# TARGET T0380 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0380.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 104 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 2 I 0.007 0.014 0.011 0.110 0.003 0.034 0.821 3 D 0.003 0.003 0.016 0.242 0.120 0.051 0.564 4 E 0.002 0.002 0.027 0.700 0.068 0.085 0.117 5 K 0.003 0.002 0.021 0.796 0.043 0.060 0.075 6 F 0.002 0.001 0.014 0.873 0.017 0.034 0.058 7 L 0.003 0.001 0.003 0.950 0.011 0.013 0.018 8 I 0.003 0.001 0.001 0.971 0.006 0.008 0.010 9 E 0.001 0.001 0.002 0.974 0.003 0.011 0.007 10 S 0.002 0.001 0.002 0.976 0.003 0.010 0.007 11 N 0.001 0.001 0.005 0.980 0.002 0.010 0.002 12 E 0.001 0.001 0.005 0.966 0.002 0.024 0.002 13 L 0.001 0.001 0.011 0.936 0.003 0.045 0.004 14 V 0.002 0.003 0.032 0.842 0.017 0.081 0.023 15 E 0.005 0.001 0.053 0.486 0.035 0.397 0.023 16 S 0.012 0.005 0.035 0.138 0.126 0.551 0.132 17 S 0.021 0.003 0.002 0.007 0.211 0.023 0.732 18 K 0.074 0.001 0.001 0.001 0.711 0.019 0.193 19 I 0.936 0.010 0.001 0.001 0.016 0.003 0.033 20 V 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 21 M 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 22 V 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 23 G 0.942 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.048 24 T 0.857 0.003 0.001 0.001 0.025 0.001 0.113 25 N 0.727 0.087 0.001 0.001 0.030 0.003 0.150 26 G 0.285 0.020 0.006 0.001 0.027 0.025 0.637 27 E 0.059 0.008 0.010 0.001 0.131 0.704 0.087 28 N 0.007 0.004 0.008 0.001 0.186 0.774 0.021 29 G 0.013 0.003 0.002 0.001 0.802 0.081 0.098 30 Y 0.086 0.053 0.002 0.001 0.090 0.016 0.752 31 P 0.366 0.228 0.008 0.003 0.063 0.041 0.292 32 N 0.369 0.026 0.022 0.010 0.130 0.065 0.378 33 I 0.451 0.028 0.023 0.016 0.132 0.028 0.322 34 K 0.470 0.027 0.016 0.039 0.073 0.020 0.355 35 A 0.531 0.014 0.029 0.038 0.037 0.024 0.327 36 M 0.710 0.021 0.037 0.031 0.028 0.023 0.150 37 M 0.726 0.011 0.047 0.022 0.044 0.022 0.129 38 R 0.660 0.009 0.071 0.023 0.040 0.029 0.168 39 L 0.668 0.019 0.037 0.020 0.057 0.019 0.180 40 K 0.671 0.014 0.024 0.014 0.036 0.015 0.226 41 H 0.561 0.022 0.027 0.018 0.053 0.032 0.287 42 D 0.295 0.019 0.060 0.030 0.114 0.188 0.295 43 G 0.123 0.007 0.050 0.016 0.204 0.437 0.163 44 L 0.051 0.004 0.035 0.006 0.214 0.613 0.078 45 K 0.067 0.002 0.013 0.001 0.308 0.511 0.097 46 K 0.606 0.008 0.003 0.001 0.061 0.035 0.287 47 F 0.942 0.006 0.001 0.001 0.003 0.001 0.048 48 W 0.978 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.018 49 L 0.970 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.024 50 S 0.883 0.005 0.001 0.001 0.013 0.002 0.095 51 T 0.533 0.016 0.002 0.001 0.071 0.016 0.361 52 N 0.101 0.013 0.021 0.009 0.245 0.173 0.438 53 T 0.010 0.006 0.047 0.023 0.204 0.605 0.106 54 S 0.005 0.004 0.053 0.063 0.249 0.522 0.105 55 T 0.008 0.007 0.016 0.242 0.373 0.110 0.244 56 R 0.016 0.021 0.020 0.471 0.094 0.103 0.275 57 M 0.020 0.023 0.024 0.667 0.050 0.062 0.154 58 V 0.016 0.006 0.035 0.823 0.022 0.036 0.061 59 E 0.010 0.001 0.048 0.866 0.018 0.033 0.024 60 R 0.009 0.001 0.045 0.884 0.011 0.028 0.022 61 L 0.006 0.004 0.071 0.868 0.009 0.021 0.022 62 K 0.010 0.001 0.058 0.793 0.016 0.106 0.016 63 K 0.006 0.002 0.046 0.481 0.025 0.418 0.022 64 N 0.012 0.004 0.013 0.046 0.282 0.089 0.554 65 N 0.027 0.003 0.008 0.007 0.342 0.147 0.466 66 K 0.221 0.005 0.010 0.003 0.388 0.171 0.203 67 I 0.816 0.012 0.002 0.001 0.014 0.004 0.152 68 C 0.971 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.023 69 L 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 70 Y 0.957 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.038 71 F 0.915 0.004 0.001 0.001 0.010 0.001 0.069 72 V 0.702 0.009 0.001 0.001 0.057 0.009 0.222 73 D 0.260 0.012 0.008 0.001 0.158 0.049 0.511 74 D 0.035 0.004 0.152 0.009 0.230 0.466 0.104 75 N 0.024 0.004 0.245 0.005 0.165 0.504 0.053 76 K 0.065 0.006 0.212 0.005 0.163 0.456 0.093 77 F 0.269 0.013 0.038 0.001 0.209 0.191 0.279 78 A 0.636 0.008 0.005 0.001 0.114 0.018 0.218 79 G 0.941 0.008 0.001 0.001 0.010 0.004 0.037 80 L 0.979 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.017 81 M 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.007 82 L 0.974 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 83 V 0.937 0.001 0.001 0.001 0.011 0.005 0.046 84 G 0.891 0.003 0.001 0.001 0.031 0.006 0.067 85 T 0.906 0.003 0.001 0.001 0.022 0.002 0.067 86 I 0.942 0.003 0.001 0.001 0.005 0.001 0.049 87 E 0.972 0.002 0.001 0.001 0.007 0.001 0.017 88 I 0.952 0.006 0.001 0.001 0.005 0.001 0.035 89 L 0.842 0.007 0.001 0.001 0.032 0.007 0.110 90 H 0.375 0.016 0.002 0.005 0.190 0.018 0.393 91 D 0.050 0.005 0.007 0.040 0.172 0.035 0.692 92 R 0.002 0.001 0.085 0.763 0.043 0.081 0.025 93 A 0.001 0.001 0.058 0.861 0.026 0.042 0.011 94 S 0.002 0.001 0.049 0.901 0.010 0.024 0.014 95 K 0.002 0.002 0.019 0.934 0.008 0.021 0.014 96 E 0.005 0.001 0.024 0.885 0.011 0.061 0.013 97 M 0.006 0.002 0.038 0.794 0.016 0.129 0.016 98 L 0.007 0.004 0.036 0.687 0.038 0.185 0.043 99 W 0.015 0.007 0.045 0.539 0.071 0.198 0.123 100 T 0.015 0.006 0.040 0.441 0.127 0.094 0.277 101 D 0.008 0.003 0.074 0.702 0.065 0.076 0.072 102 G 0.010 0.003 0.114 0.649 0.041 0.105 0.078 103 C 0.012 0.005 0.156 0.644 0.031 0.075 0.078 104 E 0.026 0.004 0.158 0.630 0.027 0.082 0.074 105 I 0.032 0.003 0.179 0.479 0.040 0.204 0.065 106 Y 0.045 0.017 0.140 0.435 0.077 0.195 0.090 107 Y 0.061 0.037 0.071 0.136 0.234 0.067 0.395 108 P 0.038 0.015 0.126 0.067 0.142 0.345 0.266 109 L 0.020 0.013 0.097 0.033 0.157 0.519 0.160 110 G 0.015 0.015 0.094 0.009 0.168 0.128 0.572 111 I 0.013 0.009 0.127 0.012 0.151 0.499 0.189 112 D 0.008 0.012 0.115 0.009 0.194 0.534 0.128 113 D 0.007 0.016 0.065 0.003 0.301 0.053 0.555 114 P 0.006 0.008 0.089 0.005 0.086 0.723 0.082 115 D 0.018 0.003 0.063 0.001 0.074 0.797 0.045 116 Y 0.425 0.048 0.029 0.002 0.065 0.021 0.410 117 T 0.847 0.016 0.002 0.001 0.010 0.003 0.122 118 A 0.953 0.003 0.001 0.001 0.006 0.003 0.034 119 L 0.976 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.018 120 C 0.967 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.026 121 F 0.917 0.006 0.001 0.001 0.009 0.001 0.067 122 T 0.528 0.006 0.001 0.001 0.012 0.002 0.451 123 A 0.088 0.003 0.229 0.034 0.108 0.465 0.073 124 E 0.047 0.003 0.247 0.029 0.166 0.477 0.030 125 W 0.176 0.009 0.314 0.038 0.114 0.200 0.149 126 G 0.569 0.012 0.019 0.023 0.042 0.043 0.293 127 N 0.854 0.013 0.007 0.013 0.027 0.020 0.066 128 Y 0.919 0.009 0.004 0.009 0.011 0.008 0.040 129 Y 0.829 0.010 0.008 0.019 0.025 0.017 0.091 130 R 0.603 0.016 0.009 0.021 0.114 0.040 0.197 131 H 0.186 0.005 0.010 0.023 0.270 0.144 0.363 132 L 0.052 0.004 0.015 0.028 0.334 0.286 0.282 133 K 0.037 0.004 0.048 0.131 0.275 0.320 0.184 134 N 0.120 0.011 0.043 0.230 0.189 0.165 0.243 135 I 0.279 0.018 0.030 0.436 0.054 0.043 0.140 136 T 0.369 0.017 0.010 0.473 0.022 0.016 0.094 137 F 0.390 0.010 0.011 0.506 0.013 0.013 0.057 138 K 0.345 0.007 0.012 0.560 0.015 0.020 0.040 139 I 0.220 0.002 0.021 0.697 0.014 0.017 0.030 140 D 0.204 0.002 0.027 0.702 0.021 0.017 0.026 141 E 0.252 0.001 0.037 0.624 0.025 0.030 0.031 142 I 0.212 0.007 0.056 0.554 0.040 0.079 0.051 143 Y 0.223 0.012 0.029 0.357 0.091 0.158 0.129 144 N 0.085 0.019 0.022 0.145 0.005 0.313 0.411 145 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997