 0.009 234 A 0.022 0.078 0.097 0.203 0.004 0.030 0.018 0.018 0.012 0.003 0.059 0.218 0.167 0.004 0.039 0.027 235 R 0.032 0.073 0.244 0.161 0.004 0.027 0.016 0.002 0.017 0.003 0.011 0.016 0.123 0.007 0.009 0.254 236 Y 0.045 0.063 0.391 0.445 0.001 0.004 0.003 0.003 0.001 0.001 0.003 0.005 0.018 0.001 0.005 0.013 237 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 238 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 239 E 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.989 0.003 0.001 0.001 0.001 240 D 0.001 0.001 0.009 0.002 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.934 0.002 0.005 0.031 241 L 0.002 0.001 0.028 0.002 0.001 0.007 0.007 0.001 0.001 0.001 0.017 0.012 0.909 0.003 0.003 0.008 242 H 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.007 0.004 0.001 0.001 0.001 0.013 0.020 0.938 0.005 0.003 0.003 243 S 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.003 0.002 0.001 0.001 0.001 0.023 0.024 0.931 0.003 0.003 0.005 244 D 0.001 0.005 0.007 0.002 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.006 0.028 0.895 0.003 0.006 0.040 245 L 0.002 0.002 0.042 0.003 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 0.004 0.011 0.913 0.001 0.003 0.014 246 I 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.029 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.008 0.942 0.001 0.001 0.001 247 P 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.102 0.019 0.865 0.001 0.001 0.001 248 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.232 0.755 0.001 0.001 0.001 249 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.990 0.001 0.001 0.001 250 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.995 0.001 0.001 0.001 251 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.995 0.001 0.001 0.001 252 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 253 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.001 0.001 254 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.982 0.001 0.002 0.002 255 D 0.001 0.001 0.004 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.006 0.003 0.959 0.005 0.004 0.012 256 I 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 0.969 0.001 0.002 0.002 257 E 0.001 0.001 0.004 0.002 0.001 0.004 0.006 0.001 0.001 0.001 0.011 0.005 0.936 0.020 0.001 0.008 258 Q 0.001 0.005 0.008 0.006 0.001 0.003 0.005 0.003 0.001 0.001 0.007 0.021 0.900 0.006 0.031 0.004 259 D 0.001 0.004 0.013 0.008 0.003 0.010 0.023 0.002 0.003 0.002 0.005 0.009 0.689 0.114 0.017 0.099 260 L 0.015 0.010 0.045 0.018 0.001 0.009 0.025 0.007 0.001 0.001 0.022 0.009 0.680 0.012 0.111 0.034 261 A 0.016 0.030 0.151 0.038 0.002 0.012 0.024 0.005 0.008 0.005 0.013 0.029 0.454 0.016 0.019 0.179 262 T 0.136 0.027 0.118 0.074 0.016 0.044 0.073 0.004 0.006 0.003 0.018 0.019 0.316 0.049 0.016 0.082 263 V 0.023 0.144 0.316 0.147 0.009 0.029 0.029 0.021 0.004 0.002 0.032 0.017 0.131 0.018 0.037 0.040 264 N 0.010 0.025 0.057 0.047 0.048 0.485 0.063 0.009 0.008 0.015 0.022 0.051 0.122 0.012 0.010 0.016 265 R 0.019 0.093 0.035 0.037 0.020 0.030 0.020 0.044 0.005 0.003 0.534 0.030 0.084 0.017 0.014 0.014