# TARGET T0378 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-pb-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 16 (1 pb ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp7/T0378/T0378.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1350 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M N O P 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.047 0.026 0.087 0.105 0.017 0.357 0.025 0.007 0.010 0.019 0.044 0.066 0.158 0.005 0.006 0.022 2 L 0.022 0.071 0.055 0.055 0.015 0.076 0.010 0.021 0.002 0.003 0.413 0.077 0.160 0.005 0.006 0.010 3 S 0.011 0.052 0.027 0.031 0.019 0.079 0.020 0.021 0.010 0.008 0.069 0.428 0.145 0.055 0.012 0.014 4 A 0.009 0.011 0.035 0.013 0.001 0.058 0.009 0.017 0.003 0.005 0.119 0.080 0.520 0.003 0.105 0.012 5 N 0.007 0.014 0.018 0.008 0.001 0.015 0.001 0.003 0.006 0.007 0.192 0.149 0.534 0.001 0.004 0.042 6 Q 0.035 0.007 0.006 0.005 0.001 0.017 0.001 0.001 0.001 0.001 0.031 0.269 0.620 0.001 0.001 0.006 7 I 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.022 0.001 0.001 0.001 0.001 0.024 0.036 0.905 0.001 0.001 0.001 8 K 0.001 0.004 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.030 0.945 0.001 0.001 0.001 9 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.026 0.966 0.001 0.001 0.001 10 L 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.989 0.001 0.001 0.001 11 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.987 0.001 0.001 0.002 12 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.976 0.009 0.001 0.005 13 L 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.006 0.003 0.945 0.012 0.010 0.009 14 R 0.001 0.003 0.009 0.002 0.001 0.002 0.007 0.001 0.001 0.001 0.003 0.010 0.920 0.009 0.015 0.018 15 E 0.005 0.002 0.013 0.003 0.001 0.007 0.012 0.001 0.001 0.001 0.007 0.007 0.854 0.033 0.013 0.039 16 R 0.008 0.009 0.027 0.005 0.001 0.014 0.014 0.004 0.001 0.001 0.052 0.017 0.766 0.018 0.038 0.026 17 K 0.010 0.020 0.040 0.009 0.001 0.012 0.011 0.004 0.002 0.001 0.051 0.054 0.690 0.014 0.023 0.058 18 Y 0.025 0.019 0.058 0.023 0.001 0.016 0.017 0.003 0.003 0.001 0.029 0.072 0.667 0.013 0.013 0.040 19 R 0.012 0.020 0.096 0.026 0.003 0.035 0.025 0.004 0.001 0.001 0.025 0.034 0.673 0.007 0.013 0.025 20 L 0.008 0.027 0.051 0.030 0.006 0.060 0.022 0.008 0.002 0.001 0.058 0.041 0.642 0.009 0.012 0.023 21 R 0.013 0.047 0.052 0.037 0.020 0.040 0.079 0.011 0.005 0.003 0.082 0.061 0.380 0.115 0.021 0.033 22 E 0.014 0.052 0.088 0.045 0.002 0.035 0.022 0.036 0.005 0.002 0.036 0.053 0.328 0.009 0.241 0.031 23 Q 0.023 0.097 0.147 0.056 0.001 0.021 0.009 0.003 0.035 0.007 0.016 0.023 0.183 0.005 0.016 0.359 24 A 0.293 0.054 0.301 0.166 0.001 0.014 0.006 0.002 0.004 0.001 0.013 0.017 0.086 0.003 0.006 0.033 25 F 0.018 0.027 0.641 0.141 0.002 0.062 0.004 0.002 0.001 0.001 0.007 0.009 0.074 0.001 0.003 0.008 26 A 0.010 0.047 0.160 0.482 0.012 0.077 0.004 0.004 0.001 0.001 0.069 0.010 0.107 0.003 0.002 0.011 27 V 0.007 0.036 0.070 0.517 0.071 0.093 0.015 0.007 0.001 0.001 0.048 0.040 0.083 0.007 0.002 0.005 28 E 0.004 0.106 0.086 0.567 0.003 0.039 0.002 0.050 0.003 0.003 0.014 0.024 0.076 0.001 0.010 0.011 29 G 0.006 0.009 0.020 0.090 0.008 0.527 0.003 0.003 0.007 0.035 0.077 0.031 0.175 0.001 0.001 0.009 30 P 0.009 0.025 0.007 0.011 0.001 0.106 0.001 0.002 0.001 0.001 0.559 0.066 0.213 0.001 0.001 0.001 31 K 0.001 0.018 0.001 0.011 0.001 0.016 0.001 0.001 0.001 0.001 0.068 0.693 0.191 0.001 0.001 0.001 32 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.027 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.127 0.832 0.001 0.001 0.001 33 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.009 0.980 0.001 0.001 0.001 34 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 0.983 0.001 0.001 0.001 35 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.991 0.003 0.001 0.003 36 M 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.933 0.017 0.010 0.024 37 L 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.026 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.933 0.013 0.006 0.011 38 P 0.004 0.005 0.012 0.001 0.001 0.004 0.024 0.003 0.001 0.001 0.013 0.003 0.775 0.071 0.022 0.062 39 F 0.022 0.119 0.052 0.012 0.001 0.003 0.026 0.003 0.009 0.001 0.009 0.014 0.283 0.051 0.126 0.269 40 Y 0.056 0.011 0.448 0.014 0.001 0.017 0.044 0.002 0.001 0.002 0.008 0.010 0.269 0.003 0.039 0.075 41 R 0.051 0.185 0.299 0.053 0.001 0.078 0.008 0.004 0.003 0.002 0.056 0.020 0.177 0.002 0.004 0.056 42 C 0.034 0.020 0.039 0.098 0.001 0.414 0.002 0.003 0.003 0.001 0.162 0.066 0.151 0.001 0.002 0.004 43 R 0.002 0.690 0.081 0.058 0.001 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.111 0.042 0.001 0.001 0.002 44 M 0.003 0.003 0.046 0.797 0.001 0.013 0.001 0.002 0.001 0.001 0.024 0.003 0.101 0.001 0.002 0.004 45 L 0.003 0.007 0.670 0.157 0.005 0.015 0.006 0.001 0.001 0.001 0.006 0.005 0.120 0.001 0.001 0.004 46 V 0.002 0.022 0.019 0.888 0.002 0.012 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.003 0.045 0.001 0.001 0.002 47 G 0.002 0.016 0.021 0.674 0.013 0.192 0.002 0.002 0.001 0.002 0.004 0.004 0.062 0.001 0.001 0.004 48 T 0.002 0.010 0.005 0.040 0.020 0.750 0.002 0.008 0.001 0.002 0.078 0.007 0.072 0.002 0.001 0.001 49 A 0.001 0.026 0.001 0.012 0.001 0.024 0.001 0.015 0.001 0.001 0.797 0.060 0.058 0.001 0.001 0.001 50 A 0.001 0.024 0.002 0.011 0.001 0.008 0.002 0.001 0.004 0.001 0.015 0.668 0.255 0.001 0.002 0.005 51 M 0.005 0.002 0.017 0.007 0.001 0.008 0.011 0.001 0.001 0.001 0.012 0.024 0.880 0.008 0.006 0.016 52 L 0.002 0.006 0.051 0.008 0.001 0.014 0.015 0.003 0.001 0.001 0.019 0.021 0.817 0.012 0.018 0.011 53 R 0.004 0.009 0.015 0.020 0.001 0.014 0.008 0.003 0.002 0.001 0.019 0.025 0.820 0.011 0.018 0.030 54 A 0.019 0.011 0.027 0.022 0.002 0.013 0.027 0.002 0.004 0.001 0.026 0.029 0.678 0.048 0.013 0.078 55 V 0.020 0.042 0.169 0.038 0.001 0.013 0.038 0.005 0.002 0.001 0.020 0.025 0.494 0.019 0.045 0.071 56 S 0.014 0.069 0.410 0.142 0.001 0.009 0.017 0.003 0.003 0.001 0.004 0.010 0.169 0.005 0.018 0.124 57 T 0.059 0.014 0.182 0.081 0.023 0.306 0.031 0.005 0.002 0.007 0.017 0.010 0.227 0.005 0.006 0.025 58 P 0.014 0.076 0.052 0.023 0.049 0.156 0.057 0.016 0.001 0.002 0.384 0.010 0.059 0.090 0.004 0.007 59 H 0.008 0.272 0.021 0.068 0.002 0.029 0.011 0.123 0.010 0.002 0.057 0.188 0.028 0.003 0.173 0.005 60 D 0.016 0.099 0.115 0.073 0.001 0.002 0.003 0.001 0.202 0.004 0.001 0.007 0.015 0.001 0.006 0.456 61 A 0.412 0.004 0.397 0.168 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.009 62 E 0.009 0.011 0.746 0.218 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 63 V 0.001 0.009 0.012 0.935 0.002 0.030 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 64 V 0.001 0.017 0.026 0.947 0.002 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 65 E 0.002 0.010 0.023 0.926 0.005 0.025 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 66 L 0.005 0.032 0.058 0.876 0.006 0.016 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 67 P 0.001 0.003 0.001 0.022 0.004 0.965 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 68 E 0.001 0.034 0.001 0.011 0.001 0.018 0.001 0.006 0.001 0.001 0.923 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 69 S 0.003 0.079 0.003 0.021 0.003 0.020 0.002 0.001 0.012 0.001 0.014 0.831 0.006 0.002 0.001 0.001 70 F 0.013 0.030 0.259 0.063 0.001 0.020 0.010 0.024 0.002 0.002 0.100 0.050 0.357 0.001 0.048 0.019 71 D 0.006 0.029 0.054 0.037 0.002 0.221 0.006 0.006 0.009 0.007 0.038 0.141 0.399 0.004 0.003 0.037 72 F 0.012 0.007 0.010 0.017 0.001 0.065 0.007 0.003 0.001 0.001 0.200 0.037 0.628 0.005 0.003 0.003 73 K 0.002 0.076 0.045 0.050 0.001 0.007 0.011 0.003 0.003 0.001 0.018 0.294 0.458 0.005 0.016 0.012 74 R 0.009 0.005 0.035 0.080 0.002 0.011 0.011 0.002 0.004 0.001 0.008 0.008 0.688 0.018 0.013 0.103 75 I 0.013 0.024 0.546 0.067 0.004 0.008 0.052 0.001 0.001 0.001 0.006 0.005 0.188 0.020 0.011 0.053 76 S 0.018 0.032 0.191 0.128 0.018 0.165 0.078 0.018 0.002 0.005 0.009 0.014 0.244 0.020 0.025 0.033 77 T 0.021 0.102 0.081 0.122 0.009 0.163 0.020 0.035 0.013 0.010 0.164 0.015 0.171 0.011 0.016 0.048 78 Q 0.053 0.217 0.051 0.126 0.007 0.063 0.013 0.012 0.033 0.008 0.114 0.135 0.100 0.009 0.010 0.048 79 T 0.063 0.115 0.374 0.123 0.010 0.023 0.038 0.007 0.007 0.003 0.036 0.065 0.074 0.012 0.014 0.036 80 T 0.024 0.035 0.237 0.099 0.022 0.285 0.059 0.020 0.004 0.007 0.031 0.042 0.101 0.005 0.016 0.013 81 P 0.016 0.384 0.122 0.175 0.004 0.047 0.010 0.028 0.018 0.004 0.086 0.017 0.042 0.003 0.009 0.035 82 Q 0.039 0.097 0.103 0.672 0.001 0.009 0.001 0.003 0.022 0.002 0.005 0.020 0.008 0.001 0.003 0.015 83 P 0.044 0.018 0.560 0.341 0.001 0.018 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.005 0.001 0.001 0.006 84 L 0.009 0.025 0.177 0.722 0.001 0.047 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 85 M 0.001 0.030 0.044 0.916 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 86 A 0.001 0.001 0.017 0.974 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 87 V 0.001 0.007 0.038 0.937 0.008 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 88 F 0.001 0.005 0.007 0.937 0.008 0.039 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 89 D 0.001 0.098 0.014 0.820 0.008 0.048 0.001 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 90 L 0.006 0.031 0.011 0.776 0.024 0.127 0.002 0.004 0.002 0.003 0.010 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 91 P 0.006 0.199 0.048 0.346 0.016 0.271 0.003 0.025 0.005 0.005 0.055 0.015 0.004 0.001 0.002 0.002 92 A 0.010 0.216 0.031 0.438 0.011 0.075 0.004 0.010 0.021 0.008 0.115 0.041 0.009 0.002 0.001 0.008 93 E 0.036 0.108 0.142 0.390 0.010 0.116 0.008 0.012 0.010 0.005 0.030 0.098 0.023 0.001 0.004 0.005 94 P 0.013 0.122 0.179 0.324 0.004 0.162 0.005 0.013 0.006 0.006 0.053 0.035 0.060 0.001 0.003 0.012 95 E 0.020 0.044 0.069 0.336 0.017 0.147 0.008 0.008 0.010 0.005 0.177 0.062 0.083 0.003 0.002 0.007 96 P 0.018 0.116 0.117 0.320 0.016 0.055 0.009 0.018 0.006 0.002 0.086 0.095 0.122 0.004 0.006 0.009 97 V 0.014 0.058 0.099 0.286 0.061 0.129 0.022 0.016 0.015 0.008 0.026 0.058 0.161 0.010 0.007 0.029 98 V 0.011 0.030 0.082 0.067 0.253 0.060 0.261 0.013 0.003 0.003 0.044 0.010 0.066 0.081 0.008 0.010 99 E 0.008 0.119 0.057 0.116 0.002 0.028 0.005 0.407 0.010 0.005 0.016 0.017 0.025 0.002 0.172 0.011 100 G 0.032 0.045 0.065 0.274 0.001 0.007 0.001 0.002 0.333 0.031 0.007 0.006 0.014 0.001 0.002 0.178 101 L 0.574 0.014 0.151 0.247 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.001 0.001 0.003 102 T 0.003 0.003 0.460 0.529 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 103 L 0.001 0.002 0.016 0.967 0.004 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 104 L 0.001 0.011 0.004 0.959 0.013 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 105 L 0.001 0.005 0.002 0.178 0.627 0.170 0.010 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 106 D 0.001 0.283 0.007 0.131 0.004 0.049 0.001 0.484 0.003 0.002 0.024 0.002 0.001 0.001 0.008 0.001 107 G 0.005 0.076 0.009 0.197 0.003 0.064 0.001 0.008 0.366 0.159 0.043 0.039 0.005 0.001 0.001 0.023 108 V 0.343 0.038 0.121 0.082 0.030 0.087 0.030 0.006 0.005 0.004 0.139 0.068 0.037 0.004 0.003 0.005 109 Q 0.008 0.263 0.257 0.220 0.005 0.029 0.004 0.036 0.004 0.002 0.030 0.091 0.032 0.002 0.010 0.008 110 D 0.009 0.016 0.028 0.090 0.204 0.288 0.091 0.004 0.020 0.029 0.024 0.057 0.093 0.027 0.003 0.015 111 P 0.015 0.078 0.072 0.042 0.016 0.044 0.023 0.107 0.003 0.002 0.366 0.031 0.142 0.007 0.044 0.007 112 G 0.007 0.036 0.030 0.042 0.002 0.025 0.002 0.025 0.067 0.091 0.030 0.458 0.132 0.001 0.011 0.042 113 N 0.078 0.004 0.012 0.009 0.013 0.119 0.015 0.002 0.005 0.015 0.110 0.096 0.496 0.010 0.001 0.014 114 V 0.005 0.006 0.012 0.003 0.001 0.017 0.001 0.012 0.001 0.001 0.307 0.138 0.490 0.001 0.007 0.001 115 G 0.001 0.002 0.002 0.003 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.037 0.439 0.506 0.001 0.001 0.002 116 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.026 0.961 0.001 0.001 0.001 117 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.977 0.001 0.001 0.001 118 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.992 0.001 0.001 0.001 119 R 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.992 0.001 0.001 0.001 120 T 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.983 0.001 0.001 0.004 121 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.988 0.001 0.001 0.001 122 D 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.982 0.001 0.001 0.002 123 W 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.988 0.001 0.001 124 F 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.988 0.001 125 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.983 126 I 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 127 R 0.001 0.924 0.071 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 128 H 0.001 0.001 0.010 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 129 V 0.001 0.001 0.949 0.049 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 130 W 0.001 0.001 0.006 0.986 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 131 L 0.001 0.003 0.003 0.931 0.021 0.040 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 132 G 0.001 0.010 0.001 0.203 0.697 0.061 0.008 0.001 0.001 0.006 0.006 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 133 T 0.002 0.126 0.002 0.164 0.012 0.101 0.001 0.549 0.004 0.001 0.017 0.009 0.001 0.001 0.009 0.001 134 G 0.002 0.082 0.013 0.091 0.005 0.051 0.003 0.015 0.218 0.366 0.105 0.024 0.005 0.001 0.001 0.020 135 S 0.286 0.120 0.033 0.071 0.008 0.137 0.009 0.010 0.010 0.004 0.059 0.221 0.022 0.001 0.006 0.003 136 A 0.015 0.126 0.337 0.094 0.002 0.058 0.009 0.012 0.006 0.005 0.142 0.088 0.070 0.005 0.011 0.019 137 D 0.015 0.029 0.052 0.075 0.004 0.255 0.010 0.004 0.006 0.006 0.043 0.374 0.111 0.002 0.008 0.007 138 V 0.015 0.065 0.049 0.040 0.003 0.056 0.007 0.004 0.003 0.002 0.357 0.047 0.312 0.003 0.002 0.035 139 F 0.014 0.126 0.106 0.115 0.001 0.009 0.004 0.004 0.002 0.001 0.017 0.430 0.145 0.002 0.006 0.017 140 S 0.002 0.001 0.017 0.003 0.001 0.498 0.002 0.001 0.001 0.002 0.006 0.016 0.449 0.001 0.001 0.002 141 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.882 0.004 0.108 0.001 0.001 0.001 142 K 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.942 0.051 0.001 0.001 0.001 143 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.990 0.001 0.001 0.001 144 V 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.982 0.001 0.001 0.001 145 Q 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.983 0.001 0.001 0.001 146 A 0.001 0.001 0.003 0.005 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.981 0.001 0.001 0.001 147 S 0.001 0.001 0.002 0.007 0.012 0.004 0.020 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.742 0.197 0.001 0.009 148 M 0.001 0.006 0.005 0.009 0.001 0.007 0.004 0.014 0.001 0.001 0.006 0.004 0.750 0.003 0.189 0.003 149 G 0.001 0.009 0.005 0.014 0.001 0.009 0.003 0.002 0.018 0.013 0.008 0.010 0.618 0.004 0.006 0.279 150 A 0.145 0.005 0.007 0.009 0.002 0.019 0.009 0.001 0.001 0.001 0.027 0.037 0.712 0.008 0.005 0.011 151 L 0.006 0.026 0.085 0.011 0.003 0.020 0.037 0.004 0.001 0.001 0.042 0.054 0.624 0.056 0.018 0.012 152 A 0.004 0.042 0.041 0.086 0.001 0.015 0.016 0.013 0.003 0.001 0.017 0.049 0.560 0.006 0.110 0.035 153 R 0.022 0.040 0.140 0.132 0.001 0.003 0.013 0.001 0.022 0.002 0.002 0.004 0.116 0.010 0.007 0.485 154 V 0.134 0.010 0.531 0.222 0.002 0.010 0.027 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.033 0.003 0.006 0.017 155 Q 0.014 0.040 0.416 0.245 0.005 0.217 0.008 0.004 0.001 0.002 0.005 0.002 0.027 0.001 0.002 0.010 156 P 0.014 0.099 0.028 0.676 0.005 0.044 0.002 0.003 0.004 0.001 0.099 0.006 0.011 0.002 0.001 0.006 157 T 0.015 0.136 0.112 0.640 0.008 0.023 0.004 0.002 0.004 0.001 0.005 0.038 0.007 0.001 0.001 0.004 158 P 0.010 0.038 0.197 0.538 0.012 0.136 0.006 0.007 0.002 0.003 0.012 0.007 0.021 0.001 0.002 0.008 159 L 0.011 0.070 0.046 0.144 0.052 0.524 0.011 0.008 0.004 0.005 0.085 0.013 0.019 0.002 0.001 0.005 160 K 0.013 0.407 0.047 0.276 0.002 0.017 0.001 0.043 0.004 0.004 0.108 0.056 0.014 0.001 0.005 0.003 161 N 0.002 0.005 0.005 0.016 0.001 0.758 0.001 0.001 0.004 0.018 0.010 0.135 0.042 0.001 0.001 0.002 162 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.001 0.001 0.001 0.001 0.887 0.009 0.081 0.001 0.001 0.001 163 V 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.024 0.908 0.063 0.001 0.001 0.001 164 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.025 0.970 0.001 0.001 0.001 165 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.994 0.001 0.001 0.001 166 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.994 0.001 0.001 0.001 167 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.996 0.001 0.001 0.001 168 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.973 0.012 0.001 0.013 169 F 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.960 0.003 0.013 0.005 170 R 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.978 0.002 0.002 0.008 171 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.989 0.001 0.001 172 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.992 0.001 173 G 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.975 174 I 0.994 0.001 0.003 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 175 P 0.001 0.019 0.931 0.046 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 176 V 0.001 0.001 0.006 0.981 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 177 Y 0.001 0.011 0.042 0.941 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 178 G 0.001 0.001 0.004 0.977 0.009 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 179 A 0.002 0.015 0.023 0.903 0.028 0.018 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 180 F 0.001 0.022 0.004 0.485 0.057 0.411 0.001 0.006 0.002 0.004 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 181 L 0.003 0.074 0.008 0.164 0.510 0.079 0.015 0.021 0.002 0.005 0.105 0.005 0.002 0.005 0.001 0.001 182 D 0.003 0.143 0.009 0.084 0.011 0.177 0.002 0.401 0.009 0.007 0.032 0.081 0.005 0.001 0.033 0.001 183 G 0.006 0.038 0.021 0.051 0.007 0.063 0.007 0.022 0.164 0.126 0.339 0.040 0.040 0.004 0.009 0.066 184 Q 0.248 0.173 0.050 0.069 0.002 0.016 0.006 0.009 0.015 0.003 0.050 0.274 0.048 0.003 0.018 0.017 185 S 0.056 0.036 0.375 0.088 0.006 0.089 0.025 0.005 0.011 0.006 0.023 0.061 0.137 0.008 0.011 0.062 186 L 0.033 0.086 0.399 0.177 0.009 0.066 0.024 0.009 0.003 0.002 0.041 0.027 0.095 0.004 0.009 0.017 187 Y 0.017 0.090 0.112 0.227 0.010 0.260 0.013 0.018 0.009 0.007 0.036 0.054 0.116 0.004 0.007 0.022 188 E 0.022 0.109 0.145 0.342 0.007 0.053 0.012 0.010 0.010 0.004 0.100 0.039 0.113 0.005 0.006 0.022 189 A 0.033 0.053 0.139 0.275 0.018 0.146 0.029 0.010 0.010 0.005 0.034 0.087 0.124 0.010 0.009 0.019 190 P 0.026 0.162 0.273 0.275 0.005 0.022 0.018 0.017 0.007 0.003 0.041 0.020 0.063 0.007 0.015 0.045 191 L 0.035 0.038 0.222 0.482 0.011 0.058 0.018 0.005 0.014 0.005 0.009 0.021 0.041 0.003 0.006 0.032 192 P 0.057 0.064 0.337 0.347 0.021 0.039 0.028 0.009 0.002 0.005 0.024 0.007 0.034 0.004 0.004 0.018 193 N 0.026 0.097 0.061 0.391 0.024 0.262 0.008 0.028 0.010 0.009 0.020 0.026 0.021 0.003 0.005 0.009 194 F 0.020 0.054 0.061 0.195 0.023 0.281 0.011 0.030 0.016 0.013 0.227 0.019 0.035 0.002 0.004 0.008 195 T 0.013 0.612 0.055 0.184 0.001 0.019 0.002 0.008 0.010 0.002 0.016 0.059 0.008 0.001 0.003 0.007 196 E 0.040 0.038 0.207 0.524 0.003 0.092 0.004 0.003 0.018 0.003 0.013 0.011 0.019 0.001 0.002 0.023 197 P 0.016 0.136 0.564 0.247 0.001 0.020 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.001 0.001 0.002 198 A 0.003 0.076 0.094 0.816 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 199 I 0.001 0.001 0.116 0.878 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 200 L 0.001 0.001 0.058 0.932 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 201 V 0.001 0.001 0.002 0.751 0.231 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 202 L 0.001 0.029 0.002 0.699 0.070 0.097 0.001 0.098 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 203 G 0.001 0.110 0.004 0.467 0.017 0.106 0.001 0.032 0.100 0.129 0.023 0.004 0.002 0.001 0.001 0.004 204 S 0.080 0.067 0.011 0.133 0.215 0.248 0.021 0.010 0.017 0.029 0.090 0.066 0.005 0.004 0.001 0.002 205 E 0.007 0.126 0.055 0.065 0.027 0.104 0.006 0.184 0.003 0.002 0.250 0.102 0.026 0.005 0.037 0.002 206 G 0.003 0.064 0.022 0.040 0.112 0.036 0.136 0.009 0.067 0.034 0.043 0.144 0.025 0.218 0.012 0.036 207 R 0.076 0.042 0.039 0.065 0.001 0.007 0.009 0.111 0.010 0.004 0.025 0.060 0.056 0.001 0.478 0.017 208 G 0.017 0.017 0.125 0.021 0.001 0.026 0.004 0.001 0.095 0.053 0.008 0.013 0.033 0.001 0.001 0.585 209 I 0.496 0.081 0.183 0.172 0.001 0.005 0.001 0.002 0.001 0.001 0.012 0.023 0.020 0.001 0.001 0.003 210 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 211 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 212 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 0.001 0.001 213 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 214 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.993 0.001 0.001 0.001 215 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.989 0.002 0.001 0.003 216 E 0.002 0.001 0.005 0.002 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.793 0.075 0.011 0.100 217 I 0.002 0.001 0.037 0.001 0.001 0.004 0.042 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.821 0.027 0.034 0.027 218 T 0.006 0.078 0.086 0.007 0.001 0.014 0.043 0.003 0.001 0.001 0.007 0.009 0.567 0.021 0.063 0.096 219 D 0.078 0.059 0.058 0.076 0.001 0.018 0.008 0.005 0.010 0.002 0.054 0.010 0.294 0.031 0.049 0.249 220 R 0.066 0.061 0.687 0.039 0.001 0.003 0.013 0.001 0.003 0.001 0.002 0.007 0.043 0.005 0.007 0.063 221 L 0.020 0.014 0.607 0.288 0.001 0.013 0.010 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.026 0.001 0.002 0.013 222 T 0.005 0.026 0.231 0.718 0.002 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.005 223 I 0.006 0.006 0.034 0.796 0.063 0.079 0.006 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 224 P 0.002 0.046 0.015 0.218 0.137 0.502 0.003 0.027 0.001 0.002 0.038 0.003 0.005 0.001 0.001 0.001 225 A 0.001 0.077 0.003 0.071 0.449 0.063 0.020 0.036 0.014 0.013 0.202 0.029 0.004 0.018 0.001 0.001 226 S 0.006 0.101 0.014 0.050 0.008 0.042 0.004 0.429 0.021 0.009 0.035 0.132 0.012 0.002 0.132 0.002 227 G 0.011 0.023 0.042 0.026 0.012 0.040 0.019 0.015 0.249 0.151 0.101 0.046 0.067 0.011 0.012 0.176 228 L 0.404 0.049 0.062 0.061 0.008 0.016 0.017 0.031 0.016 0.005 0.088 0.126 0.060 0.008 0.031 0.017 229 S 0.035 0.063 0.348 0.096 0.009 0.068 0.013 0.014 0.025 0.013 0.017 0.089 0.129 0.004 0.023 0.054 230 V 0.043 0.017 0.090 0.058 0.258 0.050 0.225 0.005 0.005 0.008 0.035 0.014 0.057 0.108 0.003 0.026 231 K 0.020 0.094 0.136 0.115 0.008 0.030 0.011 0.307 0.005 0.002 0.022 0.029 0.042 0.004 0.169 0.006 232 G 0.010 0.031 0.064 0.152 0.003 0.043 0.006 0.011 0.210 0.174 0.031 0.024 0.059 0.002 0.004 0.176 233 H 0.492 0.065 0.074 0.182 0.003 0.022 0.005 0.002 0.006 0.003 0.025 0.054 0.053 0.001 0.002 0.010 234 T 0.022 0.021 0.241 0.140 0.018 0.303 0.013 0.005 0.002 0.003 0.047 0.064 0.107 0.003 0.002 0.007 235 E 0.006 0.215 0.110 0.268 0.006 0.060 0.003 0.014 0.003 0.002 0.079 0.084 0.139 0.001 0.005 0.007 236 S 0.007 0.016 0.015 0.101 0.010 0.250 0.005 0.002 0.007 0.010 0.052 0.144 0.368 0.001 0.001 0.009 237 L 0.007 0.012 0.034 0.020 0.001 0.046 0.001 0.003 0.001 0.001 0.219 0.105 0.550 0.001 0.001 0.001 238 N 0.001 0.002 0.002 0.004 0.001 0.031 0.001 0.001 0.001 0.001 0.090 0.344 0.524 0.001 0.001 0.001 239 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.068 0.072 0.856 0.001 0.001 0.001 240 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.061 0.937 0.001 0.001 0.001 241 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.992 0.001 0.001 0.001 242 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 243 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 244 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 245 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 246 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 247 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 248 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 249 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.990 0.003 0.001 0.003 250 W 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.971 0.009 0.003 0.008 251 R 0.001 0.003 0.019 0.004 0.001 0.001 0.025 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.799 0.063 0.027 0.054 252 R 0.009 0.009 0.076 0.020 0.002 0.005 0.037 0.003 0.002 0.001 0.002 0.003 0.539 0.033 0.068 0.194 253 R 0.040 0.019 0.177 0.037 0.011 0.025 0.110 0.005 0.005 0.009 0.016 0.005 0.277 0.067 0.020 0.178 254 S 0.045 0.104 0.087 0.037 0.022 0.170 0.113 0.018 0.003 0.004 0.058 0.043 0.206 0.028 0.037 0.024