PFRMAT QA TARGET T0369 AUTHOR 7072-3475-1278 METHOD linear combination of alignment based constraints and METHOD undertaker cost functions MODEL 1 QMODE 1 Zhang-Server_TS4 0.653 Pcons6_TS5 0.649 Zhang-Server_TS1 0.644 GeneSilicoMetaServer_TS3 0.642 HHpred1_TS1 0.639 Pmodeller6_TS5 0.624 MetaTasser_TS2 0.622 MetaTasser_TS1 0.621 BayesHH_TS1 0.619 Zhang-Server_TS2 0.617 MetaTasser_TS5 0.616 Pmodeller6_TS3 0.615 ROBETTA_TS1 0.615 RAPTOR_TS2 0.614 Zhang-Server_TS5 0.612 Pmodeller6_TS2 0.612 ROBETTA_TS2 0.612 HHpred2_TS1 0.611 HHpred3_TS1 0.611 GeneSilicoMetaServer_TS4 0.609 Zhang-Server_TS3 0.608 MetaTasser_TS3 0.607 RAPTORESS_TS2 0.601 GeneSilicoMetaServer_TS2 0.600 RAPTOR-ACE_TS3 0.599 Pmodeller6_TS1 0.599 shub_TS1 0.595 RAPTOR-ACE_TS1 0.594 GeneSilicoMetaServer_TS1 0.590 UNI-EID_expm_TS1 0.587 beautshotbase_TS1 0.586 SAM_T06_server_TS3 0.583 FAMS_TS1 0.577 FAMSD_TS4 0.575 FAMS_TS4 0.575 FUNCTION_TS2 0.573 Phyre-2_TS1 0.569 beautshot_TS1 0.569 keasar-server_TS5 0.565 MetaTasser_TS4 0.557 ROBETTA_TS4 0.553 Pcons6_TS2 0.552 SPARKS2_TS1 0.548 ROBETTA_TS3 0.546 ROBETTA_TS5 0.546 Phyre-2_TS3 0.546 FUNCTION_TS1 0.543 Phyre-2_TS4 0.543 FAMSD_TS1 0.542 RAPTOR-ACE_TS4 0.542 SP3_TS1 0.542 RAPTOR-ACE_TS2 0.542 CIRCLE_TS5 0.541 CIRCLE_TS4 0.538 FAMSD_TS2 0.538 FAMS_TS5 0.538 SP4_TS1 0.536 RAPTOR-ACE_TS5 0.535 Phyre-2_TS5 0.531 CIRCLE_TS3 0.530 FAMS_TS2 0.530 FAMS_TS3 0.530 Bilab-ENABLE_TS1 0.530 FUGMOD_TS1 0.530 Ma-OPUS-server_TS2 0.527 PROTINFO-AB_TS3 0.526 SP4_TS2 0.519 mGen-3D_TS1 0.519 Phyre-2_TS2 0.519 SAM_T06_server_TS2 0.518 PROTINFO-AB_TS2 0.518 PROTINFO-AB_TS1 0.513 PROTINFO_TS5 0.513 Ma-OPUS-server2_TS2 0.513 Pcons6_TS1 0.513 Pcons6_TS3 0.513 Pcons6_TS4 0.512 3D-JIGSAW_TS1 0.509 keasar-server_TS1 0.507 3D-JIGSAW_RECOM_TS4 0.507 3D-JIGSAW_RECOM_TS3 0.506 3D-JIGSAW_RECOM_TS2 0.506 3D-JIGSAW_RECOM_TS1 0.506 keasar-server_TS3 0.496 Huber-Torda-Server_TS4 0.495 PROTINFO-AB_TS4 0.495 GeneSilicoMetaServer_TS5 0.490 Pmodeller6_TS4 0.486 LOOPP_TS5 0.476 PROTINFO_TS4 0.475 keasar-server_TS2 0.473 3D-JIGSAW_RECOM_TS5 0.472 NN_PUT_lab_TS1 0.472 nFOLD_TS1 0.472 FOLDpro_TS1 0.456 CIRCLE_TS1 0.456 Phyre-1_TS1 0.441 FUGMOD_TS2 0.441 FORTE1_AL1 0.420 FORTE2_AL1 0.420 FORTE1_AL2 0.419 FORTE2_AL2 0.419 UNI-EID_sfst_AL1 0.412 SAM-T99_AL2 0.411 SAM-T99_AL1 0.410 UNI-EID_bnmx_TS1 0.394 Ma-OPUS-server2_TS1 0.391 Ma-OPUS-server_TS1 0.391 ROKKY_TS5 0.390 karypis.srv_TS1 0.390 SP3_TS2 0.383 keasar-server_TS4 0.378 FUGUE_AL1 0.370 LOOPP_TS3 0.369 ABIpro_TS3 0.369 SAM-T02_AL2 0.368 FAMSD_TS3 0.367 ROKKY_TS4 0.365 ROKKY_TS3 0.361 ROKKY_TS1 0.358 FUNCTION_TS3 0.357 Frankenstein_TS1 0.355 FUGUE_AL2 0.351 ROKKY_TS2 0.347 SAM-T99_AL3 0.346 3Dpro_TS3 0.339 ABIpro_TS1 0.339 SAM_T06_server_TS4 0.338 SAM_T06_server_TS5 0.337 LOOPP_TS4 0.337 SAM_T06_server_TS1 0.333 karypis.srv_TS4 0.331 PROTINFO_TS2 0.331 karypis.srv_TS5 0.329 FUGUE_AL4 0.326 RAPTOR_TS1 0.326 PROTINFO_TS1 0.323 FAMSD_TS5 0.321 RAPTOR_TS3 0.321 RAPTORESS_TS1 0.320 ABIpro_TS5 0.320 3Dpro_TS1 0.319 ABIpro_TS2 0.319 FORTE1_AL3 0.318 FORTE2_AL3 0.318 RAPTOR_TS4 0.315 RAPTORESS_TS3 0.313 RAPTORESS_TS4 0.311 LOOPP_TS2 0.308 Distill_TS5 0.308 PROTINFO-AB_TS5 0.307 SP3_TS4 0.305 SP4_TS5 0.305 Distill_TS3 0.305 Distill_TS1 0.305 Ma-OPUS-server2_TS3 0.304 Distill_TS4 0.302 nFOLD_TS4 0.301 SP3_TS3 0.299 Ma-OPUS-server_TS5 0.298 FORTE1_AL4 0.297 FORTE2_AL4 0.297 RAPTOR_TS5 0.297 Distill_TS2 0.295 Huber-Torda-Server_TS5 0.292 FORTE1_AL5 0.291 FORTE2_AL5 0.291 SP3_TS5 0.291 RAPTORESS_TS5 0.290 karypis.srv_TS3 0.289 FOLDpro_TS3 0.288 karypis.srv.2_TS5 0.287 SP4_TS4 0.285 SP4_TS3 0.283 SAM-T02_AL1 0.283 3D-JIGSAW_POPULUS_TS3 0.281 ABIpro_TS4 0.281 FUNCTION_TS5 0.278 3D-JIGSAW_POPULUS_TS2 0.277 Ma-OPUS-server_TS3 0.277 Ma-OPUS-server2_TS4 0.273 FUGUE_AL5 0.270 karypis.srv.2_TS1 0.268 3D-JIGSAW_POPULUS_TS1 0.268 MIG_FROST_AL1 0.267 nFOLD_TS5 0.267 FUGMOD_TS4 0.266 FUNCTION_TS4 0.266 3D-JIGSAW_TS4 0.265 CaspIta-FOX_TS5 0.261 Ma-OPUS-server2_TS5 0.261 POMYSL_TS4 0.259 Ma-OPUS-server_TS4 0.259 karypis.srv_TS2 0.259 FUGUE_AL3 0.258 CaspIta-FOX_TS2 0.258 LOOPP_TS1 0.257 CaspIta-FOX_TS3 0.257 forecast-s_AL5 0.256 CIRCLE_TS2 0.256 3D-JIGSAW_TS5 0.255 Huber-Torda-Server_TS3 0.255 POMYSL_TS1 0.253 karypis.srv.2_TS4 0.252 forecast-s_AL3 0.251 Huber-Torda-Server_TS2 0.250 CaspIta-FOX_TS4 0.249 PROTINFO_TS3 0.248 SPARKS2_TS4 0.247 SPARKS2_TS2 0.246 SPARKS2_TS3 0.244 forecast-s_AL4 0.239 3D-JIGSAW_TS2 0.239 FOLDpro_TS5 0.230 forecast-s_AL1 0.230 POMYSL_TS2 0.229 3D-JIGSAW_TS3 0.226 SAM-T02_AL4 0.226 3D-JIGSAW_POPULUS_TS4 0.223 karypis.srv.2_TS3 0.223 3D-JIGSAW_POPULUS_TS5 0.222 SAM-T02_AL3 0.221 3Dpro_TS4 0.220 Frankenstein_TS2 0.219 SPARKS2_TS5 0.218 karypis.srv.2_TS2 0.215 karypis.srv.4_TS4 0.213 POMYSL_TS5 0.213 Huber-Torda-Server_TS1 0.212 FPSOLVER-SERVER_TS2 0.211 forecast-s_AL2 0.211 karypis.srv.4_TS1 0.210 POMYSL_TS3 0.209 Frankenstein_TS4 0.208 FPSOLVER-SERVER_TS4 0.206 nFOLD_TS2 0.205 3Dpro_TS2 0.203 FUGMOD_TS3 0.199 FOLDpro_TS2 0.192 FUGMOD_TS5 0.191 panther2_TS1 0.184 karypis.srv.4_TS3 0.182 nFOLD_TS3 0.180 karypis.srv.4_TS5 0.178 karypis.srv.4_TS2 0.172 FPSOLVER-SERVER_TS5 0.171 FPSOLVER-SERVER_TS3 0.170 FOLDpro_TS4 0.164 FPSOLVER-SERVER_TS1 0.162 CaspIta-FOX_TS1 0.158 3Dpro_TS5 0.158 Frankenstein_TS5 0.125 Frankenstein_TS3 0.118 END