# TARGET T0381 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-pb-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 16 (1 pb ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp7/T0381/T0381.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1165 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M N O P 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.151 0.038 0.258 0.363 0.011 0.029 0.029 0.002 0.009 0.012 0.011 0.014 0.030 0.005 0.002 0.035 2 T 0.036 0.048 0.157 0.182 0.009 0.465 0.008 0.013 0.002 0.003 0.013 0.025 0.029 0.001 0.006 0.003 3 A 0.005 0.103 0.041 0.193 0.008 0.136 0.004 0.012 0.010 0.007 0.413 0.019 0.032 0.003 0.002 0.012 4 T 0.029 0.278 0.060 0.314 0.004 0.022 0.005 0.005 0.011 0.002 0.018 0.219 0.022 0.001 0.005 0.006 5 E 0.021 0.033 0.333 0.289 0.007 0.114 0.015 0.005 0.005 0.005 0.017 0.022 0.099 0.002 0.006 0.026 6 P 0.019 0.078 0.210 0.249 0.011 0.194 0.010 0.015 0.003 0.003 0.089 0.026 0.078 0.003 0.004 0.010 7 T 0.012 0.090 0.038 0.186 0.009 0.298 0.006 0.017 0.006 0.005 0.126 0.092 0.101 0.004 0.004 0.006 8 E 0.013 0.082 0.061 0.192 0.008 0.068 0.012 0.013 0.009 0.003 0.189 0.136 0.183 0.009 0.010 0.013 9 K 0.021 0.085 0.121 0.208 0.005 0.047 0.022 0.009 0.011 0.003 0.037 0.103 0.245 0.014 0.020 0.049 10 I 0.029 0.048 0.329 0.258 0.004 0.017 0.031 0.006 0.006 0.003 0.017 0.022 0.146 0.009 0.017 0.059 11 L 0.033 0.033 0.293 0.246 0.012 0.141 0.032 0.005 0.005 0.004 0.014 0.015 0.120 0.004 0.007 0.038 12 P 0.026 0.180 0.186 0.419 0.005 0.025 0.008 0.011 0.003 0.003 0.044 0.011 0.048 0.004 0.004 0.024 13 S 0.010 0.017 0.025 0.074 0.010 0.725 0.005 0.004 0.004 0.007 0.014 0.044 0.054 0.001 0.002 0.004 14 P 0.004 0.043 0.019 0.019 0.003 0.048 0.004 0.005 0.001 0.001 0.755 0.017 0.073 0.002 0.001 0.003 15 D 0.004 0.074 0.008 0.028 0.001 0.022 0.001 0.004 0.004 0.001 0.024 0.771 0.050 0.001 0.005 0.003 16 Y 0.012 0.013 0.080 0.036 0.001 0.026 0.004 0.002 0.005 0.002 0.094 0.057 0.616 0.002 0.004 0.044 17 V 0.009 0.006 0.046 0.015 0.001 0.056 0.006 0.001 0.001 0.001 0.040 0.097 0.716 0.001 0.001 0.003 18 Q 0.001 0.023 0.011 0.025 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 0.041 0.077 0.804 0.001 0.001 0.002 19 S 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.030 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.049 0.900 0.001 0.001 0.001 20 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.014 0.961 0.001 0.001 0.001 21 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.078 0.913 0.001 0.001 0.001 22 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.994 0.001 0.001 0.001 23 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.996 0.001 0.001 0.001 24 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.989 0.001 0.001 0.001 25 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 26 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 27 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 28 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 29 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.976 0.012 0.001 0.008 30 F 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.931 0.013 0.031 0.009 31 D 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.002 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.898 0.020 0.012 0.050 32 H 0.015 0.007 0.011 0.003 0.003 0.004 0.056 0.001 0.001 0.001 0.020 0.005 0.457 0.310 0.016 0.090 33 R 0.008 0.021 0.065 0.003 0.001 0.007 0.077 0.007 0.001 0.001 0.015 0.027 0.294 0.058 0.388 0.028 34 N 0.011 0.038 0.105 0.009 0.002 0.017 0.085 0.003 0.009 0.005 0.015 0.022 0.213 0.044 0.066 0.357 35 Q 0.241 0.094 0.114 0.035 0.001 0.029 0.035 0.007 0.007 0.004 0.053 0.085 0.146 0.005 0.044 0.102 36 R 0.064 0.147 0.367 0.028 0.001 0.061 0.016 0.001 0.010 0.002 0.018 0.029 0.071 0.003 0.007 0.174 37 R 0.032 0.211 0.496 0.204 0.001 0.003 0.001 0.002 0.001 0.001 0.006 0.016 0.019 0.001 0.003 0.007 38 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 39 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 40 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 41 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 42 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 43 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 44 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.001 0.001 45 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 0.981 0.001 0.001 46 T 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.032 0.001 0.961 0.001 47 D 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.042 0.001 0.001 0.948 48 L 0.921 0.004 0.010 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.047 0.001 0.001 0.004 49 T 0.002 0.006 0.058 0.001 0.001 0.643 0.002 0.001 0.001 0.001 0.016 0.044 0.220 0.001 0.002 0.001 50 R 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.876 0.011 0.101 0.001 0.001 0.001 51 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.934 0.060 0.001 0.001 0.001 52 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.011 0.981 0.001 0.001 0.001 53 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.016 0.980 0.001 0.001 0.001 54 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.984 0.001 0.001 0.001 55 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 56 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 57 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 58 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 59 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 60 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 61 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 62 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.978 0.001 0.003 63 L 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.982 0.001 64 G 0.001 0.001 0.011 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.025 0.021 0.001 0.001 0.030 0.001 0.001 0.906 65 Y 0.979 0.001 0.003 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 66 V 0.012 0.038 0.746 0.123 0.003 0.019 0.004 0.001 0.001 0.001 0.003 0.011 0.030 0.002 0.002 0.005 67 A 0.003 0.033 0.094 0.586 0.045 0.180 0.008 0.003 0.001 0.001 0.005 0.004 0.029 0.002 0.002 0.005 68 T 0.005 0.071 0.037 0.336 0.347 0.068 0.039 0.015 0.003 0.003 0.039 0.005 0.012 0.016 0.001 0.004 69 D 0.006 0.118 0.033 0.118 0.036 0.243 0.014 0.252 0.010 0.011 0.039 0.041 0.020 0.005 0.049 0.005 70 G 0.014 0.117 0.044 0.083 0.007 0.064 0.014 0.036 0.127 0.094 0.223 0.037 0.040 0.006 0.013 0.079 71 S 0.264 0.179 0.060 0.096 0.003 0.037 0.013 0.008 0.033 0.007 0.029 0.208 0.025 0.003 0.018 0.019 72 A 0.067 0.094 0.530 0.130 0.001 0.015 0.008 0.003 0.011 0.002 0.011 0.020 0.028 0.002 0.008 0.071 73 F 0.053 0.017 0.514 0.308 0.002 0.032 0.005 0.002 0.003 0.003 0.010 0.015 0.023 0.001 0.002 0.012 74 W 0.031 0.041 0.206 0.322 0.040 0.237 0.013 0.003 0.002 0.003 0.029 0.013 0.052 0.002 0.001 0.007 75 L 0.006 0.134 0.044 0.626 0.004 0.046 0.001 0.019 0.002 0.002 0.047 0.031 0.033 0.001 0.002 0.003 76 T 0.002 0.006 0.010 0.052 0.007 0.718 0.001 0.002 0.004 0.013 0.034 0.061 0.086 0.001 0.001 0.002 77 P 0.002 0.005 0.003 0.005 0.001 0.036 0.001 0.002 0.001 0.001 0.796 0.031 0.119 0.001 0.001 0.001 78 R 0.001 0.018 0.001 0.004 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.872 0.083 0.001 0.001 0.001 79 V 0.001 0.001 0.002 0.003 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.027 0.953 0.001 0.001 0.001 80 L 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.973 0.001 0.001 0.001 81 E 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.003 0.002 0.001 0.001 0.001 0.005 0.004 0.968 0.005 0.001 0.003 82 L 0.001 0.002 0.003 0.008 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 0.960 0.001 0.009 0.001 83 G 0.001 0.001 0.003 0.004 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.960 0.003 0.001 0.016 84 Y 0.001 0.002 0.001 0.004 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.010 0.965 0.001 0.001 0.001 85 S 0.001 0.008 0.006 0.011 0.001 0.005 0.003 0.001 0.001 0.001 0.004 0.022 0.918 0.004 0.003 0.014 86 Y 0.003 0.005 0.014 0.013 0.001 0.014 0.016 0.001 0.001 0.001 0.006 0.013 0.869 0.018 0.011 0.016 87 L 0.003 0.017 0.044 0.019 0.003 0.013 0.032 0.002 0.001 0.001 0.016 0.012 0.765 0.027 0.022 0.025 88 S 0.007 0.023 0.036 0.032 0.002 0.023 0.013 0.010 0.002 0.002 0.021 0.031 0.679 0.012 0.055 0.053 89 S 0.034 0.027 0.055 0.019 0.005 0.024 0.049 0.003 0.008 0.004 0.033 0.019 0.404 0.106 0.017 0.192 90 L 0.053 0.060 0.204 0.045 0.001 0.019 0.016 0.014 0.002 0.001 0.042 0.053 0.355 0.004 0.101 0.030 91 S 0.015 0.046 0.121 0.034 0.001 0.156 0.007 0.002 0.008 0.012 0.023 0.078 0.397 0.002 0.004 0.094 92 L 0.031 0.012 0.025 0.023 0.001 0.107 0.002 0.002 0.001 0.001 0.272 0.062 0.456 0.001 0.001 0.004 93 P 0.001 0.014 0.012 0.007 0.001 0.039 0.001 0.001 0.001 0.001 0.074 0.396 0.452 0.001 0.001 0.001 94 E 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.064 0.071 0.848 0.001 0.001 0.001 95 V 0.001 0.002 0.002 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.072 0.908 0.001 0.001 0.001 96 A 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.021 0.970 0.001 0.001 0.001 97 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.989 0.001 0.001 0.001 98 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.007 0.984 0.001 0.001 0.001 99 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.973 0.001 0.001 0.001 100 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.996 0.001 0.001 0.001 101 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.994 0.001 0.001 0.001 102 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.002 103 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 104 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 105 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.987 0.001 0.001 0.004 106 K 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.017 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.111 0.835 0.002 0.028 107 V 0.001 0.002 0.036 0.002 0.001 0.002 0.020 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.151 0.003 0.773 0.004 108 H 0.003 0.028 0.042 0.007 0.001 0.005 0.011 0.001 0.012 0.005 0.003 0.003 0.143 0.004 0.004 0.729 109 E 0.708 0.032 0.055 0.112 0.001 0.005 0.003 0.001 0.003 0.001 0.008 0.007 0.039 0.001 0.003 0.021 110 S 0.016 0.046 0.748 0.108 0.001 0.042 0.004 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.018 0.001 0.001 0.005 111 S 0.006 0.113 0.168 0.674 0.001 0.019 0.001 0.002 0.001 0.001 0.007 0.002 0.006 0.001 0.001 0.002 112 S 0.001 0.009 0.048 0.914 0.001 0.015 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 113 V 0.002 0.009 0.099 0.872 0.002 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 114 S 0.001 0.003 0.016 0.963 0.006 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 115 I 0.006 0.009 0.014 0.619 0.212 0.127 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 116 L 0.001 0.006 0.002 0.043 0.914 0.011 0.008 0.006 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 117 D 0.001 0.005 0.001 0.004 0.005 0.031 0.001 0.927 0.001 0.002 0.004 0.001 0.001 0.001 0.017 0.001 118 G 0.002 0.021 0.002 0.005 0.001 0.015 0.002 0.011 0.446 0.257 0.178 0.006 0.004 0.002 0.001 0.047 119 A 0.712 0.086 0.010 0.019 0.001 0.003 0.001 0.003 0.012 0.001 0.005 0.124 0.003 0.001 0.019 0.003 120 D 0.034 0.048 0.766 0.026 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.108 121 I 0.038 0.002 0.735 0.218 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 122 V 0.001 0.016 0.398 0.580 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 123 Y 0.001 0.001 0.003 0.960 0.006 0.028 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 124 V 0.001 0.032 0.019 0.728 0.121 0.072 0.001 0.009 0.001 0.001 0.012 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 125 A 0.001 0.085 0.006 0.790 0.004 0.023 0.001 0.070 0.003 0.002 0.009 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 126 R 0.008 0.039 0.060 0.810 0.004 0.012 0.001 0.003 0.031 0.007 0.003 0.002 0.002 0.001 0.001 0.015 127 V 0.093 0.019 0.190 0.613 0.019 0.044 0.006 0.002 0.001 0.002 0.003 0.002 0.003 0.001 0.001 0.002 128 P 0.004 0.074 0.076 0.491 0.032 0.286 0.002 0.013 0.001 0.003 0.011 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 129 V 0.003 0.044 0.005 0.212 0.029 0.541 0.002 0.017 0.006 0.006 0.119 0.011 0.005 0.001 0.001 0.001 130 S 0.006 0.602 0.019 0.142 0.003 0.026 0.002 0.016 0.016 0.003 0.062 0.094 0.007 0.001 0.002 0.002 131 R 0.031 0.074 0.138 0.413 0.004 0.060 0.005 0.011 0.036 0.007 0.044 0.105 0.046 0.002 0.005 0.020 132 I 0.030 0.029 0.575 0.220 0.004 0.034 0.006 0.003 0.003 0.001 0.020 0.013 0.049 0.001 0.002 0.010 133 M 0.014 0.056 0.158 0.655 0.003 0.033 0.002 0.003 0.002 0.001 0.013 0.015 0.038 0.001 0.001 0.006 134 T 0.008 0.024 0.060 0.780 0.039 0.041 0.008 0.002 0.001 0.001 0.006 0.004 0.017 0.006 0.001 0.003 135 V 0.005 0.034 0.078 0.758 0.007 0.031 0.002 0.041 0.002 0.001 0.009 0.003 0.018 0.001 0.008 0.002 136 G 0.003 0.039 0.052 0.790 0.011 0.029 0.002 0.004 0.018 0.009 0.009 0.004 0.013 0.001 0.001 0.017 137 I 0.078 0.018 0.047 0.764 0.018 0.030 0.002 0.004 0.002 0.002 0.010 0.005 0.017 0.001 0.001 0.003 138 T 0.003 0.013 0.029 0.111 0.652 0.104 0.034 0.003 0.001 0.003 0.008 0.005 0.006 0.028 0.001 0.001 139 I 0.003 0.052 0.009 0.176 0.012 0.046 0.001 0.595 0.002 0.001 0.031 0.006 0.010 0.001 0.054 0.001 140 G 0.003 0.053 0.012 0.115 0.009 0.046 0.006 0.007 0.357 0.260 0.028 0.038 0.018 0.002 0.002 0.044 141 T 0.529 0.035 0.037 0.127 0.005 0.039 0.007 0.015 0.006 0.003 0.072 0.058 0.054 0.001 0.006 0.006 142 R 0.014 0.145 0.457 0.203 0.003 0.023 0.005 0.005 0.013 0.003 0.015 0.043 0.033 0.002 0.003 0.035 143 L 0.034 0.023 0.171 0.571 0.008 0.073 0.007 0.003 0.003 0.003 0.010 0.023 0.061 0.001 0.003 0.005 144 P 0.008 0.042 0.102 0.205 0.018 0.412 0.005 0.006 0.002 0.004 0.055 0.018 0.117 0.001 0.001 0.004 145 A 0.006 0.083 0.015 0.268 0.011 0.095 0.003 0.011 0.003 0.002 0.308 0.080 0.108 0.002 0.001 0.003 146 Y 0.005 0.087 0.035 0.144 0.012 0.049 0.008 0.006 0.008 0.002 0.030 0.342 0.257 0.003 0.006 0.007 147 A 0.005 0.009 0.032 0.047 0.004 0.054 0.006 0.006 0.003 0.004 0.053 0.037 0.724 0.002 0.004 0.013 148 T 0.004 0.015 0.012 0.015 0.002 0.081 0.002 0.001 0.001 0.002 0.049 0.114 0.697 0.001 0.001 0.004 149 S 0.004 0.004 0.005 0.011 0.002 0.018 0.003 0.001 0.001 0.001 0.245 0.117 0.584 0.002 0.001 0.003 150 M 0.001 0.005 0.007 0.011 0.001 0.005 0.001 0.002 0.001 0.001 0.058 0.165 0.738 0.001 0.004 0.001 151 G 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.018 0.967 0.001 0.001 0.001 152 R 0.001 0.009 0.001 0.008 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.025 0.953 0.001 0.001 0.001 153 V 0.001 0.001 0.001 0.017 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.961 0.001 0.001 0.001 154 L 0.001 0.006 0.003 0.019 0.001 0.010 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.949 0.003 0.001 0.001 155 L 0.001 0.006 0.003 0.037 0.007 0.006 0.027 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.536 0.342 0.019 0.008 156 A 0.002 0.004 0.021 0.015 0.001 0.002 0.012 0.015 0.001 0.001 0.003 0.002 0.290 0.021 0.533 0.079 157 G 0.012 0.008 0.031 0.011 0.001 0.001 0.004 0.001 0.007 0.003 0.001 0.001 0.052 0.004 0.008 0.856 158 L 0.407 0.029 0.345 0.082 0.002 0.012 0.014 0.001 0.001 0.002 0.002 0.006 0.054 0.002 0.005 0.038 159 P 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.976 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.012 0.001 0.001 0.001 160 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.978 0.006 0.006 0.001 0.001 0.001 161 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.985 0.007 0.001 0.001 0.001 162 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.036 0.959 0.001 0.001 0.001 163 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.995 0.001 0.001 0.001 164 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.995 0.001 0.001 0.001 165 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 166 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.001 0.001 167 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.992 0.002 0.002 0.001 168 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.979 0.004 0.005 0.008 169 K 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.528 0.308 0.013 0.128 170 L 0.005 0.003 0.103 0.002 0.001 0.002 0.023 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.645 0.005 0.188 0.018 171 D 0.005 0.015 0.052 0.006 0.001 0.037 0.011 0.001 0.001 0.002 0.012 0.012 0.687 0.008 0.006 0.144 172 I 0.088 0.043 0.033 0.040 0.001 0.026 0.010 0.002 0.001 0.001 0.125 0.044 0.539 0.014 0.010 0.022 173 Q 0.009 0.041 0.154 0.033 0.003 0.040 0.037 0.003 0.002 0.001 0.038 0.130 0.458 0.018 0.018 0.017 174 R 0.009 0.050 0.090 0.081 0.003 0.035 0.022 0.007 0.003 0.001 0.051 0.026 0.538 0.009 0.027 0.049 175 L 0.022 0.122 0.197 0.183 0.005 0.021 0.045 0.003 0.009 0.003 0.017 0.050 0.184 0.029 0.013 0.097 176 T 0.017 0.012 0.103 0.034 0.012 0.415 0.068 0.006 0.001 0.003 0.014 0.028 0.254 0.005 0.018 0.009 177 E 0.006 0.106 0.047 0.031 0.004 0.043 0.010 0.020 0.005 0.002 0.517 0.018 0.135 0.013 0.009 0.033 178 R 0.035 0.226 0.046 0.147 0.002 0.012 0.008 0.006 0.027 0.004 0.013 0.349 0.060 0.011 0.023 0.031 179 T 0.042 0.013 0.290 0.041 0.002 0.104 0.032 0.003 0.005 0.005 0.016 0.026 0.338 0.003 0.021 0.058 180 I 0.025 0.038 0.165 0.039 0.005 0.108 0.019 0.004 0.002 0.002 0.330 0.026 0.206 0.005 0.003 0.025 181 T 0.019 0.239 0.070 0.150 0.001 0.013 0.002 0.016 0.003 0.002 0.028 0.335 0.105 0.001 0.006 0.008 182 A 0.001 0.002 0.006 0.007 0.001 0.507 0.001 0.001 0.001 0.005 0.013 0.044 0.407 0.001 0.001 0.003 183 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.001 0.001 0.001 0.001 0.692 0.011 0.273 0.001 0.001 0.001 184 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.027 0.808 0.163 0.001 0.001 0.001 185 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.021 0.975 0.001 0.001 0.001 186 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 0.001 187 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 188 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 189 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 190 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 191 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 192 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.989 0.005 0.001 0.005 193 V 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.955 0.004 0.008 0.006 194 R 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.005 0.025 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.910 0.017 0.007 0.020 195 A 0.002 0.003 0.004 0.002 0.009 0.002 0.090 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.086 0.769 0.010 0.013 196 D 0.002 0.021 0.011 0.004 0.001 0.001 0.002 0.024 0.002 0.001 0.001 0.003 0.025 0.002 0.888 0.014 197 G 0.021 0.005 0.081 0.010 0.001 0.003 0.006 0.001 0.045 0.012 0.003 0.001 0.041 0.003 0.005 0.763 198 I 0.822 0.007 0.108 0.035 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.009 0.001 0.001 0.004 199 C 0.014 0.023 0.511 0.339 0.012 0.054 0.006 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.014 0.002 0.001 0.008 200 V 0.005 0.050 0.055 0.721 0.068 0.067 0.007 0.004 0.001 0.001 0.005 0.003 0.009 0.001 0.001 0.002 201 L 0.002 0.030 0.009 0.128 0.051 0.670 0.005 0.038 0.003 0.008 0.030 0.011 0.011 0.002 0.001 0.001 202 D 0.003 0.109 0.009 0.043 0.003 0.190 0.002 0.068 0.014 0.012 0.460 0.047 0.031 0.001 0.005 0.003 203 Q 0.016 0.088 0.019 0.049 0.001 0.013 0.002 0.004 0.046 0.007 0.145 0.548 0.044 0.002 0.003 0.013 204 E 0.089 0.027 0.259 0.072 0.007 0.029 0.024 0.003 0.006 0.001 0.028 0.147 0.245 0.007 0.015 0.041 205 L 0.010 0.028 0.406 0.051 0.006 0.048 0.010 0.006 0.001 0.001 0.033 0.024 0.344 0.001 0.006 0.024 206 E 0.007 0.015 0.017 0.018 0.336 0.062 0.234 0.002 0.002 0.002 0.017 0.013 0.061 0.211 0.001 0.005 207 A 0.003 0.020 0.013 0.028 0.001 0.009 0.002 0.551 0.001 0.001 0.030 0.009 0.049 0.001 0.283 0.001 208 G 0.001 0.038 0.012 0.024 0.001 0.005 0.001 0.001 0.416 0.051 0.003 0.015 0.030 0.001 0.001 0.402 209 L 0.813 0.002 0.026 0.038 0.001 0.031 0.004 0.001 0.001 0.001 0.008 0.008 0.065 0.001 0.001 0.002 210 R 0.001 0.380 0.534 0.050 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.012 0.001 0.001 0.002 211 S 0.005 0.003 0.024 0.857 0.006 0.049 0.001 0.002 0.001 0.001 0.022 0.001 0.022 0.003 0.001 0.003 212 M 0.004 0.060 0.553 0.314 0.003 0.014 0.001 0.008 0.001 0.001 0.008 0.004 0.026 0.001 0.003 0.002 213 A 0.001 0.011 0.019 0.942 0.001 0.005 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.002 0.008 0.001 0.001 0.004 214 A 0.014 0.007 0.086 0.839 0.011 0.024 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.003 215 P 0.003 0.021 0.059 0.852 0.008 0.042 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.005 0.001 0.001 0.002 216 I 0.003 0.030 0.010 0.444 0.273 0.197 0.011 0.003 0.002 0.003 0.013 0.004 0.003 0.004 0.001 0.001 217 R 0.003 0.216 0.018 0.418 0.017 0.054 0.002 0.209 0.003 0.001 0.033 0.009 0.005 0.001 0.008 0.001 218 G 0.003 0.031 0.012 0.039 0.071 0.472 0.006 0.018 0.078 0.137 0.042 0.052 0.024 0.002 0.002 0.012 219 A 0.021 0.018 0.007 0.004 0.127 0.006 0.123 0.008 0.001 0.002 0.474 0.013 0.009 0.183 0.002 0.002 220 S 0.001 0.015 0.007 0.004 0.001 0.003 0.001 0.163 0.002 0.001 0.003 0.043 0.003 0.001 0.752 0.001 221 G 0.004 0.004 0.013 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.243 0.009 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.718 222 L 0.925 0.005 0.038 0.028 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 223 T 0.004 0.004 0.744 0.088 0.001 0.153 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 224 V 0.001 0.142 0.028 0.748 0.002 0.040 0.001 0.003 0.001 0.001 0.028 0.003 0.004 0.001 0.001 0.001 225 A 0.001 0.022 0.010 0.949 0.001 0.005 0.001 0.002 0.001 0.001 0.004 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 226 A 0.002 0.002 0.079 0.864 0.018 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 227 V 0.002 0.028 0.075 0.846 0.005 0.020 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.003 0.014 0.001 0.001 0.001 228 N 0.001 0.011 0.004 0.743 0.015 0.202 0.001 0.002 0.001 0.003 0.005 0.001 0.009 0.001 0.001 0.002 229 I 0.009 0.085 0.011 0.518 0.032 0.208 0.003 0.012 0.001 0.001 0.081 0.008 0.026 0.001 0.001 0.002 230 S 0.002 0.283 0.046 0.564 0.005 0.018 0.002 0.007 0.008 0.003 0.008 0.034 0.011 0.001 0.002 0.007 231 T 0.027 0.029 0.081 0.536 0.024 0.170 0.012 0.005 0.006 0.008 0.011 0.013 0.059 0.002 0.003 0.014 232 P 0.014 0.091 0.085 0.100 0.017 0.388 0.010 0.018 0.002 0.003 0.143 0.019 0.096 0.005 0.003 0.005 233 A 0.007 0.197 0.028 0.166 0.011 0.093 0.012 0.018 0.011 0.003 0.217 0.144 0.063 0.015 0.010 0.008 234 A 0.022 0.077 0.089 0.180 0.004 0.031 0.018 0.017 0.015 0.004 0.058 0.247 0.165 0.004 0.039 0.030 235 R 0.037 0.072 0.246 0.131 0.003 0.027 0.016 0.002 0.017 0.003 0.013 0.018 0.133 0.007 0.009 0.266 236 Y 0.047 0.064 0.434 0.388 0.001 0.004 0.003 0.003 0.001 0.001 0.004 0.006 0.024 0.001 0.005 0.013 237 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 238 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 239 E 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.990 0.005 0.001 0.001 0.001 240 D 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.978 0.001 0.002 0.006 241 L 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.009 0.972 0.001 0.001 0.003 242 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.011 0.983 0.001 0.001 0.001 243 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.007 0.987 0.001 0.001 0.001 244 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.987 0.001 0.001 0.003 245 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.991 0.001 0.001 0.001 246 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 247 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.003 0.991 0.001 0.001 0.001 248 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.049 0.950 0.001 0.001 0.001 249 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 250 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 251 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 252 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.003 253 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.003 0.001 0.001 254 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.985 0.001 0.003 0.001 255 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.971 0.010 0.001 0.015 256 I 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.983 0.001 0.004 0.001 257 E 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.973 0.006 0.001 0.006 258 Q 0.002 0.002 0.004 0.003 0.001 0.002 0.005 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.948 0.007 0.010 0.008 259 D 0.002 0.006 0.019 0.004 0.001 0.006 0.042 0.001 0.001 0.001 0.005 0.006 0.566 0.216 0.017 0.108 260 L 0.008 0.015 0.134 0.012 0.001 0.006 0.049 0.005 0.001 0.001 0.011 0.006 0.515 0.012 0.183 0.043 261 A 0.017 0.047 0.167 0.042 0.002 0.020 0.030 0.003 0.009 0.006 0.010 0.020 0.362 0.016 0.015 0.234 262 T 0.155 0.041 0.124 0.064 0.019 0.066 0.090 0.005 0.004 0.003 0.038 0.019 0.259 0.050 0.012 0.052 263 V 0.017 0.176 0.277 0.115 0.011 0.043 0.027 0.033 0.004 0.002 0.067 0.033 0.114 0.014 0.042 0.024 264 N 0.013 0.046 0.087 0.096 0.069 0.235 0.079 0.014 0.020 0.023 0.042 0.088 0.124 0.022 0.014 0.029 265 R 0.040 0.113 0.075 0.083 0.033 0.052 0.038 0.068 0.009 0.006 0.255 0.050 0.109 0.020 0.031 0.020