# TARGET T0374 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0374.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2157 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.010 0.002 0.073 0.110 0.225 0.117 0.048 0.414 2 Q 0.014 0.002 0.102 0.119 0.248 0.077 0.056 0.381 3 L 0.006 0.002 0.133 0.195 0.205 0.071 0.032 0.356 4 S 0.005 0.003 0.218 0.140 0.280 0.052 0.036 0.266 5 H 0.017 0.007 0.108 0.103 0.140 0.065 0.035 0.526 6 R 0.048 0.015 0.177 0.170 0.127 0.070 0.168 0.226 7 P 0.056 0.028 0.065 0.043 0.057 0.115 0.108 0.529 8 A 0.072 0.026 0.060 0.033 0.033 0.113 0.045 0.617 9 E 0.251 0.074 0.018 0.012 0.014 0.076 0.102 0.451 10 T 0.212 0.097 0.007 0.004 0.007 0.107 0.040 0.526 11 G 0.010 0.016 0.005 0.004 0.004 0.101 0.081 0.779 12 D 0.057 0.696 0.003 0.002 0.002 0.023 0.075 0.142 13 L 0.171 0.718 0.003 0.001 0.001 0.020 0.024 0.063 14 E 0.074 0.418 0.044 0.017 0.013 0.046 0.086 0.301 15 T 0.300 0.292 0.027 0.008 0.021 0.050 0.076 0.227 16 V 0.461 0.055 0.037 0.005 0.009 0.103 0.066 0.263 17 A 0.032 0.037 0.049 0.020 0.031 0.149 0.058 0.625 18 G 0.007 0.020 0.012 0.002 0.006 0.070 0.015 0.869 19 F 0.126 0.177 0.029 0.012 0.013 0.142 0.090 0.411 20 P 0.192 0.278 0.033 0.012 0.012 0.094 0.085 0.294 21 Q 0.119 0.206 0.015 0.004 0.007 0.078 0.049 0.522 22 D 0.096 0.361 0.027 0.008 0.010 0.073 0.074 0.350 23 R 0.135 0.345 0.027 0.008 0.011 0.073 0.087 0.314 24 D 0.134 0.238 0.033 0.016 0.023 0.076 0.103 0.376 25 E 0.136 0.089 0.026 0.021 0.034 0.082 0.071 0.539 26 L 0.090 0.036 0.034 0.035 0.060 0.115 0.056 0.573 27 F 0.045 0.022 0.027 0.032 0.059 0.132 0.040 0.643 28 Y 0.014 0.013 0.033 0.040 0.065 0.137 0.029 0.669 29 C 0.021 0.012 0.027 0.032 0.039 0.121 0.032 0.715 30 Y 0.325 0.042 0.029 0.032 0.026 0.080 0.125 0.340 31 P 0.346 0.046 0.012 0.012 0.014 0.073 0.044 0.453 32 K 0.058 0.014 0.017 0.009 0.018 0.090 0.040 0.755 33 A 0.029 0.013 0.018 0.012 0.023 0.132 0.027 0.744 34 I 0.041 0.020 0.018 0.018 0.027 0.127 0.072 0.677 35 W 0.065 0.126 0.017 0.013 0.015 0.116 0.089 0.558 36 P 0.051 0.318 0.015 0.009 0.013 0.091 0.042 0.461 37 F 0.022 0.356 0.016 0.010 0.008 0.064 0.084 0.441 38 S 0.013 0.967 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.007 39 V 0.013 0.976 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.004 40 A 0.004 0.973 0.002 0.001 0.001 0.002 0.008 0.010 41 Q 0.014 0.940 0.003 0.001 0.001 0.003 0.028 0.011 42 L 0.039 0.877 0.006 0.001 0.001 0.004 0.063 0.011 43 A 0.056 0.840 0.009 0.002 0.002 0.006 0.043 0.042 44 A 0.081 0.442 0.016 0.005 0.004 0.023 0.059 0.371 45 A 0.065 0.133 0.041 0.020 0.012 0.068 0.162 0.498 46 I 0.213 0.030 0.034 0.011 0.009 0.068 0.154 0.482 47 A 0.384 0.006 0.005 0.003 0.003 0.039 0.036 0.525 48 E 0.063 0.001 0.003 0.001 0.002 0.042 0.020 0.868 49 R 0.012 0.001 0.014 0.002 0.006 0.148 0.041 0.776 50 R 0.010 0.003 0.068 0.016 0.044 0.159 0.037 0.664 51 G 0.005 0.003 0.106 0.071 0.158 0.090 0.044 0.523 52 S 0.001 0.002 0.270 0.147 0.292 0.036 0.038 0.215 53 T 0.001 0.001 0.232 0.416 0.299 0.006 0.017 0.029 54 V 0.001 0.001 0.187 0.452 0.267 0.007 0.022 0.065 55 A 0.001 0.001 0.392 0.255 0.278 0.007 0.025 0.042 56 V 0.071 0.001 0.183 0.233 0.286 0.032 0.056 0.138 57 H 0.530 0.002 0.025 0.059 0.046 0.034 0.042 0.262 58 D 0.015 0.002 0.009 0.014 0.072 0.089 0.004 0.794 59 G 0.003 0.002 0.024 0.016 0.141 0.107 0.013 0.695 60 Q 0.005 0.004 0.050 0.492 0.252 0.049 0.028 0.120 61 V 0.009 0.013 0.084 0.259 0.226 0.044 0.040 0.325 62 L 0.007 0.008 0.162 0.256 0.309 0.028 0.055 0.175 63 G 0.006 0.007 0.197 0.290 0.396 0.013 0.047 0.044 64 F 0.013 0.012 0.181 0.184 0.347 0.029 0.053 0.183 65 A 0.007 0.011 0.156 0.315 0.388 0.022 0.023 0.078 66 N 0.014 0.022 0.123 0.189 0.406 0.043 0.051 0.152 67 F 0.029 0.023 0.101 0.150 0.240 0.084 0.071 0.303 68 Y 0.076 0.023 0.065 0.192 0.198 0.078 0.093 0.275 69 Q 0.107 0.022 0.032 0.044 0.069 0.113 0.085 0.529 70 W 0.059 0.013 0.026 0.024 0.034 0.123 0.046 0.676 71 Q 0.107 0.022 0.011 0.015 0.019 0.095 0.034 0.698 72 H 0.083 0.058 0.006 0.008 0.014 0.088 0.029 0.712 73 G 0.042 0.097 0.016 0.020 0.043 0.135 0.059 0.588 74 D 0.029 0.188 0.024 0.067 0.145 0.075 0.130 0.342 75 F 0.013 0.134 0.040 0.122 0.245 0.065 0.146 0.234 76 C 0.007 0.041 0.104 0.230 0.328 0.046 0.129 0.115 77 A 0.026 0.056 0.095 0.237 0.375 0.036 0.089 0.086 78 L 0.031 0.036 0.086 0.153 0.346 0.045 0.102 0.201 79 G 0.022 0.013 0.049 0.210 0.428 0.049 0.042 0.189 80 N 0.012 0.006 0.038 0.213 0.498 0.042 0.027 0.164 81 M 0.009 0.009 0.041 0.175 0.296 0.088 0.018 0.363 82 M 0.002 0.011 0.057 0.260 0.431 0.051 0.016 0.172 83 V 0.010 0.025 0.048 0.099 0.115 0.083 0.037 0.582 84 A 0.319 0.319 0.025 0.062 0.033 0.027 0.147 0.068 85 P 0.182 0.204 0.050 0.038 0.035 0.057 0.123 0.310 86 A 0.373 0.095 0.022 0.011 0.022 0.067 0.046 0.364 87 A 0.247 0.044 0.027 0.017 0.020 0.082 0.087 0.476 88 R 0.048 0.046 0.006 0.007 0.015 0.128 0.017 0.734 89 G 0.043 0.141 0.007 0.006 0.014 0.066 0.051 0.672 90 L 0.014 0.385 0.014 0.023 0.023 0.109 0.031 0.402 91 G 0.023 0.726 0.018 0.011 0.017 0.027 0.063 0.114 92 V 0.009 0.946 0.002 0.003 0.002 0.003 0.024 0.011 93 A 0.004 0.951 0.001 0.001 0.001 0.001 0.036 0.005 94 R 0.004 0.857 0.003 0.001 0.001 0.002 0.125 0.007 95 Y 0.002 0.922 0.002 0.001 0.001 0.002 0.066 0.005 96 L 0.003 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 97 I 0.006 0.886 0.001 0.001 0.001 0.001 0.101 0.004 98 G 0.001 0.227 0.002 0.001 0.001 0.001 0.763 0.006 99 V 0.005 0.954 0.001 0.001 0.001 0.002 0.034 0.005 100 M 0.020 0.958 0.002 0.001 0.001 0.001 0.014 0.005 101 E 0.010 0.944 0.003 0.001 0.001 0.003 0.018 0.022 102 N 0.011 0.920 0.004 0.001 0.001 0.004 0.021 0.040 103 L 0.031 0.874 0.018 0.001 0.001 0.005 0.053 0.019 104 A 0.200 0.604 0.046 0.001 0.001 0.012 0.095 0.041 105 R 0.165 0.185 0.060 0.001 0.001 0.032 0.202 0.354 106 E 0.115 0.191 0.038 0.001 0.001 0.032 0.057 0.564 107 Q 0.156 0.054 0.042 0.001 0.002 0.065 0.073 0.606 108 Y 0.047 0.016 0.019 0.003 0.002 0.096 0.037 0.779 109 K 0.137 0.032 0.014 0.002 0.005 0.062 0.038 0.709 110 A 0.038 0.017 0.037 0.004 0.007 0.130 0.032 0.736 111 R 0.019 0.024 0.226 0.041 0.108 0.120 0.062 0.401 112 L 0.006 0.010 0.160 0.047 0.119 0.066 0.083 0.511 113 M 0.003 0.010 0.346 0.213 0.194 0.043 0.041 0.151 114 K 0.006 0.019 0.306 0.180 0.286 0.028 0.047 0.128 115 I 0.006 0.020 0.202 0.253 0.215 0.036 0.083 0.184 116 S 0.015 0.047 0.355 0.183 0.192 0.030 0.071 0.109 117 C 0.043 0.065 0.147 0.136 0.152 0.046 0.173 0.237 118 F 0.203 0.183 0.107 0.051 0.049 0.058 0.123 0.226 119 N 0.115 0.221 0.024 0.021 0.026 0.075 0.081 0.439 120 A 0.013 0.259 0.007 0.004 0.005 0.056 0.041 0.615 121 N 0.010 0.934 0.001 0.001 0.001 0.006 0.018 0.028 122 A 0.005 0.979 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.009 123 A 0.003 0.981 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.005 124 G 0.009 0.947 0.001 0.001 0.001 0.002 0.036 0.005 125 L 0.001 0.045 0.002 0.001 0.001 0.002 0.947 0.003 126 L 0.002 0.666 0.006 0.004 0.005 0.005 0.294 0.017 127 L 0.048 0.734 0.030 0.007 0.019 0.020 0.086 0.056 128 Y 0.116 0.131 0.145 0.099 0.056 0.053 0.275 0.125 129 T 0.544 0.019 0.010 0.006 0.010 0.030 0.023 0.358 130 Q 0.164 0.003 0.006 0.003 0.005 0.074 0.011 0.733 131 L 0.006 0.001 0.014 0.006 0.012 0.190 0.009 0.762 132 G 0.005 0.001 0.022 0.018 0.055 0.162 0.016 0.721 133 Y 0.006 0.001 0.018 0.020 0.019 0.068 0.012 0.855 134 Q 0.226 0.049 0.092 0.133 0.063 0.079 0.098 0.259 135 P 0.058 0.033 0.023 0.018 0.026 0.082 0.019 0.742 136 R 0.042 0.050 0.063 0.035 0.050 0.091 0.022 0.646 137 A 0.084 0.077 0.056 0.056 0.070 0.088 0.081 0.487 138 I 0.224 0.075 0.022 0.039 0.051 0.088 0.143 0.359 139 A 0.194 0.060 0.019 0.059 0.069 0.077 0.082 0.441 140 E 0.048 0.016 0.010 0.029 0.053 0.094 0.024 0.726 141 R 0.012 0.007 0.019 0.055 0.119 0.146 0.044 0.597 142 H 0.016 0.004 0.023 0.047 0.079 0.134 0.049 0.648 143 D 0.662 0.008 0.008 0.020 0.022 0.051 0.039 0.189 144 P 0.369 0.012 0.005 0.009 0.010 0.062 0.030 0.503 145 D 0.023 0.012 0.006 0.004 0.023 0.110 0.007 0.815 146 G 0.011 0.013 0.014 0.014 0.048 0.090 0.017 0.793 147 R 0.017 0.074 0.030 0.256 0.145 0.106 0.038 0.334 148 R 0.032 0.194 0.044 0.081 0.123 0.055 0.061 0.411 149 V 0.039 0.220 0.057 0.168 0.166 0.042 0.117 0.189 150 A 0.018 0.185 0.070 0.170 0.266 0.024 0.122 0.144 151 L 0.021 0.094 0.081 0.169 0.334 0.034 0.107 0.161 152 I 0.039 0.047 0.055 0.274 0.425 0.030 0.045 0.086 153 Q 0.071 0.013 0.046 0.202 0.299 0.045 0.068 0.256 154 M 0.021 0.007 0.025 0.148 0.225 0.083 0.042 0.450 155 D 0.036 0.004 0.015 0.056 0.123 0.101 0.023 0.642 156 K 0.070 0.002 0.008 0.060 0.062 0.132 0.025 0.639 157 P 0.022 0.002 0.007 0.020 0.032 0.099 0.030 0.789 158 L 0.065 0.004 0.006 0.012 0.019 0.096 0.038 0.761 159 E 0.159 0.010 0.010 0.028 0.028 0.118 0.062 0.586 160 P 0.035 0.006 0.008 0.010 0.018 0.077 0.021 0.824