# TARGET T0369 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0369.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 142 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.037 0.181 0.017 0.026 0.035 0.090 0.068 0.547 2 T 0.058 0.566 0.011 0.016 0.015 0.050 0.075 0.210 3 D 0.020 0.894 0.004 0.003 0.003 0.011 0.017 0.048 4 W 0.013 0.956 0.001 0.001 0.001 0.003 0.008 0.017 5 Q 0.021 0.924 0.004 0.001 0.001 0.003 0.035 0.011 6 Q 0.016 0.861 0.006 0.002 0.002 0.007 0.081 0.026 7 A 0.043 0.776 0.021 0.001 0.002 0.011 0.102 0.042 8 L 0.074 0.731 0.010 0.002 0.002 0.015 0.110 0.057 9 D 0.067 0.542 0.018 0.003 0.003 0.024 0.125 0.218 10 R 0.038 0.516 0.006 0.002 0.003 0.038 0.064 0.334 11 H 0.048 0.575 0.016 0.003 0.003 0.047 0.112 0.198 12 V 0.040 0.731 0.007 0.003 0.004 0.033 0.054 0.128 13 G 0.049 0.607 0.016 0.003 0.006 0.036 0.067 0.216 14 V 0.035 0.206 0.023 0.008 0.010 0.059 0.474 0.185 15 G 0.007 0.116 0.012 0.003 0.003 0.016 0.804 0.039 16 V 0.013 0.761 0.005 0.003 0.004 0.018 0.107 0.090 17 R 0.008 0.756 0.013 0.010 0.013 0.027 0.046 0.128 18 T 0.005 0.887 0.005 0.004 0.007 0.012 0.035 0.045 19 T 0.006 0.964 0.001 0.001 0.001 0.002 0.021 0.004 20 R 0.007 0.925 0.007 0.002 0.001 0.003 0.045 0.010 21 D 0.011 0.880 0.022 0.005 0.005 0.008 0.043 0.025 22 L 0.303 0.421 0.071 0.005 0.007 0.018 0.127 0.048 23 I 0.456 0.122 0.064 0.012 0.010 0.034 0.152 0.151 24 R 0.040 0.039 0.010 0.003 0.004 0.036 0.021 0.848 25 L 0.005 0.021 0.006 0.002 0.003 0.086 0.009 0.868 26 I 0.021 0.048 0.036 0.017 0.010 0.172 0.043 0.654 27 Q 0.493 0.172 0.006 0.003 0.003 0.047 0.038 0.237 28 P 0.459 0.150 0.013 0.003 0.003 0.043 0.064 0.265 29 E 0.097 0.122 0.020 0.006 0.007 0.082 0.035 0.630 30 D 0.249 0.063 0.014 0.005 0.009 0.063 0.046 0.551 31 W 0.082 0.021 0.014 0.011 0.012 0.115 0.032 0.714 32 D 0.046 0.020 0.015 0.014 0.031 0.103 0.040 0.732 33 K 0.034 0.009 0.011 0.011 0.019 0.110 0.032 0.774 34 R 0.026 0.009 0.033 0.055 0.054 0.188 0.046 0.588 35 P 0.090 0.011 0.014 0.011 0.020 0.094 0.036 0.725 36 I 0.308 0.028 0.015 0.018 0.022 0.096 0.050 0.464 37 S 0.044 0.021 0.014 0.009 0.016 0.106 0.037 0.754 38 G 0.043 0.134 0.010 0.010 0.018 0.099 0.058 0.629 39 K 0.029 0.303 0.015 0.014 0.021 0.100 0.057 0.461 40 R 0.014 0.531 0.013 0.015 0.017 0.049 0.138 0.224 41 S 0.006 0.894 0.002 0.003 0.003 0.005 0.069 0.017 42 V 0.001 0.975 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.004 43 Y 0.001 0.959 0.001 0.001 0.002 0.001 0.030 0.004 44 E 0.001 0.839 0.001 0.002 0.003 0.002 0.148 0.003 45 V 0.001 0.975 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.001 46 A 0.002 0.948 0.002 0.002 0.004 0.002 0.035 0.004 47 V 0.003 0.869 0.005 0.007 0.007 0.004 0.094 0.011 48 H 0.006 0.925 0.005 0.003 0.005 0.004 0.042 0.010 49 L 0.016 0.849 0.014 0.009 0.009 0.010 0.068 0.025 50 A 0.021 0.718 0.041 0.019 0.019 0.023 0.088 0.070 51 V 0.043 0.632 0.026 0.012 0.015 0.037 0.093 0.143 52 L 0.037 0.556 0.047 0.015 0.014 0.040 0.147 0.145 53 L 0.031 0.728 0.011 0.008 0.011 0.029 0.047 0.135 54 E 0.053 0.550 0.015 0.008 0.013 0.047 0.079 0.235 55 A 0.026 0.659 0.019 0.025 0.025 0.037 0.063 0.146 56 D 0.097 0.544 0.019 0.015 0.027 0.034 0.081 0.182 57 L 0.054 0.099 0.041 0.034 0.034 0.068 0.413 0.257 58 R 0.025 0.086 0.063 0.077 0.090 0.082 0.301 0.274 59 I 0.329 0.034 0.027 0.018 0.039 0.081 0.052 0.421 60 A 0.126 0.010 0.029 0.050 0.048 0.117 0.103 0.517 61 T 0.016 0.009 0.011 0.007 0.022 0.092 0.025 0.817 62 G 0.023 0.014 0.011 0.009 0.021 0.135 0.024 0.763 63 A 0.032 0.043 0.018 0.034 0.018 0.147 0.027 0.682 64 T 0.146 0.300 0.012 0.008 0.009 0.065 0.042 0.417 65 A 0.166 0.415 0.018 0.008 0.008 0.049 0.049 0.286 66 D 0.159 0.376 0.027 0.013 0.012 0.044 0.089 0.279 67 E 0.147 0.208 0.042 0.017 0.017 0.063 0.123 0.383 68 M 0.171 0.120 0.029 0.017 0.028 0.100 0.077 0.459 69 A 0.132 0.033 0.035 0.014 0.020 0.088 0.075 0.602 70 Q 0.089 0.029 0.014 0.011 0.020 0.095 0.036 0.707 71 F 0.081 0.014 0.013 0.009 0.018 0.089 0.048 0.727 72 Y 0.034 0.007 0.020 0.023 0.027 0.130 0.025 0.734 73 A 0.049 0.009 0.020 0.019 0.034 0.090 0.030 0.748 74 V 0.091 0.024 0.016 0.012 0.013 0.112 0.044 0.688 75 P 0.017 0.037 0.021 0.013 0.014 0.133 0.020 0.744 76 V 0.012 0.077 0.008 0.004 0.004 0.070 0.018 0.807 77 L 0.045 0.916 0.001 0.001 0.001 0.004 0.012 0.021 78 P 0.037 0.943 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.006 79 E 0.014 0.941 0.002 0.001 0.001 0.002 0.022 0.018 80 Q 0.013 0.895 0.004 0.001 0.001 0.006 0.055 0.026 81 L 0.022 0.937 0.002 0.001 0.001 0.003 0.027 0.008 82 V 0.019 0.931 0.003 0.001 0.001 0.003 0.029 0.014 83 D 0.021 0.824 0.003 0.001 0.001 0.007 0.051 0.092 84 R 0.012 0.093 0.005 0.001 0.001 0.008 0.855 0.027 85 L 0.025 0.489 0.004 0.001 0.001 0.008 0.447 0.026 86 D 0.053 0.731 0.004 0.001 0.001 0.017 0.043 0.152 87 Q 0.010 0.729 0.006 0.001 0.001 0.023 0.035 0.195 88 S 0.019 0.909 0.004 0.001 0.001 0.009 0.032 0.027 89 W 0.054 0.822 0.009 0.001 0.001 0.010 0.064 0.039 90 Q 0.031 0.658 0.043 0.003 0.002 0.029 0.121 0.113 91 Y 0.120 0.510 0.074 0.002 0.003 0.046 0.105 0.141 92 Y 0.173 0.411 0.087 0.004 0.004 0.048 0.111 0.161 93 Q 0.066 0.389 0.054 0.003 0.004 0.041 0.032 0.411 94 D 0.037 0.297 0.020 0.002 0.003 0.066 0.020 0.554 95 R 0.038 0.266 0.089 0.010 0.005 0.095 0.054 0.443 96 L 0.235 0.467 0.018 0.002 0.002 0.033 0.053 0.189 97 M 0.362 0.134 0.020 0.002 0.002 0.044 0.182 0.255 98 A 0.023 0.051 0.019 0.004 0.005 0.073 0.421 0.406 99 D 0.053 0.115 0.013 0.004 0.008 0.083 0.127 0.598 100 F 0.118 0.052 0.014 0.013 0.023 0.138 0.107 0.535 101 S 0.043 0.018 0.024 0.018 0.038 0.126 0.193 0.541 102 T 0.050 0.027 0.021 0.029 0.058 0.127 0.083 0.604 103 E 0.038 0.009 0.030 0.029 0.055 0.182 0.033 0.624 104 T 0.022 0.004 0.067 0.047 0.058 0.136 0.057 0.609 105 T 0.130 0.007 0.042 0.026 0.040 0.112 0.045 0.599 106 Y 0.162 0.005 0.043 0.026 0.031 0.092 0.089 0.552 107 W 0.016 0.002 0.037 0.026 0.042 0.131 0.020 0.726 108 G 0.029 0.003 0.028 0.014 0.043 0.092 0.036 0.755 109 V 0.027 0.005 0.024 0.038 0.031 0.120 0.078 0.678 110 T 0.026 0.016 0.029 0.019 0.030 0.119 0.159 0.603 111 D 0.038 0.086 0.016 0.018 0.024 0.118 0.101 0.600 112 S 0.038 0.479 0.013 0.014 0.016 0.063 0.057 0.319 113 T 0.010 0.918 0.002 0.002 0.004 0.007 0.020 0.036 114 T 0.004 0.935 0.002 0.002 0.005 0.005 0.032 0.015 115 G 0.002 0.880 0.004 0.007 0.007 0.004 0.086 0.009 116 W 0.002 0.958 0.002 0.002 0.004 0.002 0.026 0.003 117 L 0.003 0.937 0.003 0.002 0.005 0.002 0.045 0.004 118 L 0.003 0.838 0.007 0.007 0.009 0.003 0.122 0.009 119 E 0.005 0.797 0.009 0.008 0.011 0.007 0.145 0.018 120 A 0.013 0.873 0.014 0.007 0.009 0.009 0.055 0.020 121 A 0.036 0.673 0.028 0.019 0.023 0.025 0.134 0.063 122 V 0.030 0.447 0.030 0.012 0.017 0.048 0.217 0.199 123 H 0.032 0.612 0.022 0.011 0.015 0.041 0.140 0.126 124 L 0.065 0.577 0.025 0.014 0.016 0.047 0.082 0.175 125 Y 0.032 0.299 0.043 0.020 0.026 0.085 0.215 0.280 126 H 0.021 0.478 0.029 0.008 0.010 0.068 0.170 0.217 127 H 0.023 0.919 0.002 0.001 0.002 0.005 0.022 0.026 128 R 0.003 0.956 0.001 0.001 0.001 0.005 0.011 0.023 129 S 0.001 0.935 0.001 0.001 0.003 0.004 0.044 0.012 130 Q 0.001 0.966 0.001 0.001 0.001 0.001 0.029 0.001 131 L 0.001 0.976 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.001 132 L 0.001 0.660 0.003 0.003 0.003 0.001 0.328 0.001 133 D 0.001 0.951 0.003 0.004 0.003 0.001 0.035 0.002 134 Y 0.028 0.862 0.024 0.006 0.010 0.004 0.054 0.011 135 L 0.074 0.101 0.275 0.063 0.025 0.023 0.371 0.068 136 N 0.619 0.033 0.012 0.007 0.007 0.030 0.033 0.259 137 L 0.184 0.002 0.006 0.001 0.001 0.035 0.015 0.757 138 L 0.009 0.002 0.013 0.006 0.013 0.207 0.011 0.740 139 G 0.005 0.001 0.006 0.004 0.012 0.063 0.009 0.901 140 Y 0.014 0.004 0.020 0.043 0.024 0.111 0.017 0.767 141 D 0.054 0.010 0.121 0.051 0.047 0.110 0.054 0.553 142 I 0.117 0.014 0.037 0.032 0.026 0.109 0.043 0.622 143 K 0.078 0.018 0.069 0.015 0.020 0.083 0.051 0.666 144 L 0.168 0.022 0.039 0.015 0.019 0.091 0.051 0.596 145 D 0.115 0.027 0.040 0.039 0.053 0.105 0.089 0.531 146 L 0.031 0.010 0.023 0.014 0.033 0.095 0.051 0.742 147 F 0.057 0.013 0.039 0.070 0.104 0.136 0.076 0.504 148 E 0.042 0.008 0.015 0.032 0.055 0.088 0.041 0.719