# TARGET T0381 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0381.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 95 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 2 T 0.077 0.055 0.006 0.041 0.004 0.021 0.797 3 A 0.078 0.014 0.020 0.068 0.183 0.106 0.531 4 T 0.079 0.017 0.030 0.091 0.171 0.142 0.470 5 E 0.061 0.013 0.026 0.111 0.240 0.063 0.487 6 P 0.036 0.008 0.028 0.110 0.119 0.053 0.645 7 T 0.039 0.031 0.054 0.129 0.131 0.068 0.547 8 E 0.030 0.011 0.197 0.199 0.102 0.171 0.289 9 K 0.018 0.017 0.247 0.146 0.084 0.196 0.291 10 I 0.016 0.018 0.224 0.127 0.131 0.097 0.387 11 L 0.010 0.012 0.163 0.138 0.189 0.160 0.328 12 P 0.006 0.009 0.064 0.162 0.232 0.155 0.372 13 S 0.003 0.004 0.031 0.142 0.149 0.074 0.597 14 P 0.001 0.001 0.053 0.636 0.056 0.193 0.061 15 D 0.001 0.002 0.043 0.732 0.025 0.167 0.030 16 Y 0.001 0.002 0.021 0.907 0.019 0.029 0.022 17 V 0.002 0.002 0.004 0.963 0.004 0.013 0.012 18 Q 0.002 0.001 0.005 0.961 0.005 0.018 0.009 19 S 0.002 0.001 0.004 0.967 0.005 0.017 0.004 20 L 0.001 0.001 0.005 0.963 0.006 0.016 0.008 21 A 0.001 0.001 0.004 0.975 0.003 0.012 0.005 22 R 0.001 0.001 0.003 0.919 0.003 0.071 0.004 23 G 0.002 0.001 0.002 0.901 0.007 0.079 0.009 24 L 0.010 0.002 0.003 0.943 0.007 0.009 0.024 25 A 0.007 0.001 0.006 0.964 0.008 0.006 0.009 26 V 0.011 0.001 0.018 0.949 0.002 0.014 0.005 27 I 0.009 0.001 0.065 0.882 0.005 0.030 0.008 28 R 0.013 0.001 0.036 0.878 0.010 0.058 0.005 29 C 0.011 0.001 0.045 0.806 0.021 0.093 0.022 30 F 0.020 0.023 0.031 0.477 0.206 0.118 0.124 31 D 0.017 0.009 0.035 0.076 0.163 0.135 0.566 32 H 0.009 0.007 0.101 0.105 0.137 0.504 0.138 33 R 0.007 0.006 0.149 0.094 0.180 0.423 0.142 34 N 0.008 0.008 0.073 0.033 0.383 0.075 0.420 35 Q 0.029 0.010 0.047 0.033 0.185 0.190 0.506 36 R 0.071 0.047 0.038 0.030 0.121 0.167 0.526 37 R 0.034 0.041 0.006 0.013 0.341 0.029 0.537 38 T 0.031 0.069 0.001 0.031 0.128 0.009 0.731 39 L 0.001 0.001 0.006 0.980 0.004 0.006 0.004 40 S 0.001 0.001 0.005 0.987 0.001 0.004 0.002 41 D 0.001 0.001 0.003 0.992 0.001 0.002 0.001 42 V 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 43 A 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.003 0.001 44 R 0.001 0.001 0.002 0.975 0.001 0.020 0.001 45 A 0.001 0.001 0.003 0.905 0.006 0.083 0.003 46 T 0.001 0.001 0.003 0.421 0.033 0.525 0.016 47 D 0.001 0.001 0.002 0.035 0.130 0.672 0.160 48 L 0.001 0.008 0.002 0.014 0.258 0.024 0.694 49 T 0.003 0.005 0.002 0.031 0.147 0.010 0.802 50 R 0.001 0.001 0.018 0.953 0.013 0.009 0.007 51 A 0.001 0.001 0.008 0.980 0.003 0.005 0.003 52 T 0.001 0.001 0.006 0.989 0.001 0.004 0.001 53 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 54 R 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 55 R 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 56 F 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 57 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 58 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 59 T 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 60 L 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 61 V 0.001 0.001 0.003 0.988 0.001 0.006 0.001 62 E 0.001 0.001 0.007 0.924 0.003 0.063 0.001 63 L 0.001 0.001 0.007 0.288 0.005 0.699 0.001 64 G 0.002 0.001 0.003 0.019 0.029 0.930 0.018 65 Y 0.152 0.020 0.007 0.016 0.061 0.039 0.704 66 V 0.684 0.054 0.009 0.012 0.025 0.013 0.203 67 A 0.606 0.013 0.022 0.013 0.044 0.053 0.249 68 T 0.306 0.011 0.026 0.018 0.120 0.348 0.171 69 D 0.128 0.005 0.011 0.007 0.312 0.410 0.128 70 G 0.083 0.007 0.022 0.003 0.341 0.370 0.173 71 S 0.080 0.006 0.029 0.004 0.218 0.492 0.171 72 A 0.588 0.018 0.018 0.001 0.113 0.092 0.170 73 F 0.846 0.021 0.002 0.001 0.014 0.005 0.111 74 W 0.849 0.011 0.002 0.001 0.017 0.006 0.115 75 L 0.772 0.030 0.001 0.002 0.034 0.003 0.158 76 T 0.260 0.007 0.001 0.002 0.034 0.004 0.693 77 P 0.069 0.003 0.065 0.249 0.191 0.246 0.178 78 R 0.058 0.004 0.082 0.372 0.201 0.216 0.067 79 V 0.156 0.018 0.082 0.619 0.021 0.041 0.062 80 L 0.149 0.003 0.024 0.754 0.011 0.022 0.038 81 E 0.194 0.011 0.026 0.645 0.017 0.061 0.046 82 L 0.077 0.007 0.033 0.666 0.040 0.113 0.064 83 G 0.045 0.005 0.014 0.704 0.069 0.088 0.075 84 Y 0.003 0.001 0.019 0.941 0.013 0.014 0.011 85 S 0.001 0.001 0.026 0.948 0.007 0.011 0.007 86 Y 0.001 0.001 0.028 0.949 0.003 0.014 0.004 87 L 0.001 0.001 0.032 0.924 0.004 0.032 0.006 88 S 0.001 0.001 0.021 0.788 0.018 0.162 0.009 89 S 0.003 0.001 0.018 0.467 0.067 0.386 0.058 90 L 0.002 0.009 0.006 0.052 0.010 0.125 0.796 91 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999