# TARGET T0381 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0381.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1165 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.099 0.048 0.033 0.056 0.059 0.077 0.128 0.132 0.145 0.131 0.091 2 T 0.196 0.309 0.095 0.169 0.097 0.048 0.042 0.020 0.013 0.008 0.004 3 A 0.248 0.096 0.060 0.110 0.110 0.104 0.107 0.069 0.051 0.032 0.014 4 T 0.320 0.198 0.052 0.128 0.098 0.062 0.063 0.034 0.023 0.014 0.006 5 E 0.274 0.177 0.114 0.159 0.100 0.059 0.052 0.026 0.020 0.012 0.006 6 P 0.320 0.163 0.053 0.110 0.085 0.068 0.076 0.047 0.037 0.026 0.016 7 T 0.173 0.145 0.080 0.116 0.107 0.098 0.114 0.069 0.051 0.033 0.015 8 E 0.291 0.184 0.112 0.172 0.099 0.055 0.045 0.020 0.013 0.006 0.003 9 K 0.330 0.193 0.141 0.162 0.084 0.040 0.028 0.011 0.007 0.003 0.002 10 I 0.070 0.048 0.048 0.084 0.086 0.116 0.185 0.132 0.103 0.079 0.048 11 L 0.101 0.108 0.053 0.123 0.137 0.117 0.155 0.087 0.065 0.036 0.017 12 P 0.389 0.182 0.137 0.108 0.065 0.047 0.037 0.016 0.010 0.006 0.003 13 S 0.277 0.180 0.057 0.133 0.097 0.071 0.084 0.042 0.028 0.020 0.011 14 P 0.269 0.125 0.051 0.139 0.122 0.093 0.088 0.050 0.034 0.019 0.010 15 D 0.387 0.261 0.062 0.121 0.074 0.048 0.027 0.010 0.005 0.003 0.002 16 Y 0.028 0.067 0.054 0.181 0.186 0.178 0.158 0.077 0.043 0.020 0.008 17 V 0.056 0.020 0.015 0.031 0.049 0.090 0.189 0.172 0.190 0.121 0.068 18 Q 0.041 0.100 0.170 0.367 0.193 0.074 0.037 0.011 0.005 0.002 0.001 19 S 0.006 0.028 0.029 0.046 0.050 0.083 0.200 0.192 0.166 0.126 0.076 20 L 0.009 0.006 0.020 0.040 0.065 0.105 0.221 0.169 0.164 0.117 0.083 21 A 0.089 0.064 0.185 0.183 0.150 0.129 0.118 0.040 0.026 0.011 0.005 22 R 0.001 0.014 0.065 0.142 0.145 0.184 0.246 0.109 0.053 0.029 0.012 23 G 0.001 0.001 0.003 0.002 0.003 0.006 0.041 0.088 0.221 0.322 0.315 24 L 0.002 0.004 0.047 0.048 0.064 0.118 0.280 0.164 0.129 0.095 0.049 25 A 0.001 0.009 0.176 0.222 0.231 0.158 0.123 0.049 0.019 0.009 0.004 26 V 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.004 0.045 0.095 0.222 0.324 0.306 27 I 0.001 0.001 0.003 0.005 0.007 0.015 0.099 0.161 0.260 0.266 0.184 28 R 0.003 0.013 0.282 0.227 0.192 0.130 0.089 0.034 0.018 0.008 0.004 29 C 0.001 0.001 0.010 0.015 0.036 0.118 0.364 0.204 0.140 0.080 0.032 30 F 0.001 0.001 0.002 0.004 0.005 0.009 0.054 0.128 0.284 0.313 0.200 31 D 0.014 0.030 0.035 0.111 0.178 0.214 0.253 0.095 0.045 0.017 0.007 32 H 0.075 0.133 0.256 0.208 0.124 0.092 0.064 0.026 0.013 0.006 0.002 33 R 0.113 0.096 0.052 0.121 0.117 0.124 0.175 0.098 0.056 0.034 0.014 34 N 0.391 0.198 0.048 0.097 0.072 0.057 0.061 0.031 0.022 0.013 0.010 35 Q 0.249 0.208 0.097 0.152 0.103 0.069 0.060 0.030 0.018 0.010 0.003 36 R 0.404 0.145 0.049 0.126 0.088 0.073 0.066 0.024 0.014 0.007 0.004 37 R 0.057 0.063 0.040 0.099 0.115 0.127 0.197 0.139 0.091 0.049 0.024 38 T 0.014 0.148 0.045 0.159 0.149 0.147 0.126 0.081 0.062 0.042 0.025 39 L 0.003 0.004 0.006 0.015 0.033 0.079 0.184 0.193 0.214 0.155 0.115 40 S 0.135 0.070 0.083 0.201 0.205 0.151 0.100 0.032 0.015 0.005 0.002 41 D 0.005 0.029 0.079 0.358 0.250 0.138 0.092 0.030 0.012 0.004 0.003 42 V 0.001 0.002 0.013 0.009 0.008 0.008 0.034 0.093 0.206 0.288 0.337 43 A 0.001 0.001 0.016 0.012 0.026 0.064 0.230 0.202 0.208 0.139 0.102 44 R 0.003 0.011 0.535 0.272 0.109 0.045 0.017 0.005 0.002 0.001 0.001 45 A 0.001 0.004 0.018 0.025 0.085 0.223 0.425 0.126 0.057 0.024 0.012 46 T 0.006 0.003 0.004 0.005 0.004 0.009 0.051 0.106 0.214 0.282 0.316 47 D 0.706 0.147 0.038 0.048 0.025 0.016 0.011 0.003 0.002 0.002 0.001 48 L 0.024 0.041 0.053 0.087 0.095 0.112 0.175 0.154 0.127 0.084 0.049 49 T 0.149 0.381 0.066 0.102 0.079 0.065 0.068 0.036 0.023 0.018 0.012 50 R 0.092 0.093 0.066 0.147 0.168 0.172 0.144 0.048 0.037 0.019 0.014 51 A 0.248 0.078 0.052 0.072 0.069 0.091 0.150 0.083 0.074 0.048 0.035 52 T 0.008 0.033 0.053 0.210 0.205 0.191 0.170 0.070 0.035 0.015 0.009 53 A 0.002 0.001 0.005 0.003 0.004 0.006 0.057 0.125 0.234 0.306 0.257 54 R 0.003 0.005 0.052 0.164 0.220 0.270 0.163 0.061 0.035 0.018 0.008 55 R 0.002 0.015 0.240 0.165 0.141 0.125 0.166 0.075 0.043 0.021 0.007 56 F 0.001 0.001 0.005 0.005 0.007 0.019 0.114 0.166 0.231 0.256 0.196 57 L 0.001 0.001 0.005 0.003 0.004 0.010 0.098 0.136 0.224 0.294 0.224 58 L 0.002 0.009 0.323 0.192 0.157 0.115 0.090 0.050 0.034 0.019 0.009 59 T 0.001 0.006 0.045 0.064 0.096 0.174 0.346 0.148 0.076 0.033 0.010 60 L 0.001 0.001 0.015 0.005 0.003 0.003 0.023 0.076 0.231 0.340 0.304 61 V 0.001 0.002 0.017 0.050 0.102 0.176 0.338 0.157 0.093 0.046 0.019 62 E 0.004 0.019 0.340 0.169 0.150 0.122 0.120 0.044 0.023 0.007 0.003 63 L 0.002 0.008 0.013 0.062 0.092 0.198 0.302 0.161 0.090 0.055 0.017 64 G 0.224 0.150 0.055 0.114 0.074 0.068 0.109 0.085 0.067 0.038 0.015 65 Y 0.006 0.025 0.027 0.081 0.103 0.127 0.199 0.157 0.128 0.090 0.056 66 V 0.004 0.013 0.014 0.029 0.039 0.047 0.130 0.155 0.222 0.204 0.141 67 A 0.019 0.052 0.033 0.193 0.211 0.161 0.159 0.086 0.052 0.022 0.012 68 T 0.073 0.086 0.055 0.124 0.125 0.132 0.168 0.102 0.078 0.039 0.018 69 D 0.152 0.144 0.046 0.192 0.153 0.117 0.099 0.049 0.030 0.013 0.006 70 G 0.529 0.197 0.037 0.106 0.056 0.031 0.022 0.010 0.006 0.004 0.003 71 S 0.222 0.205 0.053 0.158 0.122 0.076 0.071 0.041 0.027 0.017 0.009 72 A 0.084 0.134 0.046 0.191 0.172 0.141 0.116 0.056 0.034 0.017 0.009 73 F 0.016 0.015 0.009 0.036 0.053 0.084 0.166 0.172 0.195 0.149 0.105 74 W 0.039 0.067 0.046 0.185 0.187 0.158 0.155 0.078 0.047 0.023 0.014 75 L 0.006 0.011 0.007 0.022 0.028 0.041 0.105 0.151 0.214 0.227 0.188 76 T 0.014 0.030 0.011 0.071 0.114 0.137 0.183 0.143 0.145 0.092 0.061 77 P 0.186 0.064 0.034 0.095 0.097 0.119 0.148 0.090 0.080 0.054 0.034 78 R 0.028 0.037 0.037 0.122 0.159 0.162 0.226 0.113 0.065 0.035 0.017 79 V 0.005 0.010 0.018 0.020 0.012 0.015 0.048 0.099 0.196 0.265 0.311 80 L 0.005 0.005 0.018 0.030 0.042 0.069 0.151 0.162 0.200 0.185 0.133 81 E 0.021 0.036 0.327 0.158 0.108 0.109 0.113 0.056 0.039 0.022 0.012 82 L 0.001 0.005 0.028 0.027 0.031 0.049 0.148 0.172 0.204 0.193 0.141 83 G 0.004 0.004 0.010 0.014 0.013 0.021 0.076 0.121 0.220 0.266 0.251 84 Y 0.015 0.018 0.084 0.100 0.122 0.152 0.205 0.106 0.096 0.061 0.041 85 S 0.019 0.041 0.274 0.135 0.126 0.116 0.124 0.063 0.052 0.030 0.021 86 Y 0.007 0.007 0.011 0.027 0.035 0.073 0.182 0.160 0.188 0.178 0.129 87 L 0.016 0.013 0.021 0.029 0.039 0.064 0.165 0.168 0.207 0.170 0.109 88 S 0.058 0.090 0.231 0.162 0.123 0.110 0.098 0.053 0.038 0.023 0.015 89 S 0.131 0.098 0.108 0.149 0.125 0.120 0.127 0.059 0.041 0.027 0.015 90 L 0.079 0.055 0.047 0.075 0.076 0.090 0.153 0.121 0.125 0.103 0.075 91 S 0.369 0.291 0.108 0.115 0.059 0.029 0.016 0.005 0.003 0.002 0.001 92 L 0.016 0.026 0.013 0.031 0.036 0.052 0.119 0.141 0.211 0.198 0.157 93 P 0.125 0.115 0.068 0.155 0.182 0.149 0.122 0.043 0.026 0.010 0.005 94 E 0.323 0.156 0.224 0.179 0.063 0.029 0.017 0.005 0.003 0.001 0.001 95 V 0.025 0.032 0.042 0.092 0.119 0.162 0.222 0.128 0.092 0.054 0.031 96 A 0.009 0.010 0.020 0.017 0.015 0.033 0.100 0.151 0.209 0.232 0.206 97 Q 0.010 0.045 0.109 0.184 0.221 0.198 0.152 0.047 0.022 0.009 0.004 98 P 0.250 0.120 0.438 0.111 0.040 0.020 0.012 0.004 0.002 0.001 0.001 99 H 0.004 0.013 0.014 0.062 0.103 0.171 0.326 0.145 0.087 0.053 0.023 100 L 0.001 0.001 0.008 0.005 0.006 0.016 0.092 0.131 0.234 0.250 0.257 101 E 0.015 0.023 0.287 0.312 0.200 0.105 0.043 0.010 0.004 0.001 0.001 102 K 0.007 0.034 0.459 0.238 0.144 0.078 0.031 0.005 0.002 0.001 0.001 103 L 0.001 0.001 0.008 0.005 0.009 0.022 0.130 0.180 0.251 0.229 0.164 104 S 0.002 0.002 0.014 0.024 0.055 0.115 0.334 0.197 0.148 0.076 0.035 105 H 0.016 0.033 0.783 0.117 0.035 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 106 K 0.006 0.033 0.095 0.113 0.180 0.246 0.228 0.058 0.025 0.012 0.004 107 V 0.009 0.010 0.009 0.009 0.009 0.013 0.061 0.116 0.218 0.267 0.278 108 H 0.268 0.163 0.094 0.142 0.127 0.092 0.060 0.023 0.015 0.009 0.007 109 E 0.064 0.065 0.145 0.127 0.129 0.129 0.166 0.080 0.053 0.029 0.014 110 S 0.021 0.022 0.023 0.050 0.056 0.073 0.154 0.166 0.168 0.146 0.120 111 S 0.006 0.004 0.006 0.011 0.013 0.030 0.104 0.124 0.208 0.230 0.265 112 S 0.009 0.014 0.026 0.050 0.057 0.096 0.164 0.151 0.172 0.150 0.111 113 V 0.002 0.004 0.007 0.014 0.016 0.032 0.092 0.142 0.210 0.243 0.236 114 S 0.003 0.004 0.006 0.017 0.024 0.036 0.104 0.152 0.213 0.220 0.219 115 I 0.004 0.008 0.008 0.037 0.043 0.063 0.140 0.155 0.193 0.179 0.168 116 L 0.004 0.009 0.015 0.048 0.081 0.115 0.179 0.162 0.173 0.120 0.095 117 D 0.064 0.129 0.093 0.231 0.163 0.127 0.103 0.044 0.026 0.013 0.007 118 G 0.402 0.198 0.079 0.156 0.080 0.042 0.026 0.008 0.004 0.002 0.001 119 A 0.110 0.114 0.049 0.160 0.125 0.108 0.128 0.081 0.061 0.039 0.025 120 D 0.040 0.143 0.060 0.238 0.212 0.154 0.097 0.031 0.015 0.007 0.004 121 I 0.001 0.003 0.002 0.012 0.023 0.046 0.129 0.172 0.225 0.201 0.186 122 V 0.003 0.006 0.006 0.034 0.060 0.106 0.211 0.193 0.176 0.127 0.077 123 Y 0.001 0.004 0.005 0.023 0.038 0.060 0.157 0.188 0.219 0.180 0.125 124 V 0.001 0.002 0.004 0.015 0.019 0.029 0.085 0.138 0.223 0.252 0.231 125 A 0.016 0.018 0.018 0.079 0.116 0.133 0.214 0.166 0.128 0.074 0.037 126 R 0.033 0.074 0.052 0.179 0.143 0.125 0.162 0.103 0.072 0.040 0.017 127 V 0.020 0.027 0.017 0.061 0.083 0.108 0.180 0.161 0.150 0.119 0.073 128 P 0.265 0.290 0.085 0.156 0.087 0.049 0.035 0.016 0.009 0.006 0.004 129 V 0.138 0.086 0.035 0.101 0.104 0.096 0.129 0.101 0.093 0.071 0.046 130 S 0.342 0.194 0.057 0.131 0.090 0.064 0.052 0.028 0.021 0.013 0.010 131 R 0.140 0.124 0.067 0.198 0.156 0.117 0.097 0.045 0.030 0.017 0.010 132 I 0.119 0.076 0.044 0.102 0.095 0.106 0.133 0.100 0.095 0.074 0.058 133 M 0.036 0.024 0.022 0.051 0.056 0.077 0.139 0.143 0.170 0.154 0.128 134 T 0.052 0.096 0.077 0.172 0.147 0.125 0.128 0.076 0.059 0.038 0.030 135 V 0.032 0.030 0.028 0.052 0.051 0.063 0.118 0.132 0.173 0.167 0.154 136 G 0.114 0.095 0.049 0.143 0.149 0.126 0.129 0.074 0.057 0.037 0.028 137 I 0.039 0.036 0.023 0.057 0.053 0.059 0.102 0.117 0.165 0.171 0.179 138 T 0.169 0.177 0.082 0.168 0.137 0.104 0.075 0.034 0.025 0.016 0.012 139 I 0.069 0.063 0.031 0.089 0.083 0.096 0.156 0.120 0.116 0.097 0.081 140 G 0.166 0.080 0.030 0.078 0.088 0.088 0.113 0.091 0.095 0.087 0.085 141 T 0.116 0.124 0.065 0.167 0.137 0.101 0.098 0.059 0.052 0.039 0.041 142 R 0.065 0.070 0.034 0.107 0.122 0.129 0.157 0.100 0.082 0.069 0.064 143 L 0.033 0.027 0.013 0.056 0.076 0.096 0.169 0.149 0.151 0.125 0.105 144 P 0.064 0.041 0.023 0.073 0.094 0.103 0.156 0.116 0.128 0.106 0.095 145 A 0.041 0.020 0.018 0.037 0.038 0.052 0.110 0.116 0.174 0.187 0.206 146 Y 0.031 0.021 0.018 0.047 0.056 0.091 0.197 0.156 0.157 0.128 0.099 147 A 0.026 0.024 0.027 0.043 0.037 0.054 0.126 0.140 0.172 0.183 0.167 148 T 0.030 0.025 0.035 0.050 0.051 0.066 0.129 0.130 0.169 0.163 0.152 149 S 0.019 0.013 0.027 0.032 0.032 0.046 0.120 0.130 0.191 0.203 0.187 150 M 0.005 0.009 0.018 0.026 0.031 0.044 0.114 0.137 0.205 0.220 0.192 151 G 0.008 0.008 0.024 0.028 0.033 0.051 0.137 0.160 0.212 0.190 0.149 152 R 0.007 0.008 0.033 0.038 0.052 0.085 0.196 0.172 0.171 0.137 0.102 153 V 0.003 0.003 0.028 0.010 0.008 0.013 0.052 0.109 0.208 0.274 0.293 154 L 0.001 0.002 0.016 0.011 0.011 0.018 0.069 0.126 0.227 0.255 0.264 155 L 0.001 0.001 0.014 0.010 0.014 0.027 0.117 0.149 0.250 0.238 0.178 156 A 0.001 0.003 0.016 0.018 0.024 0.047 0.182 0.174 0.238 0.184 0.114 157 G 0.018 0.021 0.029 0.058 0.081 0.118 0.293 0.156 0.129 0.067 0.030 158 L 0.001 0.004 0.003 0.011 0.024 0.048 0.137 0.193 0.200 0.218 0.160 159 P 0.046 0.646 0.096 0.120 0.050 0.023 0.011 0.004 0.002 0.001 0.001 160 D 0.567 0.167 0.044 0.117 0.071 0.023 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 161 D 0.957 0.032 0.005 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 162 E 0.010 0.022 0.037 0.147 0.150 0.226 0.248 0.083 0.049 0.019 0.009 163 L 0.001 0.001 0.006 0.006 0.012 0.051 0.232 0.243 0.219 0.150 0.079 164 D 0.002 0.008 0.445 0.246 0.145 0.103 0.038 0.009 0.003 0.001 0.001 165 A 0.005 0.025 0.647 0.171 0.087 0.042 0.016 0.004 0.002 0.001 0.001 166 Y 0.001 0.001 0.009 0.009 0.016 0.050 0.219 0.189 0.218 0.174 0.114 167 L 0.001 0.001 0.013 0.008 0.018 0.045 0.248 0.235 0.227 0.146 0.059 168 E 0.003 0.022 0.741 0.141 0.062 0.019 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 169 K 0.019 0.062 0.396 0.197 0.151 0.100 0.055 0.012 0.005 0.002 0.001 170 L 0.018 0.011 0.014 0.017 0.029 0.065 0.214 0.193 0.204 0.149 0.084 171 D 0.315 0.284 0.142 0.136 0.059 0.033 0.020 0.005 0.003 0.001 0.001 172 I 0.006 0.014 0.033 0.035 0.053 0.075 0.175 0.160 0.188 0.159 0.102 173 Q 0.218 0.209 0.167 0.203 0.101 0.050 0.031 0.010 0.006 0.003 0.002 174 R 0.194 0.136 0.112 0.164 0.127 0.101 0.094 0.035 0.021 0.010 0.007 175 L 0.008 0.013 0.013 0.032 0.050 0.102 0.188 0.164 0.171 0.141 0.118 176 T 0.040 0.057 0.038 0.084 0.107 0.128 0.186 0.133 0.111 0.070 0.045 177 E 0.546 0.135 0.142 0.102 0.039 0.018 0.011 0.004 0.002 0.001 0.001 178 R 0.077 0.089 0.065 0.146 0.156 0.144 0.158 0.072 0.051 0.028 0.014 179 T 0.019 0.023 0.011 0.031 0.033 0.053 0.123 0.145 0.202 0.204 0.156 180 I 0.036 0.022 0.026 0.070 0.104 0.161 0.233 0.127 0.119 0.065 0.037 181 T 0.040 0.094 0.138 0.117 0.125 0.124 0.151 0.091 0.066 0.036 0.018 182 A 0.015 0.195 0.064 0.173 0.109 0.123 0.126 0.083 0.053 0.037 0.021 183 R 0.017 0.017 0.020 0.078 0.168 0.200 0.236 0.121 0.085 0.039 0.020 184 D 0.781 0.091 0.091 0.027 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 185 E 0.002 0.016 0.067 0.281 0.251 0.195 0.136 0.036 0.012 0.003 0.001 186 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.051 0.124 0.232 0.298 0.287 187 K 0.001 0.003 0.075 0.189 0.255 0.281 0.151 0.032 0.011 0.003 0.001 188 A 0.009 0.025 0.802 0.124 0.030 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 189 A 0.001 0.001 0.002 0.006 0.017 0.099 0.436 0.223 0.124 0.065 0.029 190 I 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.007 0.097 0.182 0.277 0.265 0.168 191 L 0.001 0.007 0.525 0.222 0.137 0.071 0.027 0.006 0.002 0.001 0.001 192 A 0.002 0.018 0.401 0.234 0.188 0.106 0.040 0.008 0.002 0.001 0.001 193 V 0.001 0.001 0.004 0.002 0.003 0.010 0.087 0.139 0.267 0.265 0.221 194 R 0.001 0.002 0.012 0.034 0.065 0.119 0.317 0.205 0.135 0.076 0.035 195 A 0.009 0.034 0.690 0.131 0.077 0.033 0.017 0.005 0.002 0.001 0.001 196 D 0.014 0.053 0.103 0.187 0.190 0.204 0.171 0.051 0.018 0.008 0.002 197 G 0.181 0.094 0.042 0.067 0.063 0.077 0.140 0.121 0.108 0.075 0.032 198 I 0.013 0.042 0.034 0.098 0.113 0.136 0.219 0.128 0.101 0.069 0.046 199 C 0.009 0.007 0.013 0.014 0.019 0.029 0.112 0.155 0.229 0.233 0.179 200 V 0.012 0.040 0.035 0.143 0.176 0.172 0.177 0.106 0.072 0.042 0.026 201 L 0.037 0.139 0.062 0.116 0.109 0.108 0.138 0.107 0.090 0.060 0.033 202 D 0.197 0.105 0.072 0.186 0.175 0.121 0.076 0.032 0.022 0.010 0.005 203 Q 0.478 0.145 0.077 0.129 0.067 0.038 0.035 0.014 0.009 0.005 0.004 204 E 0.038 0.042 0.039 0.092 0.089 0.107 0.188 0.131 0.115 0.088 0.070 205 L 0.020 0.017 0.021 0.049 0.056 0.102 0.193 0.157 0.150 0.124 0.111 206 E 0.079 0.112 0.181 0.173 0.143 0.116 0.091 0.042 0.030 0.018 0.015 207 A 0.101 0.100 0.175 0.182 0.125 0.112 0.107 0.046 0.028 0.017 0.007 208 G 0.178 0.080 0.048 0.116 0.122 0.101 0.115 0.070 0.070 0.056 0.044 209 L 0.002 0.004 0.005 0.011 0.015 0.024 0.088 0.146 0.224 0.242 0.238 210 R 0.002 0.007 0.016 0.051 0.104 0.170 0.247 0.174 0.120 0.064 0.045 211 S 0.001 0.001 0.003 0.003 0.004 0.011 0.062 0.131 0.229 0.256 0.297 212 M 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.046 0.124 0.217 0.298 0.299 213 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.010 0.044 0.091 0.212 0.266 0.368 214 A 0.001 0.001 0.002 0.005 0.006 0.016 0.059 0.120 0.221 0.286 0.283 215 P 0.001 0.002 0.002 0.010 0.019 0.035 0.124 0.210 0.221 0.201 0.176 216 I 0.002 0.004 0.004 0.012 0.016 0.027 0.075 0.118 0.192 0.248 0.302 217 R 0.008 0.014 0.012 0.067 0.116 0.150 0.196 0.148 0.132 0.086 0.072 218 G 0.083 0.082 0.035 0.144 0.126 0.135 0.141 0.094 0.076 0.049 0.035 219 A 0.157 0.081 0.039 0.099 0.095 0.105 0.131 0.086 0.081 0.072 0.054 220 S 0.238 0.200 0.057 0.144 0.101 0.072 0.079 0.038 0.031 0.022 0.017 221 G 0.138 0.110 0.037 0.143 0.143 0.129 0.110 0.062 0.053 0.040 0.035 222 L 0.012 0.036 0.022 0.098 0.164 0.181 0.219 0.109 0.080 0.047 0.031 223 T 0.002 0.003 0.003 0.016 0.031 0.053 0.152 0.173 0.201 0.192 0.174 224 V 0.001 0.001 0.002 0.009 0.020 0.041 0.122 0.180 0.227 0.217 0.180 225 A 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.015 0.088 0.165 0.234 0.243 0.242 226 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.029 0.087 0.189 0.301 0.385 227 V 0.001 0.001 0.002 0.003 0.003 0.006 0.035 0.095 0.203 0.309 0.345 228 N 0.001 0.001 0.003 0.005 0.007 0.016 0.070 0.153 0.244 0.256 0.245 229 I 0.001 0.002 0.005 0.005 0.006 0.013 0.065 0.123 0.225 0.289 0.265 230 S 0.001 0.003 0.006 0.015 0.021 0.032 0.098 0.160 0.234 0.220 0.210 231 T 0.006 0.010 0.007 0.020 0.029 0.055 0.136 0.166 0.215 0.196 0.159 232 P 0.024 0.028 0.027 0.082 0.124 0.142 0.190 0.141 0.125 0.074 0.042 233 A 0.044 0.040 0.028 0.093 0.122 0.122 0.174 0.125 0.124 0.079 0.051 234 A 0.090 0.047 0.030 0.101 0.104 0.122 0.165 0.120 0.105 0.074 0.042 235 R 0.020 0.024 0.022 0.069 0.076 0.106 0.207 0.156 0.159 0.099 0.061 236 Y 0.005 0.006 0.008 0.014 0.026 0.057 0.153 0.184 0.193 0.208 0.147 237 S 0.090 0.490 0.112 0.164 0.073 0.031 0.019 0.008 0.006 0.004 0.003 238 L 0.105 0.073 0.046 0.148 0.194 0.174 0.141 0.059 0.038 0.017 0.007 239 E 0.792 0.098 0.035 0.041 0.017 0.007 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 240 D 0.106 0.151 0.158 0.289 0.147 0.076 0.049 0.014 0.006 0.002 0.001 241 L 0.006 0.007 0.007 0.013 0.024 0.060 0.150 0.186 0.219 0.198 0.131 242 H 0.012 0.036 0.086 0.120 0.182 0.232 0.207 0.072 0.033 0.013 0.006 243 S 0.063 0.073 0.573 0.186 0.062 0.024 0.012 0.003 0.002 0.001 0.001 244 D 0.100 0.104 0.082 0.220 0.198 0.146 0.101 0.029 0.012 0.005 0.003 245 L 0.001 0.007 0.008 0.010 0.010 0.023 0.092 0.159 0.245 0.243 0.203 246 I 0.002 0.006 0.013 0.039 0.129 0.253 0.313 0.125 0.069 0.031 0.020 247 P 0.390 0.117 0.412 0.063 0.013 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 248 S 0.002 0.011 0.014 0.097 0.186 0.260 0.295 0.090 0.031 0.012 0.004 249 L 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.003 0.020 0.066 0.196 0.291 0.420 250 R 0.003 0.006 0.065 0.192 0.270 0.287 0.137 0.026 0.009 0.003 0.001 251 V 0.010 0.030 0.745 0.140 0.046 0.019 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 252 T 0.001 0.001 0.004 0.006 0.011 0.052 0.289 0.220 0.177 0.146 0.094 253 A 0.001 0.001 0.004 0.001 0.003 0.010 0.114 0.179 0.243 0.249 0.197 254 T 0.001 0.008 0.584 0.232 0.113 0.043 0.014 0.003 0.001 0.001 0.001 255 D 0.002 0.014 0.187 0.183 0.261 0.228 0.100 0.017 0.005 0.002 0.001 256 I 0.001 0.001 0.009 0.002 0.002 0.005 0.039 0.079 0.240 0.314 0.309 257 E 0.002 0.002 0.023 0.026 0.069 0.149 0.441 0.169 0.081 0.028 0.010 258 Q 0.008 0.022 0.804 0.129 0.029 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 259 D 0.008 0.025 0.065 0.048 0.112 0.236 0.357 0.092 0.038 0.015 0.005 260 L 0.013 0.011 0.025 0.015 0.013 0.021 0.082 0.129 0.232 0.248 0.211 261 A 0.245 0.237 0.172 0.102 0.082 0.056 0.054 0.022 0.014 0.011 0.007 262 T 0.226 0.184 0.208 0.183 0.087 0.050 0.034 0.014 0.008 0.004 0.002 263 V 0.235 0.096 0.058 0.075 0.088 0.095 0.137 0.081 0.059 0.046 0.029 264 N 0.407 0.210 0.079 0.117 0.061 0.039 0.033 0.018 0.017 0.012 0.009 265 R 0.457 0.130 0.057 0.083 0.067 0.055 0.055 0.034 0.030 0.022 0.011