# TARGET T0378 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-pb-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 16 (1 pb ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp7/T0378/T0378.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1385 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M N O P 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.040 0.055 0.102 0.164 0.009 0.052 0.027 0.003 0.010 0.004 0.047 0.079 0.333 0.011 0.005 0.060 2 L 0.027 0.042 0.140 0.160 0.026 0.084 0.037 0.010 0.002 0.002 0.030 0.080 0.322 0.011 0.012 0.015 3 S 0.007 0.040 0.072 0.044 0.044 0.153 0.048 0.034 0.004 0.010 0.064 0.042 0.331 0.062 0.018 0.027 4 A 0.009 0.022 0.018 0.025 0.003 0.091 0.007 0.037 0.006 0.009 0.251 0.083 0.360 0.005 0.060 0.012 5 N 0.010 0.019 0.015 0.010 0.001 0.019 0.001 0.005 0.010 0.010 0.216 0.226 0.421 0.001 0.006 0.029 6 Q 0.035 0.013 0.011 0.008 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 0.041 0.272 0.587 0.002 0.001 0.012 7 I 0.002 0.001 0.015 0.002 0.001 0.028 0.002 0.001 0.001 0.001 0.028 0.050 0.870 0.001 0.001 0.001 8 K 0.001 0.008 0.003 0.004 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.036 0.923 0.001 0.001 0.001 9 F 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.048 0.930 0.001 0.001 0.002 10 L 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.004 0.978 0.001 0.002 0.001 11 R 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.976 0.001 0.002 0.003 12 S 0.002 0.001 0.002 0.003 0.001 0.004 0.004 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.916 0.040 0.003 0.017 13 L 0.001 0.002 0.014 0.002 0.001 0.003 0.013 0.001 0.001 0.001 0.010 0.004 0.903 0.010 0.027 0.008 14 R 0.001 0.007 0.016 0.004 0.001 0.005 0.008 0.002 0.001 0.001 0.007 0.016 0.876 0.009 0.013 0.036 15 E 0.016 0.006 0.017 0.010 0.001 0.013 0.012 0.002 0.002 0.001 0.015 0.018 0.802 0.033 0.013 0.041 16 R 0.009 0.012 0.047 0.008 0.002 0.025 0.021 0.004 0.001 0.001 0.059 0.026 0.707 0.022 0.035 0.022 17 K 0.008 0.028 0.051 0.016 0.001 0.016 0.012 0.006 0.002 0.001 0.063 0.059 0.654 0.009 0.027 0.046 18 Y 0.029 0.028 0.064 0.043 0.002 0.019 0.018 0.003 0.007 0.002 0.030 0.083 0.586 0.015 0.011 0.061 19 R 0.019 0.022 0.133 0.041 0.004 0.043 0.031 0.005 0.001 0.001 0.024 0.032 0.596 0.008 0.015 0.024 20 L 0.008 0.031 0.067 0.036 0.009 0.091 0.024 0.011 0.002 0.002 0.066 0.038 0.569 0.009 0.012 0.025 21 R 0.015 0.060 0.045 0.044 0.025 0.047 0.073 0.014 0.007 0.003 0.113 0.068 0.325 0.111 0.019 0.031 22 E 0.016 0.060 0.082 0.050 0.002 0.039 0.022 0.042 0.007 0.003 0.040 0.070 0.289 0.009 0.238 0.030 23 Q 0.024 0.105 0.162 0.057 0.001 0.018 0.009 0.003 0.038 0.007 0.015 0.023 0.160 0.004 0.017 0.357 24 A 0.295 0.049 0.317 0.175 0.001 0.012 0.005 0.002 0.004 0.001 0.011 0.015 0.071 0.003 0.005 0.033 25 F 0.019 0.023 0.659 0.144 0.002 0.060 0.003 0.002 0.001 0.001 0.006 0.008 0.063 0.001 0.002 0.007 26 A 0.009 0.046 0.147 0.502 0.013 0.084 0.004 0.004 0.001 0.001 0.068 0.009 0.098 0.003 0.001 0.009 27 V 0.006 0.036 0.058 0.530 0.076 0.094 0.014 0.007 0.001 0.001 0.048 0.039 0.077 0.007 0.002 0.004 28 E 0.004 0.103 0.078 0.577 0.003 0.039 0.001 0.054 0.003 0.003 0.014 0.025 0.074 0.001 0.010 0.011 29 G 0.006 0.010 0.022 0.101 0.007 0.498 0.003 0.003 0.009 0.038 0.081 0.031 0.180 0.001 0.001 0.010 30 P 0.011 0.028 0.008 0.014 0.001 0.105 0.001 0.002 0.001 0.001 0.532 0.069 0.226 0.001 0.001 0.001 31 K 0.001 0.020 0.001 0.014 0.001 0.022 0.001 0.001 0.001 0.001 0.063 0.671 0.207 0.001 0.001 0.001 32 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.032 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.121 0.831 0.001 0.001 0.001 33 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.011 0.976 0.001 0.001 0.001 34 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.015 0.982 0.001 0.001 0.001 35 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.989 0.004 0.001 0.003 36 M 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.927 0.016 0.012 0.027 37 L 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.022 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.934 0.009 0.005 0.014 38 P 0.005 0.005 0.016 0.002 0.002 0.005 0.040 0.003 0.001 0.001 0.010 0.002 0.605 0.220 0.015 0.069 39 F 0.017 0.070 0.047 0.010 0.002 0.007 0.035 0.010 0.006 0.001 0.017 0.014 0.323 0.055 0.283 0.103 40 Y 0.032 0.021 0.230 0.010 0.001 0.024 0.060 0.005 0.004 0.005 0.029 0.019 0.355 0.009 0.051 0.145 41 R 0.120 0.221 0.168 0.051 0.001 0.032 0.008 0.007 0.006 0.003 0.065 0.049 0.177 0.004 0.012 0.076 42 C 0.062 0.024 0.123 0.097 0.001 0.311 0.005 0.003 0.008 0.002 0.075 0.074 0.197 0.002 0.003 0.012 43 R 0.005 0.650 0.142 0.077 0.001 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 0.004 0.058 0.049 0.001 0.001 0.002 44 M 0.003 0.004 0.049 0.866 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.003 0.040 0.001 0.001 0.003 45 L 0.004 0.006 0.639 0.244 0.006 0.015 0.004 0.001 0.001 0.001 0.006 0.003 0.068 0.001 0.001 0.003 46 V 0.001 0.019 0.020 0.918 0.002 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.023 0.001 0.001 0.002 47 G 0.002 0.013 0.016 0.739 0.014 0.169 0.001 0.002 0.001 0.002 0.003 0.003 0.033 0.001 0.001 0.003 48 T 0.002 0.012 0.005 0.044 0.023 0.783 0.002 0.009 0.001 0.002 0.066 0.006 0.044 0.001 0.001 0.001 49 A 0.001 0.027 0.001 0.015 0.001 0.030 0.001 0.017 0.001 0.001 0.813 0.055 0.036 0.001 0.001 0.001 50 A 0.001 0.030 0.003 0.016 0.001 0.010 0.002 0.001 0.005 0.001 0.021 0.722 0.181 0.001 0.002 0.005 51 M 0.006 0.004 0.021 0.010 0.001 0.012 0.010 0.001 0.001 0.001 0.015 0.034 0.860 0.006 0.006 0.015 52 L 0.002 0.007 0.055 0.010 0.001 0.019 0.013 0.003 0.001 0.001 0.020 0.023 0.810 0.009 0.015 0.012 53 R 0.004 0.010 0.014 0.021 0.001 0.015 0.007 0.002 0.001 0.001 0.027 0.026 0.838 0.005 0.011 0.020 54 A 0.021 0.019 0.035 0.033 0.002 0.013 0.023 0.002 0.004 0.001 0.023 0.038 0.620 0.059 0.009 0.098 55 V 0.015 0.030 0.179 0.042 0.002 0.020 0.040 0.003 0.002 0.001 0.014 0.022 0.532 0.014 0.043 0.042 56 S 0.008 0.076 0.367 0.111 0.002 0.014 0.019 0.003 0.003 0.001 0.008 0.010 0.261 0.004 0.014 0.099 57 T 0.070 0.020 0.125 0.125 0.021 0.218 0.029 0.006 0.003 0.006 0.029 0.019 0.287 0.008 0.006 0.029 58 P 0.020 0.123 0.102 0.048 0.081 0.082 0.087 0.015 0.003 0.002 0.185 0.013 0.070 0.147 0.008 0.014 59 H 0.011 0.142 0.048 0.126 0.004 0.046 0.021 0.186 0.008 0.003 0.043 0.091 0.043 0.005 0.215 0.008 60 D 0.015 0.156 0.137 0.131 0.001 0.004 0.003 0.003 0.183 0.008 0.003 0.007 0.017 0.001 0.006 0.327 61 A 0.478 0.005 0.179 0.312 0.001 0.005 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.004 0.001 0.001 0.009 62 E 0.011 0.025 0.724 0.222 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 63 V 0.001 0.007 0.013 0.938 0.002 0.027 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 64 V 0.001 0.019 0.049 0.920 0.003 0.003 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 65 E 0.002 0.010 0.020 0.927 0.006 0.027 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 66 L 0.004 0.033 0.051 0.884 0.006 0.015 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 67 P 0.001 0.003 0.001 0.017 0.003 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 68 E 0.001 0.024 0.001 0.008 0.001 0.014 0.001 0.004 0.001 0.001 0.944 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 69 S 0.002 0.054 0.002 0.013 0.002 0.017 0.001 0.001 0.008 0.001 0.013 0.877 0.006 0.002 0.001 0.001 70 F 0.009 0.024 0.197 0.044 0.001 0.016 0.009 0.025 0.002 0.002 0.104 0.054 0.441 0.001 0.054 0.017 71 D 0.004 0.021 0.039 0.026 0.002 0.168 0.006 0.005 0.008 0.006 0.032 0.146 0.491 0.004 0.004 0.038 72 F 0.010 0.004 0.008 0.011 0.001 0.044 0.006 0.002 0.001 0.001 0.157 0.031 0.713 0.006 0.003 0.003 73 K 0.002 0.049 0.035 0.033 0.001 0.006 0.010 0.003 0.002 0.001 0.019 0.250 0.557 0.005 0.017 0.012 74 R 0.008 0.004 0.030 0.055 0.001 0.008 0.011 0.002 0.004 0.001 0.006 0.008 0.709 0.022 0.013 0.118 75 I 0.013 0.022 0.529 0.056 0.003 0.007 0.058 0.001 0.001 0.001 0.005 0.005 0.207 0.021 0.014 0.057 76 S 0.016 0.029 0.211 0.096 0.013 0.165 0.078 0.016 0.002 0.004 0.008 0.011 0.269 0.018 0.026 0.037 77 T 0.023 0.104 0.079 0.107 0.007 0.152 0.020 0.030 0.011 0.009 0.188 0.016 0.179 0.012 0.014 0.050 78 Q 0.053 0.223 0.050 0.108 0.007 0.063 0.013 0.011 0.028 0.006 0.113 0.154 0.105 0.009 0.011 0.045 79 T 0.053 0.117 0.394 0.111 0.008 0.020 0.038 0.006 0.007 0.003 0.036 0.062 0.080 0.012 0.015 0.039 80 T 0.024 0.033 0.221 0.090 0.018 0.310 0.059 0.017 0.004 0.007 0.029 0.047 0.111 0.005 0.015 0.013 81 P 0.016 0.393 0.124 0.156 0.004 0.044 0.010 0.024 0.016 0.003 0.100 0.017 0.047 0.003 0.008 0.036 82 Q 0.041 0.096 0.109 0.659 0.001 0.010 0.002 0.003 0.020 0.002 0.005 0.027 0.010 0.001 0.003 0.014 83 P 0.038 0.019 0.578 0.320 0.001 0.021 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.008 0.001 0.001 0.007 84 L 0.009 0.026 0.155 0.715 0.001 0.066 0.001 0.002 0.001 0.001 0.020 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 85 M 0.001 0.047 0.049 0.889 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 86 A 0.001 0.002 0.018 0.969 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 87 V 0.002 0.009 0.050 0.911 0.010 0.012 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 88 F 0.001 0.011 0.011 0.882 0.013 0.073 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 89 D 0.001 0.165 0.019 0.757 0.006 0.036 0.001 0.005 0.002 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 90 L 0.008 0.028 0.022 0.758 0.018 0.132 0.002 0.005 0.003 0.005 0.010 0.004 0.003 0.001 0.001 0.001 91 P 0.011 0.184 0.096 0.332 0.019 0.233 0.005 0.017 0.004 0.005 0.066 0.013 0.009 0.001 0.002 0.003 92 A 0.011 0.232 0.033 0.503 0.007 0.059 0.003 0.010 0.010 0.005 0.063 0.045 0.009 0.001 0.001 0.006 93 E 0.023 0.074 0.105 0.353 0.012 0.252 0.008 0.010 0.010 0.006 0.030 0.074 0.031 0.001 0.004 0.006 94 P 0.015 0.135 0.165 0.348 0.005 0.083 0.006 0.013 0.006 0.004 0.123 0.026 0.056 0.001 0.003 0.013 95 E 0.023 0.075 0.083 0.530 0.007 0.056 0.005 0.006 0.012 0.004 0.040 0.101 0.046 0.002 0.002 0.007 96 P 0.019 0.046 0.139 0.383 0.018 0.132 0.012 0.009 0.005 0.003 0.048 0.032 0.134 0.003 0.004 0.012 97 V 0.012 0.080 0.107 0.300 0.056 0.141 0.014 0.016 0.006 0.004 0.070 0.042 0.129 0.004 0.004 0.015 98 V 0.007 0.033 0.033 0.071 0.389 0.049 0.187 0.009 0.003 0.003 0.023 0.017 0.032 0.133 0.003 0.006 99 E 0.005 0.056 0.035 0.087 0.001 0.018 0.004 0.460 0.005 0.003 0.012 0.007 0.018 0.001 0.282 0.006 100 G 0.015 0.040 0.053 0.155 0.001 0.005 0.001 0.002 0.413 0.040 0.006 0.004 0.010 0.001 0.002 0.255 101 L 0.772 0.006 0.069 0.144 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 102 T 0.003 0.004 0.549 0.438 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 103 L 0.001 0.002 0.014 0.971 0.003 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 104 L 0.001 0.010 0.006 0.960 0.012 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 105 L 0.001 0.005 0.002 0.187 0.624 0.164 0.009 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 106 D 0.001 0.281 0.007 0.144 0.004 0.050 0.001 0.472 0.003 0.002 0.024 0.002 0.001 0.001 0.008 0.001 107 G 0.004 0.077 0.008 0.210 0.004 0.073 0.001 0.008 0.351 0.155 0.043 0.039 0.005 0.001 0.001 0.020 108 V 0.325 0.040 0.122 0.088 0.032 0.091 0.029 0.007 0.005 0.004 0.143 0.070 0.033 0.003 0.003 0.005 109 Q 0.007 0.259 0.249 0.231 0.005 0.030 0.004 0.038 0.004 0.002 0.030 0.092 0.030 0.002 0.009 0.007 110 D 0.009 0.017 0.027 0.090 0.200 0.298 0.087 0.004 0.020 0.029 0.025 0.057 0.093 0.026 0.003 0.015 111 P 0.015 0.078 0.068 0.042 0.016 0.044 0.023 0.103 0.003 0.002 0.377 0.032 0.143 0.007 0.042 0.007 112 G 0.007 0.035 0.029 0.041 0.002 0.024 0.002 0.024 0.063 0.086 0.030 0.469 0.134 0.001 0.012 0.040 113 N 0.072 0.004 0.011 0.009 0.012 0.119 0.015 0.001 0.005 0.014 0.108 0.094 0.511 0.010 0.001 0.014 114 V 0.004 0.005 0.011 0.003 0.001 0.016 0.001 0.011 0.001 0.001 0.310 0.135 0.496 0.001 0.006 0.001 115 G 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.036 0.440 0.508 0.001 0.001 0.001 116 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.025 0.963 0.001 0.001 0.001 117 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.978 0.001 0.001 0.001 118 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.993 0.001 0.001 0.001 119 R 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.993 0.001 0.001 0.001 120 T 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.986 0.001 0.001 0.003 121 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.990 0.001 0.001 0.001 122 D 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.984 0.001 0.001 0.002 123 W 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.988 0.001 0.001 124 F 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.989 0.001 125 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.984 126 I 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 127 R 0.001 0.920 0.074 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 128 H 0.001 0.001 0.011 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 129 V 0.001 0.001 0.947 0.050 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 130 W 0.001 0.001 0.006 0.986 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 131 L 0.001 0.003 0.003 0.934 0.020 0.038 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 132 G 0.001 0.011 0.001 0.218 0.683 0.061 0.009 0.001 0.001 0.006 0.006 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 133 T 0.003 0.130 0.003 0.181 0.012 0.102 0.001 0.529 0.004 0.001 0.016 0.009 0.001 0.001 0.009 0.001 134 G 0.002 0.083 0.014 0.097 0.006 0.057 0.003 0.015 0.209 0.364 0.104 0.023 0.005 0.001 0.001 0.019 135 S 0.275 0.124 0.032 0.072 0.009 0.143 0.009 0.011 0.010 0.004 0.064 0.215 0.021 0.001 0.006 0.003 136 A 0.015 0.132 0.324 0.095 0.003 0.059 0.009 0.013 0.007 0.005 0.145 0.093 0.067 0.005 0.011 0.019 137 D 0.015 0.030 0.055 0.077 0.004 0.246 0.010 0.004 0.006 0.006 0.044 0.374 0.111 0.002 0.009 0.008 138 V 0.016 0.066 0.052 0.041 0.003 0.059 0.008 0.004 0.003 0.002 0.343 0.048 0.313 0.003 0.003 0.037 139 F 0.015 0.129 0.112 0.119 0.001 0.009 0.004 0.004 0.002 0.001 0.018 0.416 0.145 0.002 0.007 0.017 140 S 0.002 0.001 0.017 0.003 0.001 0.510 0.002 0.001 0.001 0.002 0.006 0.017 0.437 0.001 0.001 0.002 141 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.883 0.004 0.107 0.001 0.001 0.001 142 K 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.942 0.051 0.001 0.001 0.001 143 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.991 0.001 0.001 0.001 144 V 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.982 0.001 0.001 0.001 145 Q 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.984 0.001 0.001 0.001 146 A 0.001 0.001 0.003 0.005 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.981 0.001 0.001 0.002 147 S 0.001 0.001 0.002 0.007 0.012 0.004 0.021 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.721 0.217 0.001 0.009 148 M 0.001 0.006 0.005 0.009 0.001 0.007 0.004 0.015 0.001 0.001 0.006 0.004 0.728 0.004 0.208 0.003 149 G 0.002 0.009 0.005 0.014 0.001 0.009 0.003 0.002 0.020 0.014 0.008 0.010 0.591 0.005 0.006 0.302 150 A 0.166 0.005 0.008 0.010 0.002 0.020 0.011 0.001 0.001 0.001 0.028 0.038 0.683 0.009 0.006 0.012 151 L 0.006 0.030 0.095 0.012 0.004 0.021 0.039 0.005 0.001 0.001 0.044 0.055 0.595 0.059 0.020 0.014 152 A 0.005 0.044 0.045 0.095 0.002 0.016 0.017 0.016 0.004 0.001 0.019 0.051 0.526 0.007 0.114 0.038 153 R 0.025 0.043 0.151 0.140 0.001 0.004 0.014 0.001 0.024 0.002 0.002 0.005 0.107 0.011 0.008 0.463 154 V 0.134 0.011 0.525 0.235 0.002 0.009 0.024 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.029 0.003 0.007 0.017 155 Q 0.015 0.037 0.430 0.265 0.004 0.193 0.007 0.004 0.001 0.002 0.004 0.002 0.023 0.001 0.002 0.010 156 P 0.016 0.085 0.030 0.699 0.004 0.045 0.002 0.003 0.004 0.001 0.090 0.005 0.009 0.001 0.001 0.005 157 T 0.012 0.137 0.102 0.664 0.007 0.022 0.003 0.001 0.003 0.001 0.004 0.033 0.005 0.001 0.001 0.003 158 P 0.008 0.033 0.168 0.571 0.013 0.145 0.005 0.007 0.002 0.003 0.012 0.006 0.018 0.001 0.002 0.006 159 L 0.009 0.074 0.043 0.138 0.051 0.536 0.010 0.008 0.004 0.005 0.085 0.012 0.017 0.002 0.001 0.005 160 K 0.012 0.422 0.042 0.281 0.001 0.016 0.001 0.041 0.004 0.004 0.101 0.055 0.013 0.001 0.004 0.003 161 N 0.002 0.004 0.005 0.016 0.001 0.771 0.001 0.001 0.003 0.017 0.009 0.127 0.039 0.001 0.001 0.002 162 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.001 0.001 0.001 0.001 0.894 0.008 0.075 0.001 0.001 0.001 163 V 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.023 0.915 0.058 0.001 0.001 0.001 164 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.024 0.971 0.001 0.001 0.001 165 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.994 0.001 0.001 0.001 166 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.994 0.001 0.001 0.001 167 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.995 0.001 0.001 0.001 168 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.972 0.012 0.001 0.013 169 F 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.952 0.004 0.014 0.006 170 R 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.973 0.003 0.003 0.010 171 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.986 0.001 0.001 172 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.990 0.001 173 G 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.971 174 I 0.993 0.001 0.003 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 175 P 0.001 0.019 0.929 0.048 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 176 V 0.001 0.001 0.006 0.982 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 177 Y 0.001 0.012 0.044 0.939 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 178 G 0.001 0.001 0.004 0.978 0.008 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 179 A 0.002 0.015 0.024 0.901 0.029 0.019 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 180 F 0.001 0.022 0.004 0.497 0.061 0.394 0.001 0.006 0.002 0.004 0.003 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 181 L 0.003 0.074 0.008 0.163 0.505 0.087 0.017 0.022 0.002 0.005 0.101 0.005 0.002 0.006 0.001 0.001 182 D 0.003 0.151 0.009 0.088 0.009 0.165 0.002 0.402 0.010 0.007 0.033 0.078 0.005 0.001 0.036 0.001 183 G 0.006 0.040 0.023 0.056 0.006 0.058 0.006 0.018 0.180 0.127 0.311 0.041 0.039 0.003 0.007 0.078 184 Q 0.287 0.173 0.064 0.081 0.002 0.015 0.006 0.007 0.012 0.003 0.040 0.230 0.046 0.003 0.015 0.016 185 S 0.044 0.027 0.359 0.087 0.006 0.139 0.024 0.005 0.008 0.007 0.025 0.061 0.153 0.007 0.010 0.039 186 L 0.025 0.106 0.275 0.166 0.012 0.093 0.024 0.012 0.003 0.002 0.084 0.036 0.128 0.006 0.008 0.018 187 Y 0.016 0.107 0.087 0.250 0.007 0.171 0.010 0.020 0.011 0.006 0.042 0.094 0.145 0.005 0.009 0.021 188 E 0.021 0.065 0.163 0.267 0.011 0.063 0.021 0.008 0.011 0.006 0.081 0.050 0.190 0.009 0.007 0.028 189 A 0.033 0.053 0.131 0.215 0.017 0.125 0.031 0.015 0.007 0.004 0.052 0.074 0.194 0.013 0.014 0.022 190 P 0.022 0.160 0.220 0.238 0.006 0.027 0.020 0.019 0.012 0.004 0.049 0.032 0.094 0.013 0.019 0.065 191 L 0.049 0.043 0.225 0.343 0.019 0.077 0.036 0.006 0.014 0.006 0.014 0.032 0.081 0.007 0.012 0.037 192 P 0.055 0.077 0.323 0.223 0.025 0.059 0.042 0.018 0.003 0.006 0.048 0.012 0.067 0.008 0.008 0.027 193 N 0.035 0.157 0.077 0.331 0.018 0.159 0.010 0.037 0.018 0.011 0.031 0.044 0.035 0.005 0.011 0.019 194 F 0.039 0.049 0.099 0.189 0.019 0.268 0.017 0.026 0.021 0.016 0.149 0.027 0.055 0.003 0.007 0.015 195 T 0.017 0.589 0.100 0.184 0.001 0.016 0.002 0.007 0.008 0.001 0.013 0.039 0.010 0.001 0.004 0.009 196 E 0.039 0.030 0.186 0.591 0.002 0.082 0.003 0.002 0.013 0.002 0.009 0.008 0.014 0.001 0.001 0.018 197 P 0.014 0.116 0.560 0.279 0.001 0.019 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.001 0.001 0.001 198 A 0.002 0.056 0.072 0.861 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 199 I 0.001 0.001 0.092 0.903 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 200 L 0.001 0.001 0.049 0.941 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 201 V 0.001 0.001 0.001 0.739 0.243 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 202 L 0.001 0.029 0.002 0.691 0.069 0.099 0.001 0.105 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 203 G 0.001 0.111 0.004 0.464 0.017 0.100 0.001 0.032 0.104 0.133 0.024 0.004 0.002 0.001 0.001 0.004 204 S 0.081 0.065 0.011 0.131 0.218 0.253 0.021 0.010 0.017 0.029 0.087 0.066 0.005 0.004 0.001 0.002 205 E 0.007 0.123 0.054 0.062 0.027 0.106 0.006 0.186 0.003 0.002 0.257 0.099 0.025 0.005 0.037 0.002 206 G 0.003 0.067 0.021 0.041 0.109 0.034 0.131 0.009 0.070 0.034 0.043 0.148 0.024 0.217 0.012 0.036 207 R 0.078 0.041 0.040 0.066 0.001 0.006 0.010 0.107 0.010 0.004 0.024 0.059 0.056 0.001 0.480 0.018 208 G 0.018 0.017 0.131 0.021 0.001 0.026 0.004 0.001 0.091 0.052 0.008 0.012 0.033 0.001 0.001 0.585 209 I 0.495 0.083 0.182 0.174 0.001 0.005 0.001 0.002 0.001 0.001 0.012 0.022 0.019 0.001 0.001 0.003 210 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 211 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 212 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.002 0.001 0.001 0.001 213 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 214 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.993 0.001 0.001 0.001 215 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.989 0.001 0.001 0.003 216 E 0.001 0.001 0.005 0.002 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.799 0.074 0.011 0.096 217 I 0.002 0.001 0.036 0.001 0.001 0.004 0.041 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.822 0.028 0.034 0.027 218 T 0.006 0.075 0.085 0.007 0.001 0.013 0.043 0.003 0.001 0.001 0.007 0.009 0.570 0.021 0.065 0.095 219 D 0.077 0.057 0.058 0.072 0.001 0.018 0.008 0.005 0.010 0.002 0.053 0.010 0.294 0.030 0.048 0.259 220 R 0.069 0.061 0.681 0.039 0.001 0.003 0.013 0.001 0.003 0.001 0.002 0.007 0.043 0.005 0.007 0.064 221 L 0.021 0.014 0.611 0.281 0.001 0.014 0.010 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.026 0.001 0.002 0.013 222 T 0.005 0.027 0.235 0.713 0.002 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.005 223 I 0.006 0.005 0.036 0.799 0.060 0.078 0.006 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 224 P 0.002 0.054 0.019 0.288 0.127 0.428 0.003 0.027 0.001 0.002 0.039 0.003 0.005 0.001 0.001 0.001 225 A 0.001 0.060 0.003 0.076 0.542 0.067 0.022 0.025 0.012 0.012 0.133 0.024 0.003 0.016 0.001 0.001 226 S 0.006 0.099 0.013 0.053 0.011 0.042 0.004 0.488 0.017 0.008 0.037 0.094 0.010 0.002 0.115 0.002 227 G 0.009 0.027 0.036 0.028 0.013 0.039 0.017 0.019 0.274 0.171 0.092 0.046 0.054 0.009 0.012 0.153 228 L 0.422 0.044 0.060 0.062 0.009 0.015 0.017 0.034 0.020 0.007 0.090 0.110 0.051 0.009 0.032 0.018 229 S 0.039 0.058 0.310 0.077 0.010 0.105 0.013 0.016 0.024 0.016 0.021 0.107 0.127 0.004 0.027 0.045 230 V 0.041 0.022 0.078 0.048 0.252 0.043 0.205 0.005 0.007 0.008 0.057 0.017 0.056 0.128 0.003 0.030 231 K 0.023 0.091 0.120 0.102 0.008 0.030 0.012 0.281 0.006 0.002 0.020 0.045 0.042 0.004 0.208 0.006 232 G 0.010 0.031 0.079 0.115 0.003 0.038 0.007 0.010 0.199 0.161 0.028 0.022 0.067 0.002 0.005 0.222 233 H 0.511 0.062 0.070 0.171 0.003 0.021 0.005 0.002 0.006 0.003 0.025 0.054 0.053 0.001 0.002 0.011 234 T 0.025 0.020 0.259 0.126 0.017 0.301 0.014 0.004 0.002 0.003 0.043 0.064 0.109 0.003 0.002 0.007 235 E 0.006 0.213 0.115 0.263 0.005 0.058 0.003 0.014 0.003 0.002 0.081 0.081 0.143 0.001 0.005 0.007 236 S 0.007 0.017 0.016 0.104 0.010 0.245 0.005 0.002 0.007 0.010 0.050 0.148 0.368 0.001 0.001 0.009 237 L 0.007 0.012 0.036 0.020 0.001 0.047 0.001 0.003 0.001 0.001 0.215 0.100 0.555 0.001 0.001 0.001 238 N 0.001 0.002 0.002 0.004 0.001 0.033 0.001 0.001 0.001 0.001 0.091 0.348 0.518 0.001 0.001 0.001 239 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.073 0.072 0.850 0.001 0.001 0.001 240 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.065 0.932 0.001 0.001 0.001 241 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.992 0.001 0.001 0.001 242 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 243 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 244 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 245 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 246 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 247 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 248 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 249 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.988 0.004 0.002 0.003 250 W 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.911 0.032 0.009 0.030 251 R 0.002 0.004 0.040 0.004 0.002 0.001 0.069 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.633 0.115 0.044 0.082 252 R 0.013 0.016 0.134 0.022 0.004 0.008 0.047 0.009 0.003 0.002 0.004 0.003 0.388 0.037 0.104 0.207 253 R 0.040 0.021 0.088 0.025 0.054 0.052 0.206 0.008 0.008 0.020 0.035 0.010 0.197 0.114 0.016 0.108 254 S 0.066 0.130 0.069 0.031 0.018 0.065 0.053 0.096 0.005 0.004 0.129 0.058 0.126 0.028 0.101 0.021