Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
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.....IRL...I...Q..PEDW.D.KRP.IS....G....KRS.V.Y.EVAVH.LAVL.L.E..A 44 .....VKD...L...S..EREA.F.WKP.NE....E....SNS.I.A.EIVQH.LLYW.N.S..T 45 .....IEN...L...P..EETA.Y.QEV.KS....V....FPS.V.S.DVLLH.MCRA.D.Y..I 46 .....LNQ...Y...T..ESDL.K.IKS.IE....S....KRA.L.F.EMCTH.LSLI.C.H..A 47 .....IEN...L...P..EETA.Y.QEV.KS....V....FPS.V.S.DVLLH.MCRA.D.Y..I 48 .....CHQ...L...T..TEEL.L.KNR.LG....G....VEN.I.L.YTLFH.IIDV.E.Y..S 49 .....LNS...L...T..DESL.K.QEI.TS....Q....NWT.L.G.RIAWH.TVAA.I.G..I 50 .....CHQ...L...T..TEEL.L.KNR.LG....G....VEN.I.L.YTLFH.IIDV.E.Y..S 51 .....LER...V...T..DENL.S.WKP.HP....K....SRS.L.G.ELAFH.VANI.P.G..M 52 .....ASA...L...S..DADY.R.ADR.GA....F....FKS.V.H.GTFNH.LLAA.D.R..I 53 .....CLS...Q...P..QEEL.V.KKR.SG....G....MGS.I.K.KNLFH.IVDV.E.V..S 54 .....LKK...V...K..ESDW.S.YRP.AD....R....MRS.L.K.ELASH.LTAI.P.E..A 55 .....CED...M...P..DEEL.L.KKR.VG....G....FGS.I.L.HTLFH.IVDV.E.Y..M 56 .....WNS...L...P..DNFL.N.WKP.DH....E....AMS.F.G.EMIRH.VWTStF.Y..Y 57 .....LDA...I...A..RIDA.E.AFP.AS....L....AF-.A.L.QQLNH.MAIV.E.E..L 58 .....LDA...I...A..RIDA.E.AFP.AS....L....AF-.A.L.QQLNH.MAIV.E.E..L 59 .....LDA...I...A..RIDA.E.AFP.AS....L....AF-.A.L.QQLNH.MAIV.E.E..L 60 fnr..LKE...L...PnyETIF.N.EQI.QS....V....FPS.I.K.DTFVH.IYIT.D.Q..V 61 .....AEA...M...P..AESY.N.FRP.NP....E....EMS.F.G.QLMAH.IGLA.D.R..N 62 .....AEK...I...S..KDHY.S.YKP.AE....T....SMS.A.E.ELVKH.ILTS.F.H..L 63 .....CEQ...L...S..DKEL.L.AER.TG....G....VGS.I.L.RTLFH.IVDV.E.W..S 64 .....WNS...L...P..DNFL.N.WKP.DD....E....AMS.F.G.EMIRH.VWSStF.Y..Y 65 .....LDA...I...A..RIDA.E.AFP.AS....L....AF-.A.L.QQLNH.MAIV.E.E..L 66 .....WNS...L...P..DNFL.N.WKP.DP....E....AMS.F.G.EMIRH.VWSStF.Y..Y 67 .....FDA...I...A..RIDA.E.AFP.AS....L....AF-.A.L.QQLNH.MAIV.E.E..L 68 .....AEK...M...P..DSLY.G.YKP.TE....R....EMS.F.G.EQLEH.INQN.M.E..W 69 .....CEK...L...S..ADEW.T.AQN.GY....G....LQS.V.R.DTLVH.MADC.Y.H..A 70 .....WNS...L...P..NNFL.N.WKP.DH....E....AMS.F.G.EMIRH.VWSStF.Y..Y 71 .....CAC...L...N..DAEY.R.KQR.PG....S....FGS.I.H.GLLNH.ILLG.D.R..R 72 .....MNE...L...P..SNVL.Y.DEV.RS....S....YPT.I.A.QTFSH.IYVV.D.A..M 73 .....IQK...I...D..EKHL.D.YKP.TE....T....SMP.A.K.ELVTH.MLQS.F.Y..T 74 .....LQT...I...S..PEKY.E.QEI.KS....V....FPS.L.A.KVCSH.LYLV.E.Y..L 75 .....VRL...V...D..GKDL.A.WKP.SE....Gsn..WMT.T.G.QLLWH.MGKS.C.G..M 76 .....VNW...LspkP..DDLL.Y.AEV.PS....S....FST.I.M.KTLDH.IWST.E.E..Y 77 .....AEA...I...P..TEKF.E.WRP.AP....G....VRS.V.S.EVLMH.TASG.N.Y..F 78 .....VLA...L...K..PGEF.E.AER.TS....F....FPS.I.K.ATLNH.VLAV.D.Y..L 79 .....LSA...Q...E..EGML.T.RQV.TS....V....FSS.I.A.EVLTH.IYTA.D.I..T 80 .....IAA...L...T..DESL.D.KRF.SE....N....GRT.L.R.RLAWH.ISQT.I.P..E 81 .....CEA...L...T..DDER.K.LER.GA....F....FGS.I.H.GTLNH.LIVG.D.Q..I 82 .....WIS...L...P..DNFL.N.WKP.DD....E....AMS.F.G.EMIRH.VWSStF.Y..Y 83 .....AEA...I...P..ADKY.A.WRP.AP....G....VRS.T.G.EVIMH.IAGA.N.F..Y 84 .....LKE...L...P..KEIY.H.QEI.QS....V....FPS.I.S.HVLSH.VYLS.D.L..G 85 lth..LKS...L...P..EELF.T.REI.KS....V....FQT.V.S.EVVTH.MCVA.D.A..L 86 .....WSS...I...P..SEVL.F.HRV.DS....S....SMT.I.L.EQVRH.VLEA.E.Y..L 87 .....VAD...L...S..EEDA.F.WKP.NE....E....SNS.I.A.EMVQH.LLYW.N.E..T 88 .....VRL...L...D..EKDL.A.WKP.TD....Gsn..WMT.T.G.QLLLH.MGKS.C.G..V 89 .....ADA...M...P..EAKW.N.FKP.TGagfkD....VRT.F.A.EQVKH.VACA.N.V..A 90 .....IQA...I...P..EDRM.D.FAP.QP....G....KFT.F.G.DLIRH.IAAT.E.R..M 91 fnr..LKE...L...PnyETIF.N.EQI.QS....V....FPS.I.K.DTFVH.IYIT.D.Q..V 92 fdr..IKE...L...PnyEAIF.T.EQI.QS....V....FPS.I.K.DTFAH.IYIT.D.Q..V 93 .....LGT...F...E..EGQQ.D.FKA.WE....Q....GMS.V.S.ELTAH.ITGS.M.E..M 94 .....LSR...I...P..DDKY.D.WQP.HP....K....SMT.I.R.SLATH.IAEL.S.T..W 95 .....MEE...I...P..LEKLhS.TIP.NF....G....SGS.I.I.KTHIS.VADC.Y.R..Y 96 .....WST...F...K..DDDL.K.RRP.HPqdk.R....GRN.A.H.EHMVH.QCMG.E.N..V 97 .....LRR...M...T..PEQL.A.WKP.PG....W....HSS.A.F.ELAEH.MALC.E.W..V 98 fer..LKE...L...PnyETIF.T.EQI.QS....V....FPS.I.K.DTFVH.IYIT.D.Q..V 99 .....AET...M...P..EAQY.K.FRA.TA....E....SMS.F.E.EHLMH.IAWA.M.D..W 100 .....AQA...M...P..EDQY.D.FKP.TK....R....QMS.F.K.TQLIH.M-EG.N.M..K 101 .....WTT...I...P..DEKL.F.WKP.DN....E....ALS.C.L.EMIRH.VLES.EhY..Y 102 fdr..IKE...L...PnyEAIF.T.EQI.QS....V....FPS.I.K.DTFAH.IYIT.D.Q..V 103 .....IEA...F...P..EEEL.FhFKA.AE....A....MRP.F.S.EMVVE.FLEI.E.Ea.Y 104 .....LHA...L...-..AAAL.D.GDA.HP....D....KRH.L.AiRILNH.IHVV.D.R..I 105 .....VEG...L...S..EEDA.F.WKP.DK....E....SHS.I.G.EIVQH.LIYW.N.E..T 106 .....CAE...I...P..KETL.H.EDL.KL....Y....FRS.I.F.GILNH.NAIV.A.E..L 107 .....VGL...C...N..DSEL.N.WKP.DE....Enn..WMT.T.A.QLLYH.TANS.G.G..K 108 .....AED...V...P..EDKY.D.FRP.AP....D....CRS.I.R.ETLVH.IAVA.P.R..L 109 .....CEQ...L...K..EDEL.L.KKR.TG....G....AGS.I.L.HTLLH.IADV.E.Y..S 110 .....MSL...I...K..DDEL.D.WKP.DH....Ghn..WMS.M.G.QLLMH.MSDA.C.Gs.T 111 .....LEA...I...P..NDKL.D.WKP.HK....K....SNT.I.G.WNANH.LADI.P.N..W 112 .....LEAvadV...P..DDGY.R.CDA.GL....F....FRS.I.H.GTLAH.LLVG.E.Hq.L 113 .....LGE...L...D..SDAF.T.APR.PG....F....FGS.L.A.ATMNH.IYEV.D.L..Y 114 .....LGA...V...P..ANHL.D.YSP.DA....K....SKT.A.L.GLLRH.LALE.D.E..W 115 fdr..IKE...L...PnyEAIF.T.EQI.QS....V....FPS.I.K.DTFAH.IYIT.D.Q..V 116 .....CDG...L...T..PAQR.M.QDI.GL....F....WGS.I.Q.GTLSH.AHWG.D.M..I 117 .....IEA...I...P..HDKG.D.YRP.DE....F....AKS.A.M.ELAWH.IVAT.E.M..R 118 .....LER...V...P..YEKA.D.WKP.HV....K....SGT.L.K.WLAGH.CAIM.P.G..W 119 .....AED...F...P..EDKY.D.FKP.TP....A....QRS.F.A.EQLLH.AAGS.T.Y..Y 120 .....VKG...I...T..EIEA.F.WKP.DK....S....SHS.I.A.EIVQH.LIYW.N.Q..I 121 .....AEA...M...P..EGKY.D.FAP.TS....GefkgVRT.F.G.QQVKH.VAAV.N.Y..V 122 .....IEL...F...P..EKDF.F.EFS.IG....G....MRP.F.A.KLVDE.LLAI.A.G..P 123 .....IER...V...P..EGRN.D.WKP.HE....K....SME.L.G.RLAV-.LVAT.M.V..G 124 .....CKQ...L...T..DEQL.Y.QNT.NA....F....FPS.V.M.AHWNH.ILFG.D.L..I 125 .....YSAamgL...S..DAQL.A.LDR.QA....F....FGS.I.L.GTLNH.LLAG.D.T..I 126 .....AKA...I...P..EEKY.S.WRP.GP....G....VRS.F.K.EVFLH.IAFG.N.Q..L 127 .....IEA...F...P..EEGF.A.AHH.AP....D....MRP.F.Q.AMACE.LAGM.V.E..Y 128 .....VEL...F...P..EDAL.FhFTP.AP....P....LRP.F.A.DMVNE.ILEM.E.E..G 129 .....AGA...F...S..EEQM.G.WRP.SE....G....VRS.T.G.ETILH.TAAA.N.Y..Y 130 .....AEK...M...P..AENY.S.FKP.TD....S....IRS.F.G.QLVGH.VGDA.Q.Y..I 131 fnr..LKE...L...PnyETIF.T.EQI.QS....V....FPS.I.K.DTFAH.IYIT.D.Q..V 132 .....AEA...M...P..EDKF.N.FKP.TA....GkfdtVHD.F.A.GQIDH.LGGG.F.F..F 133 .....IEV...F...P..EDHF.F.KYS.IG....G....MRT.F.A.EMTTE.LLAI.A.G..P 134 .....MKA...M...P..TDRF.D.YRP.HE....R....SPS.A.A.ELVWT.LARE.M.E..A 135 .....LAS...M...T..----.S.TDQ.AA....S....LHT.A.I.RTLNH.IYVV.D.R..I 136 .....AAT...L...L..GEEL.S.RNQ.GA....F....FGS.V.I.GTLNH.IAVG.D.I..I 137 .....MEL...V...S..EEML.T.WKP.SE....Gen..WMT.M.G.QLLHH.IGTG.C.G..G 138 .....LER...V...P..MGHE.K.YKP.HE....K....SME.L.G.PLVYM.VTTM.V.E..W 139 .....CSE...M...K..EV--.-.---.--....S....ART.-.A.ELFSH.ILNA.H.H..I 140 .....AKA...M...P..ESAY.S.FAP.TQ....GafekVRT.F.G.EQVKH.VATV.M.Y..M 141 .....ADK...M...P..EQQY.A.FKP.DP....G....SRS.F.G.QILGH.IADA.N.Y..L 142 .....TRV...L...D..ESDS.G.FRP.QE....G....MMT.V.A.QQVAH.TAQT.L.D..W 143 .....WSM...F...H..DDDM.P.VRP.HPtdp.R....GRS.V.H.EHMVH.QCVS.E.D..I 144 .....CAH...L...T..PEMM.R.ART.PG....G....GMT.V.A.QHLAH.MAGV.T.Q..E 145 .....LED...L...Q..KTPL.-.AAA.TP....G....GNH.A.L.WIFGH.LTFC.E.G..L 146 .....---...-...-..----.-.---.--....Y....FTS.L.H.GTLNH.LLTA.D.R..I 147 slsqsIQG...L...T..AEDA.D.WKP.SD....E....VNS.I.R.EIVNH.LIFY.N.E..R 148 .....AEK...M...P..EEAY.T.FKP.TP....E....MQS.F.G.ERIAH.IANQ.M.G..T 149 .....LTD...L...KtaGAVY.D.KAL.PI....S....FGS.F.H.QLLMH.IYYY.D.Vk.V 150 .....VEG...L...P..EDQL.W.ATA.PG....F....ANS.I.G.TLLAH.IAAV.E.R..V 151 .....LKG...M...K..EELW.T.API.SE....G....KWT.I.G.EIVSH.IMNW.D.D..Y 152 .....IKY...I...T..PEDL.T.KAL.TP....S....KNS.I.G.FLLRH.IAEV.E.L..L 153 .....---...-...-..----.-.---.--....F....FGS.I.L.GTLNH.ILVG.D.T..I 154 .....LSA...I...-..-ANV.D.TAA.YK....D....KRH.LmI.RLMNH.IYVV.D.Q..I 155 .....VED...L...T..MEEL.D.YLY.NG....E....ANS.I.G.MLLYH.MAAV.E.F..Y 156 .....---...-...-..----.-.---.--....-....---.M.G.SLAMH.IATM.L.G..W 157 .....LSK...V...V..EEEL.W.TKQ.NQ....S....LNT.L.G.NQLLH.ICGN.MtQ..Y 158 .....IER...L...D..PATW.K.AKP.PG....N....VRN.I.A.AIFTH.MHNV.R.T..K 159 .....VDS...L...S..EQQL.N.LRY.AP....N....KWS.I.K.ELLVH.IIDD.E.R..I 160 .....LEK...I...S..FKKS.G.KRP.VG....L....PYS.F.Y.EIFYH.MVYA.Q.K..D 161 .....ISD...L...S..AADA.G.RRP.AG....L....PHS.A.A.QIVAH.VQFW.Q.H..Y 162 .....LAA...L...S..AVPV.E.KQE.EP....E....FKK.A.I.RIMAH.LAVA.R.H..K 163 .....AKE...I...P..ESKW.D.IQL.IP....E....LGT.L.R.KLFIH.IVRV.R.D..V 164 .....LEA...T...P..MDRW.F.EIP.PG....G....VSH.V.A.WQVGH.LAVS.Q.Y..G 165 .....AFD...L...P..EEPF.W.RRP.KE....G....ANP.I.G.GLVRH.IAGS.S.L..R 166 .....LAA...L...T..PADL.D.LSD.GR....G....GWT.V.G.QHLGH.LAHF.R.P..G 167 .....MEK...V...P..DGLF.W.HRE.HG....V....LNS.V.G.NLMLH.LSGN.I.Rq.Y 168 .....AFD...L...P..EEPF.W.RRP.KE....G....ANP.I.G.GLVRH.ITGS.S.L..R 169 .....LEQ...C...P..GAAW.D.-QP.VA....N....LK-.F.C.QAAFHaLFFT.D.Y..Y 170 .....AKE...I...P..ESKW.D.IQL.IP....E....LGT.L.R.KLFIH.IVRV.R.D..V 171 .....LQT...V...S..NEEY.T.NNS.IP....P....YNStI.G.CHIRH.ILDI.F.S..C 172 .....LAS...L...P..DEKL.S.YAY.AD....G....KWT.I.A.EALLH.VLDT.E.R..V 173 .....YSE...I...P..EDKW.R.FAY.QS....G....KWT.I.L.EVLQH.VIDT.E.R..I 174 .....ISA...V...P..ADRL.N.WTPaIP....G....AWP.V.D.ILLGH.LLEC.L.A..G 175 .....VDP...K...A..HDPF.A.SDP.NA....Vnq..AWT.L.G.HVIVH.LTAS.C.EesA 176 .....---...-...-..----.-.---.--....-....---.-.-.-----.----.-.L..I 177 .....---...-...-..----.-.---.--....-....---.-.-.-----.----.-.-..- 178 .....LDQ...Y...T..EIDL.K.IAP.IQ....S....KRS.L.F.EMCAH.LSLI.C.H..A 179 .....---...-...-..----.L.VSP.AS....G....GNN.I.N.WVVGH.LVCV.Y.N..N 180 q....LEN...L...-..DWKI.A.VKP.IQ....N....LNT.I.A.ILAQH.IHYY.I.N..G 181 .....LEC...V...P..DEQL.E.WRP.HE....R....SST.L.G.KLANH.LAAM.P.I..F 182 .....---...-...-..----.-.---.--....-....---.-.-.-----.----.-.-..- 60 70 | | 1 D.L...R...I.....AT...G..A..T.A...D.E...MA.....Q.F..Y..A..V.....P. 2 M.L...S...G.....-T...G..L..K.F...E.G...ET.....K.D..Y..P..V.....P. 3 I.L...S...G.....-T...G..L..K.F...E.G...ET.....K.D..Y..P..V.....P. 4 I.L...S...G.....-T...G..L..K.F...E.G...ET.....K.D..Y..P..V.....P. 5 I.L...S...G.....-T...G..L..K.F...E.G...ET.....K.D..Y..P..V.....P. 6 I.L...S...G.....-T...G..L..K.F...E.G...ET.....K.D..Y..P..V.....P. 7 I.L...S...G.....-T...G..L..K.F...E.G...ET.....K.D..Y..P..V.....P. 8 I.L...S...G.....-T...G..L..K.F...E.G...ET.....K.D..Y..P..V.....P. 9 I.L...S...G.....-T...G..L..Q.F...E.G...ET.....K.D..Y..P..V.....P. 10 W.I...S...A.....LQ...E..K..E.D...N.E...PQf....K.D..Y..Q..S.....I. 11 W.I...I...A.....LQ...E..K..E.D...R.A...PQf....K.E..Y..Q..S.....I. 12 W.I...N...A.....LQ...E..K..E.D...G.A...PQf....K.E..Y..Q..S.....I. 13 W.I...N...A.....LQ...E..K..E.D...C.V...PQf....K.E..Y..Q..S.....I. 14 W.I...N...A.....LQ...E..K..E.D...G.A...PQf....K.E..Y..Q..S.....I. 15 D.L...L...I.....LN...G..S..T.E...K.E...LH.....T.F..YkeQ..T.....P. 16 W.L...Gsf.A.....FK...Q..K..R.A...D.Fs..FA.....S.N..Y..E..Iehad.V. 17 D.L...L...I.....LN...G..S..T.E...K.E...LR.....T.F..YleH..T.....P. 18 D.L...L...I.....LN...G..S..T.E...K.E...LR.....T.F..YleH..T.....P. 19 D.L...L...I.....LN...G..S..T.E...K.E...LR.....T.F..YleH..T.....P. 20 W.L...Gsf.A.....FK...Q..K..R.A...D.Fs..FA.....S.N..Y..E..Iehad.V. 21 M.A...S...Q.....-T...G..L..A.F...E.A...PA.....K.D..Y..P..V.....P. 22 D.L...L...I.....LN...G..I..T.E...K.Q...LH.....T.F..YkeQ..T.....P. 23 W.L...Gsf.A.....FK...Q..K..R.A...D.Fs..FA.....S.D..D..E..Ierad.V. 24 F.F...G...K.....LA...G..L..D.I...D.L...SH.....D.P..D..R..V.....P. 25 D.L...L...I.....LN...G..I..P.E...K.E...LH.....T.F..YieR..T.....P. 26 W.I...R...A.....MK...G..E..K.-...-.D...LI.....L.D..Y..E..S.....M. 27 W.L...Gsf.A.....FK...Q..K..R.A...D.Fs..FA.....S.D..Y..E..Iehad.V. 28 W.L...Gsf.A.....FK...Q..K..R.A...D.Fs..FA.....S.D..D..E..Iehad.V. 29 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