# TARGET T0371 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-pb-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 16 (1 pb ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp7/T0371/T0371.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 728 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M N O P 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.098 0.023 0.418 0.377 0.001 0.005 0.002 0.001 0.003 0.006 0.001 0.004 0.013 0.001 0.001 0.046 2 Q 0.012 0.002 0.030 0.018 0.001 0.921 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.010 0.001 0.001 0.001 3 I 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.107 0.001 0.001 0.001 0.001 0.876 0.003 0.008 0.001 0.001 0.001 4 E 0.001 0.045 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.932 0.007 0.001 0.001 0.001 5 S 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.030 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.047 0.907 0.001 0.001 0.005 6 F 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.049 0.006 0.931 0.001 0.001 0.001 7 K 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.097 0.879 0.002 0.001 0.001 8 S 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.965 0.007 0.004 0.011 9 L 0.001 0.004 0.035 0.002 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.840 0.006 0.010 0.086 10 L 0.007 0.002 0.045 0.003 0.002 0.033 0.119 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.737 0.026 0.006 0.014 11 P 0.007 0.135 0.038 0.012 0.001 0.029 0.016 0.010 0.001 0.001 0.065 0.011 0.601 0.003 0.052 0.021 12 K 0.006 0.270 0.021 0.049 0.001 0.001 0.002 0.001 0.030 0.001 0.003 0.012 0.041 0.007 0.004 0.553 13 Y 0.122 0.001 0.451 0.030 0.001 0.208 0.013 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.160 0.001 0.004 0.003 14 K 0.001 0.892 0.087 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 15 C 0.002 0.001 0.007 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 16 I 0.001 0.001 0.929 0.066 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 17 F 0.001 0.001 0.002 0.985 0.005 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 18 F 0.001 0.011 0.003 0.955 0.008 0.018 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 19 D 0.001 0.005 0.001 0.030 0.034 0.916 0.001 0.002 0.001 0.006 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 20 A 0.001 0.024 0.001 0.006 0.171 0.008 0.011 0.007 0.001 0.001 0.745 0.003 0.001 0.021 0.001 0.001 21 F 0.001 0.033 0.003 0.007 0.001 0.009 0.001 0.282 0.003 0.001 0.004 0.123 0.001 0.001 0.530 0.001 22 G 0.002 0.004 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.247 0.015 0.003 0.001 0.006 0.001 0.001 0.707 23 V 0.948 0.002 0.019 0.010 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.005 0.001 0.001 0.003 24 L 0.007 0.019 0.837 0.054 0.004 0.033 0.008 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.025 0.001 0.001 0.003 25 K 0.002 0.062 0.039 0.756 0.048 0.036 0.010 0.004 0.002 0.002 0.007 0.004 0.018 0.003 0.001 0.007 26 T 0.005 0.022 0.027 0.211 0.132 0.467 0.013 0.030 0.006 0.009 0.017 0.014 0.035 0.004 0.004 0.003 27 Y 0.003 0.096 0.025 0.053 0.116 0.070 0.065 0.045 0.010 0.015 0.394 0.017 0.039 0.038 0.005 0.009 28 N 0.018 0.114 0.021 0.070 0.003 0.020 0.007 0.112 0.035 0.008 0.028 0.389 0.027 0.004 0.136 0.007 29 G 0.031 0.024 0.124 0.051 0.005 0.039 0.018 0.006 0.108 0.062 0.040 0.041 0.120 0.004 0.014 0.313 30 L 0.295 0.101 0.247 0.133 0.002 0.013 0.004 0.005 0.005 0.002 0.031 0.049 0.068 0.001 0.005 0.039 31 L 0.017 0.003 0.063 0.016 0.169 0.452 0.114 0.001 0.001 0.008 0.012 0.048 0.064 0.028 0.001 0.002 32 P 0.002 0.039 0.011 0.015 0.001 0.028 0.001 0.291 0.001 0.001 0.474 0.017 0.089 0.001 0.029 0.001 33 G 0.001 0.010 0.001 0.011 0.001 0.020 0.001 0.001 0.083 0.046 0.038 0.639 0.130 0.001 0.001 0.020 34 I 0.017 0.001 0.002 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.001 0.001 0.049 0.109 0.807 0.001 0.001 0.001 35 E 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.035 0.096 0.858 0.001 0.001 0.001 36 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.036 0.958 0.001 0.001 0.001 37 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.993 0.001 0.001 0.001 38 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.995 0.001 0.001 0.001 39 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 0.001 40 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 41 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.003 0.001 42 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.002 0.003 43 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.989 0.001 0.001 44 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.992 0.001 45 G 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.985 46 Q 0.991 0.001 0.003 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 47 D 0.006 0.129 0.789 0.048 0.001 0.019 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.002 48 Y 0.002 0.018 0.057 0.897 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 49 Y 0.001 0.006 0.133 0.852 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 50 I 0.001 0.002 0.031 0.920 0.022 0.018 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 51 V 0.001 0.018 0.013 0.782 0.124 0.045 0.003 0.004 0.001 0.001 0.003 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 52 T 0.002 0.050 0.005 0.391 0.140 0.330 0.005 0.044 0.004 0.006 0.010 0.004 0.004 0.001 0.001 0.001 53 N 0.005 0.240 0.019 0.263 0.026 0.100 0.005 0.130 0.028 0.028 0.112 0.022 0.006 0.002 0.006 0.006 54 D 0.030 0.106 0.027 0.103 0.012 0.323 0.010 0.026 0.051 0.044 0.080 0.139 0.021 0.004 0.011 0.013 55 A 0.044 0.073 0.073 0.037 0.004 0.061 0.019 0.013 0.007 0.008 0.445 0.132 0.048 0.005 0.014 0.016 56 S 0.034 0.220 0.093 0.051 0.002 0.076 0.006 0.006 0.015 0.003 0.059 0.283 0.076 0.002 0.024 0.050 57 R 0.037 0.186 0.435 0.177 0.001 0.003 0.002 0.002 0.003 0.002 0.014 0.026 0.047 0.001 0.005 0.058 58 S 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.975 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.016 0.001 0.001 0.001 59 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.987 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 60 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.992 0.006 0.001 0.001 0.001 61 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.993 0.001 0.001 0.001 62 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 63 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.996 0.001 0.001 0.001 64 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.992 0.001 0.001 0.001 65 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.988 0.005 0.001 0.003 66 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.987 0.002 0.003 0.001 67 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.984 0.002 0.003 0.004 68 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.024 0.960 0.001 0.005 69 L 0.001 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.030 0.001 0.947 0.001 70 G 0.002 0.002 0.025 0.002 0.001 0.005 0.018 0.001 0.009 0.019 0.002 0.002 0.113 0.010 0.003 0.787 71 L 0.855 0.023 0.017 0.015 0.001 0.004 0.005 0.002 0.001 0.001 0.011 0.009 0.042 0.004 0.006 0.006 72 F 0.020 0.120 0.362 0.076 0.003 0.079 0.020 0.009 0.008 0.007 0.040 0.076 0.107 0.008 0.021 0.042 73 S 0.054 0.116 0.250 0.218 0.006 0.117 0.015 0.005 0.007 0.002 0.039 0.024 0.095 0.002 0.012 0.037 74 I 0.026 0.147 0.229 0.462 0.003 0.018 0.004 0.005 0.003 0.002 0.028 0.030 0.029 0.001 0.002 0.011 75 T 0.004 0.007 0.020 0.022 0.007 0.858 0.003 0.002 0.001 0.003 0.006 0.028 0.038 0.001 0.001 0.001 76 A 0.001 0.007 0.003 0.005 0.001 0.046 0.001 0.005 0.001 0.001 0.877 0.006 0.044 0.001 0.001 0.001 77 D 0.001 0.096 0.004 0.016 0.001 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.006 0.834 0.026 0.001 0.005 0.002 78 K 0.021 0.005 0.086 0.047 0.001 0.008 0.013 0.001 0.006 0.001 0.011 0.014 0.628 0.009 0.013 0.135 79 I 0.013 0.009 0.595 0.027 0.004 0.014 0.041 0.001 0.001 0.001 0.012 0.007 0.235 0.007 0.004 0.028 80 I 0.016 0.095 0.191 0.186 0.014 0.051 0.032 0.016 0.002 0.003 0.012 0.022 0.314 0.009 0.012 0.025 81 S 0.011 0.019 0.037 0.111 0.062 0.274 0.062 0.013 0.009 0.019 0.043 0.025 0.259 0.028 0.006 0.024 82 S 0.011 0.065 0.031 0.037 0.003 0.084 0.004 0.078 0.005 0.004 0.315 0.060 0.259 0.003 0.030 0.011 83 G 0.009 0.024 0.020 0.026 0.001 0.030 0.002 0.005 0.023 0.016 0.179 0.356 0.279 0.002 0.004 0.025 84 M 0.030 0.014 0.026 0.022 0.001 0.017 0.002 0.001 0.001 0.001 0.064 0.209 0.605 0.001 0.002 0.005 85 I 0.002 0.004 0.017 0.013 0.001 0.034 0.001 0.001 0.001 0.001 0.028 0.078 0.817 0.001 0.001 0.002 86 T 0.001 0.003 0.001 0.003 0.001 0.040 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.054 0.876 0.001 0.001 0.001 87 K 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.033 0.025 0.933 0.001 0.001 0.001 88 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.029 0.965 0.001 0.001 0.001 89 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.977 0.008 0.001 0.007 90 I 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.977 0.003 0.006 0.002 91 D 0.001 0.001 0.007 0.002 0.001 0.002 0.006 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.891 0.035 0.007 0.042 92 L 0.010 0.006 0.031 0.010 0.001 0.002 0.027 0.001 0.001 0.001 0.007 0.004 0.718 0.044 0.050 0.087 93 K 0.013 0.012 0.174 0.008 0.006 0.018 0.053 0.002 0.001 0.001 0.006 0.008 0.511 0.030 0.030 0.127 94 V 0.008 0.004 0.022 0.002 0.187 0.012 0.325 0.003 0.001 0.001 0.015 0.003 0.055 0.350 0.004 0.009 95 D 0.003 0.040 0.010 0.004 0.009 0.006 0.033 0.387 0.002 0.001 0.022 0.008 0.019 0.046 0.403 0.006 96 G 0.006 0.043 0.024 0.023 0.001 0.003 0.003 0.027 0.384 0.053 0.006 0.008 0.016 0.001 0.096 0.307 97 G 0.801 0.012 0.063 0.046 0.001 0.002 0.001 0.001 0.024 0.004 0.001 0.003 0.004 0.001 0.001 0.038 98 I 0.113 0.018 0.725 0.136 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 99 V 0.002 0.004 0.261 0.709 0.002 0.018 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 100 A 0.001 0.010 0.029 0.940 0.007 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 101 Y 0.001 0.006 0.005 0.569 0.347 0.057 0.004 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 102 L 0.001 0.101 0.019 0.585 0.024 0.043 0.001 0.198 0.003 0.001 0.009 0.003 0.003 0.001 0.007 0.001 103 G 0.004 0.054 0.016 0.358 0.018 0.178 0.002 0.018 0.090 0.205 0.022 0.016 0.006 0.001 0.001 0.013 104 T 0.126 0.056 0.025 0.086 0.090 0.314 0.016 0.018 0.006 0.010 0.180 0.049 0.016 0.004 0.001 0.002 105 A 0.006 0.128 0.057 0.080 0.005 0.065 0.003 0.133 0.006 0.005 0.317 0.137 0.030 0.002 0.022 0.004 106 N 0.007 0.043 0.025 0.064 0.004 0.130 0.003 0.010 0.034 0.040 0.059 0.415 0.137 0.002 0.007 0.021 107 S 0.029 0.007 0.012 0.011 0.004 0.116 0.006 0.004 0.002 0.003 0.238 0.093 0.465 0.004 0.002 0.005 108 A 0.003 0.014 0.017 0.008 0.001 0.020 0.002 0.010 0.001 0.001 0.199 0.286 0.426 0.003 0.009 0.003 109 N 0.001 0.004 0.005 0.010 0.001 0.007 0.002 0.001 0.002 0.001 0.015 0.108 0.832 0.001 0.003 0.008 110 Y 0.003 0.003 0.011 0.010 0.001 0.004 0.003 0.001 0.001 0.001 0.007 0.016 0.928 0.002 0.002 0.011 111 L 0.002 0.003 0.034 0.016 0.001 0.009 0.013 0.001 0.001 0.001 0.005 0.013 0.886 0.005 0.003 0.009 112 V 0.001 0.005 0.020 0.008 0.005 0.021 0.013 0.002 0.001 0.001 0.011 0.007 0.879 0.012 0.006 0.010 113 S 0.001 0.003 0.004 0.002 0.018 0.003 0.074 0.002 0.001 0.001 0.012 0.002 0.070 0.797 0.005 0.007 114 D 0.001 0.005 0.007 0.002 0.001 0.002 0.003 0.044 0.001 0.001 0.003 0.005 0.049 0.001 0.872 0.005 115 G 0.005 0.006 0.015 0.003 0.001 0.002 0.003 0.001 0.044 0.011 0.005 0.004 0.059 0.003 0.003 0.838 116 I 0.850 0.005 0.032 0.012 0.001 0.006 0.009 0.001 0.001 0.001 0.007 0.016 0.055 0.002 0.002 0.004 117 K 0.009 0.086 0.543 0.073 0.004 0.064 0.017 0.009 0.002 0.001 0.019 0.023 0.117 0.007 0.011 0.016 118 M 0.011 0.088 0.097 0.579 0.009 0.038 0.014 0.005 0.009 0.003 0.022 0.016 0.065 0.005 0.008 0.033 119 L 0.021 0.044 0.295 0.441 0.013 0.054 0.018 0.006 0.004 0.004 0.011 0.019 0.051 0.002 0.004 0.012 120 P 0.021 0.070 0.181 0.340 0.013 0.211 0.010 0.015 0.005 0.007 0.027 0.017 0.061 0.003 0.004 0.015 121 V 0.022 0.107 0.068 0.389 0.013 0.120 0.008 0.014 0.009 0.007 0.136 0.038 0.050 0.005 0.004 0.009 122 S 0.019 0.089 0.064 0.206 0.008 0.236 0.007 0.017 0.008 0.006 0.073 0.158 0.092 0.002 0.008 0.008 123 A 0.013 0.081 0.074 0.166 0.013 0.107 0.013 0.010 0.010 0.005 0.224 0.086 0.166 0.007 0.005 0.022 124 I 0.018 0.113 0.108 0.213 0.013 0.056 0.024 0.017 0.005 0.002 0.050 0.173 0.170 0.011 0.015 0.013 125 D 0.009 0.031 0.088 0.084 0.007 0.222 0.012 0.022 0.006 0.007 0.046 0.056 0.352 0.006 0.028 0.024 126 D 0.016 0.029 0.045 0.044 0.017 0.055 0.029 0.010 0.009 0.007 0.352 0.041 0.260 0.039 0.008 0.038 127 S 0.030 0.096 0.069 0.066 0.003 0.032 0.009 0.026 0.005 0.002 0.056 0.259 0.261 0.007 0.065 0.015 128 N 0.012 0.014 0.073 0.024 0.031 0.065 0.101 0.004 0.011 0.009 0.046 0.045 0.348 0.105 0.009 0.101 129 I 0.047 0.087 0.131 0.054 0.004 0.021 0.021 0.072 0.003 0.001 0.074 0.040 0.262 0.007 0.152 0.023 130 G 0.015 0.067 0.163 0.107 0.003 0.052 0.012 0.011 0.041 0.028 0.024 0.069 0.242 0.004 0.013 0.149 131 E 0.199 0.046 0.132 0.114 0.017 0.110 0.036 0.005 0.006 0.004 0.048 0.029 0.207 0.011 0.005 0.031 132 V 0.018 0.124 0.281 0.143 0.003 0.130 0.010 0.024 0.003 0.001 0.073 0.045 0.114 0.004 0.017 0.009 133 N 0.009 0.265 0.181 0.313 0.001 0.044 0.002 0.007 0.013 0.003 0.012 0.056 0.063 0.001 0.007 0.022 134 A 0.034 0.024 0.168 0.634 0.001 0.021 0.001 0.003 0.002 0.001 0.032 0.007 0.062 0.001 0.002 0.010 135 L 0.009 0.013 0.493 0.422 0.002 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.004 0.032 0.001 0.001 0.003 136 V 0.002 0.008 0.078 0.872 0.005 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.016 0.001 0.001 0.002 137 L 0.001 0.020 0.030 0.808 0.042 0.075 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.002 138 L 0.002 0.069 0.025 0.673 0.075 0.095 0.008 0.021 0.001 0.002 0.012 0.002 0.008 0.002 0.001 0.003 139 D 0.002 0.042 0.007 0.051 0.023 0.745 0.002 0.045 0.006 0.013 0.033 0.015 0.011 0.001 0.002 0.002 140 D 0.004 0.031 0.005 0.008 0.073 0.027 0.029 0.008 0.006 0.008 0.717 0.025 0.011 0.043 0.001 0.003 141 E 0.008 0.072 0.011 0.013 0.001 0.010 0.003 0.114 0.004 0.001 0.026 0.339 0.015 0.003 0.380 0.002 142 G 0.005 0.015 0.051 0.010 0.001 0.005 0.007 0.002 0.093 0.022 0.010 0.016 0.061 0.004 0.011 0.687 143 F 0.610 0.013 0.101 0.041 0.002 0.017 0.015 0.003 0.003 0.002 0.027 0.038 0.102 0.002 0.006 0.016 144 N 0.027 0.057 0.414 0.062 0.004 0.127 0.010 0.010 0.003 0.005 0.028 0.055 0.171 0.002 0.005 0.020 145 W 0.016 0.051 0.051 0.151 0.010 0.176 0.006 0.009 0.004 0.006 0.114 0.095 0.290 0.003 0.003 0.015 146 F 0.004 0.007 0.019 0.015 0.011 0.254 0.009 0.004 0.001 0.002 0.140 0.129 0.392 0.005 0.002 0.002 147 H 0.001 0.008 0.004 0.005 0.001 0.009 0.001 0.009 0.001 0.001 0.324 0.147 0.485 0.001 0.004 0.002 148 D 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.002 0.001 0.019 0.337 0.620 0.001 0.001 0.005 149 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.017 0.968 0.001 0.001 0.001 150 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.033 0.963 0.001 0.001 0.001 151 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.994 0.001 0.001 0.001 152 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.995 0.001 0.001 0.001 153 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 154 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 155 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.001 0.001 156 L 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.968 0.011 0.011 0.004 157 R 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.920 0.027 0.017 0.024 158 K 0.007 0.001 0.010 0.001 0.001 0.002 0.049 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.420 0.355 0.049 0.099 159 R 0.018 0.020 0.069 0.003 0.001 0.004 0.024 0.007 0.001 0.001 0.014 0.005 0.299 0.010 0.415 0.109 160 T 0.038 0.082 0.135 0.011 0.001 0.003 0.007 0.001 0.012 0.001 0.003 0.009 0.079 0.003 0.006 0.612 161 I 0.441 0.014 0.282 0.063 0.001 0.074 0.009 0.001 0.001 0.001 0.011 0.010 0.080 0.001 0.002 0.011 162 P 0.005 0.292 0.530 0.121 0.001 0.014 0.002 0.001 0.001 0.001 0.005 0.008 0.019 0.001 0.001 0.002 163 A 0.001 0.007 0.026 0.931 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 164 I 0.002 0.007 0.270 0.684 0.007 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.012 0.001 0.001 0.001 165 V 0.002 0.008 0.025 0.881 0.019 0.039 0.002 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.013 0.001 0.001 0.002 166 A 0.003 0.044 0.018 0.755 0.039 0.092 0.005 0.011 0.003 0.003 0.008 0.002 0.009 0.002 0.001 0.004 167 N 0.005 0.098 0.010 0.200 0.038 0.545 0.005 0.026 0.006 0.007 0.024 0.014 0.016 0.001 0.002 0.003 168 T 0.006 0.093 0.033 0.071 0.068 0.093 0.026 0.033 0.011 0.019 0.458 0.039 0.026 0.016 0.004 0.006 169 D 0.014 0.117 0.026 0.045 0.008 0.122 0.014 0.047 0.010 0.006 0.096 0.329 0.046 0.012 0.101 0.006 170 N 0.017 0.079 0.064 0.040 0.006 0.027 0.022 0.013 0.053 0.018 0.174 0.086 0.137 0.018 0.047 0.200 171 T 0.173 0.129 0.183 0.098 0.003 0.011 0.029 0.007 0.026 0.003 0.018 0.089 0.068 0.015 0.028 0.120 172 Y 0.053 0.026 0.608 0.100 0.003 0.038 0.032 0.004 0.004 0.004 0.005 0.013 0.063 0.002 0.011 0.034 173 P 0.035 0.058 0.263 0.204 0.010 0.236 0.013 0.011 0.006 0.008 0.041 0.012 0.078 0.001 0.003 0.022 174 L 0.030 0.126 0.056 0.245 0.026 0.177 0.011 0.011 0.008 0.006 0.166 0.070 0.054 0.005 0.002 0.008 175 T 0.014 0.090 0.076 0.161 0.023 0.151 0.013 0.032 0.008 0.004 0.112 0.203 0.089 0.007 0.011 0.006 176 K 0.009 0.089 0.119 0.119 0.013 0.087 0.026 0.023 0.015 0.009 0.117 0.105 0.205 0.010 0.019 0.034 177 T 0.038 0.086 0.114 0.164 0.002 0.053 0.007 0.020 0.016 0.007 0.083 0.122 0.224 0.003 0.025 0.036 178 D 0.056 0.048 0.194 0.172 0.004 0.072 0.011 0.004 0.012 0.006 0.051 0.068 0.249 0.004 0.005 0.045 179 V 0.041 0.073 0.232 0.293 0.002 0.038 0.004 0.006 0.002 0.001 0.044 0.051 0.197 0.001 0.004 0.010 180 A 0.006 0.026 0.096 0.276 0.018 0.177 0.011 0.002 0.003 0.002 0.037 0.038 0.291 0.005 0.002 0.008 181 I 0.004 0.046 0.041 0.179 0.012 0.091 0.008 0.006 0.001 0.001 0.070 0.042 0.491 0.001 0.004 0.004 182 A 0.004 0.047 0.021 0.102 0.076 0.133 0.025 0.011 0.006 0.007 0.047 0.127 0.336 0.035 0.003 0.021 183 I 0.013 0.023 0.024 0.029 0.024 0.052 0.028 0.046 0.003 0.002 0.090 0.042 0.510 0.032 0.068 0.011 184 G 0.004 0.021 0.046 0.023 0.001 0.018 0.001 0.028 0.010 0.017 0.093 0.099 0.561 0.001 0.042 0.036 185 G 0.019 0.001 0.003 0.005 0.001 0.028 0.001 0.001 0.003 0.007 0.058 0.105 0.760 0.001 0.001 0.010 186 V 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 0.088 0.092 0.803 0.001 0.001 0.001 187 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.130 0.858 0.001 0.001 0.001 188 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.993 0.001 0.001 0.001 189 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.995 0.001 0.001 0.001 190 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 0.001 191 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 192 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.002 193 I 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.038 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.560 0.333 0.007 0.052 194 L 0.002 0.006 0.036 0.004 0.001 0.001 0.018 0.005 0.001 0.001 0.001 0.002 0.520 0.019 0.356 0.030 195 G 0.005 0.006 0.044 0.009 0.001 0.013 0.028 0.002 0.008 0.009 0.005 0.002 0.412 0.025 0.017 0.415 196 R 0.279 0.093 0.098 0.053 0.001 0.017 0.017 0.007 0.003 0.001 0.043 0.019 0.296 0.005 0.025 0.043 197 R 0.039 0.113 0.260 0.095 0.003 0.106 0.009 0.005 0.010 0.004 0.032 0.083 0.175 0.006 0.008 0.051 198 F 0.035 0.048 0.201 0.184 0.020 0.122 0.026 0.005 0.003 0.001 0.114 0.039 0.175 0.011 0.005 0.011 199 I 0.009 0.214 0.167 0.302 0.008 0.038 0.007 0.018 0.003 0.001 0.023 0.073 0.110 0.003 0.013 0.010 200 R 0.012 0.018 0.067 0.328 0.094 0.072 0.079 0.012 0.013 0.011 0.039 0.019 0.098 0.099 0.005 0.033 201 F 0.036 0.089 0.231 0.301 0.006 0.019 0.015 0.069 0.008 0.002 0.015 0.016 0.079 0.003 0.094 0.017 202 G 0.028 0.024 0.127 0.402 0.006 0.033 0.013 0.005 0.049 0.083 0.020 0.023 0.049 0.004 0.003 0.130 203 K 0.268 0.041 0.116 0.394 0.022 0.064 0.009 0.003 0.003 0.002 0.014 0.014 0.034 0.002 0.002 0.012 204 P 0.011 0.088 0.133 0.491 0.010 0.097 0.003 0.024 0.002 0.009 0.052 0.030 0.041 0.001 0.003 0.006 205 D 0.001 0.004 0.001 0.005 0.001 0.905 0.001 0.002 0.001 0.004 0.016 0.028 0.032 0.001 0.001 0.001 206 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.929 0.017 0.046 0.001 0.001 0.001 207 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.964 0.029 0.001 0.001 0.001 208 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.011 0.983 0.001 0.001 0.001 209 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.990 0.001 0.001 0.001 210 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 0.001 211 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 212 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 213 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 214 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 215 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.986 0.008 0.001 0.003 216 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.977 0.010 0.006 0.003 217 R 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.945 0.017 0.011 0.018 218 Q 0.004 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.016 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.644 0.217 0.030 0.077 219 K 0.004 0.003 0.050 0.001 0.001 0.003 0.195 0.001 0.001 0.001 0.007 0.003 0.376 0.157 0.154 0.045 220 M 0.019 0.028 0.084 0.006 0.001 0.006 0.043 0.020 0.002 0.001 0.031 0.023 0.285 0.013 0.261 0.176 221 E 0.101 0.086 0.090 0.014 0.001 0.009 0.012 0.001 0.034 0.003 0.004 0.010 0.049 0.006 0.007 0.574 222 I 0.153 0.064 0.674 0.073 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.007 0.001 0.004 0.011 223 S 0.001 0.001 0.024 0.003 0.001 0.962 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.001 0.001 0.001 224 K 0.001 0.009 0.001 0.002 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.975 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 225 R 0.001 0.250 0.003 0.022 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.719 0.001 0.001 0.001 0.001 226 E 0.008 0.011 0.757 0.133 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.038 0.001 0.002 0.044 227 I 0.003 0.001 0.902 0.084 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 228 L 0.002 0.010 0.156 0.811 0.006 0.005 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 229 M 0.001 0.001 0.003 0.600 0.361 0.022 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.001 0.001 230 V 0.002 0.024 0.010 0.420 0.119 0.062 0.002 0.339 0.001 0.001 0.008 0.001 0.004 0.001 0.007 0.001 231 G 0.001 0.066 0.004 0.184 0.015 0.227 0.001 0.064 0.149 0.232 0.031 0.010 0.005 0.001 0.001 0.009 232 D 0.145 0.175 0.012 0.120 0.005 0.082 0.003 0.018 0.030 0.040 0.176 0.167 0.021 0.001 0.002 0.005 233 T 0.020 0.035 0.043 0.032 0.005 0.339 0.003 0.006 0.004 0.005 0.140 0.277 0.083 0.001 0.003 0.003 234 L 0.004 0.010 0.029 0.013 0.003 0.042 0.003 0.006 0.001 0.002 0.566 0.156 0.156 0.003 0.003 0.004 235 H 0.005 0.068 0.015 0.036 0.002 0.013 0.004 0.003 0.006 0.001 0.045 0.535 0.246 0.005 0.008 0.007 236 T 0.003 0.004 0.013 0.016 0.001 0.010 0.002 0.001 0.002 0.001 0.016 0.020 0.893 0.001 0.005 0.011 237 D 0.001 0.021 0.009 0.004 0.001 0.035 0.003 0.001 0.001 0.001 0.004 0.055 0.861 0.001 0.001 0.004 238 I 0.004 0.002 0.006 0.008 0.002 0.037 0.007 0.001 0.001 0.001 0.075 0.022 0.822 0.011 0.001 0.002 239 L 0.001 0.057 0.025 0.023 0.001 0.005 0.004 0.004 0.001 0.001 0.015 0.093 0.744 0.004 0.022 0.002 240 G 0.001 0.002 0.003 0.020 0.001 0.005 0.002 0.001 0.003 0.001 0.002 0.008 0.897 0.003 0.004 0.049 241 G 0.007 0.002 0.035 0.011 0.003 0.005 0.022 0.001 0.001 0.001 0.012 0.005 0.880 0.006 0.002 0.010 242 N 0.002 0.008 0.015 0.011 0.004 0.014 0.004 0.007 0.001 0.001 0.014 0.023 0.886 0.002 0.006 0.004 243 K 0.001 0.001 0.001 0.002 0.073 0.001 0.045 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.015 0.851 0.001 0.005 244 F 0.001 0.002 0.005 0.004 0.001 0.001 0.001 0.103 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.869 0.001 245 G 0.001 0.006 0.012 0.006 0.001 0.002 0.001 0.001 0.100 0.049 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.812 246 L 0.965 0.001 0.003 0.008 0.001 0.014 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.001 0.001 0.001 247 D 0.001 0.768 0.186 0.028 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 248 T 0.002 0.002 0.020 0.958 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 249 A 0.001 0.007 0.694 0.287 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 250 L 0.001 0.001 0.006 0.981 0.004 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 251 V 0.001 0.010 0.014 0.694 0.141 0.122 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 252 L 0.001 0.026 0.003 0.188 0.635 0.080 0.019 0.015 0.001 0.003 0.012 0.001 0.003 0.014 0.001 0.001 253 T 0.002 0.141 0.006 0.127 0.019 0.106 0.003 0.486 0.014 0.008 0.025 0.017 0.003 0.001 0.039 0.002 254 G 0.012 0.085 0.026 0.087 0.003 0.035 0.004 0.027 0.263 0.211 0.111 0.030 0.017 0.001 0.006 0.082 255 N 0.494 0.069 0.082 0.096 0.005 0.027 0.009 0.004 0.016 0.006 0.041 0.109 0.021 0.003 0.004 0.014 256 T 0.037 0.081 0.451 0.167 0.003 0.079 0.005 0.012 0.003 0.003 0.029 0.056 0.053 0.001 0.009 0.011 257 R 0.007 0.038 0.051 0.114 0.008 0.546 0.004 0.005 0.005 0.007 0.057 0.061 0.088 0.001 0.002 0.007 258 I 0.009 0.047 0.022 0.060 0.007 0.109 0.006 0.009 0.002 0.001 0.456 0.091 0.173 0.003 0.002 0.003 259 D 0.004 0.064 0.031 0.073 0.002 0.035 0.004 0.014 0.005 0.002 0.053 0.480 0.209 0.004 0.012 0.007 260 D 0.008 0.009 0.030 0.035 0.002 0.055 0.012 0.003 0.005 0.003 0.035 0.057 0.686 0.010 0.011 0.038 261 A 0.010 0.020 0.087 0.027 0.002 0.022 0.018 0.005 0.001 0.001 0.095 0.039 0.628 0.008 0.012 0.024 262 E 0.015 0.045 0.103 0.072 0.003 0.032 0.021 0.009 0.004 0.002 0.023 0.088 0.486 0.027 0.022 0.047 263 T 0.021 0.025 0.118 0.082 0.003 0.050 0.024 0.005 0.004 0.002 0.023 0.017 0.522 0.014 0.030 0.059 264 K 0.024 0.073 0.181 0.087 0.004 0.040 0.030 0.006 0.005 0.002 0.075 0.025 0.343 0.016 0.015 0.075 265 I 0.058 0.080 0.217 0.146 0.010 0.080 0.049 0.009 0.007 0.002 0.027 0.049 0.187 0.019 0.015 0.044 266 K 0.024 0.143 0.372 0.243 0.004 0.020 0.012 0.008 0.004 0.002 0.016 0.014 0.082 0.003 0.017 0.036 267 S 0.034 0.046 0.195 0.260 0.061 0.113 0.093 0.004 0.006 0.007 0.016 0.015 0.063 0.044 0.005 0.040 268 T 0.045 0.070 0.142 0.248 0.007 0.168 0.024 0.085 0.003 0.004 0.089 0.016 0.054 0.005 0.035 0.006 269 G 0.008 0.367 0.058 0.344 0.001 0.015 0.004 0.003 0.082 0.008 0.010 0.046 0.013 0.001 0.003 0.036 270 I 0.100 0.023 0.145 0.698 0.001 0.003 0.002 0.001 0.002 0.001 0.002 0.003 0.005 0.001 0.001 0.016 271 V 0.009 0.006 0.671 0.269 0.003 0.035 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 272 P 0.001 0.003 0.003 0.041 0.024 0.902 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 273 T 0.001 0.583 0.001 0.118 0.001 0.009 0.001 0.029 0.001 0.001 0.220 0.033 0.003 0.001 0.001 0.001 274 H 0.002 0.011 0.002 0.020 0.003 0.351 0.002 0.002 0.032 0.012 0.008 0.491 0.062 0.001 0.001 0.003 275 I 0.003 0.004 0.036 0.003 0.001 0.023 0.008 0.002 0.001 0.001 0.590 0.019 0.305 0.002 0.001 0.001 276 C 0.001 0.060 0.013 0.016 0.001 0.006 0.003 0.005 0.002 0.001 0.014 0.681 0.178 0.002 0.015 0.004 277 E 0.010 0.003 0.020 0.035 0.001 0.008 0.006 0.001 0.008 0.001 0.015 0.008 0.739 0.012 0.010 0.123 278 S 0.026 0.036 0.401 0.041 0.001 0.008 0.016 0.001 0.002 0.001 0.007 0.016 0.396 0.003 0.007 0.039 279 A 0.014 0.035 0.261 0.156 0.001 0.053 0.006 0.004 0.001 0.001 0.016 0.013 0.415 0.002 0.005 0.018 280 V 0.007 0.061 0.150 0.425 0.002 0.029 0.005 0.001 0.002 0.001 0.016 0.007 0.279 0.002 0.002 0.014 281 I 0.004 0.023 0.074 0.741 0.003 0.012 0.002 0.001 0.001 0.001 0.007 0.006 0.118 0.001 0.002 0.007 282 E 0.005 0.015 0.099 0.377 0.206 0.123 0.046 0.002 0.001 0.001 0.004 0.006 0.067 0.038 0.001 0.009 283 L 0.004 0.075 0.036 0.254 0.160 0.168 0.037 0.097 0.001 0.001 0.047 0.006 0.060 0.019 0.029 0.005